Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf ·...

48
1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація коферментів 2. Коферменти І групи 3. Коферменти ІІ групи

Upload: others

Post on 11-Jun-2020

1 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

1

Лекція 2. Коферменти

1. Визначення, класифікація коферментів

2. Коферменти І групи

3. Коферменти ІІ групи

Page 2: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

2

Ферменти

Простий білок (лише амінокислоти)

Апофермент (білок)

Кофактор (небілкова частина)

Органічні Неорганічні

Складні =холоферменти

Прості

Простетичні групи – ковалентний зв’язок з апоферментом

Коферменти –слабкий зв’язок з апоферментом

Іони металів (Fe, Cu, Zn та ін.)

КФ 3. Гідролази

КФ 1, 2, 4, 5, 6 +

Page 3: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

3

Коферменти (коензими, Ко) – небілкові органічні компоненти складних

ферментів, які проявляють високу хімічну активність і

входять до складу активних центрів

Page 4: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

4

Класифікація коферментів

І. За хімічною природою: • вітамінні • вітаміноподібні • невітамінні

ІІ. За механізмом дії: Група 1. Переносники Н+, e-, Н коферменти оксидорудектаз (КФ1)

Група 2. Переносники хімічних груп коферменти трансфераз (КФ 2)

ліаз, ізомераз, лігаз (КФ 4, 5, 6)

N.B.! Гідролази (КФ 3) - прості ферменти і не мають коферментів

Page 5: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

5

Коферменти І групи - переносники Н+, ē, Н :

А. Вітамінні: аскорбінова кислота НАД та НАДФ

ФАД та ФМН 5-дезоксиаденозилкобаламін вітамін Е

Б. Вітаміноподібні: ліпоєва кислота убіхінон (коензим Q) тетрагідробіоптерин (ТГБП) В. Невітамінні: гем глутатіон (GSH)

Page 6: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

6

Коферменти ІІ групи - переносники хімічних груп

А. Вітамінні: тіаміндифосфат (ТДФ) коензим А (КоА) піридоксальфосфат (ПАЛФ) біоцитин тетрагідрофолієвая кислота (ТГФК) метилкобаламін вітаміни К та А Б. Вітаміноподібні: карнітинВ. Невітамінні: фосфати нуклеозидів фосфати вуглеводів

Page 7: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

7

Невітамінні коферменти I групи Гем: транспорт е-

Гем:

Протопорфірин ІХ

Fe+2

Page 8: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

8

Каталаза

2Н2О2 → 2 Н2О + О2

Пероксидаза

Н2О2 → Н2О + О атомарний кисень

Біол. роль : гем входить до складу- цитохромів - каталази, пероксидази

Page 9: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

9

Глутатіон (GSH) - трипептид

γ-глутамініл-цистеїніл-гліцин

Активна частина - SH-група

Page 10: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

10

кофермент глутатіонпероксидази (антиоксидант)

Глутатіонпероксидаза

Н2О2 + 2G-SH 2Н2О + GS-SG

GSH переносить атоми Н2G-SH ↔ GS-SG

Глутатіон-дисульфід

Page 11: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

11

Убіхінон (КоQ) Убіхінол (КоQН2)

Вітамінноподібні Ко I групи

Убіхінон (Коензим Q) –

Переносить атоми Н (Н+ та ē) в дихальному ланцюгу мітохондрій

Page 12: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

12

Ліпоєва кислота – у складі піруватдегідрогенази (ПДГ), -КГДГ бере участь в окисному декарбоксилуванні -кетокислот

Ліпоєва к-та Дигідроліпоєва к-та

При нестачі ЛК зростає піруват в крові !!!

Page 13: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

13

ТГБП (тетрагідробіоптерин) – переносить Н

(дигідробіоптерин)

Фенілаланін Тирозин

Фенілаланінгідроксилаза

ТГБП ДГБП

Кофермент фенілаланінгідроксилази (фен → тир)

ÒÃÁÏ ÄÃÁÏ- 2Í

+ 2Í

Page 14: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

14

5′-дезоксиаденозилкобаламін - похідне віт. В12 (кобаламіну)

Кофермент метилмалоніл-КоА-мутази: метилмалоніл-КоА → сукциніл-КоА

Вітамінні коферменти I групи

Page 15: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

15

Аскорбінова кислота (віт. С)

γ-лактон 2,3-дигідро-L-гулонової кислоти

Page 16: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

16

Біол.роль АК: участь в р-ціях гідроксилювання

дофаміну в норадреналин; триптаміну в 5-окситриптамін

проліну та лізину в гідроксипролін та гідроксилізин в колагені

кортикостероїдів, віт.D ( у кальцитріол), пара- гідроксифенілпірувату в гомогентизинову кислоту

OH

CH2 CH2 NH2

OH

OH

CH CH2 NH2

OH

OH

Î 2Í 2Î

Àñê î ðá³í î âà ê è ñë î òà

Äî ô àì ³í Í î ðàäðåí àë ³í

CON

H

OHÎ 2

Í 2Î

Àñê î ðá³í î âà ê è ñë î òà

CON

H

OH

OH

Ï ðî ë ³í óäðî ê ñè ï ðî ë ³í

Page 17: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

17

Авітаміноз С - цинга (скорбут)зниження активності проліл- та

лізилгідроксилаз → зменшення вмісту оксипроліну та оксилізину → порушення синтезу колагенуЗапалення ясен, випадіння зубів, точкові крововиливи (петехії), анемія

Page 18: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

18

НАД+ та НАДФ+ - похідні віт.РР (нікотинаміду)

НікотинамідАденінДинуклеотидНікотинамідАденінДинуклеотидФосфат

Page 19: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

19

НАД+, НАДФ+

переносять гідрид-аніон (Н- = H + е)

нікотинамід

CH3 CH COOH

OHÏ ³ðóâàò

CH3 C COOH

O

Ëàê òàò

+ Í ÀÄ+

- Í ÀÄÍ 2

Ëàê òàòäåã³äðî ãåí àçà

N+

C

O

NH2

R

N

C

O

NH2

R

HH

2Í + H+

Í ÀÄ+ Í ÀÄÍ

Í +, å-

Í +å-+

Page 20: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

20

НАД, НАДФ – коферменти піридинзалежних дегідрогеназ, редуктаз

тканинне дихання гліколіз декарбоксилування -кетокислот ЦТК -окиснення та синтез жирних кислот пентозофосфатний шлях синтез холестерину та стероїдів гідроксилювання ксенобіотиків

Page 21: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

21

Некоферментні функції НАД:

♥ субстрат для ДНК-лігазної реакції (репарація ДНК)

♥ синтез полі-АДФ-рибози (регуляція

синтезу білка)♥ алостеричний регулятор

ферментів (ЦТК, глюконеогенез)

Page 22: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

22

ФМН, ФАД – похідні рибофлавіну (віт. В2 )

ФлавінМоноНуклеотидФлавінАденінДинуклеотид

Page 23: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

23

Жовтий колір Безбарвний

ФМН, ФАД переносять 2 атоми НДіюча частина – флавін (кільце ізоалоксазину)

Page 24: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

24

ФАД, ФМН у складі дегідрогеназ каталізують

оборотне дегідрування субстратів

ПДГдихальний

ланцюг СДГЦТК-окиснення

жирних кислот

Page 25: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

25

ФАД, ФМН у складі оксидаз –

переносять Н+, е- на О2 з утворенням Н2О2

оксидази D- та L-амінокислот

ксантиноксидаза

моноаміноксидаза

CH

OH

CH2 NH2

OH

OH

OH

OH CH

OH

CO

HH2O2

NH3+ +

í î ðàäðåí àë ³í

+ Î 2 + Í 2Î

ÔÀÄì î í î àì ³í î î ê ñè äàçà

Page 26: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

26

Вітамін Е (токоферол) – кофермент

десатурази жирних кислот

стеаринова к-та → олеїнова к-та

С17Н35СООН → С17Н33СООН

Утворення моноєнових ЖК -СН2-СН2- → -СН=СН-

Page 27: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

27

Фосфати нуклеозидів (АТФ, ГТФ, УТФ, ЦТФ)

Фосфати вуглеводівКоферменти трансфераз, кіназ

Невітамінні коферменти ІІ групи

глюкокіназа

Глюкоза + АТФ → Глюкозо-6 фосфат + АДФ

трансфераза

Глюкоза-1-фосфат + УТФ → УДФ-глюкоза + Фн

Page 28: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

28

Вітаміноподібні Ко IІ гр.:

Карнітин - транспорт жирних кислот в мітохондрії

Ацил + НО-карнітин → Ацил-карнітин

N+

CH2 CH CH2 COOH

OH

CH3

CH3

CH3

Page 29: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

29

Вітамінні коферменти IІ групи:

Тіаміндифосфат (ТДФ) – похідне тіаміну (віт. В1).

Каталізує у складі ПДГ – окисне декарбоксилування пірувату транскетолази – переніс глікоальдегідної гр.

При дефіциті ТДФ - ↑ піруват в крові

піримідинове кільце тіазолове кільце

пірофосфатний залишок

N

N

NH2

CH2 N+

S CH2 CH2 O P

O

O

OH

P

O

OH

OH

CH3

CH3

Page 30: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

30

Коензим А (КоА-SH) - похідне пантотенової кислоти (віт. В5).

Робоча частина КоА-SH SH-група β-меркаптоетиламіну

КоА-SH - нуклеотидна будова

віт. В5

Page 31: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

31

КоА-SH активує та переносить ацили у складі ацилтрасфераз

Активація оцтової кислоти в ацетилS-КоА

Активація жирних кислот - в ацилS-КоА

Входить до складу ПДГ

CH3 COOH + ÀÒÔ + Êî À-SH CH3 C

O

SKoA+ H2Î

Î öòî âà ê è ñë î òàÀöåòè ë -Êî À

Page 32: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

32

Піридоксальфосфат (ПАЛФ) - похідне піридоксину (вітаміну В6).

ПАЛФ ПАМФN

CO

H

OH

CH3

CH2 O P

O

OH

OH

N

CH2OH

CH3

CH2

NH2

O P

O

OH

OH

Ï ³ðè äî ê ñàëüô î ñô àò Ï ³ðè äî ê ñàì ³í ô î ñô àò

Page 33: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

33

ПАЛФ у складі трансаміназ – переносить NH2-групу

гістидин → гістамін + СО2

декарбоксилаз – відщеплює СО2 від АК

АЛТ, АСТ

Page 34: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

34

Біоцитин (ε-N-біотиніллізин) – похідне біотину (віт. Н).

У складі карбоксилаз переносить

СООН-групу у формі карбоксибіотину

Біотин + СО2 + АТФ → Карбоксибіотин

імідазол

тіофен

Page 35: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

35

Піруваткарбоксилаза:

CH3-CO-COOH +СО2 + АТФ →

HOOC-CН2-СО-СООН + АДФ + Фн

Page 36: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

36

ацетил-КоА-карбоксилаза:

ацетил-КоА → малоніл-КоА

CH3-CO~SКоА + СО2 + АТФ →

HOOC-CН2-СО~SКоА + АДФ +Фн

транскарбоксилаза

А-СООН + В → А + В-СООН (без АТФ!!!)

Page 37: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

37

Тетрагідрофолієва кислота (ТГФК) – похідне фолієвої к-ти (віт. В9)

фолатредуктаза, НАДФН2

ФК → ДигідроФК (Н2-фолат)

дигідрофолатредуктаза, НАДФН2

ДГФК → ТГФК (Н4-фолат)

N

NNH

NH

OH

NH2

CH2 NH C N

O

CH

H

COOH

CH2

CH2

COOHï òåðè äè í

ï àðà-àì ³í î áåí çî é í à ê è ñë î òà

ãëóòàì àò

Page 38: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

38

ТГФК переносить одновуглецеві фрагменти:• метильний –СН3

• метиленовий –СН2–

• метенільний –СН=• оксиметильний –СН2–ОН

• формільний –СОН • формімінний –СН=NH

Біол. роль: - синтез нуклеотидів (ТМФ), ДНК- обмін амінокислот (мет, глі, сер)- синтез ацетилхоліну, адреналіну

Page 39: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

39

Page 40: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

40

Метилкобаламін –

похідне кобаламіну (віт. В12) Co2+

N

N

N

NN

O

PN

OO

-

OO

NH

O

O

O

O

OH

O

O

O

CH3

CH3

CH3

CH3NH2

NH2

NH2

CH3

NH2

NH2

NH2

CH3CH3

CH3

OH

CH3

CH3

CH3

HH

H

H

â³òàì ³í Â12

Входить до • трансметилаз • метіонінсинтетазиБіол. роль: • переносить СН3- групу з метил-ТГФК на

гомоцистеїн при ресинтезі метіоніну

Í 4-ô î ë àò

Í 4-ô î ëàò-ÑÍ 3

Êî áàë àì ³í -ÑÍ 3

Êî áàë àì ³í CH2 CH2 CH COOH

S CH3 NH2

CH2 CH2 CH COOH

SH NH2

ì åò³î í ³í

ãî ì î öè ñòå¿í

Page 41: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

41

Дефіцит метилкобаламіну, ТГФК, ПАЛФ

Гіпергомоцистеїнемія:

ГЦ > 15 мкМ

Ранні інфаркти та інсульти

Page 42: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

42

•НАД, ФАД, ліпоєва к-та, ТДФ, КоА

•Піруватдегідрогеназа•Дигідроліпоїлацилтрансфераза•Дигідроліпоїлдегідрогеназа

Окисне декарбоксилування ПВК:

Page 43: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

43

Вітамін А (ретинол) - кофермент глікозилтрансфераз

- переносить олігосахариди через мембрани Участь в синтезі глікопротеїнів - муцинів (слизу)

Page 44: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

44

Ретинол – антиксерофталмічна дія

Недостатність ретинолу Ксерофталмія Кератомаляція

Ксеростомия

Page 45: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

45

Вітамін К - кофермент γ-глутаміл-карбоксилази

Карбоксилує глутамат в білках у

γ-карбоксиглутамат (може зв’язувати Са2+ )

Синтез: протромбіну (ІІ), VІІ, ІХ, Х факторів зсідання

крові білків кісткової тканини

Page 46: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

46

Дикумарини - антагоністи віт. К

- інгібітори γ-глутамілкарбоксилази

антитромботичні!!!

Інгібування

Page 47: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

47

Коферменти - лікарські засоби

♥ ТДФ -кокарбоксилаза

♥ ПАЛФ♥ Ліпоєва кислота

(берлітіон)

Page 48: Лекція 2. Коферментиbiochem.vsmu.edu.ua/biochem_common_u/lect-02.pdf · 2018-02-14 · 1 Лекція 2. Коферменти 1. Визначення, класифікація

48

Дякую за увагу!