日本バイオインフォマティクス学会

バイオインフォマティクスカリキュラム中間報告カリキュラム検討委員会

カリキュラム検討委員会

委員長 小長谷　明彦　（北陸先端大・理研 GSC）

委員

有田　正規　（産総研）宮野　悟　　（東大・京大）森　浩禎　　（奈良先端大）八尾　徹　　（理研 GSC）

バイオインフォマティクス教育の

位置付け難易度

年齢一般啓蒙教育

バイオインフォマティクス技術者教育

バイオインフォマティクス

大学院教育

テクニシャン育成

中核的研究者・技術者

育成

情報系

バイオ系

大学教育 OJD

育成される人間像

情報系 バイオ系

バイオインフォ系

・バイオがわかる情報研究者・技術者・コンピュータを使えるバイオ研究者・技術者・情報系およびバイオ系をまとめるコーディネータ的研究者・技術者

BIカリキュラム概要数 学

物理 化 学分 野

生 命医 学 分 野

学部レベル 大学院レベル

リテラシー教育 基本科目 専門科目

分 子生 物 学

入 門

プ ロ グ ラ ミ ン グ

入 門

主テーマ副副主テーマ副副主テーマ副副研究プログラム（異分野の補完）

OR

OR

OR

バ イ オ イ ン フ ォ

マ テ ィ ク ス概 論

バイオインフォマティクスと社会

応用 BI特論（医療）配列アルゴリズム論配列情報解析論パターン認識論ゲノム進化論分子モデル論分子構造論分子機能論

知識情報処理論システム生物学

応用ＢＩ特論（工学）

数理統計特論統計解析特論最適制御特論

遺伝解析特論

計算化学特論

画像解析特論高速計算特論

情 報分 野

ゲノムデータベース論

分子生物学入門（１）・ DNA、 RNAからアミノ酸化学結合、セントラルドグマ、遺伝子構造、転写、翻訳

・アミノ酸からタンパク質タンパク質、アミノ酸の性質と構造、機能

・核、細胞質、細胞膜ゲノム構造、細胞膜、膜タンパク質

・原核生物、真核生物原核真核の違いと進化、細胞小器官、代謝

・細胞のライフサイクル細胞分裂、細胞周期、分化、情報伝達

分子生物学入門（２）・シーケンシング、ｃ DNAライブラリ・配列アラインメント・ゲノム構造と遺伝子予測・データベース検索・転写シグナル、発現制御・ゲノム比較・タンパク質の構造、活性部位と機能・分子間ポテンシャル・タンパク質の構造分類・タンパク質の構造予測・発現プロファイルとプロテオーム、メタボローム解析・酵素反応とタンパク質相互作用・システムとしての生命理解

プログラミング入門•UNIXファイル構造と shell•Shellコマンド•ホームページ作成•WWW上のデータベース利用法•Perlプログラミング•プログラミング言語の基礎

バイオインフォマティクス概論

•配列解析の基礎BLAST検索、検索結果の処理、WWW上の解析ツール

•遺伝子アノテーション文字列処理とデータベース

•タンパク質のデータベース構造分類とスレ ッディング入門

•WWWページ作成•HTML•JAVAアプレ ット

学部教育

•細胞制御•細胞の構造と働き•細胞と病理•分子進化•遺伝解析•組替え DNA技術

生命・医学分野

数学・物理化学分野•解析学•線形代数学•確率論•統計論

情報分野

•離散構造•論理学•アルゴリズム•プログラミング言語•データベース•知能システム•数 値計算

•物理学•有機化学•タンパク質の物理

大学院教育（基本項目）•バイオインフォマティクスと社会

•生 物進化•歴史•特許•倫理

•分子機能論•構造分類•酵素機能

•システム生物学•生 体モデリング•生 体システム制御•ネットワーク解析•ゲノムデータベース論

•ゲノム計画•ゲノムデータベース•データベース処理技術

•配列アルゴリズム論•DP、アラインメント•マルチプルアラインメント•RNA二次構造

•配列情報解析論•文字列照合•配列数理統計•配列情報量

•ゲノム進化論•置換確率モデル•進化系統 樹•比較ゲノム、分子進化

•分子モデル論•構造決定•配座エネルギー計算•分 子 力学•基準振動解析

•分子構造論•二次構造、膜貫通部位•立体構造予測•分 子 設計

•知識情報処理論•データマイニング•遺伝子発現•プロテオーム解析•メタボローム解析

•パターン認識論•特徴抽出と判別 分析•ベイズ推定•隠れマルコフモデル•ニューラルネットワーク

大学院教育（選択項目）

•数理統計特論•確率統計•確率母関 数•マルコフ連鎖•ランダムプロセス

•最適制御特論•フィードバック制御•伝達関 数•安定性判別•最適化 手法

•統計解析特論•分 散解析•回帰 分析•重回帰モデル•時系列分析•主成分分析

•画像解析特論•画像処理技術•画像比較•NMRスペクトル分析

•高速計算特論•並列プログラム•並列アルゴリズム•分 散処理•専用ハードウエア

•応用 BI特論（医療）•医療、 再 生 医学•ゲノム創薬•SNPと診断

•応用 BI特論（工学）•育種戦略•生 物工学、代謝工学•ナノテクノロジー

•遺伝解析特論•集団遺伝学•遺伝子 連鎖•地図、 QTL解析 •計算化学特論

•構造最適化•QSAR解析•量 子 化学計算

謝辞

産総研　生命情報科学研究センターの 皆様東京大学医科学研究 所ヒトゲノム解析センターの皆様生物分子工学研究 所　藤　博幸先生