Кафедра цитологии и генетики -...

39
Изменчивость Жизнь невозможна без очень точной репликации Эволюция невозможна при абсолютно точной репликации

Upload: others

Post on 06-Jun-2020

14 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Изменчивость

Жизнь невозможна без очень точной репликации

Эволюция невозможна при абсолютно точной репликации

Page 2: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Источники изменчивости: рекомбинация

Page 3: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Мутационный процесс и храповик Мёллера

Page 4: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

X

Преодоление храповика Мёллера

Бесполое размножение

Половое размножение

Мутационная деградация клона

Свободная от мутаций

гамета

Перегруженная мутациями

гамета

Page 5: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Недостатки и преимущества секса и рекомбинации

• Недостатки – Низкая эффективность размножения

– Трата времени на поиск партнера и ухаживание

– Трата ресурсов на бесполезный пол (догадайтесь какой)

– Передача только половины генов потомству

– Опасный и расточительный способ производства гамет

– Разрушение опробованных аллельных ассоциаций

• Преимущества – Устранение вредных мутаций (борьба с

храповиком Меллера)

– Репарация повреждений ДНК

– Объединение полезных мутаций

– Совершенствование межгенных коопераций

– Образование новых генных ассоциаций для

• Выхода из конкурентного тупика (Заросший пруд)

• Снижения конкуренции сибсов

• Жизни в непредсказуемом мире (Красная королева)

– Борьба с дрейверами

Page 6: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Сравнительная эффективность бесполого и полового размножения

Page 7: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Плата за половое размножение

Page 8: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Плата за половое размножение: груз самцов

Page 9: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Плата за мейоз потомки бесполых наследуют ВСЕ гены родителя,

потомки половых - только половину

Page 10: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

L Z EP MP M-I ANA-II

Нарезать ДНК в лапшу

Из 20 ДНР сделать один кроссинговер

Разрушить опробованные аллельные ассоциации и создать неизвестно какие, но новые

300-10000 ДНР

20-50 Кроссоверов

Плата за мейоз

Page 11: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Если плата за секс и рекомбинацию так высока, почему они возникли в ходе

эволюции и так сильно распространены среди эукариот?

Это могло произойти только в том случае, если преимущества сильно

прикрывают недостатки

Page 12: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

X

Преимущества рекомбинации 1. Преодоление храповика Мёллера

Бесполое размножение

Половое размножение

Мутационная деградация клона

Свободная от мутаций

гамета

Перегруженная мутациями

гамета

Page 13: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

L Z EP MP M-I ANA-II

Репарировать мутации по интактной копии

Разрушить старые аллельные ассоциации и создать новые

300 ДНР

20-50 Кроссоверов

Преимущества рекомбинации 2. Репарация мутаций

3. Быстрое накопление благоприятных комбинаций мутаций

Использовать ДНР для поиска гомологии

Page 14: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Двунитевые разрывы (ДНР)

Внедрение цепи

Некроссоверный путь

Репарация цепи

Лигирование цепи

Использование ДНР для репарации

Кроссоверный путь

Преимущества рекомбинации 2. Репарация мутаций

Page 15: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Преимущества рекомбинации 3. Быстрое накопление благоприятных комбинаций

мутаций

Бесполое размножение

Половое размножение

aabb aaBb aabb aabb aabb aabb Aabb Aabb aabb aabb aabb aaBb aabb aabb

Стартуем с аавв. Наилучший генотип А_В_

Page 16: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Гаплотипы – набор тесно сцепленных маркеров в одной хромосоме, которые наследуются

вместе

Page 17: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Преимущества рекомбинации

4. Преодоление эффекта попутного транспорта (Hitchhiking effect)

• За счет тесного сцепления с адаптивными

аллелями в популяциях могут распространяться нейтральные или даже вредные аллели.

• Рекомбинация препятствует этому

Page 18: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Эффект Хилла-Робертсона

Page 19: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Преимущества рекомбинации 5. Преодоление эффекта Хилла-Робертсона

• Рекомбинация препятствует обеднению генофонда популяций

• Рекомбинация способствует сохранению разнообразия в генофондах популяций

Page 20: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

6. Преимущества рекомбинации Проверка межгенной кооперации

Отн

оси

тел

ьная

пр

исп

осо

бл

енн

ост

ь

Генетический фон

Page 21: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Межгенная кооперация

• Рекомбинация способствует отбору оптимальных «компанейских» аллелей,

Page 22: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Преимущества рекомбинации 7. Снижение конкуренции сибсов

Половое размножение Бесполое размножение

Page 23: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Преимущества рекомбинации 7. Снижение конкуренции сибсов

• Благодаря рекомбинации в каждой семье есть разнообразие

– и тем самым снижается конкуренция сибсов

– и тем самым повышается приспособленности их родителей

Page 24: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Преимущества рекомбинации 8. Красная королева "in this place it takes

all the running you can do, to keep in the

same place."

Page 25: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Sorex areneus

Felis catus

Vulpes vulpes

B B

Canis familiaris

XY

XY

Mustela vison

Mus musculus

XY

XY

XY

Частота и распределение рекомбинации у млекопитающих

XY

Page 26: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Частота рекомбинации у млекопитающих Тестирование гипотез

Красная королева или Конкуренция сибсов

Зависимость эксцесса числа сайтов MLH1 над гаплоидным числом хромосом от времени смены поколений (в месяцах, логарифмическая шкала) и размера помета. Синим представлены данные по полевкам, красным – по остальным млекопитающим.

Page 27: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Преимущества рекомбинации 8. Красная королева

• В непредсказуемом мире успехом пользуются неожиданные свойства (новые комбинации аллелей)

• В гонке вооружений с паразитами новые и редкие комбинации аллелей получают преимущество

Page 28: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Преимущества рекомбинации 9. Подавление драйверов

• Мейотический драйв - (или нарушение расщепления) преимущественная передача потомству одного из аллелей гетерозиготного родителя.

Page 29: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Медея

Page 30: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Преимущества рекомбинации Подавление драйверов (Медея у мучного червя)

Драйв без рекомбинации – незаконная выгода

Драйв при рекомбинации – самоубийство

A

T

A+

T +

A

T

A+

T T +

A A+

T +

A

т

A

T

A

T

A+

T+

A+

T +

A+

T +

T A TA

T+A+

T + T A

T+A+

A+

T

A+

T +

Page 31: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Преимущества рекомбинации 7. Подавление драйверов Segregation distortion у

дрозофилы

Драйв без рекомбинации – незаконная выгода

Драйв при рекомбинации – самоубийство

R

S

R+

S +

R

S

R+

S

S +

R R+

S +

R

S

R

S

R

S

S

R+

S +

R+

S +

R+

S +

S S S + S +

S + S + S

Page 32: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Недостатки и преимущества секса и рекомбинации

• Недостатки – Низкая эффективность размножения

– Трата времени на поиск партнера и ухаживание

– Трата ресурсов на бесполезный пол (догадайтесь какой)

– Передача только половины генов потомству

– Опасный и расточительный способ производства гамет

– Разрушение опробованных аллельных ассоциаций

• Преимущества – Устранение вредных мутаций (борьба с

храповиком Меллера)

– Репарация повреждений ДНК

– Объединение полезных мутаций

– Совершенствование межгенных коопераций

– Образование новых генных ассоциаций для

• Выхода из конкурентного тупика (Заросший пруд)

• Снижения конкуренции сибсов

• Жизни в непредсказуемом мире (Красная королева)

– Борьба с дрейверами

Page 33: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Как жить без секса (рекомбинации) и быть счастливым

• Очень стабильная среда

• Очень маленькие геномы (<5000 генов)

• Очень быстрая смена поколений

• Очень многочисленные популяции

• Очень интенсивный отбор

Page 34: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Переключения типов размножения

Бесполое - когда хорошо Половое – когда плохо

Page 36: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Древние асексуальные скандалы (коловратки)

• Многочисленность популяций

• Постоянно нарастающая гетерозиготность (гетерозис)

• Ангидробиоз – (смерть паразитам) двунитевые разрывы – репарация- митотическая конверсия

Page 37: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Литература

http://evolution2.narod.ru/recpap.pdf

Page 38: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Литература

http://evolution2.narod.ru/invpriroda.pdf

Page 39: Кафедра цитологии и генетики - Изменчивостьcag.nsu.ru/wp-content/uploads/2013/03/evolution13-06.pdf · 2013-03-22 · Недостатки и

Литература

http://www.ozon.ru/context/detail/id/6752674/

Возникновение и эволюция пола и рекомбинации