β-talasemİnİn molekÜler tanisi
TRANSCRIPT
ββ--TALASEMİNİN TALASEMİNİN MOLEKÜLER TANISIMOLEKÜLER TANISI
DÜZEN GENETİK HASTALIKLAR TANI MERKEZİ
SERPİL ERASLAN, PhD
BETA TALASEMİHEMOGLOBİNOPATİLER
Otozomal resesif (globin gen ailesi)Özellikle Çukurova, Akdeniz kıyı şeridi, Ege ve Marmara bölgelerinde talasemi taşıyıcılığı çok sık görülmektediriç Anadolu,Doğu ve Güneydoğu Anadolu ?Beta-talasemi taşıyıcı sıklığı
Türkiye geneli : %2.1En sık görülen illerde : %4.3Dünyada : %5
Türkiye'de yaklaşık 1.300.000 taşıyıcı ve 4000 hasta Akraba evliliği oranı %25 (%70’i 1oakraba)
Urfa: % 6.4K.Maraş: %0.7Edirne: %6.4Aydın: % 5.1Muğla: % 4.5İzmir: %4.8Diyarbakır: %3.6Antalya: %13.1Mersin: %2.3istanbul: % 4.5Denizli: %2.6Antakya: %4.6Kırklareli: % 3.4İsparta: %2.4Bursa: %1.7Adana: %3.7
Muğla: %0.5Diyarbakır: %0.5Antalya: %2.5Mersin: %13.6Antakya: %10.5Adana: %10.0
Sağlık Bakanlığı ve UHK Değerleri(Toplam 377.339 kişi)
Talasemi ve anormal hemoglobin sıklığının 16 ilde dağılımı
Hemoglobinopatiler : HbS
Türkiye’nin Talasemi Haritası
Ref : Sağlık Bakanlığı AÇSAP Genel Müdürlüğü
Globin gen ailesi ve
Beta globin geni
Kromozom 113 ekson, 2 intron~2000 bçmRNA : 626bProtein : 147aa
BETA GLOBBETA GLOBİİN GEN TOPLULUN GEN TOPLULUĞĞUUKromozom 11Kromozom 11
ALFA GLOBALFA GLOBİİN GEN TOPLULUN GEN TOPLULUĞĞUUKromozom 16Kromozom 16
Hemoglobin
2α + 2β
Hemoglobinopati Kontrol Programı İle Tanı Ve Tedavi Merkezleri Yönetmeliği
Kapsamı
EğitimTarama Hastaların tedavilerine ilişkin her türlü faaliyetler Tanı ve tedavi merkezleriKayıt, bildirim, sevk ve izin işlemleri Genetik danışma Doğum öncesi ve sonrası tanı
Moleküler Yaklaşım-1Genetik Danışma
Evlilik öncesi tam kan sayımı ve hemoglobin elektroforezi
Evlilik öncesi yapılmamışsa, gebelik öncesi veya gebeliğin erken döneminde eşlerin hematolojik değerlendirmelerinin yapılması gerekir
Hemoglobinopati / beta talasemi ayırımı = TANITaşıyıcı bireylerde mutasyon analiziMutasyonu tespit edilen bireylerde prenataltanı amaçlı yönlendirme
Beta Globin Gen Veribankasıhttp://globin.cse.psu.edu
Toplam – 1215 (hemoglobin varyantları ve talasemi)Varyantlar – 909Talasemi – 352Varyant + talasemi – 46
Beta geni (toplam) – 680Talasemi mutasyonları – yaklaşık 200
Türk toplumu – yaklaşık 45 mutasyon (~ %95)Bilinmeyen mutasyonlar - ~ %5En sık görülen varyant – HbS – Orak hücre anemisi
Türk Toplumunda Belirlenmiş ve Çalışma Kapsamımızda Olan Mutasyon Frekansları
3.1-30
0.8-87
?HbC
4.4HbS
1.2FSC8/9
<1FSC44
<1FSC36/37
<1FSC22
5.5FSC-8
0.6FSC-6
2.1FSC-5
<1Cd39
<1Cd30
<1IVS-I-25
5.1IVS-II-745
4.9IVS-II-1
0.2IVS-I-116
14.75IVS-I-6
1.1IVS-I-5
<1IVS-I-2
5.1IVS-I-I
42.3IVS-I-110
Frekansı (%)Mutasyon ismi
Σ = ~%93
Moleküler Yaklaşım-2Genotip-Fenotip Korelasyonu
Mutasyon tespit etme oranı –%93-97Genotip
Beta_0 mutasyonlar – beta zinciri (-) Beta_+ mutasyonlar – beta zinciri bozuk / eksik
Beta_0/N veya beta_+/N – (minör)Beta_0/beta_0 (majör)Beta_0/beta_+ (majör)Beta_+/beta_+ (majör, intermedia)Beta_0/HbS (ağır)Beta_+/HbS (ağır)
FenotipMutasyon türüneMutasyon lokalizasyonunaMutasyonun homozigot mutant veya kompound heterozigot oluşu ile yakından ilişkilidirSessiz taşıyıcılar
Mutasyon Analiz Sistemlerimiz
Polimeraz zincir reaksiyonu (PZR; PCR)’a dayalı teknikler
Allele özgü primer analizleri (ARMS,ASO)Restriksiyon enzim analiziHeterodupleks analiziMutasyon kitleri (hibridizasyon uygulamali)Beta globin gen dizi analizi
Mutasyonun tespit edilmesi neden önemli?
Hastalığın tanısını kesinleştirirKesin tanıyı desteklerTaşıyıcılık tanısı ve prenatal tanıda kesin sonuç verilebilir
Çalışma Kapsamımız
Beta-talasemimutasyonlarının analiziVaryantlar
HbSHbCHbDHbE
NUMUNE TÜRÜ
K3EDTA’lı tam kan (5cc)DNA izolasyonu sırasında
Sitratlı-Heparin’li tüpe alınmış,EDTA’lı tüpe alındığı halde pıhtılaşan,Hemolizli kanlar işleme alınmaz.Belli ilaçların kullanımı (kumadin vs.) sorun oluşturabilir
Prenatal tanı materyali Koriyon villus biyopsisi (CVS)Amniyotik sıvı materyali (AFS)Kordon kanı
Diğer materyaller*
HASTA KABULU VE ANALİZLERE DESTEK OLMASI AÇISINDAN
ÖNEMLİ NOKTALAR
Hasta/aile bilgilerinin tam olmasıAile ve doktorların iletişim adreslerinin tam olmasıBilgilendirilmiş hasta onay formunun doldurulmasıβ-talasemi hastalarının kayıtlarında hemoglobin elekroforezi ve tam kan sayım sonuçları (ÖNEMLİ)
Taşıyıcılık Tanısı
Ailede daha önce görülen bir vaka varsa
Taramalar sırasında hemoglobin A2 değerleri belirgin bir şekilde ↑ -mutasyon %95’’in üzerinde tespit edilirse
Hemoglobin A2 değerleri sınırda ise
TAŞIYICILIK TANISI YAPILMALIDIR
PRENATAL TANI
Öncesinde mutlaka ailede DNA analizi yapılmalıdırEşlerden her ikisinde de mutasyon belirlenmiş ise P.T. Kesin tanı verilebilirEşlerden sadece bir tanesinde mutasyon belirlenebilmiş ise P.T. eksklüzyon analizi ile verilebilir. Sonuç %50 kesindir23.gebelik haftasından sonra numune kabul edilmezBu hastalığın prenatal tanısı sırasında cinsiyet analizi kesinlikle yapılmaz
ÇALIŞMA SONUÇLARIMIZHaziran 1996 – Eylül 2005
TOPLAM AİLE SAYISI : 290TOPLAM ANALİZ SAYISI : 389
Mutasyon analizi : 263Prenatal tanı :126
MUTASYONU TESPİT REKANSIMIZ ~%89Geliştirilen mutasyon spekturumuSınır A2 değerleriŞüpheli klinik
DNA DİZİ ANALİZİ İLE BELİRLENEMEYEN MUTASYONLARIN TARANMASI
DÜZEN GENETİK HASTALIKLAR TANI MERKEZİ
Uzman Dr. Belgin Eroğlu Kesim, MDBiyolog Dr. Bilgen Dölek, PhDBiyolog Sevim Güz Eroğlu, BScBiyolog Günay Karataş, BScYüksek Biyolog Gülfer Gültekin, MScBiyolog Aslı Dağdemir
KATILIMINIZ İÇİN TEŞEKKÜRLER