11 nuclear acids

12

Upload: nizhgmaru

Post on 19-Feb-2017

159 views

Category:

Education


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: 11 nuclear acids
Page 2: 11 nuclear acids

Nuclear acid

+Н2ОMono-

nucleotide

+Н2ОNuclear base+ Ribose (Deoxyribose) + Н3РО4

Nuclear acid RNA

DNA

НО-СН2

Н НОНО

ОН ОН

β-Ribofuranose

β-Deoxyribofuranose

Н Н

НО-СН2

Н НОНО

ОН НН Н

НО Р О

О

НО

СН2 О NBase

Р О

О

НО

НО Р О

О

НО

СН2 Р О

О

НО

О О

PentosePhosphoric acid fragment

НОН

рН>7

НО-СН2 ОN N +НОН

рН<7

Pentose +

Nuclear Base+Н3РО4

Nucleoside

Nucleotide

Page 3: 11 nuclear acids

Nuclear Bases.

N

N

Н

О

О

N

N

Н

О

О

CH3

Н

NH2

Urasil U RNA

Thymine T DNA

Cytosine C

N

Н

N

N

N

NH2

N

Н

NN

N

О

NH2

Н

Guanine GAdenine А

Н Н

N

N

О

DNA, RNA

Page 4: 11 nuclear acids

N

N

Н

О

О

СН3

N

Н

NN

N

О

Н

(Nucleotide Inosine)

Hypoxanthine3 – N – Methyluracil

м3 U

N

Н

N

N

N

О

NH2

СН3

N

Н

NN

N

О

N(СH3)2

Н

1 – N – Methylguanineм1 G 2 – N, N –

Dimethylguanineм2

2 G

Page 5: 11 nuclear acids

N

N

Н

О

О

Н

5 - Fluorouracil

F

N

Н

NN

N

SH

6 - Mercaptopurine

Page 6: 11 nuclear acids

НО-СН2

Н НОНО

ОН ОНН Н

N

N

Н

О

О

Н

-Н2О

Cytosine-Cytidine

Thymine-Thymidine

НО-СН2

Н Н

О

ОН ОНН Н

N

N

О

О

Н

N – Glycosidicbond

Uracil Uridine -idine

НО-СН2

Н НОНО

ОН НН Н

N

Н

N N

N

NH2

+-Н2О

НО-СН2

Н Н

О

ОН НН Н

N

N N

N

NH2

-osineAdenine Deoxyadenosine

Page 7: 11 nuclear acids

НО Р

О

НО

ОН НО ----СН2

Н Н

О

ОН ОНН Н

N

N N

N

О

Н

+-Н2О

NH2НО Р О

О

НО

О N Р СН2

G

Н Н

ОНОНН Н

Ester Bond

Guanosine-5’-phosphateor -5’- GMP

НО-СН2

Н НNО

О ОНН Н

G

НО Р

НО

О

-Н2О

Guanosine-3’-phosphateor -3’- GMP

Page 8: 11 nuclear acids

dGMP Deoxyguanosine – 5’ –phosphateCMP Cytidine – 5’ –phosphatedCMP Deoxycitidine – 5’ – phosphateUMP Uridine – 5’ –phosphateТМP Thymidine – 5’ –phosphate

Cyclic Nucleotide

СН2

Н НNО

О ОНН Н

Р

НО

О

Adenosine– 3’,5’ – cyclophosphate

Nucleotidepolyphosphate

НО – Р – О – Р – О – Р – О –СН2

high-energy phosphate bonds

Н НNО

ОН ОНН Н

AО О О

ОН ОН ОН

ATP

АТФ + Н2О АДФ + Н3РО4 ;

6<0

cAMP

Page 9: 11 nuclear acids

Nuclear Acid Primary Structure

P P PPentose Pentose Pentose5’ 3’ 5’ 3’ 5’ 3’

Nuclear Base Nuclear Basе Nuclear Base

2 нм5’ 3’

А…..Т

Т…..А

C…..G C…..G А…..Т

Т…..А

G..C Т…..А

Page 10: 11 nuclear acids

Nuclear Acid Secondary Structure

N

N N

N

НN – Н

chain

N

N

О

О

НСН3

N

N N

N

Н – N – Н

N

N

О

О

Н

chain chain chainN Н

Н

А Т G C

l = 1, 08 nml = 1, 11 nm

НО Р

О

ОО

СН2 О А

НО Р О

ОО

СН2 О G

НО Р О

ОО

СН2 О C

ОТ СН2 О

Р НОО

О

ОC СН2 О

Р НОО

О

ОG

5’ 3’3’ 5’

Page 11: 11 nuclear acids

Chargaff's rules state that DNA from any cell of all organisms should

have a 1:1 ratio of pyrimidine and purine bases and, more specifically,

that the amount of guanine is equal to cytosine and the amount of

adenine is equal to thymine. This pattern is found in both strands of the

DNA.Chargaff Parity Rule 1

The first rule holds that a double-stranded DNA molecule globally has percentage

base pair equality: %A = %T and %G = %C. The rigorous validation of the rule

constitutes the basis of Watson-Crick pairs in the DNA double helix.

Chargaff Parity Rule 2

The second rule holds that both %A ~ %T and %G ~ %C are valid for each of the

two DNA strands. This describes only a global feature of the base composition in

a single DNA strand.

Chargaff's rules.

1) А + G = C + Т2) А = Т; G = C3) А + C = G + Т

Page 12: 11 nuclear acids

Thank You!