1.aminoacizii proteinogeni
TRANSCRIPT
1.AMINOACIZII CODIFICATI GENETIC
În natură există mai mult de o sută de
aminoacizi, dar acest capitol se va limita la
caracterizarea a unui sfert din aceştia care sunt
cei mai importanţi în biologia mamiferelor şi
bacteriilor. Dintre aceştia toţi sunt constituenţi
ai proteinelor, cu excepţia a patru sau cinci. Toţi
aminoacizii care formează proteinele au gruparea –NH2
legată de atomul de carbon alăturat grupării –COOH. Din
acest motiv aceşti aminoacizi se numesc aminoacizi
(atomii de carbon sunt denumiţi , etc. începând
cu carbonul de care se leagă gruparea –COOH
1. Clasificarea aminoacizilor
O clasificare făcută în funcţie de structura chimică
împarte aminoacizii în 6 clase: monoamino-
monocarboxilici, diamino-monocarboxilici, monoamino-
dicarboxilici, hidroxiamino-acizi, tioamino-acizi şi ciclici.
Cea mai utilizată clasificare a celor 20 de aminoacizi
proteinogeni ţine cont de polaritatea radicalilor R ai
acestora. Utilitatea acestei clasificări rezidă din tendinţa
COOH
H
C
C
C
C
H2N
proteinelor aflate în soluţie apoasă să adopte acele
conformaţii (aranjamente spaţiale ale atomilor constituenţi)
în care radicalii hidrofili (polari) se orientează în aşa fel
încât să fie hidrataţi, iar radicalii hidrofobi ( nepolari) se
orientează astfel încât să excludă contactul lor cu
moleculele de apă.
1. Aminoacizii proteinogeni.
Analiza unui mare număr de proteine a arătat că ele sunt
compuse din resturile a 20 de aminoacizi care participă la
biosinteza lor. Aceşti aminoacizi se numesc proteinogeni
sau "standard". Cu excepţia prolinei toţi ceilalţi sunt -
aminoacizi având structura generală R-CH(NH2)–COOH.
Cu excepţia glicinei, după cum rezultă din structura
generată, la toţi ceilalţi aminoacizi atomul de C este
asimetric.
1. Aminoacizii cu radicali nepolari.
1. Glicina; Gly; G; Acid aminoacetic. Numit şi
glicocol acest aminoacid are cel mai mic radical, un
atom de hidrogen. Glicina constituie o treime din
radicalii aminoacizilor din structura colagenului şi a
gelatinei care este produs al hidrolizei parţiale a
H C
NH3+
COO-
H
colagenului. Organismul sintetizează glicina şi, în afara
biosintezei proteinelor, ea serveşte la sinteza sărurilor
biliare primare, a bazelor purinice ş.a. Glicina este un
neurotransmiţător inhibitor. Ea participă la detoxifierile
hepatice. Datorită volumului său mic, radicalul opune cea
mai mică piedică sterică pentru radicalii vecini,
particularitate importantă pentru stabilitatea moleculei de
colagen.
2. Alanina; Ala; A; Acid -aminopropionic.
Cu excepţia prolinei toţi aminoacizii proteinogeni
pot fi consideraţi ca derivaţi ai alaninei.
Organismul sintetizează alanina iar prin transformările pe
care le suferă în celulă, ea face legătura dintre
metabolismul proteic şi glucidic.
3. Valina; Val; V; Acid -
aminoizovalerianic. Ovalbumina, cazeina şi
globulinele sanguine sunt proteine bogate în
valină. În cursul evoluţiei lor anumite forme de viaţă au
pierdut capacitatea de sinteză a unor aminoacizi. Omul nu
poate sintetiza valina şi prin urmare ea este indispensabilă
în alimentaţia lui. Din acest motiv valina se numeşte
H C
NH3+
COO-
CH3
H C
NH3+
COO-
CHCH3
CH3
aminoacid esenţial. Aminoacizii pe care organismul uman
îi poate sintetiza în suficientă cantitate pentru a acoperi
necesităţile organismului se numesc neesenţiali.
Aminoacizii a căror biosinteză nu acoperă necesităţile se
numesc semiesenţiali.
4. Leucina; Leu; L; Acid -
aminoizocaproic. Este prezentă în cantităţi
însemnate în structura globulinelor. Leucina
este un aminoacid esenţial organismul fiind capabil să o
transforme în compuşi numiţi corpi cetonici. Are o mică
solubilitate în apă. În smalţul incisivilor centrali, de la fătul
uman s-a reuşit izolarea leucinei în cantităţi apreciabile.
Leucină s-a identificat şi într-un peptid izolat din smalţul
imatur de bovine.
5. Izoleucina; Ile; I; Acid -metil-,-aminovalerianic.
Este un izomer de catenă al leucinei,
aminoacid esenţial care ca şi leucina are
o mică solubilitate în apă datorită caracterului hidrofob al
radicalului. În cazul aminoacizilor prezentaţi până acum,
acest caracter se intensifică începând cu glicina şi
terminând cu leucina şi izoleucina care au cei mai
H C
NH3+
COO-
CH2 CHCH3
CH3
voluminoşi radicali. Izoleucina conţine doi atomi de carbon
asimetrici.
6. Metionina; Met; M;
Acid -amino-S-metiltiobutiric. Se
găseşte în cantităţi însemnate în
cazeină. În organism joacă un rol important ca donator de
grupări metil, în reacţia de transmetilare. Favorizează
transformarea grăsimilor insolubile în lecitine mai solubile
împiedicând degenerescenţa grasă a ficatului. Participă la
hematopoeză şi la detoxifierile hepatice. Metionina este un
aminoacid esenţial, principală sursă de sulf organic pentru
organism.
7. Prolina; Pro; P; Acid pirolidin--carboxilic. Este un
-aminoacid cu grupare amino secundară care
face parte din categoria aminoacizilor la care un
atom din grupările funcţionale participă la
închiderea unui ciclu. Structura rigidă, fără libertate de
rotaţie a ciclului prolinei în jurul legăturilor peptidice prin
care el este inserat în catena polipeptidică, influenţează
puternic panta de încolăcirea, specifică, a colagenului.
Prolina este un aminoacid neesenţial. Ea a fost identificată
H2
H2
H2
H
C
CCC
N
-OOC
H
în proteinele izolate din smalţul matur cât şi în smalţul
imatur al fătului, unde reprezintă un sfert din totalul de
resturi de aminoacizi ai proteinei izolate.
8. Fenilalanina; Phe; F. Este prezentă în aproape toate
proteinele cunoscute. Cele mai bogate în
fenilalanină sunt ovalbumina, cazeina,
colagenul. Radicalul ei are o pronunţată
hidrofobicitate. Este un aminoacid esenţial, principală sursă
de nuclee benzenice pentru organism.
9. Triptofanul; Trp; W; Acid -
amino--indolilpropionic. Acest
aminoacid are un nucleu heterociclic
numit indol. Se găseşte în aproape
toate proteinele iar în organism serveşte la sinteza
serotoninei, vitaminei PP ş.a. Triptofanul este un aminoacid
esenţial, lipsa lui din alimentaţie determinând grave
tulburări. Ca şi în cazul fenilalaninei, radicalul său este
foarte hidrofob.
2. Aminoacizii cu radicali polari.
1. Serina; Ser; S; Acid -amino--hidroxipropionic.
Este prezentă în proporţie mare în sericină
H C
NH3+
COO-
CH2
H C
NH3+
COO-
CH2
N
H C
NH3+
COO-
CH2 OH
(proteina mătăsii naturale). Joacă un rol important în
centrul activ al enzimelor numite serin-enzime. O
concentraţie mare de serină s-a găsit în proteinele din
smalţul dinţilor şi pare să fie o caracteristică a proteinelor
din smalţul matur. Rolul posibil al serinei este că de ea legă
o grupare fosfat care este iniţiatoarea formării cristalelor
anorganice din smalţ. De asemene în fosfoproteinele din
dentină, serina şi fosfoserina au o pondere importantă. Tot
de această grupare (OH) se leagă covalent oligozaharidele
(catene de monozaharide sau derivaţi ai lor, cu număr mic
de subunităţi) la catena polipeptidică din structura
glicoproteinelor. Organismul sintetizează serina din glicină
şi o foloseşte chiar şi pentru sinteza unor lipide
(fosfatidilserine).
2. Treonina; Thr; T; Acid -amino--
hidroxibutiric. Omolog superior al serinei,
treonina joacă un rol similar cu al acesteia în
centrul activ al. enzimelor. Este, de asemenea, centru de
legare a oligozaharidelor în glicoproteine. Treonina este un
aminoacid esenţial şi conţine doi atomi de carbon
asimetrici.
3. Asparagina; Asn; N; Acid -amino-
-amidosuccinic. Este amida acidului
aspartic. Gruparea amidică poate fi locul de
legare covalentă a oligozaharidelor în glicoproteine.
Asparagina este mai răspândită în proteinele vegetale decât
în cele animale. Gruparea amidică, deşi nu are caracter
acid, poate participa la formarea
legăturilor de hidrogen. Este un
aminoacid neesenţial. Grupare
amidică hidrolizează transformându-se în grupare carboxil
şi rezultând acid aspartic, din acest motiv când nu se poate
preciza care dintre radicalii celor doi aminoacizi se află
într-o poziţie pe catena polipeptidică, se indică prescurtarea
Asx sau B.
4. Glutamina; Gln; Q; Acid -amino--amidoglutaric.
Este omologul superior al asparaginei. Participă la fel ca şi
asparagina la legături de hidrogen. Este un aminoacid
neesenţial. În caz de incertitudine se simbolizează cu Glx
sau Z. Glutamina este forma
detoxifiată de transport a amoniacului
metabolic.
H C
NH3+
COO-
CH2 CO
NH2
H C
NH3+
COO-
CH2 CH2 CO
NH2
H C
NH3+
COO-
CH2 OH
5. Tirozina; Tyr; Y; p-Hidroxifenilalanină. Este un
aminoacid cu o largă răspândire în structura proteinelor.
Tirozina joacă un rol important în centrul activ al enzimelor
unde funcţionează ca donor de protoni. Organismul o
sintetizează prin hidroxilarea fenilalaninei şi prin urmare
este un aminoacid neesenţial. Tirozina
serveşte la sinteza unor compuşi cum sunt
catecolaminele, hormonii tiroidieni,
melaninele. Alături de leucină se întâlneşte în polipeptidele
din smalţul matur uman şi în smalţul bovinelor. De
asemenea, tirozina intră în compoziţia colagenului.
6. Cisteina; Cys; C; Acid -amino--tiopropionic. Se
găseşte în mari cantităţi în keratine. Gruparea tiol a
cisteinei este uşor oxidabilă, chiar şi cu oxigen molecular
transformându-se prin formarea unei punţi disulfurice în
cistină. Puntea disulfurică poate lega catene polipeptidice
diferite ca de pildă în keratine, sau poate produce plierea
unei singure catene ca în cazul ribonucleazei (enzimă care
catalizează hidroliza ARN). Capacitatea de a se oxida a
cisteinei, face ca ea sau unii compuşi care o conţin, ca de
exemplu glutationul, să participe la procesele oxido-
H C
NH3+
COO-
CH2 SH
reducătoare din celule. Cisteina joacă un rol important în
centrul activ al tiol-enzimelor. Atomii de sulf tiolic
reacţionează cu metalele grele (mercur, plumb ş.a.) ceea ce
explică otrăvirea tiol-enzimelor cu aceste metale. Datorită
solubilităţii reduse, în situaţii patologice, cisteina se poate
acumula în calculi vezicali sau renali. Cisteina este un
aminoacid neesenţial.
7. Lizina; Lys; K; Acid
-diaminocaproic. Este
prezentă în aproape toate
proteinele cunoscute de origine animală. Lizina joacă un rol
important în procesele de creştere, lipsa ei în dietă provoacă
tulburări ale acestora. Este un aminoacid esenţial:
Bazicitatea grupării -amino, face ca, în condiţii fiziologice
(t = 37°C; pH = 7,4), această grupare să fie protonată, ceea
ce conferă radicalului lizinei sarcina electrică pozitivă (q =
+1 u.e.s.). Datorită sarcinii şi reactivităţii ei, această
grupare asociază sau leagă coenzimele la catena
polipeptidică a enzimelor.
8. Arginina; Arg ;R;
Acid -amino-- H C
NH3+
COO-
CH2 CH 2 CH2 NH CNH2
+
NH2
guanidinovalerianic. Prin hidroliză aginina produce un acid
-diamino-monocarboxilic, ornitina, implicată în ciclul
ureogenetic. Arginina alături de ornitină participă la
transformarea amoniacului metabolic în uree (ureogeneza).
Arginina este principalul component al unor proteine
bazice protaminele şi histonele. Întrucât în timpul creşterii
organismului, biosinteza argininei nu acoperă necesarul, el
este un aminoacid semiesenţial. Datorită bazicităţii sale
mari gruparea guanidil este în stare protonată.
9. Histidina; His; H; Acid -amino--
imidazolilpropionic. Se găseşte în cantitate
mare în proteina hemoglobinei, globina
(cca. 10 % procente masice). Histidina joacă un rol
important în centrul activ al multor enzime din clasa
hidrolazelor (enzime care catalizează reacţii de hidroliză).
Este un aminoacid semiesenţial.
10. Acidul aspartic; Asp; D; Acidul
aminosuccinic. Acidul aspartic sau
aspartatul se găseşte în cantităţi apreciabile
în structura albuminei şi globulinelor sanguine, dar şi în
H C
NH3+
COO-
CH2
N
N
H
H C
NH3+
COO-
CH2 CO
O-
proteinele vegetale. Este un aminoacid neesenţial pe care
organismul îl foloseşte în ureogeneză şi în sinteza bazelor
pirimidinice. Aspartatul este un neurotransmiţător excitator.
Datorită acidităţii grupării carboxil a radicalului, la pH
fiziologic această grupare este ionizată, ceea ce conferă
radicalului sarcina q = -1. Din acest motiv cel mai frecvent
se foloseşte denumirea de aspartat şi nu de acid aspartic
indiferent dacă aminoacidul este liber sau legat într-o
catenă polipeptidică.
11. Acidul glutamic; Glu; E; Acid
-amino-glutaric. Acidul glutamic sau
glutamatul se găseşte în numeroase
proteine vegetale şi animale cum ar fi gliadina din grâu şi
cazeina. El este un aminoacid neesenţial care ocupă o
poziţie centrală în metabolismul aminoacizilor. Este un
neurotransmiţător excitator. Ca şi la aspartat datorită
acidităţii grupării carboxil a radicalului, la pH fiziologic
radicalul are sarcina q = -l. De aceea denumirea mai
frecvent folosită este aceea de glutamat.
H C
NH3+
COO-
CH2 CO
O-CH2