5èmes journées scientifiques du labex numevformation • arrivage du master 2 biostatistique au...

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5 èmes Journées Scientifiques du Labex NUMEV Solutions Numériques, Matérielles et Modélisation pour L’Environnement et le Vivant Mercredi 5 et jeudi 6 octobre 2016 Session Posters Montpellier SupAgro Hall d’honneur ANIMATION SCIENTIFIQUE Groupe de travail rhéologie sanguine (AAP2014-2-025-MENDEZ) Simon Mendez IMAG Ecole thématique PLURIBOIS « Les bois et leurs usages, approches pluridisciplinaires de la diversité » (AAP2014-2- 051-GRIL) Joseph GRIL (1), Mériem Fournier (2), Sabine Care (3) (1) LMGC, (2) AgroParis Tech Nancy, (3) Laboratoire Navier Champs-sur-Marne 48èmes Journées de Statistique de la Société Française de Statistique (2015-1-006-DESAPORTA) Benoîte De Saporta (1), Olivier Gimenez (2), Nicolas Verzelen (3) (1) IMAG, (2) CEFE, (3) MISTEA Formation à la data science et diffusion vers les entreprises du secteur agronomique et l’agro-industrie (AAP2015-1-011-FONTEZ) Bénédicte Fontez, Céline Casenave, Pascal Neveu (1) ; Fabien Campillo (2), Hazaël Jones (3) (1) UMR – MISTEA ; (2) INRIA ; (3) UMR ITAP École thématiques « Galaxy4Bioinformatics », 3ème édition (AAP2015-2-014-CHATEAU) Annie Château (1), Jean-François Dufayard (2) (1) LIRMM, (2) CIRAD Mathematical and Computational Evolutionary Biology 2016 (AAP2015-2-001-GUINDON) O. Gascuel, S. Guindon (1) ; C. Scornavacca (2) ; R. Leblois (3) (1) IBC, LIRMM, CNRS, Université de Montpellier ; (2) Institut des Sciences de l’Evolution de Montpellier ; (3) The Center for Biology and Managment of Populations Organisation des 27ème francophones d'ingénierie des connaissances (AAP2015-2-002-BRINGAY) Sandra Bringay (1), Nathalie Pernelle (2) (1) LIRMM-UM-CNRS-UPVM, (2) CLRI, UPS Summer School : ECMC 2016. European Computational motor control : from normal to pathological movements (AAP2015-2-028-SCHWEIGHOFER) N. Schweighofer, M. Hayashibe, D. Mottet University of Southern California, INRIA, Université de Montpellier ANIMATION SCIENTIFIQUE

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Page 1: 5èmes Journées Scientifiques du Labex NUMEVFORMATION • Arrivage du master 2 Biostatistique au Labex NUMEV et lancement de la nouvelle habilitation 2015-2019 (2014- 2-010-DESAPORTA)

5èmesJournéesScientifiquesduLabexNUMEV

SolutionsNumériques,MatériellesetModélisationpourL’EnvironnementetleVivant

Mercredi5etjeudi6octobre2016

SessionPostersMontpellierSupAgro

Halld’honneur

ANIMATIONSCIENTIFIQUE• Groupedetravailrhéologiesanguine(AAP2014-2-025-MENDEZ)

SimonMendezIMAG

• EcolethématiquePLURIBOIS«Lesboisetleursusages,approchespluridisciplinairesdeladiversité»(AAP2014-2-

051-GRIL)JosephGRIL(1),MériemFournier(2),SabineCare(3)(1)LMGC,(2)AgroParisTechNancy,(3)LaboratoireNavierChamps-sur-Marne

• 48èmesJournéesdeStatistiquedelaSociétéFrançaisedeStatistique (2015-1-006-DESAPORTA)

BenoîteDeSaporta(1),OlivierGimenez(2),NicolasVerzelen(3)(1)IMAG,(2)CEFE,(3)MISTEA

• Formationàladatascienceetdiffusionverslesentreprisesdusecteuragronomiqueetl’agro-industrie(AAP2015-1-011-FONTEZ)BénédicteFontez,CélineCasenave,PascalNeveu(1);FabienCampillo(2),HazaëlJones(3)(1)UMR–MISTEA;(2)INRIA;(3)UMRITAP

• Écolethématiques«Galaxy4Bioinformatics»,3èmeédition (AAP2015-2-014-CHATEAU)

AnnieChâteau(1),Jean-FrançoisDufayard(2)(1)LIRMM,(2)CIRAD

• MathematicalandComputationalEvolutionaryBiology2016(AAP2015-2-001-GUINDON)O.Gascuel,S.Guindon(1);C.Scornavacca(2);R.Leblois(3)(1)IBC,LIRMM,CNRS,UniversitédeMontpellier;(2)InstitutdesSciencesdel’EvolutiondeMontpellier;(3)TheCenterforBiologyandManagmentofPopulations

• Organisationdes27èmefrancophonesd'ingénieriedesconnaissances (AAP2015-2-002-BRINGAY)

SandraBringay(1),NathaliePernelle(2)(1) LIRMM-UM-CNRS-UPVM,(2)CLRI,UPS

• SummerSchool:ECMC2016.EuropeanComputationalmotorcontrol:fromnormaltopathologicalmovements(AAP2015-2-028-SCHWEIGHOFER)N.Schweighofer,M.Hayashibe,D.MottetUniversityofSouthernCalifornia,INRIA,UniversitédeMontpellier

ANIMATIONSCIENTIFIQUE

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FORMATION

• Arrivagedumaster2BiostatistiqueauLabexNUMEVetlancementdelanouvellehabilitation2015-2019(2014-2-010-DESAPORTA)BenoîteDeSaporta(1),ChristopheAbraham(2)(1) IMAG,(2)MISTEA

• Organisationd’unemanifestationscientifiqueautourdelarechercheensciences«Omiques»(2014-2-017-FISTON)Anne-SophieFiston-LavierFacultédesSciencesdel’UniversitédeMontpellier,ISEM

• StratégiesverslaprofessionalisationetadossementàlarecherchedePhysiqueBiomédicale,spécialitéenMasterSTICpourlaSanté(2014-2-048-CLOITRE)ThierryCloitre,CsillaGERGELY(1);AlexandreDouplik(2)(1)L2C,(2)UniversitédeToronto,Canada

• ProjetpédagogiquedevalorisationetdediffusiondelaculturescientifiqueauseinduLABEXNUMEV (2015-1-015-SABY)JocelynChauvet,HervéManzanarez,AlicePercher,SimonModeste,DanielRamos,NicolasSabyIREM,ISEM,IMAG,IEM

• Hydrocontest2016(2015-2-027-DARIDON)LDaridon(1),V.Dufour(2),L.Lapierre,L.Latorre(3)(1)LMGC,(2)InstitutdesSciencesdel’évolution,(3)LIRMM

• Moduleimage,avril2017(2015-2-004-STRAUSS)OlivierStrauss,BenjaminGillesLIRMM

RECHERCHE

Axe‘AlgorithmesetCalculs’

• StatisticalModellingForHigh-ThroughputPlantPhenotypingFunctionalData(2013-1-007-HILGERT)TitoManrique(1)(2),ChristopheCrambes(1),NadineHilgert(2)(1)IMAG,(2)MISTEA

• Localisation,identificationetcomptagedepoissonsdansdesimagesphotographiquessous-marines(2015-1-002-

CHAUMONT)S.Villon(1),M.Chaumont(1),J.Pasquet(1),G.Subsol(1),S.Villéger(2),T.Claverie(2),D.Mouillot(2)(1)LIRMM;(2)MARBEC,IRD,Ifremer

• OntheConsistencyOfOrthologyRelationships(2015-1-004-PAUL)

MarkJones(1),ChristophePaul(1),CélineScornavacca(2)LIRMM(1),(2)ISEM,IRD,EPHE

• AlgorithmesEvolutionnairespourl’AdaptationPersonnaliséedePagesWeb(2015-1-007-HUCHARD)

YoannBonavero,MarianneHuchard,MichelMeynardLIRMM,CNRSetUniversitédeMontpellier

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Axe‘DonnéesScientifiques’

• ComplexMultisourceQueryingandMining(2013-1-010-PONCELET)

VijayIngalalli(1)(2),DinoIenco(2),PascalPoncelet(1)(1) LIRMM;(2)IRSTEA

• VisualAnalyticsinLifeSciences(2014-1-035-SALLABERY)

FlorenceYingWang(1,2),ElenaArsevska(3),ArnaudSallaberry(1,4),MathieuRoche(5)(1) LIRMM;(2)UniversitédeMontpellier;(3)Cirad,UMRCMAEE;(4)UniversitéPaulValéry;(5)Cirad,UMRTETIS

• AgroPortal:anontologyrepositoryforagronomy(2014-2-023-JONQUET)

C.Jonquet(1)(2)(6),A.Toulet(1)(2),E.Arnaud(3),S.Aubin(4),E.Dzalé-Yeumo(4),V.Emonet(1), J.Graybeal(6),M.A.Musen(6),V.Pesce(7),P.Larmande(2)(5)(1)LIRMM;(2)IBC;(3)BioversityInternational;(4)INRA;(5)UMRDIADE;(6)BMIR;(7)FoodandAgricultureOrganizationoftheUnitedNations

• ISEMRX3D:renouvellementdumicrotomographeRXdelaplateformeMRI(2015-2-008-SUBSOL)GérardSubsol(1),RenaudLebrun(2)(3)(1) LIRMM,(2)ISEM,(3)PlateformeMRI

Axe‘SystèmesModèlesetMesures’• Transportofionsandmoleculesinsidecarbonnanotubes:towardsthedetectionofindividualbiomolecules

(2012-JOURDAIN)Khadija Yazda (1), Saïd Tahir (1), Thierry Michel (1), Jean-Baptiste Thibaud (2), Bastien Loubet (3), ManoelManghi(3),JohnPalmeri(1),FrançoisHenn(1),VincentJourdain(1)(1)L2C;(2)InstitutdesBiomoléculesMaxMousseron;(3)LaboratoiredephysiquethéoriqueIRSAMC

• OptimizingPerformanceOfADesalinationUnit(2014-2-008-CHRYSOCHOOS)

AndréChrysochoos(1),EmmanuelMatéo(2),LaurentTrémel(2)(1)LMGC-PolytechMontpellier;(2)MontepllierEngineering

• Interactionsandassembliesofwheatprolamins(2014-2-040-RAMOS)

JustinePincemaille(1)(2),AmélieRamos(2),PaulMenut(1),Marie-HélèneMorel(1)etLaurenceRamos(2)(1) IMRIATE,(2)L2C

• DynamicsofacolloidalEllipsoidnearaGas-LiquidInterface(2014-2-044-NOBILI)S.Villa(1),M.Heran(2),A.Stocco(1),M.In(1),C.Blanc(1),C.Ligoure(1),N.Nobili(1)(1)L2C,(2)IEM

• Imagerieetspectroscopieoptiquedebiomoléculesindividuellestransitantdansunnanotubedecarbonepour

ledéveloppementdenouvellesméthodesd’analyseultrasensibles(2014-2-049-JOURDAIN)LénonardMoniello,KhadijaYazda,SaidTahir,RémyVialla,GuillaumePrévot,ThierryMichel,VincentJourdainL2C

• Variabilitédespropriétésthermo-hygro-viscoélastiquesdesbois:mesuresvibratoiresetmodélisationpar

homénéisation.1èreétape:Homogénéisationdeladoubleparoicellulairedubois(2015-1-018-BARDET)JoffreyLhonneur,TancrèdeAlmeras,SandrineBardet,YannMonerieLMGC

• Transportofionsandmoleculesinsidecarbonnanotubes:towardsthedetectionofindividualbiomolecules(2015-1-026-MONTERRO)CédricMontero(1),ArieVanDerLee(2),PatrickLangbour(3)(1)LMGC,(2)InstitutEuropéendesMembranes,(3)CIRAD

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• Contributionsdumatériauboisdesruchesàl’activitéetlasantédescoloniesd’abeilles(2015-2-033-JULLIEN)DelphineJullienetAnnaDupleixLMGC

• Antennesspiraleslogarithmiquespourcubesat3U(2015-2-051-DUSSEAU)S.Jarrix(1),M.Gueye(1),V.Muravyev(2),L.Dusseau(1)(1)IES,(2)CSU

Axe‘Modélisation’

• Eco-conceptionbois:caractérisationdelaressourcerégionaleenPinsetmiseenplacedemodulesdeformationdédiés(AAP2013-1-009-MONTERRO)A.Burgers(1),C.Montero(1),O.Arnould(1),P.Langbour(2),D.Guibal(2),E.LeClezio(3),T.Delaunay(3),J.Gril(1),B.Thibaut(1),M.Vinches(4)R.Marchal(2)(1)LMGC,(2)CIRAD,(3)LGEI,MEA,(4)IES

• Inversionadaptativeetrobustededonnéesgéodésiquesàl’échellecontinentale(AAP2014-2-002-MOHAMMADI)

SéverineFrust(1),BijanMohammadi(2),JeanChéry(1),MichelPeyret(1)(1) GéosciencesMontpellier,(2)IMAG

• Anonconforminghigh-ordermethodfortheBiotproblem(AAP2014-2-006-DIPIETRO)MicheleBoti,DanieleA.DiPietroIMAG

• Modélisationdutransportdel’eaudanslestissusd’uneracine(AAP2015-1-019-FELBACQ)AnaMariaVelezCardona,YannBoursiac,DidierFelbacqL2CLaboratoiredeBiochimieetPhysiologieMoléculairedesPlantes,INRA/CNRS/MontpellierSupagro/UM

• Mécanobiologiedelamorphogenèseépithélialenormaleetpathologique(AAP2015-2-005-MAURIN)

J.Averseng(1),S.Baghdigian(2),M.Martin-Laverrat(3),B.Maurin(1),F.Rousset(2),A.Sahuquet(3)(1)LMGC,(2)ISEM,(3)DIMNP

• Structuringpolymergelsviacatalyticreactions(AAP2015-2-011-KOB)

VirginieHugouvieux(1),WalterKob(2)(1)INRA,MontpellierSupAgroandUniversitéMontpellier,UMR1083SPO;(2)L2C

• NonparametricEstimationstrategiesforintervalcensoreddatawithapplicationinthelifeexpectancywithoutincapacityoftheelderly(AAP2015-2-016-BRUNEL)L.Vidale(1),E.Brunel(1),I.Carrière(2)(1)IMAG,(2)INSERM

• Numericalmodelingofcartilagegrowthundermechanicalstresses.Mechanicalandbiologicalanalysisoninvitro«micropellet»model(AAP2015-2-039-CANADAS)M.Maumus(1)(2),G.Dusfour(1),S.LeFloch(1),D.AMbard(1),C.Jorgensen(2),D.Noël(2),P.Canadas(1)(1)LMGC,(2)IRMB,CHU,INSERM

• Collectivebehaviorodrandomlyplacesciliainanarray(AAP2015-2-046-PITARD) S.Dey,D.Donnarumma,G.Massiera,andE.Pitard L2C

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ProjetIntégré‘Atteintedusystèmenerveux’

• DirectSpiralCordStimulation(SCS)forvisceralfunctionrestorationinSCIpatients–Preliminaryexplorationonaporcinemodel(AAP2013-1-003-GUIRAUD)ThomasGuiho(1),ChristineAzevedo-Coste(1),Jean-RodolpheVignes(3),LucBauchet(2),DavidGuiraud(1)(1) INRIA–LIRMMMontpellier;(2)CHUMontpellier/INM,INSERM;(3)CHUBordeaux,INSERM

• Tissuealterationsinspinalcordinjuredrodent(AAP2014-2-011-GOZEBAC)

Guillaume Saint-Martin (1)(2), Harun N. Noristani (1),Maïda Cardoso (2), Christophe Coillot (2), Rahima Sidi-Boulemouar(2),ChristopheGoze-Bac(2),FlorenceE.Perrin(1)(1)INSERM,(2)L2C

• Neuroplasticitéetrécupérationdanslesstructures(sous)-corticalesdistantessuiteàlachirurgieéveilléedes

gliomesinfiltrantsdebasgrade:investigationdessignauxIRMfetEEGpardesméthodesstandardsetnon-linéaires.(AAP2015-2-018-BONNETBLANC)AnthonyBOYER(1),SofianeRamdani(2),FrançoisBonnetblanc(1),HuguesDuffau(3)(1)INRIA,(2)INSERM,(3)INSERM

• Stimulationélectro-fonctionnellepourl’assistanceauxmouvementsdesmembresinférieursdanslessituationsdedéficiencessensori-motirces(AAP2015-2-041-AZEVEDO)BenoîtSijobert(1),ChristineAzevedo(1),DavidAndreu(1),ChristianGeny(2),JérômeFroger(3)(1)INRIA-LIRMM,(2)CHUMontpellier,(3)CHUNîmes

ProjetIntégré‘ADNetGénome’• Relationsentreréarrangementschromosomiquesetstructure3Ddelachromatiechezladrosophile(AAP2014-2-

028-SWENSON)S.Pulicani(1)(2)(3),K.Swenson(1)(2),E.Rivals(1)(2)(1)LIRMM;(2)IBC;(3)IGH

• Anewscoringfunctionforidentificationoftranscriptionfactorsbindingsites(AAP2014-2-039-BREHELIN)VandelJimmy,CharlesLecellier,SophieLèbre,LaurentBréhélinLIRMM,UniversitédeMontpellier,CNRS,IBC

• Portailwebcollaboratifdevisualisationetcomparaisondephylogénies(AAP2015-1-013-CHIFOLLEAU)FloréalCabanettes(1),MarchChakiachvili(1),VincentLefort(1),Jean-FrançoisDufayard(2),FrédéricdeLamotte(3),Anne-MurielArigonChifolleau(1)(1)LIRMM,(2)CIRAD,(3)INRA,(4)LGI2P

• LargeNGSdataanalysesforPanGenomicanalysisusingTOGGLE(LANDPan-Toogle)(AAP2015-1-030-LARMANDE)CécileMonat,FrançoisSabot,PierreLarmandeLIRMM,UMRDIDADE,SouthGreenPlatform

• PhysicalModellingofActiveBacterialDnaSegregation(AAP2015-2-055-GENIET)J-Y.Bouet(3),J.Dorignac(1),F.Geniet(1),V.Lorman(1),M.Nollmann(4),J.Palmeri(1),A.Parmeggiani(1)(2),J-C.Walter(1)(3)

(1)L2C,(2)DIMNP,(3)LMGC),(4)CBS

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ProjetIntégré‘Observationdel’environnement’

• Commandedebrasmanipulateursderobotsous-marinpourlamanipulationàgrandeprofondeur

d'échantillonsbiologiquesdéformables(AAP2014-2-004-CREUZE)F.Leborne(1)(2),VincentCreuze(1),AhmedChemori(1),LorenzoBrignone(2)(1)LIRMM,(2)IFREMER

• Real-Timedynamicalmonitoringofwaterstatusinplants:fromlowfieldNMRinlaboratorytocompactNMRinplanta(AAP2014-2-026-NATIVEL)Rahima Sidi-Boulenouar (1)(2), Olivier Yzebe (1)(4), Christophe Coillot (1), Eric Alibert (1), Eric Nativel (3),FrédéricGatineau(2),Jean-LucVerdeil(2),NadiaBertin(4),ChristopheGoze-Bac(1)(1)L2C,(2)CIRAD,(3)IES,(4)INRA

• Designofanimplantabledeviceforin-vivomonitoringoffishphysiologicalparameters(AAP2014-2-030-KERZERHOAchraf Lamlih, Vincent Kererho, Fabien Soulier, Serge Bernard, Mariane Comte, Michel Renovell (1); TristanRouyer,SylvainBohommeau(2)(1)LIRMM;(2)IFREMER

• Self-mixinginlownoisesemiconductorVORTEXlaserforagro-environmentapplications(AAP2014-2-045-GARNACHE)

MohamedSeghilani(1),MikhaëlMyara(1),IsabelleSagnes(2),RyadBendouloa(3),ArnaudGarnache(1)(1) IES,(2)LaboratoiredePhotoniqueetNanostructures,(3)IRSTEA

• EtudeexploratoiredemesuresphysiologiquesnondestructricesenagronomieparspectroscopieTHz(AAP2015-1-001-BLIN)Bassli(1),A.Pénarier(1),P.Nouvel(1),C.Romieu(2),S.Blin(1)(1)IES,(2)INRA

• ProjetALEYIN:PremièreexpérimentationenmilieuKarstique,GOURNEYRAS(AAP2015-2-007-LAPIERRE)

AdrienLasbouygues,LionelLapierre,DavidAndreu,HervéJourdeLIRMM,HSM

• Faisabilitéd’unbiocapteurmultiplexésursupportenpapierpourladétectiondesbactériespathogènesresponsablesdesinfectionsnosocomiales(AAP2015-2-064-SORLI)TatianaRabeRalam,ArnaudVena,BriceSorli(1),HélèneMarchandin,StafaniyaHantova(2),LucTéot(3)(1)IES,(2)Laboratoiredebactériologie–FacultédePharmacie,(3)UnitéMédico-chirurgicalePlaiesetCicatrisations,CHRULapeyronie

ProjetIntégré‘Sang,objetComplexe’• Thrombosisriskinbloodcontactingdevices(AAP2015-2-059-NICOUD)

RodrigoMendezRojanoIMAG

• UltrasoundPulse-EchoanalysisofBloodAggregation(AAP2015-1-003-CHARLOT)L.Lanotte(1)(2),D.laux(2),B.Charlot(2),M.Abkarian(1)(1)CBS,(2)IES