accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems klaas nierop departement...

38
Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Upload: jonathan-claes

Post on 12-May-2015

218 views

Category:

Documents


2 download

TRANSCRIPT

Page 1: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure

zandige bodems

Klaas Nierop

Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Page 2: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Inhoud

Korte historie organische stof chemie Moleculaire technieken (NMR, pyrolyse) Organische stof in zandige bodems

beginnende podzol (Hulshorster Zand/Leuvenumse Bos) podzolloze bodem (Amsterdamse Waterleiding Duinen) paleopodzol (Defensiedijk)

Page 3: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Humus

Fulvozuren Huminezuren Humine

Page 4: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Humus vorming: polyfenol theorie

Page 5: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Humus molecuul

?

Page 6: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

13C-NMR (Kernspinresonantie)

Page 7: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

13C-NMR van organische stof

Alkyl C (lipiden)

O-alkyl C (polysaccharides)Aromatische C

(o.a. lignine)

Carbonyl C

Page 8: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Pyrolyse-GC/MS

Macromolecuul

Structuredetermination

Pyrolysis

ΔT Inte

rpre

tatio

n

Inte

rpre

tatio

n

Thermische afbraak (600 oC) onder inerte omstandigheden Detection / IdentificationDetection/identification

Page 9: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

RT: 0.00 - 50.99

0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50

Time (min)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

55

60

65

70

75

80

85

90

95

100

Re

lative

Ab

un

da

nce

39.67

40.40

40.7216.00

25.72

39.3920.30

39.2513.47

28.2918.07 24.2236.84

14.23 21.5936.4011.03

8.88 26.84 32.6212.753.85

7.22 30.65

32.871.9841.0222.70 35.576.27

5.77 41.309.00

41.5443.50

45.17 47.59

NL:3.46E7

TIC MS HVK60

HVK60 #1117 RT: 19.62 AV: 1 NL: 2.57E6T: {0,0} + c EI det=350.00 Full ms [ 45.00-500.00]

50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200

m/z

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

55

60

65

70

75

80

85

90

95

100

Re

lativ

e A

bu

nd

an

ce60.1

57.173.1

70.156.169.1

98.197.1 137.174.147.1 61.189.1 174.0115.1 131.1 182.181.1 102.1 138.153.1 157.0149.1121.168.1 107.1 159.1 194.1168.1 190.1 196.1

Page 10: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen
Page 11: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Algemene bouwstenen

Page 12: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Specifieke bouwstenen

Page 13: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Specifiekere bouwstenen

Page 14: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Zelfs lego humificeert…

Page 15: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Promotieonderzoek in Wageningen

Theorie podzolisatie kennen we nu wel, maar hoe zit het nu met de organische stof (chemie)?

Onderzoek in Hulshorster Zand/ Leuvenumse Bos

Page 16: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Zand

Page 17: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Algen ‘mat’

Page 18: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Mosveld en vliegden

Page 19: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Dennenbos + gras/bosbes

Page 20: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Beuk

Page 21: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Beginnende podzol

F

L

HE

B

Page 22: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Pyrolyse-GC/MS (onder beuk)

Fiber

Wateroplosbare organische stof

B horizont

n

n

n

n

n

n

n

n

n

n

nnn

n

n

nn

nn

n

n

n

n

n

n

n

n

nn

n

n

nn

n

n

nn

Rel

ativ

e in

tens

iteit

Retentietijd

= polysaccharides; = fenolen; = lignine; = lipiden

Page 23: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Pyrolyse

Nadeel: verbindingen met veel polaire groepen zijn minder of zelfs helemaal niet zichtbaar.

Oplossing: toevoeging van methylerings reagents (TMAH), oftewel ‘Thermally assisted Hydrolysis and Methylation (THM)’

Page 24: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

THM van B horizont onder beuk

= vetzuur; □ = ω-hydroxyvetzuur; = α,ω-divetzuur;

= alcohol (allen als methyl ester en/of methyl ether)

Retention time

Rel

ativ

e in

tens

ity

C22

9,10,18-trimethoxy-C18 vetzuur

:

9,16

en

10,1

6-di

met

hoxy

-C1

6 v

etzu

ur

C24

C22

C24

C24

C28 C30C22

C20

C20

C20

C18

C18:1

C22

C16

C16

C18

C18:1

OCH3

COOCH3

OCH3

OCH3

COOCH3

OCH3

C16

Page 25: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Ester-gebonden lipiden: cutine en suberine

Cutine (cuticula van bladeren, naalden, vruchten)

Suberine (bast, wortels, knollen)

Bernards, Can. J. Bot. 80, 227-240 (2002)

Page 26: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Bouwstenen cutine en suberine

O

OH OH

O

OH

O

OH

Cutine Suberine

O

OH

OH

OH

OH

C16 en C18 ook C20 en langer

O

OH OH

O

O

OH OH

OH

Page 27: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

THM van B horizont onder beuk

= vetzuur; □ = ω-hydroxyvetzuur; = α,ω-divetzuur;

= alcohol (allen als methyl ester en/of methyl ether)

Retention time

Rel

ativ

e in

tens

ity

C22

9,10,18-trimethoxy-C18 vetzuur

:

9,16

en

10,1

6-di

met

hoxy

-C1

6 v

etzu

ur

C24

C22

C24

C24

C28 C30C22

C20

C20

C20

C18

C18:1

C22

C16

C16

C18

C18:1

OCH3

COOCH3

OCH3

OCH3

COOCH3

OCH3

C16

Page 28: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

C input in minerale bodem

Bioturbatie Inspoeling Ondergrondse biota (plant)

13C-NMR

Alkyl C

Page 29: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Fiber

Wateroplosbare organische stof

B horizont

n

n

n

n

n

n

n

n

n

n

nnn

n

n

nn

nn

n

n

n

n

n

n

n

n

nn

n

n

nn

n

n

nn

Rel

ativ

e in

tens

iteit

Retentietijd

= polysaccharides;

= fenolen;

= lignine;

= lipiden

Nierop & Buurman, 1999

Page 30: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Leuvenum

Wateroplosbare organische stof: veel aromatische verbindingen (lignine en andere polyfenolen)

B horizonten: veel ‘alifatische’ componenten, met name suberines

Dus: de C in de jonge B horizonten bestaat voornamelijk uit de meeste resistente componenten van (oud) wortelmateriaal

Wateroplosbare organische stof spoelt voornamelijk door de B horizont heen en slaat neer als fiber

Page 31: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Zandige subhorizonten in Amsterdamse Waterleiding Duinen (AWD)

Zeer kleine hoeveelheden aan verweerbare mineralen (zelfs Al/Fe), geen podzolvorming

Grote pH gradient Verwaarloosbare bioturbatie Zelfde plant input (wortels)

Page 32: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Duivendrift

Hoek van Klaas

Jonge Duinen

Ontkalkings-diepte: 25 cm

Oude Duinen

Ontkalkings-diepte: 115 cm

14C>600 BP

Page 33: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Lipiden fractionering organische stof

Extractie m.b.v. organisch oplosmiddel Extraheerbare (vrije) lipiden Soxhlet extractie/ASE in DCM/MeOH (9:1)

Basische hydrolyse (verzeping)

Ester-gebonden verbindingen

1M KOH in MeOH op 70 oC (1 uur)(Vergelijk NaOH extractie humus!)

Page 34: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Opbrengsten vrije en ester-gebonden lipiden

pH (CaCl2) Free Ester-bound(weight %) (weight %)

Oak roots 7.03 10.42Dui-Ck 6.9 1.47 2.90Dui-C1 4.3 3.68 4.09HvK-C1 3.8 10.16 12.61

Nierop et al. (2003)

Page 35: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Retention time

Re

lativ

e in

tens

ity

C18:1

C18

C16

C22C16

C24

C16

C18:1

C18

C16

C24

C22

C16

C20C16

C9C9

C1

8:1

(11

)

C16

C8C8

C1

8:1

(9)

C18

C1

8:1

(11

)C

18

:1(1

1)

C1

8:1

(9)

C18

C18

C1

8:1

(10

)

C16

Legenda (als TMS esters en/of ethers): = 1-alcohol = vetzuur = ω-hydroxyvetzuur = α,ω-divetzuur = dihydroxyvetzuur = trihydroxyvetzuur

= dihydroxy-α,ω-divetzuur

Ester-gebonden lipiden met GC/MS: vegetatie vs. bodem

Wortels

Dui-Ck

Page 36: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Dui-Ck

HvK-C1

Dui-C1

Retention time

Re

lativ

e in

tens

ity

C18:1

C18:

C18

C16

C22C16

C24

C16

C18:1

C18

C16

C24

C22

C16

C20C16

C8

C16

C16C18

C22

C20

C18:1

C24

C16

C9

C9C9

C9

C8

C9

C16

C14

C16

C9

C8C8

C8C8

C22C1

8:1

(9) C18

C1

8:1

(11

)

C1

8:1

(9)

C18

C1

8:1

(11

C1

8:1

(10

)

C1

8:1

(9)

C18

C18

C18

C18

OH

COOH

OH

OCH3

COOH

OH

COOH

OCH3

OH

CO OH

age

pH

Ester-gebonden lipidenin subhorizont onder eikenbos met GC/MS

Legenda (als TMS esters en/of ethers):

= 1-alcohol = vetzuur = ω-hydroxyvetzuur = α,ω-divetzuur = dihydroxyvetzuur = trihydroxyvetzuur = dihydroxy-α,ω-divetzuur

Page 37: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

(Paleo)podzols (14C tot 4000 jaar BP)

(Van Mourik et al., in prep.???)

Retention time

Re

lativ

e in

ten

sity

C22

C24

C22

C16

C24

G

O O

C22

C24

Defensiedijk

Suberine (Calluna?)

THM van 4B

= 1-alcohol = vetzuur = ω-hydroxyvetzuur = α,ω-divetzuur

Page 38: Accumulatie van alifatische biopolymeren (suberine) in zure zandige bodems Klaas Nierop Departement Aardwetenschappen - Geochemie Faculteit Geowetenschappen

Conclusies

Organische stof van “Humic substances, which constitute 70-80% of organic matter in mineral soils, are dark-coloured partly aromatic, acidic, hydrophilic, molecularly flexible polyelectrolyte materials.” (Schnitzer)

naar vooral alifatische bio(macro)moleculen In zure, zandige bodems breekt aromatische

componenten (lignine) snel af, en accumuleren en preserveren suberines (ook in podzol B horizonten)

Onderschat de invloed en bijdrage van wortels niet!