afghanistan polio eradication initiative

Afghanistan Polio Eradication Initiative

Surveillance Update Week 25

(Ending on Saturday 21 June 2008)

National Surveillance Office

June 24, 2008

AFP Case Classification Afghanistan 2008

Data up to 24 Jun 08

Year 2008

Reported AFP cases 627

Confirmed 8

Compatible 0

Discarded 553

Pending 66**48 Adequate AFP cases pending lab results

04 Inadequate AFP cases pending 60 days follow up and lab results

09 Inadequate AFP cases pending 60 days follow up

05 AFP cases pending ERC

%

%

$$ $

$$ $

$

$ $$

$

##

#

## #

$

$

$

$

#

#

##

Recent NSL1 from, Maywand District of Kandahar Province, onset is 07 Mar, age 14m, 17 OPV doses

Recent NSL3 from, Jalalabad District of Nangarghar Province, onset is 14 May, age 08m, 10 OPV doses

NSL1=04NSL3=04Comp=0

2008

Confirmed polio cases & Compatibles Afghanistan 06-08

NSL1NSL3Compatible

$

$

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

# #

#

#

#

#

#

###

#

%% %

%

%

%

%

2006



2007


$

$$

$

$

$

$$

$$

$

##

##

##

$

$

$

$

#

#

##

2007

NSL1=06

NSL3=11

$$

#

#

####

### ####

###

###

##

##

#

##

# ###

$

$

#

#

$$$$$

$$ $

$$ $

$$$$

$

$

$

####

#######

##

###

####

#

#

### #

######

#

#

##

#

######

##

2004

NSL1= 2

NSL3= 2

NSL1

NSL3

1999

NSL1= 45

NSL3= 18

P1 & P3 Poliovirus Isolates Afghanistan 1999, 04, 06-08

2006

NSL1=29

NSL3= 2

NSL1=04

NSL3=04


2008

Afghanistan & Pakistan P1 isolatesby genetic cluster Jan to June 08

Cluster A-3A

Cluster B-4A


Cluster A-3D

01 Jan 08 Nawabsha

25 Feb Shikarpoor

06 Apr Nferoz

09 Apr Jacobabad

10 Feb Balab uluk07 Mar Maywand

12 Jan Nadi Ali

20 Jan Nadali

05 April Mir pur khas

25 Jan Haidrabad

01 April Khinorth

23 Apr Dadu

12 May Sanghar14 May Khisite

14 May Kohat

Afghanistan & Pakistan P3 isolatesby genetic cluster Jan to Jun 08

Cluster B-1C


09 Feb Maywand

15 Apr Balabuluk

15 Apr Shah Wali Kot

27 Apr Nowshera

14 May Jalalabad

0

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10Ja

nF

ebM

arA

prM

ayJu

nJu

lA

ug Sep

Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Apr

May

Jun

Jul

Aug Sep

Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Apr

May

Jun

Jul

Aug Sep

Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Apr

May

Jun

Jul

Aug Sep

Oct

Nov

Dec

No

of c

ases

Polio Virus Isolates By Type & Month, Afghanistan 05-08

2005

tOPV mOPV1 mOPV3 sNID NID

2006 2007 2008

Short interval additional dose

NSL1

NSL3 Data up to 24 Jun 08

List Of Confirmed Polio Cases Afghanistan 2008


*Confirmed by contact

No Epid Province District Donset Prop Fever Asym Sex Age Routine SIAsDlast OPV

Dstool 1 Dstool2 Hcase LabR Cluster

1 AFG/08/08/001 HILMAND NAD ALI 12-01-08 Y Y N M 28 0 3 28-10-07 15-01-08 16-01-08 YES NSL1 A3A

2 AFG/08/08/005 HILMAND NAD ALI 20-01-08 Y Y N M 11 0 1 20-09-07 25-01-08 26-01-08 No NSL1 A-3A

3 AFG/08/08/012 KANDAHAR MAYWAND 09-02-08 Y Y Y M 84 0 15 No date 14-02-08 15-02-08 No NSL3 B1C

4 AFG/03/08/012 FARAH BALABULUK 10-02-08 Y Y N F 26 0 2 22-04-07 20-02-08 21-02-08 No NSL1 A3A

5 AFG/08/08/027 KANDAHAR MAYWAND 07-03-08 Y Y Y M 14 5 12 09-03-08 13-03-08 14-03-08 YES NSL1 A3A

6 AFG/03/08/041 FARAH BALABULUK 15-04-08 Y Y Y F 16 0 12 13-04-08 18-04-08 19-04-08 YES NSL3 B1C

7 AFG/08/08/045* KANDAHAR SHAHWALIKOT 25-04-08 Y Y N M 12 0 0 No date 30-04-08 Died No NSL3 B1C

8 AFG/06/08/070 NANGARHAR JALALABAD 14-05-08 Y Y N M 8 4 6 15-05-08 16-05-08 Died No NSL3 B1C

Regional Reference Lab Update Afghanistan-2008


Month of onset CasesCases under process

Negative cases

NPEV positive

NPEV %Within 28

days

Positive cases

Culture ITD Wild Vaccine

Jan 97 0 0 79 10 10% 100% 2 7

Feb 112 0 0 88 14 13% 100% 2 8

Mar 115 0 0 74 14 12% 100% 1 26

Apr 125 2 0 82 29 23% 98% 1 14

May26 0 0 17 8 31% 100% 0 1

Week 1May

33 0 0 18 13 39% 100% 1 2Week 2

May24 0 0 16 6 25% 100% 0 2

Week 3May

43 1 1 27 12 28% 98% 0 2Week 4

May total 126 1 1 78 39 31% 99% 1 7

Jun 53 44 0 8 1 2% 17% 0 0

Total AFP cases 628 47 1 409 107 17% 93% 7 62 (9.87 %)

Contact Specimens

333 33 0 205 66 20% 90% 3 26 (7.80 %)

AFP Cases Pending ERC, Afghanistan 2008


EPID DONSET District Province Sex Age DosesDstool2 (or 1)

Asym Prog Fever Lab result60d follow-up result

AFG/01/08/101 10-01-08 IMAM SAHIB KUNDUZ M 29 12 . YES NO NONO

STOOLSRES WEAK

AFG/01/08/102 10-03-08 WARSAJ TAKHAR F 144 10 . YES NO NONO

STOOLSRES WEAK

AFG/12/08/013 26-03-08 BAHARAK BADAKHSHAN M 27 10 22-04-08 NO YES YES SL1 RES WEAK

AFG/08/08/050 10-04-08 KANDAHAR KANDAHAR F 20 18 10-05-08 NO YES YES EV RES WEAK

AFG/08/08/047 17-04-08 QALAT ZABUL M 48 14 06-05-08 YES YES YES NVI RES WEAK

AFP Cases Pending Classification >90 days, Afghanistan 2008


EPID DONSET District Province Sex Age DosesDstool2 (or 1)

Asym Progress FeverLab

result

Days since onset

Reason for not being

classified

AFG/01/08/101* 10-01-08 IMAM SAHIB KUNDUZ M 29 12 . YES NO NONO

STOOLS164

PEND ERC

AFG/01/08/102* 10-03-08 WARSAJ TAKHAR F 144 10 . YES NO NONO

STOOLS104

PEND ERC

AFG/07/08/021 23-03-08 GELAN GHAZNI M 48 3 08-04-08 YES YES YES NVI 91PEND FUP

*These AFP cases are reported in June 2008

AFP Cases Labeled As Hot & Pending in Lab, Afghanistan 2008

Hot by criteria=AFP cases have (Fever + rapid progress+ Asymmetric paralysis + Age <48 month)

* UP= Under Process in the Lab Data up to 24 Jun 08

Lab No

EPID DONSET District Province Sex Age DosesDate of last

OPVDstool2

(or 1)Hot by

fieldHot by criteria

Lab Result

843 AFG/08/08/063 28-05-08 GHORAK KANDAHAR M 30 0 . 02-06-08 YES YES UP

880 AFG/08/08/065 02-06-08NAWAY_I_BARAK

ZAYIHILMAND M 27 4 13-04-08 04-06-08 YES YES UP

889 AFG/03/08/077 05-06-08 KUSHKI KUHNA HIRAT M 24 12 14-04-08 09-06-08 YES YES UP

898 AFG/03/08/076 01-06-08 BALA BULUK FARAH F 24 13 13-04-08 07-06-08 YES YES UP

883 AFG/08/08/069 01-06-08 SPIN BOLDAK KANDAHAR M 18 15 04-06-08 10-06-08 YES YES UP

Reported AFP Cases, Comparison By Month, Afghanistan 06-08

@ of 2/100,0000 <15 year

@ of 1/100,0000 <15 year

0102030405060708090

100110120

Jan

Feb

Mar

Ap

rM

ay Jun

Jul

Au

gS

ep Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Ap

rM

ay Jun

Jul

Au

gS

ep Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Ap

rM

ay Jun

Jul

Au

gS

ep Oct

Nov

Dec

Nu

mb

er o

f ca

ses

2006 2007 2008


AFP Cases By Week Of Onset Afghanistan 2008

Week (Sun-Sat)

Expected 2= Two cases/100,000 <15 yrs Good AFP= GBS or T. Myelitis, T. Neuritis


Region

AFP Cases 2008Week Number

14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25

Exp

ect “2”

Rep

orted

Good

AF

P

05-Ap

r

12-Ap

r

19-Ap

r

29-Ap

r

03-May

10-May

17-May

24-May

31-May

07-Jun

14-Jun

21-Jun

Badakhshan 10 19 4 0 0 0 0 1 0 1 1 1 2 0 0

Central 62 146 52 4 7 7 2 6 7 9 9 7 7 7 0

Eastern 29 84 29 5 2 4 3 4 4 9 3 5 2 0 1

Kunduz 38 104 38 5 4 4 2 5 2 3 4 4 5 3 0

Northern 46 80 25 4 3 3 6 3 2 2 3 2 4 2 0

South East 34 43 14 1 4 2 2 4 2 2 0 3 1 0 0

Southern 57 71 27 6 3 3 4 0 6 4 1 3 8 0 0

Western 54 80 36 5 10 5 5 5 7 3 6 1 4 1 0

Afghanistan 329 627 225 30 33 28 24 28 30 33 27 26 33 13 1

Population Density Map Afghanistan 2008

#

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

##

## ##

##

#

#

###

##

##

##

##

##

#

#

##

##

#

##

##

#

##

###

#

#

###

#

#

## #

#

#

##

##

#

#

#

#

##

## #

#

###

# #

##

#

####

#

#

##

#

#### #

# # ###

#

##

#

#

#

#

##

###

###

#

# #

#

#

#

##

###

##

# #

## ##

###

#

#

#

##

#

##

#

#

## ##

#

##

#

#

## #

###

#

##

###

# ## ##

####

#

#

##

#

##

#

###

##

# ###

#

#

##

#

#

#

#

#

#

#

#

#

#

#

#

####

## ##

## ##

#

#

#

###

##

#

###

### ###

##

##

#

###

#

#

#

#

##

##

#

###

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

########

#

#

##

#

#

#

#

##

#

##

####

## #

# ### #

#

#

#

###

#

##

##

#

# #

## ##

##

#

##

##########

#

#####

#

##

#

###

#

###

# ####

## ##

#

####

#

#

#

#

##

#

#

#

##

##

##

#

##

##

#

#

#

#

##

#

#

###

#

#

#

#

#

##

###

#

#

#

###

#

####

#

###

## #### ##

#

#

####

####

##

###

# #### ##

## #

#

###

####

### ##

#

#

########

##

# ## #

#

##

####

##

############################

#####################

##############################################################################

###########################################################################################################################

################

#################################################

######################################

###################################################################

#############

#######################

#################################

#####################################################################################################

#############

###################################

####################################################################################################################

##

#

#

##

### #

##

#

##

##

#

# #

#

##

#

#

#

#

##

#

### #

#

#

#

#

###

##

## #

## ###

#

##

##

#

#

#

#

##

# #

#

#

##

#

#

##

##

# ####

#

#

##

## #

#

##

#

##

##

##

##

#

#

##

##

#

## ###

# ###

#

# ###

##

#

#

#

#

#

##

#

#

#

#

##

##

##

#

##

#

#

#

# #

### #

#

#

## #

##

#

#######

#

##

# #

##

# #

#

##

#

##

#

## ###

# ### #### ### ###

##

#

###

##

#### ##

###

#

##

#

# #

##

##

# ##

##

## #

##

##

#

#

## ### ##

##

##

####

# ##

#

# #

#

# #

#

#

#

##

#

##

#

#

#

#

##

#

#

##

# ##

##

#

#

#

#

##

#

##

#

##

# ##

#

##

# ###

#

# ###

# # ###

#

##

###

# #

#

#

##

#

##

#

##

###

#

#

#

#

#

#

##

##

##

#

#

#####

###

###

#

#

###

#

##

#

####

#

#

# #

##

##

##### ###

# ####

#

#

# ## ##

#

## #

#

#

#

#

#

##

#

##

##

#

####

##

##

#

#

#

#

####

###

#

#

#

##

# ##

#

###

#

##

## ##

#

### #

#

##

######

### ## ############

### #

########

#####

#

#

#

# ######

####

#####

####

## ####### ##

######

# ##

#### #### ##### ###### ## ## #### ####

#### ####

# ##########

# ########### ########

#######

#######

###############

########### # ##

#

##

#

#

### ##

#

#

# ###

#

#

#

## ## ####

###### ###

# ##########

# ####### ## #### #

########

# ## #### ## #### #

##

#

#

#

####

###

####

#

#

#### ##

#

##

# ##

#

###

#

#

#

#

#

###

#

#

##

## ######

##

##

##### ##

# ######### ###

#####

###

# ##### #####

##

####

####

###

##

######

##########

###

#######

#########

###

##

##

####

## ####

##

######

##

####

#######

###########

####

###

###

####

##

### #

##

# #

#

# ###

#

#

##

#

#

#

## #####

# ##### ##### ##

##

###

# ## #####

#

## ## #

##

#

##

##

###

####

## ### ##

###

####### ############ ##

###### ############### ##### ## ######### ###

##### ###### ######

######

#######

## ##### ###### ######### ###########

##### #

###

### #### ##

### ##

# ## ###

####

#

###

#

## #

#

####

## ##

##

# ##### #### #### ######## ##### #

###

#####

#

### #####

################################################################################### ####################

###

#

#

#

#####

##

#

######

##

#####

#

##

##

##

#

##

### ##

####

######

###

###

#

########

####

#########################################################################

#

#

##

# #####

# ##

# ### ### ## ### ###

#

##

###### ## ####

#

# #

#

#

# #

##

## ##

###

## # #

# #

#

# ###

## ## ### #

## #

#

# ####

##

# ### #

#

##### #

### ### #

#########

##

#

##

###

####

###

##

#

####

#

#

##

##

#

##

#

### #

#

#

#

##

##

######### ###

#

########

###

####

###

##

### #

#

## #####

##

####### ############

##

######

#

########## ###########

#

#### ####

############# #####

#############

###

##########

##

###

#

###

# ##

#

############## ###

# #

#

########

#######

#

#####

####

######

#####

########

###

#######

#

########

## ######

### #

##########

#######

# ######

######

################

####

#

## #####

##

####

##

#

#########

##

## ### ##

##

##

# ##

#####

#

##

#

##### #

#######

## ## #################

#

####

#

#

########

###### ##

####

#

####

# ###

####

####

##

#

# ######## ######

#######

#############

##########

# ####### ## ##

##

###########

#

# ###

#

#

#

#######

###

#####

###

## ######

#### ##

#### ######

#

## #

######## #####

######

############

### ####

# ####### #######

### #####

#

###

#

#

######

####

## #####

## ######

###

# ### ## #

##

###

### #

##

# #

#####

#

#

##

#####

######################

#######

# ###

#

#

#

####### ####

########### ### ####

####

#

#

##

#######

#

###

##

#

####

######## #####

######

# ###

## ##

######### ##

##

### #####

# #

###### ###

# ######

#

## ### ########

#

###

#######

####### #

##########

#

####

####

######## ######################

# ## ##########

#

#####

######

###########

####

######

####

# ###

#

#

####

#######

# ###

### ######

##

## #

######

#######

###

### #####

#########

#

##

##

####

#

####

###

####

# #########

##

#

#

#

# ###

#

########

########

######

## ##

##################

####

###

##

###

##

#############

####

#

###

#

###

#

#

####

## #

###

######

###

#######

#####

####

#

# ## #####

##

# #

###

##

# ######## ##

###

##

#

# #

#

###########

###

# ######

#### #########

#######

# ############

### ############# #######

##

#####

######### ##### #

#########

## ############## #####

#######

################## ###

##

# ### #

###########

## ###############

#######

#####

####### #

# ###

# ### ###

############ #####

############## ### ###

###

### # ##

#### ### # ###

# ######

###

# ##

### #

##

# ##

#

#####

##

#

###########

# ###

###

####

##

### ###

###############

#

#

#

###

#

### #

##

#

#

### #

#

###

#

####

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

#

####

#########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################

#

#

#

#

##

# ## ##### ##

#################

###

####

# ##

####

########

#

###

###

##############

## #

# ###

#

# #########

################

##

#####

#

#

#

#

#

#

##

##

#

#

#

#

#

##

###

##

###

#

##

#

##

######

# ##

## #

## ### ##

####

######

##

##

# ####

####

#

######

###

###

##

##

##

#### ############

### ##### ######### ###### #

#####

#### #####

##

#

# ##

#

##

#

#

##

######

#

####

####

#

#

#

##

##

#

#

##

#

####

####

###

#

##

###

#

##

#####

#

# ## ##

#

#

###

##

##

#

##

#

##########

#

##########

#

#

##

# #

## #####

######

####

####

#### ##

##

### ###

### #####

### ## ###

##

#

#

#

##

#

#

##

##

## ##

##

####

#

#

#####

#######

#

##

#

###

##

####

#

## ##

#

##

##

#######

######

##

#

#### ##

###

#

# #

####

#

#

####

###

#

##

## ####

#

#

#

#

##

##

#######

# #

# ##

#

#

#####

#

#

####

#

#

###

########

## ##

#

###

#####

#

## ##

#

# ###

##

##

# #

#

#

#

#

##

#

##

##

#

###

###

##

#### #

#

##

#

##

#

#

#####

#

#

##

## ##

#

#

### #######

####

#

###

###

#

#

#

##

##

#

#

#

## #

#

#

#

#

##

#

#

##

#

#

#

####

#

###

###

#

### ###

#

#

#

#

#

#

# #

#### #####

#

#### #

##

#

##

# ###

#

### ######## #####

#####

##

# # ##

####### ##

##

##

###

#

#####

# ##

#

#####

#########

#

## # ##

#

##

##

####

##

##

#

#

#

###

#

###

##

##

##

####

##

##

#

##

#

###

##

####

#

#

## #

#

# ###############

#

# ##

###################

########## ###### ###########

#####

#

#

#

#

#

#

#

##

######

###

######

##

#

###

# #

###

###

####

# ######

#

##

##

#

####

#

#

#

##

#

#

## ### #

#

##

######

##

#

##

##

# ###########

#

#

##

###

#

#

##

###

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

#

#

#

#

##

##

#

#

#

#

#

##

####

###

#

###

###

###

#

##

#

#

#

##

#

#

##

###

#

##

###

# ## ## #

#

#

##

#

##

#

#

## ## # # ## ## #

###

##

#

##

# #

#

#

#

#

##

#

##

##

##

#

#

###

##

#

#

#

#

# #

##

##

###

##

##

##

##

##

## #

#

##

#

#

####

#

## #

#

#

#

#

#

# #

#

# #

####

# ## #

#

##

####

#

##

##

#

#

##

#

#

## #

#

#

#

#

#

##

## #

# ## #####

#

#

### #

#

#

#

###

#

## ##

#

#

##

#

##

##

####

#

#

##

#

#

###

#

#

## ##

#

### #

#

## ##

#

#

#

#

#

## ##

##

###

## ## ###

#

#

###

##

#

###

###

####

#

##

#

#

#

#

#

#

###

#

#

#

# ##

#

## #

##

#

#

#

##

#

##

#

##

##

##

#

#

####

#

###

#

# #

###

##

#

#

##

#

### #

###

## #

Hirat

Farah

Ghor

HilmandNimroz Kandahar

Badakhshan

Uruzgan Ghazni

Balkh

Zabul

Faryab

Paktika

Baghlan

Badghis

Sari Pul

Takhar

Bamyan

Jawzjan

Parwan

Wardak

Nuristan

Samangan

Kunduz

Paktya

KunarKabul

Nangarhar

Khost

Pakistan

Uzbakistan

Turkmanistan

Iran

Tajikistan

China

Dot=10 Persons/Sq Km

Non-Polio AFP Rate by Province, Afghanistan per 100,000 under 15 years

2008

2007

2006

0-0.991-23-45+


2.59

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

Badak

hshan

Centra

lEas

t

North

East

North

South

east

South

Wes

tAFG

Per

cen

tage

Y06 Y07 Y08

% of AFP cases reported within 7 days of paralysis onset by region Afghanistan 06-08


Proportion Of Adequate Stools By Region Afghanistan 06-08

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

Badak

hsha

n

Centr

alEas

t

North

East

North

South

east

South

ern

Wes

t

Nation

al

Per

cent

age

2006 2007 2008


0102030405060708090

100

Badak

hshan

Centr

al

Easte

rn

North

East

North

ern

South

easte

rn

South

ern

Wes

tern

Natio

nal

2006 2007 2008

AFP Cases with Stool Specimen Reaching The RRL Within 3 and 7 Days of 2nd Specimen Collection By Region, Afghanistan 06-08

Within 3 days

Within 7 days

0102030405060708090

100

Badak

hshan

Centr

al

Easte

rn

North

East

North

ern

South

easte

rn

South

ern

Wes

tern

Natio

nal

2006 2007 2008


0

2

4

6

8

10

12

14

16

18

20

Badak

hshan

Centra

l

Easte

rn

North

Easth

ern

North

ern

South

Easte

rn

South

ern

Wes

tern

Natio

nal

Pe

rce

nta

ge

Y06 Y07 Y08

Percentage of Entero -Virus and SL isolation Afghanistan 06-08

0

5

10

15

20

25

30

35

Badak

hshan

Centra

l

Easte

rn

North

Easth

ern

North

ern

South

Easte

rn

South

ern

Wes

tern

Natio

nal

Pe

rce

nta

ge

Y06 Y07 Y08

Entero Virus

SL

Per

cent

age

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

Jan Feb Mar Apr May Jun Jul Aug Sep Oct Nov Dec

Y06 Y07 Y08

EV % by month 06-08


afghanistan polio eradication initiative

Documents

region afghanistan

inadequate afp cases

days data

week of onset afghanistan

c data

sl isolation afghanistan

nonpolio afp rate

hot pending