yedİtepe Ünİversİtesİ mÜhendİslİk...
Post on 30-Aug-2019
17 Views
Preview:
TRANSCRIPT
1
2017
YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ
MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ
BOLOGNA
LİSANS
GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK PROGRAMI
BİLGİ PAKETİ
BÖLÜM BAŞKANI: PROF. DR. FİKRETTİN ŞAHİN
fsahin@yeditepe.edu.tr Dahili: 1619
BOLOGNA SORUMLUSU: YARD. DOÇ. DR. HÜSEYİN ÇİMEN
huseyin.cimen@yeditepe.edu.tr Dahili: 3259
2
YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ
MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ – GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK LİSANS PROGRAMI
BİLGİ PAKETİ (2017)
AMAÇ VE HEDEFLER
Genetik ve Biyomühedislik lisans programın amacı; genetik, biyomühendislik ve biyoteknoloji
alanında teknik ve temel bilgilere sahip, yaratıcı çözüm üreten ve uygulamada öncü bireyler
olarak yurt içi veya yurt dışı akademik, endüstriyel ve resmi kurumlarda liderlik rolünü
üstlenen, etik ve profesyonel sorumluklarının bilincinde Gen Mühendisi ve Biyomühendis
yetiştirmektir.
Moleküler Biyoloji ve Genetik, Biyoinformatik, Nanobiyoteknoloji, Doku Mühendisliği ve
Biyomalzemeler, Kök Hücre Teknolojileri gibi oldukça güncel konularda eğiterek akademi,
sanayi, klinik tıp, adli tıp gibi çeşitli alanlarda çözüm üretebilen ve ülkeye ulusal veya
uluslararası arenada rekabet gücü kazandırabilecek lider ruhlu bireyleri topluma
kazandırmak hedefimizdir.
PROGRAM ÖĞRENME ÇIKTILARI
PÇ01. Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahiptir.
PÇ02.
Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptar, tanımlar
ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunar.
PÇ03.
Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız
olarak deney tasarlar, deney yapar, veri toplar, sonuçları analiz edip ve yorumlar.
PÇ04.
İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da
süreci modern teknikler ile tasarlar.
PÇ05.
Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışır ve sorumluluk alarak karar almada
belirleyicidir.
PÇ06.
Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve
proje üretebilir.
PÇ07.
Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda
farkındalık yaratır.
PÇ08.
Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda
ifade edebilme becerisine sahiptir.
PÇ09.
Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisine
sahiptir.
PÇ10.
Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve
toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisine sahiptir.
3
Eğitim Öğretim Metotları
Öğretme – öğrenme yöntem ve stratejileri, öğrencilerin kendi kendine çalışma, yaşam boyu öğrenme, gözlem yapma, başkasına öğretme, sunma, eleştirel düşünme, takım çalışması, bilişimden etkin yararlanma gibi becerilerini arttıracak şekilde seçilmektedir. Ayrıca, öğretim tarzının farklı kabiliyetleri olan öğrencileri destekleyecek biçimde olmasına dikkat edilir. Programında kullanılan eğitim-öğretim metotları aşağıdaki listede verilmiştir*: (*) Dersin özelliklerine göre burada belirtilen yöntemlerin biri veya birkaçı uygulanabilir.
Eğitim - Öğretim Yöntemleri*
Başlıca öğrenme faaliyetleri Kullanılan Araçlar
1-Ders Dinleme ve anlamlandırma Standart derslik teknolojileri, çoklu ortam araçları, projektör, bilgisayar, tepegöz
2-Tartışmalı Ders Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme, eleştirel düşünme, soru geliştirme
Standart derslik teknolojileri, çoklu ortam araçları, projektör, bilgisayar, tepegöz
3-Özel Destek / Yapısal Örnekler
Önceden planlanmış özel beceriler
4-Rol Yapma / Drama Önceden planlanmış özel beceriler Standart derslik teknolojileri, özel donanım
5-Problem Çözme Önceden planlanmış özel beceriler
6-Vaka Çalışması Önceden planlanmış özel beceriler
7-Beyin Fırtınası Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme, eleştirel düşünme, soru geliştirme, takım çalışması
Standart derslik teknolojileri, çoklu ortam araçları, projektör, bilgisayar, tepegöz
8-Küçük Grup Tartışması
Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme, eleştirel düşünme, soru geliştirme
Standart derslik teknolojileri, çoklu ortam araçları, projektör, bilgisayar, tepegöz
9-Gösterim Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme Gözleme imkan verecek gerçek ya da sanal ortam
10-Benzetim Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme, Bilişim becerileri
Gözleme imkan verecek gerçek ya da sanal ortam
11-Seminer Araştırma – yaşam boyu öğrenme, yazma, okuma, Bilişim, Dinleme ve anlamlandırma, yönetsel beceriler
Standart derslik teknolojileri, çoklu ortam araçları, projektör, bilgisayar, tepegöz, özel donanım
12-Grup Çalışması Araştırma – yaşam boyu öğrenme, yazma, okuma, Bilişim, eleştirel düşünme, soru geliştirme, yönetsel beceriler, takım çalışması
İnternet veri tabanları, kütüphane veri tabanları, e-posta, çevrimiçi sohbet, Web tabanlı tartışma forumları
13-Saha / Arazi Çalışması
Gözlem/durumları işleme, Araştırma – yaşam boyu öğrenme, yazma, okuma
14-Laboratuar Gözlem/durumları işleme, Bilişim, yönetsel beceriler, takım çalışması
Özel donanım
15-Ödev Araştırma – yaşam boyu öğrenme, yazma, okuma, Bilişim İnternet veri tabanları, kütüphane veri tabanları, e-posta
16-Sözlü Araştırma – yaşam boyu öğrenme, durumları işleme, soru geliştirme, yorumlama, sunum
17-İnceleme / Anket Çalışması
Araştırma – yaşam boyu öğrenme, yazma, okuma
18-Panel Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme Standart derslik teknolojileri, çoklu ortam araçları, projektör, bilgisayar, tepegöz, özel donanım
19-Konuk Konuşmacı Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme
Standart derslik teknolojileri, çoklu ortam araçları, projektör, bilgisayar, tepegöz, özel donanım
20-Öğrenci Topluluğu Faaliyetleri / Projeleri
Gözlem/durumları işleme, eleştirel düşünme, soru geliştirme, takım çalışması, Araştırma – yaşam boyu öğrenme, yazma, okuma, yönetsel beceriler, Önceden planlanmış özel beceriler
(*) Dersin özelliklerine göre burada belirtilen yöntemlerin biri veya birkaçı uygulanabilir.
4
GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ (2017 GÜZ) BİRİNCİ YARIYIL T U L Y A İKİNCİ YARIYIL T U L Y A
GBE 111 Biyoloji I 2 1 3 4 8 GBE 102 Biyoloji II 3 0 0 3 3
MATH 131 Kalkülüs I 3 2 0 4 6 MATH 132 Kalkülüs II 3 2 0 4 6
AFE 131 Akademik İngilizce I 2 2 0 3 4 AFE 132 Akademik İngilizce II 2 2 0 3 4
PHYS 101 Fizik I 3 0 2 4 6 PHYS 102 Fizik II 3 0 2 4 6
CHEM 111 Genel Kimya I 2 2 0 3 6 CHEM 112 Kimya II 2 2 0 3 6
CHEM 113 Genel Kimya Lab 1 0 2 2 5
18 30 19 30
ÜÇÜNCÜ YARIYIL T U L Y A DÖRDÜNCÜ YARIYIL T U L Y A
GBE 203 Mikrobiyoloji 2 1 3 4 7 GBE 212 Klasik ve Moleküler Genetik 2 2 0 3 6
GBE 205 Hücre Biyolojisi 2 1 3 4 6 GBE 216 Klasik ve Moleküler Genetik Lab 0 1 3 2 5
CHEM 205 Organik Kimyaya Giriş ve Biyomakromoleküller
2 2 0 3 6 CHEM 215 Analitik Kimya 3 0 2 4 6
GBE 222 Biyometri: Biyomühendislik Uygulamaları için Nümerik ve İstatiksel Yöntemler
2 2 0 3 6 ECON 294 Ekonomi 3 0 0 3 4
ES 117 Bilgisayarlı Hesaplamaya Giriş 2 0 2 3 5 MATH 241 Diferansiyel Denklemler 3 2 0 4 6
HUM 103 Uygarlık Tarihi 2 0 0 2 3
17 30 18 30
BEŞİNCİ YARIYIL T U L Y A ALTINCI YARIYIL T U L Y A
GBE 301 Biyokimya I 2 1 3 4 7 GBE 302 Biyokimya II 2 1 3 4 9
GBE 321 Biyotermodinamik 2 2 0 3 5 GBE 326 Deneysel Genetik ve Biyomühendislik I: İlkeler
2 0 2 3 6
GBE 341 Gen Mühendisliği Teknikleri I 2 2 0 3 6 GBE 342 Gen Mühendisliği Teknikleri II 2 1 3 4 8
GBE 361 Biyotransport Olayları 2 2 0 3 5 GBE XX1 Kısıtlı Seçmeli I 3 0 0 3 5
TKL 201 Türk Dili I 2 0 0 2 2 TKL 202 Türk Dili II 2 0 0 2 2
FE XX1 Serbest Seçmeli I 3 0 0 3 5
18 30 16 30
YEDİNCİ YARIYIL T U L Y A SEKİZİNCİ YARIYIL T U L Y A
GBE 403 Moleküler Biyoloji I 3 0 0 3 6 GBE 404 Moleküler Biyoloji II 2 1 3 4 5
GBE 415 Deneysel Genetik ve Biyomühendislik II: Tasarım ve Uygulamalar
2 2 0 3 6 GBE 492 Mühendislik Projesi 1 0 4 3 8
GBE XX2 Kısıtlı Seçmeli II 3 0 0 3 5 GBE XX3 Kısıtlı Seçmeli III 3 0 0 3 5
GBE 451 Biyoproses Mühendisliği Teknikleri
3 0 0 3 6 GBE XX4 Kısıtlı Seçmeli IV 3 0 0 3 5
ES 301 Mühendislik Yönetimi 3 0 0 3 4 HTR 302 Atatürk İlkeleri & İnkılap Tarihi II 2 0 0 2 2
HTR 301 Atatürk İlkeleri & İnkılap Tarihi I 2 0 0 2 2 FE XX2 Serbest Seçmeli II 3 0 0 3 5
GBE 400 Yaz Stajı 0 2 0 0 1
17 30 18 30
Mezuniyet için Minimum Gerekenler
Kredi 141
AKTS 240
Ders Sayısı 45
Yaz Stajı Sayısı 1
5
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Biyoloji I GBE 111 1 2 + 1 + 3 4 8
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Yard. Doç. Dr. Hüseyin Çimen
Dersi Verenler Yard. Doç. Dr. Hüseyin Çimen
Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerleri
STAJ YOK
Dersin Amacı
Öğrencilerin hücrenin temel biyolojisi hakkında bilgi sahibi
olmalarını sağlamak ve deneysel yaklaşımlar ile pratik
geliştirilmesini sağlamak.
Dersin İçeriği
İşlevsel gruplar ve biyopolimerler; hücre metabolizması ve
fermentasyon; fotosentez; mitoz ve mayoz; DNA yapısı ve
çoğalması; transkripsiyon; translasyon; gen anlatımının kontrolü.
Ders içeriğine paralel laboratuar deneyleri.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Hücre yapısı ve fonksiyonunun temel kavramlarının anlaşılması.
1 1,2 A,C
2) Farklı hücre tiplerinin ve iç yapıların ışık mikroskobu kullanılarak incelenmesi ve yorumlanması.
1,3 1,2,3 A,B,C
3) Yaşam bilimleri laboratuar araçlarının doğru şekilde kullanılması ve deney sonuçlarının yorumlanması.
1,3 1,2,3 A,B,C
4) Moleküler Biyoloji tekniklerini kullanarak DNA izolasyonu ve analizini değerlendirebilmek ve analiz edebilmek.
1,3 1,2,3 A,B,C
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Laboratuar, 4: Vaka Çalışması
Assessment Methods:
A: Sınav, B: Deney, C: Ödev, D: Proje
6
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Biyolojiye Giriş; Su ve Çevrenin Sağlığı Ders Kitabı/
İnternet sitesi
2 Karbonun Önemi; Polimer İlkeleri Ders Kitabı/
İnternet sitesi
3 Hücre Turu Ders Kitabı/
İnternet sitesi
4 Membran Yapı ve İşlevi; Metabolizmaya Giriş Ders Kitabı/
İnternet sitesi
5 Hücresel Solunum Ders Kitabı/
İnternet sitesi
6 Ara Sınav I
7 Fotosentez Ders Kitabı/
İnternet sitesi
8 Hücre Çevrimi Ders Kitabı/
İnternet sitesi
9 Mayoz ve Eşeysel Hücre Çevrimi Ders Kitabı/
İnternet sitesi
10 Kalıtımın Moleküler Temeli Ders Kitabı/
İnternet sitesi
11 Genden Proteine Ders Kitabı/
İnternet sitesi
12 Ara Sınav II
13 Gen Anlatımının Kontrolü Ders Kitabı/
İnternet sitesi
14 Virüsler Ders Kitabı/
İnternet sitesi
15 Biyoteknoloji Ders Kitabı/
İnternet sitesi
16 Genomlar ve Evrimleri Ders Kitabı/
İnternet sitesi
KAYNAKLAR
Ders Kitabı “Biology”, Mader & Windelspecht, 11. Baskı (Uluslararası Baskı) With CONNECT
Diğer Kaynaklar CONNECT Ödev sitesi http://connect.mcgraw-hill.com
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları pdf formatında çevrimiçi olarak öğrencilerin indirebilmesi için mevcuttur.
7
Ödevler Laboratuar raporları her hafta toplanmaktadır.
Sınavlar 2 Ara Sınav ve 1 Final
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 30
Deney 8 40
Ödev 10 10
Proje
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 20
Yıl İçinin Başarıya Oranı 80
Toplam 100
Ders Kategorisi Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları
Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma.
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi.
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
X
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi.
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik Sayısı Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi (Ön çalışma, pekiştirme) 14 7 98
Ara Sınav 2 2 4
Deney 8 3 24
Ödev 10 2 20
Proje
Final Sınav 1 3 3
Toplam İş Yükü 191
Toplam İş Yükü / 25 (s) 7,64
Dersin AKTS Kredisi 8
9
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Biyoloji II GBE 102 2 3 + 0 + 0 3 3
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi
Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Yard. Doç. Dr. Fatih Kocabaş
Dersi Verenler
Yard. Doç. Dr. Fatih Kocabaş
Dersin Yardımcıları
YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı
Öğrencilerin temel biyoloji ve evrim hakkında bilgi sahibi olmasını
sağlamanın yanı sıra dünyadaki hayatın tarihçesi ve tüm yaşam formları
hakkında genel bakış açısı kazandırmak. Moleküler teknikler ve genetik
analizler hakkında bilgi vermek.
Content
Evrimsel biyoloji ve Darvinci bakış açısının özeti; evrimin ve
prokaryotların, mantarların, bitkilerin ve hayvanların ana formlarının özeti;
bitki büyümesi, sinyal yolakları ve biyoteknolojisi; doku çeşitleri ve
yapıları, beslenme, dolaşım sistemi, gaz alışverişi, bağışıklık sistemi
yapısı ve işlevi, endokrin sistem ve hormonal sinyalizasyon ve sinir
sistemi yapısı ve fonksiyonunu kapsayan hayvan fizyolojisi temelleri.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Evrim ve sistematiğin temel kavramlarının anlaşılması.
1 1,2 A,C
2) Biyoloji ve fizyolojinin temel yönlerinin ve prokaryot, mantar, bitki ve hayvanlarda farklı formlarının anlaşılması.
1 1,2 A, C
3) Bitkilerde nesillerin devam edişinin, bitki büyümesinin farklı açılarının ve bitki hormonlarının etkilerinin anlaşılması.
1 1,2 A, C
4) Farklı hayvansal organ sistemlerinin ve özellikle insanlarda nasıl etkileştiklerinin
1 1,2 A, C
10
anlaşılması ve açıklanması.
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Laboratuar, 4: Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav, B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Değişen Miras; Populasyonların Evrimi Ders Kitabı/
İnternet sitesi
2 Dünyadaki Yaşamın Tarihi; Filogeni Ders Kitabı/
İnternet sitesi
3 Bakteri ve Arke Ders Kitabı/
İnternet sitesi
4 Protista Ders Kitabı/
İnternet sitesi
5 Mantar Ders Kitabı/
İnternet sitesi
6 Ara Sınav I
7 Bitki Çeşitliliği I; Bitki Çeşitliliği II Ders Kitabı/
İnternet sitesi
8 Bitki Yapısı, Büyümesi & Gelişmesi Ders Kitabı/
İnternet sitesi
9 Bitkilerde Üreme ve Biyoteknoloji Ders Kitabı/
İnternet sitesi
10 Hayvan Çeşitliliğine Giriş, Omurgasızlar; Omurgalılar Ders Kitabı/
İnternet sitesi
11 Hayvan Yapısının ve İşleyişinin İlkeleri Ders Kitabı/
İnternet sitesi
12 Ara Sınav II
13 Hayvanlarda Beslenme; Dolaşım ve Gaz Alışverişi Ders Kitabı/
İnternet sitesi
14 Bağışıklık Sistemi Ders Kitabı/
İnternet sitesi
15 Hormonlar ve Endokrin Sistem Ders Kitabı/
İnternet sitesi
16 Sinir Sistemi; Nöronlar, Sinapslar ve Sinyaller Ders Kitabı/
İnternet sitesi
KAYNAKLAR
Ders Kitabı “Biology”, Mader & Windelspecht, 11. Baskı (Uluslararası Baskı) With CONNECT
Diğer Kaynaklar Ödev İnternet Sitesi http://connect.mcgraw-hill.com
11
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları öğrenciler tarafından pdf formatında indirilebilmektedir.
Ödevler
Sınavlar 2 Ara Sınav ve 1 Final.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 50
Deney
Ödev 10 10
Proje
Toplam 60
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl İçinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma.
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi.
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi.
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi.
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi.
12
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi.
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık.
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi.
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi.
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi.
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlikler Sayısı Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 3 42
Ara Sınav 2 3 6
Deney
Ödev
Proje
Final sınav 1 3 3
Toplam İş Yükü 93
Toplam İş Yükü / 25 (s) 3.72
Dersin AKTS Kredisi 3
13
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
MİKROBİYOLOJİ GBE 203 3 2 + 1 + 3 4 7
Ön Koşul Dersleri GBE 111
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Prof. Dr. Fikrettin Şahin
Dersi Verenler Prof. Dr. Fikrettin Şahin
Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerleri
STAJ YOK
Dersin Amacı
Öğrencilerin mikrobiyoloji, temel genetik ve moleküler biyoloji
geçmişi elde etmelerini sağlamak ve deneysel yaklaşımlarla pratik
deneyimlerini geliştirmek
Dersin İçeriği
Mikroorganizmalar, onların tanımlamaları, metabolizma, büyüme
koşulları, mikroorganizmaların kontrolü, mikrobiyal genetik ve
biyoteknolojik uygulamalar. Ders içeriğine paralel olarak
laboratuvar deneyleri.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Mikrobiyoloji ve moleküler biyoloji ile ilgili kavramları anlayabilmek ve temel genetik geçmişi elde etmek
2,3,7,10 1,2 A,C
2) Farklı besiyeri çeşitlerini kullanarak bakteri kültürleri hazırlayabilmek, ekim teknikleri, boyama ve mikroskopta gözlemleme
2,3,10 1,2,3 A,B,C
3)Mikrobiyal metabolizmayı ve onların büyüme koşullarını anlayabilmek, bir biyoreaktörün çalışma prensibini gözlemlemek ve mikroorganizmaların nasıl kontrol edilebileceğini öğrenmek
2,3,10 1,2,3 A,B,C
4)Bakteriden genomik ve plazmid DNA izolasyonunu yapabilmek, agaroz jel elektroforezi, restriksiyon ve transformasyon
2,3,10 1,2,3 A,B,C
14
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri: A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1
Kısaca Mikrobiyoloji Tarihi, Mikroplar ve İnsanlara Yararları,
Mikroplar ve İnsan Hastalıkları Ders Kitabı
2
Atomların Yapıları, Atomlar Nasıl Molekül Oluştururlar: Kimyasal
Bağlar, Kimyasal Reaksiyonlar, Inorganik Bileşikler, Organik
Bileşikler
Ders Kitabı
3
Ölçüm Birimleri, Mikroskopi: Aletler, Işık Mikroskobu İçin Örnek
Hazırlanması, Boyama Teknikleri
Ders Kitabı
4
Prokaryotik ve Ökaryotik Hücrelerin Kıyaslanması, Bakteri
Hücrelerinin Boyutu, Şekli ve Düzenlenmesi, Hücre Duvarının
Dışındaki Yapılar,Hücre Duvarının İçindeki Yapılar
Ders Kitabı
5
Ökaryotik Hücre, Kamçı ve Sil, Hücre Duvarı, Glikokaliks, Plazma
Zarı, Sitoplazma ve Organeller, Ökaryotların Evrimi
Ders Kitabı
6
Katabolik ve Anabolik Reaksiyonlar, Enzimler, Enerji Üretimi,
Karbonhidrat Katabolizması
Ders Kitabı
7
Yağ ve Protein Katabolizması, Biyokimyasal Testler ve Bakteri
Tanımlanma
Ders Kitabı
8
Fotosentez, Organizmalar Arasındaki Metabolik Çeşitlilik, Enerji
Kullanımının Metabolik Yolakları, Metabolizma Birleşmesi
Ders Kitabı
9
Büyüme Gereksinimleri, Besiyeri, Saf Kültür Elde Etme, Bakteri
Kültürlerini Saklama, Bakteri Kültürlerinin Büyümesi
Ders Kitabı
10
Mikrobiyal Kontrol Terminolojisi, Mikrobiyal Ölüm Derecesi,
Mikrobiyal Kontrol İçin Fiziksel Yöntemler
Ders Kitabı
11 Mikrobiyal Kontrol İçin Kimyasal Yöntemler Ders Kitabı
12
Genetik Materyalin Yapısı ve Fonksiyonu, Bakteriyel Gen
Ekspresyonunun Düzenlenmesi
Ders Kitabı
13
Mutasyon: Genetik Materyalde Değişim, Genetik Aktarım ve
Rekombinasyon
Ders Kitabı
15
14
Biyoteknolojiye Giriş, Biyoteknoloji Araçları, Genetik Mühendisliği
Teknikleri
Ders Kitabı
15
Genetik Mühendisliği Uygulamaları, Güvenlik Konuları ve Genetik
Mühendisliği Etiği
Ders Kitabı
16
Filogenetik Akrabalık Çalışması, Organizmaların Sınıflandırılması,
Sınıflandırma ve Tanımlama Yöntemleri
Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Mikrobiyolojiye Giriş (Tortora, Funke, Case), Onuncu Baskı
Diğer Kaynaklar Mikrobiyolojide Laboratuvar Deneyleri (Johnson Case) Yedinci Baskı
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin email adreslerine gönderilmektedir.
Ödevler 1 ödev
Sınavlar Laboratuvar Sınavı (Her hafta), 1 Arasınav ve 1 Final
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 1 20
Deney 12 20
Ödev 1 10
Proje
Final Sınavının Başarıya Oranı 1 50
Yıl içinin Başarıya Oranı
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
16
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
X
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
X
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
X
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
X
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 5 70
Ara Sınav 1 3 3
Deney 12 3 36
Ödev 1 10 10
Proje
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 164
Toplam İş Yükü / 25 (s) 6,56
Dersin AKTS Kredisi 7
17
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Hücre Biyolojisi GBE 205 3 2 + 1 + 3 4 6
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç. Bahar Soğutmaz Özdemir
Dersi Verenler Yrd. Doç. Bahar Soğutmaz Özdemir
Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerleri
STAJ YOK
Dersin Amacı Öğrencilerin temel genetik ve moleküler biyoloji temelini
güçlendirip teorik ve pratik seviyelerini artırmak
Dersin İçeriği
Hücrenin evrimi; ilkel dünyanın şartları ve protohücrenin oluşumu;
hücre yapısının keşfi ve hücresel organizasyonun önemi; hücre
organelleri; hücre zarının yapısı ve işlevi; hücreiçi zar ağları; DNA
paketlemesi; çekirdek; oksijenli solunum ve mitokondri; fotosentez
ve kloroplast; hücre iskeletinin yapısı; hücredışı yapı ve hücre
matrisi; hücrelerarası tanıma ve hücre yapışması; hücre döngüsü
ve hücre bölünmesi; hücrelerarası kimyasal işaretleşme; hücre
farklılaşması; kanser
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
prokayotik ve ökaryotik hücre farklarını öğrenir 1 1,2,4 A,C
Genetik hastalıklar hakkında bir derleme hazırlayıp sunarak bilimsel uygulamaları öğrenir.
1,3 1,2,3,4 A,B,C,D
araştırma metodlarını öğrenerek deney tasarımını öğrenir 1,3 1,2,3,4 A,B,C,D
değişik mikroskpları ve kullanımlarını öğrenir 1,3 1,2,3,4 A,B,C,D
moleküler düzeyde hücre kimyası öğrenir 1,3 1,2,3,4 A,B,C,D
sitoskeleton yapısını öğrenir 1,3 1,2,3,4 A,B,C,D
18
hücresel solunum ve metabolizma vede enerjiyi öğrenerek vaka sunumu yapar
1,3,5 1,2,3,4 A,B,C,D
protein sorting ve vezikülar taşımayı öğrenir 1,3 1,2,3,4 A,B,C,D
kanser mekanizmasını kavrar 1,3 1,2,3,4 A,B,C,D
Öğretim Yöntemleri: 1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri: A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 hücrelere giriş Ders Kitabı
2 araştırma metodları Ders Kitabı
3 hücrenin kimyasal içeriği Ders Kitabı
4 protein yapısı Ders Kitabı
5 kromozom yapı ve organizasyonu Ders Kitabı
6 DNA replikasyonö onarım ve rekombinasyonu Ders Kitabı
7 Ara Sınav 1 (Vaka Çalışması) Ders Kitabı
8 metabolizma ve enerji Ders Kitabı
9 DNAdan protein üretimine Ders Kitabı
10 Gen ekspresyon kontrolü Ders Kitabı
11 zar yapısı Ders Kitabı
12 Ara Sınav II Ders Kitabı
13 hücre içi yapılar ve taşıma Ders Kitabı
14 sitoskeleton Ders Kitabı
15 hücreler arası iletişim Ders Kitabı
16 kanser Ders Kitabı
KAYNAKLAR
19
Ders Kitabı
Essential Cell Biology, Alberts&Bray&Hopkin&Johnson&Lewis&Raff&Roberts&Walter Second Edition, Garland Science World of the Cell, The International Edition 7.th Edition Wayne Becker, Lewis Kleinsmith, Jeff Hardin, Gregory Bertoni
Diğer Kaynaklar ders notları ve slaytlar
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin email adreslerine gönderilmektedir.
Ödevler 2 ödev
Sınavlar 2 Arasınav ve 1 Final
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 30
Deney 8 30
Ödev 2 10
Proje
Final Sınavının Başarıya Oranı 1 30
Yıl içinin Başarıya Oranı
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama,
X
20
sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
x
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 12 7 84
Ara Sınav 2 3 6
Deney 8 3 24
Ödev 2 5 10
Proje
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 169
Toplam İş Yükü / 25 (s) 6,76
Dersin AKTS Kredisi 6
21
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Organik Kimya ve Biyomoleküllere Giriş
CHEM 205 3 2 + 2 + 0 3 6
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Yard. Doç. Dr. Andrew Harvey
Dersi Verenler Yard. Doç. Dr. Andrew Harvey
Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerleri
Staj YOK
Dersin Amacı
Öğrencilerin, fonksiyonel gruplar ve bunların kimyaları başta olmak
üzere temel organik kimya hakkında bilgi sahibi olmalarını
sağlamak. Fonksiyonel grup kimyası hakkında öğrenilen bilgiyi
yaygın biyomakromoleküllerin yapısı ve fonksiyonu ile birleştirmek.
Dersin İçeriği
Karbon kimyası özeti ve 3 boyutlu yapıların etkisi. Yaygın organik
fonksiyonel grupların kimyası. IUPAC kurallarına göre isimlendirme
ve yapı çizimi ve organik molekül terminolojisi. Yaygın organik
sübstitüsyon ve eliminasyon reaksiyonları. Yaygın organik
moleküllerin sentezi ve verdikleri reaksiyonlar. Nükleik asitler,
proteinler, karbonhidratlar ve lipidler gibi önemli
biyomakromoleküllerin yapı ve fonksiyonları.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Karbon kimyasının temellerini ve yaygın fonksiyonel grupların reaktivitelerini anlama.
1 1,2 A,C
2) Mekanistik mantık temellerinde reaksiyon modellerinin anlaşılması ve yorumlanması.
1 1,2 A, C
3) Spektroskopik dataya dayanarak moleküllerin anlaşılması ve yorumlanması.
1 1,2 A, C
4) Nükleik asitler, proteinler, karbonhidratlar ve lipid de dahil olmak üzere biyomakromoleküllerin yapısının ve reaktivitesinin anlaşılması.
1 1,2 A, C
Öğretim 1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Laboratuar, 4: Vaka Çalışması
22
Yöntemleri:
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav, B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Yapı ve Bağ Oluşumu; Asitler ve Bazlar Ders Kitabı/
İnternet Sitesi
2 Alkenler; Sikloalkenler Ders Kitabı/
İnternet Sitesi
3 Organik Reaksiyonların Özeti; Alkenler ve Alkinler Ders Kitabı/
İnternet Sitesi
4 Alkenlerin ve Alkinlerin Reaksiyonları; Aromatik Bileşikler Ders Kitabı/
İnternet Sitesi
5 Stereokimya Ders Kitabı/
İnternet Sitesi
6 Ara Sınav I
7 Haloalkenler; Nükleofilik Sübstitüsyon ve Eliminasyon Ders Kitabı/
İnternet Sitesi
8 Alkoller, Fenoller ve Tioller Ders Kitabı/
İnternet Sitesi
9 Aldehitler ve Ketonlar: Nükleofilik Eklenme Reaksiyonları Ders Kitabı/
İnternet Sitesi
10 Karboksilik Asitler ve Türevleri Ders Kitabı/
İnternet Sitesi
11 Karbonil α-sübstitüsyon ve kondensasyon reaksiyonları: aminler ve heterohalkalar
Ders Kitabı/ İnternet Sitesi
12 Ara Sınav II
13 Biyomoleküller: Karbonhidratlar Ders Kitabı/
İnternet Sitesi
14 Biyomoleküller: Amino Asitler ve Proteinler Ders Kitabı/
İnternet Sitesi
15 Biyomoleküller: Lipidler; Nükleik Asitler Ders Kitabı/
İnternet Sitesi
16 Yapı Tespiti Ders Kitabı/
İnternet Sitesi
KAYNAKLAR
Ders Kitabı “Fundamentals of Organic Chemistry”, John McMurry, 7. Uluslararası Baskı, ‘OWL Access’ ile
Diğer Kaynaklar OWL ödev sitesi http://owl.cengage.com
23
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları pdf formatında öğrencilerin erişimine açıktır.
Ödevler
Sınavlar 2 Ara Sınav ve 1 Final.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 25
Deney
Ödev 10 1
Proje
Toplam 60
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl İçinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma.
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi.
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi.
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi.
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
24
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik Sayısı Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 4 56
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 5 70
Ara Sınav 2 1 2
Deney
Ödev 10 1 10
Proje
Final Sınavı 1 2 2
Toplam İş Yükü 140
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5.60
Dersin AKTS Kredisi 6
25
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Biyometri: Biyomühendislik Uygulamaları için Nümerik ve İstatiksel Yöntemler
GBE 222 3 2 + 2 + 0 3 6
Ön Koşul Dersleri MATH 131
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç. Dr. Emrah Nikerel
Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Emrah Nikerel
Dersin Yardımcıları
Dersin Amacı
Biyomühendislik alanında kullanılacak istatistiksel ve nümerik
yöntemlerle ilgili temel kavramlara, teorik temellere giriştir.
emelinde biyoistatistik ve numerik yöntemlerin uygulama alanları
oldukça geniş olmasına rağmen, bu derste özellikle genetikve
biyomühendisliğin çeşitli alanlardaki uygulamalarına
odaklanılmıştır.
Dersin İçeriği
Lineer cebir uygulamaları, lineer olmayan denklem sistemlerinin
nümerik çözümü, biyolojik sistemlerden deneysel bilgi eldesi,
temel istatistiksel kavramlar ve analizler, model tabanlı deney
tasarımı gibi yeni ve temel kavramlara giriş yapılacaktır.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Biyoistatistiğin temelleri ve uygulama alanları hakkında farkındalık kazanır
1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C
2) Temel biyoistatistik yöntemlerini kullanır 1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C
3) Lineer cebirin temelleri ve biyolojik sistemlerdeki uygulamaları hakkında farkındalık kazanır
1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Laboratuar, 4: Vaka Çalışması
Ölçme ve Değerlendirme
A: Sınav, B: Deney, C: Ödev, D: Proje
26
Yöntemleri:
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma Malzemeleri
1 Giriş: Biyolojik sistemlerde biyoistatistik ve lineer cebir uygulamalarına genel bakış
Ders notları ve sunum malzemeleri
2 Lineer denklem sistemleri ve (Homojen) denklem sistemlerinin çözümü
Ders notları ve sunum
malzemeleri
3 Vektör ve Matrix işlemleri, Matrix tersi, Lineer denklem sistemlerinin çözümü, tekil olmayan matrisler
Ders notları ve sunum
malzemeleri
4 Lineer bağımlılık, bağımsızlık ve germe
Ders notları ve sunum
malzemeleri
5 Özdeğerler, öz vektörler ve özellikleri
Ders notları ve sunum
malzemeleri
6 Ara Sınav I
7 Biyolojik sistemlerde uygulamalar
Ders notları ve sunum
malzemeleri
8 Genel tekrar, ara sınav.
Ders notları ve sunum
malzemeleri
9 Biyoistatistik bilimine genel bakış, Normal dağılım, güven aralığı.
Ders notları ve sunum
malzemeleri
10 Hipotez testinin teorisi, tek örnekli t-test, 2 bağımsız örnek için t-test, eşli t-test
Ders notları ve sunum
malzemeleri
11 ANOVA
Ders notları ve sunum
malzemeleri
12 Ara Sınav II
13 P-değerlerinin yorumlanması; çoklu karşılaştırma
Ders notları ve sunum
malzemeleri
14 Korelasyon analizi
Ders notları ve sunum
malzemeleri
15 Sürekli verilerin modellenmesi: çoklu regresyon
Ders notları ve sunum
malzemeleri
16 Genel tekrar ve proje sunumları Ders notları ve sunum
27
malzemeleri
KAYNAKLAR
Ders Notu Araştırma makaleleri; ders notları; sunumlar
Diğer Kaynaklar
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar
Dönemin ikinci yarısından itibaren öpencilere o haftaki konuya ilişkin güncel araştırma makalelerinden ödevler verilmektedir. Ayrıca dönem sonunda Trends in Genetics dergisinin reveiw makale formatına uygun bir sonuç raporu yazmaları beklenmektedir.
Ödevler
Sınavlar 2 Ara Sınav ve 1 Final.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 50
Deney
Ödev 10 10
Proje
Toplam 60
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl İçinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma.
X
28
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi.
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi.
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi.
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik Sayısı Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 4 56
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 5 70
Ara Sınav 2 1 2
Deney
Ödev 10 1 10
Proje
Final Sınavı 1 2 2
Toplam İş Yükü 140
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5.60
Dersin AKTS Kredisi 6
29
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Klasik ve Moleküler Genetik
GBE 212 4 2 + 2 + 0 3 6
Ön Koşul Dersleri GBE 111
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Prof.Dr.Gamze Torun Köse
Dersi Verenler Prof.Dr.Gamze Torun Köse
Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerleri
STAJ YOK
Dersin Amacı Öğrencilerin, klasik ve moleküler genetik konusunda bilgilerini
arttırmayı sağlamak.
Dersin İçeriği
Mitoz ve Mayoz, Mendel Genetiği, Mendel Genetiği Uzantıları,
Gen Bağlanması, Kros Over ve Ökaryotlarda Gen
Haritalandırması, Seks Kromozomları, Kromozom Mutasyonları,
DNA Yapısı ve Analizi, DNA Replikasyonu ve Rekombinasyonu,
Kromozom Yapısı ve DNA Dizilim Organizasyonu, Transkripsiyon,
Translasyon ve Protein, Gen Mutasyonu, DNA Tamiri ve Hareketli
Genler, Bakteri Genetiği, Prokaryotlarda Gen Anlatımı
Regülasyonu, Ökaryotlarda Gen Anlatımı Regülasyonu,
Rekombinant DNA Teknolojisi.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Klasik Genetiği kavrayabilme ve problemleri çözebilme
1,2 1,2 A,C
2) Moleküler Genetiğin temellerini ve tekniklerini öğrenme
1 1,2 A
3) Prokaryot ve Ökaryotlardaki gen regulasyonlarını kavrayabilme
1 1,2 A
4) Rekombinant DNA Teknolojisini öğrenme 1 1,2 A
Öğretim 1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
30
Yöntemleri:
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Mitoz ve Mayoz
Ders Kitabı
2 Mendel Genetiği Ders Kitabı
3 Mendel Genetiği Uzantıları Ders Kitabı
4
Gen Bağlanması, Kros Over ve Ökaryotlarda Gen
Haritalandırması,
Seks Kromozomları
Ders Kitabı
5 Kromozom Mutasyonları Ders Kitabı
6
DNA Yapısı ve Analizi
DNA Replikasyonu ve Rekombinasyonu
Ders Kitabı
7
Vize I
Kromozom Yapısı ve DNA Dizilim Organizasyonu
Ders Kitabı
8 Transkripsiyon Ders Kitabı
9 Translasyon ve Protein Ders Kitabı
10 Gen Mutasyonu, DNA Tamiri ve Hareketli Genler Ders Kitabı
11
Bakteri Genetiği,
Prokaryotlarda Gen Anlatımı Regülasyonu
Ders Kitabı
12 Vize II Ders Kitabı
13 Ökaryotlarda Gen Anlatımı Regülasyonu Ders Kitabı
14 Rekombinant DNA Teknolojisi Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Concepts of Genetics- W.S.Klug, M.R.Cummings
31
Diğer Kaynaklar
Molecular biology of the gene-Watson, Baker, Bell, Gann, Levine,
Genetic Engineering- D.S.T. Nicholl
Genes VIII- B.Lewin
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Bazı ders slideları öğrencilere verilmektedir
Ödevler Mendel Genetiği soru kağıtları öğrencilere verilmektedir
Sınavlar 2 Arasınav ve 1 Final verilmektedir
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 60
Deney
Ödev
Proje
Final 1 40
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
X
32
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 4 56
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 4 56
Ara Sınav 2 4 8
Deney
Ödev 2 5 10
Proje
Final Sınavı 1 4 4
Toplam İş Yükü 134
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5,36
Dersin AKTS Kredisi 6
33
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Klasik ve Moleküler Genetik Laboratuvar
GBE 216
4 0 + 1 + 3 2 5
Ön Koşul Dersleri GBE 111
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Prof.Dr.Gamze Torun Köse
Dersi Verenler Prof.Dr.Gamze Torun Köse
Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerleri
STAJ YOK
Dersin Amacı Öğrencilerin klasik ve moleküler genetik teknikleri hakkında bilgi
ve deneysel yaklaşımlar ile pratik geliştirmesini sağlamak.
Dersin İçeriği
Monohibrid, Dihibrid ve Geri Çaprazlama, Politen kromozom,
Eşeye bağlılık ve çaprazlama, DNA izolasyonu ve Agaroz Jel
Elektroforezi, PCR ve RFLP, DNA Dizilim Analizi, Total RNA
İzolasyonu, RT-PCR, Kromozom Analizi
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Klasik ve Moleküler Genetik tekniklerini kavrayabilme ve pratik yapabilme
1,3 1,2,3 A,B,C
2) Moleküler Genetiğin temelini ve tekniklerini kavrama ve pratik yapabilme
1,3 1,2,3 A,B,C
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
34
1 Mendel Genetiğine giriş
Ders Kitabı
2 Monohibrid, Dihibrid ve Geri Çaprazlama Ders Kitabı
3 Eşeye bağlılık ve çaprazlama Ders Kitabı
4 Politen kromozom Ders Kitabı
5 DNA izolasyonu ve Agaroz Jel Elektroforezi Ders Kitabı
6 PCR ve RFLP Ders Kitabı
7 Vize I Ders Kitabı
8 Total RNA izolasyonu Ders Kitabı
9 RT-PCR Ders Kitabı
10 Kromozom Analizi Ders Kitabı
11 DNA Sekanslama Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Concepts of Genetics- W.S.Klug, M.R.Cummings
Diğer Kaynaklar Molecular biology of the gene-Watson, Baker, Bell, Gann, Levine
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Laboratuvar notları öğrencilere verilmektedir
Ödevler Laboratuvar deneyleri her hafta sonunda rapor olarak öğrenciler tarafından teslim edilmektedir.
Sınavlar 1 Arasınav ve 1 Final verilmektedir.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 1 30
Rapor 10 15
Quiz 10 15
35
Final 1 40
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
X
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 10 4 40
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 10 4 40
36
Ara Sınav 1 4 4
Raporlar 10 3 30
Ödev 2 2 4
Final Sınavı 1 4 4
Toplam İş Yükü 122
Toplam İş Yükü / 25 (s) 4.88
Dersin AKTS Kredisi 5
37
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Analitik Kimya CHEM 215 4 3 + 0 + 2 4 6
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Prof. Dr. Mustafa Çulha
Dersi Verenler Prof. Dr. Mustafa Çulha
Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerleri
STAJ YOK
Dersin Amacı
Bu ders öğrencinin hem analytik kimyanın biyoloji, tıp,malzeme ve
çevre bilimleri, ve adli konulardaki uygulamalarının ve hem de
toplum üzerindeki etkilerini öğrencilerin anlamaları için
düzenlenmiştir. kapsamını Öğrenciler klasik kimyasal analiz ve
spektroskopik ve kromatografik tekniklerin teori ve uygulamalarını
öğreneceklerdir.
Dersin İçeriği
Numune toplama, standardizasyon, kalibrasyon, istatiksel data
değerlendirme, kimyasal analizde hatalar, kimyasal denge,
spectrokimyasal tekniklere giriş, moleküler soğurma ve floresan
spektroskopisi, titreşimsel spektroskopi, kütle spektroskopisi,
nükleer manyetik rezonans, analitik ayrıştırma yöntemlerine giriş,
yüksek performanslı sıvı kromatografisi, gaz kromatografisi, ve
elektroforez yöntemleri.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Numune toplama, standardizasyon, kalibrasyon ve validasyonu açıklayabilme.
1 1,2 A,C
2) Temel veri analizini hesaplamalarını yapabilme. 1,5 1,2 A,B,C
3) moleküler soğurma ve floresan spektroskopisi, titreşimsel spektroskopi, kütle spektroskopisi, nükleer manyetik rezonans gibi teknikleri ve bu tekniklerin cihazlarının çalışma prensiplerini anlatabilme.
1,5 1,2,3 A,B,C
4) yüksek performanslı sıvı kromatografisi, gaz 1,5 1,2,3 A,B,C
38
kromatografisi, ve elektroforez yöntemleri ve çalışma temellerini açıklaya bilme..
5) Kimyasal çözelti ve pH hesaplamalarını yapabilme. 1,5 1,2,3 A,B,C
Öğretim Yöntemleri: 1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri: A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1
Analitik Kimyanın Doğası
Kimyasallar, Aletler ve Birim Hesaplamaları Ders Kitabı
2 Analitik Kimyada Spreadsheet Kullanımı Ders Kitabı
3 Analitik Kimyada Kullanılan Hesaplamalar Ders Kitabı
4 Numune toplama, standardizasyon, kalibrasyon ve Validasyon Ders Kitabı
5 Kimyasal analizde Hatalar Ders Kitabı
6 Kimyasal analizde Hatalar Ders Kitabı
7 Spektrokimyasal Metodlara Giriş
1. Arasınav
Ders Kitabı
8 Optik Spektrometrede Cihazlar Ders Kitabı
9 Moleküler Soğurma Spektroskopisi Ders Kitabı
10 Moleküler Floresan Spektroskopisi Ders Kitabı
11 Nükleer Manyetik Rezonans (NMR) Ders Kitabı
12 Kütle Spektrskopisi Ders Kitabı
13
Analitik Ayrıştırmaya Giriş
Yüksek Performanslı Sıvı Kromatografisi
Ders Kitabı
14 2. Arasınav Ders Kitabı
15
Elektroforez ve Elektroforezin Türleri
Gaz Kromatografi
Ders Kitabı
16 pH Ölçümü Ders Kitabı
39
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Fundamentals of Analytical Chemistry, Skoog, West, Holler, Crouch, 8th Edition (International Student Edition)
Diğer Kaynaklar
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin email adreslerine gönderilmektedir.
Ödevler
Sınavlar 2 Arasınav ve 1 Final
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 45
Deney 8 20
Ödev
Proje
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 35
Yıl içinin Başarıya Oranı 65
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
40
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
X
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 5 70
Ara Sınav 2 3 6
Deney 10 2 20
Ödev 5 2 10
Proje
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 151
Toplam İş Yükü / 25 (s) 6.04
Dersin AKTS Kredisi 6
41
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Biyokimya I GBE 301 5 2 + 1 + 3 4 7
Ön Koşul Dersleri CHEM 205
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Prof. Dr. Mustafa Çulha
Dersi Verenler Prof. Dr. Mustafa Çulha
Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerleri
STAJ YOK
Dersin Amacı
Bu kurs öğrencilerin biyokimyanın ve biyo kimya konularının
önemini ve canlı sistemlerin altında yatan temel proessleri
anlamalarını sağlamak üzere dizayn edilmiştir.
Dersin İçeriği
Hayatın molekülleri; karbohidratların, lipidlerin, proteinlerin ve
nükleik asitlerin yapısı ve işlevleri; genetic bilgi akışı; enzimler ve
enzim kinetiği; zar yapısı ve dinamiği; zar oluşumu ve işlevi;
biyoenerjetiğe giriş.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Karbonhidratların, proteinlerin, lipidlerin ve nükleik asitlerin yapılarını ve fonksiyonları arasındaki ilişkiyi anlayabilme.
1 1,2 A,C
2) DNA yapısını ve genetic bilgi akışını kavrayabilme.
1,4 1,2 A,B,C
3) Protein yapısını ve fonksiyonunu kavrayabilme.
1,4 1,2,3 A,B,C, D
4) Termodinamik kanuları ve biyosistemlerdeki enerji akışını ilişkilendirebilme.
1,4 1,2,3 A,B,C
5) Membran yapısını ve dinamiğini kavrayabilme.
1,4 1,2,3 A,B,C
6) Temel enzim knetiği hesaplamalarını yapabilme.
1,4 1,2,3 A,B,C
42
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Scope of Biochemistry Biyokimyanın kapsamı Ders Kitabı
2 Hayatın Bileşenleri: Sulu Ortamlarda Zayıf Etkileşimler Ders Kitabı
3 Yaşamın Enerjisi Ders Kitabı
4 Nükleik Asitler Ders Kitabı
5 Nükleik Asitler Ders Kitabı
6 Proteinlere Giriş: Birinci Seviye Protein Yapısı Proteinlerin 3 Boyutlu Yapısı 1. T-BOX Sınavı
Ders Kitabı
7 1. Arasınav Ders Kitabı
8 Protienler Hareket Halinde: Kasılma ve Moleküler Hareketler Ders Kitabı
9 Karbonhidratlar Ders Kitabı
10 Karbonhidratlar Ders Kitabı
11 Lipidler, Zarlar, ve Hücresel Taşınım Ders Kitabı
12 Lipidler, Zarlar, ve Hücresel Taşınım Ders Kitabı
13 Enzimler: Biyokatalizörler
2. T-BOX Sınavı
Ders Kitabı
14 2. Arasınav Ders Kitabı
15 Enzimler: Biyokatalizörler
Ders Kitabı
16 Enzimler: Biyokatalizörler
Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Biochemistry, Matthews, Van Holde, Ahern, 4. Baskı (Uluslararası Baskı)
Diğer Kaynaklar
43
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin email adreslerine gönderilmektedir.
Ödevler Laboratuvar deneyleri her hafta sonunda rapor olarak öğrenciler tarafından teslim edilmektedir.
Sınavlar 2 Arasınav ve 1 Final verilmektedir.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav ve Quizler 2 45
Deney 10 20
Ödev
Proje
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 35
Yıl içinin Başarıya Oranı 65
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
X
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
44
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 6 84
Ara Sınav 2 3 6
Deney 10 3 30
Ödev
Proje
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 165
Toplam İş Yükü / 25 (s) 6.60
Dersin AKTS Kredisi 7
45
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Biyotermodinamik GBE 321 5 2 + 2 + 0 3 5
Ön Koşul Dersleri CHEM 112
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Prof. Dr. Mustafa Özilgen
Dersi Verenler Prof. Dr. Mustafa Özilgen
Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerleri
Dersin Amacı
Mühendislik termodinamiğinin temel kavramlarınının biyolojik
sistemlere uygulanmasını öğretmek. Üç veya dört öğrenciden
oluşan gruplarla proje yaparak takım çalışması, literatür
araştırması, bilgisayar kullanım bilgisi ve termodinamik analiz
yeteneğini geliştirmek.
Dersin İçeriği Termodinamiğin temel kavramları
Dersin Öğrenme Çıktıları Program öğrenme çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
Termodinamiğin temel kavramlarının öğrenilmesi
1, 2, 9, 10 1, 2, 4 A, D
Disiplinler arası proje yapımı 1, 2, 4, 5, 6, 7 1, 2, 4 A, D
Gıda ve biyolojik sistemlerle ilgili örnekler 1, 2, 7 1, 2, 4 A, D
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
46
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Termodinamiğin gelişim süreci: Neden termodinamik öğrenme
gereksinimi oluştu, termodinamiğin gelişim süreci ve kanunları Ders kitabı
2 Temel kavramlar, enerji, iş, iç enerji Ders kitabı
3 Entropy, özgül ısı, faz değişim ısısı, entropy, enformasyon entropisi, diğer konular
Ders kitabı
4 Thermodynamic properties of biological fluids: Phase equilibria Ders kitabı
5 Rault’s ve Henry’s kanunları Ders kitabı
6 Termodinamik özelliklerin hücresel yapı için hesaplanması Ders kitabı
7 İdeal ve reel akışkanlar, su ve buhar için termodinamik veri kaynaklararı
Ders kitabı + Buhar tablosu
8-10 Termodinamiğin birinci kanununun biyolojik süreçlere
uygulanması Ders kitabı
11-12 Termodinamiğin ikinci kanununun biyolojik süreçlere uygulanması
Ders kitabı
13 Exergy analysis in biological systems Ders kitabı
14 Tekrar Ders kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Özilgen M & Sorgüven E, BioThermodynamics (Drafts of the new
textbook, in press), Taylor & Francis, USA, 2014
Diğer Kaynaklar
Smith MJ, Van Ness HC and Abbott MM, McGraw Hill,
Introduction to Chemical Engineering Thermodynamics, 7th
ed., USA 2005
Thermodynamics, Çengel Y and Boles MA. 6th ed. McGraw Hill,
USA, 2007
Özilgen, M. Endüstrileşme Sürecinde Bilgi Birikiminin Öyküsü, 2nd
ed. Arkadaş Yayınevi, Ankara, 2011
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Önceki yıllara ait sınav soruları + ek döküman
Ödevler Problem seti
Sınavlar 2 Arasınav ve 1 Final
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
47
Ara Sınav 2 40
Deney
Ödev
Proje 1 30
Toplam 70
Final Sınavının Başarıya Oranı 30
Yıl içinin Başarıya Oranı 70
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
x
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
x
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
X
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
X
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
X
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
X
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
X
48
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 3 52
Ara Sınav 2 7 14
Deney
Ödev
Proje 8 3 24
Final Sınavı 1 10 10
Toplam İş Yükü 142
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5,68
Dersin AKTS Kredisi 5
49
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Gen Mühendisliği Teknikleri I GBE 341 5 2 + 2 + 0 3 6
Ön Koşul Dersleri GBE 212
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç. Dr. Andrew J. Harvey
Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Andrew J. Harvey
Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerleri
STAJ YOK
Dersin Amacı Gen mühendisliği teknikleri kullanarak deney tasarlayabilme
becerisi sağlamak
Dersin İçeriği
Mikroskopi; diger yüksek ölçekli teknolojiler, radyoizotopların
kullanımı; enzim analizleri; DNA ve RNA işaretleme; DNA’nın in
vitro manipulasyonu; klonlama, transformasyon teknikleri,
kütüphane oluşturma ve tarama metodları, DNA ve RNA
izolasyonu; restriksiyon enzimleri, vektörler, PCR, geri
transkripsiyon ve cDNA sentezi; RT-PCR, Q-RT-PCR;
immünçökeltme, protein saflaştırması, Western blotlama, Southern
ve Northern blotlama; DNA dizileme; bölge-hedefli mutajenez;
mikrodizinler; RNA interferans ve digger yeni teknikler, özellikle
genetic ve biyomühendislik tasarım problemlerine vurgu.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) DNA klonlama stratejileri tasarlayabilme ve rekombinant protein üretebilme
2,3,4,9 1,2,4 A,C
2) Protein lokalizasyonu veya etkileşimi deneyleri tasarlayabilme
2,3,4,9 1,2,4 A,C
3) Mikrodizin veya benzeri deneyleri, PCR primerlerini ve PCR reaksiyonlarını tasarlayabilme
2,3,4,9 1,2,4 A,C
4) Yeni bir vaka ile karşılaşıldığında deneysel fikirleri öne sürebilme
2,3,4,9 1,2,4 A,C
50
5) Mole-gram dönüşümleri, vektör-insert oranları, Dalton-gram dönüşümleri vb hesaplamaları yapabilme; biyoinformatik kaynakları kullanabilme
2,3,4,9 1,2,4 A,C
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1
Gen Mühendisliğine giriş, araçları ve internet ortamındaki
materyaller
Ders notları, dağıtılan belgeler
2
Gen Mühendisliği araçlarına genel bakış: vektörler, enzimler,
ligazlar
PS 1: Rebase, Biology Workbench, NCBI
Ders notları,
dağıtılan
belgeler
3
Gen Mühendisliği araçları: Restricksiyon enzimleri
Jel elektroforezin hatırlatılması; DNA transformasyonu ve
elektroporasyon
Ders notları,
dağıtılan
belgeler
4
PCR, RT-PCR and Q-PCR
Gen Mühendisliği araçları: Vektörler I
Gen Mühendisliği araçları: Vektörler II
PS 2: DH5 ve HB101 suşları – genotip ve metilasyon
Ders notları,
dağıtılan
belgeler
5
Gen Mühendisliği araçları: Ligazlar
Klonlama ve tarama
PS 3: mavi-beyaz vs AmpR taraması – uygulama
Ders notları,
dağıtılan
belgeler
6
KARİYER HAFTASI ETKİNLİKLERİNE KATILIM
ARA SINAV 1
Ders notları,
dağıtılan
belgeler
7
Genomik DNA c Ders notları,
dağıtılan
belgeler
8 cDNA kütüphaneleri Ders notları,
dağıtılan
51
belgeler
9
mikrodizin vs RT-PCR vs Northern blotlama Ders notları,
dağıtılan
belgeler
10
Antisens ve ribozimler; RNA interferans Ders notları,
dağıtılan
belgeler
11
Gen Sekanslaması; bölge hedefli mutajenez (BHM)
Faj gösterimi; klonlanmış DNA’dan ifade
PS 4 : promoter bölgesinde BHM dizaynı
Ders notları,
dağıtılan
belgeler
12
Anlatım vektörleri; protein füzyonları ve saflaştırma
PS 5 : mayada anlatım için klonlama
PS 6 : dokuya özel anlatım için mutant DNA klonlama
Ders notları,
dağıtılan
belgeler
13
Protein-Protein etkileşimleri;
PS 7: His-işaretli protein pürifikasyonu için klonlama
Ders notları,
dağıtılan
belgeler
14
Maya ikili melez analizleri; memeli ikili melezleri
Translasyon sonrası modifikasyonlar
PS 8 : maya ikili melez vaka çalışması
Ders notları,
dağıtılan
belgeler
15
Genel Tekrar
TELAFİ SINAVI
Ders notları,
dağıtılan
belgeler
16 FINAL SINAVI
Ders notları,
dağıtılan
belgeler
KAYNAKLAR
Ders Kitabı
Principles of Gene Manipulation; Sandy B. Primrose, Blackwell
Science, 2001; ISBN 0632059540
Molecular Cloning: A Laboratory Manual (4th edition); Green MR, Cold
Spring Harbor Press, 2012, ISBN 978-1-936113-42-2
52
Diğer Kaynaklar Dağıtılan belgeler; ödevler; mini-sınavlar; teknik veri sayfaları; problem
saati materyalleri
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları
Ödevler Problem Saatlerinde pek çok ödev ve mini-sınav verilmektedir.
Sınavlar 1 Arasınav ve 1 Final verilmektedir.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 1 25
Deney
Ödev 4 – 10 25
Proje
Toplam 50
Final Sınavının Başarıya Oranı 50
Yıl içinin Başarıya Oranı 50
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
x
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
x
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
x
53
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
x
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 4 56
Ara Sınav 1 8 8
Deney
Ödev 10 3 30
Proje
Final Sınavı 1 10 10
Toplam İş Yükü 146
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5,84
Dersin AKTS Kredisi 6
54
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat
Kredi AKTS
Biyotransport Olayları GBE 361
5 2 + 2 + 0 3 5
Ön Koşul Dersleri GBE 222, MATH 241
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç. Dr. Emrah Nikerel
Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Emrah Nikerel
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı Öğrencilerin, biyolojik sistemlerdeki taşınım olayları hakkında bilgi
edinmelerini sağlama
Dersin İçeriği
Kütle, ısı ve momentum taşınımı; organ sistemlerinde taşınım
olayları; hastalıkta, tedavide ve cihaz geliştirmede taşınım olayları;
boyutsuz sayılar
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Farklı taşınım olaylarını ilişkilendirebilmek 1 1,2 A,D
2) Biyolojik sistemlerde biyolojik olayları değerlendirebilme
1 1,2 A,D
3) Kütle denkliği kurabilmek 1 1,2 A,D
4) Bir özelliğin yatışık durumdaki dağılımını bulabilmek
1 1,2 A,D
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
55
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Biyolojik sistemlerde taşınım olaylarına giriş Ders Kitabı
2 Momentum-ısı-kitle taşınım prensiplerinin ilişkilendirilmesi Ders Kitabı
3 Biyolojik sistemlerde momentum denkliği Ders Kitabı
4 Kan akışı Ders Kitabı
5 Sıvı taşınımı ve korunumuna ilişlin bağıntılar Ders Kitabı
6 Vize I Ders Kitabı
7 Biyolojik sistemlerde akışkan taşınımı Ders Kitabı
8 Biyolojik sistemlerde akışkan taşınımı Ders Kitabı
9 Dolaşımda sıvı taşınımı Ders Kitabı
10 Kütle taşınımının temelleri Ders Kitabı
11 Kütle taşınımında korunum yasaları Ders Kitabı
12 Difüzyon ve Konveksiyon Ders Kitabı
13 Transport in Porous Media Ders Kitabı
14 Transvaskülwr Taşınım Ders Kitabı
15 Tekrar Ders Kitabı
16 Vize II Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Transport Phenomena in Biological Systems, Second Edition Pearson Prentice Hall Bioengineering. 2010. George A Truskey, Fan Yuan, David F. Katz.
Diğer Kaynaklar
MATERYAL PAYLAŞIMI
56
Dökümanlar
Ödevler Ödev olarak problemler verilmektedir
Sınavlar 2 Arasınav ve 1 Final verilmektedir
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 50
Deney
Ödev 4 10
Proje
Toplam 60
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
x
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
X
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
X
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
57
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
x
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 4 56
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 4 56
Ara Sınav 2 2 4
Deney
Ödev
Proje
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 119
Toplam İş Yükü / 25 (s) 4,76
Dersin AKTS Kredisi 5
58
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Biyokimya II GBE 302 6 2 + 1 + 3 4 9
Ön Koşul Dersleri GBE 301
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Doç. Dr. Dilek Telci
Dersi Verenler Doç. Dr. Dilek Telci
Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerleri
STAJ YOK
Dersin Amacı Öğrencilerin biyokimyasal metabolik yolaklar hakkında bilgi ve
deneysel yaklaşımlar ile pratik geliştirmesini sağlamak.
Dersin İçeriği
Serbest enerji ilkeleri; hücre metabolizması ve fermentasyon;
glikoliz; TCA döngüsü; oksidatif fosforilasyon; fotosentez; amino
asit metabolizması,nükleik asit metabolizması; yağ asidi
metabolizması. Ders içeriğine paralel laboratuvar deneyleri.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Enerji hesaplarını yapabilme, biyoenerjetiğin temel kavramlarını anlayabilme
1 1,2 A,C
2) Glikoliz, glikojen yıkımı-sentezi yollarını kontrol mekanizmalarıyla yorumlayabilme
1,3 1,2,3 A,B,C
3) Oksidatif fosforilizasyonu ve metabolik önemini açıklayabilme
1,3 1,2,3 A,B,C
4) Yağ metabolizmanın bütünlüğü ve koordinasyonunu kavrayabilme ve yorumlayabilme
1,3 1,2,3 A,B,C
5) Metabolik yolakların hormanlarla regülasyonunu anlayabilme.
1,2 1,2 A
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
59
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Metabolizmaya Giriş
Ders Kitabı
2 Karbonhidrat Metabolizması I: Katabolik Yolaklar Ders Kitabı
3 Karbonhidrat Metabolizması I: Katabolik Yolaklar Ders Kitabı
4 Sitrik Asit Siklusu ve Pentoz Fosfat Yolu Ders Kitabı
5 Elektron Transport Zinciri ve Oksidatif Fosforilasyon Ders Kitabı
6 Ara Sınav 1 Ders Kitabı
7 Karbonhidrat Metabolizması II: Anabolik Yolaklar Ders Kitabı
8 Karbonhidrat Metabolizması II: Anabolik Yolaklar Ders Kitabı
9 Fotosentez Ders Kitabı
10
Lipid Metabolizması I: Yağ Asitleri, Triasilgliseroller,
Lipoproteinler
Ders Kitabı
11
Lipid Metabolizması I: Yağ Asitleri, Triasilgliseroller,
Lipoproteinler
Ders Kitabı
12 Ara Sınav 2 Ders Kitabı
13 Lipid Metabolizması II: Zar Lipitleri ve Steroidler Ders Kitabı
14 Nitrojenli Bileşklerin Metabolizması Ders Kitabı
15 Memeli metabolik Yolaklarının hormonal kontrolü I Ders Kitabı
16 Memeli metabolik Yolaklarının hormonal kontrolü II Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Biochemistry, Matthews, Van Holde, Ahern, 4. Baskı (Uluslararası Baskı)
Diğer Kaynaklar
60
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin email adreslerine gönderilmektedir.
Ödevler
Sınavlar 2 Arasınav ve 1 Final verilmektedir.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 30
Deney 8 35
Ödev
Proje
Toplam 65
Final Sınavının Başarıya Oranı 35
Yıl içinin Başarıya Oranı 65
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
X
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
61
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 11 154
Ara Sınav 2 3 6
Deney 8 3 24
Ödev
Proje
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 229
Toplam İş Yükü / 25 (s) 9,16
Dersin AKTS Kredisi 9
62
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat
Kredi AKTS
Deneysel Genetik ve Biyomühendislik I: İlkeler
GBE 326 6 2 + 0 + 2 3 6
Ön Koşul Dersleri PHYS 102, GBE 321
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç. Dr. Ali Özhan Aytekin
Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Ali Özhan Aytekin
Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerler
STAJ YOK
Dersin Amacı Biyoproses mühendisliğinin temellerini ve altakım işlemlerinin
öğrencilere aktarılması.
Dersin İçeriği Biyoproses mühendisliği, enzim ve mikrobiyal kinetikler,
biyoreaktörler, altakım işlemleri
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme
Çıktıları Öğretim
Yöntemleri Ölçme
Yöntemleri
1) Biyoproses mühendisliği kavramı ve uygulamalarının anlatılması
1, 2, 7, 10 1, 2, 3, 4 A, B, C
2) Biyoreaktör tiplerinin anlatılması ve endüstriyel üretimlerdeki önemi
1, 2 1, 2, 4 A, B
3) Alt-ve Üst-akım işlemlerinin biyoproses açısından önemi
1, 2 1, 2, 4 A, B
Öğretim Yöntemleri: 1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri: A: Sınav , B: Deney , C: Ödev , D: Proje
63
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri Laboratuar Deneyleri
1 Biyoproses mühendisliğine giriş
Ders Kitabı
2 Biyoproses mühendisliği Ders Kitabı
3 Biyoproses mühendisliği Ders Kitabı
4 Biyoproses mühendisliği ve Kinetik Ders Kitabı
5 Kinetik Ders Kitabı
6 Biyoreaktörler ve Ara-Sınav I Ders Kitabı
7 Biyoreaktörler Ders Kitabı Mikroorganizmaların
izolasyonu
8 Biyoreaktörler Ders Kitabı Mikroorganizmaların seçimi
9 Biyoreaktörler Ders Kitabı Enzim kararlılığı ve
optimum koşulları
10 Biyoreaktörler Ders Kitabı Ortam optimizasyonu
11 Alt-Akım işlemleri ve Ara-Sınav II Ders Kitabı
12 Alt-Akım işlemleri Ders Kitabı Hücre Parçalama
13 Alt-Akım işlemleri Ders Kitabı Ayırma ve Saflaştırma
işlemleri
14 Alt-Akım işlemleri Ders Kitabı İmmobilizasyon
15 Alt-Akım işlemleri Ders Kitabı
16 Alt-Akım işlemleri Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Biochemical Engineering Fundamentals, Bailey & Ollis, 4th Ed.
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Gerekli olabilecek olan tablolar ve grafikler öğrencilere fotokopi olarak verilmektedir.
64
Ödevler
Sınavlar 2 Arasınav ve 1 Final verilmektedir.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 45
Deney 7 20
Ödev
Proje
Toplam 65
Final Sınavının Başarıya Oranı 35
Yıl içinin Başarıya Oranı 65
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
X
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
X
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme
65
becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
X
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 4 56
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 6 84
Ara Sınav 2 3 6
Deney
Ödev
Proje
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 149
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5,96
Dersin AKTS Kredisi 6
66
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+LSaat Kredi AKTS
Gen Mühendisliği Teknikleri II GBE 342 6 2 + 1 + 3 4 8
Ön Koşul Dersleri GBE 341
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç. Dr. Andrew J. Harvey
Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Andrew J. Harvey
Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerleri
STAJ YOK
Dersin Amacı Gen mühendisliği teknikleri kullanarak pratik deney becerileri
kazandırmak
Dersin İçeriği
Hücre kültürlerinde geçici veya stabil transfeksiyon gibi teknikler;
kök hücrelerin genetic manipulasyonları; hayvan ve insan
klonlama; transgenic hayvan gibi genetic manipulasyonlar;
bitkilerin genetic manipulasyonu; özellikle transgenic teknolojiler ve
farmasötik biyomühendislik ile gen mühendisliği laboratuvar
deneyimine vurgu.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) PCR ve klonlama yapabilme becerisi 2,3 1,2,3,4 A,B,C
2) Proteinleri bakteride anlatabilme becerisi 2,3 1,2,3,4 A,B,C
3) Hücre hattı veya kök hücre manipulasyonları tasarlayabilme becerisi
2,3,4,9 1,2,3,4 A,B,C
4) Transgenik hayvanlar veya bitkiler tasarlayabilme becerisi
2,3,4,6,8,9,10
1,2,4 A,B,C,D
5) Yeni vakalarla karşılaşıldığında deneysel fikir üretebilme becerisi
2,3,4,6,8,9,10 1,2,4 A,B,C,D
67
6) Yeni bir ürüne yönelik takım halinde proje önerisi hazırlayabilme becerisi (TÜBİTAK proje öneri formu kullanılır)
2,3,4,6,8,9,10 1,2,4 A,B,C,D
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1
Hücre kültürü, temel ekipman, malzeme ve teknikler
Hücrelere transfeksiyon
Ders notları, dağıtılan belgeler; laboratuvar manueli
2
Stabil ve indüklenebilir hücre hatları
DENEY 1 (DNA’nın restriksiyon haritası)
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
manueli
3
Stabil ve indüklenebilir hücre hatları (devam)
PS1: Okuma (Yeşil Floresan Proteinler)
DENEY 2 (Klonlama için vektör hazırlanması)
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
manueli
4
Kök hücrelere giriş
PS2: Okuma (embryonik kök hücreler)
DENEY 3 (insert DNA’nın PCR ile hazırlanması)
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
manueli
5
Kök hücrelerin genetik manipulasyonu
PS3: okuma (indüklenmiş pluripotan hücreler)
DENEY 4 (erime sıcaklığı tespiti)
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
manueli
6
Hayvan ve insan klonlama çalışmaları
DENEY 5 (bakteri transformasyonu)
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
68
manueli
7
ARA SINAV
DENEY 6 (mavi-beyaz taramalar)
Dönem ödevlerinin atanması
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
manueli
8
Transgenik hayvanlar ve biyomühendislik
PS4: Okuma (mikrodizin teknolojisi)
DENEY 7 (RNA izolasyonu)
Dönem Ödevi Çalışması. Bir gen mühendisliğinin endüstriyel
uygulamasının biyoprosesinin tasarlanması
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
manueli
9
Bitkilerin genetik manipulasyonu
PS5: Okuma (RNAi teknolojisi)
DENEY 8 (RNA jel elektroforezi)
Dönem Ödevi Çalışması (devam). Bir gen mühendisliğinin
endüstriyel uygulamasının biyoprosesinin tasarlanması
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
manueli
10
Hayvan ve bitkilerin transgenik uygulamaları – hastalık modelleri
PS5: Okuma (genetiği değiştirilmiş organizmalar)
DENEY 9 (cDNA sentezi)
Dönem Ödevi Çalışması (devam). Bir gen mühendisliğinin
endüstriyel uygulamasının biyoprosesinin tasarlanması
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
manueli
11
Transgenik teknolojiler – farmasötik uygulamalar
PS 6: Okuma (hayvan hastalık modelleri)
DENEY 10 (gerçek zamanlı RT-PCR)
Dönem Ödevi Çalışması (devam). Bir gen mühendisliğinin
endüstriyel uygulamasının biyoprosesinin tasarlanması
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
manueli
12
Transgenik uygulamalar – biyodizel
PS 7: Okuma (insülin ve aşı üretimi; biyodizel üretimi)
DENEY 11 (bakteride GST-protein üretimi)
Dönem Ödevi Çalışması (devam). Bir gen mühendisliğinin
endüstriyel uygulamasının biyoprosesinin tasarlanması
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
manueli
69
13
Genetiği değiştirilmiş organizmalarla ilgili etik ve hukuki durumlar
Dönem Ödevi Çalışması (devam). Bir gen mühendisliğinin
endüstriyel uygulamasının biyoprosesinin tasarlanması
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
manueli
14
Dönem Ödevi Çalışması (devam). Bir gen mühendisliğinin
endüstriyel uygulamasının biyoprosesinin tasarlanması
Dönem Ödevi Yazılı Raporun teslim edilmesi
Dönem Ödevlerinin Takım Sunumları
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
manueli
15
Revizyon
MAKE-UP SINAVI
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
manueli
16 FINAL EXAM
Ders notları,
dağıtılan
belgeler;
laboratuvar
manueli
KAYNAKLAR
Ders Kitabı
Principles of Gene Manipulation; Sandy B. Primrose, Blackwell
Science, 2001; ISBN 0632059540
Molecular Cloning: A Laboratory Manual (4th edition); Green MR, Cold
Spring Harbor Press, 2012, ISBN 978-1-936113-42-2
Diğer Kaynaklar Dağıtılan belgeler; ödevler; mini-sınavlar; teknik veri sayfaları; problem
saati materyalleri; laboratuvar manueli
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları Sınav Sonucu Panosu’nda asılmakta, isteyen öğrencilere sınav kağıtları gösterilmektedir.
Ödevler Problem Saatlerinde ve Laboratuvar saatinde pek çok ödev ve mini-sınav verilmektedir; ayrıca öğrencilerin takımlar halinde çalışmalarını gerektiren bir Dönem Ödevi bulunmaktadır.
Sınavlar 1 Arasınav ve 1 Final verilmektedir.
70
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 1 20
Deney 1 20
Ödev 4 – 10 arası
4
Proje 1 16
Toplam 60
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
x
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
x
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
x
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
x
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
x
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
x
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, x
71
çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 4 56
Ara Sınav 1 6 6
Deney 14 2 28
Ödev 5 3 15
Proje 1 35 35
Final Sınavı 1 7 7
Toplam İş Yükü 189
Toplam İş Yükü / 25 (s) 7,56
Dersin AKTS Kredisi 8
72
Ders Bilgileri
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
MOLEKÜLER BİYOLOJİ GBE 403 7 3 + 0 + 0 3 6
Ön Koşul Dersleri GBE 341
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Yard Doç Dr HÜSEYİN ÇİMEN
Dersi Verenler Yard Doç Dr HÜSEYİN ÇİMEN
Dersin Yardımcıları Yok
STAJ Yok
Dersin Amacı öğrencilere hücresel fonksiyonları ve fizyolojisinin mekanizmalarını
ve bunların kontrol edilmesini tanıtır.
Dersin İçeriği
hücre kimyası ve biyosentez. proteinler. DNA kromozom ve genom.
DNA replikasyonu-onarımı-rekombinasyonu. Enerji dönüşümü
mitokondri ve kloroplast. Hücre döngüsü ve apoptosis. kanser
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) hücre içi yapıları ve bunların fonksiyonlarını öğrenir
1, 8, 9 1,2 A,C
2) hücre içinde temel mekanızmaları öğrenir. 1, 8, 9 1,2 A,C
3) kanser ve ilgili misregüle edilen yada fonksiyonel olmayan hücresel meknızmaları anlar
1, 8, 9 1,2 A,C
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 derse giriş Ders Kitabı
73
2 Hücre kimyası ve biyosentez Ders Kitabı
3 proteinler Ders Kitabı
4 DNA ve Kromozomlar vede genom Ders Kitabı
5 DNA Replikasyon, Gen Anlatımı ve onarımı Ders Kitabı
6 DNAdan proteine: hücre nasıl genomu anlatır Ders Kitabı
7 gen anlatımı kontrolü Ders Kitabı
8 enerji dönüşümü mitokondri ve kloroplast Ders Kitabı
9 ARA SINAV I Ders Kitabı
10 hücre kominikasyon mekanizmaları Ders Kitabı
11 sitoskeleton ve genel tekrar Ders Kitabı
12 hücre döngüsü ve apoptosis Ders Kitabı
13 kanser Ders Kitabı
14 ARA SINAV II Ders Kitabı
15 hücre içi bölümler ve protein sıralandırılması Ders Kitabı
16 hücre içi veziküler taşıma ve tekrar Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Molecular Biology of the Cell, Wilson and Hunt, Garland
Science 6th ed
Diğer Kaynaklar
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin eposta adreslerine gönderilmektedir
Ödevler
Sınavlar 2 Ara Sınav and 1 Final Sınavı
74
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 60
Deney
Ödev
Proje
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersi
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahiptir.
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptar, tanımlar ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunar.
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlar, deney yapar, veri toplar, sonuçları analiz edip ve yorumlar.
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlar.
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışır ve sorumluluk alarak karar almada belirleyicidir.
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilir.
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık yaratır.
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisine sahiptir.
X
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisine sahiptir.
X
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisine sahiptir.
X
75
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası hariçtir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 7 98
Ara Sınav 2 3 6
Deney
Ödev
Proje
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 149
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5.96
Dersin AKTS Kredisi 6
76
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat
Kredi AKTS
Deneysel Genetik ve Biyomühendislik II: Tasarım ve Uygulamalar
GBE 415 7 2 + 2 + 0 3 6
Ön Koşul Dersleri GBE 326
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç. Dr. Ali Özhan Aytekin
Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Ali Özhan Aytekin
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı Ekonomi ve biyoproses mühendisliği yaklaşımları ile fabrika
tasarımının anlaşılması.
Dersin İçeriği
Biyoproses mühendisliği, Pazar araştırması, Isı ve Kütle transferi
hesaplamaları, Biyoreaktör ve tank ölçülerinin hesaplanması,
altakım işlemlerinin belirlenmesi, maliyet analizi
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Biyolojik üretimler için fabrika tasarımında dikkat edilmesi gereken noktaların verilmesi
2, 4 1, 2, 3, 4 A, D
2) Fabrika tasarımı için yapılması gereken kütle-enerji ve basınç düşüşlerinin hesapları
1, 2, 4 1, 2 A, C, D
3) Belirli bir ürün için pazar araştırmasının yapılması ve fabrika için maliyet analizinin yapılması
7 1, 2, 3 A, C, D
Öğretim Yöntemleri: 1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
77
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney , C: Ödev , D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri Proje raporlarının
konusu
1 Tasarıma Giriş
Ders Kitabı
2 Maliyet Analizi Ders Kitabı
3 Yapım malzemeleri Ders Kitabı
4 Kütle Dengesi Hesapları Ders Kitabı
5 Kütle Dengesi Hesapları Ders Kitabı
6 Kütle Dengesi Hesapları Ders Kitabı
7 Kütle ve Enerji Dengesi Hesapları Ders Kitabı Pazar Araştırması
8 Enerji Dengesi Hesapları Ders Kitabı Maliyet Analizi
(Başlangıç)
9 Enerji Dengesi Hesapları Ders Kitabı Üretim Ortamının
Belirlenmesi
10 Basınç kayıpları Ders Kitabı Akış Diagramı
11 Borulama sistemleri ve Ekipmanlar Ders Kitabı Hesaplamalar
(Kütle Dengesi)
12 Borulama sistemleri ve Ekipmanlar Ders Kitabı Hesaplamalar
(Enerji Dengesi)
13 Atık Yönetimi Ders Kitabı Hesaplamalar
(Toplam)
14 Güvenlik Ders Kitabı Hesaplamalar
(Tank ve Biyoreaktör)
15 Ders Kitabı Cihaz Seçimi
16 Ders Kitabı Maliyet Analizi
(Son)
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Chemical Engineering Design, Volume 6, Richardson & Coulson
78
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Gerekli olabilecek olan tablolar ve grafikler öğrencilere fotokopi olarak verilmektedir.
Görevler Pazar araştırması raporu, eğitimin başlamasından itibaren ilk 7 hafta içerisinde teslim edilmesi gerekmektedir. Proje raporları, belirlene akış içerisinde 1 hafta içerisinde teslim edilmesi gerekmektedir.
Sınavlar 1 Final verilmektedir.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav
Deney
Ödev 1 25
Proje 7 35
Toplam 60
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
X
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
X
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
79
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
X
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası hariçtir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 7 98
Ara Sınav 2 3 6
Deney
Ödev
Proje
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 149
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5.96
Dersin AKTS Kredisi 6
80
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Biyoproses Mühendisliği Teknikleri
GBE 451 7 3 + 0 + 0 3 6
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç. Dr. Ali Özhan Aytekin
Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Ali Özhan Aytekin
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı Biyoproses mühendisliği uygulamaları ve biyoürünlerin önemi ile
ilgili örnekler ve prensiplerin sunulması.
Dersin İçeriği
Biyoproses mühendisliği, biyoreaktörler, altakım işlemleri,
enzimler, antibiotikler, biyoyakıtlar, organik asitler, monoklonal
antikorlar.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme
Çıktıları Öğretim
Yöntemleri Ölçme
Yöntemleri
1) Biyoproses mühendisliği ve uygulamalarına özet bir bakış
2, 7, 10 1, 2, 3 A
2) Mikrobiyal temelli biyoürünlerin hazırlanmasında karşılaşılan önemli hususların ve yöntemlerin verilmesi
2, 10 1, 2, 4 A, D
3) Hücre kültürü temelli biyoürünlerin hazırlanmasında karşılaşılan önemli hususların ve yöntemlerin verilmesi.
2, 10 1, 2, 4 A, D
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney , C: Ödev , D: Proje
81
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Giriş
Ders Kitabı
2 Biyoproses Mühendisliği Ders Kitabı
3 Mikrobiyal ve Hücre Kültürleri Ders Kitabı
4 Biyoreaktörler Ders Kitabı
5 Alt- ve Üst-akım işlemleri Ders Kitabı
6 Tek Hücre Proteini - Ara Sınav I Ders Kitabı
7 Biyoyakıtlar Ders Kitabı
8 Biyoyakıtlar - Enzimler Ders Kitabı
9 Enzimler Ders Kitabı
10 Antibiyotikler Ders Kitabı
11 Laktik asit ve Asetik asit Ders Kitabı
12 Sitrik asit – Ara Sınav II Ders Kitabı
13 Biyoplastikler ve Biyopolimerler Ders Kitabı
14 Aminoasitler Ders Kitabı
15 Monoklonal antikorlar Ders Kitabı
16 Aşılar Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Biochemical Engineering Fundamentals, Bailey & Ollis, 4th Ed.
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Gerekli olabilecek olan tablolar ve grafikler öğrencilere fotokopi olarak verilmektedir.
82
Sınavlar 2 Ara sınav ve 1 Final verilmektedir.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 60
Deney
Ödev
Proje
Toplam 60
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
X
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
X
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
83
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
X
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası hariçtir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 7 98
Ara Sınav 2 2 4
Deney
Ödev
Proje
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 147
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5,88
Dersin AKTS Kredisi 6
84
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat
Kredi AKTS
Yaz Stajı GBE 400 7 0 + 2 + 0 1 1
Ön Koşul Dersleri AFE 132, GBE 301, GBE 341
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç. Dr. Bahar Soğutmaz Özdemir
Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Bahar Soğutmaz Özdemir
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ VAR
Dersin Amacı
Bölüm tarafından onaylanan bir şirkette veya laboratuvarda 20 iş
günü içerisinde genetik ve biyomühendislik uygulamaları
konusunda tecrübe kazanmak.
Dersin İçeriği
Staj raporunda belirtilmesi istendiği üzere öğrenci, profesyonel
çalışma ortamında eğitim görür, çalışma yeri ve alet/techizat
hakkında bilgi toplar ve istenen görevleri yerine getiri.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme
Çıktıları Öğretim
Yöntemleri Ölçme
Yöntemleri
Şirkette veya laboratuvarda genetik ve biyomühendislik uygulamaları konusunda yeterlilik kazanması
2,3,4,5,9 2,3,4 B, D
Çalışma ortamı, farklı bölümlerarası takım çalışması, üretkenlik konusunda profesyonel bilgi birikimi kazanması
2,3,4,5,9 2,3,4 B, D
Sesli ve yazılı iletişim becerilerin geliştirilmesi 2,3,4,5,9 2,3,4 B, D
Öğretim Yöntemleri: 1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri: A: Sınav , B: Deney , C: Ödev , D: Proje
DERS İÇERİĞİ
85
Hafta Konular Çalışma Malzemeleri
1
Çalışma yerinde bulunan danışman tarafından
belirlenir
2
Çalışma yerinde bulunan danışman tarafından
belirlenir
3
Çalışma yerinde bulunan danışman tarafından
belirlenir
4
Çalışma yerinde bulunan danışman tarafından
belirlenir
KAYNAKLAR
Ders Kitabı
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar
Sınavlar
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav
Deney
Ödev
Proje 1 50
Toplam 50
Final Sınavının Başarıya Oranı 50
Yıl içinin Başarıya Oranı 50
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
86
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
x
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
x
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
x
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
x
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
X
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası hariçtir: 4x toplam ders saati) 4 4 16
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 4 1 4
Ara Sınav
Deney
Ödev
Proje 1 5 5
Final Sınavı
Toplam İş Yükü 25
Toplam İş Yükü / 25 (s) 1
Dersin AKTS Kredisi 1
87
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Moleküler Biyoloji II GBE 404 8 2 + 1 + 3 4 5
Ön Koşul Dersleri GBE 341
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Doç. Dr. Dilek Telci
Dersi Verenler Doç. Dr. Dilek Telci
Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerleri
STAJ YOK
Dersin Amacı
Öğrencilerin hücre siklus kontrolü, hücre dışı matris ve hücre
yapışması, embriyonik gelişim ve bağışıklık biyolojisi gibi öncelikli
hücre moleküler biyolojisi konularında bilgi ve deneysel
yaklaşımlar ile pratik geliştirmesini sağlamak.
Dersin İçeriği
Hücre siklusu ve hücre ölümü, Hücre bağlantıları-adezyon ve
hücre dışı matris, Bağışıklık Biyolojisi, Üreme hücreleri ve
döllenme, Çok hücreli organizmalarda gelişim, Dokuların
Histolojisi. Ders içeriğine paralel laboratuvar deneyleri.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Hücre siklusu ve ölümünün temel ilkelerini kavramak. 1 1,2 A,C
2) Hücre bağlarının ve adezyonunun çok hücreli organizmaların gelişimindeki, hücre canlılığındaki ve doku bütünlüğündeki önemini anlamak.
1,3 1,2,3 A,B,C
3) Bağışıklık sisteminin oranizmaların yaşamı sürdürmesindeki önemini anlamak.
1,3 1,2,3 A,B,C
Öğretim Yöntemleri: 1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri: A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
88
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Hücre Siklusu ve Ölümü
Ders Kitabı
2 Hücre Siklusu ve Ölümü Ders Kitabı
3 Hücre Bölünmesi Mekanizması Ders Kitabı
4 Hücre Bağları, Adezyon ve Hücre Dışı Matris Ders Kitabı
5 Hücre Bağları, Adezyon ve Hücre Dışı Matris Ders Kitabı
6 Arasınav 1 Ders Kitabı
7 Doğuştan Gelen ve Edinilmiş Bağışıklık Sistemi Ders Kitabı
8 Edinilmiş Bağışıklık Sistemi Ders Kitabı
9 Edinilmiş Bağışıklık Sistemi Ders Kitabı
10 Üreme Hücreleri ve Döllenme Ders Kitabı
11 Arasınav II Ders Kitabı
12 Çok Hücreli Organizmalarda Gelişim Ders Kitabı
13 Çok Hücreli Organizmalarda Gelişim Ders Kitabı
14 Çok Hücreli Organizmalarda Gelişim Ders Kitabı
15 Dokuların Histolojisi Ders Kitabı
16 Dokuların Histolojisi Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Molecular Biology of the Cell, Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter, 5th edition.
Diğer Kaynaklar Derleme Yayınlar
MATERYAL PAYLAŞIMI
89
Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin email adreslerine gönderilmektedir.
Ödevler Laboratuvar deneyleri her hafta sonunda rapor olarak öğrenciler tarafından teslim edilmektedir.
Sınavlar 2 Arasınav ve 1 Final verilmektedir.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 30
Deney 8 35
Ödev
Proje
Toplam 65
Final Sınavının Başarıya Oranı 35
Yıl içinin Başarıya Oranı 65
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
X
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
X
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
X
90
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
X
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası hariçtir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 4 56
Ara Sınav 2 3 6
Deney 8 3 24
Ödev
Proje
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 131
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5,24
Dersin AKTS Kredisi 5
91
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Mühendislik Projesi GBE 492 8 1 + 0 + 4 3 8
Ön Koşul Dersleri 4. sınıf öğrencisi olmak
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi
Lisans
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü
Bölüm fakülte üyeleri
Dersi Verenler
Bölüm fakülte üyeleri
Dersin Yardımcıları
ilgili laborauvarın bölüm bursiyerleri
STAJ YOK
Dersin Amacı
biyomühendislik projesinin tamamlanması için gerekli biyomühendislik
problemin saptanması ve deneylerin tasarlanıp gerçekleştirilmesi
Content
Bir mühendislik / bilim probleminin analiz, tasarım ve gerçeklenmesi,
sonuçların rapor ve seminer olarak sunumu, proje ile ilgili laboratuvar
deneyleri
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) biyomühendislik alanında bir problemin tanımlar
2, 6, 7, 10 2, 3, 4 A,B.C.D
2) çözüm sunabilmek için projeyi tasarlar 3, 4, 9, 10 2, 3, 4 A,B.C.D
3) laboratuvar deneylerini tasarlar ve yapar 3, 4, 5, 9, 10 2, 3, 4 A,B.C.D
4) bulguları analiz eder ve yazılı vede sözlü olarak sunar
7, 9,10 2, 3, 4 A,B.C.D
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Laboratuar, 4: Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav, B: Deney, C: Ödev, D: Proje
92
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 ilgili lab danışmanı ile proje konusu tartışması
2 final projesi için konuların belirlenmesi
3 kaynak araştırması
4 kaynak araştırması
5 kaynak araştırması
6 seçilen konu ile alakalı çalişmaların organize edilip tartışılması
7 gerekli iş ve deneylerin belirlenmesi
8 hesaplamalar veya analizler veya deneyler
9 hesaplamalar veya analizler veya deneyler
10 hesaplamalar veya analizler veya deneyler
11 sonuçların yada bulguların değerlendirilmesi
12 tez yazımı
13 tez yazımı
14 gerekli düzeltmeler ve tez teslimi
KAYNAKLAR
Ders Kitabı
Diğer Kaynaklar
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar
Ödevler
Sınavlar
93
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Proje raporları 1 60
Final (tez değerlendirilmesi) 1 40
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl İçinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersi
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahiptir.
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptar, tanımlar ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunar.
X
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlar, deney yapar, veri toplar, sonuçları analiz edip ve yorumlar.
X
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlar.
X
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışır ve sorumluluk alarak karar almada belirleyicidir.
X
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilir.
X
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık yaratır.
X
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisine sahiptir.
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisine sahiptir.
X
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisine sahiptir.
X
94
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlikler Sayısı Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası hariçtir: 14x toplam ders saati) 14 8 112
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 5 70
Final sınav 1 10 10
Toplam İş Yükü 192
Toplam İş Yükü / 25 (s) 7.68
Dersin AKTS Kredisi 8
95
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Neurobiyoloji GBE 324 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu Seçmeli
Dersin Koordinatörü
Bölüm öğretim görevlileri
Dersi Verenler Bölüm öğretim görevlileri
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı Lisans düzeyinde temel nörobiyoloji altyapısı oluşturmak, bunu
takiben güncel gelişmelerle ilgili tartışmalar yapmak
Dersin İçeriği
Sinir hücreleri, sinir hücresi aktivasyonunun reseptör aracılığı ile
kontrolü; G protein bağlı reseptörlerin moleküler biyolojisi; beyin ve
merkezi sinir sistemi; kan-beyin bariyeri; baskılayıcı amino asitler
ve dopamin; öğrenme ve hafızanın hücresel mekanizmaları;
nörodejeneratif hastalıklar; nörodejeneratif hastalıkların modeli
olarak transgenic hayvanlar
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Nörobiyloji, öğrenme ve hafızayla ilgili temel bilgiler
1,6 1,2 A
2) Sinir sistemi hastalıklarının modeli olarak transgenik hayvanların kullanımına ilişkin temel bilgiler
1,6 1,2 A
3) Güncel genetik teknikler yanısıra nörorejenerasyonla bağlantılı kök hücre teknolojilerine ait temel bilgiler
1,6 1,2 A
96
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1
Sinir hücreleri ve davranışa giriş (Kısım I ve II)
Ders notları, powerpoint sunumları, ders kitabı
2
Nörositoiskelet; nöronlarda protein sentezi; aksonal taşıma
(Bölüm 4,5)
Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
kitabı
3
Iyon kanalları (Bölüm 6) Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
kitabı
4
Zar potansiyeli; aksiyon potansiyeli
Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
kitabı
5
Sinaptik ileti
Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
kitabı
6
Sinaptik iletinin modülasyonu (Bölüm 13)
Sinaptik bütünleştirme
Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
kitabı
7
ARA SINAV
Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
kitabı
8
Nöroanatomi – Sinir sisteminin işlevsel organizasyonu
Sinir sisteminin gelişimi - I
Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
97
kitabı
9
Sinir sisteminin gelişimi – II
Sinir kök hücreleri ve nörorejeneratif tedaviler
Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
kitabı
10
Akson rehberliği (Bölüm 54)
Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
kitabı
11
Öğrenme ve hafıza (Bölüm 62, 63)
Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
kitabı
12
Öğrenme ve hafızanın hücresel mekanizmaları
Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
kitabı
13
Beynin yaşlanması; nörodejeneratif hastalıklar (Bölüm 58)
Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
kitabı
14
Dil hastalıkları; psikolojik hastalıklar
Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
kitabı
15 Revizyon ve Telafi Sınavı
Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
kitabı
16 Final Sınavı
Ders notları,
powerpoint
sunumları, ders
kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı
1. Principles of Neural Science, Kandel, Schwartz, Jessell, McGraw
Hill, 2000, 4th Ed.
98
2. From Neuron to Brain, Nicholls, Martin, Wallace, Fuchs
Diğer Kaynaklar Dağıtılan belgeler
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları Sınav Sonucu Panosu’nda asılmakta, isteyen öğrencilere sınav kağıtları gösterilmektedir.
Ödevler yoktur.
Sınavlar 1 Arasınav ve 1 Final verilmektedir.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 1 35
Deney
Ödev 15
Proje
Toplam 50
Final Sınavının Başarıya Oranı 50
Yıl içinin Başarıya Oranı 50
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
X
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
99
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
X
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
X
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
X
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 8 6 48
Ara Sınav 1 10 10
Deney
Ödev
Proje
Final Sınavı 1 20 20
Toplam İş Yükü 120
Toplam İş Yükü / 25 (s) 4,80
Dersin AKTS Kredisi 5
100
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Bitki Genetiği GBE 356 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5
Ön Koşul Dersler YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu Seçmeli
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç. Dr. Andrew Harvey
Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Andrew Harvey
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı
Genetik manipülasyona odaklı bir şekilde, öğrencilere bitki
biyolojisi ve genetiği hakkında bilgi kazandırmak. Moleküler
teknikler ve bitki biyoteknolojisine uygulanan genetik analizler
hakkında bilgi vermek.
Dersin İçeriği
Bitki biyolojisi hakkında genel bilgi; nükleer ve sitoplazmik
genomların yapıları; gen transfer teknikleri; çiçekli bitkilerin
gelişiminde gen anlatımı ve düzenlenmesi; bitkilerde genetik
mühendisliği; transgenik bitkiler ve biyoteknolojide kullanımları.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Bitki genetiği ve kalıtımının temel kavramlarını anlayabilme
1 1,2 A,C
2) Temel bitki biyolojisini, fizyolojisini ve bunların bitki doku kültürüne uygulamalarını anlayabilme
1 1,2 A, C
3) Bitki DNA vektörlerinin yapılandırılmasını, ayrıca bitki transformasyon amaç ve yöntemlerini, açıklayabilme ve yorumlayabilme
1 1,2 A, C
4) Transgenik bitkilerin analizini açıklayabilme ve değerlendirebilme
1 1,2 A, C
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Laboratuvar, 4: Vaka Çalışması
101
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav, B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Bitki Genetiği ve Biyoteknolojisine Giriş Ders Kitabı
2 Mendel Genetiği & Bitki Üremesi Ders Kitabı
3 Bitki Yetiştirme Ders Kitabı
4 Bitki Gelişimi & Fizyolojisi Ders Kitabı
5 Bitki Doku Kültürü Ders Kitabı
6 Ara Sınav 1 Ders Kitabı
7 Moleküler Gen Anlatımı Ders Kitabı
8 Rekombinant DNA & Vektörler Ders Kitabı
9 Genler ve İlgilenilen Özellikler Ders Kitabı
10 Bitki Transformasyonu Ders Kitabı
11 Promotörler ve Marker Genler Ders Kitabı
12 Ara Sınav 2 Ders Kitabı
13 Transgenik Bitkilerin Analizi Ders Kitabı
14 Düzenlemeler ve Biyogüvenlik Ders Kitabı
15 Saha Testleri ve Riskler Ders Kitabı
16 Tartışma ve Gelecek Planları Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Stewart, C.N., Jr. (Ed.) 2008. Plant Biotechnology and Genetics: Principles, Techniques and Applications, Wiley and Sons
Diğer Kaynaklar
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Öğrenciler ders notlarını pdf dosyası halinde indirebilir.
Ödevler
Sınavlar 2 Ara sınav ve 1 Final verilmektedir.
102
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 30
Deney
Ödev
Proje
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
X
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
X
5 Disiplinler arası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin,
X
103
çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi (Ön çalışma, pekiştirme) 14 5 70
Ara Sınav 2 3 6
Deney
Ödev
Proje
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 121
Toplam İş Yükü / 25 (s) 4,84
Dersin AKTS Kredisi 5
104
Ders Bilgileri
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
İnsan Genetiği GBE 357 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu Seçmeli
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç. Dr. Fatih Kocabaş
Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Fatih Kocabaş
Dersin Yardımcıları Yok
STAJ Yok
Dersin Amacı
Bu ders, insan özelliklerinin aktarılışını ve bu aktatışın insan sağlığı
üzerindeki etkileriyle ilgili bilgi katmayı ve Homo sapiens’ in genetik
özelliklerini incelemek için bilimsel ilgi kazandırmayı amaçlar
Dersin İçeriği
Genetiğe Genel Bakış, Hücreler ve Bölünme (Mitoz ve Mayoz
Bölünme), Aktarma Genetiği, Gen kalıtımı, Mendel Kanunları, Çok
Genli Özellikler, Cinsiyet Belirleme Genetiiği, Davranışsal Genetik,
DNA ve Kromozomlar, Yapı, Replikasyon, Gen Anlatımı, Genom
Yapısı, Mutasyonlar, Popülasyon Genetiği, Allel Sıklığı, İnsan Soyu,
Soy Islahı, Bağışıklık ve Kanser Genetiği, Laboratuvarda Genetik,
Genetik Teknolojileri, Genetik Bozukluklar, Genetik Testleri ve
Tedaviler, Reprodüksiyon Teknolojileri, Gen Bilimi, Genomik
Damgalama, Gen Tanımlama, İnsan Genomunun Genetik ve
Fiziksel Haritalandırılması, İnsan Genom Projesi, İnsan Gen
Bozuklukları- Vaka çalışması.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) İnsan genomu ve fenotipte değişik özellerin ekspress edilmesi arasındaki ilişkiyi anlamak
3,4 1 A,C
2) Normal ve anormal (gen bozuklukları) özellik aktarımlarının aile ağaçları ve punett karesi üzerinde gösterilmesi ve bunun genetik danışmanlık uygulamalarında kullanılması.
4,7 1,2,4 A,D
105
3) İnsan genetiğinin bağışıklık tepkisini kontrol etmedeki temellerini anlamak ve Onkojenesis’in (Kanser) başlatılması.
7,10 1 A,D
4) Laboratuvar genetik çalışmalarıyla ilgili gelecekteki beklentileri ve düzeltici genetik çalışmalarının gen bozukluklarını üzerindeki etkilerini öğrenmek
10 1,2,4 C,D
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Genetiğe Genel Bakış Ders Kitabı
2 Hücreler ve Bölünme (Mitoz ve Mayoz Bölünme) Ders Kitabı
3 Aktarma Genetiği Ders Kitabı
4 Mendel Kanunları Ders Kitabı
5 Çok Genli Özellikler, Cinsiyet Belirleme Genetiiği,
Davranışsal Genetik
Ders Kitabı
6 DNA ve Kromozomlar, Yapı, Replikasyon, Gen Anlatımı, Genom Yapısı, Mutasyonlar
Ders Kitabı
7 Popülasyon Genetiği, Allel Sıklığı, İnsan Soyu, Soy Islahı Ders Kitabı
8 ARA SINAV Ders Kitabı
9 Bağışıklık ve Kanser Genetiği Ders Kitabı
10 Laboratuvarda Genetik, Genetik Teknolojileri Ders Kitabı
11 Genetik Bozukluklar, Genetik Testleri ve Tedaviler Ders Kitabı
12 Reprodüksiyon Teknolojileri, Gen Bilimi Ders Kitabı
13 Genomik Damgalama, Gen Tanımlama, İnsan Genomunun Genetik ve Fiziksel Haritalandırılması
Ders Kitabı
14 İnsan Genom Projesi Ders Kitabı
15 İnsan Gen Bozuklukları- Vaka çalışması / SEMİNER REPREZENTASYON
Ders Kitabı
16 FİNAL SINAVI Ders Kitabı
106
KAYNAKLAR
Ders Kitabı 1. Human Genetics – Concepts and Applications. Author -
Ricki Lewis (Available from Library)
Diğer Kaynaklar
2. Concepts of Genetics. Authors - William Klug, Michael
Cummings, Charlotte Spencer, Michael Palladino (Available
from Library)
3. Genes VIII. Author – Benjamin Lewin (Available from
Library)
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin email adreslerine gönderilmektedir
Ödevler Verilen ödevler bir hafta sonra toplanmaktadır
Sınavlar 1 Ara Sınav and 1 Final Sınavı
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 1 40
Ödevler 4-6 10
Proje 1 10
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
107
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
X
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
X
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
X
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
X
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
X
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 5 70
Ara Sınav 1 3 3
Deney
Ödev
Proje 1 0.5 0.5
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 118.5
Toplam İş Yükü / 25 (s) 4.74
Dersin AKTS Kredisi 5
108
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Bitki Doku Kültürü Mühendisliği GBE 373 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu Seçmeli
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç. Dr. Bahar Soğutmaz Özdemir
Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Bahar Soğutmaz Özdemir
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı
Bitki doku kültüründe kullanılan yeni teknikler, bitki doku kültürü
yöntemleri, bitkilerin genetik mühendisliği ile ilgili bilgi sağlanması
ve uygulama alanlarını tartışılması.
Dersin İçeriği
Bitki doku kültürü teknikleri, bitki transformasyon yöntemleri, klonal
çoğaltma, bitki doku kültüründe kullanılan mühendislik teknikleri:
bilgisayarlı görüntü analizi, bitki çoğaltımında biyoreaktör
teknolojisi, kültürel ortamın mühendisliği ve mekanize bitki üretimi.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme
Çıktıları Öğretim
Yöntemleri Ölçme
Yöntemleri
1) Bitki doku kültüründe temel kavramların verilmesi
2, 10 1, 2 A, D
2) Bitki çoğaltımı ve genetik mühendisliğindeki önemli hususların ve yöntemlerin verilmesi
2, 7, 9, 10 1, 2, 3, 4 A, D
3) Bitki doku kültürü mühendisliğindeki önemli hususların ve kullanılan yöntemlerin verilmesi
2, 9, 10 1, 2, 4 A, D
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney , C: Ödev , D: Proje
109
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Giriş
Ders Kitabı
2 Bitki hücre ve doku kültürü gereksinimleri Ders Kitabı
3
Bitki doku kültürü yöntemleri I (Organogenez,
embriyogenez)
Ders Kitabı
4
Bitki doku kültürü yöntemleri II (embriyo
kurtarma, haploid bitki üretimi, protoplast
füzyonu)
Ders Kitabı
5 Bitki genetik mühendisliği teknikleri Ders Kitabı
6
Bitki genetik mühendisliği meseleleri ve
uygulamaları
Ders Kitabı
7 Ara Sınav Ders Kitabı
8 Bilgisayarlı görüntü analizi Ders Kitabı
9 Bitki üretiminde biyoreaktör teknolojisi Ders Kitabı
10 Kültürel ortamın mühendisliği Ders Kitabı
11 Mekanize bitki üretimi ve deneysel tasarımlar Ders Kitabı
12 Uygulama alanları Ders Kitabı
13 Sunumlar Ders Kitabı
14 Sunumlar Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı
Plant Tissue Culture Engineering, Gupta DS and Ibaraki Y, 2nd Edition, Springer, 2008. Trigiano RN and Dennis JG (2005) Plant development and biotechnology. CRC Press, USA.
MATERYAL PAYLAŞIMI
110
Dökümanlar Ders notları öğrencilere verilecektir.
Sınavlar 1 Ara Sınav, 1 Sunum ve 1 Final Sınavı
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 1 30
Sunum 1 20
Final Sınavı 1 50
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 50
Yıl içinin Başarıya Oranı 50
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
X
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
X
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
X
111
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
X
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Ara Sınav 1 2 2
Sunum 1 1 1
Ders dışı çalışmalar 14 5 70
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 118
Toplam İş Yükü / 25 (s) 4,72
Dersin AKTS Kredisi 5
112
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Adli Teknolojiler GBE 376 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu seçmeli
Dersin Koordinatörü Yrd. Doç. Dr. Fatih Kocabaş
Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Fatih Kocabaş
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı adli teknoloji bilimini öğrencilere tanıtmak ve kullanılan temel
teknik ve metodları öğretmek
Content
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1. adli teknolojinin tarihini ve değişik alanlarını öğrenir
9,10 1,2 A,C,D
2. eski ve yeni teknik ve metodları anlar 9,10 1,2 A,C,D
3. grup içinde çalışma yeteneği kazanır ve adli vaka çalışmasını bilgisini kullanarak saptar ve çözer.
2,5,6,7 1,2,4 A,C,D
4. adli bilim insanı bakışıyla suçun ortaya çıkarılmasında temel teknikleri öğrenir
7,9,10 1,2,,4 A,C,D
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Laboratuar, 4: Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav, B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 adli teknolojilere giriş slaytlar ve notlar
2 temel alanlar ve laboratuvarlar slaytlar ve notlar
113
3 parmakizi incelemesi I slaytlar ve notlar
4 parmakizi incelemesi II slaytlar ve notlar
5 temel olay yeri inceleme teknikleri slaytlar ve notlar
6 Ara Sınav I (vaka incelenmesi ödevi) slaytlar ve notlar
7 kanıt takibi analizi slaytlar ve notlar
8 kanıt takibi analizi slaytlar ve notlar
9 kontrol edilen maddelerin analizi I slaytlar ve notlar
10 kontrol edilen maddelerin analizi II slaytlar ve notlar
11 Ara Sınav II slaytlar ve notlar
12 kan kalıntısı analizi slaytlar ve notlar
13 adli seroloji slaytlar ve notlar
14 DNA analizi slaytlar ve notlar
15 alanda yeni teknolojiler slaytlar ve notlar
16 alanda yeni teknolojiler slaytlar ve notlar
KAYNAKLAR
Ders Kitabı
Diğer Kaynaklar ders notları ve slaytlar
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları öğrenciler tarafından pdf formatında indirilebilmektedir.
Ödevler adli teknolojlerin değişik alanları için ödevler
Sınavlar 2 Ara Sınav ve 1 Final.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 60
Deney
Ödev 1 10
114
Proje
Final 1 30
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 30
Yıl İçinin Başarıya Oranı 70
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersi
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahiptir.
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptar, tanımlar ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunar.
x
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlar, deney yapar, veri toplar, sonuçları analiz edip ve yorumlar.
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlar.
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışır ve sorumluluk alarak karar almada belirleyicidir.
x
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilir.
x
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık yaratır.
x
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisine sahiptir.
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisine sahiptir.
x
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisine sahiptir.
x
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlikler Sayısı Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası hariçtir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
115
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 5 70
Ara Sınav (Vaka) 1 8 8
Ara Sınav 1 3 6
Deney 0 0 0
Ödev 1 3 3
Proje
Final sınav 1 3 3
Toplam İş Yükü 132
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5.3
Dersin AKTS Kredisi
5
116
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat
Kredi AKTS
Protein Kimyası GBE 405 6-7-8 3+0+0 3 5
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu Seçmeli
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç .Dr. Hüseyin Çimen
Dersi Verenler Yrd. Doç .Dr. Hüseyin Çimen
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı
Öğrencilere proteinlerin saflaştırılmasının genel özellikleri ve
protein saflaştırmasında kullanacakları kromatografi, liyofilizasyon,
elektroforez, diyaliz, ultrafiltrasyon gibi tekniklerle ilgili bilgilerin
kazandırılması amaçlanmıştır.
Dersin İçeriği
Aminoasitler, protein yapıları, Protein ayrıştırmasında ve saflaştırmasında kullanılan genel ve spesifik metotlar. Proteinlerin dokulardan ekstraksiyonu ve fraksiyonlanması. Ultrasantrifügasyon kromatografik teknikler. Proteomik uygulamalara giriş
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Protein saflaştırmanın prensipleri ve aşamaları hakkında ayrıntılı bilgi sahibi olabileceklerdir
1,3, 9,10 1,3,4 A,C
2) Protein kimyası ve aminoasitler hakkında detaylı bilgi kazanır
1,3, 9,10 1,3,4 A,C
3) Protein ayrıştırma ve saflaştırma için kullanılan teknik ve uygulamalar konusunda bilgi sahibi olur.
1,3, 9,10 1,3,4 A,C
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
117
Ölçme Yöntemleri: A: Sınav,B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma Malzemeleri
1 Giriş: protein kimyasına genel bakış Ders notları ve sunum malzemeleri
2 Protein saflaştırma stratejisi ve amacı Ders notları ve sunum malzemeleri
3 Protein saflaştırmasında kullanılan metotlar Ders notları ve sunum malzemeleri
4 Proteinlerin ekstraksiyonu ve fraksiyonlanması Ders notları ve sunum malzemeleri
5 Protein ekstraktının deriştirilmesi Ders notları ve sunum malzemeleri
6 Ultrasantrifügasyon Ders notları ve sunum malzemeleri
7 Ara Sınav Ders notları ve sunum malzemeleri
8 İyon değişimi kromatografisi Ders notları ve sunum malzemeleri
9 Protein katlanma problem Ders notları ve sunum malzemeleri
10 Jel filtrasyon kromatografisi Ders notları ve sunum malzemeleri
11 Afinite kromatografisi Ders notları ve sunum malzemeleri
12 Elektroforetik yöntemler Ders notları ve sunum malzemeleri
13 HPLC ve proteomik metodlar Ders notları ve sunum malzemeleri
14 İmmünolojik yöntemler Ders notları ve sunum malzemeleri
15 Sunumlar Ders notları ve sunum malzemeleri
16 Genel tekrar ve proje sunumları Ders notları ve sunum malzemeleri
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Araştırma makaleleri; ders notları; sunumlar
Diğer Kaynaklar yoktur
MATERYAL PAYLAŞIMI
118
Dökümanlar
Ödevler Dönemin ikinci yarısından itibaren öğrencilere o haftaki konuya ilişkin güncel araştırma makalelerinden ödevler verilmektedir.
Sınavlar 1 ara sınav, öğrenci sunumları ve 1 Final.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 1 25
Deney
Ödev
Proje 1 35
Final 1 40
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen, istatistik ve mühendislik bilgilerini uygulama becerisi. X
2 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci tasarlama becerisi.
3 Biyoteknoloji ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve bilişim araçları kullanarak çözme becerisi.
X
4 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi.
5 Biyoteknoloji alanında etkin iletişim kurabilme ve kendini sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi.
6 Mesleki ahlak ve sosyal sorumluluk bilinci kazanmış, güncel konularda meslek etiğine uygun söz, beyan ve uygulamalarda bulunma becerisi.
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık.
119
8 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi.
9 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi.
X
10 Kendini global alanda ingilizce olarak yeterli seviyede yazılı ve sözlü olarak ifade becerisi.
X
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 3 42
Ara Sınav 1 10 10
Deney
Ödev
Proje 1 20 20
Final Sınavı 1 15 15
Toplam İş Yükü 129
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5.2
Dersin AKTS Kredisi 5
120
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Kanser Biyolojisi GBE 414 6-7- 8 3 + 0 + 0 3 5
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu seçmeli
Dersin Koordinatörü
Doç. Dr. Dilek Telci
Dersi Verenler Doç. Dr. Dilek Telci
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı
Öğrencilere kanser gelişimi ve biyolojisi üzerine moleküler
yolakları öğretmek. Öğrencileri kanser tedavisinde kullanılan
moleküler hedefli ilaçlar konusunda bilgilendirmek.
Dersin İçeriği
Moleküler kanser biyolojisini etioloji, kanser gelişimi, genetiği,
tedavisi ve önlenmesi baz alarak açıklamak. Kanserin doğası,
etiolojisi, kanserin oluşma nedenleri (kalıtımsal, kimyasal, viral ve
çevresel faktörler), kanserde oluşan genetik değişiklikler,
onkogenler, tümör baskılayıcı genler, apoptoz ve metastaz .
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Kanser oluşumunun ve gelişiminin temel kavramlarını anlar
1,2,9 1,2 A
2) Onkogenlerin ve tümör baskalıyıcı genlerin kanser gelişimindeki kontrol ve etkilerini mekanizmalarıyla yorumlar
1,2,9 1,2,3 A
3) Kanser gelişiminde apoptoz ve yaşam sürdürme sinyal yolaklarının önemini açıklayr
1,2,9 1,2,3 A
4) Metastaz koordinasyonunu kavrayabilme ve kök hücrelerin kanser gelişimindeki önemini yorumlar
1,2,9 1,2,3 A
5) Kanser tedavisinde kullanılan klasik ilaçlar ve hedefli ilaçlar konusunda bilgi edinir.
2,3.7,10 1,2 A
121
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Kanser Biyolojisine Giriş; Kanser gelişimi
Ders Kitabı
2
DNA yapısı ve stabilitesi, mutasyon ve DNA hasarı tamir
mekanismaları
Ders Kitabı
3
DNA yapısı ve stabilitesi, mutasyon ve DNA hasarı tamir
mekanismaları
Ders Kitabı
4 Gen ifadesi regülasyonu Regulation of gene expression Ders Kitabı
5 Büyüme Faktörü Sinyal İletimi Yolağı ve Onkogenler Ders Kitabı
6 Büyüme Faktörü Sinyal İletimi Yolağı ve Onkogenler Ders Kitabı
7 Arasınav I Ders Kitabı
8 Hücre Siklusu Ders Kitabı
9 Hücre Büyümesi Inhibasyonu ve tümör baskılayıcı genler Ders Kitabı
10 Hücre Büyümesi Inhibasyonu ve tümör baskılayıcı genler Ders Kitabı
11 Apoptoz Ders Kitabı
12 Arasınav II Ders Kitabı
13 Kök hücre ve Başkalaşımı Ders Kitabı
14 Kök hücre ve Başkalaşımı Ders Kitabı
15 Metastaz Ders Kitabı
16 Metastaz Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Molecular Biology of Cancer, Lauren Pecorino, 3. baskı.
122
Diğer Kaynaklar Uluslararas dergilerde çıkan son yıllara ayit derleme makaleleri
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin email adreslerine gönderilmektedir.
Ödevler
Sınavlar 2 Arasınav ve 1 Final verilmektedir.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 2 50
Deney
Ödev
Proje
Final 1 50
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 50
Yıl içinin Başarıya Oranı 50
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersi
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahiptir.
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptar, tanımlar ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunar.
X
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlar, deney yapar, veri toplar, sonuçları analiz edip ve yorumlar.
X
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir
123
sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlar.
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışır ve sorumluluk alarak karar almada belirleyicidir.
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilir.
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık yaratır.
X
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisine sahiptir.
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisine sahiptir.
X
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisine sahiptir.
X
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahil değildir: 14x toplam ders saati)
14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 5 70
Ara Sınav 2 3 6
Deney
Ödev
Proje
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 121
Toplam İş Yükü / 25 (s) 4,84
Dersin AKTS Kredisi 5
124
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Kök Hücre Biyolojisi GBE 431 6-7- 8 3 + 0 + 0 3 5
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu Seçmeli
Dersin Koordinatörü Yrd. Doç. Dr. Fatih Kocabaş
Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Fatih Kocabaş
Dersin Yardımcıları Yok
STAJ Yok
Dersin Amacı
Bu ders, Kök Hücre Biyolojisin temel bilgilerini vermektedir, aynı zamanda kök
hücre biyolojisinin gelişimsel biyolojiden gelen temellerini ve en son araştırmalarla
bulunan ilerlemeleri kapsamaktadır.
Dersin İçeriği
Hücresel ve Nükleer Yeniden Programlama, Genom Bilimi ve Proteomiks,
Yenileme, Ektoderm Spesifikasyonu ve Farklılaşması, Reprodüksyonda Gamet ve
Vücut Hücresi Biyolojisi, Kök Hücre İmmunolojisi, Endoderm Spesifikasyonu ve
Farklılaşması, Mezoderm Spesifikasyonu ve Farklılaşması, Tedavi Beklentileri,
Epigenetik, Mikroçevre, Biyoloji, Homing ve Migrasyon, Doku Mühendisliği.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Kök Hücre Biyolojisinin temellerini öğrenme ve Gelişimsel Biyolojisinden genişletilmesini anlamak.
1,4 1 A
2) Konvensiyonel biyoloji prensiplerini kök hücre ortamındakilerle ilişkilendirmek
1,6 1,2 A,C
3) Potansiyel Kök Hücre araştırma uygulamaları hakkında bilgi edinme ve etik konularla ilgili bilgi sahibi olmak.
6,10 1,4 A,D
4) Kök hücre araştırma becerileri edinme ve potansiyel araştırma olasılıklarını incelemek
8,10 1,2,4 C,D
125
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma Malzemeleri
1 Hücresel ve Nükleer Yeniden Programlama Ders Kitabı
2 Genom Bilimi ve Proteomiks Ders Kitabı
3 Yenileme Ders Kitabı
4 Ektoderm Spesifikasyonu ve Farklılaşması Ders Kitabı
5 Reprodüksyonda Gamet ve Vücut Hücresi Biyolojisi Ders Kitabı
6 Kök Hücre İmmunolojisi Ders Kitabı
7 ARA SINAV Ders Kitabı
8 Endoderm Spesifikasyonu ve Farklılaşması Ders Kitabı
9 Mezoderm Spesifikasyonu ve Farklılaşması Ders Kitabı
10 Tedavi Beklentileri Ders Kitabı
11 Epigenetik Ders Kitabı
12 Mikroçevre, Biyoloji, Homing ve Migrasyon Ders Kitabı
13 Doku Mühendisliği I Ders Kitabı
14 Doku Mühendisliği II Ders Kitabı
15 SEMİNER PRESENTASYONU
16 FİNAL SINAVI Ders Kitabı
ÖNERİLEN KAYNAKLAR
Ders Kitabı 1. Stembook – Havard Stem Cell Institute
Diğer Kaynaklar 2. Stem Cell Biology – Review articles (Pubmed, NCBI)
126
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin email adreslerine gönderilmektedir.
Ödevler Verilen ödevler bir hafta sonra toplanır.
Sınavlar 1 Ara Sınav and 1 Final Sınavı
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 1 40
Deney
Ödevler 4-6 10
Proje 1 10
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
X
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
127
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
X
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
X
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
X
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 5 70
Arasınav 1 3 3
Deney
Ödev
Proje 1 0.5 0.5
Final examination 1 3 3
Toplam İş Yükü 118.5
Toplam İş Yükü / 25 (s) 4.74
Dersin AKTS Kredisi 5
128
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Hücre ve Doku Kültürü
GBE 432 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu Seçmeli
Dersin Koordinatörü
Prof.Dr.Gamze Torun Köse
Dersi Verenler Prof.Dr.Gamze Torun Köse
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı Öğrencilerin hücre ve doku kültürü konusunda bilgilerini arttırmayı
sağlamak.
Dersin İçeriği
Hücre ve Doku Kültürü sistemleri; güvenlik testi; tarihçe ve temel
metodoloji; kültür tekniklerinin özelleştirilmesi; temel kültür
koşulları; hücre kültürleri ve primer hücreler; gen transferi
teknikleri; hücre ve doku kültürlerinin moleküler analiz yöntemleri;
kültürlerden DNA, RNA ve protein izolasyonu; raportör gen
deneyleri; apoptoz ve çoğalma analizleri; kök hücresi izolasyonu
ve kültürü; doku mühendisliği, hücrelerin matrisler üzerinde
büyütülmesi ve devam ettirilmesi; gelecekteki beklentiler
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Temel hücre kültürü tekniklerini öğrenme 1 1,2 A,D
2) Hücre ve doku kültüründeki güvenlik kurallarını öğrenme
1 1,2 A,D
3) Kök hücre terminolojisini kavrayabilme 1 1,2 A,D
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
129
Yöntemleri:
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Hücre ve Doku Kültürü Terminolojisi ve Tarihçesi
Ders Kitabı
2 Sterilite (Aseptik teknikler, Sterilizasyon metotları ve Filtrasyon) Ders Kitabı
3 Güvenlik kuralları Ders Kitabı
4 Hücre kültürü laboratuvarı dizaynı ve önemli ekipmanlar Ders Kitabı
5 Kültür ortamı: Besiyeri hazırlanması ve formülasyonları Ders Kitabı
6 Rutin hücre kültürü, hücre çoğalması analizi ve hücre canlılığı Ders Kitabı
7 Primer hücre kültürü (İzolasyon ve karakterizasyonu) Ders Kitabı
8 Vize Ders Kitabı
9 Hücre saklanması (dondurma ve çözme) Ders Kitabı
10 Kök Hücre I Ders Kitabı
11 Kök Hücre II Ders Kitabı
12 Sunum Ders Kitabı
13 Sunum Ders Kitabı
14 Sunum Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Tissue Culture Techniques – Bernice M.Martin
Diğer Kaynaklar Basic Cell Culture Protocols – C.D.Helgason, C.L.Miller
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları öğrencilere verilmektedir
130
Ödevler Proje sunum konuları ve hazırlık bilgileri öğrencilere verilmektedir
Sınavlar 1 Arasınav, 1 Sunum ve 1 Final verilmektedir
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 1 30
Deney
Ödev
Proje 1 30
Final 1 40
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
X
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve
131
bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 4 56
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 3 42
Ara Sınav 1 4 4
Deney
Ödev
Proje 1 20 20
Final Sınavı 1 4 4
Toplam İş Yükü 112
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5.04
Dersin AKTS Kredisi 5
132
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat
Kredi AKTS
Biyomalzemeler GBE 433 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu Seçmeli
Dersin Koordinatörü
Prof.Dr.Gamze Torun Köse
Dersi Verenler Prof.Dr.Gamze Torun Köse
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı Öğrencilerin, insan vucudu hasarlarında kullanabilecek
biyomalzemeler konusunda bilgilerini arttırmayı sağlamak.
Dersin İçeriği
Materyallerin Özellikleri: Mekanik Özellikleri, Yüzey Özellikleri,
Yüzey Karakterizasyonu, Tıpta Kullanılan Matreyaller: Polimerler,
Biyoemilebilir Materyaller, Metalik İmplant Materyaller, Seramikler
ve Hidrojeller, Doğal Materyaller, Biyomateryallere Karşı Konakçı
Reaksiyonu ve Değerlendirilmesi, Doku Mühendisliği.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Tıpta kullanılan malzeme çeşitlerini öğrenme 1 1,2 A
2) Malzemelerin özelliklerini öğrenme 1 1,2 A,D
3) Biyomalzemelerin vucutta yaratabileceği reaksiyonları ve bunların değerlendirmesini kavrayabilme
1 1,2 A,D
4) Doku Mühendisliğini kavrama 1 1,2 A,D
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
133
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Derse giriş ve Sunum konularının tanıtılması
Ders Kitabı
2 Malzeme özellikleri I Ders Kitabı
3 Malzeme özellikleri II Ders Kitabı
4 Tıpta kullanılan malzemelerin sınıflandırması I Ders Kitabı
5 Tıpta kullanılan malzemelerin sınıflandırması II Ders Kitabı
6
Biyomalzemelerin vucutta yaratabileceği reaksiyonlar ve
değerlendirmesi
Ders Kitabı
7 Biyomalzemelerin biyolojik testi Ders Kitabı
8 Biyolojik ortamda biyomalzemelerin bozunması Ders Kitabı
9 Vize Ders Kitabı
10 Tıp, Biyoloji ve Yapay organda malzeme uygulamaları Ders Kitabı
11 Doku Mühendisliği Ders Kitabı
12 Sunum Ders Kitabı
13 Sunum Ders Kitabı
14 Sunum Ders Kitabı
KAYNAKLAR
Ders Kitabı Biomaterials Science – Ratner, Hoffman, Schoen, Lemons
Diğer Kaynaklar Biomaterials: Principles and Applications – J.B.Park and J.D.Bronzino
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları öğrencilere verilmektedir
Ödevler Proje sunum konuları ve hazırlık bilgileri öğrencilere verilmektedir
134
Sınavlar 1 Arasınav, 1 Sunum ve 1 Final verilmektedir
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 1 30
Deney
Ödev
Proje 1 30
Final 1 40
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
X
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
135
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 4 56
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 3 42
Ara Sınav 1 4 4
Deney
Ödev
Proje 1 20 20
Final Sınavı 1 4 4
Toplam İş Yükü 112
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5.04
Dersin AKTS Kredisi 5
136
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS
Gen Terapisi GBE 435 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu Seçmeli
Ders Koordinatörü Bölüm öğretim görevlisi
Dersi Veren Bölüm öğretim görevlisi
Dersin Yardımcıları Yok
Staj Yok
Dersin Amaçları
Bu ders gen iletiminin basit prensiplerini ve düzeltici gen terapileri
için programlanan rekombinant genetik stratejileri öğretmeyi
amaçlar.
Dersin içeriği
Gen Terapisine Giriş, Virüssüz Gen Terapisi- Plazmid DNA ve Uygulamaları, Retrovirüs, Lentivirüs Vektörleri ve Entegrasyon Analizi, Adenoviral, Adeno-ilişkili virüs, Herpes Simplex Virüs Vektörleri, Düzenleyici RNA- RNA interferans, DNA Entegrasyon Vektörleri- Transpozonlar ve Integraz. Güvenlik ve Düzenleme konuları, Hedeflenmiş Gen Modifikasyonu ve Gen Terapisi için Homolog Rekombinasyon, Gen Terapide Klinik-Öncesi Çalışmalar için Gen Anahtarları, Merkezi Sinir Sistemi Bozuklukları ve Hemoglobinopati için Gen Terapisi, Birinci Dereceden İmmün Yetmezlikler ve Hemofili için Gen Terapisi, Obezite, Diyabet ve Duschene Kas Distrofisi için Gen Terapisi, Kanser Gen Terapisi ve Otoimmün Bozukluklar, Gen Terapisi için kısa bilgiler.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Gen terapi methodlarının temellerinin öğretilmesi ve düzeltici terapi için özgün genetik stratejiler oluşturma.
2,3 1,2 A,C
2) Genetik mühendislik tekniklerinin öğrenilmesi ve gen terapisi için rekombinant DNA teknolojisi uygulamaları.
1,3,4 1,2 A,C
137
3) Genetik terapi uygulamalarında, etik ve güvenlik bilgileri kazandırmak ve genetik terapi uygulamalarıyla alakalı bilgilerin öğretilmesi
7,10 1 A
4) Gen terapisinin İnsan Sağlık Bozukluklarını düzeltmek üzerine etkilerinin öğretilmesi
3,4,10 1,2,4 A,C,D
Teaching Methods:
1:Ders , 2: Soru-Cevap, 3: Laboratuvar, 4: Vaka Çalışması
Assessment Methods:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konu Çalışma Materyali
1 Gen Terapisine Giriş Ders Kitabı
2 Virüssüz Gen Terapisi- Plazmid DNA ve Uygulamaları Ders Kitabı
3 Retrovirüs, Lentivirüs Vektörleri ve Entegrasyon Analizi Ders Kitabı
4 Adenoviral, Adeno-ilişkili virüs, Herpes Simplex Virüs Vektörleri Ders Kitabı
5 Düzenleyici RNA- RNA interferans Ders Kitabı
6 DNA Entegrasyon Vektörleri- Transpozonlar ve Integraz Ders Kitabı
7 Güvenlik ve Düzenleme konuları Ders Kitabı
8 Ara Sınav Ders Kitabı
9 Hedeflenmiş Gen Modifikasyonu ve Gen Terapisi için Homolog Rekombinasyon
Ders Kitabı
10 Gen Terapide Klinik-Öncesi Çalışmalar için Gen Anahtarları Ders Kitabı
11 Merkezi Sinir Sistemi Bozuklukları ve Hemoglobinopati için Gen Terapisi
Ders Kitabı
12 Birinci Dereceden İmmün Yetmezlikler ve Hemofili için Gen Terapisi
Ders Kitabı
13 Obezite, Diyabet ve Duschene Kas Distrofisi için Gen Terapisi, Kanser Gen Terapisi ve Otoimmün Bozukluklar, Gen Terapisi için kısa bilgiler
Ders Kitabı
14 Kanser Gen Terapisi ve Otoimmün Bozukluklar Ders Kitabı
15 Gen Terapisi için kısa bilgiler /SEMİNER PRESENTASYONU Ders Kitabı
16 Final Sınavı Ders Kitabı
138
KAYNAKLAR
Ders Kitabı
1. A Guide to Human Gene Therapy. Author – Roland Herzog,
Sergei F Zolotukhin Year 2010, World Scientific Publishers
(Available from Internet)
Diğer Kaynalar
2. The Forever Fix: Gene Therapy and the Boy who saved it.
Authors – Ricki Lewis Year 2013, Griffin Publishing (Available
from Library)
3. Gene Therapy. Author – Giacca Mauro Year 2010, Springer
Verlag Italia Publishers (Available from Internet)
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin e-mail adreslerine gönderilmektedir.
Ödevler Verilen ödevler bir hafta sonra toplanılmaktadır.
Sınavlar 1 Ara Sınav, 1 Final Sınavı
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 1 40
Ödev 4-6 10
Proje 1 10
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
139
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
X
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
X
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
X
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
X
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
X
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 5 70
Ara Sınav 1 3 3
Deney
Ödev
Proje 1 0.5 0.5
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 118.5
Toplam İş Yükü / 25 (s) 4.74
Dersin AKTS Kredisi 5
140
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat
Kredi AKTS
Genomik ve Proteomik GBE 442 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu Seçmeli
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç. Dr. Hüseyin Çimen
Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Hüseyin Çimen
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı Öğrencilerin genomiks, proteomiks, biyoenformatik bilgilerini
artırmak.
Dersin İçeriği
Genomik bilgilere giriş, web tabanlı uygulamaları tanıtmak,
proteomik ve kütle spektrometrisi uygulamaları, analiz için örnek
hazırlama yöntemleri, örnek ayrıştırma ve saflaştırma sistemleri.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
Genomik temellerini öğrenme ve veritabalanlarını kullanabilme
1,8,9 1,2 A,C
Proteomik yaklaşımların öğrenilmesi ve deneysel yaklaşımlar
1,8,9 1,2 A,C
Biyoenformatik araçların öğrenilmesi ve yüksek hacimli işlemler
1,8,9 1,2 A,C
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
141
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Derse giriş ve Sunum konularının tanıtılması
Ders Kitabı
2 Genomik başlangıç Ders Kitabı
3 Yazılımlar Ders Kitabı
4 Metagenomiks Ders Kitabı
5 Proteomik başlangıç Ders Kitabı
6 Protein kimyasına giriş Ders Kitabı
7 Protein yapı ve analizleri Ders Kitabı
8 Deneysel yaklaşımlar Ders Kitabı
9 Vize Ders Kitabı
10 Kütle spektrometrisi Ders Kitabı
11 Çözünürlük, kütle doğruluğu ve cihazlar Ders Kitabı
12 Biyomolekül analizleri Ders Kitabı
13 Ekspresyon proteomik uygulamaları Ders Kitabı
14 Nicel ve nitel yaklaşımlar Ders Kitabı
15 Biyoenformatik uygulamalar Ders Kitabı
16 Sunum değerlendirmeleri
KAYNAKLAR
Ders Kitabı
Richard Twyman, Principles of Proteomics, Taylor & Francis
Edmond de Hoffmann, Vincent Stroobant, Mass Spectrometry:
Principles and Application, Wiley-Interscience 3 ed.
Diğer Kaynaklar
142
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları öğrencilere verilmektedir
Ödevler
Sınavlar 1 Arasınav, 1 Sunum ve 1 Final verilmektedir
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 1 30
Deney
Ödev
Proje 1 30
Final 1 40
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
143
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
X
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
X
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 5 70
Ara Sınav 1 4 4
Deney
Ödev
Proje 1 20 20
Final Sınavı 1 4 4
Toplam İş Yükü 140
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5.60
Dersin AKTS Kredisi 5
144
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat
Kredi AKTS
Biyoinformatiğe Giriş
GBE 444 6-7-8 3+0+0 3 5
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu Seçmeli
Dersin Koordinatörü
Yrd. Doç .Dr. Emrah Nikerel
Dersi Verenler Yrd. Doç .Dr. Emrah Nikerel
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı
Biyolojik sistemlerden gelen yüksek hacimli verilerin biyoinformatik
analizi, dizileme ve diğer gen okuma teknikleri hakkında hakkında
anlayış geliştirme.
Dersin İçeriği
Temelinde, biyoinformatik algoritma geliştirme üzerine bir bilim olmakla beraber uygulama alanları oldukça geniştir. Ders bünyesinde, biyolojik verilerden bilgi eldesi, mikrodizin deneyleri, veritabanlarında veri madenciliği, BLAST uygulamaları ve Needleman-Wursch, Smith Waterman algoritmaları, Yeni Nesil Dizileme verilerinin analizi ve –omik deneyler için deney tasarımı gibi yeni ve temel kavramlara giriş yapılacaktır.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Biyoinformatiğin temelleri hakkında farkındalık kazanır
1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C
2) Temel biyoinformatik yöntemlerini kullanır 1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C
3) Biyoinformatiğin uygulama alanları hakkında farkındalık kazanır
1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri: A: Sınav,B: Deney, C: Ödev, D: Proje
145
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma Malzemeleri
1 Giriş: biyoinformatik bilimine genel bakış Ders notları ve sunum malzemeleri
2 Nükleik asit ve protein dizilerinin analizi, moleküler biyolojinin santral dogması
Ders notları ve sunum
malzemeleri
3 Dizi hizalama yöntemleri, Needleman-Wunsch algoritması
Ders notları ve sunum
malzemeleri
4 Insan Genom Projesi, Genom Haritaları ve Diziler. Genom nasıl çalışılır*
Ders notları ve sunum
malzemeleri
5 Dizileme yöntemlerine bakış: Sanger dizileme metodu, Yeni Nesil Dizileme, Egzom dizileme, Shotgun Dizileme
Ders notları ve sunum
malzemeleri
6 Dizilemede birleştirme yöntemleri: De Bruijn çizgileri. Varolan algoritmalar/yazılımlar
Ders notları ve sunum
malzemeleri
7 Kısıtlama haritalama: Çift ve Kısmi Digest Sorunu
Ders notları ve sunum
malzemeleri
8 Gen ifadesine biyoinformatik yaklaşımlar
Ders notları ve sunum
malzemeleri
9 Protein katlanma problem
Ders notları ve sunum
malzemeleri
10 Ara sınav
Ders notları ve sunum
malzemeleri
11 Mikrodizin analizine giriş
Ders notları ve sunum
malzemeleri
12 Diferansiyel ekspresyon analizi, istatistik uygulamaları
Ders notları ve sunum
malzemeleri
13 GO terimi zenginleştirilmesi, mikrodizin verilerinin fonksiyonel araştırılması
Ders notları ve sunum
malzemeleri
14 Genel tekrar ve proje sunumları
Ders notları ve sunum
malzemeleri
KAYNAKLAR
146
Ders Kitabı Araştırma makaleleri; ders notları; sunumlar
Diğer Kaynaklar yoktur
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Sınav sonuçları Sonuç Panosuna asılmaktadır ve görmek isteyen öğrencilere sınav kağıdına veya raporuna bakma hakkı verilmektedir.
Ödevler
Dönemin ikinci yarısından itibaren öpencilere o haftaki konuya ilişkin güncel araştırma makalelerinden ödevler verilmektedir. Ayrıca dönem sonunda Trends in Genetics dergisinin reveiw makale formatına uygun bir sonuç raporu yazmaları beklenmektedir.
Sınavlar 1 ara sınav, öğrenci sunumları ve 1 Final.
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav - 25
Deney - -
Ödev - -
Proje 1 35
Final 1 40
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen, istatistik ve mühendislik bilgilerini uygulama becerisi. X
2 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci tasarlama becerisi.
X
3 Biyoteknoloji ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve bilişim
X
147
araçları kullanarak çözme becerisi.
4 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi.
X
5 Biyoteknoloji alanında etkin iletişim kurabilme ve kendini sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi.
X
6 Mesleki ahlak ve sosyal sorumluluk bilinci kazanmış, güncel konularda meslek etiğine uygun söz, beyan ve uygulamalarda bulunma becerisi.
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık.
8 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi.
X
9 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi.
X
10 Kendini global alanda ingilizce olarak yeterli seviyede yazılı ve sözlü olarak ifade becerisi.
X
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 3 42
Ara Sınav 1 10 10
Deney
Ödev
Proje 1 20 20
Final Sınavı 1 15 15
Toplam İş Yükü 129
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5.2
Dersin AKTS Kredisi 5
148
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat
Kredi AKTS
Doku Mühendisliğinde Yenilikler
GBE 472 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu Seçmeli
Dersin Koordinatörü
Prof.Dr.Gamze Torun Köse
Dersi Verenler Prof.Dr.Gamze Torun Köse
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı Öğrencilerin, doku mühendisliği konusunda bilgilerini arttırmayı
sağlamak.
Dersin İçeriği
Hücre ve Doku Kültürü sistemleri; temel kültür koşulları; hücre
kültürleri ve primer hücreler; kök hücresi izolasyonu ve kültürü;
hücrelerin matrisler üzerinde büyütülmesi ve devam ettirilmesi;
Materyallerin Özellikleri: Mekanik Özellikleri, Yüzey Özellikleri,
Yüzey Karakterizasyonu, Tıpta Kullanılan Materyaller: Polimerler,
Biyoemilebilir Materyaller, Metalik İmplant Materyaller, Seramikler
ve Hidrojeller, Doğal Materyaller, Biyomateryallere Karşı Konakçı
Reaksiyonu ve Değerlendirilmesi, Doku Mühendisliği
uygulamaları.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Hücre kültürünü kavrama 1, 4 1,2 A,D
2) Biyomalzeme çeşitlerini ve özelliklerini öğrenme 1, 4 1,2 A,D
3) Biyomalzemelerin vucutta yaratabileceği reaksiyonları ve bunların değerlendirmesini kavrayabilme
1, 4 1,2 A,D
4) Doku Mühendisliğini kavrama 1, 4 1,2 A,D
149
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1 Derse giriş ve Sunum konularının tanıtılması
Ders Kitabı
2
Sterilite, Lab güvenli kuralları, Hücre kültürü lab dizaynı,
Kültür ortamı içerikleri Ders Kitabı
3
Rutin hücre kültürü, Primer hücre kültürü, Hücre saklama
koşulları Ders Kitabı
4 Kök hücre
Ders Kitabı
5 Büyüme faktörleri
Ders Kitabı
6 Malzeme özellikleri
Ders Kitabı
7 Tıpta kullanılan malzemelerin sınıflandırması Ders Kitabı
8
Biyomalzemelerin vucutta yaratabileceği reaksiyonlar ve
değerlendirmesi
Ders Kitabı
9 Biyomalzemelerin biyolojik testi Ders Kitabı
10 Biyolojik ortamda biyomalzemelerin bozunması Ders Kitabı
11 Doku mühendisliği uygulamaları I Ders Kitabı
12 Doku mühendisliği uygulamaları II Ders Kitabı
13 Sunum Makale
14 Sunum Makale
KAYNAKLAR
Ders Kitabı
Tissue Engineering by Bernhard Palsson and Sangeeta Bhatia.,
Prentice Hall
Diğer Kaynaklar Biomaterials Science – Ratner, Hoffman, Schoen, Lemons
150
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları öğrencilere verilmektedir
Ödevler Proje sunum konuları ve hazırlık bilgileri öğrencilere verilmektedir
Sınavlar 1 Arasınav, 1 Sunum ve 1 Final verilmektedir
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav 1 30
Deney
Ödev
Proje 1 30
Final 1 40
Toplam 100
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
X
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
X
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak
151
karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 4 56
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 3 42
Ara Sınav 1 4 4
Deney
Ödev
Proje 1 20 20
Final Sınavı 1 4 4
Toplam İş Yükü 112
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5.04
Dersin AKTS Kredisi 5
152
DERS BİLGİLERİ
Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat
Kredi AKTS
Özel Konular: Biyoanalitik Teknikler Konusundaki Gelişmeler
GBE 482 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5
Ön Koşul Dersleri YOK
Dersin Dili İngilizce
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Türü Zorunlu Seçmeli
Dersin Koordinatörü
Prof. Dr. Mustafa Çulha
Dersi Verenler Prof. Dr. Mustafa Çulha
Dersin Yardımcıları YOK
STAJ YOK
Dersin Amacı
Bu ders öğrencinin yeleşik ve gelişmekte olan birçok
spektroskopik tekniğinbiyomedikal, biyomühendislik ve moleküler
biyoloji gibi biyoljik bilimlerde ve uygulamalarının öğrenmesini
amaçlamaktadır.
Dersin İçeriği
Nükleer manyetik rezonans, kütle spektroskopisi, X-Ray
kristolografi, UV/Vis, Floresans ve titreşimsel spektroskopinin
temelleri ve bu tekniklerin biyo-bilim ve uygulamalarda
kullanımları, Elektroanalitik ve biyoayrıştırma teknik ve yöntemleri.
Gelişmekte olan mikroakışkan ve fotoniks gibi teknikler.
Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1) Numune toplama, standardizasyon, kalibrasyon ve validasyonu açıklayabilme.
3, 6 1,2 A,C, D
2) Temel veri analizini hesaplamalarını yapabilme. 3, 6
1,2 A,C, D
3) moleküler soğurma ve floresan spektroskopisi, titreşimsel spektroskopi, kütle spektroskopisi, nükleer manyetik rezonans gibi teknikleri ve bu tekniklerin cihazlarının çalışma prensiplerini anlatabilme.
3, 6
1,2
A,C, D
4) yüksek performanslı sıvı kromatografisi, gaz kromatografisi, ve elektroforez yöntemleri ve çalışma temellerini açıklaya bilme..
3, 6
1,2 A,C, D
153
5) Kimyasal çözelti ve pH hesaplamalarını yapabilme. 3, 6
1,2 A,C, D
Öğretim Yöntemleri:
1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması
Ölçme Yöntemleri:
A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje
DERS İÇERİĞİ
Hafta Konular Çalışma
Malzemeleri
1
Spektrskopiye Giriş
Çeşitli kaynaklar
2 Biyobilimlerde Teknikler
Çeşitli
kaynaklar
3 Moleküler Teknikler: UV/Vis, Floresans, IR ve Raman
Çeşitli
kaynaklar
4 Dikraksiyon Teknikler: X-ray diffraction, Nötron ve Elektron Difraksiyonu
Çeşitli
kaynaklar
5 Biyoayrıştırma Teknikleri: LC, ve Elektroforez
Çeşitli
kaynaklar
6 1. Arasınav Çeşitli
kaynaklar
7 Biyofotoniks ve nanobiyofotoniks
Çeşitli
kaynaklar
8 Biyoanalizde mikroakışkanlar
Çeşitli
kaynaklar
9 Lab-on-a- -TAS)
Çeşitli
kaynaklar
10
Mikroskopik Teknikler: Taramalı Sonda Mikroskopları (SPM),
AFM, STM, NSOM
Çeşitli
kaynaklar
11
Mikroskopik Teknikler: Taramalı Sonda Mikroskopları (SPM),
AFM, STM, NSOM
Çeşitli
kaynaklar
12 Öğrenci sunumları
154
13 Öğrenci sunumları
14 Öğrenci sunumları
15 Öğrenci sunumları
16 Öğrenci sunumları
KAYNAKLAR
Ders Kitabı ilgili yayın, derleme ve notlar dönem içerisinde öğrenciye verilecektir.
Diğer Kaynaklar
MATERYAL PAYLAŞIMI
Dökümanlar Ders notları öğrencilere verilmektedir
Ödevler
Sınavlar 1 Arasınav, 1 Sunum ve 1 Final verilmektedir
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav ve Quizler 3 60
Deney
Ödev
Proje
Toplam 60
Final Sınavının Başarıya Oranı 40
Yıl içinin Başarıya Oranı 60
Toplam 100
DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri
DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI
155
No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma
2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi
3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi
X
4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi
5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi
6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi
X
7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık
8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi
9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 20 3 60
Ara Sınav 1 3 3
Deney
Ödev 2 10 20
Proje
Final Sınavı 1 3 3
Toplam İş Yükü 128
Toplam İş Yükü / 25 (s) 5.12
Dersin AKTS Kredisi 5
156
Dersler ile Program Öğrenme Çıktıları İlişkileri
Dersler PÇ1 PÇ2 PÇ3 PÇ4 PÇ5 PÇ6 PÇ7 PÇ8 PÇ9 PÇ10
Akademik İngilizce I 0 0 0 0 5 0 4 5 5 0
Biyoloji I 5 0 0 5 0 0 0 0 0 0
Genel Kimya I 5 0 0 0 0 5 5 0 0 0
Fizik I 5 5 3 0 5 0 3 0 3 3
Kalkülüs I 5 5 3 5 1 0 5 0 0 0
Akademik İngilizce I 0 0 0 0 5 0 4 5 5 0
Genel Kimya II 5 4 0 4 0 5 4 0 0 0
Genel Kimya Laboratuvar
5 0 0 5 5 5 5 5 3 0
Biyoloji II 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Kalkülüs II 5 5 3 5 1 0 5 0 0 0
Fizik II 5 0 3 4 5 1 3 1 3 3
Bilgisayarlı Hesaplamaya Giriş
5 0 0 3 0 0 0 0 4 0
Mikrobiyoloji 0 5 5 0 0 0 5 0 0 5
Hücre Biyolojisi 5 0 5 0 4 0 0 0 0 0
Org.Kim. & Biyomakromoleküllere Giriş
5 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Biyometri 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Klasik ve Moleküler Genetik
5 5 0 0 0 0 0 0 0 0
Klasik ve Moleküler Genetik Lab.
5 0 5 0 0 0 0 0 0 0
Analitik Kimya 5 0 0 0 5 0 0 0 0 0
Ekonomi 0 0 0 0 5 5 0 0 0 0
Diferansiyel Denklemler
5 5 0 0 0 0 0 0 0 0
Türk Dili I 0 0 0 0 0 0 3 4 5 0
Biyokimya I 5 0 0 5 0 0 0 0 0 0
Biyotermodinamik 5 5 5 5 5 5 1 0 3 5
Gen Mühendisliğinde Teknikler I
0 5 4 5 0 0 0 0 5 0
Biyotransport Olayları 5 0 0 5 2 0 0 0 0 2
Türk Dili II 0 0 0 0 0 0 3 4 5 0
Biyokimya II 5 5 5 0 0 0 0 0 0 0
Deneysel Genetik ve Biyomühendislik I: İlkeler
5 5 0 0 0 0 5 0 0 5
Gen Mühendisliğinde Teknikler II
0 5 5 5 0 5 0 5 5 5
Bitki Genetiği (RE) 5 0 5 5 0 0 0 0 0 5
İnsan Genetiği (RE) 0 0 4 4 0 0 5 0 0 5
Mühendislik Yönetimi 5 5 0 0 0 5 0 0 5 5
Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi I
0 0 0 0 5 0 0 0 5 0
Yaz Stajı 0 3 5 5 5 0 0 0 5 0
Moleküler Biyoloji I 5 0 0 0 0 0 0 4 5 0
Deneysel Genetik ve 5 5 0 5 0 0 5 0 0 0
157
Biyomühendislik II: Tasarım ve Uygulama
Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi II
0 0 0 0 5 0 0 0 5 0
Moleküler Biyoloji II 5 3 5 0 0 0 4 0 4 0
Mühendislik Projesi 0 5 5 5 5 5 5 0 5 5
Nörobiyoloji (RE) 0 0 0 0 5 0 0 0 5 0
Bitki Doku Kültürü Mühendisliği (RE)
0 5 0 0 0 0 5 0 3 5
Adli Teknolojiler (RE) 5 0 0 0 0 5 0 0 0 0
Protein Kimyası (RE) 5 0 3 0 0 0 0 0 5 3
Kanser Biyolojisi (RE) 0 5 0 0 5 3 2 0 3 3
Kök Hücre Biyolojisi (RE)
5 3 5 0 0 0 4 0 4 3
Hücre ve Doku Kültürü (RE)
5 0 0 5 0 5 0 5 0 5
Biyomalzemeler (RE) 5 0 0 5 0 0 0 0 0 0
Gen Terapisi (RE) 5 0 0 5 0 0 0 0 0 0
Genomik ve Proteomik (RE)
5 4 4 4 0 0 5 0 0 5
Biyoinformatiğe Giriş (RE)
5 4 3 4 5 0 0 5 5 3
Doku Mühendisliğinde Yenilikler (RE)
5 0 0 5 0 0 0 0 0 0
Özel Konular: Biyoanalitik teknikler konusundaki Gelişmeler (RE)
5 5 0 0 0 0 5 5 5 5
158
Alınacak Derece:
Yeditepe Üniversitesi Genetik ve Biyomühendislik Bölümü’nde eğitimlerini başarı ile
tamamlayan mezunlara, 240-AKTS lisans eğitim ve öğretimini tamamlayan öğrencilerin,
“Gen Mühendisi ve Biyomühendis” ünvanı verilmekte, bu diploma İngilizce ve Türkçe olarak
hazırlanmakta ve bu ünvana tanınan bütün yetkilerle birlikte alındığı diplomada
belirtilmektedir.
Kabul Koşulları:
Bölüme kayıt yaptırmak isteyen öğrenci, üniversitenin akademik ve yasal mevzuatı
çerçevesinde ÖSYM (Öğrenci Seçme ve Yerleştirme Merkezi) tarafından belirlenen süreçleri
tamamlamak / sınavları başarmış olmak zorundadır. Yurtiçi veya dışında eşdeğer programda
öğrenimine başlamış bir öğrenci yatay geçiş için başvuru yapabilir. Öğrencilerin kabulü
dönem başlamadan, her bir öğrencinin şartları ve başvuru yaptığı derece dikkate alınarak
incelenir ve özel olarak değerlendirilir. Üniversiteye giriş hakkında daha etraflı bilgi Kurum
Tanıtım Kataloğu`nda mevcuttur.
Üniversite tarafından onaylanmış ve bir anlaşma ile sınırları belirlenmiş öğrenci değişim
programları kapsamında yurtdışından gelen öğrenciler İngilizce olarak verilen dersleri
alabilirler. Öğrenci Türkçe dil bilgisi yeterliliğine sahipse Ders Planı`nda belirtilen herhangi bir
Türkçe derse de kayıt yaptırabilir.
Mezunların İstihdam Olanakları ve Üst Kademeye Geçiş: Genetik ve Biyomühendislik
bölümü mezunlarının, akademi, sanayi (ilaç, tarım, gıda, biyomedikal v.b.), klinik ve genetik
tıp ve tanı merkezleri, adli tıp, kamu kuruluşları ile uluslararası araştırma merkezleri ve
laboratuvarlarında iş bulabilmektedirler. Piyasada genetik klinikler, tüp bebek merkezleri ve
uluslararası biyoteknoloji ve biyomedikal şirketlerinin Türkiye temsilciliklerinde gen
mühendislerine ve biyomühendislerine yönelik yoğun bir talep bulunmaktadır.
Lisans eğitimini başarı ile tamamlayan adaylar kendi alanlarında veya ilgili alanlarda, ALES
sınavından geçerli not almaları ve yeterli düzeyde İngilizce dil bilgisine sahip olmaları
koşuluyla lisansüstü ve doktora programlarında öğrenim görebilirler. Genetik ve
Biyomühendislik Bölümü, Üniversitenin Fen Bilimleri Enstitüsü’ne bağlı olarak Biyoteknoloji
Yüksek Lisans Programı ve Doktora eğitimi vermektedir.
Mezuniyet Koşulları:
Lisans eğitim ve öğretimini tamamlayan öğrencilerin (240-AKTS) mezun olabilmeleri için
genel not ortalamasının en az 2.00 olması gereklidir. Mezuniyet genel not ortalaması 4.00
üzerinden hesaplanır; bu ortalama hesaplanırken alınan tüm dersler hesaba katılır.
Öğrencilerden genel not ortalaması 3.50 ya da üstü olanlar "yüksek onur”, 3.00 ile 3.49
arasında olanlar "onur” listesine alınırlar. Buna ek olarak öğrencilerin Genetik ve
Biyomühendislik bölümü tarafından öngörülen 20 günlük stajı tamamlama mecburiyetleri
vardır.
Türk Yüksek Öğretim kurumlarında önceki formal (örgün) öğrenmenin tanınması dikey, yatay
ve üniversite içindeki geçişler Yüksek Öğretim Kurulu'nun belirlemiş olduğu
"YÜKSEKÖĞRETİM KURUMLARINDA ÖNLİSANS VE LİSANS DÜZEYİNDEKİ
PROGRAMLAR ARASINDA GEÇİŞ, ÇİFT ANADAL, YAN DAL İLE KURUMLAR ARASI
159
KREDİ TRANSFERİ YAPILMASI ESASLARINA İLİŞKİN YÖNETMELİK" kapsamında
gerçekleştirilmektedir. Türkiye'de örgün eğitim kurumları dışında formal olmayan sertifikaya
dayalı veya tecrübeye dayalı (in-formal ve non-formal ) öğrenmenin tanınma süreci henüz
başlangıç aşamasındadır. Bu nedenle Yeditepe Üniversitesi'nin tüm programlarında önceki
öğrenmenin tanınması tam olarak başlatılmış değildir.
DERS KATEGORİ LİSTESİ
DESTEK DERSLERİ AKTS
CHEM 111 Genel Kimya I 6
CHEM 112 Kimya II 6
CHEM 113 Genel Kimya Lab. 5
MATH 131 Mühendisler için Analiz I 6
MATH 132 Mühendisler için Analiz II 6
MATH 241 Diferansiyel Denklemler 6
PHYS 101 Fizik I 6
PHYS 102 Fizik II 6
Toplam 47
TEMEL MESLEKİ DERSLER
CHEM 205 Org.Kim. & Biyomakromoleküllere Giriş 5
CHEM 215 Analitik Kimya 6
GBE 111 Biyoloji I 8
GBE 102 Biyoloji II 3
GBE 203 Mikrobiyoloji 7
GBE 205 Hücre Biyolojisi 6
GBE 222 Biyometri 6
GBE 301 Biyokimya I 7
GBE 302 Biyokimya II 9
GBE 321 Biyotermodinamik 5
GBE 403 Moleküler Biyoloji I 6
GBE 404 Moleküler Biyoloji II 5
Toplam 68
UZMANLIK ALAN DERSLERİ
GBE 212 Klasik ve Moleküler Genetik 6
GBE 216 Klasik ve Moleküler Genetik Lab 5
GBE 326 Deneysel Genetik ve Biyomühendislik I: İlkeler 6
GBE 341 Gen Mühendisliğinde Teknikler I 6
GBE 342 Gen Mühendisliğinde Teknikler II 8
GBE 361 Biyotransport Olayları 5
GBE 400 Summer Practice 1
GBE 415 Deneysel Genetik ve Biyomühendislik II: Tasarım ve Uygulama 6
GBE 451 Biyoproses Mühendisliği Teknikleri 6
GBE 492 Mühendislik Projesi 8
GBE 324 Nörobiyoloji (RE) 5
GBE 356 Bitki Genetiği (RE) 5
GBE 357 İnsan Genetiği (RE) 5
GBE 373 Bitki Doku Kültür Mühendisliği 5
GBE 376 Adli Teknolojiler (RE) 5
GBE 405 Protein Kimyası (RE) 5
GBE 414 Kanser Biyolojisi (RE) 5
GBE 431 Kök Hücre Biyolojisi (RE) 5
GBE 432 Hücre ve Doku Kültürü (RE) 5
GBE 433 Biyomalzemeler (RE) 5
GBE 435 Gen Terapisi (RE) 5
GBE 442 Genomik ve Proteomik (RE) 5
GBE 444 Biyoinformatiğe Giriş (RE) 5
GBE 472 Doku Mühendisliğinde Yenilikler (RE) 5
GBE 482 Özel Konular: Biyoanalitik teknikler konusundaki Gelişmeler (RE) 5
Toplam 132
160
BEŞERİ, İLETİŞİM VE YÖNETİM BECERİLERİ DERSLERİ
AFE 131 Akademik İngilizce I 4
AFE 132 Akademik İngilizce II 4
ECON 294 Ekonomi 4
ES 117 Bilgisayarlı Hesaplamaya Giriş 5
ES 301 Mühendislik Yönetimi 4
HUM 103 Uygarlık Tarihi 3
TKL 201 Türk Dili I 2
TKL 202 Türk Dili II 2
HTR 301 Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi I 2
HTR 302 Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi II 2
Toplam 32
BÜTÜN DERSLERİN AKTS TOPLAMI 279
DEĞERLENDİRME VE DERECELEME
Puan Başarı Notu Katsayısı
90-100 AA 4,00 85-89 BA 3,50 80-84 BB 3,00 75-79 CB 2,50 70-74 CC 2,00 60-69 DC 1,50 50-59 DD 1,00 49 and below F 0,00 Diğer Notlar: I Eksik (Incomplete) P Geçer (Pass) X Proje ve Tezler İçin Devam Ediyor (In progress) T Transfer (Transfer) W Dersten Çekilme (Withdrawal) NC Kredisiz (Non-credit) ND Diplomaya Yönelik Olmayan (Nondegree) R Tekrar (Repeat) L İzinli (Leave) ADD Ders Ekleme DR Ders Bırakma AU Dinleyici (Audit) I Notu, geçerli bir mazeret nedeniyle dersin gereği çalışmaları tamamlayamayan
öğrencilere verilir. (I) notunun gerektirdiği eksikliklerin en geç bir sonraki normal dönemin son ders ekleme tarihine kadar tamamlanması gerekir. Eksiklik giderildiğinde öğrenci hakettiği ders notunu alır; başarısızlık halinde ise I, FF’ye dönüşür.
P Notu, not ortalamalarına katılmayan derslerden geçen öğrencilere verilir. X Notu, proje, tez ve benzeri çalışmaları sürdürmekte olan öğrencilere verilir. R Notu, dersin tekrarlandığını gösterir. NC Notu, kredisiz olarak alınan dersler için kullanılır. ND Notu, Yeditepe Üniversitesinden diploma almaya yönelik olmayan ve kredili veya
kredisiz olarak alınan dersler için kullanılır. L Notu, Yönetmelik hükümleri uyarınca izinli olan öğrenciler için kullanılır. T Notu, başka bir bölüm, fakülte ya da üniversiteden transfer olup ilgili yönetim
kurulunca intibakı onaylanan ve not ortalamasına katılmayan derslere veya ÖSS sınavı sonucu ile Üniversiteye yeniden kaydolan öğrencilere, evvelce almış oldukları ve denkliği bölümün önerisiyle ilgili yönetim kurulunca tanınan dersler için verilir.
161
W Notu,son ders bırakma tarihinden sonra minimum ders yükü altında düşmemek koşuluyla, her yıl akademik takvimde belirlenen süre içinde, danışmanın ve öğretim elemanının görüşü alınarak ilgili yönetim kurulu kararıyla bırakılmasına izin verilen derslere verilir.
İletişim Bilgileri :
BÖLÜM BAŞKANI:
Prof. Dr. FİKRETTİN ŞAHİN
Dahili: 1619 fsahin@yeditepe.edu.tr
AKTS KOORDİNATÖRÜ
Yrd. Doç. Dr. HÜSEYİN ÇİMEN
Dahili: 3259 huseyin.cimen@yeditepe.edu.tr
BÖLÜM SEKRETERİ: DİLEK SEVİNÇ
Tel: +90 216 578 0619, Faks: +90 216 578 0829
Adres: Yeditepe Üniversitesi, 26 Ağustos Yerleşimi, Mühendislik Fakültesi, Genetik ve
Biyomühendislik Bölümü, Kayışdağı, 34755, ATAŞEHİR, İSTANBUL, TURKİYE
162
ÖĞRENCİLERE UYGULANAN ANKETLER Program çıktılarına ulaşma yöntemleri
Program Çıktılarına erişimin ölçülmesinde aşağıda belirtilen yöntemlerin kullanılması
öngörülmüştür.
A. Öğrenciler
1. Ders AKTS işyükü formu
2. Ders Çıktısı Değerlendirme Anketi
3. Ders Değerlendirme formu
B. Stajyer değerlendirme raporu C. Mezun değerlendirme anketi
A. Öğrenciler
1. Ders AKTS işyükü formu TARİH / DATE:……………………………DERSİ AKTS İŞ YÜKÜ FORMU/………………………COURSE ECTS WORKLOAD FORM
1. Ders haftada kaç saat yapıldı?
Bu derse devam yüzdenizi belirtiniz.
…………………… saat
% 100 %90 %80 %70 % %60 %50 %40 %30 %20 %10
2. Bu dersin sınıf içi ders saatleri dışında, dersle ilgili etkinliklerini (quiz, ödev, proje, kütüphane çalışması, laboratuvar, ara sınav ve dönem sonu sınavı gibi) yerine getirmek için haftada ortalama kaç saat ayırıyorsunuz?
Ders saatleri dışında ders için ayrılan haftalık ortalama süre: …………………… saat
3. Bu ders için ön hazırlık ( dersten önce makale-kitap-dergi okuma, kütüphane- internet araştırması vb... genel ders hazırlığı çalışmaları) yaptınız mı?
EVET HAYIR
EVET ise haftalık ön hazırlık saati: …………………… saat
4. Bu ders kapsamında ödev hazırladınız mı ?
(Ders saatleri dışında gerçekleştirilen ve sonuçları dersin öğretim görevlisine sunulan örnek olay incelemeleri/case study, problem/soru çözme çalışmaları vb)
EVET HAYIR
EVET ise hazırlanan ödev sayısı: …………………… adet
Her ödevi oluşturmak için harcadığınız ortalama süre: …………………… saat
(Kütüphane çalışması, grup çalışması, araştırma yapmak, internet taraması vb)
5. Bu ders kapsamında sunum/seminer hazırladınız mı?
EVET HAYIR
EVET ise Hazırlanan sunum/seminer sayısı: …………………… adet
Her sunumu/semineri oluşturmak için harcadığınız ortalama süre: ………… saat
(Kütüphane çalışması, grup çalışması, araştırma yapmak, internet taraması vb)
6. Bu ders kapsamında proje veya çizim hazırladınız mı ?
EVET HAYIR
EVET ise hazırladığınız proje/çizim sayısı: ……………………
Her projeyi veya çizimi hazırlamak için harcadığınız ortalama süre: …………………… saat
(Kütüphane çalışması, grup çalışması, araştırma yapmak, internet taraması vb)
7. Bu derste küçük sınava (quiz) girdiniz mi?
EVET HAYIR
EVET ise katıldığınız ara sınav (quiz) sayısı: ……………………
Her quize hazırlanmak için harcadığınız ortalama süre: …………………… saat
8. Bu derste ara sınava (vize) girdiniz mi? EVET HAYIR
EVET ise katıldığınız ara sınav sayısı: ……………………
Her ara sınava hazırlanmak için harcadığınız ortalama süre: …………………… saat
163
9. Bu ders kapsamında laboratuar çalışması , sanal mahkeme ya da stüdyo çalışması gibi uygulama çalışmalarına katıldınız mı ?
EVET HAYIR
EVET ise katıldığınız uygulama çalışması sayısı: ……………………
Her uygulama çalışması için harcadığınız ortalama süre: …………………… saat
10. Bu ders kapsamında arazi ve/veya saha çalışmasına, teknik gezilere ya da inceleme gezilerine katıldınız mı ?
EVET HAYIR
EVET ise katıldığınız arazi/ saha/ teknik/ inceleme gezisi veya çalışması sayısı:…………………
Her çalışma/gezi için harcadığınız ortalama süre: …………………… saat
11. Bu derste yarıyıl sonu (final) sınavına girdiniz mi?
(Bu dersten final sınavı yerine proje, rapor, çizim vb. çalışmalar da yapmış olabilirsiniz)
EVET HAYIR
EVET ise yarıyılı sonu sınavına veya final sınavı için sunduğunuz çalışmaya hazırlık için harcadığınız
ortalama süre: …………………… saat
12. Yukarda belirtilmeyen, bu dersle ilgili eklemek istediğiniz farklı bir çalışma, uygulama veya faaliyet var mı?
EVET HAYIR
EVET ise hangi çalışma, uygulama veya
faaliyetler:.........................................................................................................................
Bu faaliyet veya çalışma için bir dönemde ayırdığınız toplam süre: …………………………..saat
164
2. Ders Çıktısı Değerlendirme Anketi
165
3. Ders Değerlendirme formu
B. Stajyer değerlendirme raporu
34 öğrenci katılmıştır. TOTAL (2009) TOTAL (2011)
166
Genetik ve biyomühendislik bilgilerini uygulama
yeteneği kazandım. 3,5 3,4
Deney tasarlama ve yapabilme, deney sonuçlarını
analiz etme ve de yorumlama yeteneği kazandım. 3,7 3,8
Mesleki ve etik sorumluluk bilinci kazandım. 3,5 3,8
Disiplinler arası takımlarda çalışabilme yeteneği
kazandım. 3,3 3,5
Problemlerini tanımlama ve çözme yeteneği
kazandım. 3,5 3,5
Etkin iletişim kurma yeteneği kazandım. 3,6 3,6
Şirkette/Enstitüde var olan laboratuvar
olanaklarından memnunum. 3,3 3,7
Sorumluluk almayı öğrendim. 3,7 3,6
İnisiyatif almayı öğrendim. 3,6 3,5
Edindiğim tecrübe ile planlı çalışma ve zamanı iyi
kullanabilme becerileri sağladı. 3,5 3,5
Yapmış olduğum stajın faydalı olduğunu
düşünüyorum. 3,7 3,8
Takım içerisinde çalışmayı öğrendim 3,6 3,6
Amirlerim ile gereksinim duyduğum etkileşimi
gerçekleştirdim. 3,7 3,9
Genel değerlendirme 3,6 3,6
Derecelendirme: Çok az (1), orta (2), iyi(3), çok iyi
(4) Genel Genel
167
168
169
C. Mezunlar
Derecelendirme: İlgili Değil (İD), Çok az (1), Az (2), orta (3), iyi (4), çok iyi (5)
Genel Eğitim Değerlendirmesi Notlar
Verilen eğitimin İngilizce olmasının faydasını gördüm. 4,8
Yapmış olduğum stajın şimdiki kariyerime olumlu etkisi olduğunu düşünüyorum. 4,5
Okurken yarı zamanlı olarak bir mühendislik işinde çalışmamın şimdiki
kariyerime olumlu etkisi olduğunu düşünüyorum. (Bu grup mezunumuzdan hiç
biri okurken bir işte çalışmadığından, bu soruya hiçbiri cevap vermemiştir). ID
Okurken herhangi bir profesyonel ya da diğer kuruluşun aktif bir üyesi olmamın
şimdiki kariyerime olumlu etkisi olduğunu düşünüyorum. 4,5
Yeditepe Üniversitesi’nden aldığım yüksek lisans derecesinin şimdiki kariyerime
olumlu etkisi olduğunu düşünüyorum. 4,3
Genel Değerlendirme 4,5
b) Eğitsel Altyapının Değerlendirmesi Notlar
Öğretim üyelerinin yeterliliği 4,3
Araştırma görevlilerinin yeterliliği 4,1
Öğrenci-öğretim üyesi iletişiminin bölüm tarafından desteklenmesi 4,3
Aktif (katılımlı) öğrenmenin bölüm tarafından desteklenmesi 4,2
Zaman yönetimi ile ilgili öğretim üyelerinin vurgusu 4,2
Kütüphanenin yeterliliği 3,9
Laboratuvarların yeterliliği 4,2
Bilgisayarların kalitesi ve yeterliliği 4,0
Akademik danışmanın etkinliği ve ulaşılabilirliliği 4,2
Genel Değerlendirme 4,2
Eğitim Amaçlarının Değerlendirilmesi Notlar
Temel bilgi donatımı 4,6
Tasarım yapma ve gerçekleme 4,6
Problem çözebilme 4,6
Güçlü donanım ve yazılım altyapısı 4,6
Laboratuvar kullanma 4,6
Grup çalışması yapabilme 4,6
Yaratıcı olabilme 4,6
Girişimci ruha sahip olabilme 4,5
Sorumluluk sahibi olabilme 4,6
Özgüven sahibi olabilme 4,5
Mesleki ve kişisel gelişimini sürdürebilme 4,5
Etkili iletişim kurabilme 4,5
Rekabet edebilme 4,5
Etik ilkelere bağlılık 4,5
Çevre bilincine bağlılık 4,5
Yazılı ve sözlü sunumda başarı 4,5
Alanında rekabet edebilme 4,4
Bilgisayar ve yazılım araçlarıyla hesapsal yöntemleri uygulama 4,4
Yaratıcı, disiplinlerarası, bağımsız araştırma ve geliştirme yapabilme 4,4
Ulusal ve uluslararası yüksek lisans programlarına girebilme 4,4
170
Genel Değerlendirme 4,5
YENİ MEZUN Değerlendirme Tablosu Notlar
Matematik, Fen ve Mühendislik bilgilerini uygulama yeteneği kazandım. 4,0
Deney (ölçme, araştırma düzeneği vs.) tasarlama ve yapabilme, deney sonuçlarını
analiz etme ve de yorumlama yeteneği kazandım. 4,5
Belirli bir alandaki gereksinimleri karşılayabilecek sistem veya süreç (proses)
tasarlayabilme yeteneği kazandım. 4,5
Disiplinler arası takımlarda çalışabilme yeteneği kazandım. 4,1
Mühendislik problemlerini tanımlama ve çözme yeteneği kazandım. 4,0
Mesleki ve etik sorumluluk bilinci kazandım. 4,1
Etkin iletişim kurma yeteneği kazandım. 4,4
Mühendislik çözümlerininin toplumsal yaşamdaki önemini anlamamı sağlayan
geniş kapsamlı bir eğitim aldım. 4,0
Yaşam boyu öğrenme bilinci ve bu bilinci sürdürme yeteneği kazandım. 4,0
Çağdaş mesleki konular hakkında bilgi sahibi oldum. 4,2
Mühendislik uygulamaları için gereksinim duyulan teknik ve araçları
kullanabilme yeteneği kazandım. 4,2
Aldığım eğitimin kalitesinden memnunum. 4,1
Eğitimin gerçekleştirildiği dersliklerden ortamdan memnunum. 4,1
Bana sunulan laboratuvar olanaklarından memnunum. 4,6
Mezuniyet sonrasında, mesleki açıdan, isteklerimi gerçekleştirebileceğime
inanıyorum. 4,1
Aldığım eğitim planlı çalışma ve zamanı iyi kullanabilme becerileri sağladı. 4,2
Öğretim üyeleri ile gereksinim duyduğum etkileşimi gerçekleştirdim. 4,3
Genel olarak Bölümümden memnunum. 4,5
Yapmış olduğum stajın faydalı olduğunu düşünüyorum. 4,6
Yapmış olduğum mühendislik projesinin faydalı olduğunu düşünüyorum. 4,5
Yapmış olduğum Çift Anadal Programından memnunum.
(sadece 2 öğrenci cevaplamıştır) ID
Yapmış olduğum Yandal Programından memnunum. ID
Genel olarak Mühendislik ve Mimarlık Fakültesi Dekanlığının verdiği hizmetten
memnunum. 4,1
Verilen eğitimin İngilizce olmasından memnunum. 4,6
Üniversitedeki sosyal, sportif ve kültürel olanaklardan memnunum. 4,5
Üniversitedeki bilgisayar olanaklarından memnunum. 4,4
Üniversitedeki kütüphane ve veritabanı olanaklarından memnunum. 4,5
Üniversitedeki yemek olanaklarından memnunum. 3,2
Üniversitedeki servis (ulaşım) olanaklarından memnunum.
(sadece 8 öğrenci cevaplamıştır) 4,5
171
Üniversitedeki yurt olanaklarından memnunum.
(sadece 9 öğrenci cevaplamıştır) 4,1
Üniversitedeki arkadaşlık ortamından memnunum. 4,4
Genel olarak Yeditepe Üniversitesi Rektörlüğü Öğrenci İşlerinin verdiği
hizmetten memnunum. 4,2
Genel Değerlendirme 4,3
172
173
174
175
176
177
178
top related