analisis faktor resiko infeksi escherichia coli o157:h7 ... awal.pdfamin, s.pd, m.pd dan andi batari...
TRANSCRIPT
ANALISIS FAKTOR RESIKO INFEKSI Escherichia coli O157:H7
PADA SAPI DI KECAMATAN PETANG KABUPATEN BADUNG
SKRIPSI
Diajukan untuk Melengkapi Tugas-Tugas dan Memenuhi Persyaratan untuk
Mencapai Gelar Sarjana Kedokteran Hewan
Oleh
Andi Isma Lestari Amin
NIM 1009005071
BAB I
FAKULTAS KEDOKTERAN HEWAN
UNIVERSITAS UDAYANA
DENPASAR
2014
i
ANALISIS FAKTOR RESIKO PENYEBARAN Escherichia coli O157:H7
PADA SAPI DI KECAMATAN PETANG KABUPATEN BADUNG
SKRIPSI
Diajukan untuk Melengkapi Tugas-Tugas dan Memenuhi Persyaratan untuk
Mencapai Gelar Sarjana Kedokteran Hewan
Diajukan oleh
Andi Isma Lestari Amin
NIM 1009005071
Menyetujui/Mengesahkan
Pembimbing I, Pembimbing II,
Dr. drh. I Wayan Suardana, M.Si drh. Kadek Karang Agustina, SKH, M.P
NIP. 19700122 199512 1 001 NIP. 19840804 200812 1 001
DEKAN FAKULTAS KEDOKTERAN HEWAN
UNIVERSITAS UDAYANA
Dr. drh. Nyoman Adi Suratma, M.P
NIP. 19600305 198703 1 001
Tanggal Lulus :
ii
Setelah mempelajari dan menguji dengan sungguh – sungguh kami
berpendapat bahwa tulisan ini baik ruang lingkup maupun kualitasnya dapat
diajukan sebagai skripsi untuk memperoleh gelar Sarjana Kedokteran Hewan.
Ditetapkan di Denpasar, tanggal
Panitia penguji
Dr. drh. I Wayan Suardana. M.Si
Ketua
drh. Kadek Karang Agustina, SKH, M.P dr. Made Agus Hendrayana, M.Ked
Sekretaris Anggota
drh. Tjokorda Sari Nindhia, SKH, M.P Dr. drh. Hapsari Mahatmi, M.P
Anggota Anggota
i
RIWAYAT HIDUP
Penulis, Andi Isma Lestari Amin, dilahirkan di Tanahberu, Kabupaten
Bulukumba Sulawesi Selatan pada tanggal 22 September 1990. Penulis
merupakan anak kedua dari tiga bersaudara dari pasangan Andi Muhammad
Amin, S.Pd, M.Pd dan Andi Batari Toja, S.Pd.
Penulis menempuh Sekolah Dasar (SD) di Sekolah Dasar Negeri 155 Center
Tanahberu dan lulus pada tahun 2003, kemudian lulus dari bangku Sekolah
Menengah Pertama (SMP) di Sekolah Menengah Pertama Negeri 2 Kota
Bulukumba pada tahun 2006, dan menamatkan Sekolah Menengah Atas (SMA) di
Sekolah Menengah Atas Negeri 2 Kota Bulukumba pada tahun 2009. Penulis
resmi terdaftar sebagai mahasiswa Kedokteran Hewan Universitas Udayana pada
tahun 2010 melalui jalur Seleksi Nasional Masuk Perguruan Tinggi Negeri
(SNMPTN).
Selama berada di Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana, penulis
aktif menjadi Pengurus Minat dan Profesi (Minpro) “SULUH” pada periode
kepengurusan 2011-2013 dan aktif menjadi Pengurus BEM Fakultas Kedokteran
Hewan Universitas Udayana tahun 2012-2014.
Dalam rangka menyelesaikan tugas akhir dan untuk memenuhi salah satu
persyaratan untuk mencapai gelar Sarjana Kedokteran Hewan penulis melakukan
penelitian dengan judul “Analisis Faktor Resiko Infeksi Escherichia coli
O157:H7 Pada Sapi di Kecamatan Petang Kabupaten Badung”.
ii
ABSTRAK
Tujuan penelitian ini untuk mengetahui faktor resiko yang berperan dalam
infeksi agen E. coli O157:H7 dan mengetahui asosiasi diantara faktor-faktor
resiko terhadap infeksi E. coli O157:H7 pada ternak sapi. Sampel yang
dipergunakan adalah sebanyak 58 sampel feses sapi yang dilengkapi dengan data
epidemiologi. Sampel berasal dari tujuh desa di Kecamatan Petang Kabupaten
Badung. Tahapan isolasi E. coli dilakukan dengan menumbuhkan bakteri pada
media eosin methylene blue agar (EMBA). Selanjutnya dilakukan pewarnaan
Gram untuk mengetahui bentuk dan warna dari E. coli. Untuk membedakan
bakteri fecal coli dan non fecal coli maka dilakukan identifikasi isolat dengan uji
indol, methyl red, voges-proskauer dan simon citrate (IMVIC). Selanjutnya untuk
mengkonfirmasi E. coli O157 maka isolat ditumbuhkan pada media sorbitol
macConkey agar (SMAC) yang dilanjutkan dengan uji aglutinasi latek O157.
Tahapan akhir yang dilakukan untuk memastikan E. coli O157 tersebut adalah E.
coli O157:H7 maka diuji dengan uji antiserum H7. Hasil analisis data
epidemiologi dengan Odds ratio menunjukkan bahwa sapi jenis kelamin jantan
memiliki nilai Odds ratio 4,1 yang berarti memiliki resiko menyebarkan E. coli
O157:H7 4,1 kali lebih besar dibandingkan dengan sapi yang berjenis kelamin
betina. Selain itu, sumber air minum ternak yang berasal dari non PAM memiliki
nilai Odds ratio 2,4 yang berarti 2,4 kali beresiko menyebarkan E. coli O157:H7
dibandingkan dengan air minum yang bersumber dari PAM. Namun, setelah
dilakukan uji Chi square belum ditemukan adanya signifikansi yang berpengaruh
nyata (P>0,05) dari asosiasi diantara faktor- faktor resiko tersebut.
Kata kunci : E. coli O157:H7, VTEC, Faktor resiko, Sapi, Petang
iii
ABSTRACT
The purpose of the research are to find out the risk factors that take part in
the infection of E. coli O157:H7 agent and also the association between the risk
factors toward the infection of E. coli O157:H7. The samples that are used in this
research are the samples of cattle feces and completed by the epidemiologic data.
The samples comes from seven villages in Petang subdistrict, Badung regency.
The isolation stages of E. coli are proceeded by growing the bacteria on eosin
methylene blue agar (EMBA) media. Then continued with the Gram coloring in
order to identifythe sahpe and the color of E. coli. In oreder to differentiate fecal
coli bacteria with non fecal coli, isolates identification with indole test, methyl
red, voges-proskauer and simon citrrate (IMVIC) are needed. Next stage is to
confirm the E. coli O157 by growing the isolates on sorbitol macConkey agar
(SMAC) media nad continued by latex agglutination test of E. coli O157.the last
stage is in order to ensure the E. coli O157 in needed E. coli O157:H7, then the
antiserum H7 test is needed. The result from the epidemiologic data analysis with
Odds ratio shows that the male cattle possess the Odds ratio of 4,1 which means
there are 4,1 times more E. coli O157:H7 transmit risk than female cattle. More
over, drinking water source for cattle that comes from non PAM source has odds
ratio of 2,4, which means that there are 2,4 times more E. coli O157:H7 transmit
risk than the drinking water from PAM. However, after Chi square test had been
carried out, there is still no risk factors yet that has significant real impact
(P>0,05) from the association among those risk factors.
Keywords : E. coli O157:H7, VTEC, Risk factor, Cattle, Petang
iv
UCAPAN TERIMA KASIH
Puji syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT, Tuhan Yang Maha Esa,
berkat rahmat dan karunia-Nya penelitian dan penulisan skripsi yang berjudul
“Analisis Faktor Resiko Infeksi Escherichia coli O157:H7 Pada Sapi di
Kecamatan Petang Kabupaten Badung” dapat terselesaikan. Skripsi ini ditulis
sebagai salah satu persyaratan untuk mencapai gelar Sarjana Kedokteran Hewan
pada Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana.
Pada kesempatan ini penulis menyampaikan ucapan terima kasih dan
penghargaan yang setinggi-tingginya kepada :
1. Bapak Dr. drh. Nyoman Adi Suratma, M.P, selaku Dekan Fakultas
Kedokteran Hewan Universitas Udayana.
2. Bapak Dr. drh. I Wayan Suardana, M.Si selaku pembimbing I yang telah
banyak membimbing saya dan atas keikutsertaan saya dalam penelitian
kerjasama Kemitraan Penelitian dan Pengembangan Pertanian Nasional
(KP3N) yang didanai oleh Badan Pengembangan Pertanian Kementerian
Pertanian 2014.
3. Bapak drh. Kadek Karang Agustina, SKH, M.P selaku pembimbing II yang
dengan penuh kebesaran hati telah meluangkan waktu dan pikiran untuk
membimbing penulis dalam penulisan skripsi sehingga skripsi ini dapat
terselesaikan dengan baik.
4. Para dosen penguji Bapak dr. Made Agus Hendrayana, M.Ked, Ibu drh.
Tjokorda Sari Nindhia, SKH, M.P, dan Ibu Dr. Drh. Hapsari Mahatmi, M.P,
atas kesediaannya menjadi penguji skripsi dan telah memberikan saran dan
kritik yang sangat baik dan membangun dalam rangka perbaikan skripsi ini.
5. Bapak drh. I Gusti Ketut Suarjana, M.P selaku pembimbing akademik yang
telah membimbing penulis selama mengikuti perkuliahan di Fakultas
Kedokteran Hewan Universitas Udayana.
6. Bapak dan Ibu dosen Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana yang
telah mendidik dan membimbing penulis selama mengikuti masa perkuliahan.
v
7. Ibu Ni Wayan Nursini, S.Tp, M.P staf Laboratorium Biosains dan
Bioteknologi Bukit Jimbaran yang telah membantu dalam penelitian saya.
8. Kedua orang tua tercinta, Ibunda Andi Batari Toja S.Pd dan Ayahanda Andi
Muhammad Amin, S.Pd, M.Pd, yang tak henti-hentinya memanjatkan doa
dan senantiasa memberikan nasehat dan dukungan moril maupun materi, serta
kakak dan adik ku tercinta, Andi Primi Lestari dan Andi Nur Ilmi Tenri Dio
serta Andi Dhadan Mirdan yang selalu menjadi penyemangat dan inspirasiku
untuk maju.
9. Ruwaidah, Natazha Priski Deanasthi, Tri Suci Galingging, Ratna
Bayuningsih, Sari Sartini, Yunita Sri Hastuti, Wahyu Hananto serta teman-
teman seperjuangan angkatan 2010, yang tidak dapat penulis sebutkan satu
persatu. Terima kasih atas berbagai bantuan dan kerjasamanya.
10. Venny Johan, drh. Rasdiyanah, dan drh. Adriyani Ris serta semua anggota
keluarga besar IKAMI (Ikatan Mahasiswa/Pelajar Indonesia) Sulsel Cab. Bali
yang telah menjadi keluarga baru selama penulis tinggal di Bali.
Penulis menyadari skripsi ini masih jauh dari sempurna dan untuk itu segala
kritik dan saran penulis harapkan demi sempurnanya skripsi ini. Sebagai akhir
kata penulis berharap skripsi ini dapat bermanfaat bagi kita semua.
Denpasar, Mei 2014
P e n u l i s
vi
DAFTAR ISI
Halaman
RIWAYAT HIDUP .................................................................................. i
ABSTRAK ................................................................................................ ii
ABSTRACT .............................................................................................. iii
UCAPAN TERIMA KASIH ................................................................... iv
DAFTAR ISI ............................................................................................. vi
DAFTAR TABEL .................................................................................... viii
DAFTAR GAMBAR ................................................................................ ix
DAFTAR LAMPIRAN ............................................................................ x
BAB I PENDAHULUAN ......................................................................... 1
1.1 Latar Belakang ........................................................................... 1
1.2 Rumusan Masalah ...................................................................... 4
1.3 Tujuan Penelitian ........................................................................ 4
1.4 Manfaat Penelitian ...................................................................... 5
1.5 Kerangka Konsep ....................................................................... 5
1.6 Hipotesis Penelitian .................................................................... 8
BAB II TINJAUAN PUSTAKA .............................................................. 9
2.1 Escherichia coli ......................................................................... 9
2.2 Verotipe Escherichia coli ........................................................... 11
2.3 Escherichia coli O157:H7 .......................................................... 14
2.3.1 Penularan Escherichia coli O157:H7 ............................... 17
2.3.2 Faktor Resiko Infeksi Escherichia coli O157:H7............. 19
2.4 Kondisi Geografis Kecamatan Petang ....................................... 22
BAB III MATERI DAN METODE ......................................................... 24
3.1 Bahan Penelitian ......................................................................... 24
3.2 Alat Penelitian ............................................................................ 24
3.3 Cara Pengumpulan Data Epidemiologi ...................................... 25
3.4 Prosedur Pengambilan Sampel Feses ......................................... 26
3.5 Isolasi dan Identifikasi Escherichia coli O157:H7 .................... 27
3.6 Variabel Penelitian .................................................................... 31
3.7 Analisis Data ............................................................................. 31
3.8 Lokasi Dan Waktu Penelitian .................................................... 32
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN .................................................. 33
4.1 Isolasi dan Identifikasi Escherichia coli O157:H7 ..................... 33
4.2 Analisis Faktor Resiko Infeksi Escherichia coli O157:H7 ........ 35
4.3 Pengujian Hipotesis ................................................................... 42
vii
BAB V PENUTUP ..................................................................................... 43
5.1 Kesimpulan ................................................................................ 43
5.2 Saran ........................................................................................... 43
DAFTAR PUSTAKA ............................................................................... 44
LAMPIRAN .............................................................................................. 49
viii
DAFTAR TABEL
Tabel Halaman
1. Hasil Isolasi E. coli dan Identifikasi E. coli O157:H7 di Kecamatan
Petang Kabupaten Badung ................................................................. 34
2. Deskripsi Data Hasil Analisis Faktor-faktor yang Berpengaruh
Terhadap Infeksi E. coli O157:H7 pada Sapi di Kecamatan Petang .. 35
3. Hasil Penghitungan Chi-square, P value dan Odds ratio Faktor
yang Berpengaruh Terhadap Infeksi E. coli O157:H7 ....................... 37
ix
DAFTAR GAMBAR
Gambar Halaman
1. Wilayah Kecamatan Petang .............................................................. 3
2. Bagan Kerangka Konsep E. coli O157:H7 ........................................ 6
3. Bentuk Bakteri Escherichia coli pada Mikroskop Elektron ............... 10
4. Transmisi Infeksi E. coli O157:H7 dari Ternak ke Manusia ............. 18
5. Bakteri Escherichia coli yang Tumbuh Pada Media EMBA ............. 28
6. Kondisi Sapi pada Beberapa Tempat Pemeliharaan .......................... 36
x
DAFTAR LAMPIRAN
Lampiran Halaman
1. Kuisioner Penelitian .......................................................................... 49
2. Data Hasil Isolasi dan Identifikasi E. coli O157:H7 di Kecamatan
Petang Kabupaten Badung ................................................................. 50
3. Data Hasil Uji Chi square dan Uji Odds ratio ................................... 52
4. Foto Hasil Uji Isolasi dan Identifikasi E. coli O157H7 ..................... 61