anÁlisis filogenÉtico del gÉnero psychotria l. (rubiaceae)
DESCRIPTION
De acuerdo al APG (Angiosperm Phylogenic Group), Rubiaceae es el grupo hermano del resto de familias de Gentianales y se distingue por la presencia de ovario ínfero y estipulas interpeciolares. Anteriormente la Familia estaba en el Orden Rubiales dentro del S. Clasificación de Cronquist.TRANSCRIPT
ANÁLISIS FILOGENÉTICO DEL GÉNERO Psychotria L.
(Rubiaceae)
Jorge Caranqui, Luis Espinoza, Edison Lomas, Ángeles Simbaña
INTRODUCCIÓN
Familia Rubiaceae:
Origen etimológico:
Rubia L. latín “ruber”= “rojo” refiere al coloranterojo que se extrae de la especie asiática Rubiatinctorum.
Presenta hierbas, arbustos o árboles uocasionalmente trepadoras, no presentan látex,si presentan iridoides, alcaloides y resinas.
POSICIÓN FILOGENÉTICA
De acuerdo al APG (Angiosperm PhylogenicGroup), Rubiaceae es el grupo hermano delresto de familias de Gentianales y se distinguepor la presencia de ovario ínfero y estipulasinterpeciolares.
Anteriormente la Familia estaba en el OrdenRubiales dentro del S. Clasificación de Cronquist.
ORDEN GENTIANALES
DISTRIBUCIÓN GEOGRÁFICA
Trópicos, Subtrópicos y en las Zonas templadas.
10.000 spp. y 500-700 (Taylor 2001b)
Ecuador: 499 spp. y 78 géneros (Taylor 1999)se distribuyen desde las tierras bajas, Bosquesmontanos y los Páramos.
PROBLEMA
Anteriormente los sistemas de clasificación se basaban en características morfológicas que conllevan al problema de confundir caracteres sinapomórficos de homoplásicos.
HIPOTESIS
Las 14 especies en estudio del genéro Psychotria, son un grupo monofilético
PREGUNTAS
¿ Los modelos realizados nos darán patrones similares en las relaciones filogenéticas entre las 14 especies de Psychotria ?
Familia Rubiaceae
In-group:Género Psychotria:14 especies
Out-group:
Especies: Cinchona macrocalyx
Palicourea lasiorrachis
MATERIALES Y MÉTODOS
MATERIALES Y MÉTODOS
Obtención de datos (genes-nucleótidos):NCBIEMBL-EBIDBGET
Gen rbCL (ribulose-bisphosphate carboxylase )
Este gen es el mas comúnmente estudiado enlas plantas, ya que tiene un tamaño más omenos largo (1428 pares de bases).
Puede ser alineado fácilmente, por lo que es ungen muy utilizado en sistemática.
Debido a que la proteína codificada por él esmuy importante para las plantas, éste es un genque no presenta cambios o mutaciones muyfrecuentes.
Análisis
Alineamiento: Clustalx, BioEdit
Winclade: Parsimonia
PAUP: Distancia, Máxima Verosimilitud
Mr. Bayes: Bayesiano
RESULTADOS
L= 194
CI= 0.59
RI= 0.70
PARSIMONIA
100
6770
95
85
95
84
Palicourea lasiorrachis
Psychotria poeppigiana
Psychotria bremekampiana
Psychotria borucaza
Psychotria ipecacuanha
Psychotria leptothyrsa
Psychotria holtzii
Psychotria kirkii
Psychotria peteri
Psychotria nervosa
Psychotria micralabastra
Psychotria ramuensis
Psychotria mariniana
Psychotria micrococca
Psychotria graciliflora
Cinchona macrocalyx
Palicourea lasiorrachis
Psychotria poeppigiana
Psychotria bremekampiana
Psychotria borucaza
Psychotria ipecacuanha
Psychotria leptothyrsa
Psychotria holtzii
Psychotria kirkii
Psychotria peteri
Psychotria nervosa
Psychotria micralabastra
Psychotria ramuensis
Psychotria mariniana
Psychotria micrococca
Psychotria graciliflora
Cinchona macrocalyx
Sinapomorfia
Homoplasia
PARSIMONIA
P. holtzii
P. kirkii
P. peteri
P. nervosa
P. graciliflora
P. micralabastra
P. ramuensis
P. mariniana
P. micrococca
Cinchona
macrocalyx
P. borucaza
P. ipecacuanha
P. leptothyrsa
P. bremekampiana
Palicourea lasiorrachis
P. poeppigiana0.005 substitutions/site
0.002
0.011
0.005
0.012
0.002
0.002
0.001
0.001
0.003
0.005
0.005
0.005
0.054
0.001
0.004
0.005
0.001
0.001
0.009
0.005
0.067
0.005
0.010
0.004
0.012
0.018
0.012
0.010
0.012
DISTANCIAS
P. graciliflora
Cinchona macrocalyx
P. holtzii
P. kirkii
P. peteri
P. nervosa
P. micralabastra
P. ramuensis
P. mariniana
P. micrococca
P. borucaza
P. ipecacuanha
P. bremekampiana
P. bremekampiana
Palicourea lasiorrachis
P. peteri
88
95
83
MAXIMA VEROSIMILITUD
Psychotria graciliflora
Cinchona macrocalyx
Palicourea lasiorrachis
Psychotria poeppigiana
Psychotria bremekampiana
Psychotria borucaza
Psychotria ipecacuanha0.98
Psychotria leptothyrsa
0.67
Psychotria holtzii
Psychotria kirkii0.99
Psychotria peteri
0.72
Psychotria nervosa
0.90
0.76
Psychotria micralabastra
Psychotria ramuensis1.00
Psychotria mariniana
1.00
Psychotria micrococca
0.82
0.98
0.98
0.83
0.01
BAYESIANO
DISCUSIÓN
En todos los modelos realizados Cinchona macrocalyx fue utilizada como Outgroup, sin embargo ya en los cladogramas apareció siempre incluido en el Ingroup; esto puede deberse a un error en la identificación de la especie, o por otra parte podría ser que no existen diferencias genéticas marcadas.
Al parecer las especies de Psychotria en estudio, constituyen un grupo monofilético, según los resultados del modelo de Parsimonia.
El modelo de máxima verosimilitud, demostró que estas especies de Psychotria no están suficientemente relacionados por un ancestro común.
GRACIAS