aula de bioinformática

FACULDADE SANTA EMLIA DE RODAT

Curso de Bacharelado em BiomedicinaDisciplina de BioinformticaTurma: BIO_3NA (2015/1)Professor: Rodrigo Niskier Ferreira BarbosaContato: [email protected]

Faculdade Santa Emlia de Rodat Prof. Rodrigo Niskier - Biomedicina - 2015

BIOINFORMTICA DESENHO DE PRIMERS E

BANCOS DE DNA FORENSE


ASSUNTOS E TRABALHOS PARA N2

Assuntos:Anlise de Biomolculas (DNA, RNA e Protenas)Desenho de Primers (PCR)Bioinformtica aplicada a gentica forense

Trabalhos para N2:Trabalho A (5,0 pontos) Anlise de biomolculas de um gene escolhidoEntrega: 19/05 (neste dia o laboratrio estar reservado para concluso dos trabalhos e para tirar dvidas). Dever ser enviado por e-mail at esta data.

Trabalho B (5,0 pontos) Realizar o desenho de um conjunto de primers para o diagnstico molecular de uma doena.Entrega: 09/06 (neste dia o laboratrio estar reservado para concluso dos trabalhos epara tirar dvidas). Dever ser enviado por e-mail at esta data.


DIAGNSTICO PELA PCR


DIAGNSTICO PELA PCRDiagnstico de doenas genticas

Marcadores moleculares do cncer

Gentica forense

Diagnstico gentico pr-implantacional


DESENHO DE PRIMERS

PCR REAO EM CADEIA DA POLIMERASE


PRIMERS = ESPECIFICIDADE


DESENHO DE PRIMERS


ESCOLHENDO UM ALVO


DESENHANDO PRIMERS


ESCOLHENDO OS PRIMERS


TESTANDO OS PRIMERS


RESULTADO NO BLAST PRIMER FOWARD


RESULTADO NO BLAST PRIMER REVERSE


ATIVIDADE PARA N21) Entrar no NCBI e escolher um gene alvo relacionado ao diagnstico molecular1) Copiar parte da sequncia FASTA deste DNA-alvo2) Colar no Primer3plus3) Gerar os primers4) Escolher um par de primers5) Testar cada primer do par escolhido no BLAST6) Enviar para o e-mail da disciplina um arquivo com: a) A identidade do gene escolhido no NCBI b) Um printscreen das informaes sobre o par de primers escolhidos c) o printscreen do BLAST de cada primer escolhido


BANCOS DE DNA FORENSE


REPETIES STR


IDENTIFICAO PELO DNA


IDENTIFICAO PELO DNA

Incluso de paternidade Excluso de paternidade


STR BASE


IDENTIDADE PELO DNA

Alelos do SP/Freqncia (p)

19/ 0,010

18/ 0,1811

14/ 0,225

14/ 0,015

IP(19) 50

IP(18) 2,7609

IP(14) 2,2222

IP(14) 33,3333

IAP 10225,4431

PP = 0,99990221428 ou 99, 9902214%

IP = 12p

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