biochimie clinique (1)
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METABOLISME PROTEIQUE
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METABOLISME PROTEIQUE
1. Introduction. Généralités sur le métabolisme azoté
2. Protéines plasmatiquesPrincipales protéines : albumine, glycoprotéines, marqueurs tumorauxExploration biologique : protéinurie, dosages, électrophorèseDysglobulinémies
3. Enzymes plasmatiquesGénéralités sur l’enzymologie cliniquePrincipales enzymes d’intérêt cliniqueMarqueurs de l’ischémie myocardique
4. Constituants azotés non protéiquesUrée, créatinine, applications à la pathologie rénaleAmmoniac, bilirubine, applications à la pathologie hépatiqueAcide urique, dyspurinies.
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Généralité
En estimation :
• Génome humain : 30 000 à 50 000 gènes structurale• Une cellule : 3000 à 5000 protéines différentes• Dans le sérum : ~ 300 protéines visualisé par 2D électrophorèse
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METABOLISME PROTEIQUE1. Introduction. Généralités sur le métabolisme azoté
1.1 Besoins,quantitatifs : 1g/kg de poids corporelqualitatifs : acides aminés indispensables, vitamines
1.2 Digestion des protéines alimentaires
1.3 Utilisation métabolique des aminoacidesbiosynthèses, néoglucogénèsecatabolisme : désamination, transamination, uréogénèseexcrétion uréique rénale
1.4 Régulation hormonaleFacteurs anabolisants : insuline, hormone de croissance,
androgènes, oestrogènes, facteurs de croissance,cytokines
Facteurs catabolisants : cortisol, thyroxine.
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●
●
3-phosphoglycerate
Glucose 6-phosphate
Phosphoenol pyruvate
AlanineValine
Leucine
Pyruvatefamily
Citric AcidCycle
Pyruvate
Oxaloacetate
2-Oxaloglutarate
Histidine
Hexose pathway
Glycolysis
Ribose 5- phosphate
Erythrose 4-phosphate
●
Phenylalanine Tyrosine
Tryptophane
Serine
Synthesized fromphenylalanine Aromatic
family
Cysteine
SerineGlycine
Serine family
Asparagine
AspartateThreonine
Isoleucine
Methionine
Lysine
NH3
●
Aspartatefamily
GlutamateGlutamine
Proline
Ornithine
NH3
2NH3
Arginine
Ureacycle
Glutamate family
Amino Acid Biosynthesis :Overview
* **
*
*
*
*
*
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Citric AcidCycle
Oxaloacetate
Fumarate
Succinyl CoA2-Oxaloglutarate
Glucose
Serine
CysteinePyruvate
Propionyl CoA
Asparagine
Aspartate
Valine
Phenylalanine
Tyrosine
Isoleucine
Acetyl CoA Glutamate
Glutamine Proline
Arginine
Methionine
Pyruvate
Alanine
Histidine
Typtophan
Pyruvate Serine Glycine
ThreonineAlanine
LysineLeucine
Ket
one
bod
ie
Cysteine
Acetyl CoA AcetoAcetate
Several patway
Amino acid degradation overview
Glutamate
Glutamine Proline
Arginine
Methionine
Pyruvate
Alanine
Histidine
Typtophan
Pyruvate Serine Glycine
ThreonineAlanine
LysineLeucine
Ket
one
bod
ie
Cysteine
Acetyl CoA AcetoAcetate
Several patway
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OAA
α- ketoglutarate
Pyruvate
3-phosphoglycerate
Glucose
ala
asn asp
ser gly
ser gly
pro
arg
gln
his
glu
fumarate
succinylCoA
Pyruvate
3-phosphoglycerate
Glucose
acetylCoA
α- ketobutyrateval
thr met
phe, tyr
ser gly thr
cysala
trp
ile
propionylCoA
acetoacetate
lys , tyr
ile, leu trp
Metabolism fate of nonessential Amino acid
Metabolism fate ofessential Amino acid
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The urea cycle, the TCA cycle, and thetransamination of oxaloacetate are linked by
fumarate and aspartate
Urea
α- Aminoacid
α- keto acidCarbamoyl phosphate
CO2 + NH4+
OrnithineArgino
Succinate
Citruline
Arginine
Aspartate
Fumarate
Malate
OxaloacetateUreacycle
TCAcycle
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protein
amino acid
α- ketoacids
energy
α- ketoglutarate
glutamate
alanine
pyruvate
glutamine
NH4+
pyruvate
urea
NH4+
glutamate
NH4+
α-ketoglutarate
glutamate
glutamine
NH4+
glutamate urea
Muscle
Liver
Kidney
Major pathways of inter organ nitrogentransport following muscle proteolysis
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Glucose
Isoleucine
Methionine
Threonine
Valine
Aspartate
Phenylalanine
Tyrosine
Asparagine
Aspartate
Alanine
Cysteine
Glycine
Serine
Threonine
Tryptophane
Isoleucine
Leucine
TryptophnaePyruvate
Acetyl CoA Acetoacetyl CoA
Phosphoenol pyruvate
Fumarate
Succinyl CoA α-ketoglutarate
Citrate
Oxaloacetate
Leucine
Lysine
Phenylalanine
Tryptophane
Tyrosine
Arginine
Glutamate
Histidine
Proline
Fate of degradation ofcarbon skeleton of amino acid
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METABOLISME PROTEIQUE
1. Introduction. Généralités sur le métabolisme azoté
2. Protéines plasmatiquesPrincipales protéines : albumine, glycoprotéines, marqueurs tumorauxExploration biologique : protéinurie, dosages, électrophorèseDysglobulinémies
3. Enzymes plasmatiquesGénéralités sur l’enzymologie cliniquePrincipales enzymes d’intérêt cliniqueMarqueurs de l’ischémie myocardique
4. Constituants azotés non protéiquesUrée, créatinine, applications à la pathologie rénaleAmmoniac, bilirubine, applications à la pathologie hépatiqueAcide urique, dyspurinies.
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Origines de protéines plasmatiques
• Cellules et tissu sécrètent dans le plasma à la suite d’un« turnover » naturel des tissus.
• Cellule : protéines structurales : membrane cellulaire, organelle,cytoplasme.
• Organe:– Production : foie, plasmocytes, glandes endocrines– Catabolisme : foie
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Fonctions des protéines sériques et plasmatiques
• Garder la pression oncotique plasmatique à un niveau acceptable(surtout albumine).
• Coagulation et fibrinolyse.
• Molécules de signalisation (hormones et cytokines)
• Fonction immunologique (immunoglobine et compléments)
• Anti protéase (protéines de la phase aiguë et anticoagulant)
• Système de tampon
• Liaison d’autre molécules :– Fonction de porteur : augmentation la solubilité– Fonction de livraison: endocytose médiée par un récepteur– Fonction de stockage– Fonction de tampon biologique
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METABOLISME PROTEIQUE
1. Introduction. Généralités sur le métabolisme azoté
2. Protéines plasmatiquesPrincipales protéines : albumine, glycoprotéines, marqueurs tumorauxExploration biologique : protéinurie, dosages, électrophorèseDysglobulinémies
3. Enzymes plasmatiquesGénéralités sur l’enzymologie cliniquePrincipales enzymes d’intérêt cliniqueMarqueurs de l’ischémie myocardique
4. Constituants azotés non protéiquesUrée, créatinine, applications à la pathologie rénaleAmmoniac, bilirubine, applications à la pathologie hépatiqueAcide urique, dyspurinies.
![Page 15: Biochimie Clinique (1)](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081722/55cf968f550346d0338c5489/html5/thumbnails/15.jpg)
METABOLISME PROTEIQUE2. Protéines plasmatiques
Rôle, pression oncotique, holoprotéine et glycoprotéines
2.1 Principales protéines :Sérum albumine, *Glycoprotéines de transport : transferrine, transcortine,
céruléoplasmine,Glycoprotéines de l’inflammation : orosomucoïde, haptoglobine,
CRP*Marqueurs tumoraux : ACE, AFP, PSA, CA 15.3, CA 19.9, hCG ***Immunoglobulines *
2.2 Exploration biologiqueRecherche et étude d’une protéinurie ***
Dosage, nature (électrophorèse, immuno-fixation),classification
Dosages protéiquesProtéines totales, Immuno-dosages isolés ou groupés
profils protéiques * *
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Protéinogramme
Albumine
Globuline
α2γ α1
β
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Électrophorèse de protéines sérique
FibrinogèneC4C5β2microglobuline
Céruloplasminehémopexine
α1 glycoprotéineacide(oromucoïde)
Mineur
IgGIgM
TransferrineComplément(C3)IgA
α2microglobulineα2 haptoglobine
α1 trypsineinhibiteurα1 lipoprotéine(HDL)
AlbumineMajeur
γ globulineβ globulineα2 globulineα1 globulineAlbumine
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Importance clinique de protéines sériques principales
1. Albumine sérique :
PM : 66 000 Da (580-585 acide aminée), non glycosylé
Elle est le principal agent de la pression oncotique etjoue un rôle très important de transporteur: transportde bilirubine, d'acides gras, de médicaments,d'hormones thyroïdiennes.
Valeur de référence :– Nouveau-né : 2,8 – 4,4 g/dL– Adulte : 3,4 – 5,0 g/dL– Personne âgée : 3,4 – 4,8 g/dL
Variation pathologique :
Hypoalbuminémie
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Importance clinique de protéines sériques principales
2. Transferrine,
Migration dans la zone β , (plusieurs formes génétique)
Glycoprotéine de PM 77 000 Da
Valeur de référence : 220 - 400mg/dL
Variation Pathologie :
– Diminution: lors la réaction de la phase aiguë
– Augmentation : carence de fer (anémie)
– Sidérophiline apparaît rapidement dans l’urine, après
albumine, dans le syndrome néphrotique ( explique anémie
hypochrome )
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Importance clinique de protéines sériques principales
3. Transcortine
a1 globuline PM 56000
Fixant le cortisol avec une grande affinité. Elle est donc, comme la SBP(sex binding protein) fixant les androgènes et la DBP (vitamin D bindingprotein), la Retinol binding protein, un transporteur particulier d'hormoneslipidiques ou de produits proches.
Sa concentration normale est voisine de 70 mg/l.
Variation pathologique :
Augmentation au cours de la grossesse et les traitements androgénique ouœstrogénique.
Des déficits congénitaux ont été décrits, liés au chromosome X
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Importance clinique de protéines sériques principales
4. Céruloplasmine :• α2 glycoprotéine de PM 120 000 à 160 000
Fonction :
– Lier le Cu2+ ( 6 – 7 atome de Cu/molécule). 95 % de Cu sérique lie àla céruloplasmine et 5 % est dialysable , qui lie faiblement aualbumine et histidine et des autres protéines.
– Anti-oxydant (protection contre les radicaux libre provenant desgranulocytes activés)
Valeur de référence chez adulte : 18 – 45 mg/dL
Variation pathologique :
– Augmentation en cas d’infection , tumeur maligne (maladie deHodgkin),traumatisme.
– Diminution dans le maladie de Wilson
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Importance clinique de protéines sériques principales
5. Αlpha 1 glycoprotéine ou acide orosomucoïde
Protéine de la phase aiguë (protéine de l’inflammation) :le taux augmenter fortement de manière non spécifique au cours de l’étatinflammatoire (RAA de l’enfant), due à une augmentation de synthèsehépatique, médiée par l'interleukine, qui n'a pas de retentissement sur laprotéinémie totale.
Pas avoir la valeur de diagnostique mais permettant de suivre l'évolution dela maladie inflammatoire
• Fonction: inconnu
• Valeur de référence : 0,6 et 1,2 g/l
VS ( vitesse de sédimentation globulaire )
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Importance clinique de protéines sériques principales
6. Haptoglobine (hp)
Fixation à l’Hb se forme en complexes Hp/Hb, qui sont phagocyté par lessystème réticuloendothélial.
Au maxi 3 g d’Hb (= 30ul de sang) peut être liée par l’Hp présente dans leSang. Si Hp diminue vers 0, elle redevient normal après environ unesemaine.
Valeur de référence : entre 0,5 et 1,5 g/l.
Variation pathologique :
– Augmentation pendant l’inflammation (pas de valeur diagnostiqueni pronostique).
– Diminution en cas d’hémolyse (hémolyse discrète)
Hémopexine fixe hème , est un paramètre d’hémolyse
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Importance clinique de protéines sériques principales
7. Protéine C réactive (CRP)
• Glycoprotéine (120 KDa) , propriété de précipiter au contact dupolysaccharide C du pneumocoque.
• Un rôle d'activation du complément, de facilitation de la phagocytoseet de modulation de la multiplication des lymphocytes T.
• C'est un marqueur très précoce de l'inflammation , s'élevant dans les2 à 4 heures après le début du processus inflammatoire.Du fait de sa demi-vie très courte (24 heures), la CRP est aussi untémoin précoce de l'efficacité thérapeutique, (ex. antibiothérapie )
Le taux normal varie de 0 à 6 mg/l
Variation pathologique :
– les états inflammatoires* – les infections bactériennes néo-natales**, – la surveillance post-opératoire***
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Importance clinique de protéines sériques principales
8. Fibrinogène
• Rôle dans la coagulation
• Il est aussi une protéine de la phase aiguë dont le taux augmente aucours des syndromes inflammatoires.
• C'est une glycoprotéine, synthétisé dans le foie essentiellement etaussi, faiblement, par les mégacaryocytes.
• Les valeurs de référence chez l'adulte sont 2,5 à 3,5 g/l.
• L'intérêt du dosage du fibrinogène sera donc mixte, dans toutprocessus inflammatoire, où son élévation accompagnera celle de laVS et des autres marqueurs protéiques et en hémostase, où le tempsde thrombine explore plus particulièrement la fibrino-formation.
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Importance clinique de protéines sériques principales
9. Αlpha 1 antitrypsine (alpha 1 anti protéase )
Inhiber bien d'autres sérine-protéases que la trypsine. Un inhibiteurpuissant des diverses enzymes protéolytiques pouvant être déversées dansle plasma par des tissus ou par des cellules circulantes comme lespolynucléaires.
Glycoprotéine de petite taille, ayant une demi-vie brève (5 jours).
Le taux normal est de 2 à 4 g/l.
Des variations pathologiques:
– Au cours de l'inflammation où le taux est banalement augmenté.– Les diminutions, par contre, sont plus intéressantes car
génétiques ou acquises.
Elles intéressent la pathologie pulmonaire et hépatique.*Au cours de bronchopneumopathies et d'emphysèmes,*Au cours de cirrhoses infantiles, *Au cours des entéropathies exsudatives,
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Importance clinique de protéines sériques principales
10. Αlpha 2 macroglobuline (α2 M) :
• Glycoprotéine à PM 750 KDa
• Inhibiteur de protéase.
• Se combine aux diverses enzymes protéolytiques circulantes(plasmine, collagénase, trypsine et a chymotrypsine, protéasesbactériennes et protéases granulocytaires).
• Limiter les effets néfastes de la réaction inflammatoire en inhibantles enzymes lysosomiales déversées.
• Les valeurs de référence sont: 2 à 3,5 g/l.
• Les variations pathologiques sont surtout en "hyper":
– Syndromes néphrotiques – l'inflammation aiguë, moins nette toutefois que celle de
l'orosomucoïde, de l'haptoglobine ou de la CRP.– Cirrhose du foie
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Importance clinique de protéines sériques principales
11. Βeta 2 microglobuline,
PM de 11 800, un composant de molécule de HLA Classe I
Filtrée par le glomérule, réabsorption tubulaire et catabolisée.Moins de 10% arrive dans l’urine.
β2 microglobuline dans le sérum :
• Le taux plasmatique normal est de 1,2 à 2 mg/l.• Valeur élevée : lympho proliférative, SIDA, désordre de la filtration
glomérulaire (ex, diabète, glomérulonéphrite chronique,inflammation).
β2 microglobuline dans l’urine : un marqueur de la fonction tubulaire.
• Un prélèvement optimal nécessite une urine légèrement alcalin oualcalinisé.
• Valeur de référence : 4- 370 µg/L• Augmentation: néphrite interstitielle, néphrite toxique, réjection de
greffe rénal.
Elle augmente aussi si la concentration sérique est au dessus de seuilde l’absorption ( 4000 µg/L) dans le sérum
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Importance clinique de protéines sériques principales
12. IMMUNOGLOBULINES
Valeur de Ig varie selon age
90-45070-280800-1800Adult
96-28050-178697-158912 ans
48-20442-174605-14576 ans
39-12319-167440-12923 ans
2-9819-104344-118018 mois
5-7919-96225-7575 mois
0-65-18618-1380Nouveau-né
IgAIgMIgG
Immunoglobuline en mg/100mLAge
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Importance clinique de protéines sériques principales
7. IMMUNOGLOBULINES ( Variation pathologique):
Ig basses :
• Une classe Ig ou déficience générale ?• Congénital ou acquise ?
Ig élevées : (polyclonale vs monoclonale)
• Ig monoclonale : bénin ou malin ?
• Ig polyconale augmente :
• Cirrhose du foie (surtout IgA)• Infection chronique (TB, ostéomyélite)• Cirrhose biliaire primitive (IgM ↑)• Hépatite chronique (IgG ↑)
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Myélome
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METABOLISME PROTEIQUE
1. Introduction. Généralités sur le métabolisme azoté
2. Protéines plasmatiquesPrincipales protéines : albumine, glycoprotéines, marqueurs tumorauxExploration biologique : protéinurie, protidémie total, électrophorèseDysglobulinémies
3. Enzymes plasmatiquesGénéralités sur l’enzymologie cliniquePrincipales enzymes d’intérêt cliniqueMarqueurs de l’ischémie myocardique
4. Constituants azotés non protéiquesUrée, créatinine, applications à la pathologie rénaleAmmoniac, bilirubine, applications à la pathologie hépatiqueAcide urique, dyspurinies.
![Page 33: Biochimie Clinique (1)](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081722/55cf968f550346d0338c5489/html5/thumbnails/33.jpg)
RECHERCHE DE LA PROTEINURIE
DOSAGE DE LA PROTEINURIE TOTALE
ELECTROPHORESE DES URINES CONCENTREES
Absence de fractions anormales
< 0,3 g/l
> 0,5 g/l
PROTEINURIE PATHOLOGIQUE
Protéinogramme
normal
PROTEINURIE
PHYSIOLOGIQUE
Protéine monoclonale
sérique
RECHERCHE PBJ
Classification
PROTEINURIE
GLOMERULAIRE
Sélectivité ? PROTEINURIE
TUBULAIRE
Immunofixation Dosages kappa ou lambda
Dosage Albumine, Transferrine Ig G
Dosage RBP ß2Microglobuline.
Stratégie d'étude d'une protéinurie
![Page 34: Biochimie Clinique (1)](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081722/55cf968f550346d0338c5489/html5/thumbnails/34.jpg)
METABOLISME PROTEIQUE2. Protéines plasmatiques
2.3 Variations pathologiquesHypoprotéinémies : hypoalbuminémie, hypogamma-
globulinémies
Hyperglobulinémies diffuses ou polyclonales : infectionsaiguës ou chroniques, cirrhoses, maladies auto-immunes
Hyperglobulinémies monoclonales :» myélome multiple ou maladie de Kahler : clinique,
radio, biologie sanguine,urinaire, médullaire,» macroglobulinémie de Waldenström,» gammapathies monoclonales bénignes
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Causes de variation pathologique
Catabolisme :InfectionHyperthyrosePerte :RénaleGastrointestinalPeau (brûlure grave)
GrossesseAlitementPerfusion dans le bras
MalabsorptionMalnutritionAlcoolismeInsuffisant hépatiquehypogammaglobulinémie
↓
Perte de liquideCongestion (artéfact)*
GammopathieInfection chronique**↑
Catabolisme/perteHémodilution/concentration
synthèseProtéinetotale
synthèse Catabolisme/perte
± 5% ± 5%
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Syndrome néphrotique
Normale