biokimia kuliah 9 - usu...
TRANSCRIPT
![Page 1: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/1.jpg)
Biokimia
kuliah 9kuliah 9
E N Z I M
![Page 2: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/2.jpg)
Enzim berbeda dengan katalis kimia biasa dalam:
• Laju reaksi lebih tinggi, 106 – 1012 KALI. Karbonik anhidrase 105 mol CO2 per detik
• Kondisi reaksi ‘mild’, tidak terlalu panas
• Spesifikasi lebihbesar, tidak ada produk • Spesifikasi lebihbesar, tidak ada produk samping
• Kapasitas untuk pengaturan
![Page 3: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/3.jpg)
Feedback inhibition
![Page 4: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/4.jpg)
Mekanisma pengontrolan enzim
• Feed back inhibition, produk akhir dalam suatu jalur menghambat enzim pertama dalam lintasan
• Fosforilasi residu threonin atau tyrosin
• Disintesis dam prekursornya, zimogen. • Disintesis dam prekursornya, zimogen. Pengaktifan terjadi melalui pemutusan ikatan peptida
![Page 5: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/5.jpg)
Klasifikasi dan tata nama enzim
• Reaksi-reaksi dan enzim yang mengkatalisisnya dibagi dalam 6 kelas
• Nama enzim mempunyai 2 bagian
• Keterangan tambahan
• Masing-masing enzim mempunyai nomor kode sistematik (EC) nomor ini menyetakan ; jenis reaksi. Sub kelas dan sub sub kelas
![Page 6: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/6.jpg)
Keenam kelas enzim tersebut adalah:
• Oksidoreduktase
S red + S’ oks ------ S oks + S’red
• Transferase
S—G + S’ ---- S’—G + S
X Y
S—G + S’ ---- S’—G + S
• Hidrolase
Asilkolin + H2O ----- kolin + asam
• LiaseC ---C ------ X---Y + C---C
ikatan rangkap
![Page 7: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/7.jpg)
• Isomerase
• ligase
![Page 8: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/8.jpg)
Spesifikasi substrat
tripsin trombin
![Page 9: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/9.jpg)
Karakteristik sisi aktif enzim
• Bagian yang relatif kecil dibanding ukuran total enzim
• Struktur 3 dimensi dibentuk oleh gugus dari residu yang berlainan, berjauhan
• Berupa cekungan, daerah terbuka yang dangkal
• Spesifikasi ikatan tergantung pada pengaturan secara tepat sisi aktif enzim
![Page 10: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/10.jpg)
2 model interaksi enzim dengan substrat
Model lock n key Induce fit model
![Page 11: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/11.jpg)
Sifat kinetika enzim
1. Efek temperatur
menurut teori kinetika reaksi kimia:
- untuk bereaksi molekul harus saling membentur
- untuk benturan yang berhasil, harus mempunyai cukup energi untuk mengatasi energi penghalang, pembatas reaksi
Koefisien temperatur (Q10).
![Page 12: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/12.jpg)
2. Pengaruh pH
• Denaturasi enzim pada pH ekstrim
• Pengaruh terhadap keadaan muatan listrik enzim dan substrat
![Page 13: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/13.jpg)
3. Pengaruh konsentrasi reaktan
• Substrat
![Page 14: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/14.jpg)
Pengaruh konsentrasi enzim
• Kecepatan reaksi tidak selalu sebanding dengan
[enzim]
• Bila reaksi yang dikatalisis enzim mengawali 1
atau lebih substrat menjadi produk (P), tidak ada
produk (P) untuk reaksi terbalik terjadiproduk (P) untuk reaksi terbalik terjadi
• Pada awal reaksi kecepatan awal (Vi) akan
berbanding langsung dengan [enzim]
• Enzim adalah reaktan yang bergabung dengan
substrat membentuk EnzS yang akan terurai
menghasilkan Produk dan enzim bebas
![Page 15: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/15.jpg)
k1 k2
Enz + S EnzS Enz + P
k-1 k-2
Disederhanakan
k1
Enz + S Enz + P
k-2
Kec 1 = k1 [Enz] [S]
Kec 2 = k-2 [Enz] [P]
k1 [Enz] [P] [P]
Keq = = =
k-2 [Enz] [S] [S]
![Page 16: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/16.jpg)
• Jadi: Enzim merubah jalan reaksi tetapi tidak mengubah konsentrasi reaktan dan produk pada awal dan akhir keseimbangan faktor-faktor yang keseimbangan faktor-faktor yang menentukan Keq
![Page 17: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/17.jpg)
- Sifat irreversibel, inhibitor terurai sangat
lambat karena terikat kuat oleh ikatan
kovalen dan non kovalen dengan enzim
- Sifat reversibel, dapat dengan mudah terurai
4. Pengaruh inhibitor
- Sifat reversibel, dapat dengan mudah terurai
inhibitor kompetitif
inhibitor non kompetitif
![Page 18: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/18.jpg)
![Page 19: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/19.jpg)
Inhibitor kompetitif dan non kompetitif
![Page 20: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/20.jpg)
Pengaruh inhibitor pada kecepatan reaksi
![Page 21: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/21.jpg)
Pengaruh non kompetitif inhibitor
![Page 22: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/22.jpg)
![Page 23: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/23.jpg)
![Page 24: Biokimia kuliah 9 - USU OpenCourseWareocw.usu.ac.id/course/...biokimia/bio206_slide_kuliah_9_-_enzim.pdf · Biokimia kuliah 9 E N Z I M. Enzim ... • Bila reaksi yang dikatalisis](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022020120/5b5a3df27f8b9ac7498b9952/html5/thumbnails/24.jpg)