biología molecular 1
DESCRIPTION
molecularTRANSCRIPT
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
1
17-05-2011
Biología molecular, genética y proteínas
Mario Chiong
Como sabemos, el material genético porta toda la información necesaria del organismo. Si
esta información se altera se puede producir un cambio en la estructura, que puede llevar a un
cambio en la función.
Estructura de un gen
En la imagen se muestra la
estructura básica de un gen.
Toda la información contenida
para la regulación de la expresión del
gen está contenida en el promotor,
luego del cual (río abajo) se encuentra
el gen estructural. El término de este
gen se conoce con el nombre de
terminador.
La hebra que es idéntica al
mRNA es la que va de 5`3` (la
superior en esta estructura), que se
conoce como hebra codificante y la
hebra complementaria, que va en
sentido 3`5` se denomina hebra no
codificante y es la que sirve de
templado a la RNA polimerasa para fabricar el mRNA.
La primera base de la hebra codificante recibe el nombre +1. La base inmediatamente
anterior se conoce como -1 (no hay un cero). Por nomenclatura, todas las secuencias negativas se
conocen como río arriba (río arriba del gen estructural se encuentra el promotor) y todas las
secuencias positivas se conocen como río abajo (río abajo del promotor se encuentra el gen
estructural y el terminador).
De acuerdo a la nomenclatura internacional al anotar las secuencias sólo se anota la hebra
codificante (en ella está codificada la secuencia aminoacídica).
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
2
Cambios en el genoma
El genoma humano, a pesar de ser un 99,99% idéntico presenta diferencias entre cada
uno de nosotros.
La secuencia contenida en el DNA no es estática, es dinámica y cambia no solamente
porque se hereda y por recombinación homóloga, también lo hace porque a medida que uno
envejece ocurren mutaciones debido a factores ambientales, por ejemplo. Estos cambios en la
estructura del DNA producen cambios en la expresión de genes.
Pueden haber también alteraciones cromosómicas, como por ejemplo polisomías,
aberraciones cromosómicas, inserción y deleción de genes y mutaciones que son habitualmente
de bases únicas o pocas bases. Estas mutaciones pueden alterar secuencias promotoras, el
procesamiento de mRNAs, la estructuras de proteínas, la actividad enzimática, la estabilidad de
proteínas, etc.
Tipos de mutaciones
Puede haber mutaciones que producen inversión de genes, deleciones, translocaciones,
inserciones.
Missense: Ocurre un cambio en una base que implica el cambio de un aminoácido por otro
Nonsense: El cambio de una base implica el cambio de un codón que codifica para un
aminoácido por un codón de término
Frameshift: Ocurre un corrimiento en el marco de lectura (por inserción o deleción)
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
3
Nomenclatura de las mutaciones
En el primer caso la adenina es positiva, por
tanto la mutación ha ocurrido en el gen estructural
o en el terminador.
Muchas veces aparece una c minúscula
delante de esta secuencia, que indica que la base 1
se considera a partir del cromosoma. Cuando no
tiene nada, como en este caso, corresponde a la
secuencia sin intrones.
Si la secuencia que se muestra es negativa,
la mutación ha ocurrido río arriba del gen
estructural, (zona promotora).
Esta misma nomenclatura es la que se usa
en proteínas
Estudios genéticos
Uno de los datos importantes
cuando se hace la anamnesis de un
paciente es saber si tiene antecedentes
familiares que puedan corroborar la
enfermedad que tiene. Hay varias
enfermedades que tienen un
componente genético relevante, como
la diabetes, la hipertensión y muchas
otras.
Los diagnósticos de estas enfermedades se hacen habitualmente por estudios genéticos y
se construye en la anamnesis un pedigree, que es un árbol genealógico.
En la herencia humana es muy difícil que existan genéticas mendelianas simples, aunque
existe lo que se llama la penetración incompleta del gen. Esto significa que una enfermedad puede
a veces saltarse una generación debido a que los genes pueden no expresar la dominancia en
todas las generaciones.
En el pedigree que se muestra a la derecha, se observa claramente un gen dominante,
también hay penetración incompleta.
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
4
Distribución del genoma
Los procesos de replicación, transcripción y
traducción ocurren en un 22% del genoma.
Estructura-función
Existe una asociación entre enfermedades y mutaciones (relación entre estructura y
función).
Sólo a modo de ejemplo de enfermedades genéticas vamos a ver tres casos particulares.
Probablemente estos ejemplos abarcan cerca de un 90% de todas las enfermedades de origen
genético.
Pérdida o ganancia de actividad enzimática
Alteración de estructura tridimensional de proteínas
Cambios en la estabilidad de proteínas
*Pérdida o ganancia de actividad enzimática
En la tabla se muestran
algunos ejemplos de enzimopatías.
Una mutación de una
enzima particular puede provocar
una disminución notoria o
desaparición de su actividad. Esta
mutación podría ocurrir, por
ejemplo, en el gen estructural o en
el promotor de un gen que codifica
una enzima.
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
5
Primer conceptoMutaciones que llevan a distintos niveles de un metabolito pueden dar lugar a
enfermedades clínicamente distintas. Esto se puede evidenciar con los ejemplos que se muestran
a continuación.
Gota
Es muy frecuente, la padecen 800 personas por cada 100000 habitantes y aparece más
temprano en varones.
Causas: aumento de la ingesta de carnes rojas, falla en la eliminación renal
Hay una alteración en el metabolismo de las purinas con acumulación de ácido úrico
plasmático.
Se asocia a obesidad, dislipidemia y diabetes. De hecho, cuando una persona tiene el primer
síntoma de hipertensión, de diabetes y/o hipercolesterolemia, uno de los marcadores que se
toman de la persona en el análisis sanguíneo es el contenido de ácido úrico. Mientras más alto
el contenido de éste es peor predictor en su patología.
La xantina oxidasa es una enzima que utiliza agua y oxígeno para generar peróxido de
hidrógeno, por lo que genera estrés oxidativo. Altos niveles de ácido úrico están asociados
entonces a altos niveles de estrés oxidativo endógeno.
Hay una alteración en el metabolismo de las purinas con acumulación de ácido úrico
plasmático.
La xantina oxidasa oxida el anillo de las purinas, generando ácido úrico, que se acumula en
la sangre. Cuando el ácido úrico alcanza una concentración crítica precipita principalmente en
las articulaciones, produciendo un efecto físico abrasivo que gatilla los procesos inflamatorios
en las articulaciones mayores. El proceso inflamatorio crónico produce remodelación de las
articulaciones y destrucción de las estructuras, causando gran dolor.
Tratamiento: alopurinol, un inhibidor competitivo de la xantina oxidasa.
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
6
Enfermedad de Lesch-Nyham
Enfermedad hereditaria ligada al cromosoma X, causada por una deficiencia en la enzima
hipoxantina guanina fosforibosiltransferasa (HPRT).
Las bases nitrogenadas pueden ser recicladas para la
síntesis de nucleótidos. La enzima responsable de esto
es la HPRT. Por tanto, cuando esta enzima no existe se
produce una gran acumulación de bases nitrogenadas
libres, las que empiezan a ser eliminadas como ácido
úrico.
A diferencia de la gota, aquí se produce una GRAN
acumulación de ácido úrico en todo el cuerpo, lo que
lleva a la aparición de gota severa y en estados muy
tempranos del desarrollo de la persona, es decir, en
niños. En el adolescente se puede desarrollar artrosis
debido a que el efecto del ácido úrico es tan grande que
produce deformación ósea con alteración en el control
muscular y retardo mental moderado producto de la
acumulación de purinas y pirimidinas en el cerebro.
Incidencia: 1:380000
Tratamiento paliativo con alopurinol
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
7
Inmunodeficiencia combinada severa
En células con deficiencia en la adenosina deaminasa hay acumulación de desoxiadenosina y
conversión de desoxiadenosina a dATP.
En estos pacientes, debido a que hay falla en esta enzima, hay muy bajos niveles de ácido úrico,
pero hay acumulación de desoxiadenosina y desoxi ATP. La acumulación de estos dos metabolitos
afecta la proliferación de linfocitos y altera su función, produciendo una grave inmunodeficiencia.
Esta enfermedad es conocida como la enfermedad del niño burbuja.
Segundo conceptoMutaciones de distintas enzimas de una misma ruta metabólica pueden dar
origen a distintas enfermedades.
Aquí tenemos una ruta metabólica clásica que es la de fenilalanina a ácido meleilaacético.
En este caso, la primera mutación es en la fenilalanina hidroxilasa (permite transformar
fenilalanina en tirosina). Esta mutación hace que el paciente acumule fenilalanina y produzca poca
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
8
tirosina. La acumulación de fenilalanina produce ácido fenilpirúvico, que causa neurotoxicidad.
Esto es característico de la enfermedad de la fenilcetonuria.
La fenilcetonuria es una de las tres enfermedades genéticas que en Chile se diagnostican
en niños recién nacidos en forma obligatoria. Cuando los niños recién nacen se les hace un
pinchazo en el talón del pie, se les saca una gota de sangre y se le miden los niveles de fenilalanina
plasmática. Los niveles elevados de ésta en el niño indican fenilcetonuria.
A un niño que se le detecta la enfermedad inmediatamente se le hace un tratamiento por
control de ingesta de fenilalanina tratando de disminuirla al máximo para que no se acumule, ya
que su acumulación es neurotóxica y provoca problemas de retardo mental.
La fenilcetonuria es una enfermedad no poco frecuente en Chile.
Como estos niños tienen poca tirosina y ésta es sustrato para fabricar melanina, pueden
ser albinos. Una mutación en esta enzima produce albinismo y también, como la tirosina es
sustrato para fabricar las hormonas tiroideas T3 y T4, se puede producir cretinismo.
Tratamiento: disminuir al máximo el consumo de fenilalanina y usar un suplemento de tirosina.
Alteración de estructura tridimensional de proteínas Agregación de proteínas
Las proteínas con estructura alterada tienden normalmente a agregarse.
Las enfermedades más estudiadas por
agregaciones son las de tipo
neurodegenerativo. Probablemente la
enfermedad de este tipo más conocida es
la causada por la acumulación del péptido
β-amiloide en el cerebro, que corresponde
a la enfermedad de Alzheimer. Otra muy
conocida, es la enfermedad de las vacas
locas, que en humanos se conoce como la
enfermedad de Creutzfeldt-Jakob, y que
se caracteriza por la acumulación de una
proteína prion en el cerebro generando
acumulación de placas de amiloides
llamadas variantes Creutzfeldt-Jakob. Esta
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
9
enfermedad produce una demencia senil precoz que lleva finalmente a la muerte por
neurodegeneración.
Enfermedad de Parkinsonacumulación de alfa-sinucleína
Encefalopatía familiaracumulación de neuroserpina
Enfermedad de Huntingtonacumulación de proteínas ricas en glutamina
Estas son proteínas que han sufrido una mutación, por lo que pierden estructura y se
agregan. La formación de agregados es muy importante porque generalmente es tóxico para la
célula y al tenerlos dentro de su estructura citoplasmática muere, por eso se produce la
neurodegeneración.
Degradación de proteínas intracelulares
La degradación de proteínas puede ocurrir por: el sistema lisosomal (endosomas-
lisosomas) y el sistema ubiquitina-proteosoma (basado en la proteína ubiquitina). Todas las
proteínas del organismo dentro de una célula son degradadas por estos dos únicos sistemas, no
hay otros.
Mecanismo de ubiquitinación
Ubiquitinaproteína muy ubicua, se encuentra en todos los organismos, de ahí el nombre.
Una serie de enzimas (E1, E2, E3 y
E4) marcan una proteína uniéndole
covalentemente ubiquitina. Las proteínas
que están ubiquitinadas se marcan para
degradación y son reconocidas por el
sistema ubiquitina-proteasoma (todas las
proteínas que tienen ubiquitina son
degradadas por el sistema proteasoma).
E1activa la ubiquitina, utiliza ATP. La
ubiquitina se activa y se une
covalentemente a E1
E2enzima conjugadora de ubiquitina.
Toma la ubiquitina unida covalentemente
a E1, la une a E2 y el que reconoce el
sustrato a ser degradado es la E3.
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
10
E3enzima ubiquitin-ligasa, que reconoce al sustrato, une a la E2 que tiene ubiquitina ligada y
hace que ésta (la E2) transfiera la ubiquitina a la proteína blanco.
E4enzima poliubiquitin-ligasa. Una vez que está ubiquitinada la proteína la poliubiquitina
Las enzimas E1 y E2 son muy pocas en el organismo. Sin embargo, existen muchas E3,
debido a que éstas reconocen al sustrato de manera muy específica. Existe prácticamente una E3
por cada proteína a ser degradada por el sistema ubiquitina-proteasoma.
Una vez que la proteína está poliubiquitinada ésta es llevada al proteasoma, que es un
complejo muy grande (se ve por microscopio electrónico), que está formado por muchas
subunidades y que degrada proteínas por una actividad semejante a quimiotripsina, requiere para
esto ATP.
Este complejo de proteasoma se conoce con el nombre proteasoma 26s por el peso
molecular que tiene (es del tamaño de un ribosoma, más o menos).
En el proteasoma se liberan las ubiquitinas para ser recicladas.
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
11
Autofagia (Sistema lisosomal)
Una doble membrana,
proveniente de la membrana
plasmática o del retículo
endoplásmico crece englobando
parte del citoplasma y luego se
fusiona con el lisosoma para
degradar todo el contenido que
hay en su interior (se forma una
vesícula de doble membrana).
El lisosoma se fusiona con
la vesícula externa, mientras que
la membrana interna con todo el
contenido citoplasmático es degradado mediante las enzimas del lisosoma.
Membrana pre-autofágicaformación de una vesícula autofágica (autofagosoma)fusión con el
lisosoma y formación de un autolisosoma.
Cuando se forma la vesícula autofágica, el contenido engloba todo el citoplasma y este es
un método para degradar organelos, por ejemplo. Se puede tener una mitocondria y alrededor de
ella se puede formar esta vesícula autofágica para luego fusionarse con lisosomas, destruyendo la
mitocondria completamente.
Proteínas individualesdegradadas por el sistema ubiquitina-proteasoma
Agregados proteicos, organelos o muchas proteínasdegradadas por autofagia (se engloba
completo y se digiere con proteasas).
Hay un compuesto que fue encontrado y aislado en la isla de pascua (rapa nui), el
compuesto se llama rapamicina. Éste, induce autofagia a través del control de la Tor quinasa.
Cuando se dio rapamicina a ratones en bajas cantidades, los ratones fueron más longevos, debido
a que este compuesto induce la autofagia y se sabe que este mecanismo de degradación produce
un aumento de la expectativa de vida mediante la degradación de mitocondrias disfuncionales.
Cuando las mitocondrias no funcionan bien producen radicales libres a través de la cadena
transportadora de electrones, lo que produce exceso de estrés oxidativo. Si esas mitocondrias son
eliminadas por autofagia se reducen los niveles de estrés oxidativo, ocurre menos daño y por
tanto, los ratones viven más tiempo.
Es por eso que la restricción calórica, que induce autofagia es un método para prolongar la
vida.
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
12
Enfermedades neurodegenerativasHay un mal
funcionamiento del sistema del sistema
proteosoma, que degrada mal las proteínas y éstas
se agregan. Si las proteínas son removidas por
autofagia no pasa nada, pero si además hay una
alteración de la autofagia se produce la
acumulación de estos agregados (agresomas) y eso
produce las enfermedades
Hay varias mutaciones relacionadas con el
Alzheimer que son hereditarias. Algunas de éstas
corresponden a mutaciones de las enzimas del
sistema ubiquitina-proteasoma, otras se asocian
con alteración en la vía autofágica. Por tanto, alteración o disminución de los sistemas de
remoción de proteínas producen enfermedades neurodegenerativas
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
13
Terapia Génica
Consiste en hacer una corrección del genoma. Si hay información genética que está errada
se podría modificar esa información y corregir con ello la función.
Se usan vectores para introducir DNA de manera eficiente a una célula
Vectores usados (lo va a preguntar en la prueba)
El DNA puede ser administrado desnudo, en forma de liposomas o en forma de partículas
virales (virus adenoasociados, adenovirus, retrovirus)
El DNA desnudo generalmente corresponde a un plasmidio, en el cual se inserta el gen de
interés para sobreexpresar una proteína en un determinado organismo, por ejemplo. El problema
es que el DNA desnudo es muy sensible a las nucleasas. Por tanto, si tomáramos un tubo con DNA
desnudo en una jeringa y lo inyectáramos en un vaso sanguíneo para que se disperse en el
organismo, lo más probable es que de las 1023 moléculas que logre inyectarme, puede que 1 entre
a la célulamuy ineficiente (la mayoría se degrada y el DNA no entra espontáneamente a la
célula)
La única aplicación que se le da al DNA desnudo en terapia génica es para fabricar vacunas
genéticas. Para eso, se toma DNA desnudo y se inyecta en el músculo. Unas pocas moléculas de
esas logran llegar a entrar a las células musculares y fabrican la proteína foránea codificada por el
gen que se inyectó y el sistema reconoce como extrañas esas proteínas que se acaban de
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
14
sisntetizar y fabrica anticuerpos celulares, de manera que se produce inmunidad. La gracia que
esto tiene es que se requieren pocas proteínas para producir inmunidad global (estas proteínas se
sintetizan endógenamente y luego producen respuesta inmune).
Cuando se produce una proteína intracelular, la respuesta inmune que se gatilla no es la
humoral con anticuerpos, sino que es una respuesta celular mediada por células linfocitos T
citotóxicos natural killer (es un sistema muy importante para la eliminación de células
cancerígenas y de células infectadas por virus).
Liposomas catiónicos
Lípidos que neutralizan las cargas negativas del DNA desnudo y aumentan 100 veces la entrada
de DNA a las células (respecto al DNA desnudo).
No pueden ser usados in vivo, pues son “secuestrados” por proteínas plasmáticas, impidiendo
que éstos entren a la célula.
Corresponden a una doble membrana lipídica que en el interior cotiene DNA.
no pueden ser usados in vivo por las proteínas plasmáticas, ya que éstas también interaccionan
con los liposomas y los secuetsran, impidiendo que entren a las células.
Generalmente se usa a nivel tópico (tratamiento de DNA en la piel)
En los últimos 2 años varios grupos han estado trabajando en liposomas que puedan
resistir las proteínas plasmáticas para desarrollar un vehículo de administración vía venosa, sin
embargo no se tiene nada aún a nivel clínico.
Viruseficiencia 10 o 100 millones mayor
Se usan básicamente 3 (aunque hay un cuarto que no aparece en la tabla, el virus herpes)
ʘ Adenovirus
- Es un virus del resfrío (muy inmunogénico) que posee una estructura hexamérica.
- Posee DNA de doble hebra
- Está recubierto con proteínas de cubierta y tiene fibras unidas a un pentón. La fibra es la
proteína que reconoce la célula blanco.
- La gracia que tienen los adenovirus es que son capaces de infectar cualquier tipo celular.
- Tiene dos ITR que son zonas promotoras que permiten el encapsidamiento del virus,
también controlan la regulación de la expresión génica del virus
- Poseen una zona de secuencia phi, que es la secuencia de empaquetamiento viral.
- Para terapia génica, se toma todo el genoma del adenovirus y se elimina parte de éste
para reemplazarlo por el gen de interés. Entonces a este adenovirus, cuyo genoma
completo es de se le saca el gen E1 (E viene de early, temprano), que es el primer gen que
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
15
se expresa cuando entra el virus. Este gen E1 es un
factor transcripcional que regula la expresión de todo
el resto de los genes virales.
- Al primer adenovirus que se fabricó se le eliminó el
gen E1 y se le reemplazó por el gen de interés. Este
nuevo virus, como no tiene el gen E1, al introducirlo
dentro de la célula no se puede replicar (porque para
esto requiere E1), por tanto es inerte.
- A éstos se les llama virus de primera generación
- Cuando se empezaron a usar in vivo los virus de
primera generación, se dieron cuenta que era
importante eliminar E3, que es un gen que inhibe la apoptosis (se expresa para que la
célula no se muera y el virus se alcance a replicar).
- Para evitar hacer estos virus más seguros, se eliminó E3. De tal manera que si se escapa el
virus del laboratorio y entra a una célula, ésta hará apoptosis y morirá (esto los hace
seguros).
- Fabricación de estos virus: Se toma un plasmidio que tiene todo el genoma viral y un
plasmidio pequeño (al cual se le pone el gen de interés) y se hace que éstos recombinen
para formar el virus. Este virus de primera generación se fabrica entonces por
recombinación entre un vector que porta el transgén y otro que porta el genoma del
adenovirus.
- El problema de usar estos adenovirus de primera generación se presentó cuando en el año
1999 un paciente en estudio de fase 2 fue inyectado con un virus de primera generación y
se murió producto de una respuesta inmunológica alérgica desencadenada por estas
proteínas exógenas. Este evento hizo que se parara todo el estudio de terapia génica por 5
años, con el objetivo de solucionar el problema inmunológico. Durante esos 5 años se
desarrollaron nuevos vectores y se desarrolló el adenovirus de tercera generación.
- En el caso del individuo que murió es porque si bien es cierto que el virus no tenía E1, el
promotor todavía tenía niveles bajos
de expresión y estas células
infectadas con el adenovirus podían
producir antígeno viral en cantidades
bajas pero suficientes como para
gatillar respuesta inmune.
- Virus de tercera generación Se
eliminó todo el gen viral, de manera
que se dejó un DNA vacío, sólo con el
gen de interés.
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
16
- Se hizo un estudio con adenovirus y se vio que en el caso de los de primera generación, a
las 20 semanas el sistema inmune elimina las células que tienen el virus, por tanto la
terapia génica desaparece. En el caso de los de tercera generación, como no producen
proteínas virales, el sistema inmune no los reconoce y pueden permanecer largo tiempo
en el organismo y por tanto pueden ser usados en terapia génica. El problema que tienen
es que el DNA no se integra al
genoma (DNA episomal),
quedando fuera del
cromosoma, por lo que se
van perdiendo cuando la
célula se divide (una de ellas
se queda con el adenovirus y
la otra no), de manera que al
haber divisiones sucesivas se
va perdiendo (pérdida del
adenovirus por división
celular). Por eso se observa
en el gráfico una pendiente
negativa.
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
17
- Un ejemplo de cómo se usa: cáncerglioma cerebral (cáncer inoperable). Esta fue una
terapia génica muy exitosa, es el único tratamiento que existe actualmente para el
tratamiento del glioma cerebral.
- Los gliomas están comunicados célula-célula mediante gap junctions. Entonces, con una
micro jeringa se inyecta en el centro del glioma un adenovirus que sobreexpresa la enzima
timidina kinasa, que transforma el aciclovir o ganciclovir, fosforilándolo. Una vez que esto
ocurre éste puede ser usado para fabricar nucleótidos que servirán en los procesos de
replicación y/o transcripción de genes. Como sabemos, aciclovir y ganciclovir se usan
como terapia para el virus herpes porque éste tiene una timidina kinasa que le permite
utilizar el aciclovir para la replicación viral y, una vez que el aciclovir se incorpora en las
bases nitrogenadas del virus, éste deja de replicarse. Por tanto lo que ocurre en el caso de
este tratamiento es: se le inyecta el adenovirus que expresa timidina kinasa al glioma, de
manera que éste comienza a producir timidina kinasa. Luego, se infunde en el líquido
cefalorraquídeo gancilovir, el que va a ser captado por estas células que están expresando
timidina kinasa para fabricar nucleótidos y como todos los gliomas están conectados por
gap junctions este nucleótido se reparte en todo el glioma y es usado para replicación. Al
incorporarse al DNA, el glioma deja de replicarse y se detiene el crecimiento del tumor.
- Como las células neuronales normales como los astrocitos no tienen timidina kinasa y por
lo tanto no pueden ocupar el ganciclovir, no hay daño neuronal (esto es selectivo a las
células del glioma por incorporación de la timidina kinasa).
ʘ Retrovirus
- Los retrovirus se caracterizan por ser muy patogénicos y muy poco inmunogénicos (tiende
a escaparse del sistema inmune).
- Como el problema del adenovirus es que no se integra, se diseñaron 2 virus extras: el
retrovirus y el virus adenoasociado, que sí se integran al genoma y por tanto pueden
perpetuarse (se puede hacer con ellos una terapia génica permanente).
- Un ejemplo del uso del retrovirus: actualmente, se están usando retrovirus para el
tratamiento de los niños burbuja con adenosina deaminasa. Este es un tratamiento ex
vivo, que consiste en tomar al niño con la deficiencia genética, extraerle médula ósea para
cultivarla in vitro. Las células madres aisladas de este niño se infectan con un retrovirus
que posee el gen que codifica para la adenosina deaminasa. Como ésta va en un retrovirus
se integra al genoma. Luego, se seleccionan las células que son adenosina deaminasa
positivas (stem cells) y se cultivan nuevamente. Posteriormente, se toma al niño y se
irradia para destruirle toda la médula ósea original, con el objetivo de reimplantarle la
médula ósea tratada ex vivo (médula con células adenosina deaminasa positivas). De esta
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
18
manera, se coloniza nuevamente la médula ósea y se recupera, eliminando la enfermedad
inmune.
- Los niños burbujas no viven más de 12 años, se mueren por algún problema del sistema
inmune. El tratamiento actual sin terapia génica es trasplante de médula ósea por un
dador compatible (el mismo tratamiento que se hace para la leucemia)
- El éxito de la terapia génica es de entre un 60 a un 70%. El problema que tiene esta terapia
génica con retrovirus es que en 2 de los primeros 17 casos de niños burbuja tratados
desarrollaron leucemia, lo que se debe a que el retrovirus se inserta al azar dentro del
genoma y como hay inserción al azar se pueden prender oncogenes.
ʘ Virus adenoasociados
- No se le conoce ninguna enfermedad asociada y es extremadamente poco inmunogénico.
- No se replica solo. La única manera de contagiarse con un virus adenasociado es
contagiándose antes con adenovirus (de ahí el nombre).
- Utiliza la maquinaria del adenovirus para replicarse.
- Se integra al genoma específicamente en el brazo corto del cromosoma 19 en una zona
donde no hay replicación, ni transcripción génica. Es una zona inerte del brazo corto del
cromosoma 19. Por lo tanto, a diferencia del retrovirus que se integra al azar, éste se
integra en una zona muy específica del DNA genómico.
- AAVtiene 2 ITRs, es un DNA de hebra simple, tiene 2 proteínas de cubierta y varias
proteínas Rep. Éstas son las encargadas de insertar el virus al cromosoma 19.
- En la imagen se muestra la estructura de un adenoasociado recombinante donde se
preservan los 2 ITRs y se
cambia todo el genoma viral
por el transgén. El problema
que tiene el adenoasociado es
que es muy pequeño. El
tamaño máximo de este
transgén es del orden de 3,8
kb. Genes más grandes que
eso no entran en el virus.
- Como requiere genes de
adenovirus para replicarse, se
utiliza un plasmidio que tiene
los genes adenovirales (se
Transcripciones de Cátedras
Química Fisiológica y Patología Integrada I
Díaz, H. Las Heras, M. Pinto, F. Reyes, M. Rivera, C. Romero, R.
Universidad de Chile | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas
19
llama AAV helper)E2, E4 son genes de replicación adenoviral.
- También están las proteínas Rep y Cap del adenoasociado.
- Se coloca también un plasmidio con el gen de interés y las zonas ITR. Se introducen estos
tres plasmidios dentro de una célula para fabricar toda la maquinaria replicativa del virus y
encapsidarla. Luego se rompen las células y se purifica el vector adenoviral y éste es el que
se usa. Son entonces 3 vectores los que se usan en una célula para producir esta partícula
viral.
- Ejemplo: tratamiento de la hemofilia con AAV aportando el factor IX. Se pone una
inyección intramuscular del AAV portando el factor IX de la coagulación. Esto se integra y
las células comienzan a producir el factor IX que va a la sangre y estas personas se
recuperan de la hemofilia.