文摘数据库检索 -...
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李春英北京大学医学图书馆
文摘数据库检索
内容提要
文摘库概述 PubMed
文摘数据库概述
报道和揭示文献的外部特征（题名、著者、期刊、卷期、页码、时间、文献类型、语种）和文献的内部特征的检索工具。
又称二次文献数据库，是对原始文献进行二次加工而形成的文献集合
生物医学领域中外文摘数据库
美国生物医学文献数据库(PubMed)
荷兰医学文献数据库(Embase)
美国生物学文献数据库(BIOSIS Previews)
美国化学文摘网络数据库(SciFinder)
中国生物医学文献数据库（CBM）
中文生物医学期刊文献数据库（CMCC）
6
文摘数据库特点
提供原文的摘要信息摘要信息包括：题目、作者、刊名，或论文相关信息
缩小每篇论文的篇幅，节省空间和内存
信息量大文献类型多（期刊论文、会议论文、专利、读者来信、述评等）
回溯年代长
期刊种类多（每个数据库收录千种以上，甚至上万）
多国多语种
出版形式多样：光盘版、网络版、在线
学科范畴广（生物医学专题、生物医学交叉）
文摘数据库使用情况
109864
800484
0
100000
200000
300000
400000
500000
600000
700000
800000
900000
文摘索引数据库 电子期刊全文数据库
2005-2006年北京大学医学图书馆两种类型文献使用人次统计
文摘数据库的作用
1. 可了解和把握某课题领域研究动态和研究现状
2. 对不熟悉的语种文章，看英文摘要即可
3. 判断自己课题(学位论文选题、开题)的新颖性
4. 申请立项课题或申报成果奖励、成果鉴定
5. 申请专利
6. 科研绩效评价
文摘数据库掌握要领
1.数据库的概况
2.数据库的结构
3.数据库的检索界面
4. 检索技巧与方法
17
PubMed数据库
主要内容
1. 数据库概况
2. 数据库检索机制
3. 数据库的组成结构
4. 检索界面
5. 检索方法与技巧
PubMed概况
1.创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI)
2.类型：文摘型网络数据库
3.网址：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed（pubmed.gov，建议使用谷
歌、火狐、搜狗等浏览器）
4.特色：具有收录学科范围广、文献类型多、多国多语种、回溯时间长、
检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获得
全文
5. 学科范围：生物医学、生命科学、行为科学、生物工程、化学等学科
PubMed数据来源
1.MEDLINE：包括OLDMEDLINE
2.In Process Citations：每天收录，尚未经规范处理的数据
3.Publisher-Supplied Citations：由出版商提供的电子文献，
每条记录标有[PubMed-as supplied by Publisher]
PubMed检索机制
1．自动截词转换匹配功能(AutomaticTermMapping)对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和
转换，再进行检索。词表匹配转换顺序是：MeSH表(MeSH table)、期刊刊名表(Journal table)、作者索引(Author Index)、调查者表(Investigator table) 、所有字段（All Fields）。如果在以上5个表中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语分开，以单词为单位，分别重复以上的过程，检索时各个词之间是AND逻辑关系。
PubMed检索机制
2．短语检索(Phrase Searching)也可称为强迫词组检索，即，如果要将短语作为一个词组进行检索，可用双引号“ ”将其引起来。如：“drug therapy”作为词组进行检索的词，系统不进行自动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。
PubMed检索运算符
1.逻辑运算符：
逻辑与：AND，逻辑或：OR，逻辑非：NOT
当一个检索表达式中同时含有三个运算符时，运算顺序从左至右，括号可以改变运算顺序
2.截词符：*，一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词符
如：chem*表示用词根进行检索。
如：Heart attack* 会关闭自动转换匹配检索词，myocardial infarction等词会匹配不到
PubMed检索运算符
3.双引号：“ ”，表示对引号中的短语进行检索。
4.检索字段标识符：[tag]，tag为字段名称。
[ti]，[au]，[ta]，[so]，[la]，[pt]。
常用字段组成标识符 字段名称
TI Title
AU Author
AD Affiliation
AB Abstract
DP Publication Date
EDAT Entrez Date
SO Source
TA Journal Title Abbreviation
MH MeSH Terms
PT Publication Type
DP publication date
检索界面
基本检索
高级检索
MeSH Database检索
限定检索
期刊查询(Journals Databases )
引文匹配器(Citation Matcher)
临床咨询(Clinical Queries)
特殊咨询(Topic-Specific Queries)
基本检索界面
高级检索界面
MeSH Database检索界面
Journals Databases检索界面
Single Citation Matcher检索界面
Batch Citation Matcher检索界面
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临床咨询界面
特殊专题咨询界面
临床试验查询界面
PubMed检索方法
1.基本检索：在基本检索界面下完成的检索方法
2.高级检索：高级检索界面下进行的检索方法
3. MeSH Database检索：借助主题词完成的检索方法
基本检索
基本检索表达式
1.关键词、词(词组)或短语：
2.作者：Smith JS 或 Smith[au]
3.期刊刊名：GENE THERAPY[TA]，JAMA[TA]
4.截词：CHEMO*
5.复杂表达式：CANCER AND THERAPY
6.#1 AND #2
例如：肝癌的基因治疗 liver cancer gene therapy
Search Details检索过程
Search details检索过程
("liver neoplasms"[MeSH Terms] OR ("liver"[All Fields] AND
"neoplasms"[All Fields]) OR "liver neoplasms"[All Fields] OR
("liver"[All Fields] AND "cancer"[All Fields]) OR "liver
cancer"[All Fields])
("genetic therapy"[MeSH Terms] OR ("genetic"[All Fields]
AND "therapy"[All Fields]) OR "genetic therapy"[All Fields]
OR ("gene"[All Fields] AND "therapy"[All Fields]) OR "gene
therapy"[All Fields])
修改为：“liver neoplasms”[MeSH Terms] AND "genetic
therapy"[MeSH Terms]
修改后的检索结果
高级检索
高级检索技巧选择不同检索字段，检索效果不同
MeSH Database检索
输入查找的主题词
副主题词表
主题词注释表
根据树状结构表中位置选择
树状结构表
款目词
相关词汇
MeSH主题词
什么是MeSH ？
医学主题词，又称叙词，在标引和检索中用以表达文献主题的规范化的词或词组。
主题词如何形成？
哪些词可以作为主题词？
主题词和自由词的区别？
主题词与自由词区别
主题词：又称叙词，在标引和检索中用以表达文献主题的规范化的词或词组
主题词表示的是概念，概念由语词表达的，并不是所有的词语都是主题词
自由词：关键词、文本词、款目词。表示的字面
MeSH的特性
动态性
唯一性
MeSH Database检索步骤
1.输入查找的主题词
2.找到所需主题词，直接点击词的链接
3.选择与主题词对应的副主题词表（检索范围，参考树状结构表）
4.添加到检索框中
5.在PubMed中检索
以艾滋病的药物治疗方面的文献查询为例
检索结果返回到基本检索页面
限定检索
Article types（文献类型）
Text availability（文本利用，文摘和全文）
Publication dates（出版日期）
Species（研究对象）
Languages（语种）
Sex（性别）
Subjects（主题范畴）
Journal categories（期刊类型）
Ages（年龄组）
Search fields（特定字段）
限定检索
限定检索
点击取消限定
PubMed几种检索方法的选择
基本检索
高级检索
MeSH Database检索
举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献
基本检索
1.检索表达式： children asthma drug therapy
2.直接输入检索框中，进行检索
检索过程（Search details）("child"[MeSH Terms] OR "child"[All Fields] OR "children"[All Fields])
AND ("asthma"[MeSH Terms] OR "asthma"[All Fields]) AND
("drug therapy"[Subheading] OR ("drug"[All Fields] AND "therapy"[All Fields]) OR
"drug therapy"[All Fields] OR "drug therapy"[MeSH Terms] OR ("drug"[All Fields]
AND "therapy"[All Fields]))
修改检索式：
child[MeSH Terms] AND asthma[MeSH Terms] AND
"drug therapy"[Subheading]
举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献
MeSH Database检索
1.确定主题词：child asthma
drug therapy(副主题词)
2.查找主题词
举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献
高级检索
1.确定检索词：child asthma drug therapy
2.选择检索字段
3.输入检索词
主题、刊名全称或缩写、ISSN
可以浏览MEDLINE现刊
PubMed收录多少种中国期刊
单篇文献匹配器
临床咨询
可选择病因、诊断、治疗、预后和临床预测指南
特殊专题咨询
检索结果处理
显示
保存
打印
显示格式
格式：Summary
Abstract
MEDLINE
每页条数
排序方式
增加显示功能小技巧
安装一个小程序文件 (scholarscope, https://www.scholarscope.cn/)
可以显示期刊影响因子
点击立即下载后，有安装教程，很多浏览器都可以安装
插件安装成功后的页面
显示为文摘格式，每篇文献下面都有全文链接
单篇文摘格式
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2.Format（格式）
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整理后的NCBI
检索练习
1.检索有关“禽流感预防控制方面”的文献(两种检索方法)
2.检索微量元素缺乏与皮肤病关系的文献（限英文综述）
3.利巴韦林（ribavirin）治疗SARS方面的综述文献
4.眼结核(ocular tuberculosis)引起失明(blindness)的文献
（比较基本检索和主题词检索的结果）
5.北京大学人民医院黄晓军教授发表的英文文献
6.CANCER LETTERS期刊上查找有关基因治疗方面的文献
PubMed检索小结
1.任何一项研究主题都有多个检索途径，要比较多个检索途径的结果，那个更适合该项研究主题
2.Search Details描述检索过程
3.*关闭自动转换匹配功能
4.限定检索条件要及时关闭，否则会影响后续的检索结果
作业
1.闭角型青光眼手术疗法方面的综述文献
2.洛伐他汀治疗高胆固醇血症临床试验方面的文献
3.老年人褥疮护理的文献
4.艾灸对类风湿性关节炎疗效方面的文献
5.正畸矫正器矫治错位咬合时引起的不良反应
谢 谢 !