catálogo de sondas para hibridación in situ con ... · pdf filechr8...

FISH

Catálogo de sondas para Hibridación In Situ con Fluorescencia

NIMGenetics desarrolla productos genómicos que mejoran el diagnóstico clínico, el valor pronóstico y el manejo

terapéutico, incrementando así la calidad de vida de los pacientes.

En este contexto, lanzamos nuestro catálogo de productos (sondas de

ADN y reactivos) para ensayos FISH (Hibridación In Situ con Fluorescencia).

Los ensayos FISH se realizan en Laboratorios de Genética, Anatomía

Patológica o Hematología, entre otros, y se dirigen a identificar

posibles alteraciones que afectan a un gen interés. En la práctica

clínica, la elección de estos ensayos se debe a la rapidez y eficacia con

la que detectan al gen candidato o sospechoso de intervenir en la

enfermedad.

Las sondas de ADN que se emplean para llevar a cabo estos ensayos

están diseñadas en base al conocimiento de la secuencia del

genoma humano.

¿Por qué elegir las sondas de NIMGenetics? Asi nos diferenciamosNuestras sondas de FISH, a diferencia de otros productos del mercado, están diseñadas desde una colección de oligonucléotidos de 80 pares de bases de longitud con cobertura en todo el genoma*. Basándonos en criterios científicos y clínicos, NIMGenetics ha generado a partir de esa colección, un catálogo único de sondas de FISH con doble y triple color que contienen de manera redundante el gen o la región de interés. Nuestras sondas se caracterizan por:

1. Alta Especificidad: al ser sondas generadas a partir de oligonucleótidos, y no de clones tipo BACs (Cromosomas Artificiales Bacterianos), entre otras ventajas, no contienen secuencias de ADN repetitivo por lo que ofrecen señales de alta especificidad que permiten una fácil interpretación.

2. Alta Precisión: las sondas están basadas en secuencias de pequeño tamaño (oligonucleótidos de 80 pares de bases) que permiten localizar reordenamientos con alta precisión, en comparación con la imprecisión de sondas obtenidas a partir de BACs que tienen de media un tamaño de 150.000 pares de bases.

3. Alta Luminosidad: la introducción del marcaje durante el proceso de síntesis de la sonda hace que ésta adquiera un marcaje de alta luminosidad permitiendo una óptima visualización al microscopio. Por el contrario, las sondas procedentes de BACs tienen una menor intensidad al incorporar el marcaje mediante procesos enzimáticos posteriores a la síntesis.

4. Permanentemente Actualizadas: todos los nuevos avances científico-clínicos validados se plasmarán en la renovación y actualización automática del diseño de nuestras sondas, que estarán disponibles para nuestros clientes de forma inmediata.

* Con el apoyo de Agilent Tech. Inc.

NIMGenetics diseña y valida las sondas NIMFISH, consiguiendo los más altos

estándares de especificidad, precisión y luminosidad

¿Qué servicios ofrecemos?

1. Catálogo orientado a Oncología y Onco-hema-tología (Médula ósea, sangre periférica y biop-sias de Anatomía Patológica de material inclui-do en parafina).

a. Sondas dirigidas a Gen o Alteración Única b. Kits de sondas por patología c. Sondas centroméricas y subteloméricas

2. Catálogo orientado para la Genética Clínica.

a. Sondas dirigidas a Gen o Alteración Única b. Sondas centroméricas y subteloméricas

Además, ofrecemos servicios como:

3. Crea tu propia sonda con tu propio gen y/o región de interés en tu propio formato/presentación.

4. Sondas pancentroméricas y panteloméricas (humanas y murinas)

5. Reactivos para FISH

Sonda gen TP53 (señal roja). Centrómero Cr. 17 (señal verde)

¿Cómo te lo ofrecemos?Disponemos de varias opciones de trabajo con el objetivo de que el cliente obtenga el máximo rendimiento y eficacia.

Por ello, ofrecemos, para todas nuestras sondas:

1. Presentación “Lista para usar”: Rápido y sencillo. Sondas y buffer conjuntamente optimizados y mezclados listos para su uso

2. Presentación “Sonda + buffer de hibridación”: Tú decides. Si quieres ser tú mismo quien realice la mezcla, este es tu formato.

Además, dependiendo del número de veces que necesites utilizar nuestras sondas*, elige:

1. NIMFISH 10: Válido hasta para 10 usos.

2. NIMFISH 15: Utilízalas hasta 15 veces.

*Consultar con NIMGenetics para otros formatos.

Tumores SNC

Región 1p36 (señal roja)

Región 1q25 (señal verde)

ONCOLOGÍA - HEMATOLOGÍACatálogo de sondas dirigidas a gen o alteración única

CATÁLOGO NIM GEN / Región Diseño Gen Citobanda Tamaño (kb) Color Funciona en FFPE

NF-1001 IGH Breakapart3'-IGH

14q32.33641 Verde

Si5'-IGH 301 Rojo

NF-1002 BCL2 Breakapart3'-BCL2

18q21.33389 Rojo

Si3'-BCL2 598 Verde

NF-1003 ALK Breakapart3'-ALK

2p23.2300 Rojo

Si5'-ALK 600 Verde

NF-1003-CE ALK CE Breakapart3'-ALK

2p23.2300 Rojo

Si5'-ALK 600 Verde

NF-1004 ROS1 Breakapart3'-ROS1

6q22.11100 Rojo

Si5'-ROS1 1150 Verde

NF-1004-CE ROS1 CE Breakapart3'-ROS1

6q22.11100 Rojo

Si5'-ROS1 1150 Verde

NF-1005 RET Breakapart3'-RET

10q11.21144 Rojo

Si5'-RET 600 Verde

NF-1005-CE RET CE Breakapart3'-RET

10q11.21144 Rojo

Si5'-RET 600 Verde

NF-1006 TFE3 Breakapart3'-TFE3

Xp11.23240 Rojo

Si5'-TFE3 550 Verde

NF-1007 ERG Breakapart3'-ERG

21q22.2228 Rojo

Si5'-ERG 505 Verde

NF-1008 FOXO1 (FKHR) Breakapart3'-FOXO1

13q14.11600 Verde

Si5'-FOXO1 601 Rojo

NF-1009 SS18 (SYT) Breakapart3'-SS18

18q11.2616 Verde

Si5'-SS18 406 Rojo


NF-1010 EWSR1 Breakapart3'-EWSR1

22q12.2263 Rojo

Si5'-EWSR1 564 Verde

NF-1011 DDIT3 (CHOP) Breakapart3'-DDIT3

12q13.3537 Verde

Si3'-DDIT3 498 Rojo

NF-1012 MALT1 Breakapart5'-MALT1

18q21.32300 Rojo

Si3'-MALT1 603 Verde


3q27.3-q28371 Rojo

Si5'-BCL6 481 Verde

NF-1015 C-MYC Breakapart3'-MYC

8q24.21623 Verde

Si5'-MYC 432 Rojo

NF-1016 MLL (KMT2A) Breakapart3'-MLL

11q23.3199 Rojo

No5'-MLL 497 Verde

NF-1017 ETV6 Breakapart3'-ETV6

12p13.2396 Rojo

No5'-ETV6 505 Verde

NF-1018 RARA Breakapart5'-RARA

17q21.1600 Verde

No3'-RARA 419 Rojo

NF-1019CBFBInv(16)(p13.3q22)

Breakapart5'-CBFB

16q22.1240 Rojo

No3'-CBFB 284 Verde


19q13.31305 Rojo

No3'-BCL3 451 Verde

NF-1021 CCND1 Breakapart5'-CCND1

11q13.3311 Rojo

Si3'-CCND1 352 Verde

NF-1022 PDGFRB (5q33) Breakapart3'-PDFGRB

5q33.1354 Rojo

No5'-PDFGRB 435 Verde

NF-2001 TP53 (p53) Copy numberTP53 17p13.1 120 Rojo

SiChr17 Centrómero 436 Verde

NF-2002 MET Copy numberMET 7q31.2 400 Rojo


NF-2002-CE MET CE Copy numberMET 7q31.2 400 Rojo



NF-2003 del(5)(q31)/EGR1 Copy numberEGR1 5q31.2 184 Rojo

NoD5S630 5p15.31 370 Verde

NF-2004 EGFR1 Copy numberEGFR 7p11.2 188 Rojo


NF-2005 Her2 Copy numberHER2 17q12 191 Rojo


NF-2006 PTEN Copy numberPTEN 10q23.31 160 Rojo


NF-2007 1p/19qCodeletionCopy number

TPRG1L 1p36.32 332 Rojo

SiABL2 1q25.2 600 Verde

ZNF443 19p13.2 513 Verde

GLTSCR2 19q13.33 300 Rojo

NF-2009 MDM2 Copy numberMDM2 12q14.3 180 Rojo


NF-2010 FGFR2 Copy numberFGFR2 10q26.13 360 Rojo


NF-2011 FGFR1 Copy numberFGFR1 8p11.2 325 Rojo


NF-2012 N-MYC Copy numberMYCN 2p24.3 277 Rojo


NF-2013 CEP4/10/17 Copy number

Chr4 Centrómero 613 Azul

SiChr10 Centrómero 676 Rojo

Chr17 Centrómero 435 Verde

NF-2014 1p/1q Myeloma Copy numberCDKN2C 1p32.3 153 Verde

NoCKS1B 1q21.3 100 Rojo

NF-2015CDKN2Adel(9)(p21)

Copy numberCDKN2A 9p21.3 188 Rojo

NoChr9 Centrómero 367 Verde

NF-2016 IKZF1 Copy numberIKZF1 7p12.2 62 Rojo


NF-2017 del(13)(q14.2) Copy numberD13S319 13q14.2 154 Rojo



NF-2018ATMdel(11)(q22.3)

Copy numberATM 11q22.3 732 Rojo


NF-2019 D12Z3-CEP12 Copy number Chr12 Centrómero 704 Verde No

NF-2020 MYB, del(6)(q23) Copy number3'-MYB 6q23.2 251 Rojo


NF-2021 D9Z3/D15Z4 Copy number Chr9 Centrómero 367 Verde Si

NF-2022del(7)(q31)/D7S486

Copy numberD7S486 7q31.2 200 Rojo


NF-2023 del(20)(q12) Copy numberD20S108 20q13.1 200 Rojo


NF-2024 CEP8 Copy number Chr8 CEP Centrómero 635 Rojo No

NF-2025 del(5)(q33)/CSF1R Copy numberCSF1R 5q33.1 286 Rojo

NoD5S630 5p15.31 370 Verde

NF-3001 ALK/EML4 Dual fusionALK 2p23.2 479 Rojo

SiEML4 2p22.1 496 Verde

NF-3002 NCOA2/HEY1 Dual fusionNCOA2 8q13.3 700 Rojo

SiHEY1 8q21.13 774 Verde

NF-3003 IGH/CMYC Dual fusionIGH 14q32.33 1519 Verde

SiMYC 8q24.21 815 Rojo

NF-3004 IGH/BCL2 Dual fusionIGH 14q32.33 1519 Verde

SiBCL2 18q21.33 1000 Rojo

NF-3005 IGH/CCND1 Dual fusionIGH 14q32.33 1519 Verde

NoCCND1 11q13.3 1000 Rojo

NF-3006 IGH/MAF Dual fusionIGH 14q32.33 1519 Verde

NoMAF 16q23.2 600 Rojo

NF-3007 BCR/ABL1 Dual fusionBCR 22q11.21 1388 Verde

NoABL 9q34.12 640 Rojo

NF-3008ETV6/RUNX1 (TEL/AML1)

Dual fusionETV6 12p13.2 505 Rojo

NoRUNX1 21q22.12 670 Verde

NF-3009 TCF3/PBX1 Dual fusionPBX1 1q23.3 603 Rojo

NoTCF3 19p13.3 730 Verde


NF-3010 PML/RARA Dual fusionPML 15q23.33 450 Rojo

NoRARA 17q21.1 1060 Verde

NF-3011RUNX1T1/RUNX1 (ETO/AML1)

Dual fusionRUNX1T1 8q21.3 734 Rojo

NoRUNX1 21q22.12 672 Verde

NF-3012 IGH/FGFR3 Dual fusionIGH 14q32.33 1519 Verde

NoFGFR3 4p16.3 623 Rojo

NF-3013 TMPRSS2/ERG Dual fusionERG 21q22.13 777 Verde

SiTMPRSS2 21q22.3 873 Rojo

NF-4001 TMPRSS2/ERGTricolor

3'-ERG 21q22.13 426 Rojo

Si5'-ERG 21q22.2 552 Verde

5'-TMPRSS2 21q22.3 529 Azul

NF-4002del(4)(q12)F I P 1 L 1 / C H I C 2 /PDGFRA

Tri fusion

FIP1L1 4q11 500 Verde

NoCHIC2 4q11 470 Rojo

PDGFRA 4q12 481 Azul

CATÁLOGO NIM GEN / Región Diseño Gen Citobanda Tamaño (kb) Color

NF-5001

Leucemia Linfática Crónica

TP53 (p53)/del(13)(q14.2) Copy numberTP53 17p13.1 120 Verde

D13S319 13q14.2 154 Rojo

ATM, del(11)(q22.3)/CEP12 Copy numberATM 11q22.3 732 Verde

Chr12 Centrómero 704 Rojo

NF-5002

Mieloma Múltiple I

IGH Breakapart3'-IGH 14q32.33 641 Verde

5'-IGH 14q32.33 301 Rojo

TP53 (p53) Copy numberTP53 17p13.1 120 Rojo


ONCOLOGÍA - HEMATOLOGÍACatálogo de kits de sondas por tipo de patología


NF-5003

Mieloma Múltiple II

TP53 Copy numberTP53 17p13.1 120 Rojo


IGH/CCND1 Dual fusionIGH 14q32.33 1519 Verde

CCND1 11q13.3 1000 Rojo

IGH/MAF Dual fusionIGH 14q32.33 1519 Verde

MAF 16q23.2 600 Rojo

IGH/FGFR3 Dual fusionIGH 14q32.33 1519 Verde

FGFR3 4p16.3 623 Rojo

NF-5004

Mieloma Múltiple III

TP53 (p53) Copy numberTP53 17p13.1 120 Rojo


IGH/CCND1 Dual fusionIGH 14q32.33 1519 Verde

CCND1 11q13.3 1000 Rojo

IGH/MAF Dual fusionIGH 14q32.33 1519 Verde

MAF 16q23.2 600 Rojo

IGH/FGFR3 Dual fusionIGH 14q32.33 1519 Verde

FGFR3 4p16.3 623 Rojo

1p/1q Myeloma Copy numberCDKN2C 1p32.3 153 Verde

CKS1B 1q21.3 100 Rojo

NF-5005

Sindromes Mielodisplásicos I

del(5)(q31)/EGR1 Copy numberEGR1 5q31.2 184 Rojo

D5S630 5p15.31 370 Verde

del(7)(q31)/D7S486 Copy numberD7S486 7q31.2 200 Rojo


NF-5006

Sindromes Mielodisplásicos II

del(5)(q31)/EGR1 Copy numberEGR1 5q31.2 184 Rojo

D5S630 5p15.31 370 Verde

del(7)(q31)/D7S486 Copy numberD7S486 7q31.2 200 Rojo


CEP8 Copy number Chr8 Centrómero 635 Rojo

del(20)(q12) Copy numberD20S108 20q13.1 200 Rojo



NF-5007

Diagnóstico Prenatal

13q14/ CEP 18 /21q22 Copy number

RB1 13q14.2 522 Verde

DSCR8 21q22.13 494 Rojo

Chr18 Centrómero 711 Azul

CEP X/Y Copy numberChrX Centrómero 587 Verde

ChrY Centrómero 273 Rojo

Síndromes de Microdeleción

NF-2028 22q11.2 DiGeorge TBX1 Copy numberTBX1 22q11.21 68 Rojo

Chr 22 Centrómero 668 Verde

NF-2029 XIST (Xq13.2) Copy numberXIST Xq13.2 161 Rojo

Chr X Centrómero 587 Verde

NF-2030 15q11.2/D15S11 Prader Willi Copy numberD15S11 15q11.2 135 Rojo


NF-2031 GABRB3/15q12 Prader Willi Copy numberGABRB3 15q12 230 Rojo


NF-2032 KAL (Xp22.3) Kallman Copy numberKAL1 Xp22.31 186 Rojo

Chr X Centrómero 587 Verde

NF-2033 YP11.3/SRY Copy number SRY Yp11.31 131 Rojo

Cromosoma Diseño Centrómero CATÁLOGO NIM Color

Chr1 Copy number

CEP1 NF-2035 Rojo/Verde

Subtelómero brazo p NF-2059 Rojo/Verde

Subtelómero brazo q NF-2060 Rojo/Verde

Chr2 Copy number




Chr3 Copy number




GENÉTICA CLÍNICACatálogo de sondas dirigidas a gen o alteración única

GENÉTICA CLÍNICACatálogo de sondas centroméricas


Chr4 Copy number




Chr5 Copy number




Chr6 Copy number




Chr7 Copy number




Chr8 Copy number




Chr9 Copy number




Chr10 Copy number




Chr11 Copy number




Chr12 Copy number




Chr13 Copy number




Chr14 Copy number





Chr15 Copy number




Chr16 Copy number




Chr17 Copy number




Chr18 Copy number




Chr19 Copy number




Chr20 Copy number




Chr21 Copy number




Chr22 Copy number




ChrX Copy number

CEPX NF-2057 Rojo/Verde



ChrY Copy number

CEPY NF-2058 Rojo/Verde



SONDAS DISEÑO ORIGINAL PARA FISHCATÁLOGO NIM Concepto Especificaciones Color

NF-6000-X Disponibles según diseño del investigador Tamaño a elegir Formatos Variables

NF-6001 Sonda PNA Pancentromérica Humana Marca todos los centromeros de todos los cromosomas Color Verde

NF-6002 Sonda PNA Pantelomérica Humana Marca todos los telómeros de todos los cromosomas Color Verde

NF-6003 Sonda PNA Pancentromérica Murina Marca todos los centromeros de todos los cromosomas Color Verde

NF-6004 Sonda PNA Pantelomérica Murina Marca todos los telómeros de todos los cromosomas Color Verde

CATÁLOGO NIM Concepto Formato

NF-R1002 IQFISH Fast Hybridization Buffer 200 20-tests

NF-R1003 IQFISH Fast Hybridization Buffer 200x6 120-tests

CATÁLOGO NIM Concepto Formato

NF-R1004 Hybridization Buffer 10-tests

NF-R1005 Wash Buffer 1 500ml

NF-R1006 Wash Buffer 2 500ml

NF-R1007 Mounting Buffer without DAPI 10-tests

NF-R1008 Mounting Buffer with DAPI 10-tests

NF-R1009 FISH Hybridization Buffer and Mounting Buffer with DAPI 10-tests

NF-R1010 FISH Hybridization Buffer and Mounting Buffer with DAPI 30-tests

NF-R1011 FISH Hybridization Buffer and Mounting Buffer without DAPI 10-tests

NF-R1012 FISH Hybridization Buffer and Mounting Buffer without DAPI 30-tests

Reactivos para FISHMuestras en Parafina

Reactivos para FISHMuestras de Citogenética

Color FluorocromoEspecificaciones

L.O. Excitación L.O. Emisión

Rojo Orange Red 547 nm 565 nm

Verde FITC 495 nm 517 nm

Azul AQUA 429 nm 470 nm

INFORMACIÓN SOBRE FLUOROCROMOS

Sonda Deleción 5q31

Región 5q31 (señal roja)

Región 5p15 control (señal verde)

Sonda Breakapart Gen IGH

3’ IgH (señal verde)

5’ IgH (señal roja)

MADRIDParque Científico de Madrid

Faraday, 7 (Campus de Cantoblanco)28049 Madrid

Tel.+34 91 804 77 60

BRASILRua Elvira Ferraz, nº250, Cj. 211.

Itaim - São Paulo, SP.CEP: 04552-040

Tel. +55 11 3044 1813

MÉXICOWorld Trade Center

Montecito, 38 - Piso 35 - Oficina 10Col. Nápoles - 03810 Ciudad de México

Tel. +52 55 68232076

www.nimgenetics.com / [email protected]

NIMGenetics es un centro de Diagnóstico Genético autorizado por la Consejería de Sanidad y Consumo de la Comunidad de Madrid, inscrito en el Registro correspondiente con el Nº CS 10673

CAT-12; Rev 02; 30/03/2017

catálogo de sondas para hibridación in situ con ... · pdf filechr8...

Documents