centrifugation at 105,000 g for 1h endonuclease
DESCRIPTION
washing with low salt buffer. urea (7 M), thiourea (2M), CHAPS (4% w/v) DTT (15 mM) protease inhibitor cocktail. or. Tris (40 mM) GSH (1 mM) EDTA (0.5 Mm) protease inhibitor cocktail. grounded mechanically under liquid nitrogen passing through a syringe needle sonication - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
centrifugation at 105,000 g for 1hendonuclease
Cultured animal cell lineTissue, E. Coli, yeast..
washing with low salt buffer
grounded mechanically under liquid nitrogenpassing through a syringe needle sonication Dounce homogenization
urea (7 M), thiourea (2M), CHAPS (4% w/v) DTT (15 mM) protease inhibitor cocktail
Tris (40 mM) GSH (1 mM) EDTA (0.5 Mm)protease inhibitor cocktail
or
Serum
Diluted with separation media final protein concentration of 0.5~6.0 mg/ml
FFE 1500V, 25 mA, ~33 minmax. 70 fractions (pH 2.5~11)
1D PAGE
1. 샘플은 1.0~6.0 mg protein 으로 건조되어있는 상태이거나 low salt buffer 에
녹여있는 상태이어야 하며 샘플 당 전체 volume 이 0.1 ml 을 넘지 않도록
해야 합니다 .
2. 최대 5 개 sample 까지 한번에 running 가능하며 , sample 이 예를 들어 7
개인경우에는 2 개 , 5 개 로 나눠 맡기셔야 합니다 . 같은 종류의 샘플도 0.1
ml 또는 전체 단백질량이 6 mg 을 넘을 경우 에는 두개의 샘플로 간주됩니
다 . 자세한 조건은 샘플 의뢰 전에 문의하시기 바랍니다 .
3. Serum 은 전 처리없이 그냥 가져오시면 됩니다 .
4. 모든 샘플은 urea 가 있을 때와 없을 때 둘 다 running 가능합니다 . Running p
rotocol 은 urea 가 들어가는 조건에서는 Low UHGP 을 권장합니다 . Urea 가
들어가지 않는 조건에서는 High HGP 를 사용하는 것이 좋고 , glycerol 이
후처리에 있어서 문제가 되는 경우 protocol MP 를 사용하게되나 , High HGP
에 비해 separation 효율은 좀 떨어집니다 .
5. Fraction 은 최소 14 개에서 최대 70 개까지 얻을 수 있으며 14, 28, 42, 56,
70 개 중에서 선택할 수 있으나 , 56 또는 70 개를 권장합니다 .
6. Focusing range 는 이론상 pH 2.5~11 까지 가능하고 , acidic 또는 basic regi
on 만 선별하여 running 할 수 있으나 , pH 3~10 range 조건을 권장합니다 .
7. Fraction 은 well 당 0.6~0.7 ml 정도 얻어지고 그 농도는 running 한 protein
이 모든 well 로 골고루 퍼졌다고 계산할 때 0.04~0.08 g/l 입니다 . Protei
n 회수율은 ~90% 정도입니다 .
8. Fraction 은 deep well plate(1ml) 에 담아서 드리고 그 중 몇 개 fraction 을
4-12% Bis-Tris 12 well small gels 한 장에 걸어서 첨부하여 드립니다 .
9. Sample preparation 과정은 제시된 비용에 포함되어 있지 않습니다 .
10. Sample preparation 과정에서의 buffer 조성 (urea, salt 농도 , detergent) 은
의뢰 전에 반드시 문의하시기 바랍니다 .
FEE sample running
Media Inlet
Anodic stabilization med.
Separation medium 1
Separation medium 2
Separation medium 3
Cathodic stabilization med.
Counter flow
Running condition
Voltage 1500 V
Current mA
Temperature 10 °C
Media Pump Flow rate ml/h
Sample Pump Flow rate ml/h
Title
Date:
Sample
Sample preparation
method
inlet I
Dilution media Separation medium
Dilution factorDissolved Total precipitate with Separation medium
Diluted with Separation medium
Concentration mg/ml
Total amount ml
Amount per well ml
Protocol Sample No.
Protocol (urea M 농도 , 다른시약 % 농도 ),
MP Mannitol 4.56 Prolyte 25
MGP Mannitol 4.56 Glycerol 25 Prolyte 25
UMP Urea 8 Mannitol 4.0 Prolyte 25
High HP HPMC 0.2 Prolyte16.6
High HGP HPMC 0.2 Glycerol 25 Prolyte16.6
High UHGP Urea 8 HPMC 0.12 Glycerol 14.5 Prolyte 14.5
Low HGP HPMC 0.05 Glycerol 25 Prolyte16.6
Low UHGP Urea 8 HPMC 0.03 Glycerol 14.5 Prolyte 14.5
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12A
B
C
D
E
F
G
H
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
NuPAGE (invitrogen 4-12% Bis-Tris gel)