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Chimica Organica II
Acidi nucleici: un copolimero fosfato-ribosio
La differenza tra RNA e DNA sta nell’assenza dell’ossidrile 2’ del ribosio nel secondo, che rende la macromolecola molto più stabile all’idrolisi
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Chimica Organica II
Acidi nucleiciLa minor stabilità dell’RNA è dovuta al fatto che l’ossidrile in 2’ può agire come nucleofilo intramolecolare. A pH 7 e 25 °C il tempo di semivita del’RNA è di 100 anni, quello del DNA è 100 milioni di anni
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Chimica Organica II
Acidi nucleici: nuclobasi
purina pirimidina
adenina guanina citosina uracile timina
RNA DNA
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Chimica Organica II
Acidi nucleici: nucleosidi
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Chimica Organica II
Acidi nucleici: nucleotidi
Adenosina 5’-monofososfatoUn ribonuclotide
2’-desossicitidina 3’-monofososfatoUn desossiribonuclotide
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Chimica Organica II
Acidi nucleici: base pairing
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Chimica Organica II
Acidi nucleici: coppie di basi
Coppie di basi di Watson e Crick
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Chimica Organica II
Acidi nucleici: doppia elica
Minor groove
Major groove
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Chimica Organica II
Acidi nucleici: doppia elica
G-quadruplex
Sono note altre strutture oltre alla doppia elica B
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Chimica Organica II
Acidi nucleici: interazione con le proteine
Soppressore di trascrizione legato all’elica B nei major grooves
Enzima di restrizione EcoRV legato al DNA
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Chimica Organica II
Acidi nucleici: duplicazione del DNA
Le DNA polimerasi possono estendere un DNA solo in direzione 5’ –3’
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Chimica Organica II
Acidi nucleici: trascrizione del DNA
Una RNA polimerasi copia la sequenza bersaglio in un RNA messaggero
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Chimica Organica II
Acidi nucleici: sintesi delle proteine
Il ribosoma contiene m-RNA come elemento attivo
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Chimica Organica II
Nucleotidi ed energia: ATP
ATP + H20 = ADP + idrogeno fosfato - 7.3 Kcal/mol
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Chimica Organica II
Nucleotidi ed energia: ATP
La reazione non avviene: il gruppo uscente è troppo povero
ATP è molto reattiva, reagisce con l’acetato fosforilandolo. Quest’ultimo derivato è sufficientemente reattivo da reagire con il tiolo.