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Consejo Nacional de Ciencia y TecnologíaCentro de Investigación en Matemáticas, A.C.
Estimaciones de la Tasa de Reproducción EfectivaRt de COVID-19 para los Estados y Zonas
Metropolitanas de México
27 de Mayo de 2020
Reporte realizado por:Dra. Graciela González FaríasM.en C. Domingo Iván Rodríguez González
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CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA
CENTRO DE INVESTIGACIÓN EN MATEMÁTICAS, A.C.
27 de Mayo de 2020
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Tabla de Contenidos
1 Estimaciones de Rt en Orden Ascendente . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41.1 Estimaciones de Rt por Estado en Orden Ascendente 5
1.2 Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana en Orden Ascendente 6
2 Estimaciones de Rt por Estado . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
3 Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19
4 Metodología de Estimación de Rt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 294.1 Metodología para la Estimación del Rt. 304.1.1 Datos de entrada para la estimación . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 304.1.2 Estimación de la tasa de reproducción efectiva Rt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
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1. Estimaciones de Rt en Orden Ascendente
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1.1 Estimaciones de Rt por Estado en Orden Ascendente 5
1.1 Estimaciones de Rt por Estado en Orden Ascendente
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día27 de Mayo de 2020
La figura 1.1 muestra las estimaciones del Rt para los 32 estados de México, ordenados demanera ascendente. Se tomaron los datos de nuevos casos hasta el día 21 de Mayo de 2020. Enverde se muestran los estados para los que el Rt estimado es menor a 1. Se incluyen los intervalosde máxima densidad del 50 % y 90 %.
MÉX
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DURA
NGO
COLI
MA
0.5
0.0
0.5
1.0
1.5
2.0
2.5
3.0
R t
Rt más reciente por EstadoRt>1Rt
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6 Capítulo 1. Estimaciones de Rt en Orden Ascendente
1.2 Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana en Orden Ascendente
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día27 de Mayo de 2020
La figura 1.2 muestra las estimaciones del Rt para las 25 Zonas Metropolitanas con mayornúmero de casos confirmados de COVID-19, ordenadas de manera ascendente. Se tomaron los datosde nuevos casos hasta el día 21 de Mayo de 2020. En verde se muestran las zonas metropolitanaspara las que el Rt estimado es menor a 1. Se incluyen los intervalos de máxima densidad del 50 %y 90 %.
Valle
de
Méx
ico
Tiju
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Pach
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0.5
0.0
0.5
1.0
1.5
2.0
2.5
3.0
R t
Rt más reciente por Zona MetropolitanaRt>1Rt
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2. Estimaciones de Rt por Estado
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8 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día27 de Mayo de 2020
A contiuación se muestran las gráficas del comportamiento de la tasa Rt a lo largo del tiempopara los 32 estados de México. La fecha inicial se toma a partir de la cual existen datos suficientespara hacer la estimación, mientras que la fecha final corresponde al 21 de Mayo de 2020, es decir,7 días anteriores de la fecha de elaboración de este reporte.
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
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4.0
5.0
(Rt)
1.48Rt más reciente
AGUASCALIENTES
716 casos totales31 defunciones totales
2020-03-14 fecha de inicio49.91 casos por 100mil habitantes0.92 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
0.97Rt más reciente
BAJA CALIFORNIA
4590 casos totales771 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio126.28 casos por 100mil habitantes5.88 % de casos a nivel nacional
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9
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
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(Rt)
1.20Rt más reciente
BAJA CALIFORNIA SUR
557 casos totales33 defunciones totales
2020-03-18 fecha de inicio69.22 casos por 100mil habitantes0.71 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
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5.0
(Rt)
1.24Rt más reciente
CAMPECHE
486 casos totales59 defunciones totales
2020-03-08 fecha de inicio48.57 casos por 100mil habitantes0.62 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
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(Rt)
1.31Rt más reciente
COAHUILA
965 casos totales72 defunciones totales
2020-02-28 fecha de inicio29.98 casos por 100mil habitantes1.24 % de casos a nivel nacional
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10 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.64Rt más reciente
COLIMA
128 casos totales19 defunciones totales
2020-03-14 fecha de inicio16.30 casos por 100mil habitantes0.16 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0(R
t)1.36
Rt más reciente
CHIAPAS
1402 casos totales106 defunciones totales
2020-02-29 fecha de inicio24.47 casos por 100mil habitantes1.80 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
0.93Rt más reciente
CHIHUAHUA
1356 casos totales285 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio35.67 casos por 100mil habitantes1.74 % de casos a nivel nacional
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11
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
0.93Rt más reciente
CIUDAD DE MÉXICO
21826 casos totales1945 defunciones totales
2020-02-27 fecha de inicio242.01 casos por 100mil habitantes27.97 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.50Rt más reciente
DURANGO
279 casos totales32 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio14.93 casos por 100mil habitantes0.36 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.28Rt más reciente
GUANAJUATO
1238 casos totales101 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio19.88 casos por 100mil habitantes1.59 % de casos a nivel nacional
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12 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
0.91Rt más reciente
GUERRERO
1421 casos totales217 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio38.86 casos por 100mil habitantes1.82 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0(R
t)1.33
Rt más reciente
HIDALGO
1479 casos totales234 defunciones totales
2020-02-27 fecha de inicio47.92 casos por 100mil habitantes1.90 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.42Rt más reciente
JALISCO
1355 casos totales126 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio16.11 casos por 100mil habitantes1.74 % de casos a nivel nacional
-
13
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
0.76Rt más reciente
MÉXICO
13140 casos totales1393 defunciones totales
2020-02-28 fecha de inicio75.40 casos por 100mil habitantes
16.84 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.19Rt más reciente
MICHOACÁN
1613 casos totales138 defunciones totales
2020-03-18 fecha de inicio33.43 casos por 100mil habitantes2.07 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.22Rt más reciente
MORELOS
1264 casos totales251 defunciones totales
2020-03-09 fecha de inicio61.84 casos por 100mil habitantes1.62 % de casos a nivel nacional
-
14 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.38Rt más reciente
NAYARIT
476 casos totales44 defunciones totales
2020-03-18 fecha de inicio36.94 casos por 100mil habitantes0.61 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0(R
t)1.29
Rt más reciente
NUEVO LEÓN
1288 casos totales77 defunciones totales
2020-03-10 fecha de inicio22.96 casos por 100mil habitantes1.65 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.26Rt más reciente
OAXACA
1144 casos totales122 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio27.61 casos por 100mil habitantes1.47 % de casos a nivel nacional
-
15
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.20Rt más reciente
PUEBLA
2458 casos totales307 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio37.22 casos por 100mil habitantes3.15 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.34Rt más reciente
QUERÉTARO
786 casos totales80 defunciones totales
2020-03-10 fecha de inicio34.48 casos por 100mil habitantes1.01 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.18Rt más reciente
QUINTANA ROO
1729 casos totales323 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio100.33 casos por 100mil habitantes2.22 % de casos a nivel nacional
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16 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.49Rt más reciente
SAN LUIS POTOSÍ
786 casos totales46 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio27.42 casos por 100mil habitantes1.01 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0(R
t)0.93
Rt más reciente
SINALOA
2903 casos totales427 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio91.96 casos por 100mil habitantes3.72 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.00Rt más reciente
SONORA
1613 casos totales100 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio52.46 casos por 100mil habitantes2.07 % de casos a nivel nacional
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17
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.00Rt más reciente
TABASCO
3484 casos totales438 defunciones totales
2020-03-17 fecha de inicio135.44 casos por 100mil habitantes4.47 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.21Rt más reciente
TAMAULIPAS
1360 casos totales87 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio37.25 casos por 100mil habitantes1.74 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.35Rt más reciente
TLAXCALA
944 casos totales130 defunciones totales
2020-03-23 fecha de inicio68.41 casos por 100mil habitantes1.21 % de casos a nivel nacional
-
18 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.03Rt más reciente
VERACRUZ
3374 casos totales444 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio39.51 casos por 100mil habitantes4.32 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.30Rt más reciente
YUCATÁN
1602 casos totales130 defunciones totales
2020-03-12 fecha de inicio70.91 casos por 100mil habitantes2.05 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.40Rt más reciente
ZACATECAS
261 casos totales29 defunciones totales
2020-03-16 fecha de inicio15.66 casos por 100mil habitantes0.33 % de casos a nivel nacional
-
3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
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20 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día27 de Mayo de 2020
A contiuación se muestran las gráficas del comportamiento de la tasa Rt a lo largo del tiempopara las 25 Zonas Metropolitanas con mayor número de casos de COVID-19. La fecha inicial setoma a partir de la cual existen datos suficientes para hacer la estimación, mientras que la fechafinal corresponde al 21 de Mayo de 2020, es decir, 7 días anteriores de la fecha de elaboración deeste reporte.
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
0.86Rt más reciente
Valle de México
33172 casos totales3200 defunciones totales
2020-02-27 fecha de inicio151.18 casos por 100mil habitantes42.52 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.03Rt más reciente
Villahermosa
2204 casos totales270 defunciones totales
2020-03-18 fecha de inicio247.96 casos por 100mil habitantes2.82 % de casos a nivel nacional
-
21
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
0.91Rt más reciente
Tijuana
2197 casos totales540 defunciones totales
2020-03-17 fecha de inicio109.24 casos por 100mil habitantes2.82 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.27Rt más reciente
Puebla-Tlaxcala
2161 casos totales239 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio67.97 casos por 100mil habitantes2.77 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.03Rt más reciente
Mexicali
2132 casos totales192 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio196.05 casos por 100mil habitantes2.73 % de casos a nivel nacional
-
22 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.22Rt más reciente
Veracruz
1565 casos totales148 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio163.62 casos por 100mil habitantes2.01 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0(R
t)1.06
Rt más reciente
Culiacán
1522 casos totales256 defunciones totales
2020-03-17 fecha de inicio158.07 casos por 100mil habitantes1.95 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.03Rt más reciente
Toluca
1355 casos totales69 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio56.98 casos por 100mil habitantes1.74 % de casos a nivel nacional
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23
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.13Rt más reciente
Cancún
1279 casos totales244 defunciones totales
2020-03-12 fecha de inicio147.39 casos por 100mil habitantes1.64 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.26Rt más reciente
Monterrey
1230 casos totales74 defunciones totales
2020-03-10 fecha de inicio23.96 casos por 100mil habitantes1.58 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.28Rt más reciente
Mérida
1139 casos totales82 defunciones totales
2020-03-12 fecha de inicio92.03 casos por 100mil habitantes1.46 % de casos a nivel nacional
-
24 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.41Rt más reciente
Guadalajara
896 casos totales85 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio17.09 casos por 100mil habitantes1.15 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0(R
t)0.99
Rt más reciente
Juárez
880 casos totales230 defunciones totales
2020-03-14 fecha de inicio60.07 casos por 100mil habitantes1.13 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
0.98Rt más reciente
Acapulco
870 casos totales81 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio94.59 casos por 100mil habitantes1.12 % de casos a nivel nacional
-
25
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.32Rt más reciente
Oaxaca
667 casos totales53 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio95.45 casos por 100mil habitantes0.85 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.16Rt más reciente
Cuernavaca
657 casos totales142 defunciones totales
2020-03-14 fecha de inicio62.01 casos por 100mil habitantes0.84 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.31Rt más reciente
Querétaro
619 casos totales60 defunciones totales
2020-03-10 fecha de inicio41.88 casos por 100mil habitantes0.79 % de casos a nivel nacional
-
26 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.50Rt más reciente
Tuxtla Gutiérrez
592 casos totales28 defunciones totales
2020-02-29 fecha de inicio65.76 casos por 100mil habitantes0.76 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0(R
t)1.37
Rt más reciente
Aguascalientes
591 casos totales30 defunciones totales
2020-03-14 fecha de inicio51.67 casos por 100mil habitantes0.76 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.51Rt más reciente
Pachuca
579 casos totales74 defunciones totales
2020-02-27 fecha de inicio95.21 casos por 100mil habitantes0.74 % de casos a nivel nacional
-
27
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.44Rt más reciente
León
556 casos totales21 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio29.56 casos por 100mil habitantes0.71 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.15Rt más reciente
Hermosillo
556 casos totales11 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio58.77 casos por 100mil habitantes0.71 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.18Rt más reciente
Tampico
498 casos totales17 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio50.79 casos por 100mil habitantes0.64 % de casos a nivel nacional
-
28 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.37Rt más reciente
Tlaxcala-Apizaco
474 casos totales47 defunciones totales
2020-03-23 fecha de inicio80.79 casos por 100mil habitantes0.61 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 10 Mar 19 Mar 28 Apr 06 Apr 15 Apr 24 May 03 May 12 May 21Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
(Rt)
1.12Rt más reciente
Mazatlán
450 casos totales41 defunciones totales
2020-03-23 fecha de inicio84.31 casos por 100mil habitantes0.58 % de casos a nivel nacional
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4. Metodología de Estimación de Rt
-
30 Capítulo 4. Metodología de Estimación de Rt
4.1 Metodología para la Estimación del Rt.A continuación se resume la metodología utilizada para estimar el valor de la tasa de repro-
ducción Rt cada día por Estados y Zonas Metropolitanas de la República Mexicana. La cual estábasada en la propuesta del sitio Estimating COVID-19’s Rt in Real-Time [1], que estima los valoresde Rt para los Estados Unidos de América.
Esta tasa de reproducción es una medida de la rapidez con la que se trasmite la enfermedadCOVID-19, pues se refiere al número promedio de personas que son infectadas por una personainfecciosa. Si el valor de Rt es superior a 1.0, la enfermedad continúa su expansión, mientras quesi es menor a 1.0 la expansión se está deteniendo.
4.1.1 Datos de entrada para la estimaciónLos datos a partir de los cuáles se estiman los valores de Rt corresponden a la información
oficial provista por el Gobierno de México, a través de su portal de acceso abierto, respecto a loscasos confirmados de COVID-19 en el país (ver el sitio).
Mediante estos datos se determina la serie de nuevos casos confirmados por día para cada unode los estados, tomando como fecha el día de presentación de los síntomas de cada individuo. Sedescartan los datos correspondientes a los últimos 7 días. La siguiente gráfica muestra los nuevoscasos diarios para la Ciudad de México hasta el 26 de abril.
4.1.2 Estimación de la tasa de reproducción efectiva RtSe estima la probabilidad a posteriori P (Rt|k) utilizando el Teorema de Bayes, donde t es el
día y k es el número de casos nuevos de COVID-19 en ese día:
P (Rt|k) =P (k|Rt) · P (Rt)
P (k)(4.1)
https://github.com/k-sys/covid-19/blob/master/Realtime%20R0.ipynbhttps://datos.gob.mx/busca/dataset/informacion-referente-a-casos-covid-19-en-mexico
-
4.1 Metodología para la Estimación del Rt. 31
La probabilidad a priori P (Rt) se calcula a partir de la probabilidad a priori del día anteriorP (Rt−1), asumiendo que P (Rt|Rt−1) sigue una distribución normal centrada en Rt−1, es decirN(Rt−1, σ).
Para la verosimilitud P (k|Rt) se propone una distribución Poisson:
P (k|Rt) =λke−λ
k!(4.2)
con parámetro λ = kt−1eγ(Rt−1), que depende del número de casos nuevos del día anterior y delparámetro γ = 1/7, pues el invervalo serial es de 7 días.
Para estimar la posterior P (Rt|k) del día t, se fija k, pues se conoce el número de nuevoscasos en el día t, y se varía Rt en un rango propuesto entre 0 y 12. Se repite el proceso de maneraiterativa para calcular la probabilidad posterior para cada día de la serie. La siguiente figura muestralas posteriores diarias obtenidas para la Ciudad de México.
Finalmente para cada día se calculan los intervalos de máxima densidad (HDI) para el 50 %y el 90 %, así como el valor de máxima verosimilitud (ML), a partir de la posterior P (Rt|k). Lasiguiente tabla muestra los valores estimados para 5 días de la Ciudad de México.
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Referencias
[1] Systrom K. (2020). Estimating COVID-1’s Rt in Real-Time. Del sitio https://github.com/k-sys/covid-19/blob/master/Realtime%20R0.ipynb
[2] Systrom K., Vladeck T. & Krieger M. (2020). Rt Covid-19. Del sitio https://rt.live/
https://github.com/k-sys/covid-19/blob/master/Realtime%20R0.ipynbhttps://github.com/k-sys/covid-19/blob/master/Realtime%20R0.ipynbhttps://rt.live/
Estimaciones de Rt en Orden AscendenteEstimaciones de Rt por Estado en Orden AscendenteEstimaciones de Rt por Zona Metropolitana en Orden Ascendente
Estimaciones de Rt por EstadoEstimaciones de Rt por Zona MetropolitanaMetodología de Estimación de RtMetodología para la Estimación del Rt.Datos de entrada para la estimaciónEstimación de la tasa de reproducción efectiva Rt