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Novembre 2011

RAPPORT FINAL › Référence

Projet CORAF/WECARD - Labo d’excellence

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Dr Nazaire K. Kouassi, Rapport Final - Evaluation des Capacités des Laboratoires Nationaux etRégionaux d’Afrique de l’Ouest qui pourraient servir de Centre d’excellence de la CEDEAO et duCORAF/WECARD en Biotechnologie et Biosécurité© CORAF/WECARD 2012

Le CORAF/WECARD encourage l’utilisation équitable sans permission des informations publiées dansle présent rapport à des fins de recherche agricole, de développement et d’éducation. Touteréférence doit se faire de façon appropriée. Les désignations utilisées dans la présentation desinformations publiées dans la présente publication n’impliquent de la part du CORAF/WECARD aucuneprise de position quant au statut juridique d’un pays, d’un territoire, d’une ville, d’une zone ou de leursautorités ni au tracé de leurs frontières ou limites.

CORAF/WECARD7, Avenue BourguibaBP 48 CP, 18523 Dakar SénégalEmail : [email protected] Internet : www.coraf.org

ISBN …

Références photographiques : CORAF/WECARD

Référence

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Cette étude a été commanditée par le CORAF/WECARD dans le cadre de la mise en place du « Pland’Action pour le Développement de la Biotechnologie et de la Biosécurité en Afrique de l’Ouest»(PADBBAO). L’objectif global est de développer la biotechnologie agricole dans l’espace CEDEAO àtravers des centres d’excellence nationaux et régionaux spécialisés en biotechnologie et biosécurité.Le PADBBAO a, en effet, défini explicitement comme action prioritaire à mener l’identification et ledéveloppement des capacités des centres d’excellence opérant en Afrique de l’Ouest, et ce,conformément aux recommandations de la Conférence ministérielle de Ouagadougou.

Cette étude, initialement prévue pour une période d’un mois (septembre-octobre 2010), a connu unretard dû au climat d’insécurité découlant de la crise politico-sociale qu’a vécue la Côte d’Ivoired’octobre 2010 à mai 2011. En outre, les événements liés aux élections présidentielles au Nigeria aupremier trimestre 2011 n’ont pas permis d’effectuer la visite des laboratoires présélectionnés dans cepays.

Nous exprimons notre gratitude au Secrétariat Exécutif du CORAF/WECARD, institution qui a initié etcommandité cette étude, pour son rôle déterminant dans la recherche et le développementagricoles, et en particulier dans la promotion des biotechnologies en Afrique de l’Ouest et du Centre.

Nous adressons nos remerciements aux directeurs des institutions et aux responsables des laboratoiresvisités pour leur disponibilité et leur compréhension.

Avant-propos


RAPPORT FINAL › Avant-propos

Remarques

Lors de l’enquête dans les différents laboratoires, pour des raisons diverses, certainsaspects du questionnaire n’ont pas été renseignés comme il aurait fallu. Ainsi les résultatsexposés dans certains tableaux de ce rapport connaissent des insuffisances que nouscorrigerons dès que les personnes-ressources des différents laboratoires concernéscommuniqueront les données manquantes.

RAPPORT FINAL › S O M M A I R E


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Avant-propos 05Résumé exécutif 07Liste des sigles 10Liste des tableaux 12Liste des figures 12

I. CONTEXTE ET JUSTIFICATION 14

II. RAPPEL DE QUELQUES NOTIONS SUR LA BIOTECHNOLOGIE ET LA BIOSECURITE 16

2.1 Définition de la biotechnologie 162.2 Applications de la biotechnologie 162.3 Biosécurité : prévention et gestion des risques liés aux OGM 18

III. EVALUATION DES CAPACITES DE LABORATOIRES DE L’AFRIQUEDE L’OUEST EN MATIERE DE BIOTECHNOLOGIE ET DE BIOSECURITE 20

3.1 Problématique 203.2 Méthodologie utilisée dans le cadre de l’étude 213.3 Résultats 21

3.3.1 Domaines d’activités et spécialités des laboratoires 213.3.2 Activités en cours et techniques utilisées 243.3.3 Capacités en infrastructures et équipements techniques

des laboratoires 383.3.4 Capacités humaines des laboratoires

et encadrement d’étudiants 453.3.5 Aptitude à la production scientifique 513.3.6 Aptitude des laboratoires à la collaboration

nationale, régionale et internationale 543.3.7 Forces et faiblesses des laboratoires visités 643.3.8 Besoins en renforcement des capacités des laboratoires 703.3.9 Rôles potentiels des laboratoires et stratégies envisagées 863.3.10 Dispositifs de biosécurité dans les pays abritant les laboratoires visités 93

IV. DISCUSSION 96

V. MISE EN RÉSEAU DES LABORATOIRES 100

VI. TRANSFERT DE TECHNOLOGIES 102

6.1 Des laboratoires du Nord vers les laboratoires d’excellence 1026.2 Des laboratoires d’excellence vers les laboratoires du groupe

de spécialité ou les SNRA 102

VII. CONCLUSION ET RECOMMANDATIONS 104

SOMMAIRE

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a. L’évaluation des principaux laboratoires de biotechnologie de la région, y compris les laboratoiresdes systèmes nationaux et des institutions internationales, a été effectuée sous l’égide duCORAF/WECARD. Il s’agissait d’évaluer les capacités techniques des laboratoires nationaux etrégionaux pouvant servir de centres d’excellence dans la zone CEDEAO afin d’identifier leslaboratoires ayant les meilleurs potentiels et d’apprécier également leurs faiblesses. Au terme decette évaluation, il s’agit de proposer des mesures devant permettre un renforcement des capacitésdes laboratoires en fonction de leurs avantages comparatifs.

b. Une séance de travail préliminaire s’est tenue au secrétariat du CORAF à Dakar au Sénégal avecles gestionnaires des programmes du CORAF/WECARD. Au cours de cette séance, la méthodologied’évaluation des centres d’excellence a été présentée et validée. En outre, une liste de 23laboratoires de biotechnologies agricoles, localisés dans sept pays de la sous-région (zone CEDEAO)a été élaborée sur la base des données antérieures disponibles.

c. Les missions d’enquête-évaluation des laboratoires présélectionnés se sont déroulées dans lesdifférents pays selon l’ordre suivant : la Gambie, le Sénégal, le Mali, le Burkina Faso, la Côte d’Ivoire,le Ghana et le Nigeria. Au cours de ces missions, 23 laboratoires appartenant à 19 différentesinstitutions mères ont été visités.

d. Dans chaque laboratoire présélectionné, une séance de travail avec les personnes-ressourcesdésignées par les responsables des institutions ou des laboratoires a été organisée afin d’expliqueret de renseigner la fiche d’évaluation. Elle a été suivie d’une visite des locaux permettantd’apprécier l’aspect général du laboratoire et de réaliser des prises de vues afin de disposer dedonnées numériques des équipements.

e. Les laboratoires sont classés en trois grands types en fonction de leur spécialisation : productionvégétale, production animale ou les deux domaines à la fois. Au total, 24 spécialités différentesregroupées en six domaines ont été répertoriées dans les laboratoires visités. Ces domaines varientd’un laboratoire à un autre, chacun des laboratoires pouvant servir en biotechnologie et/ou enbiosécurité en Afrique de l’Ouest.

f. Les six domaines recensés dans les laboratoires visités sont la biotechnologie végétale, labiotechnologie animale et halieutique, les ressources génétiques, l’environnement et la biosécurité,l’agroalimentaire et la sécurité sanitaire et enfin l’adaptation au changement climatique.

g. Les activités de biotechnologies et /ou biosécurité en cours dans les différents laboratoires visitéssont très diversifiées et ont des niveaux de densité très variés. Ces activités portent sur les végétaux,les animaux et les microorganismes (champignons, virus, bactéries et levures).

h. Les techniques utilisées pour mener les activités dans ces laboratoires vont de la culture in vitro (micropropagation, embryogénèse somatique, culture de méristème et d’anthère) à la transformationgénétique en passant par l’amplification de l’ADN et ses dérivés (PCR, RT-PCR, Real Time PCR), leclonage, le séquençage, les microfarads, les marqueurs et autres outils moléculaires d’étude de ladiversité (RAPD, AFLP, SSR, SNP).

RESUME EXECUTIF


RAPPORT FINAL › RESUME EXECUTIF



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i. Les techniques de base en biologie moléculaire et en biologie cellulaire sont utilisées par tous leslaboratoires ; certains laboratoires utilisent des techniques additionnelles spécifiques en fonction deleurs domaines et de leurs activités. La technique de base en biologie moléculaire la pluscommunément utilisée est la PCR.

j. La transformation génétique est annoncée dans certains laboratoires visités. Cependant, elle n’estpas pratiquée effectivement sur site pour le moment, mais dans des laboratoires partenairesrégionaux ou internationaux dans le cadre d’une collaboration Sud-Sud ou Sud-Nord.

k. Au plan des infrastructures et des équipements, la majorité des laboratoires disposent de sallesspacieuses, adaptées à leurs domaines de recherche. De même, les laboratoires présentent engénéral un niveau d’équipement assez important, mais il existe d’un laboratoire à un autre desdifférences en termes de qualité et de quantité.

l. Au niveau institutionnel, les pays abritant les laboratoires visités se sont dotés de cadres debiotechnologie et biosécurité. Cependant, concernant la loi sur la biosécurité, deux des pays visités(la Côte d’Ivoire et la Gambie) n’en disposaient pas au moment de l’enquête.

m. L’insuffisance de capacités humaines constitue l’une des faiblesses des laboratoires en matière debiotechnologies. En effet, seul le laboratoire LCV-MEP au Mali présente un effectif relativementimportant de 33 chercheurs. Les autres laboratoires disposent d’effectifs en chercheurs variant entre3 et 15.

n. L’effectif du personnel d’appui technique à la recherche varie d’un laboratoire à un autre. Lelaboratoire (LaGeFaGe) de l’université d’Abobo-Adjamé (RCI) ne dispose d’aucun technicienspécialisé, les laboratoires CERAAS-ISRA et LCBV-UCAD (Sénégal) ont chacun deux techniciensspécialisés quand les autres laboratoires disposent d’un effectif compris entre 3 à 34.

o. Concernant la formation, 15 des 23 laboratoires (soit 65%) encadrent beaucoup plus d’étudiantsde niveau 3è cycle (DEA, master II et doctorat) que de stagiaires de niveau 2è et 1è cycles (BSc,maîtrise, licence, DUT et BTS). Au niveau du 3è cycle, sept laboratoires (soit 30%) ont de bonnesdispositions à la formation (au moins deux stagiaires de 3è cycle formés par laboratoire et par an).Il est à remarquer que le laboratoire LAPGBV-IPR (Mali) forme par an un peu plus de 20 stagiaires de2è et 1è cycles et que le BGEAL-SHESTCO (Nigeria) en forme 45.

p. Dans les laboratoires visités, le nombre de productions scientifiques des cinq dernières années parlaboratoire est compris entre 2 et 80. De même, le nombre de revues scientifiques concernées parces publications varie entre 1 et 45 par laboratoire. Le Laboratoire de Biotechnologies Animales(LBA-CIRDES, Burkina Faso) se démarque des autres laboratoires par le nombre exceptionnel de 80publications parues dans 45 revues scientifiques différentes au cours des cinq dernières années.

q. Il existe, dans les pays concernés, un nombre relativement élevé de laboratoires nationaux etrégionaux collaborant déjà avec les laboratoires visités ; ces laboratoires pourraient, chacun danssa spécialité, assister les laboratoires dans le cadre de la mise en œuvre du Plan d’Action pour leDéveloppement de la Biotechnologie et de la Biosécurité en Afrique de l’Ouest (PDBBAO).

r. Les laboratoires visités sont beaucoup plus ouverts sur le plan international que sur le plan régional.Ainsi, par laboratoire visité, on note en moyenne, au niveau régional, 3,5 laboratoires ou institutionspartenaires et, au niveau international, 4,5 laboratoires ou institutions partenaires.

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s. Sur la base des dix critères définis pour évaluer les forces et les faiblesses de chaque laboratoire, troisgroupes de laboratoires se distinguent : les laboratoires ayant plus de forces que de faiblesses, leslaboratoires dont les forces et les faiblesses sont approximativement équilibrées et les laboratoiresprésentant plus de faiblesses que de forces.

t. En matière de renforcement des capacités, le Laboratoire d’Agro-physio-génétique et deBiotechnologies Végétales (LAPGBV-IPR, Mali) a exprimé les besoins en équipements les plusimportants; il est suivi des laboratoires de Microbiologie et Laboratoires Associés (LMLA-IRSAT, BurkinaFaso) et Biotechnology Laboratory (BL-NACGRAB, Nigeria). Des équipements de pointe, tels queséquenceur automatique d’ADN, machine à PCR quantitative (qPCR), spectrophotomètred’absorption atomique, LICOR pour SNPs, sont sollicités par les laboratoires visités.

u. Les besoins exprimés sont liés à la taille des laboratoires et à l’importance des travaux en perspective.Dans ce contexte, ces besoins peuvent être qualifiés de raisonnables, même si certains laboratoiresexpriment des besoins qui semblent démesurés pour un renforcement des capacités. Ces besoinstraduisent la volonté des laboratoires d’améliorer leurs potentialités pour relever les défis à venir.

v. Le recrutement de chercheurs (niveau doctorat), ingénieurs de recherche, techniciens supérieurset techniciens est sollicité. Les spécialités demandées couvrent tous les domaines de la recherche(moléculaire, génétique, microbiologie, biochimie, reproduction, entomologie, etc.). Le nombre dechercheurs à recruter varie, selon les laboratoires, entre 1 et 11. La formation de chercheurs et detechniciens est également réclamée. Les besoins exprimés par certains laboratoires sont enadéquation parfaite avec les faiblesses en capacités humaines révélées par l’étude.

w. Les laboratoires visités ont identifié 47 laboratoires du Nord avec lesquels ils souhaitent collaborer,dans le cadre de la mise en œuvre du PADBBAO, pour la réalisation de différents types de travaux.Ces vœux ont pour raisons : la compétence, la longue expérience, la grande expertise, latechnicité, le plateau technique avancé des laboratoires dont le partenariat est sollicité, ainsi quel’aide financière ou l’appui à la formation qu’ils peuvent apporter. Dans certains cas, cettecollaboration existe déjà.

x. S’agissant des rôles et des stratégies envisagés par les laboratoires visités pour le renforcement deleurs capacités, différentes préoccupations ont été exprimées par les laboratoires en fonction deleurs spécificités. Presque tous les laboratoires ont souhaité fonctionner sous un statut hybride(laboratoire à mandat national et régional).

y. De façon générale, les laboratoires envisagent des stratégies en rapport avec les faiblessesidentifiées au cours de l’étude et avec les rôles qu’ils souhaitent jouer.



RAPPORT FINAL › LISTE DES SIGLES


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LISTE DES SIGLES

ADN Acide désoxyribonucléiqueADRAO Association pour le Développement de la Riziculture en Afrique de l'Ouest

AIEA Agence Internationale de l’Énergie AtomiqueARN Acide ribonucléique

BC Biotechnology Centre BGEAL Biotechnology and Genetic Engineering Advanced Laboratory

BL Biotechnology LaboratoryBt Bacillus thuringiensis

CDB Convention sur la diversité biologiqueCEDEAO Communauté Économique des États de l’Afrique de l’OuestCERAAS Centre d’Etude Régional pour l’Amélioration de l’Adaptation à la Sécheresse

GCRAI/CGIAR Groupe Consultatif sur la Recherche Agricole InternationaleCIAT Centre International d’Agriculture Tropicale

CIRAD Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour leDéveloppement

CIRDES Centre International de Recherche-Développement sur l'Elevage en Zone SubhumideCNRA* Centre National de Recherche Agronomique / Bambey, SénégalCNRA Centre National de Recherche Agronomique /Abidjan, Côte d’Ivoire

CORAF Conseil Ouest et Centre Africain pour la recherche et le développement agricolesCPG Chromatographie en phase gazeuseCRI Crop Research Institute

CSIR Council for Scientific and Industrial Research DLS Department of Livestock Services, USDA-ARS Miami

ECOWAS Economic Community of West African StatesELISA Essai d'immuno-absorption enzymatiqueFAO Organisation des Nations Unies pour l’Alimentation et l’AgricultureFEM Fonds pour l’Environnement Mondial

GMO Genetically Modified OrganismsHPLC High Performance Liquid ChromatographyICCO Organisation Internationale du Cacao

ICGEB International Centre for Genetic Engineering and BiotechnologyICRISAT Institut International de Recherche sur les Cultures des Zones Tropicales Semi-arides

IER Institut d’Economie RuraleIITA Institut International pour l’Agriculture Tropicale

INERA Institut de l'Environnement et de Recherches Agricoles [Burkina Faso]INRAB Institut National de Recherche Agronomique du Bénin

IPR Institut Polytechnique RuralIRD Institut de Recherche pour le Développement

IRSAT Institut de Recherche en Sciences Appliquées et TechnologiesISRA Institut Sénégalais de Recherches Agricoles

ITC International Trypano-tolerance Center ITRAD Institut Tchadien de la Recherche Agronomique pour le Développement

LaGeFaGe Laboratoire de Génomique Fonctionnelle et Amélioration GénétiqueLANADA Laboratoire National d’Appui au Développement Agricole

LBA Laboratoire de Biotechnologies Animales LBMA Laboratoire de Biologie Moléculaire Appliquée

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RAPPORT FINAL › LISTE DES SIGLES

LCB Laboratoire Central de BiotechnologiesLCBV Laboratoire Campus de Biotechnologies Végétales

LCV Laboratoire Centrale Vétérinaire LGBV Laboratoire de Génétique et de Biotechnologies Végétales LMLA Laboratoire de Microbiologie et Laboratoires Associés

LNERV Laboratoire National d’Elevage et de Recherches Vétérinaires LNSP Laboratoire National de Santé PubliqueLVBV Laboratoire de Virologie et de Biotechnologies Végétales

LVCQV Laboratoire de Virologie et de Contrôle de Qualité Vaccin MEP Ministère de l’Elevage et des Pêches MRC Medical Research CouncilMSU Michigan State University

NACGRAB National Centre for Genetic Resources and BiotechnologyNARI National Agricultural Research Institute

NARS / SNRA National Agricultural Research System/Système National de Recherche AgronomiqueOGM Organisme génétiquement modifié

OIE Organisation Mondiale de la Santé Animale (anciennement Office International des Epizooties)ONU Organisation des Nations UniesOVI Ondonstepoort Vet Insitute

OVM Organisme vivant modifiéPADBBAO Plan d’Action pour le Développement de Biotechnologie et Biosécurité en Afrique de l’Ouest

PB Plant Biotechnology PCR Réaction de polymérisation en chaîne

PNUD Programme des Nations Unis pour le DéveloppementPNUE Programme des Nations Unies pour l’Environnement

QPCR Quantitive Polymerisation Chain reactionREC Radiation Entomology Center

RETRO-CI Projet de recherche et de prise en charge en direction des prostituées RFLP Restriction Fragment Length Polymorphisme

RVTH Royal Victoria Teaching HospitalSAM Sélection assistée par marqueurs moléculaires

SHESTCO Sheda Science and Technology Complex [Nigeria]SIDA Syndrome immuno déficience acquis

SSR Single sequence repeats (micosatellites)SNRA / NARS Système National de Recherche Agronomique / National Agricultural Research System

UAA Université d’Abobo-AdjaméUAC Université d’Abomey CalavyUAC Université d’Abijan-Cocody

UB Université de BamakoUEMOA Union Economique et Monétaire Ouest Africaine

UFR Unité de Formation et de RecherchesUGL University of Ghana, Legon

UNEP-GEF United Nations Environment Program –Global Environment Facility USAID United States Agency for International DevelopmentUSDA United States Department of Agriculture

VIH Virus d’immunodéficience humaineWAITRO World Association of Industrial and Technological Research Organizations

WECARD West and Central African Council for Agricultural Research and Development

RAPPORT FINAL › LISTE DES TABLEAUX • LISTE DES FIGURES


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Tableau I : Identification des laboratoires visités et de leurs spécialités dans la recherche 25Tableau II : Liste des activités de biotechnologies et /

ou biosécurité en cours dans les laboratoires visités 31Tableau III : Equipements disponibles dans les laboratoires de biotechnologies visités 39Tableau IV : Capacités humaines et encadrement d’étudiants 46Tableau V : Niveau et spécialité des étudiants encadrés au cours

des cinq dernières années (2005-2010) 49Tableau VI : Récapitulatif des productions scientifiques des cinq dernières années 52Tableau VII : Laboratoires nationaux ou régionaux établis dans le pays des laboratoires visités 55Tableau VIII : Laboratoires régionaux et internationaux collaborant avec les laboratoires visités 59Tableau IX : Fiche technique des laboratoires visités 62Tableau X : Récapitulatif des forces et faiblesses des laboratoires enquêtés 65Tableau XI : Besoins en équipements et infrastructures exprimés par les laboratoires 71Tableau XIIa : Liste détaillée des besoins en personnel et en formation exprimés

par les laboratoires 75Tableau XIIb : Récapitulatif des besoins en personnel et en formation

(effectif de chercheurs et de techniciens) 80Tableau XIII : Collaborations sollicitées avec des laboratoires des pays développés identifiés 83Tableau XIV : Rôles souhaités par les laboratoires visités et stratégies envisagées 87Tableau XV : Proposition de rôles des laboratoires devant devenir centres d’excellence 92Tableau XVI : Présence de dispositifs de biotechnologies/biosécurité dans les pays concernés 94Tableau XVII : Liste par spécialité des laboratoires susceptibles de servir de centres d’excellence.97Tableau XVIII : Interlocuteurs des laboratoires visités 106

Figure 1a : Effectif de chercheurs et de techniciens des laboratoires (au cours des cinq dernières années) 47

Figure 1b : Effectif de stagiaires formés dans les laboratoirespendant les cinq dernières années 47

Figure 2 : Nombre de publications parues au cours des cinq dernières annéeset diversité des revues 53

Figure 3a : Recrutement (effectif de chercheurs et de techniciens)sollicité par les laboratoires visités 81

Figure 3b : Formation (effectif de chercheurs et de techniciens) ollicitée par les laboratoires visités 81

LISTE DES TABLEAUX

LISTE DES FIGURES

I

CONTEXTEET JUSTIFICATION

RAPPORT FINAL › CONTEXTE ET JUSTIFICATION


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La biotechnologie est pratiquée depuis longtemps par le genre humain. En effet, les agriculteurs, depuis des milliersd’années, sélectionnent les organismes vivants afin d’obtenir des produits de qualité en quantité suffisante, touten allégeant leur travail. Cette démarche, empirique au départ, a été améliorée grâce aux connaissancesacquises par l’étude du fonctionnement des organismes vivants. De nos jours, le développement desbiotechnologies permet de rationaliser davantage l’amélioration des plantes. Avec l’essor des biotechnologies,et plus spécifiquement des OGM (organismes génétiquement modifiés), fortement médiatisés, des mesures deprévention des risques liés à cette nouvelle science sont mises en place. Ces mesures, plus connues sous le termede biosécurité, ont fait l’objet d’un protocole international dénommé Protocole de Cartagena sur la préventiondes risques biotechnologiques relatifs à la convention sur la diversité biologique.

Les études menées par le CORAF/WECARD ont montré que les biotechnologies peuvent être d’un apportconsidérable en agriculture et en production animale, notamment concernant : i) le développement des vaccinset des outils de diagnostic pour prévenir et gérer les épidémies; ii) le développement des technologies demultiplication in vitro des plantes alimentaires et des ressources forestières pour assurer un approvisionnementrégulier des paysans en semences et soutenir les programmes de reboisement; iii) l'utilisation des marqueursmoléculaires pour accélérer les programmes de sélection génétique et; iv) l’exploitation de la transgénèse pourrégler des problèmes que l’amélioration génétique traditionnelle ne peut résoudre. De même, en matièred'environnement et de ressources naturelles, l’utilisation des biotechnologies permet : i) l’évaluation, la conservationet la gestion durable de la diversité biologique; ii) une meilleure connaissance des microorganismes des sols africainspour l'amélioration des procédés de dépollution et la gestion durable des sols et; iii) l’exploration de la biodiversitépour la lutte biologique (biopesticides; entomovirus, etc.). Dans le secteur de l'industrie agroalimentaire, laprincipale potentialité identifiée concerne l’utilisation des performances des microorganismes dans les procédésde fermentation et dans la production et la valorisation des substances biologiques à haute valeur ajoutée.

Depuis le Sommet de Sacramento (USA) de juin 2003, l’Afrique de l’Ouest explore les voies d’une utilisationappropriée de la biotechnologie pour accroître la productivité agricole et réduire l’insécurité alimentaire etnutritionnelle ainsi que la pauvreté. En effet, des recommandations ont été formulées à ce sommet pour faciliterl’accès des pays en développement aux nouvelles technologies agricoles et alimentaires dans le but d’atteindreles objectifs du Sommet mondial de l’alimentation, à savoir réduire la faim de moitié dans le monde d’ici 2015.

Dans le cadre de la mise en œuvre de ces recommandations, une conférence régionale pour l’Afrique de l’Ouests’est tenue en juin 2004 à Ouagadougou, au Burkina Faso. Elle avait pour thème « la maîtrise des sciences et destechnologies en vue d’accroître la productivité agricole en Afrique : perspectives ouest-africaines ». Cetteconférence a mis en évidence la nécessité d’établir, pour les États d’Afrique de l’Ouest, un système d’informationpublique sur les biotechnologies et de créer un centre ouest-africain de biotechnologie. Elle a également dévoilél’utilité d’un partenariat entre les institutions ouest-africaines de recherche et leurs homologues du Nord, enparticulier celles des États-Unis d’Amérique, en matière de sciences et de technologie agricoles. La conférencea également pris la décision d’organiser une Conférence ministérielle sur les biotechnologies, sous l’égide de laCEDEAO et du Gouvernement du Mali, à Bamako. La perspective est d’institutionnaliser une Conférenceministérielle sur les biotechnologies en Afrique de l’Ouest et d’adopter un plan d’action pour promouvoir lesbiotechnologies et harmoniser la réglementation sur la biosécurité.

Ce Plan d’action pour le développement de la biotechnologie et de la biosécurité (PADBBAO), élaboré sur labase d’un processus participatif impliquant l’UEMOA et les réseaux régionaux du domaine, a été adopté en mai2007 à Accra. Il comporte trois objectifs opérationnels : 1) le développement des produits biotechnologiques dansl’espace CEDEAO en vue d’améliorer la productivité et la compétitivité agricoles et de gérer durablement lesressources génétiques, 2) la mise en œuvre d’une approche régionale de la biosécurité et, 3) la mise en placed’un mécanisme efficace de coordination, de pilotage, de suivi et d’évaluation, ainsi qu’un plan de financement.En liaison avec le mandat du CORAF/WECARD dans la région, la CEDEAO a confié à cette organisation la miseen œuvre de l’objectif spécifique 1 et certaines actions de l’objectif spécifique 3 du PADBBAO. Pour la mise enœuvre de son objectif spécifique 1, le PADBBAO définit explicitement l’identification et le développement descapacités des centres d’excellence (CE) qui opèrent dans sa région comme une des actions prioritaires à mener.

I. CONTEXTE ET JUSTIFICATION

RAPPEL DE QUELQUES NOTIONSSUR LA BIOTECHNOLOGIE

ET LA BIOSECURITE II

RAPPORT FINAL › RAPPEL DE QUELQUES NOTIONS SUR LA BIOTECHNOLOGIE ET LA BIOSECURITE


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La biotechnologie moderne peut être considérée comme le point de rencontre de plusieurs spécialités(biologie, génétique, biochimie, microbiologie, botanique, écologie, zoologie, médecine, pharmacie,physique, électronique, informatique, génie génétique, etc.). Cette science connaît des applicationsdiverses, notamment dans l’agriculture, la sécurité alimentaire, l’industrie, la santé humaine et animale,l’énergétique, la préservation et la conservation de l’environnement. Elle connait également desapplications dans la génomique (étude de la carte génétique), la bioélectronique et les biocapteurs,pour ne citer que les domaines les plus importants. Ce secteur économique, qui s'est considérablementdéveloppé depuis le début des années 1980, est aujourd'hui intégré à part entière dans le tissu industrielmondial et génère un chiffre d'affaires annuel de plus 120 milliards US$.

2.1 Biotechnologie : définition

D’après la définition adoptée par la FAO, la biotechnologie est l’utilisation des propriétés desorganismes vivants pour la production de matières et de services au bénéfice de l’humanité (FAO,2001). Dans cette définition, on entend par propriétés des organismes vivants certaines facultés qu’ontles cellules vivantes; il s’agit par exemple de la totipotence (propriété de se différencier en n’importequelle cellule spécialisée et de se structurer en formant un être vivant) ; il s’agit également de la fixationde l’azote de l’air par certaines bactéries, les rhizobiums, constituant des biofertilisants. La fermentationpar des bactéries ou la transformation des organismes vivants par génie génétique font égalementpartie de ces propriétés. Les matières produites par la biotechnologie sont les molécules biologiquesutilisées pour la santé (médicaments, vitamines, vaccins, hormones, enzymes et autres protéines) etles biopesticides. Les services rendus par la biotechnologie à l’humanité concernent donc l’agriculture,l’agroalimentaire, l’industrie, la santé et l’environnement.

La biotechnologie classique intervient dans les méthodes traditionnelles de croisement chez lesvégétaux et les animaux (sélection classique), la fermentation, la production d’enzymes et la culturein vitro des tissus végétaux et animaux. Quant à la biotechnologie moderne, elle porte sur l’applicationde techniques in vitro aux acides nucléiques, y compris la recombinaison de l’acidedésoxyribonucléique (ADN). Elle concerne également l’introduction directe d’acides nucléiques dansdes cellules ou organites, ainsi que la fusion cellulaire d’organismes n’appartenant pas à la mêmefamille taxonomique. Ces techniques surmontent les barrières naturelles de la physiologie de lareproduction ou de la recombinaison et ne sont pas utilisées pour la reproduction et la sélection detype classique. La biotechnologie intervient donc dans l’amélioration et la sélection des plantes,l’étude de la diversité génétique, l’étude des pathogènes et leur élimination (sanitation ouassainissement) chez certaines espèces à multiplication végétative. Elle est utilisée également dansla multiplication des plantes par culture in vitro (CIV) et dans la transformation des plantes pourl’obtention d’organismes génétiquement modifiés (OGM).

2.2 Applications de la biotechnologie

• Amélioration génétique, diversité génétique et génotypage

L’objectif du sélectionneur est de créer des variétés possédant un/des caractères bénéfiques donnés.Pour ce faire, les biotechnologies modernes permettent la sélection directe et rapide parl’identification et la localisation des gènes responsables du caractère recherché. Cette méthode

* Les mots ou groupes de mots soulignés dans le texte représentent les termes clés utilisés en biotechnologie/biosécurité

II RAPPEL DE QUELQUES NOTIONS SUR LA BIOTECHNOLOGIEET LA BIOSECURITE

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complémentaire de la sélection classique, appelée sélection assistée par marqueurs moléculaires(SAM), utilise des marqueurs moléculaires (petite portion d’ADN ou son expression) pour la sélection.La biotechnologie permet aussi, par l’utilisation des marqueurs moléculaires (RFLP, RAPD, AFLP,microsatellites et autres), de mettre en évidence, au niveau du patrimoine génétique (ADN), unpolymorphisme qui n’est pas perceptible au niveau du phénotype. Elle permet par l’analyse de ladiversité génétique d’étudier la structure et l’évolution des populations naturelles. De même, le profilde l’ADN ou la séquence de nucléotides, caractéristiques de chaque individu ou clone, est utilisécomme une base solide d'identification des individus dans une population.

• Cartographie génétique, identification de QTLs et caractérisation des gènes

La carte génétique indique des portions d’ADN (QTLs), impliquées dans l’expression d’un caractèreagronomique donné, qui peuvent être utilisées chez les jeunes plants comme indices de sélection vis-à-visde ce caractère. Les gènes d’intérêt agronomique ou les QTLs identifiés peuvent être clonés et séquencéspuis comparés à d’autres gènes connus. Le degré d’homologie ou de similarité entre le gène nouvellementséquencé et l’une ou l’autre des séquences de la banque des gènes permet ainsi la caractérisation dugène (type, fonction). Ces gènes peuvent ensuite être utilisés pour le criblage et la sélection des variétés,ou pour la transformation des plantes en vue de l’obtention de plantes transgéniques (OGM).

• Dépistage et étude de pathogènes chez les animaux et les plantes

Deux méthodes de détection de microorganismes pathogènes sont généralement utilisées. Il s’agit dutest de dépistage ELISA, basé sur une réaction spécifique anticorps-antigènes (l’antigène est en généralun virus), et du test PCR (Polymerase Chain Reaction), qui consiste en une amplification d’un fragmentd’ADN de l’agent pathogène. Dans ce dernier cas, les fragments amplifiés peuvent être visualisés surun support comme le gel d’agarose, puis séquencés. Le dépistage des pathogènes peut aussi êtreréalisé par d’autres techniques (cultures d’isolats sur milieux, immunoprécipitation et hybridation).

Les tests de dépistage et de caractérisation peuvent se faire au laboratoire, dans les centres derecherche, les universités et grandes écoles, pour la recherche-développement ou à la demanded’un opérateur agricole en tant que prestation de service.

• Multiplication d’individus et conservation des ressources génétiques

La multiplication d’individus par culture in vitro est, dans la pratique, la technique la plus utilisée denos jours en biotechnologie agricole. Elle consiste à cultiver des cellules, des tissus ou des organes aulaboratoire dans des boîtes de Petri, des tubes ou des bocaux, sur des milieux nutritifs contenant deshormones, des oligo-éléments, des vitamines et d’autres éléments nécessaires au développement descellules animales et végétales. Elle permet la production en masse de milliers de plantules jumelles(clones). La culture in vitro est utilisée, soit pour la conservation des ressources génétiques, soit pour lamultiplication d’individus élites, soit encore pour la production en masse de plantules destinées à lacréation des plantations.

• Transformation des plantes pour l’obtention d’OGM

Les organismes génétiquement modifiés sont des organismes vivants dont le support héréditaire (ADN)a été modifié par mutation, par insertion ou par délétion d’un ou de quelques gènes dans le but deleur conférer de nouvelles propriétés. Les organismes vivants – plantes, animaux, bactéries ou virus –sont transformés et de nouveaux caractères (résistance à une maladie, production de protéines, devitamines, amélioration de la qualité nutritionnelle) leur sont ainsi conférés. Les nouveaux produits dela biotechnologie que sont les plantes transgéniques ne représentent qu’une petite partie des OGM,la majeure partie des OGM étant constituée par les bactéries, par exemple Escherichia coli, bactériesqui sont utilisées au laboratoire en génie génétique depuis des dizaines d’années.





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• Biotechnologie appliquée aux ressources animales et halieutiques

Chez les animaux, la biotechnologie intervient particulièrement dans la gestion des géniteurs, dansl’amélioration de la santé animale à travers le diagnostic, la caractérisation et la lutte contre les agentspathogènes. Ainsi, elle permet l’obtention de vaccins recombinants par génie génétique. Ces vaccinsoffrent davantage de sécurité sanitaire que les vaccins classiques (absence de risque de réveil dupathogène, réduction des risques de contamination par d'autres agents pathogènes, etc.).Spécifiques et stables, ils permettent surtout de faire la distinction entre les animaux vaccinés et ceuxnaturellement infectés. La technologie de l'ADN recombinant offre également de nouvelles possibilitéspour le développement de vaccins contre les parasites (tiques, helminthes, etc.), alors que lesapproches traditionnelles ont échoué. Plusieurs techniques de reproduction sont disponibles, à savoirl'insémination artificielle, le transfert d'embryons, le sexage de l’embryon et la cryoconservation desperme, d’ovules et d'embryons. De même, il existe, encore au stade de la recherche, des animauxtransgéniques, comme par exemple la souris transgénique qui sécrète une grande quantitéd’hormone de croissance. Certains animaux transgéniques servent à la fabrication de produitsthérapeutiques et d’autres pourraient être utilisés comme donneurs d’organes.

2.3 Biosécurité : prévention et gestion des risques liés aux OGM

L’Agenda 21, adopté en 1992 lors de la conférence de Rio sur l’Environnement et le Développement,identifie la biotechnologie comme un outil prometteur, propre à contribuer aux objectifs dudéveloppement durable. Cependant, les questions relatives aux biotechnologies, et en particulier auxorganismes génétiquement modifiés (OGM), sont l’objet de débats et de controverses depuis le débutde la commercialisation des OGM. Ceux-ci portent sur les risques, hypothétiques ou avérés, des OGMpour la santé, l’environnement ou la sécurité alimentaire. Cependant, les OGM, et plusparticulièrement les plantes transgéniques, sont à nos frontières et à nos portes. Il s’avère plus quejamais urgent de comprendre les enjeux, à la fois scientifiques, agronomiques, économiques, sociaux,culturels et éthiques, qui accompagnent cette problématique. Ceci permettra de réduire, voireéliminer, les éventuels effets néfastes liés à ces variétés biotechnologiques pour bénéficier desnombreux avantages qu’elles offrent pour la sécurité alimentaire.

Plusieurs pays ont signé et ratifié la Convention sur la diversité biologique (CDB ou CBD) qui leur confèrela pleine souveraineté dans la gestion de leurs ressources génétiques, mais leur fait obligation, au nomde la communauté internationale, d’assurer la conservation durable de ces ressources génétiques.Cette convention, en son article 8 (g), stipule que chaque partie contractante « doit mettre en placeet maintenir une réglementation nécessaire pour gérer et minimiser les risques associés à la production,à l’utilisation, aux échanges et à la dissémination volontaire d’organismes vivants modifiés (OVM)résultant de la biotechnologie, qui pourraient avoir des effets défavorables sur la conservation etl’utilisation durable de la diversité biologique, compte-tenu également des risques pour la santéhumaine, en mettant plus précisément l’accent sur les mouvements transfrontières». A la suite de cetteconvention, le protocole de Cartagena sur la prévention des risques biotechnologiques (biosécurité),en vigueur depuis 2003, fixe les règles de base de cette réglementation.

Des précautions doivent être prises vis-à-vis des dangers toxicologiques et allergéniques, vis-à-vis desrisques de transfert à la flore intestinale de gènes de résistance aux antibiotiques et vis-à-vis de lapollution génétique par les flux de gènes (apparition de mauvaises herbes résistantes aux herbicides,d'insectes résistants aux OGM). L’impact sur les organismes non-cibles, sur l'environnement et sur lasanté humaine et animale est également à éviter.

Parmi plusieurs initiatives au niveau mondial découlant de ces préoccupations, la plus importanteporte sur le renforcement des capacités en biosécurité, financé par le Fonds pour l’EnvironnementMondial (FEM) et mis en œuvre par le Programme des Nations Unies pour l’Environnement (PNUE), leProgramme des Nations Unies pour le Développement (PNUD) et la Banque Mondiale. Cette initiative

EVALUATION DES CAPACITESDE LABORATOIRES DE

L’AFRIQUE DE L’OUEST ENMATIERE DE BIOTECHNOLOGIE

ET DE BIOSECURITE III

RAPPORT FINAL › EVALUATION DES CAPACITES DE LABORATOIRES DE L’AFRIQUE DE L’OUEST EN MATIERE DE BIOTECHNOLOGIE ET DE BIOSECURITE


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3.1 Problématique

Différentes études ont montré que la région de l’Afrique de l’Ouest dispose de laboratoires nationauxet régionaux qui, après renforcement de leurs capacités, pourront servir de base, non seulement pourla formation et le transfert progressif des technologies, mais aussi pour la recherche fondamentale.Etablies comme instruments techniques de référence, ces institutions peuvent être utilisées pour créerun flux de savoir-faire, d’une part, des pays développés vers elles et, d’autre part, d’elles vers les paysde la région. Certaines tâches à mener au profit des programmes nationaux, et en collaboration aveceux, pourraient être confiées à ces centres d’excellence (CE) dans le cadre de projets de recherche«commandités» et financés à travers la mise en œuvre des programmes régionaux. Ces centresd’excellence peuvent aussi établir des consortiums de recherche avec les Systèmes Nationaux deRecherche Agronomique et postuler à des fonds compétitifs.

Cette nouvelle approche opérationnelle privilégie la notion de « programme » à celle de « réseau » etutilise, comme outil de travail, le centre d’excellence plutôt que la base centre du CORAF/WECARD.Ces changements s’alignent sur les modes opératoires suggérés par le PADBBAO.

Dans le but de sélectionner, parmi les anciennes bases centres et les laboratoires nationaux de larégion, les laboratoires d’Afrique de l’Ouest devant servir de centre d’excellence, il est nécessaired’évaluer leurs capacités actuelles en matière de biotechnologie et de biosécurité. Cette évaluationa pour objectif de dégager les forces et les faiblesses des laboratoires, les contraintes à la mise enœuvre du protocole de Cartagena et les besoins en renforcement des capacités.

L’objectif global est de développer la biotechnologie agricole dans l’espace CEDEAO à travers lescentres d’excellence nationaux et régionaux spécialisés en biotechnologie et biosécurité.De façon spécifique, il s’agit :

• d’évaluer les capacités techniques des laboratoires nationaux et régionaux pouvant servir decentres d’excellence en matière de biotechnologie et biosécurité dans la zone CEDEAO ;

• d’identifier les laboratoires possédant les meilleurs potentiels ;• de relever leurs faiblesses et de proposer des mesures devant permettre le renforcement de

leurs capacités.

Les laboratoires visités dans le cadre de cette étude sont directement impliqués dans la recherche oule développement en biotechnologie, ou dotés de potentiels leur permettant d’assurer un rôle dansla mise en place d’un système de biosécurité dans la zone CEDEAO.

Ce rapport expose, pour chaque laboratoire, ses forces, ses faiblesses, les contraintes qui limitent sonefficacité. Il propose également les mesures de renforcement des capacités qui pourront lui permettrede jouer pleinement son rôle. Après l’exposé de la méthodologie utilisée dans le cadre de cette étude,il présente, pour les laboratoires visités :

• Les domaines d’activités et les spécialités ;• Les activités en cours et les techniques utilisées ;

III. EVALUATION DES CAPACITES DE LABORATOIRESDE L’AFRIQUE DE L’OUEST EN MATIEREDE BIOTECHNOLOGIE ET DE BIOSECURITE

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• Les capacités en infrastructures et équipements techniques;• Les capacités humaines et d’encadrement;• L’aptitude à la production scientifique;• L’aptitude à la collaboration nationale, régionale et internationale ;• Les forces et les faiblesses;• Les besoins en renforcement des capacités;• Les rôles potentiels et les stratégies envisagées.

La discussion et les conclusions terminent le rapport.

3.2 Méthodologie utilisée dans le cadre de l’étude

Les laboratoires concernés par l’étude sont des laboratoires nationaux et régionaux de certains paysd’Afrique de l’Ouest. La présente étude a été réalisée sous forme d’une enquête menée dans leslaboratoires identifiés pour recueillir le maximum d’informations sur leurs potentiels actuels en matièrede biotechnologie et leurs capacités en matière de biosécurité.

• Elaboration de la fiche d’enquête

La fiche d’enquête proposée pour cette évaluation permet de collecter un ensemble d’informationssur les capacités scientifiques et techniques du laboratoire, ainsi que sur ses prédispositions àfonctionner comme laboratoire ou centre d’excellence en matière de biotechnologie et debiosécurité en Afrique de l’Ouest, pour le compte de la CEDEAO et du CORAF/WECARD. Le contenude cette fiche d’enquête a été discuté et validé par un groupe de spécialistes du Secrétariat duCORAF/WECARD.

Après la partie signalétique, cette fiche porte sur les domaines d’activités du laboratoire visité, sesspécialités de recherche, les activités de biotechnologies et /ou biosécurité en cours et les capacitéshumaines et techniques disponibles. Elle permet de faire le bilan de la production scientifique et del’encadrement d’étudiants du laboratoire durant les cinq dernières années. Sont également pris encompte par cette fiche d’enquête l’environnement scientifique du laboratoire, les relations decollaboration avec d’autres laboratoires ou instituts de recherche nationaux, régionaux etinternationaux. Enfin, le renforcement de capacités dont le laboratoire a besoin pour remplir le rôlede laboratoire d’excellence en matière de biotechnologie et de biosécurité est signalé.

• Présélection des laboratoires

Les laboratoires nationaux et régionaux sont en grande majorité connus par la CEDEAO et leCORAF/WECARD. Des données secondaires de base ont été collectées auprès de personnesressources et du chef de programme Biotechnologie et Biosécurité du CORAF/WECARD, lors d’unerencontre de travail. La liste ("short list") de laboratoires à visiter a été établie sur la base de cesdonnées.

3.3 Résultats3.3.1 Domaines d’activités et spécialités des laboratoires

Au cours de ces travaux, 23 laboratoires appartenant à 19 institutions de recherche et développementde sept pays de la zone CEDEAO, à raison de deux à quatre laboratoires par pays, ont été visités. Ils’agit de deux laboratoires en Gambie, trois en Côte d’Ivoire, trois au Mali, trois au Nigeria, quatre auBurkina Faso, quatre au Ghana et quatre au Sénégal. D’après les enquêtes menées dans le cadre de




22

cette étude, les laboratoires concernés utilisent, à des niveaux variés, des outils biotechnologiques,pour mener des activités dans plusieurs domaines agronomiques. Au total, 24 spécialités, regroupéesen six domaines d’activités, ont été répertoriées (tableau I). Ces domaines d’activités varient d’unlaboratoire à un autre, chaque laboratoire pouvant servir à un niveau ou à un autre en biotechnologieet/ou en biosécurité en Afrique de l’Ouest. Les domaines concernés sont les suivants :

• Biotechnologie végétale• Biotechnologie animale et halieutique• Agroalimentaire et sécurité sanitaire• Ressources génétiques• Environnement et biosécurité• Adaptation au changement climatique

On distingue, en fonction de leurs spécialités, trois grands types de laboratoires, répertoriés ci-dessous.

• Type I : Laboratoires spécialisés dans la production végétale

- Laboratoire de Virologie et de Biotechnologies Végétales (LVBV-INERA), au Burkina Faso,spécialisé dans la caractérisation moléculaire des pathogènes et dans la lutte génétique parla production de semences OGM ;

- Laboratoire de Génétique et de Biotechnologies Végétales (LGBV-INERA), au Burkina Faso,spécialisé dans l’étude de la diversité génétique des plantes ;

- Laboratoire Central de Biotechnologies (LCB-CNRA), en Côte d’Ivoire, spécialisé dans l’étudede la diversité génétique, la culture in vitro des tissus végétaux et la caractérisationmoléculaire des pathogènes ;

- Laboratoire de Génomique Fonctionnelle et Amélioration Génétique (LaGeFAGe-UAA), deCôte d’Ivoire, spécialisé dans la formation à la caractérisation moléculaire des plantes ;

- Biotechnology Laboratory (BL-NARI), en Gambie, spécialisé dans l’étude de la diversitégénétique ;

- Plant Biotechnology (PB-BNARI), au Ghana, spécialisé dans la culture in vitro des tissusvégétaux, l’assainissement (sanitation) et la mutation génétique par irradiation ;

- Biotechnology Center (BC-UGL), au Ghana, spécialisé dans la sélection assistée parmarqueurs, la détection et la caractérisation moléculaire des pathogènes et la formation ;

- Biotechnology Laboratory (BL-CRI) du Ghana, spécialisé dans la culture in vitro, lacaractérisation des pathogènes et les tests en milieu confiné/Biosécurité ;

- Laboratoire d’Agro-physio-génétique et de Biotechnologies végétales (LAPGBV-IPR), au Mali,spécialisé dans la formation, la production par la culture in vitro de semences de pomme deterre et de bananier ;

- Biotechnology Laboratory (BL-IAR) du Nigeria, spécialisé en culture in vitro (micropropagationet cryoconservation) et en sélection assistée par marqueurs ;

- Biotechnology Laboratory (BL - NACGRAB) du Nigeria, spécialisé en culture in vitro (productionen masse par méthode conventionnelle et par la technologie d’immersion temporaire parbioréacteur et la physiologie des semences ;

- Biotechnology and Genetic Engineering Advanced Laboratory (BGEAL - SHESTCO) du Nigeria,spécialisé en culture in vitro (production en masse par la méthode conventionnelle et par latechnologie d’immersion temporaire par bioréacteur), transformation génétique, sélectionassistée par marqueurs, microbiologie, biodépollution et valorisation des déchets et résidus ;

- Laboratoire CAMPUS de Biotechnologies Végétales (LCBV-UCAD) au Sénégal, spécialisé dansla culture in vitro et la formation ;

- Centre d’Etude Régional pour l’Amélioration de l’Adaptation à la Sécheresse (CERAAS-ISRA)au Sénégal, spécialisé dans la sélection des plantes pour la résistance à la sécheresse.


23

• Type II : Laboratoires spécialisés dans la production animale

- Laboratoire de Biotechnologies Animales (LBA-CIRDES) au Burkina Faso, spécialisé dansl’étude de la diversité génétique et la recherche de marqueurs génétiques associés auxmaladies chez les animaux ;

- Laboratoire de Virologie et de Contrôle Qualité Vaccin (LVCQV-LANADA) de Côte d’Ivoire,spécialisé dans la caractérisation moléculaire des pathogènes, le développement et lecontrôle des vaccins ;

- International Trypano-Tolerance Center (ITC) en Gambie, avec comme spécificité la sélectionchez les animaux et la lutte anti vectorielle ;

- Radiation Entomology Center (REC-BNARI) du Ghana, spécialisé dans la lutte anti vectorielle ;- Laboratoire Central Vétérinaire (LCV-MEP) du Mali avec comme spécialité principale l’étude

de pathogènes chez les animaux et le développement de vaccins ;- Laboratoire National de l’Elevage et de Recherches Vétérinaires (LNERV-ISRA) au Sénégal,

spécialisé dans la santé et la production animale (diagnostic et contrôle qualité).

• Type III : Laboratoires couvrant à la fois la production végétaleet animale

- Laboratoire de Microbiologies et Laboratoires associés (LMLA- IRSAT) du Burkina Faso, quimène des activités de contrôle de qualité des denrées alimentaires ;

- Laboratoire de Biologie Moléculaire Appliquée (LBMA-UB), au Mali, spécialisé en dépistagemoléculaire, diversité et amélioration génétiques, production d’OGM et biosécurité ;

- Institut Sénégalais de Recherches Agricoles-Production (ISRA-Production), au Sénégal,spécialisé dans la production en masse de vaccins et de semences végétales.

Vingt-quatre spécialités ont été répertoriées (tableau I) dans les 23 laboratoires visités, aussi bien enbiotechnologie classique qu’en biotechnologie moderne ; il s’agit notamment de :

• Sélection classique, • Etude flux de gènes. • Production de bio-pesticides,• Analyse de résidus• Analyse sensorielle• Analyse physicochimique• Production de semences• Biodégradation & Bioremédiation• Microbiologie,• Culture in-vitro, • Transfert d’embryons• Sélection par mutation

• Développement de vaccins,• Physiopathologie,• Physiologie,• Etudes de pathogènes,• Epidémiologie moléculaire,• Diversité génétique (SSR),• Biologie moléculaire,• Séquençage,• Caractérisation moléculaire,• Sélection assistée /M (SAM),• Génie génétique/OGM,• Evaluation/Détection OGM

Le nombre de spécialités répertoriées par laboratoire varie entre trois pour les laboratoires trèsspécialisés, comme ITC en Gambie, et 10 à 12 pour les laboratoires très diversifiés, comme LVBV-INERA,BL-CRI et LBMA-UB, BC-UGL et BGEAL-SHESTCO. Entre ces deux types de laboratoires, les laboratoiresLCV-MEP, BL-NARI, CERAAS-ISRA, LGBV-INERA, LMLA-IRSAT, LaGeFAGe-UAA, LAPGBV-IPR, LCBV-UCADet ISRA-Production ont quatre à six spécialités chacun ; les laboratoires LVCQV-LANADA de Côted’Ivoire, REC-BNARI et PB-BNARI du Ghana, LBA-CIRDES du Burkina Faso, LCB-CNRA de Côte d’Ivoire,BL-IAR et BL-NACGRAB du Nigeria et LNERV-ISRA affichent sept à neuf spécialités chacun (tableau I).




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Deux laboratoires se situent en aval de la recherche-développement et interviennent en appui audéveloppement. II s’agit de ISRA-Production, spécialisé dans la production en masse de vaccins etde semences pour les producteurs, et de LMLA-IRSAT du Burkina Faso, qui intervient dans le domainedes technologies alimentaires, et a pour spécialité le contrôle de qualité des denrées alimentaires. Ilest également à noter que seulement quatre laboratoires produisent des OGM : LVBV-INERA du BurkinaFaso, BL-CRI et BL-UGL du Ghana et BL-IAR du Nigeria. Au moins 50 % des laboratoires visités affirmentmener, ou sont prêts à mener, des activités dans le domaine de la biosécurité.

3.3.2 Activités en cours et techniques utilisées

Les activités de biotechnologies et /ou biosécurité en cours dans les différents laboratoires visités(tableau II) sont très diversifiées et portent sur différents matériels : végétaux, animaux etmicroorganismes (champignons, virus, bactéries et levures). On distingue les laboratoires conduisantun nombre élevé d’activités (LVBV-INRA, LGBV-INERA, LBA-CIRDES, LCB-CNRA, PB-BNARI, BC-UGL, BL-CRI, LBMA-UB, BL-IAR, BL-NACGRAB, BGEAL-SHESTCO, LCBV-UCAD, CERAAS-ISRA et LNERV-ISRA), leslaboratoires conduisant peu d’activités au moment de la visite (ITC, BL-NARI et REC-BNARI) et leslaboratoires conduisant un nombre moyen d’activités (LMLA-IRSAT, LVCQV-LANADA, LaGeFaGe-UAA,LAPGBV-IPR, LCV-MEP et ISRA-Production).

Il est à remarquer que 65% des laboratoires utilisent au plus six techniques différentes, trois laboratoires(LGBV-INERA, LaGeFaGe-UAA, CERAAS-ISRA) emploient uniquement la technique PCR et ses dérivéset quatre laboratoires utilisent plus de neuf techniques différentes de biotechnologie (BC-UGL, LBMA-UB, BGEAL-SHESTCO et LNERV-ISRA (tableau II).

Les techniques utilisées pour mener les activités dans ces laboratoires vont de la culture in vitro(micropropagation, embryogénèse somatique, culture de méristème et d’anthère, cryoconservation,immersion temporaire par bioréacteur, propagation en masse) à la transformation génétique, enpassant par la PCR et ses dérivés (RT-PCR, Real Time PCR), le clonage, le séquençage, les microarrays,les marqueurs (SNP, RAPD, AFLP, SSR) et autres outils moléculaires d’étude de la diversité. Les techniquescomme la digestion enzymatique, la mutagénèse par irradiation, le test ELISA, les analyses par HPLC,CPG, spectrophotométrie atomique, colorimétrie, électrophorèse, la bio fermentation, la culture decellules animales (œufs embryonnés, cellules de singes), les croisements classiques et l’inséminationartificielle ont été recensées.

De façon générale, les techniques de base en biologie moléculaire et en biologie cellulaire sontcommunes à tous les laboratoires. Certains laboratoires utilisent des techniques additionnellesspécifiques en fonction de leurs domaines et de leurs activités. La technique de base en biologiemoléculaire la plus utilisée est la PCR et ses dérivés ; elle est pratiquée dans tous les laboratoires visitéshormis ISRA-Production du Sénégal et le LAPGBV-IPR du Mali. La technique de base en biologiecellulaire est la culture in vitro, pratiquée par 65 % des laboratoires et par au moins un laboratoire danschaque pays visité.

Certaines techniques relativement nouvelles sont utilisées. La transformation génétique, recensée dansquatre laboratoires (LVBV-INERA du Burkina Faso, BL-CRI du Ghana, LBMA-UB au Mali et BGEAL-SHESTCOau Nigeria), n’est cependant pratiquée effectivement que dans des laboratoires partenaires régionauxou internationaux dans le cadre d’une collaboration Sud-Sud ou Sud-Nord. La PCR quantitative (qPCR)est effectivement pratiquée dans quatre laboratoires (LBMA-UB, LNERV-ISRA, LVCQV-LANADA et BC-UGL). La technique de pointe de migration des fragments amplifiés (microsatellites) sur le LICOR n’estdisponible qu’au LBA-CIRDES. De même, le séquençage automatique ne se pratique que dans quatrelaboratoires (LBA-CIRDES, LBMA-UB, LNERV-ISRA et BGEAL-SHESTCO).


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Tableau I : Identification et spécialités des laboratoires visitésN

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nd

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PCR

DA

NID

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3

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iqu

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en

ha

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e



32

N°

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n c

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A, F

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tiqu

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loss

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es

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, mig

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n s

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esé

qu

en

ce

ur L

ICO

R

CIR

AD

, IR

D, I

MT

Etu

de

de

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ive

rsité

gé

né

tiqu

e c

he

z le

s g

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ine

s G

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ina

pa

lpa

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am

bie

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, mig

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n s

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esé

qu

en

ce

ur L

ICO

R

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, mig

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n s

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esé

qu

en

ce

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R

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eD

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Etu

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né

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e c

he

z le

s c

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su

r le

séq

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nc

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ch

ia ru

min

an

tium

PC

R, R

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nte

s e

spè

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co

co

tier,

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ïs, ri

z, s

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ho

Ma

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eu

rsm

icro

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mi ;

FI

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Séle

ctio

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ca

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Mia

mi

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nè

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ao

yer e

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tion

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s m

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tro

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CA

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lé

Cu

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ryo

n d

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rC

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PC

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ine

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tec

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ara

cté

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mo

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pa

tho

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ne

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tes

cu

ltivé

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, b

an

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ier,

ca

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alm

ier

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na

me

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en

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CA

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èn

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PC

R

Cira

d –

Mo

ntp

elli

er,

AIE

A-V

ien

ne

; In

stitu

teo

f An

ima

l He

alth

,Pi

rbrig

ht,

UK

33



N°

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bo

rato

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Ac

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s e

n c

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s d

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Part

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ires

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u ré

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ctio

n d

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nte

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RU

CL

(Be

lgiq

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PIC

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atio

n d

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tiqu

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tion

gé

né

tiqu

e

Bio

info

rma

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LG G

em

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ux

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lgiq

ue

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C

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n d

u c

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co

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ullu

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RU

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em

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8

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nu

cle

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em

An

ima

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chn

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Lab

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Ge

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h In

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Gh

an

a

10

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AN

A

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iatio

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tom

olo

gy

Ce

nte

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EC-B

NA

RI)

Pop

ula

tion

ge

ne

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ies

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ala

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osq

uito

es

PCR

, Se

qu

en

cin

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oo

l Sc

ho

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f Tro

pic

al

Me

dic

ine

(LS

TM)

Inse

ctic

ide

resis

tan

ce

stu

die

sPC

R, M

icro

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ay

LSTM

SNP

ass

ay

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ale

ma

laria

mo

squ

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sPC

R, P

AG

ELS

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Bio

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hno

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ine

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ple

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ha

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ga

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ne

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rop

rop

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rmo

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Ge

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em

bry

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Ge

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ing

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/ EL

ISA

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ap

loid

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ctio

nA

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cu

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chn

olo

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Ma

rke

r Ass

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RT

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Co

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ll U

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ers

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Ge

ne

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cre

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Tra

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P A

sso

cia

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Am

plif

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Ag

en

es

We

st A

fric

a C

en

tre

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Cro

p Im

pro

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en

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Mo

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tho

ge

n is

ola

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Un

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ia,

Da

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Mo

lec

ula

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ara

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ristic

s o

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no

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es

Sou

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ing

, Clo

nin

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nc

ing

, DN

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al c

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teris

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oo

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tro

ph

oto

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try,

HPL

C, S

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PAG

E,C

olo

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try,

Pa

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g ,

Sen

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an

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sis

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triti

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oo

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eD

ep

t, U

niv

ers

ity o

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an

a

Foo

d R

ese

arc

h In

sititu

te,

Ac

cra



34

N°

PAY

SLa

bo

rato

ires

Ac

tivité

s e

n c

our

s d

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alis

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chn

ique

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es

Part

ena

ires

12

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AN

A

Stu

dy

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ysm

sR

T-PC

RC

orn

ell

Un

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rsity

Ge

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ht

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iza

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an

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an

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Un

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rsity

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irgin

ia,

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Mu

tatio

n b

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din

gPC

R, I

rra

dia

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, IA

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Mo

lec

ula

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teris

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n o

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ses

and

pa

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ge

nic

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cte

ria

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og

en

iso

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n &

ide

ntif

.U

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f Ca

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rnia

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ima

l Bio

tec

hn

olo

gy

PCR

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ce

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iv.

Gh

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chn

olo

gy

Lab

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tory

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f ‘H

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’ Sw

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ica

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ctr

op

ho

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,

CO

RA

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Iba

da

n,

CN

RA

-RC

I ; IN

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B –

Ben

in, S

LAR

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AR

I –Li

be

ria,

ITR

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To

go

,IN

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N –

Nig

er &

USA

ID.

Ass

ess

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th

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e e

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fp

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ge

ne

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in G

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, Ele

ctr

op

ho

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lam

ide

ge

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ion

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rop

rop

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ep

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ha

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go

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atio

n o

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no

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lite

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er

cro

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m,

Co

co

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, Sw

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tpo

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,C

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ava

, an

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rafr

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ota

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, Ele

ctr

op

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–a

ga

rose

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da

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ide

ge

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Pla

nt

Ge

ne

ticR

eso

urc

es

Re

sea

rch

Inst

itute

, Bu

nso

Gh

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a.

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k

Esta

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hm

en

t o

f in

vitr

o P

rod

uc

tion

Gu

ide

line

s a

nd

pro

toc

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velo

pm

en

t fo

r ro

ot

an

d t

ub

er c

rop

sM

icro

pro

pa

ga

tion

Un

ive

rsity

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ha

na

,Le

go

nG

en

etic

Re

s. R

ese

arc

hIn

stitu

te, B

un

so G

ha

na

.W

orld

Ba

nk

35



N°

PAY

SLa

bo

rato

ires

Ac

tivité

s e

n c

our

s d

e ré

alis

atio

nTe

chn

ique

s ut

ilisé

es

Part

ena

ires

14

MA

LI

Lab

ora

toire

de

Bio

log

ieM

olé

cul

aire

Ap

pliq

uée

(LBM

A-U

B)

Eva

lua

tion

de

s é

pito

pe

s d

es

pe

ptid

es

de

VIH

2EL

ISPO

TEp

iva

x, G

AIA

Dé

pist

ag

e, c

ultu

re e

t a

ntib

iog

ram

me

de

s so

uc

he

s d

eM

ico

ba

cte

rium

tu

be

rcu

losis

ave

c la

ma

ch

ine

MG

IT96

0 d

e la

co

mp

ag

nie

BD

®.

Cu

lture

, an

tibio

gra

mm

e,

mic

rosc

op

ie

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kin

son

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, Pro

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én

étiq

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, Id

en

tific

atio

nd

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gro

up

es

ch

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ue

s

Un

ive

rsité

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Ba

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ers

ity

15

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ora

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gro

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sio

-g

éné

tique

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chn

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n g

én

étiq

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thè

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en

èse

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, IER

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, BM

,PA

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ctio

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ts s

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s d

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an

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iers

M

icro

pro

pa

ga

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CN

RA

,BM

,PA

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P,D

NA

,IER

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AM

,FO

PBPr

od

uc

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de

pla

nts

sa

ins

de

ca

nn

e à

su

cre

Cu

lture

de

mé

ristè

me

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la (

suc

rerie

)

16La

bo

rato

ireC

ent

ral

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térin

aire

(LC

V-M

EP)

Tec

hn

iqu

es

imm

un

o-e

nzy

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tiqu

eEL

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de

co

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ion

, ELI

SAsa

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wic

h, E

LISA

-PC

RA

ge

nc

e In

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na

l de

l’En

erg

ie A

tom

iqu

e (

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Bio

log

ie m

olé

cu

laire

PCR

, RT-

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AIE

AU

tilisa

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de

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nd

es

Hyb

rida

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in s

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C L

on

dre

sPr

od

uc

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va

cc

ins

Sur c

ellu

les

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ge

)PA

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BA

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ntif

ica

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de

s p

ath

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èn

es

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me

nt

mili

eu

liq

uid

e,

solid

e

FSP5

La

bo

17N

IGER

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chn

olo

gy

Lab

ora

tory

(B

L -

IAR)

De

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pm

en

t o

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pa

ga

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icro

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ga

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Na

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ug

ar

De

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pm

en

t C

ou

nc

il,A

bu

ja, N

ige

ria

Cry

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rese

rva

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te

ch

niq

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s fo

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un

dn

ut

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op

rese

rva

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Inst

itute

for A

gric

ultu

ral

Re

sea

rch

(IA

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Zaria

-N

ige

ria

De

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pm

en

t o

f pro

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ols

for m

icro

pro

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ga

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of

pin

ea

pp

le, c

arr

ot,

Art

em

isia

an

nu

a, J

atr

op

ha

cu

rca

sM

icro

pro

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ga

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Inst

itute

for A

gric

ultu

ral

Re

sea

rch

(IA

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Zaria

-N

ige

ria

Ma

rke

r Ass

isste

d S

ele

ctio

n in

co

wp

ea

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, Ag

aro

se G

el

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ctr

op

ho

resis

, FT

A-

Pla

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rd a

nd

Ge

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me

nta

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NA

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ID, K

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ust

, USA

Ge

no

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ing

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B e

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ctio

n m

eth

od

,A

ga

rose

Ge

le

lec

tro

ph

ore

sis a

nd

PC

RIC

RIS

AT



36

N°

PAY

SLa

bo

rato

ires

Ac

tivité

s e

n c

our

s d

e ré

alis

atio

nTe

chn

ique

s ut

ilisé

es

Part

ena

ires

18

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ERIA

Bio

tec

hno

log

yLa

bo

rato

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L -

NA

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Ma

ss p

rop

ag

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n a

nd

su

pp

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nt

pla

nts

e.g

. pin

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lan

tain

, su

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r ca

ne

, etc

.

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cu

lture

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na

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od

an

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ers

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Na

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l Bio

tec

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ge

ncy

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mm

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Ag

ricul

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l Pro

duc

tC

om

pa

ny, I

NC

A (

Cub

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IITA

Pro

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ol d

eve

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me

nts

of d

iffe

ren

t e

co

no

mic

an

dtr

ee

cro

ps

eg

. Eu

ca

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tus,

Ne

em

, etc

.Ti

ssu

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ultu

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ese

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stitu

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fN

ige

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g, M

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cu

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atio

n a

nd

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ing

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da

te p

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ts a

nd

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ima

lsM

ole

cu

lar m

ark

ers

su

ch

as

RA

PD a

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AFL

PU

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ers

ity o

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go

s, L

ag

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an

ad

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Do

rma

ncy

Eva

lua

tion

----

Inst

itute

of A

gric

ultu

ral

Re

sea

rch

(IA

R),

Za

ria.

Un

ive

rsity

of A

gric

ultu

re,

Ab

eo

kuta

.

19

Bio

tec

hno

log

ya

nd G

ene

ticEn

gin

ee

ring

Ad

vanc

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Lab

ora

tory

(B

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L -

SHES

TCO

)

Pla

nt

Tiss

ue

Cu

lture

of f

oo

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rop

s (B

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a /

Pla

nta

in, P

ine

ap

ple

, Su

ga

rca

ne

, etc

) a

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tre

ec

rop

s (S

he

a b

utt

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Mo

ring

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Ne

em

, etc

) M

icro

pro

pa

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C

om

me

rcia

l ve

ntu

re w

ith a

ny

sta

keh

old

er (

e.g

Ba

lye

saSt

ate

Go

vern

me

nt)

Pl

an

t Ti

ssu

e C

ultu

re o

f fo

od

cro

ps

(Ba

na

na

/Pl

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tain

, Pin

ea

pp

le, S

ug

arc

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e, e

tc)

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d t

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cro

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(Sh

ea

bu

tte

r, M

orin

ge

r, N

ee

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uc

aly

ptu

s e

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Tem

po

rary

Imm

ers

ion

Bio

rea

cto

r Te

ch

no

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y

Na

tion

al C

en

ter f

or

Sug

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e R

ese

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h,

Ha

van

a, C

UBA

C

rop

resis

tan

ce

ag

ain

st b

iotic

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d a

bio

tic s

tre

sse

sa

nd

bio

fort

ific

atio

n (

rice

, ca

ssa

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ow

pe

a a

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sorg

hu

m)

Ge

ne

tic E

ng

ine

erin

g

(ge

ne

clo

nin

g, g

en

etr

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sfo

rma

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dm

ole

cu

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ha

rac

teriz

atio

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Pro

f. Ja

me

s R

. Ke

tud

at

Ca

irns,

Inst

. of S

cie

nc

e

Sura

na

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Un

iv. o

f Te

ch

.,N

akh

on

Ra

tch

asim

a

Ma

rke

r – A

ssist

ed

Se

lec

tion

(M

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cu

lar M

ap

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Ac

he

r, so

rgh

um

, oil-

pa

lm t

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) SS

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eq

ue

nc

ing

,PC

R (

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pla

nn

ed

)1)

NC

RI,

Nig

eria

(2

) N

IFO

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ige

riaIs

ola

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an

d c

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rac

teriz

atio

n o

f re

sista

nt

ge

ne

into

ma

to fo

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sariu

m w

ilt d

isea

se.

mR

NA

iso

latio

n a

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Sub

tra

ctiv

e h

ybrid

iza

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tec

hn

iqu

e

Un

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f Ag

ricu

lture

,A

be

oku

ta, N

ige

ria

Ide

ntif

ica

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of n

ove

l in

dig

en

ou

s m

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be

s o

fb

iod

eg

rad

atio

n o

f po

lluta

nts

(w

ast

e p

last

ics

an

dc

he

mic

als)

M

icro

bio

log

y, s

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ue

nc

ing

In

- H

ou

se

Bio

-min

ing

of i

nd

ige

no

us

/ lo

ca

l mic

ro-o

rga

nism

s fo

rn

ove

l ch

em

ica

ls a

nd

ph

arm

ac

eu

tica

ls in

clu

din

giso

latio

n a

nd

ext

rac

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of s

ec

on

da

ry m

eta

bo

lite

sfr

om

en

do

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ytic

fun

gi

Mic

rob

iolo

gy,

se

qu

en

cin

g

In -

Ho

use

Ide

ntif

ica

tion

an

d c

ha

rac

teriz

atio

n o

f he

rba

l pla

nts

with

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timic

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ial a

nd

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ti-o

xid

ativ

e p

ote

ntia

ls M

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bio

log

y, s

ero

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asa

raw

a S

tate

Un

ive

rsity

,Ke

ffi a

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Ed

uc

atio

n T

rust

Fu

nd

Nig

eria

Ap

plic

atio

n o

f irr

ad

iatio

n t

ec

hn

iqu

e

Ga

mm

a ir

rad

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n fo

rst

eril

iza

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Ma

x R

ub

ne

r In

stitu

t,Bu

nd

esf

ors

ch

un

gsin

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t fü

rEr

nä

hru

ng

un

d L

eb

en

smitt

el,

Karls

ruh

e G

erm

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y Bi

od

eg

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atio

n a

nd

Bio

rem

ed

iatio

n o

f co

mm

od

ityp

last

ics

an

d o

il p

ollu

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U

rba

n m

inin

g a

nd

bio

ma

teria

ls sc

ien

ce

In

-ho

use

De

velo

pm

en

t o

f va

lue

-ad

de

d p

rod

uc

ts fr

om

wa

ste

Pa

pe

r an

d p

ulp

te

ch

no

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ya

nd

ce

ram

ics

tec

hn

olo

gy

Ra

w M

ate

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Re

sea

rch

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dD

eve

lop

me

nt

Co

un

cil

(RM

RD

C)

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d F

ed

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l Min

istry

of E

nvi

ron

me

nt

De

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pm

en

t o

f Bio

Mic

roEl

ec

tro

Me

ch

an

ica

lSy

ste

ms

(Bio

MEM

S) d

evi

ce

s fo

r dru

g d

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Ti

ssu

e E

ng

ine

erin

g a

nd

co

ntr

olle

d re

lea

se o

f dru

gs

Afri

ca

n U

nive

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of S

cie

nce

and

Te

chn

olo

gy

and

Prin

ce

ton

Uni

veris

ty U

SA

Bio

Na

no

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hn

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gy

for C

an

ce

r de

tec

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dtr

ea

tme

nt

Phyt

osy

nth

esis

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db

iosy

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esis

of

na

no

pa

rtic

les

Afri

ca

n U

nive

rsity

of S

cie

nce

and

Te

chn

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gy

and

Prin

ce

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Uni

vers

ity U

SA.

An

inve

nto

ry o

f pla

nts

of m

ed

icin

al a

nd

ind

ust

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valu

e in

Na

sara

wa

Sta

te, N

ige

ria

Bio

pro

spe

ctin

g

Na

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te U

niv

ers

ity,

Keff

i an

d E

du

ca

tion

Tru

st F

un

dN

ige

ria

37



N°

PAY

SLa

bo

rato

ires

Ac

tivité

s e

n c

our

s d

e ré

alis

atio

nTe

chn

ique

s ut

ilisé

es

Part

ena

ires

20

SEN

EGA

L

Lab

ora

toire

Ca

mp

us d

eBi

ote

chn

olo

gie

sV

ég

éta

les

(LC

BV-U

CA

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Cu

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in v

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du

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lmie

r da

ttie

rEm

bry

og

en

èse

so

ma

tiqu

eIR

D M

on

tpe

llie

r, LR

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HB

Alg

er,

CER

D (

Djib

ou

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Un

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rsité

de

No

ua

ckc

ho

ttSé

lec

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de

cu

ltiva

rs d

e p

alm

ier d

att

ier a

da

pté

s à

lasé

ch

ere

sse

et

à la

sa

linité

Cu

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d’e

mb

ryo

ns,

myc

ho

riza

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IRD

-Co

rus

Cu

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in v

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du

ma

nio

cM

icro

pro

pa

ga

tion

Dire

ctio

n d

e l’

Ag

ricu

lture

/M

inist

ère

de

l’A

gric

ultu

re

Cul

ture

in v

itro

de

la p

om

me

de

terre

Mic

rop

rop

ag

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nd

s n

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na

l de

Re

ch

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he

Ag

rico

le e

tA

gro

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en

taire

C

ultu

re in

vitr

o d

u fr

aisi

er

Mic

rop

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ag

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nEN

DA

Tie

rs-M

on

de

Cu

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in v

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de

Ac

ac

ia s

en

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ale

nsis

Mic

rop

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ag

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nA

SILA

-Gu

m S

NEt

ud

e d

e la

div

ers

ité g

én

étiq

ue

et

cu

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in v

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du

fila

oPC

R, E

lec

tro

ph

orè

seM

icro

pro

pa

ga

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IRD

-DSF

Etud

e d

e la

div

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éné

tique

et s

éle

ctio

n c

hez

le n

iéb

éPC

R, E

lec

tro

ph

orè

seA

IEA

, Virg

inia

Te

ch

(U

SA

21

Ce

ntre

d’E

tud

eRé

gio

nal p

our

l’Am

élio

ratio

n d

el’A

da

pta

tion

à la

Séc

here

sse

(C

ERA

AS-

ISRA

)

Etu

de

de

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ive

rsité

gé

né

tiqu

e d

u S

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ho

, Re

ch

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d'Id

éo

typ

es

SSR

sC

NR

A d

e B

am

be

y

Etu

die

de

la

div

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ité g

én

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ue

de

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co

llec

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du

fon

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ég

al

RA

PDs

Un

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rsité

de

Th

ies

Re

ch

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de

QTL

s /

ca

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cité

de

fixa

tion

d'a

zote

du

nié

bé

SSR

sU

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ers

ité d

e D

aka

r

Ap

plic

atio

n o

f DN

A m

ark

ers

for c

ow

pe

a re

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VIS



38

3.3.3 Capacités en infrastructures et équipements techniques des laboratoires

Au plan des capacités en infrastructures, la majorité des laboratoires dispose de salles spacieuses etadaptées à leurs domaines de recherche. Cependant, il faut signaler l’étroitesse des locaux duBiotechnology Laboratory (BL-NARI) en Gambie. Seuls quelques laboratoires sont équipés de groupesélectrogènes pour sécuriser les manipulations en cours lors des coupures générales de l’électricitépublique. De même, très peu de laboratoires disposent de serres de type P2 (OGM) fonctionnelles etde locaux de quarantaine, qui sont pourtant très importants dans un dispositif de biosécurité.

Le niveau d’équipement scientifique des laboratoires est en général assez important, même s’il existeune différence, en termes de qualité et de quantité, d’un laboratoire à un autre (tableau III). II existecependant des laboratoires dont le plateau technique est insuffisant. On distingue ainsi, en matièred’équipement, trois groupes de laboratoires : (i) sept laboratoires très bien équipés (BGEAL-SHESTCO,LBMA-UB, LBA-CIRDES, LNERV-ISRA, BC-UGL, LVCQV-LANADA et BL-CRI), qui disposent de matériels depointe, notamment de séquenceur automatique ou d’un oligosynthétiseur ou encore d’une PCRquantitative (qPCR) ; (ii) douze laboratoires bien équipés (LVBV-INERA, LMLA-IRSAT, LCB-CNRA,LaGeFaGe-UAA, ITC-GB, REC-BNARI, PB-BNARI, LCV-MEP, BL-IAR, BL-NACGRAB, LCBV-UCAD et CERAAS-ISRA); (iii) quatre laboratoires moyennement équipés (LGBV-INERA, BL-NARI, LAPGBV-IPR, et ISRA-PRO).

Il faut retenir cependant que tous les laboratoires visités disposent au minimum des équipements debase nécessaires à la conduite de leurs activités de recherche en regard de leur spécialisation et deleur mandat. Les niveaux d’équipement des laboratoires du premier groupe sont similaires ou supérieursà ceux de certains laboratoires du Nord. Toutefois, pour suivre l’avancée de la biotechnologie,d’importants équipements modernes indispensables au bon fonctionnement des laboratoires debiologie moléculaire doivent être acquis dans le cadre d’un programme de renforcement descapacités.

39



Tableau III: Equipements disponibles dans les laboratoires debiotechnologies visités

EQUIPEMENTSBURKINA FASO MALI SENEGAL

LVBVINERA

LGBVINERA

LMLAIRSAT

LBACIRDES

LBMAUB

LAPGBVIPR

LCVMEP

LCBVUCAD

CERAASISRA

ISRAPRO

LNERVISRA

Autoclaves F F F F F F F F F F F

Bain marie F F F F F F F F F

Balance de précision F F F F F F F F F - F

Système photo de gel F F F F F F F - F

Centrifugeuse à bassevitesse F F F F F F F F F F F

Centrifugeuse à grandevitesse F - - F F NF F - F - F

PCR conventionnelle F F - F F - F F F - F

PCR quantitative - - - F F - - - - - F

Canon à microparticules - - - - - - - - - - NF

Congélateur à –20°C F F - F F - F NF F F F

Congélateur –80°C F - F F F - F NF F F F

Dessiccateur F - F NF - F F F F - F

Système distillateur eau F F F F F F F F F NF F

Chambre froide F NF - NF - F F F F F F

Lyophilisateur F - - NF F - F F NF F F

Hotte chimique F - - - - - F F F - F

Hotte bactériologique F - - - F - F - F - F

Machine à glace F F - F F - NF NF F - F

Cytomètre à flux - - - - - - - - - - F

Ultra centrifugeuse F - F F - F - - - F

Micro centrifugeuse F - F F F F F - F - F

Four à micro onde F F - F F F F F F - F

Speed Vaccum - F - - F - F F - - -

Séquenceurautomatique d’ ADN - - - F F - - - - - -

Spectrophotomètre UV /visible F F F NF F NF F NF F - F

Agitateur/incubateur demicroplaques F F - F F - F - - F F

Etuves F F F F F F F NF F F F

Homogénéisateur - F NF - F - - F - - F

Hotte à flux laminaire F - - F F F F F F F F

Incubateur de cellules F - - - F - F - - F F

Chambre de culture(CONVIRON) F - - - - - F F - - F

Chambre de culture(logettes) F - - - F F - F - - F

Microscope composé F - - - F F F F F F F



40

EQUIPEMENTSBURKINA FASO MALI SENEGAL

LVBVINERA

LGBVINERA

LMLAIRSAT

LBACIRDES

LBMAUB

LAPGBVIPR

LCVMEP

LCBVUCAD

CERAASISRA

ISRAPRO

LNERVISRA

Microscope àfluorescence - - - - - - F F - - F

Microscope à inversionde phase - - F - F - F F - F F

Microscopeélectronique - - - - - - - NF - - -

Sécheur gel (sous vide) - F - - F - - - F - F

Pompe péristaltique - - - - - - F - F F F

Chromatographe phasegazeuse - - F - - - F F NF - NF

Chromatographecouche mince - - NF - - - - - F - F

Equipement pour le testELISA F - - F F NF F - - - F

Equipemt.électrophorèseacrylamide

F F NF F F NF F F F - F

Equipementélectrophorèse agarose F F - F F F F F F - F

Equipementélectrophorèse isozyme - - - - - - - - - - -

Equipement pourWestern blot F - - F F - F - - F

Distillateur de produitschimiques F - - - F - - - - - -

HPLC - - NF - - - F F - - F

Four pasteur F - F - - - F NF - F F

Equipementinformatique F F F F F F F F F NF F

Accès internet F F F F F F F F F F F

Equipements spécifiques

Groupe électrogène - - - F F - - - F - -

Biofermenteur - - - - - - - - - NF -

Vibro-broyeurs - - - - - - - - F - -

Unité de productiond’azote liquide - - - F - - - - - - -

Matériel de collecte desperme - - - F - - - - - - -

Autres appareilsspécifiques - - 8 - - - - - - - -

F : équipement fonctionnelNF : équipement non fonctionne

41

Tableau III : Equipements disponibles dans les laboratoires debiotechnologies visités (suite)



EQUIPEMENTSCOTE D’IVOIRE GHANA GAMBIE

LCBCNRA

LVCQVLANADA

LaGeFaGeUAA

RECBNARI

PBBNARI

BCUGL

BLCRI

ITC BLNARI

Autoclaves F F F F F F F F -

Bain marie F F F F F F F F F

Balance de précision F F F F F F F F F

Système photo de gel F F F F F F F F F

Centrifugeuse à basse vitesse F F F F F F F F F

Centrifugeuse à grande vitesse NF F F - F F F F F

PCR conventionnelle F F F F F F F F F

PCR quantitative - F - - - F F - -

Canon à microparticules - - - - - - F - -

Congélateur à –20°C F F F F F F F F -

Congélateur –80°C F F F F F F F -

Dessiccateur NF F - F F F F F -

Système distillateur eau F NF NF F F F F F -

Chambre froide F NF - NF - F F - -

Lyophilisateur - F - - - F - - -

Hotte chimique F F - - F F F F -

Hotte bactériologique F F - F F F F F -

Machine à glace F F F F NF F F F -

Cytomètre à flux - - - - - - NF - -

Ultra centrifugeuse - - - - - F F F -

Micro centrifugeuse F F F F F F F F F

Four à micro onde F F F F F F F F

Speed Vaccum - - - - - F - F

Séquenceur automatique (ADN) - - - - - - - - -

Spectrophotomètre UV / visible NF F F F - F F F F

Agitateur/incubateur demicroplaques F F - F F F F F F

Etuves F F F F F F F - -

Homogénéisateur NF F F - - - F F F

Hotte à flux laminaire F F F - F F F - -

Incubateur de cellules F F - - F F NF F -

Chambre de culture (CONVIRON) F F F - F F NF - -

Chambre de culture (logettes) F - - - F F F - -

Microscope composé F F - F F F F F F

Microscope à fluorescence - F - - - - F F -

Microscope à inversion de phase - - - - - - F F -

Microscope électronique - - - - - F - - -

Sécheur gel (sous vide) NF F - - - F - - -



42

EQUIPEMENTSCOTE D’IVOIRE GHANA GAMBIE

LCBCNRA

LVCQVLANADA

LaGeFaGeUAA

RECBNARI

PBBNARI

BCUGL

BLCRI

ITC BLNARI

Pompe péristaltique - F - - F F F - -

Pompe à vide F F F - - F F - -

Chromatographe phase gazeuse - - - - - - - - -

Chromatographe couche mince - - - - - - - - -

Equipement pour le test ELISA F F - F F F F F -

Equipement électroph. Acryl. F F F F F F F - -

Equipement électroph. agarose F F F F - F F - F

Equipement électroph. isozyme F - F - - - - - -

Equipement pour Western blot - F - F - - - - -

Distillateur de produits chimiq. - - - - - - F - -

HPLC NF - - F F NF F - F

Four pasteur - NF - F - F F - F

Equipement informatique F F F F F F F F F

Accès internet F F F F F F F F F

Equipements spécifiquesGroupe électrogène F - - - F F F - -

Microscope inversé - - - - F - - - -

Biofermenteur - - - - - - - - -

Vibro-broyeurs - - - - - - - - -

Fluoriomètre NF - - - - - - - -

EQUIPEMENTSNIGERIA

BLIAR

BLNACGRAB

BGEALSHESTCO

Autoclaves F F F

Bain Marie F F F

Balance de précision F F F

Système photo de gel F F F

Centrifugeuse à basse vitesse F F F

Centrifugeuse à grande vitesse F F F

PCR conventionnelle F F F

PCR quantitative - - -

Canon à microparticules - - F

Congélateur à –20°C F F F

Congélateur –80°C - - F

Dessiccateur F F F

Système distillateur eau F F F

Chambre froide F F -

Lyophilisateur - F F

Tableau III : Equipements disponibles dans les laboratoires debiotechnologies visités (fin)

43



EQUIPEMENTSNIGERIA

BLIAR

BLNACGRAB

BGEALSHESTCO

Hotte chimique F F FHotte bactériologique - F FMachine à glace F - FCytomètre à flux - - -Ultra centrifugeuse F - FMicro centrifugeuse F F FFour à micro onde F F FSpeed Vaccum - - -Séquenceur automatique d’ADN - - FSpectrophotomètre UV / visible - F FAgitateur/incubateur de microplaques - F -Etuves F F FHomogénéisateur F - -Hotte à flux laminaire F F FIncubateur de cellules - F FChambre de culture (CONVIRON) F F FChambre de culture (logettes) F F FMicroscope composé - F -Microscope à fluorescence - - -Microscope à inversion de phase - - FMicroscope électronique - F FSécheur gel (sous vide) - - -Pompe péristaltique F F -Pompe à vide - - FChromatographe phase gazeuse - - FChromatographe couche mince - - FEquipement pour le test ELISA - - -Equipement électrophorèse acrylamide F F FEquipement électrophorèse agarose F F FEquipement électrophorèse isozyme - - -Equipement pour Western blot - - -Distillateur de produits chimiques - F FHPLC - - FFour pasteur F - FEquipement informatique F F FAccès internet F F F

Equipements spécifiquesGroupe électrogène F - FBiofermenteur F - FDensitomètre - - FElectroporarteur - - FIncinérateur F - -Oligosynthétiseur - - FMicroscope à balayage - - FSpectrophotomètre abs. atomique - - FDefractomètre - - FTemporary immersion bioreactor’s - F F



44

LVBV : Laboratoire de Virologie et de Biotechnologies végétalesLGBV : Laboratoire de Génétique et de Biotechnologies végétalesLMLA : Laboratoire de Microbiologie et Laboratoires AssociésLBA : Laboratoire de Biotechnologies Animales/CIRDESLBMA : Laboratoire de Biologie Moléculaire AppliquéeLAPGBV : Laboratoire d’Agro-physio-génétique et de Biotechnologie végétale LCV : Laboratoire Central VétérinaireIAR : Institute for Agricultural ResearchNACGRAB : National Centre for Genetic Resources & BiotechnologySHESTCO : Sheda Science and Technology ComplexLCBV : Laboratoire Campus de Biotechnologie VégétaleCERAAS : Centre d’Etude Régional pour l’Amélioration de l’Adaptation à la SécheresseISRA-PRO : Institut Sénégalais de Recherche Agricole / ProductionLNERV : Laboratoire National de l’Elevage et de Recherches Vétérin.

F : équipement fonctionnelNF : équipement non fonctionnel

45



3.3.4 Capacités humaines des laboratoires et encadrement d’étudiants

Les enquêtes réalisées montrent que les capacités humaines constituent l’une des faiblesses deslaboratoires.

• Chercheurs

Sur la base du nombre de chercheurs par laboratoire, qui varie entre 3 et 33, les laboratoires sontrépartis en quatre groupes (tableau IV, Fig.1). Le premier groupe n’est représenté que par le laboratoireLCV-MEP, qui a un effectif important de 33 chercheurs. Le deuxième groupe comprend dix laboratoires(LVBV-INERA, LBA-IRSAT, LBA-CIRDES, PB-BNARI, LAPGBV-IPR, LBMA-UB, LNERV-ISRA, LaGeFAGe-UAA, BL-NACGRAB et BGEAL-SHESTCO), qui ont un effectif moyen (entre 8 et 15 chercheurs). Neuf autreslaboratoires (BL-CRI, LCB-CNRA, REC-BNARI, ISRA-Productions, LCBV-UCAD, CERAAS-ISRA, ITC, LGBV-INERA et BL-IAR), formant le troisième groupe, se caractérisent par un effectif de chercheurs faible(quatre à sept). Enfin, trois laboratoires (BC-UGL, BL-NARI, LVCQV-LANADA) ont un très faible effectif(trois chercheurs) et constituent le quatrième groupe.

• Personnel technique d’appui

L’effectif du personnel d’appui technique à la recherche varie entre 0 et 34 techniciens (tableau IV,Fig. 1). Un seul laboratoire (LaGeFAGe) ne dispose pas de technicien spécialisé tandis que le LCV encompte 34. Huit laboratoires, soit 35% (LGBV-INERA, LCV-MEP, LCB-CNRA, LVCQV, BL-NARI, BC, ITC etISRA-Production) ont au moins un technicien pour un chercheur. Deux de ces laboratoires (ISRA-Production et ITC) ont un ratio technicien/chercheur très élevé (2 à 4). Toutefois, 65% des laboratoiresvisités présentent de mauvais ratios technicien/chercheur (moins d’un technicien par chercheur). Eneffet, dans ces laboratoires, un technicien est affecté à deux, voire trois chercheurs. C’est le cas auLVBV-INERA, au LMLA-IRSAT, au LBA-CIRDES, au PB, au LAPGBV-IPR, au LBMA-UB, au BL-IAR, au BL-NACGRAB, au LCBV-UCAD et au CERAAS-ISRA.

• Encadrement et formation

Concernant l’encadrement et la formation, il apparait que 65% des laboratoires encadrent beaucoupplus d’étudiants de niveau 3è cycle (DEA, master II et doctorat) que de techniciens supérieursspécialisés (BTS, DUT, maîtrise, licence, BSc) (tableaux IV, V, Fig 1).

Sept laboratoires (soit 30%), qui encadrent en moyenne au moins deux stagiaires de 3è cycle par an,ont de bonnes dispositions à la formation. Deux laboratoires, le LCB-CNRA et le LCBV-UCAD, sont entête, avec au moins quatre stagiaires de 3è cycle encadrés par an. Suivent le BC-UGL, le LVBV-INERA,le LNERV-ISRA, le LBA-CIRDES et le LVCQV-LANADA, qui forment chacun en moyenne deux stagiairesde 3è cycle par an. Les laboratoires LMLA-IRSAT, LaGeFaGe-UAA, ITC, PB-BNARI, LBMA-UB et LAPGBV-IPR forment chacun en moyenne un stagiaire de 3è cycle par an. Les autres forment ou encadrentmoins d’un stagiaire de 3è cycle par an (tableau V).

Quant à la formation de stagiaires de 2è cycle et de premier cycle, trois laboratoires se distinguent parun score significatif ; il s’agit de BGEAL-SHESTCO (45 stagiaires par an), LAPGBV-IPR (20 stagiaires paran) et BC-UGL (6 stagiaires par an). Les autres laboratoires ne forment qu’un seul ou même aucunstagiaire de cette catégorie (tableau V, Fig. 1).

Selon les laboratoires, il existe deux à sept spécialités de formation des stagiaires. La culture in vitro,l’étude de la diversité génétique, la biologie moléculaire, l’étude de pathogènes et la génétiqueanimale constituent les plus fréquentes (tableau V).



46

Tableau IV : Capacités humaines des laboratoires visités etencadrement d’étudiants

PAYS Laboratoires Nombre dechercheurs

Nombre detechniciensspécialisés

Nombrestagiaires3è cycle

Autresstagiaires(2è cycle)

1

BURKINA FASO

Laboratoire de Virologie et deBiotechnologies Végétales (LVBV)

11 05 15 00

2 Laboratoire de Génétique et deBiotechnologies Végétales (LGBV) 04 06 03 05

3 Laboratoire de Microbiologie etLaboratoires Associés (LMLA) 13 05 05 01

4 Laboratoire de BiotechnologiesAnimales (LBA) 11 06 10 06

5

CÔTED’IVOIRE

Laboratoire Central deBiotechnologies (LCB) 07 08 21 08

6 Laboratoire de Virologie et deContrôle de Qualité Vaccin (LVCQV) 03 05 08 00

7Laboratoire de GénomiqueFonctionnelle et AméliorationGénétique (LaGeFAGe)

09 00 05 00

8GAMBIE

International Trypano-ToleranceCenter (ITC) 04 09 06 02

9 Biotechnology Laboratory (BL-NARI) 03 05 02 00

10

GHANA

Radiation Entomology Center (REC) 05 03 00 03

11 Plant Biotechnology (PB) 10 03 06 00

12 Biotechnology Centre (BC) 03 03 17 30

13 Biotechnology Laboratory (BL-CRI) 08 06 04 01

14

MALI

Laboratoire de Biologie MoléculaireAppliquée (LBMA) 11 03 07 00

15Laboratoire d’Agro-physio-génétiqueet de Biotechnologies Végétales(LAPGBV)

14 03 6 100

16 Laboratoire Central Vétérinaire (LCV) 33 34 01 02

17

NIGERIA

Biotechnology Laboratory / Institute forAgricultural Research (BL - IAR) 08 04 06 01

18Biotechnology Laboratory / NationalCentre for Genetic Resources andBiotechnology (BL - NACGRAB)

14 07 02 08

19Biotechnology and Genetic EngineeringAdvanced Laboratory / Sheda Science &Technology Complex (BGEAL - SHESTCO)

15 10 13 227

20

SENEGAL

Laboratoire Campus deBiotechnologies Végétales (LCBV) 05 02 29 00

21Centre d’Etude Régional pourl’Amélioration de l’Adaptation à laSécheresse (CERAAS)

04 02 04 02

22Institut Sénégalais de RecherchesAgricoles - Production(ISRA-Production)

06 22 02 02

23Laboratoire National de l’Elévageet de Recherches Vétérinaires(LNERV)

14 11 10 03

47



Figure 1a : Effectif de chercheurs et de techniciens des laboratoires (au cours des cinq dernièresannées)

Figure 1b : Effectif de stagiaires formés dans les laboratoires (pendant les cinq dernières années)



48

LVBV : Laboratoire de Virologie et de Biotechnologies Végétales LGBV : Laboratoire de Génétique et de Biotechnologies Végétales LMLA : Laboratoire de microbiologie et laboratoires associés LBA : Laboratoire de Biotechnologies animales LCB : Laboratoire Central de Biotechnologies LVCQV : Laboratoire de Virologie et de Contrôle de Qualité VaccinLaGeFAGe : Laboratoire de Génomique Fonctionnelle et Amélioration GénétiqueITC : International Trypano-Tolerance Center BL : Biotechnology laboratory-NARIREC : Radiation Entomology Center –BNARIPB : Plant Biotechnology-BNARIBC : Biotechnology CentreBL : Biotechnology LaboratoryLBMA : Laboratoire de Biologie Moléculaire AppliquéeLAPGBV : Laboratoire d’Agro-Physio-Génétique et Biotechnologies VégétalesLCV : Laboratoire Central VétérinaireBL : Biotechnology Laboratory-IARBL : Biotechnology Laboratory-NACGRABBGEAL : Biotechnology and Genetic Engineering advanced laboratoryCERAAS : Centre d’Etude Régional pour l’Amélioration de l’adaptation à la SécheresseLCBV : Laboratoire Campus de biotechnologies Végétales LNERV : Laboratoire National de l’Elevage et de la recherche Vétérinaires ISRA-Production : Institut Sénégalaise de recherche Agricole production

49

Tableau V : Niveau et spécialité des étudiants encadrés auxcours des cinq dernières années (2005-2010)



N° PAYS Laboratoires visités Diplôme encadré Spécialités

1

BURKINA FASO

Laboratoire de Virologie et deBiotechnologies Végétales (LVBV)

01 Master05 DEA07 Doctorats02 Doctorats en cours

Culture in vitro, VulgarisationBiologie moléculaire, Etude de pathogènes Virologie, Sélection, Bio mo

2 Laboratoire de Génétique et deBiotechnologies Végétales (LGBV)

2 DEA1 PhD05 Techniciens

Génétique et Biotechnologie

3 Laboratoire de microbiologie etlaboratoires associés (LMLA)

01 DEA01 DESS01 Doctorat03 Doctorat en cours

BiotechnologieIndustrie agro alimentaireSciences de l’alimentMicrobiologie, Nutrition

4 Laboratoire de BiotechnologiesAnimales (LBA)

06 Doctoratd’université04 Master/DEA04 Ingéniorat deDéveloppement rural02 Technicienssupérieurs d’étudesspécialisées

Etude de pathogènes, Caractérisation des gènes, Diversité génétique, Biologie moléculaire, Etude de pathogènes, Diversité génétique

5

CÔTED’IVOIRE

Laboratoire Central deBiotechnologies (LCB)

14 Doctorat (Thèseunique)07 DEA03 IngénieursAgronomes05 TechniciensSupérieurs

Culture in vitro, Caractérisationmoléculaire, Diversité génétique,Caractérisation des pathogènes,Etude des pathogènes, sélectionassistée MM

6 Laboratoire de Virologie et deContrôle de Qualité Vaccin (LVCQV)

04 DEA04 Doctorat unique

-

7Laboratoire de GénomiqueFonctionnelle et AméliorationGénétique (LaGeFAGe)

05 DoctoratDiversité Génétique, Culture invitro, Ecologie, GénétiqueAnimale, Flux de gène

8

GAMBIE

International Trypano-ToleranceCenter (ITC)

02 Bachelors ofScience02 Masters04 Doctorats

Agriculture, Santé AnimaleNutrition, parisitologieMicrobiologie, Santé Public

9 Biotechnology laboratory (BL-NARI)

02 Doctorats

Effet de l’Aflatoxine surl’arachideproduction, Rice blast-selectionbreeding,Diversité génétique



50


10

GHANA

Radiation Entomology Center(REC-BNARI)

01 Senior Technician01 Technician01 Technologist

-

11 Plant Biotechnology (PB - BNARI) 06 Doctorats

Sélection / Mutation génétique,sanitation/ virus et techniquesde culture de Tissue (IAEA),propagation in vitro manioc(IAEA), Tissue culture techniques-cassava, ananas et Jatropha(IAEA)

12 Biotechnology Centre(BC – Legon Univ.)

30 BSc15 MPhil02 PhD

Genetic Diversity, PlantImprovement, Marker AssistedSelection, Molecular Biology;Plant Pathology

13 Biotechnology Laboratory(BL-CRI)

01 BSc03 MPhil01 PhD

Micropropagation, mangue,ananas Diversité génétique, DNAfingerprinting Introgression de larésistance de l’ACMV dans lemanioc et Ceiba

14

MALI

Laboratoire de BiologieMoléculaire Appliquée(LBMA-FAST)

07 DEAParasito-entomologie,Amélioration des végétaux,Biotechnologie appliquée

15Laboratoire d’Agro-physio-génétique et de Biotechnologiesvégétales (LAPGBV - IPR)

06 DEA50 ingénieurs50 Technicienssupérieurs

Parasito-entomologie,Amélioration des végétaux

16 Laboratoire Centrale Vétérinaire (LCV)

01 Techniciend’élevage01 IngénieurZootechnicien01 DEA

Maladies infectieusesMicrobiologiesMicrobiologies

17

NIGERIA

Biotechnology Laboratory(BL - IAR)

03 PhD01 master 01 Bsc

SAM, CIV, transformationgénétique, Biologie Moléculaire

18 Biotechnology Laboratory (BL - NACGRAB)

02 Master03 BscCertificate

Botanique, Microbiologie, CIVForesterie, Biochimie, TIB,Biotech. Végét., Ressourcesgénétiques, productionsvégétales, marqueursmoléculaires

19Biotechnology and GeneticEngineering Advanced Laboratory (BGEAL - SHESTCO)

03 Doctorats10 Master227 Bsc

Diversité génétique etmicrobiologie, Microbiologie,Transformation génétique, CIV.Microbiologie, BiologieMoléculaire

51



- Non précisé

3.3.5 Aptitude des laboratoires à la production scientifique

Concernant la production scientifique des cinq dernières années (2005-2010), on observe de grandesdifférences entre les laboratoires : entre deux et 80 publications dans une à 45 revues différentes(tableau VI, Fig.2). Le LBA-CIRDES, avec un nombre exceptionnel de 80 publications parues dans 45revues scientifiques différentes, est le plus productif. Le LCB-CNRA (32 publications dans 24 revues) etle LVBV-INERA (30 publications dans 20 revues scientifiques) ont une production honorable.

En rapportant le nombre de publications au nombre de chercheurs, on observe que l’aptitude à lapublication des résultats de recherche est faible, surtout pour 70% des laboratoires. En effet, seulementsix laboratoires ont produit au moins 2,5 publications par chercheur en cinq ans ; il s’agit de BC-UGL(1,6 publication/chercheur/an), LBA-CIRDES (1,5 publication/chercheur/an), LVCQV-LANADA (1,4publication/chercheur/an), LCB-CNRA (1 publication/chercheur/an), LVBV-INERA et LGBV-INERA (0,5publication /chercheur /an. Onze laboratoires ont une production moyenne comprise entre 0,2 et 0,4publication/chercheur/an. Les autres laboratoires ont produit moins de 0,2 publication/chercheur/an.

Notons cependant que 55% des laboratoires ont une très bonne tendance à la diversification desrevues de publication (tableau VI, Fig. 2).


20

SENEGAL

Laboratoire Campus deBiotechnologies Végétales(LCBV - UCAD)

08 Doctorats08 Doctorats en cours11 DEA2 Masters en cours

Culture in vitro, Etude des flux degènes, Diversité génétique,Biologie moléculaire,Caractérisation des gènesCulture in vitro

21Centre d’Etude Régional pourl’Amélioration de l’adaptation à laSécheresse (CERAAS)

IngénieurMaster03 DEAThèse

Diversité génétiqueTechnique de marquagemoléculaireDiversité génétique, DiversitémoléculaireGénétique moléculaire

22Institut Sénégalaise de rechercheAgricole /Production(ISRA/Production)

TechnicienssupérieursTechniciens enélevageIngénieurs destravaux d’élevageDocteurs vétérinaires

Analyses BiologiquesProduction animaleProduction animaleMédecine vétérinaire

23Laboratoire National de l’Elevageet de la recherche Vétérinaires(LNERV-ISRA)

2 DESS01 Master I02 Master II02 DEA04 Thèses vétérinaires02 Thèses Pharmacie

AquacultureGénie chimiqueGéographie et ProductionanimalBiochimie des produits naturelsDoctorat vétérinaire ; Ingénieurdes travaux d’élevage ;Pharmacie



52

Tableau VI : Récapitulatif des productions scientifiques descinq dernières années

N° PAYS Laboratoires Nombre dechercheurs

Nombre depublications

Nombrede revues

scient.

Nombrepubli/

cherh./an

1

BURKINAFASO

Laboratoire de Virologie et deBiotechnologies Végétales (LVBV-INERA) 11 30 20 0,5

2 Laboratoire de Génétique et deBiotechnol. Végétales (LGBV-INERA) 04 11 08 0,5

3 Laboratoire de Microbiologie etLaboratoires Associés (LMLA-IRSAT) 13 14 07 0,2

4 Laboratoire de BiotechnologiesAnimales (LBA-CIRDES) 11 80 45 1,5

5

CÔTED’IVOIRE

Laboratoire Central deBiotechnologies (LCB-CNRA) 07 35 24 1,0

6 Laboratoire de Virologie et de Contrôlede Qualité Vaccin (LVCQV-LANADA) 03 21 16 1,4

7Laboratoire de GénomiqueFonctionnelle et AméliorationGénétique (LaGeFAGe-UAA)

09 11 09 0,2

8GAMBIE

International Trypano-ToleranceCenter (ITC)

04 07 05 0,4

9 Biotechnology laboratory (BL-NARI) 03 05 03 0,3

10

GHANA

Radiation Entomology Center (REC-BNARI) 05 07 06 0,3

11 Plant Biotechnology (PB-BNARI) 10 09 07 0,2

12 Biotechnology Centre (BC-UGL) 03 24 18 1,6

13 Biotechnology Laboratory (BL-CRI) 08 15 08 0,4

14

MALI

Laboratoire de Biologie MoléculaireAppliquée (LBMA-UB) 11 18 10 0,3

15Laboratoire d’Agro-physio-génétiqueet de Biotechnologies Végétales(LAPGBV-IPR)

14 07 06 0,1

16 Laboratoire Central Vétérinaire (LCV-MEP) 33 07 04 0,0

17

NIGERIA

Biotechnology Laboratory (BL - IAR) 08 08 06 0,2

18 Biotechnology Laboratory (BL - NACGRAB) 14 08 04 0,11

19Biotechnology and GeneticEngineering Advanced Laboratory(BGEAL - SHESTCO)

15 15 10 0,2

20

SENEGAL

Laboratoire Campus deBiotechnologies Végétales (LCBV-UCAD)

05 08 08 0,3

21Centre d’Etude Régional pourl’Amélioration de l’Adaptation à laSécheresse (CERAAS-ISRA)

04 02 02 0,1

22Institut Sénégalais de RecherchesAgricoles – Production (ISRA - Production)

06 04 03 0,1

23Laboratoire National de l’Elevageet de Recherches Vétérinaires(LNERV - ISRA)

14 06 06 0,1

53



LVBV : Laboratoire de Virologie et de Biotechnologies Végétales LGBV : Laboratoire de Génétique et de Biotechnologies Végétales LMLA : Laboratoire de microbiologie et laboratoires associés LBA : Laboratoire de Biotechnologies animales LCB : Laboratoire Central de Biotechnologies LVCQV : Laboratoire de Virologie et de Contrôle de Qualité VaccinLaGeFAGe : Laboratoire de Génomique Fonctionnelle et Amélioration GénétiqueITC : International Trypano-Tolerance Center BL : Biotechnology laboratory-NARIREC : Radiation Entomology Center –BNARIPB : Plant Biotechnology-BNARIBC : Biotechnology CentreBL : Biotechnology LaboratoryLBMA : Laboratoire de Biologie Moléculaire AppliquéeLAPGBV : Laboratoire d’Agro-Physio-Génétique et Biotechnologies VégétalesLCV : Laboratoire Central VétérinaireBL : Biotechnology Laboratory-IARBL : Biotechnology Laboratory-NACGRABBGEAL : Biotechnology and Genetic Engineering advanced laboratoryCERAAS : Centre d’Etude Régional pour l’Amélioration de l’adaptation à la SécheresseLCBV : Laboratoire Campus de Biotechnologies Végétales LNERV : Laboratoire National de l’Elevage et de la recherche Vétérinaires ISRA-Production : Institut Sénégalaise de recherche Agricole - Production

Figure 2 : Nombre de publications parues au cours des cinq dernières années et diversité des revuesconcernées



54

3.3.6 Aptitude des laboratoires à la collaboration nationale,régionale et internationale

• Au plan national

L’environnement scientifique se mesure par la présence de laboratoires nationaux et régionaux dansles pays des laboratoires visités. L’effectif de ces laboratoires est relativement important (tableau VII).Leurs domaines d’activités sont variés. Dans le cadre de la mise en œuvre du PADBBAO, ils pourraientapporter leur assistance dans leur spécialité. Les laboratoires visités, objets de cette étude, collaborent déjà en moyenne avec six de ceslaboratoires établis dans le pays. Certains sont particulièrement ouverts à cet environnementscientifique et d’autres n’exploitent pas suffisamment cette opportunité de collaboration.

•Au plan régional et international

De manière générale, les laboratoires visités sont beaucoup plus ouverts sur le plan international quesur le plan régional (tableau VIII). Ainsi, on note en moyenne par laboratoire visité, 3,5 institutions oulaboratoires régionaux partenaires contre 4,5 institutions ou laboratoires internationaux.

En tenant compte de toutes les collaborations régionales et internationales, huit laboratoires, qui ont10 à 15 partenaires, sont les plus actifs (BL-CRI, BC-UGL, LCBV-UCAD, LGBV-INERA, LVBV-INERA, LCB-CNRA, LBA-CIRDES et LAPGBV-IPR). Cinq laboratoires, qui ont sept à onze partenaires (LMLA-IRSAT, LCV,LVCQV-LANADA, LBMA-UB et CERAAS-ISRA), sont très actifs au plan régional et international. Septautres laboratoires (LaGeFaGe-UAA, ITC-Gambie, BL-NARI, PB-BNARI, BL-IAR, BGEAL-SHESTCO et LNERV-ISRA), qui ont quatre à six partenaires, sont relativement ouverts à la coopération ou au partenariat.Enfin, trois laboratoires (BL-IAR, REC-BNARI, ISRA-Production), qui n’ont que un à trois partenaires, sontles moins actifs en matière de coopération régionale et internationale.

Quel que soit le partenaire, il s’agit de collaborations d’ordre technique et financier.

55

Tableau VII : Laboratoires nationaux ou régionaux établis dansle pays des laboratoires visités (environnementscientifique)



N° PAYS LABORATOIRESVISITES

AUTRES LABORATOIRESDANS LE PAYS

DOMAINESD’ACTIVITES

1

BURKINAFASO

Laboratoire deVirologie et de

BiotechnologiesVégétales (LVBV)

• CIRDES Bobodioulasso• Centre Muraz-Bobo• IRSAT, Ouagadougou • Université de Ouagadougou• Laboratoire Biomédical de saint

Camille• Centre National de Lutte / le

Paludisme• Université Saint Thomas D’Aquin• IRD• CIRAD• Université Polytechnique de Bobo• Institut Intern. de l’Eau et de

l’Environnement

• Production animale• Santé humaine• Technologie alimentaire• Recherche /Formation• Recherche méd. Biol. mol• Recherche / Paludisme• Recherche/formation• Recherche/formation• Recherche/formation• Recherche/formation• Recherche/formation

2Laboratoire deGénétique et deBiotechnologiesVégétales (LGBV)

• Laboratoire d’entomologie• Laboratoire de virologie et de

Biotechnologie• Laboratoire de production animale• Laboratoire du dispensaire Saint

Camille• CIRDES• Centre National de Lutte contre le

Paludisme• IRSH et Centre Muraz

• Entomologie • Virologie & Biotechnologie• Production animale• Santé humaine• Production animale• Santé Humaine• Santé humaine

3Laboratoire deMicrobiologie etLaboratoiresAssociés (LMLA)

• CRSBAN, Université deOuagadougou

• Laboratoire de l’INERA• Laboratoire National de Santé

Publique• Laboratoires de Bureau National

des sols• Laboratoire de Food Research

Institut (FRI)• Faculté des Sciences Agronomiques

• Microbio., Mycotoxines• OGM• Mycotoxine• Minéraux• Microbio., Mycotoxines• Microbiologie

4Laboratoire deBiotechnologiesAnimales (LBA)

• Les SNRA des pays membres duCIRDES

• Labo Contrôle de Méd. vétérinairesDakar

• Centre Muraz• IRSS

• Biotechnologies• Contrôle de médicaments• Formation santé• Santé humaine



56




5

CÔTED’IVOIRE

LaboratoireCentral de

Biotechnologies(LCB)

• LVCQV / LANADA, Bingerville• Labo contrôle de qualité et de

Métrologie• Africa Rice - Bouaké• Institut Pasteur de Côte d’Ivoire• LaGeFaGe-UAA• Laboratoire de culture in vitro-NESTLE

• Etude des pathogènes• Contrôle qualité• Gènes de résistance/riz• Recherche médicale (virus)• Diversité génétique• Embryogénèse somatique• Micropropagation

6Labo. de Virologieet de Contrôle de

Qualité Vaccin(LVCQV)

• Institut Pasteur de Côte d’Ivoire• Laboratoire Retroci• Labo. Central de Biotechnologie-

CNRA

• Virologie• séquençage• Biotechnologie

7

Labo. deGénomique

Fonctionnelle etAmél. Génétique

(LaGeFAGe)

• Labo central de Biotechnologies-CNRA

• Institut Pasteur• Laboratoire de Génétique, Univ.

Cocody

• Biotechnologie/Biosécurité• Biomédicale• Diversité génétique

8

GAMBIE

InternationalTrypano-Tolerance

Center (ITC)

• Medical Research Council (MRC)• Royal Victoria Teaching Hospital (RVTH)• Department of Livestock Services (DLS)• National Agriculture Research

Institut (NARI)

• PCR and Microbiology• Microbiology , Parasitology• Heamatology, Entomology• Nutrition

9Biotechnology

Laboratory(BL-NARI)

• International TrypanosomiasisCentre (ITC)

• Public Health Laboratory• Fisheries laboratory

• Animal Research• Public health services• Fish research

10

GHANA

RadiationEntomologyCenter (REC)

• Human Biology Dept., Univ. of CapeCoast

• Zoology Dept., University of Ghana• Molecular Genetic & Biotech.

11 PlantBiotechnology (PB)

• Plant Genetic Resource ResearchInstitute

• Oil Palm Research institute• Cocoa Research Institute of Ghana

• Plant research• Coconut research• Cocoa research

12 BiotechnologyCentre (BC)

• Crop Research Institute• Savannah Agricultural Res. Institute

(SARI)• Ghana Atomic Energy Commission

(GAEC)• Plant Services Protection Agency• Agricultural Research Station• Cocoa Research Institute of Ghana• Kwame Nkrumah Univ. of Science &

Tech.• University of Cape Coast

• Plant Improvement, • Plant Protection• Tissue Culture• Quarantine, Dignostics• Plant Diseases & Improvement• Cocoa Improvment & diseases• Biotechnology, Plant Breeding• Molecular Biology

13BiotechnologyLaboratory-CRI

(BL-CRI)

• CSIR Forestry Research Institute• Kwame Nkrumah Univ. of Science &

Techn.• BNARI - Accra• University of Ghana, Legon (Biotech

center)• Crop Science Dept, University of

Cape Coast,• Tissue Culture Laboratory, Univ. of

Ghana, L • CSIR – Plant Genetic Res. Research

Institute• CSIR – animal Research Institute• CSIR – Oil Palm Research Institute• Cocoa Research Institute of Ghana• CSIR Food Research Instiute

• Forest Research• Plant Research• Crop Research• Animal Research• Food Research

57






14

MALI

Laboratoire deBiologie

MoléculaireAppliquée (LBMA)

• Institut d’Economie Rurale• Laboratoire Central Vétérinaire• Laboratoire National de la Santé• Centre de Rech. et de form.

SIDA et Tuberc.• Institut Nat. de Recherche en Sante

Publique

• Amélioration des végétaux• Médecine Vétérinaire• Produits naturels• Maladies virales &

bactériennes• Reproduct. & fertilité humaine

15

Laboratoired’Agro-physio-

génétique et deBiotechnologies

végétales(LAPGBV)

• Laboratoire de biologie mol. / Univ.Bamako

• Laboratoire de Parasitologie/Univ.Bamako

• Laboratoire Central Vétérinaire/MEP• Laboratoire des semences du

Mali/MA

• Biologie moléculaire etpaludisme

• Production de vaccins• Certification des semences

16Laboratoire

CentralVétérinaire

(LCV)

• Institut Nat. de Recherche en SantéPublique

• Institut d’Economie Rurale• Centre National de lutte contre la

Maladie• Faculté de médecine de phcie et

odontos• Laboratoire National de la Santé• Faculté des Sciences et Techniques• Institut Polytechnique Rural

• Santé publique• Economie des filières &

analyses• Analyses et recherches• Analyses et recherches• Analyses-autorisations vaccins• Etudes, Recherches• Etudes, Recherches

17

NIGERIA

BiotechnologyLaboratory

(BL-IAR)

• National BiotechnologyDevelopment Agency (NABDA).• Plant Biotechnology Laboratory,

Jigawa Research Institute• International Institute for Tropical

Agriculture

• formation • Culture de tissus• transformation génétique

18Biotechnology

Laboratory (BL-NACGRAB)

• International Institute of TropicalAgriculture (IITA)

• National Institute of HorticulturalResearch (NIHORT)

• Institute of Agricultural Researchand Training

• University of Lagos• University of Agriculture• Forestry Research Institute of Nigeria• Obafemi Awolowo University• University of Ibadan• Ladoke Akintola University

• Formation• Ressources génétiques• Evaluation et amélioration

génétiqiue • Systématique moléculaire • Foresterie

19

Biotechnologyand GeneticEngineeringAdvancedLaboratory

(BGEAL)

• National Cereal Research Institute• National Institute for Oil Palm

Research• University of Agriculture• Raw Materials Development and

Research Council• African University of Science &

Technology• Nasarawa state University• University of Essex, U.K

• biologie moléculaire• génie génétique • Sérologie• SAM • stress biotique • Culture de tssus • Material Science• Bioresources /

ethnopharmacologie



58




20

SENEGAL

LaboratoireCampus de

BiotechnologiesVégétales

(LCBV)

• Unité de Rech. Commune en CIV(URCI- ISRA)

• Labo. Commun de Microbio.UCAD-ISRA-IRD

• Laboratoire de Biotechnologie/CERAAS

• Centre Nat. de RechercheForestière-ISRA

• Culture in vitro• Microorganismes symbiot.• Sélection, Biologie moléculaire• Physiologie des semences

21

Centre d’EtudeRégion. pour

l’Amélioration del’Adaptation à la

Sécheresse(CERAAS)

• Laboratoire de biotechnologieAfrica Rice

• Laboratoire de biotechnologie del'UCAD

• Laboratoire LCM de l'IRD

• Production végétale• Production végétale • Production végétale

22 ISRA - Production (ISRA)

• Institut Pasteur• LNERV

• section Vaccin fièvre jaune• Contrôle de vaccins

23

LaboratoireNational del’Elevage et

de RecherchesVétérinaires

(LNERV)

• Institut Pasteur Dakar• Laboratoire de chimie analy. et de

toxicologie• Ceres locutox• LNRPV/ISRA• Laboratoire ISRA/CRODT• Laboratoire de contrôle des

médicaments• Laboratoire ONUSIDA/HALD• Laboratoire ONAS• Labo. phytosanitaire & de prot. des

végétaux• Laboratoire bio 24 (Laboratoire

privé)

• Microb. & contrôle vaccins• Toxicologie• Analyse de résidus• Microbiologie • Analyse de résidus• Analyse de résidus• Microbiologie• Microb, DCO et DBO &

polluants • Analyse résidus • Analyses médicales microbio.

59

Tableau VIII : Laboratoires régionaux et internationauxcollaborant avec les laboratoires visités




LABORATOIREREGIONAL LABORATOIRE INTERNATIONAL

1

BURKINAFASO



(LVBV-INERA)

• Labo Virologie/IER (Mali)• Labo Virologie/Univ. Lomé, Togo• ITRA Togo• Labo Phytopathologie/Africa Rice • ITRAD Tchad

• Labo Gén. et Dével.des plantes/IRD

• Labo Rés. plantes auxBioagresseurs/IRD

• Laboratoire de Génétique /CIRAD

• University of Tucson, Arizona, USA• Swedish University of Agricultural Sc.• University of California, Davis, USA

2

Laboratoire deGénétique et deBiotechnologies

Végétales (LGBV- INERA)

• CBDC Bénin • Bioversity • Kirkhouse Trust • GCP • AGRA

• Uinversity of Virginia• University of California Riverside • IITA-Kano• ICIPE-KENYA• Bioversity • Kirkhouse Trust

3Laboratoire se

Microbiologie etLaboratoires associés

(LMLA-IRSAT)

• Facultés de Sciences Agron. UAC• Food research Institute (FRI) • University of Development Study,

Nogvongo, Ghana• IER, Mali

• Univ. Copenhagen, Faculty of LifeScience

• Université de Liège, Belgique•Faculté des Sciences Agron.

Gembloux, • IRD, Montpellier France• London Metropolitan University

4Laboratoires deBiotechnologies

Animales(LBA-CIRDES)

• LACOMEV/EISMV Dakar SENEGAL• ILRI/Nairobi KENYA• Labo. SNRA des membres du

CIRDES• UEMOA

• UMR IRD-CIRAD INTERTROP/CIRAD• Institut de Médecine Tropicale

d’Anvers • AIEA• Université de Turin• Agropolis international/France• OIE• FAO• INRA

5

COTED’IVOIRE

Laboratoire Centralde Biotechnologies

(LCB-CNRA)

• Cocoa Research Institute ofGhana

• Labo. de Biotechnologie(AfricaRice)

• Labo. Central de Biotech, IITA-Ibadan

• Biotechnology Laboratory -CRI

• USDA-ARS Miami• CIRAD Montpellier• IRD Montpellier• Rothamsted International• Fera-UK• Bioversity, Montpellier• CFC• ICCO

6

Laboratoire deVirologie

et de Contrôlede Qualité Vaccin (LVCQV-LANADA)

• LCV de Bamako – Mali• Laboratoire vétérinaire de Dakar – SN• Ondonstepoort Vet Insitute – SA• Nat Research Vet Institute -Nigeria

• Cirad – Montpellier • Animal Helath Inst.-Pribright- UK• Sweeden Veterinary Institute -

Suède• St Jude’s Hospital – Memphis-USA

7

Laboratoire de Gén.Fonctionnelle et

AméliorationGénétique

(LaGeFAGe-UAA)

• INERA Burkina Faso• Laboratoire centrale de

Biotechnologie IITA Ibadan

• Gembloux Agro-Biotech• Univ Catholique de Louvain• IRD Paris



60



8

GAMBIE

InternationalTrypano-Tolerance

Center (ITC)

• Medical research centre• Nigeria government/institutions• EISMV, Dakar-Sénégal

• ITM and ANTWERP university• German gtz/university of berlin• Northwick park institute for

medical res.

9Biotechnology

Laboratory(BL-NARI)

• Africa Rice Center (Biotech. Lab)• Crops Research Institute-Ghana• Kwame Nkrumah Univ. Sc.Tech.

GH

• FAO• PUM- Philanthropy organisationThe Netherlands

10

GHANA

RadiationEntomology Center

(REC-BNARI)-

• Liverpool School of TropicalMedicine

• International Atomic EnergyAgency

11Plant

Biotechnology (PB-BNARI)

• West African Centre for CropImprovement (WACCI)

• CIRAD- France• Internat. Atomic Energy Agency

(IAEA)• Donald Danforth Plant Science

Centre• African Agency for

Biotechnology (AAB)• WAITRO, Malaysia

12Biotechnology

Centre (BC-UGL)

• Africa Rice Centre• Ministry of Food and Agriculture• West Africa Centre for Crop

Improvement

• Wageningin Univ.• Tuskegee University• AIEA• NEPAD• UC DAVIS• Cornell University• VW Foundation• Kirkhouse Trust• FAO• World Bank

13Biotechnology

Laboratory (BL-CRI)

• National Root Crops ResearchInstitute (NRCRI) Umudike. Nigeria

• Africa Rice Centre(Biotechnology lab)

• CNRA – Cote d’Ivoire, • INRAB – Benin, • SLARI – Sierra Leone, • CARI – Liberia, • ITRA – Togo, • INRAN – Niger

• IITA and CIMMYT• ICRISAT Biotechnology Laboratory

-India • CIAT Biotechnology Laboratory• IAEA Biotechnology laboratory

Vienna,• Plant Biotechnology and

Genomics Research LaboratoryTuskegee

• Molecular Cytogenetics andCytometry Institute ofExperimental Botany SokolovskiaOlomouc Czech Republic

14 MALI

Laboratoirede BiologieMoléculaireAppliquée(LBMA- UB)

• PASAOP

• PAFA

• Tulane University• ICRISAT• Univ. of Wisconsin-Madison

(horticult)• IRD/Montpellier• Institute of Plant Breeding, Seed

Science and PopulationGenetics, University ofHohenheim, Stuttgart D-70599Germany

• Department of Plant Biology,University of Georgia, Athens GA30602, USA

61





15

MALI

Laboratoired’Agro-physio-

génétique et deBiotechnologies

végétales(LAPGBV- IPR)

• Univ. Abdou Moumouni deNiamey

• Labo. de Biotech. Vég. Foulaya,Guinée

• Laboratoire de quarantaine à Tunis • Labo. de Biotech. végétales

Akoupé /RCI • Univ. des sciences et Tech. Oran / Alg.• Labo. de virologie de Mornag

(Tunisie)

• Sciences, outils, CultureInternational

• Université de Dijon (France)• Université d’Etat de Michigan (USA)• Université de l’Amitié des Peuples

Patrice Lumumba, Moscou (Russie)

16Laboratoire

CentralVétérinaire(LCV-MEP)

• Institut Sén. de rechercheagronomique

• Laboratoire vétérinaire de Vom,Nigéria

• OVI Afrique du sud• CIRDES – Bobo• ILRI Nairobi

• Laboratoires de l’agenceinternationale de l’énergieatomique (AIEA)

• CIRAD Montpellier• Coopération Allemande• Institut tropical de santé Publique

(Suisse)

17

NIGERIA

BiotechnologyLaboratory (BL - IAR) Informations non fournies • CSIRO Australia

18Biotechnology

Laboratory(BL - NACGRAB)

• Central iotechnology Laboratory,IITA

• Global Crop Diversity Trust• CBOL• Applied Biotech International (USA)

19

Biotechnologyand GeneticEngineeringAdvancedLaboratory

(BGEAL - SHESTCO)

• The Africa Rice Center Cotonou,Benin Republic

• African University of Science andTechnology

• National Center for SugarcaneResearch, Havana, CUBA

• Max Rubner Institut,Bundesforschungsinstitut fürErnährung und Lebensmittel,Karlsruhe Germany

• Princeton University USA. • Prof. James R. Ketudat Cairns, Inst.

of Science Suranaree Univ. ofTech., Nakhon Ratchasima 30000,THAILAND

20

SENEGAL



(LCBV-UCAD)

• Université de Bamako, Mali• Université de Nouakchott,

Mauritanie• Université Abdou Moumouni, Niger• Université Abomey Calavi, Bénin• Université Abobo Adjamé, Côte

d’Ivoire• Université de Ouagadougou,

Burkina Faso

• IRD-Montpellier• CIRAD-Montpellier• MSU-USA• Virginia Tech - USA• FIS • AIEA

21

Centre d’EudeRégional pour


Séch. (CERAAS-ISRA)

• Africa Rice• Université Abomey calavi, Bénin

• UGENT Belgique• Cirad France• California Riverside University, USA• Purdue university USA• Embrapa Brésil

22 ISRA-Production(ISRA)

• Lab Vétérinaire (Ghana)• AU /IBAR PANVAC (Ethiopie)

• Galvmed (UK)

23

LaboratoireNational

de l’Elevageet de

RecherchesVétérinaires

(LNERV-ISRA)

• INERA (Burkina Faso) • CNERV (Mauritanie)

• IRD-Montpellier• CIRAD-Montpellier• Institut Pasteur de Paris• INRA Clermont Ferrand



62

Tableau IX. Fiche technique des laboratoires visités (situationdes cinq dernières années)

Lab

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64

3.3.7 Forces et faiblesses des laboratoires visités

Les données recueillies, synthétisées dans le tableau IX, ont permis d’établir les forces et les faiblessesdes laboratoires (tableau X), en tenant compte des douze critères suivants:

• Diversité des spécialités pratiquées• Nombre d’activités en cours • Niveau des équipements (quantité et qualité)• Diversité des techniques utilisées dans les laboratoires• Potentiel en personnel chercheur• Potentiel en personnel technicien• Aptitude à l’encadrement et à la formation (stagiaires)• Aptitude à la production scientifique• Environnement scientifique (autres laboratoires dans le pays)• Initiatives de coopération Sud-Sud et Sud-Nord• Caractéristiques des infrastructures (taille des laboratoires, espace)• Disponibilité d’une structure de confinement (serre, insectarium etc.)

Trois groupes de laboratoires sont ainsi constitués en fonction de leurs forces et faiblesses.

• Premier groupe

Il comprend onze laboratoires présentant de nombreuses forces et très peu de faiblesses. Il s’agit de :Laboratoire de Virologie et de Biotechnologies Végétales (LVBV-INERA), Laboratoire deBiotechnologies Animales (LBA-CIRDES), laboratoire Central de Biotechnologies (LCB-CNRA),Laboratoire Biotechnology Centre (BC-UGL), Biotechnology Laboratory (BL-CRI), Laboratoire deBiologie Moléculaire Appliquée (LBMA-UB), Laboratoire Central Vétérinaire (LCV-MEP), BiotechnologyLaboratory (BL-IAR), Biotechnology Laboratory (BL-NACGRAB), Biotechnology and Genetic EngineeringAdvanced Laboratory (BGEAL-SHESTCO), Laboratoire National de l’Elevage et de RecherchesVétérinaires (LNERV-ISRA).

• Deuxième groupe

Ce groupe comprend onze laboratoires présentant approximativement autant de forces que defaiblesses. Il s’agit de : Laboratoire de Génétique et Biotechnologies Végétales (LGBV-INERA),Laboratoire de Microbiologie et Laboratoires Associés (LMLA-IRSAT), Laboratoire de Virologie et deContrôle de Qualité Vaccin (LVCQV-LANADA), Laboratoire de Génomique Fonctionnelle etAmélioration Génétique (LaGeFAGe-UAA), International Trypano-Tolerance Center (ITC-GB), RadiationEntomology Center (REC-BNARI), Plant Biotechnology (PB-BNARI), Laboratoire d’Agro-physio-génétiqueet de Biotechnologies Végétales (LAPGBV-IPR), Laboratoire CAMPUS de Biotechnologies Végétales(LCBV-UCAD), Institut Sénégalais de Recherches agricoles - Production (ISRA-Production) et Centred’Etude Régional pour l’Amélioration de l’Adaptation à la Sécheresse (CERAAS-ISRA).

• Troisième groupe

Il est représenté par le seul laboratoire présentant beaucoup plus de faiblesses que de forces, à savoirle laboratoire de Biotechnology Laboratory (BL-NARI) de Gambie.

Les lacunes relevées portent en général sur l’équipement (absence de serres), les ressources humaines(techniciens et chercheurs), l’encadrement d’étudiants, l’aptitude à la publication, la diversificationdes revues de publication, le nombre d’activités en cours et d’initiatives à la coopération.

65

Tableau X : Récapitulatif des forces et des faiblessesdes laboratoires enquêtés



N° PAYS FORCES FAIBLESSES

1

BURKINAFASO

Laboratoire de Virologie et de Biotechnologies végétales (LVBV-INERA) Ouagadougou, BURKINA FASO

• Grande diversité de spécialités• Grand nombre d’activités en cours, • Grande diversité de techniques utilisées• Bon équipement de laboratoire• Assez bon potentiel de chercheurs (11)• Assez bonne aptitude à l’encadrement• Assez bonne aptitude à la publication• Bon environnement scientifique• Bonne tendance à la coopération •Taille moyenne des locaux de laboratoire •Disponibilité de serre de type P1

• Faible potentiel de techniciens

2

Laboratoire de Génétique et de Biotechnologies Végétales (LGBV-INERA) Ouaga, BURKINA FASO

• Diversité moyenne de spécialités • Grand nombre d’activités en cours • Laboratoire moyennement équipé • Assez bon potentiel de techniciens• Assez bonne aptitude à la publication• Bon environnement scientifique • Assez bonne tendance à la coopération

internationale• Taille correcte des locaux de laboratoire

• Très faible nombre de techniques utilisées • Faible potentiel de chercheurs• Faible aptitude à l’encadrement • Absence de serre

3

Laboratoire de Microbiologie et Laboratoires Associés (LMLA-IRSAT) Ouagadougou, BURKINA FASO

• Grand nombre de techniques utilisées.• Laboratoire bien équipé.• Bon potentiel de chercheurs.• Aptitude moyenne à la publication• Bon environnement scientifique• Assez bonne tendance à la coopération. • Taille correcte des locaux de laboratoire

• Faible diversité de spécialités• Très faible nombre d’activités en cours • Faible potentiel de techniciens.• Faible aptitude à l’encadrement• Absence de structure de confinement

4

Laboratoire de Biotechnologies Animales (LBA-CIRDES) Ouagadougou, BURKINA FASO

• Grande diversité de spécialités, • Grand nombre d’activités en cours de

réalisation.• Grand nombre de techniques utilisées• Laboratoire très bien équipé (équipements

de pointe)• Assez bon potentiel de chercheurs (11).• Très grande aptitude à la publication.• Bonne aptitude à l’encadrement.• Environnement scientifique moyen.• Bonne tendance à la coopération sud-

nord• Disponibilité d’un insectarium

• Faible potentiel de techniciens. • Insuffisance de coopération sud-sud• Exiguïté de certaines salles de laboratoire



66


5

COTED’IVOIRE

Laboratoires Central de Biotechnologies (LCB-CNRA), Abidjan, COTE D’IVOIRE

• Assez grande diversité de spécialités • Grand nombre d’activités en cours• Grand nombre de techniques utilisées• Bien équipé (+ groupe électrogène)• Potentiel moyen de chercheurs• Très grande aptitude à l’encadrement • Grande aptitude à la publication• Assez bon environnement scientifique• Assez bonne aptitude à la coopération• Ampleur des locaux de laboratoire

•Faible potentiel de techniciens supérieurs • Absence de serre

6

Laboratoire de Virologie et de Contrôle de Qualité Vaccin, (LVCQV- LANADA) Bingerville,COTE D’IVOIRE

• Diversité moyenne de spécialités• Très bon équipement (+ qPCR)• Bon potentiel de techniciens• Aptitude moyenne à l’encadrement• Très bonne aptitude à la publication• Bon environnement scientifique• Assez bonne tendance à la coopération• Ampleur des locaux de laboratoire

• Très faible nombre d’activités en cours• Faible nombre de techniques utilisées • Faible potentiel de chercheurs. • Absence de structure de confinement

7

Laboratoire de Génomique Fonctionnelle et Amélioration Génétique (LaGeFAGe-UAA),Abidjan, COTE D’IVOIRE

• Diversité moyenne de spécialités• Bon équipement de laboratoire• Assez bon potentiel de chercheurs• Aptitude moyenne à la publication• Environnement scientifique moyen• Tendance moyenne à la coopération• Exiguïté des locaux du laboratoire principal

• Faible nombre d’activités en cours • Faible diversité de techniques utilisées• Absence de techniciens spécialisés • Faible aptitude à l’encadrement • Absence de structure de confinement

8

GAMBIE

International Trypanotolerance Center (I.T.C) Banjul, GAMBIE

• Faible diversité des spécialités• Bon équipement de laboratoire• Bon potentiel de techniciens• Aptitude moyenne à l’encadrement• Aptitude moyenne à la publication• Environnement scientifique moyen• Aptitude moyenne à la coopération• Ampleur des locaux de laboratoire

• Faible nombre d’activités en cours.• Faible diversité de techniques utilisées• Faible potentiel de chercheurs.• Absence de structure de confinement

9

Biotechnology Laboratory (BL-NARI) Banjul, GAMBIE

• Equipement moyen• Potentiel moyen de techniciens• Environnement scientifique moyen• Aptitude moyenne à la publication• Tendance moyenne à la coopération

• Faible diversité de spécialités • Très faible nombre d’activités en cours • Très faible diversité de techniques utilisées• Faible potentiel de chercheurs • Très faible aptitude à l’encadrement. • Exiguïté des locaux du laboratoire• Absence de structure de confinement

67




10

GHANA

Radiation Entomology Center (REC-BNARI) Accra, GHANA

• Diversité moyenne de spécialités • Diversité moyenne de techniques utilisées • Bon équipement de laboratoire• Potentiel moyen de chercheurs• Aptitude moyenne à la publication• Ampleur des locaux de laboratoire • Disponibilité d’une structure de

confinement (insectarium)

• Faible nombre d’activités en cours.• Faible potentiel de techniciens• Faible aptitude à l’encadrement.• Faible environnement scientifique • Faible tendance à la coopération

11

Plant Biotechnology (PB-BNARI) Accra, GHANA

• Bon équipement de laboratoire• Assez bon potentiel de chercheurs• Potentiel moyen de techniciens• Aptitude moyenne à la publication• Environnement scientifique moyen• Tendance moyenne à la coopération sud-

nord• Ampleur des locaux de laboratoire • Disponibilité d’une serre de type P1

• Faible diversité de spécialités• Faible diversité de techniques utilisées• Faible nombre d’activités en cours, • Faible aptitude à l’encadrement

12

Biotechnology Center (BC-UGL) Accra, GHANA

• Grande diversité de spécialités• Grand nombre d’activités en cours• Très bon équipement de laboratoire

(+qPCR)• Potentiel moyen de techniciens• Très bonne aptitude à la publication• Assez bonne aptitude à l’encadrement• Bon environnement scientifique• Bonne tendance à la coopération• Grand espace de laboratoire• Disponibilité d’une serre de type P2

• Faible diversité de techniques utilisées• Faible potentiel de chercheurs

13

Biotechnology Laboratory (BL-CRI), Kumasi, GHANA

• Très grande diversité de spécialités• Grand nombre d’activités en cours• Grande diversité de techniques utilisées• Très bon équipement (+qPCR)• Potentiel moyen de chercheurs• Aptitude moyenne à la publication• Très bon environnement scientifique• Très grande tendance à la coopération

sud-nord• Taille moyenne des locaux de laboratoire

(extension)• Disponibilité d’une serre de type P2

• Insuffisance de techniciens• Faible aptitude à l’encadrement.



68


14

MALI

Laboratoire de Biologie Moléculaire Appliquée (LBMA-UB), Bamako, MALI

• Grande diversité de spécialités • Grand nombre d’activités en cours• Grande diversité de techniques utilisées• Très bon équipement (+ qPCR +

séquenceur + gpe électro)• Assez bon potentiel de chercheurs• Aptitude moyenne à la publication• Aptitude moyenne à l’encadrement• Bon environnement scientifique• Assez bonne tendance à la coopération

sud-nord• Ampleur des locaux de laboratoire

• Faible potentiel de techniciens.• Absence de structure de confinement

15

Laboratoire d’Agro-Physio-Génétique et de Biotechnologies Végétales (LAPGBV-IPR)Katibougou MALI

• Diversité moyenne de spécialités• Equipement moyen de laboratoire• Bon potentiel de chercheurs • Grande aptitude à l’encadrement• Environnement scientifique moyen• Grande tendance à la coopération,

surtout sud-sud• Grand espace de laboratoire • Disponibilité d’une serre de confinement

• Faible nombre d’activités en cours.• Faible diversité de techniques utilisées• Faible potentiel de techniciens• Faible aptitude à la publication

16

Laboratoire Central Vétérinaire (LCV-MEP) Bamako, MALI

• Faible diversité de spécialités• Faible nombre d’activités (forte

spécialisation)• Nombre moyen de techniques utilisées• Très bon équipement de laboratoire• Très grand potentiel de chercheurs• Très grand potentiel de techniciens• Bon environnement scientifique• Assez bonne tendance à la coopération• Très grand espace de laboratoire • Disponibilité d’une structure de

confinement

• Faible aptitude à la publication.• Très faible aptitude à l’encadrement.

17 NIGERIA

Biotechnology Laboratory (BL - IAR)

• Grande diversité de spécialités • Grand nombre d’activités en cours • Bon équipement de laboratoire• Potentiel moyen de chercheur • Aptitude moyenne à l’encadrement• Aptitude moyenne à la publication• Environnement scientifique moyen • Grand espace de laboratoire (extension)• Disponibilité d’une serre de type P2 (OGM)

• Faible diversité de techniques utilisées• Faible potentiel de techniciens• Très faible tendance à la coopération

69




18

NIGERIA

Biotechnology Laboratory (BL - NACGRAB)

• Grande diversité de spécialités • Grand nombre d’activités en cours• Bon équipement de laboratoire • Bon potentiel de chercheurs• Potentiel moyen de techniciens• Aptitude moyenne à l’encadrement• Aptitude moyenne à la publication• Bon environnement scientifique• Grand espace de laboratoirel• Disponibilité de serres de type P2

• Faible diversité de techniques utilisées • Faible tendance à la coopération

19

Biotechnology and Genetic Engineering Advanced Laboratory (BGEAL - SHESTCO)

• Grande diversité de spécialités • Très grand nombre d’activités en cours• Très grand diversité de techniques utilisées • Très bon équipement de

labo(+Séquenceur+oligosynth)• Bon potentiel de chercheurs• Bon potentiel de techniciens• Très grande aptitude à l’encadrement• Assez bonne aptitude à la publication• Assez bon environnement scientifique• Tendance moyenne à la coopération• Disponibilité d’une petite serre de type P1

20

SENEGAL

Laboratoire CAMPUS de Biotechnologies Végétales (LCBV-UCAD)

• Grand nombre d’activités (surtout en CIV) • Bon équipement de laboratoire• Potentiel moyen de chercheurs• Grande aptitude à l’encadrement• Aptitude moyenne à la publication• Environnement scientifique moyen• Très grande tendance à la coopération• Grand espace de travail

• Faible diversité de spécialités• Faible diversité de techniques • Faible potentiel de techniciens • Absence de structure de confinement

21

Centre d’Eude Régional pour l’Amélioration de l’Adaptation à la Sécheresse (CERAAS-ISRA)

• Spécialisation importante• Diversité moyenne de techniques• Nombre moyen d’activités en cours• Bon équipement de laboratoire (+ qPCR)• Environnement scientifique moyen• Assez bonne tendance à la coopération• Ampleur des locaux de laboratoire• Disponibilité d’une serre P1/P2 et d’une

quarantaine

• Faible potentiel de chercheurs• Faible potentiel de techniciens• Faible aptitude à la publication• Faible aptitude à l’encadrement



70


22

SENEGAL

Institut Sénégalais de Recherches agricoles - Production (ISRA/Productions) Dakar, SENEGAL

• Diversité moyenne de spécialités• Nombre moyen d’activités en cours • Equipement de laboratoire moyen• Nombre moyen de techniques utilisées• Potentiel moyen de chercheurs• Très bon potentiel de techniciens• Environnement scientifique moyen• Disponibilité d’une serre et d’une

quarantaine

• Faible aptitude à la publication• Très faible aptitude à l’encadrement• Faible tendance à la coopération• Faible espace de travail

23

Laboratoire National de l’Elevage et de Recherches Vétérinaires (LNERV-ISRA), Dakar, SENEGAL

• Grande diversité de spécialités • Nombreuses activités en cours• Très bon équipement (+qPCR +

séquenceur)• Très grand nombre de techniques utilisées• Bon potentiel de chercheurs• Bon potentiel de techniciens• Assez bonne aptitude à l’encadrement• Très bon environnement scientifique• Bonne tendance à la coopération• Ampleur des locaux de laboratoire• Disponibilité d’une serre et d’une

quarantaine

• Faible aptitude à la publication

3.3.8 Besoins en renforcement des capacités des laboratoires

L’analyse des besoins exprimés par les laboratoires, éventuels centres d’excellence pour leCORAF/WECARD et la CEDEAO, permet certains commentaires.

• Equipements à renforcer (tableau XI)

En matière d’équipements, le Laboratoire d’Agro-physio-génétique et de Biotechnologies Végétales(LAPGBV-IPR) a exprimé les besoins les plus importants ; viennent ensuite le Laboratoire deMicrobiologie et Laboratoires Associés (LMLA-IRSAT) et le BL-NACGRAB (tableau XI). Ces laboratoiresont sollicité, en plus des équipements de pointe (séquenceur automatique d’ADN, machine à PCRquantitative, spectrophotomètre d’absorption atomique, LICOR pour SNPs), de nombreux appareils.La taille de ces laboratoires et l’importance des travaux en perspective expliquent probablement cesbesoins, qui peuvent alors être qualifiés de raisonnables. Cependant, certains laboratoires ont exprimédes besoins démesurés pour un renforcement des capacités ; ces besoins peuvent traduire leur volontéd’améliorer leurs potentialités pour relever les défis à venir. Toutefois, les besoins exprimés par lelaboratoire d’Agro-physio-génétique et Biotechnologies Végétales (LAPGBV-IPR) doivent être étudiés.

Concernant la biosécurité, aucun besoin en locaux de quarantaine ou en serres de confinement n’aété exprimé, alors que l’absence de telles infrastructures a été relevée dans plusieurs laboratoires,probablement parce que cette préoccupation a déjà été formulée à l’endroit du programme deBiosécurité de l’UEMOA. Les seuls besoins en infrastructures et équipements de biosécurité expriméspar les laboratoires sont les chambres de culture et les serres de type S2 ; ils ont été mentionnés par leLCB-CNRA, par le LaGeFAGe-UAA et par le LBMA-CIRDES. Une demande d’agrandissement delaboratoire a été formulée par le LVCQV-LANADA.

Signalons également qu’aucune demande de remise en état de fonctionnement d’équipements n’aété exprimée par les laboratoires, alors que la présence d’appareils non fonctionnels a été signalée.

71



Tableau XI : Besoins en équipements et en infrastructuresexprimés par les laboratoires

N° PAYS LABORATOIRES BESOINS EN EQUIPEMENTS ET INFRASTRUCTURES

1

BURKINAFASO


BiotechnologiesVégétales (LVBV)

• Machine à PCR quantitative• Equipements d’électrophorèse

(agarose, PAGE)• Séquenceur automatique d’ADN• Fermenteur• Lyophilisateur• Equipements pour le test ELISA

• Congélateurs -40°C• Etuves• Four Pasteur• HPLC• Hotte à flux laminaire• Spectromètre d’absorption

atomique

2Laboratoire de

Génétique et deBiotechnologies

Végétales (LGBV)

• LICOR pour SNPs• System gel doc• congélateur -80C

• Système d’autonomieénergétique

• Hotte à flux laminaire• Phytotron

3Laboratoire deMicrobiologie &

Laboratoires Associés(LMLA-IRSAT)

• Machine à PCR quantitative• Equipements d’électrophorèse

agarose/acryl.• Séquenceur automatique d’ADN• Fermenteur• Lyophilisateur• Congélateurs -40°C et -20°C• Réfrigérateurs• Four Pasteur• HPLC

• Centrifugeuse réfrigérantegrande vitesse

• Centrifugeuse basse vitesse• Système de purification d’eau

MilliQ• Hotte à flux laminaire• Hotte bactériologique• Hotte chimique• Microscope à inversion de

phase& ap. photo• Spectromètre d’absorption

atomique• Equipements pour le test ELISA

4Laboratoire deBiotechnologiesAnimales (LBA)

• Séquenceur capillaire (ABI)• Centrifugeuses• Tétrades (thermocycleurs à 4 plaques)• Jeux de pipettes multicanaux

(12 canaux)• Jeux de pipettes multicanaux

(8 canaux)• Jeux de pipettes ordinaires• Autoclave

• Congélateur verticale -20°C• Congélateur verticale -80°C• Equipements culture in vitro• Etuves• Bain marie• Distillateur• Spectrophotomètre

5

CÔTED’IVOIRE

Laboratoire Central deBiotechnologies (LCB)

• Real Time-PCR (qPCR – TaqMan)• Centrifugeuse grande vitesse• Serre P2 (OGM)• Analyseur Séquenceur ABI 3100• Spectrophotomètre UV visible• LICOR Machine

• Distillateur et désioniseur d’eau• Plate reader (analyse SNP)• Laveur de plaques ELISA• Auclave grande capacité• Agitateur/incubateur de

microplaques

6

Laboratoirede Virologie

et de Contrôle deQualité Vaccin

(LVCQV-LANADA)

• Agrandissement du laboratoire• Bistillateur• Appareil à déioniser• Laveur de plaque ELISA

• Chambre froide +4°C• Chambre froide -20°C• Photocopieur

7

Laboratoire deGénomique

Fonctionnelle etAmélioration Génétique

(LaGeFAGe-UAA)

• Chambre de culture - Luminicube• Agitateur rotatif

• Spectrophotomètre



72


8

GAMBIE

InternationalTrypanotolerance

Center (ITC)

• Freezer• Liquid Nitrogen Tank• Feed Drier

• Artificial InseminationEquipment

• Burdizzo (Big And Small)• Tractor And Its Implements

9Biotechnology

Laboratory (BL-NARI)

• Microwave• Ice-Making machine• Autoclave machine• Pippets SET• PCR plates

• Tips• Laminar flow• Fumehood• Spectrophotometer• Desktop

10

GHANA

Radiation EntomologyCenter (REC-BNARI)

• Gradient PCR machine• Automatic sequencer• freezer -80

• Microplate reader• Ice-making machine• Ultra centrifuge

11 Plant Biotechnology(PB-BNARI)

• Imaging device (Electronicmicroscope fitted with camera andmonitor)

• Automatic sequencer• freezer -80• Microplate reader

• Fluoremeter• Ultra centrifuge• Flow cytometer• Liquid Nitrogen Cannisters

12 BiotechnologyCentre (BC-UGL)

• Washing machine• HPLC• Nanodrop• Sequence machine• Homogenizer

• Electron Microscope• Rotary Drum mixer• Drying oven• Programmable shaker

13Biotechnology

Laboratory(BL-CRI)

• Automatic Screenhouse• Growth Cabinet• Vertical Electrophoresis• Real-time PCR

• Laminar Flow Hood• Peristaltic dispenser• pH meter• Microwave oven

14

MALI

Laboratoire de BiologieMoléculaire Appliquée

(LBMA-UB)

• Chambre de culture in vitro pourplante

• Serre

15

Laboratoire d’Agro-physio-génétique et de


(LAPGBV-IPR)

• Machnine à PCR quantitative• Equipements d’électrophorèse

agarose/acryl.• Séquenceur automatique d’ADN• Lyophilisateur• Congélateurs -20°C• Congélateurs -80°C• Lave vaisselle• Cytomètre à flux• Ultra centrifugeuse• Centrifugeuse rotative• Speed vaccum• Séquenceur automatique d’ADN• Spectrophotomètre UV visible• Agitateur/incubateur de

microplaques• Homogénéisateur• Incubateur de cellules• Chambre de culture (CONVIRON)

• Centrifugeuse à grande vitesse• Hotte bactériologique• Hotte chimique• Four Pasteur• HPLC• Equipements pour le test ELISA• Bain-marie• Centrifugeuse à basse vitesse• Canon à microparticules• Machine à glace• Microscope électronique• Sécheur gel (sous vide)• Pompe à vide• Chromatographe phase

gazeuse• Chromatographe couche

mince• Equipement électrophorèse

isozyme• Distillateur de produits

chimiques• Microscope à fluorescence

16Laboratoire

Central Vétérinaire (LCV-MEP)

• Séquenceur

73




17

NIGERIA

BiotechnologyLaboratory(BL - IAR)

• Informations non fournies sur la fiched’enquête

• Informations non fournies sur lafiche d’enquête

18Biotechnology

Laboratory (BL - NACGRAB)

• Jeux de Micropipettes de différentestailles

• Machine à glace• Spectrophotometer (Biophotometer)• Water conductivity meter• congélateur -80oC• Microscope (Labomed Digi 1)• Seed Counter (Countador)• Dessicateur• Autoclave (bucket)

• Macintosh computer• Microtome• Moisture meter (humidimètre)• Combine Thermo- hydrometer• Refrigerator (300L)• Deep freezers• Table top Centrifuge• Laminar Flow• Evaporator Rotatif

19

Biotechnologyand Genetic Engineering

Advanced Laboratory (BGEAL - SHESTCO)

• Dynamic Light Scattering equipment• (4-zone fully intermeshing counter-

rotating) Twin Screw extruder• Realtime PCR

• Accessories for cryogenicexamination of tissue samplesand biological materials withScanning Electron Microscope

• LC-MS/MS

20

SENEGAL



(LCBV-UCAD)

• Hotte à flux laminaire• Autoclave grande capacité• Machine à PCR conventionnelle• Machine à glace

• Congélateur -80°C• Distributeur de milieu• Table rotatif d’agitation• Serre

21

Centre d’EtudeRégional pour


Sécheresse(CERAAS-ISRA)

• qPCR

22Institut Sénégalais

de RechercheAgricole - Production

(ISRA/Production)

• Hotte bactériologique pour descultures bactériennes en anaérobiose

• Chaudière• Congélateur -80°C• Lyophilisateur

• Incubateurs d’œufs• Distillateur d’eau• Ordinateurs• Chambres de congélation -

20°C• Centrifugeuse réfrigérée

23

Laboratoire National del’Elevage

et de RecherchesVétérinaires

(LNERV-ISRA)

• Equipements informatiques• Accessoires Absorption atomique

(lampes, cabine de gaz)

• CPG nouvelle gamme• HPLC avec détecteur UV et

capteur électrons



74

• Besoins en personnel

Les laboratoires ont exprimé leur besoin de recruter des chercheurs (niveau doctorat), des ingénieursde recherche, des techniciens supérieurs et des techniciens (tableaux XIIa et XIIb, Fig.3). Cesrecrutements couvrent toutes les spécialités de la recherche (biologie moléculaire, génétique,microbiologie, biochimie, reproduction, entomologie etc.). Selon les laboratoires, le nombre dechercheurs à recruter varie de 0 à 11. Le Laboratoire de Génomique Fonctionnelle et AméliorationGénétique (LaGeFaGe-UAA) et l’Institut Sénégalais de Recherche Agricole-Production (ISRA-PRO)n’ont pas manifesté de besoin en chercheur.

Les besoins en techniciens varient de 1 à 20. Le minimum (un technicien) a été demandé par leBiotechnology Centre (BC-UGL), par le Laboratoire de Biologie Moléculaire Appliquée (LBMA-UB), parle BL-NACGRAB et par le Centre d’Etude Régional pour l’Amélioration de l’Adaptation à la Sécheresse(CERAAS-ISRA). Le Laboratoire d’Agro-physio-génétique et de Biotechnologies Végétales (LAPGBV-IPR) a exprimé les besoins en recrutement les plus importants, 20 techniciens et 11 chercheurs.

Pour 31% des laboratoires, le nombre de chercheurs à recruter est plus important que celui detechniciens ; pour 50% des laboratoires, le nombre de techniciens à recruter est plus élevé. Au total,le nombre de techniciens à recruter est plus élevé que celui des chercheurs.

• Besoins en formation

Les besoins en formation exprimés sont très différents d’un laboratoire à l’autre (tableaux XIIa et XIIb,Fig.3). Concernant les chercheurs, quatre laboratoires (Laboratoire de Virologie et de BiotechnologiesVégétales (LVBV-INERA), Laboratoire de Microbiologie et Laboratoires Associés (LMLA-IRSAT),Laboratoire de Biotechnologies Animales (LBA-CIRDES) et l’Institut Sénégalais de Recherche Agricole-Production (ISRA-Production)) ne sollicitent aucune formation. D’autres laboratoires ont besoin deformer un grand nombre de chercheurs ; c’est le cas du Laboratoire central vétérinaire (LCV-MEP) (10chercheurs) et du Centre d’Etude Régional pour l’Amélioration de l’Adaptation à la Sécheresse(CERAAS-ISRA), 12 chercheurs. Selon les laboratoires, un à 14 techniciens sont proposés à la formation.Quatre laboratoires (Radiation Entomology Center (REC-BNARI), Laboratoire de Biologie MoléculaireAppliquée (LBMA-UB), Laboratoire Central Vétérinaire (LCV-MEP) et Laboratoire Campus deBiotechnologies Végétales (LCBV-UCAD) sollicitent la formation d’un seul technicien. A l’autreextrémité, la formation de 12 techniciens est sollicitée par le CERAAS-ISRA et celle de 14 technicienspar le Laboratoire de Microbiologie et Laboratoires Associés (LMLA-IRSAT).

Au total, pour 39% des laboratoires le nombre de chercheurs à former est plus important que celui detechniciens ; pour 30% des laboratoires, le nombre de techniciens proposé à la formation est plus élevéque ceux de chercheurs ; ces besoins sont équilibrés pour 31% des laboratoires.

Les besoins en recrutement et/ou formation de chercheurs et/ou techniciens de certains laboratoiressont en adéquation parfaite avec les faiblesses des capacités humaines révélées par l’étude (voirtableau X). C’est le cas par exemple du Laboratoire de Microbiologie et Laboratoires Associés (LMLA),du Laboratoire de Biotechnologies Animales (LBA), du Laboratoire de Génomique Fonctionnelle etAmélioration Génétique (LaGeFAGe), du Biotechnology Laboratory (BL-NARI), du RadiationEntomology Center (REC), du Biotechnology Centre (BC), du Biotechnology Laboratory (BL-CRI), duLaboratoire d’Agro-physio-génétique et Biotechnologies Végétales (LAPGBV), du Centre d’EtudeRégional pour l’Amélioration de l’Adaptation à la Sécheresse (CERAAS).

75

Tableau XIIa : Liste détaillée des besoins en personnelet en formation exprimés par les laboratoires



N°

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76

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80

Tableau XIIb : Récapitulatif des besoins en personnel et enformation (effectif de chercheurs et detechniciens)

N° PAYS LaboratoiresRecrutements souhaités Formations souhaitées

Chercheurs Techniciens Chercheurs Techniciens

1

BURKINAFASO

Laboratoire de Virologie et deBiotechnologies Végétales (LVBV-INERA)

03 05 00 06

2Laboratoire de Génétique et de

Biotechnologies Végétales (LGBV-INERA)03 05 04 06

3Laboratoire de Microbiologie et Laboratoires

Associés (LMLA-IRSAT)03 10 00 14

4Laboratoire de Biotechnologies Animales

(LBA-CIRDES)05 03 00 08

5

CÔTED’IVOIRE

Laboratoire Central de Biotechnologies(LCB-CNRA)

05 05 04 04

6Laboratoire de Virologie et de Contrôle de

Qualité Vaccin (LVCQV-LANADA)02 02 03 02

7Laboratoire de Génomique Fonctionnelle et

Amélioration Génét. (LaGeFAGe-UAA)00 02 03 03

8GAMBIE

International Trypano-Tolerance Center (ITC) 04 04 06 04

9 Biotechnology Laboratory (BL-NARI) 02 03 04 04

10

GHANA

Radiation Entomology Center (REC-BNARI) 02 06 02 01

11 Plant Biotechnology (PB-BNARI) 02 06 05 02

12 Biotechnology Centre (BC-UGL) 04 01 04 02

13 Biotechnology Laboratory (BL-CRI) 02 05 04 04

14

MALI

Laboratoire de Biologie MoléculaireAppliquée (LBMA-UB)

02 01 02 01

15Laboratoire d’Agro-physio-génétique et de

Biotechnol. Végétales (LAPGBV-IPR)11 20 02 06

16 Laboratoire Central Vétérinaire (LCV-MEP) 04 03 10 01

17

NIGERIA

Biotechnology Laboratory (BL - IAR) - - 04 02

18 Biotechnology Laboratory (BL - NACGRAB) 02 01 07 02

19Biotechnology and Genetic Engineering

Advanced Laboratory (BGEAL - SHESTCO)03 02 02 02

20

SENEGAL

Laboratoire Campus de BiotechnologiesVégétales (LCBV-UCAD)

02 02 01 01

21Centre d’Etude Régional pour l’Amélioration

de l’Adaptation à la Sécheresse(CERAAS-ISRA)

02 01 12 12

22Institut Sénégalais de Recherche Agricole /

Production (ISRA/Production)00 08 00 03

23Laboratoire National de l’Elevage et deRecherches Vétérinaires (LNERV-ISRA)

02 08 02 05

81

LVBV : Laboratoire de Virologie et de Biotechnologies Végétales LGBV : Laboratoire de Génétique et de Biotechnologies Végétales LMLA : Laboratoire de microbiologie et laboratoires associés LBA : Laboratoire de Biotechnologies animales LCB : Laboratoire Central de Biotechnologies LVCQV : Laboratoire de Virologie et de Contrôle de Qualité Vaccin ITC: International Trypano-Tolerance Center BL: Biotechnology laboratory-NARIREC: Radiation Entomology Center -BNARIPB: Plant Biotechnology-BNARI LaGeFAGe : Laboratoire deGénomique Fonctionnelle et Amélioration GénétiqueBC: Biotechnology Centre

BL: Biotechnology LaboratoryLBMA : Laboratoire de Biologie Moléculaire AppliquéeLAPGBV : Laboratoire d’Agro-Physio-Génétique et BiotechnologiesVégétalesLCV : Laboratoire Central Vétérinaire LCBV : Laboratoire Campus de biotechnologies Végétales LNERV : Laboratoire National de l’Elevage et de la rechercheVétérinaires ISRA-Production : Institut Sénégalaise de recherche Agricole production CERAAS : Centre d’Etude Régional pour l’Amélioration de l’adaptationà la Sécheresse



Figure 3a : Recrutement (effectif de chercheurs et de techniciens) sollicité par les laboratoires visités

Figure 3b : Formation (effectif de chercheurs et de techniciens) sollicitée par les laboratoires visités



82

• Besoins en collaboration avec les laboratoires du Nord (tableau XIII)

Les laboratoires ont exprimé leurs besoins de collaborer avec certains laboratoires du Nord pour réaliserdifférents types de travaux. L’analyse de ces informations a permis d’identifier les laboratoires du Nord,au nombre de 47, cités par les laboratoires visités, ainsi que les raisons de ce choix : la compétence,l’expérience, la grande expertise, la technicité des laboratoires du Nord. Cette collaborationpermettrait aux laboratoires enquêtés de bénéficier d’un plateau technique avancé, d’aidefinancière et de formation. Il s’agit d’initier une nouvelle collaboration ou de renforcer lescollaborations déjà existantes.

Parmi les laboratoires du Nord identifiés, le CIRAD-Montpellier, France, nommé sept fois, et l’IRDMontpellier, France, nommé six fois, apparaissent comme les plus sollicités en matière de renforcementdes capacités. La collaboration avec ILTAB/Danforth Plant Science Center, tout comme celle avecMichigan State University aux USA est sollicitée par trois laboratoires du Sud. Celle avec la Facultéd’Agronomie de l’université de Wageningen, aux Pays-Bas, est sollicitée par deux laboratoires.

Notons que 30% des laboratoires sollicités sont localisés aux Etats Unis d’Amérique, 60 % en Europe et10 % ailleurs dans le monde. Un ajustement est donc nécessaire afin de respecter les recommandationsde la conférence régionale, tenue à Ouagadougou en juin 2004, qui précise que les partenariatsdoivent être établis entre institutions d’Afrique de l’Ouest et celles des USA.

83

Tableau XIII : Collaborations sollicitées avec des laboratoiresdes pays développés



LABORATOIRES DU NORD IDENTIFIES LABORATOIRES DU SUDSOUHAITANT COLLABORER TYPE D’ACTIVITE A CONDUIRE RAISONS

Biotechnolgy Laboratories ofCIAT and CIMMYT

(BL-CRI) Ghana Caractérisation moléculaire dugermoplasme

Grande expertise dans ledomaine

Centre Wallon de BiologieIndustrielle / Université deLiège, Belgique

(LMLA-IRSAT) Burkina faso -Développement de ferments,-Production de bactériocine

Compétence etexpérience

CIRAD-Montpellier,France

(LGBV-INERA) Burkina Faso Développement et validationmarqueurs, et formation

Expérience en prod.végétales

(LBA-CIRDES) Burkina FasoDiagnostic vétérinaire, épidémiologiemoléculaire, formation Caractérisation des gènes

- Grande expertise- Renforcement de la

collaboration

(LCB-CNRA) Côte d’Ivoire Etude génomique des plantes tropicales(Cacao, Hévéa, canne à sucre)

Longue expérience dansla génomique desplantes tropicales

(LVCQV-LANADA) Côte d’Ivoire

biotechnologie / Biologiemoléculaire, détection etcaractérisation des pathogènes

Collaboration de longuedate sur les mêmesthèmes

(LCV-MEP) Mali Biotechnologies Longue expérience

(CERAAS-ISRA) SN Cartographie génétique Plateau technique avancé

(LVBV-INERA) Burkina Faso Biotechnologies Technique et Financière

Cornel UniversityBiotechnology laboratories

(BL- CRI) Ghana Séquençage et caractérisation desplantes

Longue expérience dansce domaine

Department of HorticultureUniversity of Wisconsin-Madison, USA

(LBMA-UB) Mali Amélioration variétale Projet en commun

Department of Plant Biology,Univ. of Georgia, Athens GA30602, USA

(LBMA-UB) MaliGénétique des populationsdes céréales et leurs parasites Projet en commun

ILTAB/Donald Danforth PlantScience Center

(PB-BNARI) Ghana Formation sur la transformationgénétique et la biosécurité

Grande expérience

(LCB-CNRA) Côte d’Ivoire Production, évaluation et détectiondes OGM et mesures de Biosécurité

Grande expérience enla matière

(LVBV- INERA) Burkina Faso Taxonomie, diversité des virus deplantes, développement des OGM

Technique et Financière

Ecole vétérinaire de Liège,Belgique

(LBA-CIRDES) Burkina FasoDiagnostic vétérinaireAmélioration génétiqueFormation

- Grande expertise- Diversification despartenaires

Ecole vétérinaire de Nantes,France

(LBA-CIRDES) Burkina Faso Insémination artificielle, collecte ettransfert d’embryons et formation

- Grande expertise- Renforcement de lacollaboration

European union (BL-NARI) Gambie Aflatoxine Financement

European Commission - JRC (LCB-CNRA) Côte d’Ivoire Méthode de détection des OGM -Biosécurité

Grande expérience enla matière

Faculté d’agronomie –Université de Wageningen,Pays Bas

(LBA-CIRDES) Burkina Faso Diagnostic vétérinaire, améliorationgénétique et formation

Grande expertiseDiversification despartenaires

(PB-BNARI) Ghana Formation en renforcement descapacités

Grande expertise



84


Faculté Vétérinaire de SaintHyacinthe, Canada

(LBA-CIRDES) Burkina Faso Diagnostic moléculaire de maladiesanimales

- Grande expertise- Diversification des

partenaires

Faculty of Life Sciences,Université de Copenhague

(LMLA-IRSAT) Burkina Faso

Etude des souches de fermentationEtude et sélection de souchesprobiotiquesContaminants et toxines


IAEA Biotechnologylaboratory, Vienna, Austria

(BL-CRI) Ghana Application of mutation breeding forcrop improvement

Grande expertise dans ledomaine

IITA, Ibadan, Nigeria

(LCB-CNRA) Côte d’IvoireEtude génomique des plantestropicales (Cacao, Hévéa, canne àsucre)

Longue expérience sur lagénomique des plantestrop.

(BL-CRI) Ghana In vitro conservation of Germplasm &virus indexing

Grande expérience dansle domaine

(BL – NACGRAB) Nigéria Training on Virus Indexing and SeedHealth

-

Imperial College, UK (REC-BNARI) Ghana Training in GMO’s, genetictransformation and biosafety

Technical experience

Institut de Médecine Tropicalede Anvers, Belgique

(LBA-CIRDES) Burkina FasoDiagnostic vétérinaireEpidémiologie moléculaire de lachimiorésistance et Formation

Grande expertiseRenforcement decollaboration

INRA Institut National de laRecherche Agronomique,France

(LBA-CIRDES) Burkina fasoCaractérisation des gènesAmélioration génétiqueFormation

- Grande expertise- Renforcement de

collaboration

Institute for Animal Health –Pirbright, UK

(LVCQV-LANADA) Côte d’Ivoire

biotechnologie / Biologie moléculairep pour la détection etcaractérisation des pathogènes

collaboration de longuedate sur les mêmesthèmes

International Max PlanckInstitute

(PB-BNARI) Ghana Formation en biologie cellulaire etmoléculaire.

Expérience

IRD, Institut pour la Rechercheet le Développement, Montpellier France

(LGBV-INERA) Burkina Faso Développement validationmarqueurs et formation


(LMLA-IRSAT) Burkina Faso Etude nutritionnelle des aliments etvoie d’amélioration


(LBA-CIRDES) Burkina FasoDiagnostic vétérinaire, Epidémiologiemoléculaire, Formation etCaractérisation des gènes

- Grande expertise- Renforcement de

collaboration

(LCB-CNRA) Côte d’Ivoire Etude génomique du caféierEtude Moléculaire du RYMV

Longue expérience engénomique caféier

(CERAAS-ISRA) Sénégal Cartographie génétique Plateau technique avancé

(LVBV) INERA-BurkinaDéveloppement des OGM Culture invitro Caractérisation de virus,épidémiologie


ITM, Antwerp,-Belgium (I.T.C) Gambie MicrobiologyParasitology

DNA/RNA DECODING

Laboratoire de culture in vitroen Australie

(LCBV) / UCAD-Sénégal Culture in vitroOuverture d’unecollaboration

Laboratoire de Seibersdorf,Autriche

(LCV) / Mali Biotechnologies (vaccinsrecombinants)

Longue expérience

Liverpool School of TropicalMedicine

(REC) / BNARI-Ghana Training in molecular geneticsExpérience / techniqueavancées

Mérial (ISRA-Production) /Sénégal

Transfert de technologie pourcertains vaccins

Expérience dans ledomaine

85

*Informations non fournies par BL-IAR




MSU, Michigan StateUniversity, USA

(LCB) / CNRA-Côte d’Ivoire BiosécuritéGrande expérience dansla gestion des risques liésaux OGM

(LVBV) / INERA-BurkinaFaso

Production de plants transgéniquesrésistantes aux pathogènes


(LAPGBV-IPR) Mali Micropropagation des plantes etdétection des maladies

CoopérationFormation

Oxford University, UK (REC) -BNARI-Ghana Training in GMO’s, genetictransformation & biosafety

Technical experience

Pfizer (ISRA-Production) /Sénégal

Transfert de technologie pour certainsvaccins

Expérience dans ledomaine

Plant Biotechnology andGenomics ResearchLaboratory Tuskegee

(BL-CRI) Ghana Developpement des plantestransgéniques

Grande experience dansle domaine

Plant Breeding Unit, AIEA (LCB-CNRA) Côte d’Ivoire Mutation induite et analyse dugénome

Spécialisé dans les étudesde mutations

Plateforme de GénotypageGenindex, La Rochelle, France

(LCB-CNRA) Côte d’Ivoire Génotypage/séquençage/analysesfonctionnelles

Grande expertise etRenforcement decollaboration

UGENT (CERAAS-ISRA) Sénégal Diversité génétique Projets en commun

Université d’Utrecht (LBA-CIRDES) Burkina Faso Recherche et Formations (Master,PhD,…)

- Grande expertise- Diversification des

partenaires

Université Libre de Berlin,Allemagne

(LBA-CIRDES) Burkina FasoDiagnostic vétérinaireEpidémiologie moléculaire de lachimiorésistance

Grande expertiseRenforcement decollaboration

Department of BiologicalSciences, Universityof Essex, UK

(BGEAL – SHESTCO) Nigéria Cloning and genetic engineering Leur expertise

University of Reading (LCB-CNRA) Côte d’Ivoire Etude du CSSV chez le cacaoyer

Quarantaine intern. ducacaoyer est à Reading

University of Tucson, Arizona,USA

(LVBV-INERA) Burkina Faso Biotechnologies Formation et technique

USDA (LCB-CNRA) Côte d’Ivoire Développent de marqueurs SNP etséquençage

Plateau technique trèsmoderne

Laboratoire A et B d’Amiens(France)

(LAPGBV-IPR) Mali Androgenèse et Biotechnologie Collaboration Formation

Laboratoire des plantestropicales de Louvain(Belgique)

(LAPGBV-IPR) Mali

MicropropagationAndrogenèse somatiqueCulture de protoplastesTransgénèse

Formation

Laboratoire: Comité NordPlants de pomme de terre,Beaurains (France)

(LAPGBV-IPR) MaliProduction de plantsContrôle sanitaireCréation variétale

FormationStages de recyclage

Iowa State University (BC-UGL) Ghana Seed testing, agriculturalbiotechnology

Excellent facilities

OARDC (Ohio State University) (BC-UGL) Ghana Plant Disease Diagnostics USDA affiliated lab

Laboratoire International enBiologie Moléculaire

(LNERV- ISRA) Sénégal Biologie moléculaire et génétique Profiter de son expérience



86

3.3.9 Rôles potentiels des laboratoires et stratégies envisagées

Les laboratoires ont révélé le rôle qu’ils pensent pouvoir jouer, en fonction de leurs spécificités, auniveau régional et les stratégies qu’ils envisagent de développer pour renforcer leurs capacités(tableau XIV). Les rôles souhaités correspondent aux spécialisations ou aux technicités des différentslaboratoires.

Il existe de nombreux points communs aux stratégies envisagées par les différents laboratoires.Ces stratégies se résument comme suit :

• Collaborer avec d’autres laboratoires plus expérimentés ;• Renforcer les capacités du laboratoire par la formation initiale et la formation continue du

personnel ;• Recruter des chercheurs et techniciens ; • Acquérir de nouveaux équipements et assurer la maintenance des équipements ;• Aménager (réhabiliter, étendre, construire) les locaux pour une meilleure opérationnalité ; • Développer la démarche qualité selon les normes ISO 17025 et/ou ISO 9001 ;• Obtenir l’accréditation du laboratoire et la certification du fonctionnement ; • Rechercher des financements à travers les projets de recherche ; • Diversifier, avec l’appui du CORAF/WECARD, la coopération ;• Assurer un meilleur fonctionnement des services ; • Bénéficier du support financier de la CEDEAO et d’autres institutions ;• Elaborer un plan stratégique ; • Solliciter le CORAF/WECARD pour faciliter les commandes de consommables de laboratoire ; • Développer des techniques et outils moléculaires.

De façon générale, les stratégies envisagées par les laboratoires permettent d’améliorer les pointsfaibles mis en évidence par l’étude et de parvenir à jouer les rôles potentiels exprimés. Le statutsouhaité par les laboratoires visités dans le cadre de la mise en œuvre du PADBBAO est un statuthybride (Laboratoire national exécutant des mandats nationaux et régionaux).

En tenant compte de toutes les informations recueillies, nous proposons, pour chaque laboratoire, lafonction qu’il devrait assumer en tant que laboratoire d’excellence (tableau XV). Il appartient auComité de sélection et d’attribution de valider ces propositions et/ou d’y apporter des modifications.

87

Tableau XIV : Rôles souhaités par les laboratoires visitéset stratégies envisagées



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88

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89



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92

Tableau XV : Proposition de rôles des laboratoires devantdevenir centres d’excellence

N° PAYS LABORATOIRES ROLES

1

BURKINAFASO

Laboratoire de Virologie et deBiotechnologies Végétales (LVBV-INERA)

• Production de semences OGM• Mesure de biosécurité• Caractérisation moléculaire des virus

2Laboratoire de Génétique et deBiotechnologies Végétales (LGBV-INERA)

• Diversité génétique des plantes alimentaires• Etude de flux de gènes

3Laboratoire de Microbiologie et LaboratoiresAssociés (LMLA-IRSAT)

• Contrôle de qualité physico-chimique et microbiologiquedes denrées alimentaires

4Laboratoire de Biotechnologies Animales(LBA-CIRDES)

• Caractérisation moléculaire chez les animaux• Caractérisation mol. des vecteurs &Pathogènes• Epidémiologie moléculaire

5

CÔTED’IVOIRE

Laboratoire Central de Biotechnologies(LCB-CNRA)

• Diversité génétique chez les plantes pérennes• Culture in vitro chez les plantes pérennes

6Laboratoire de Virologie et de Contrôle deQualité Vaccin (LVCQV-LANADA)

• Contrôle qualité vaccins• Diagnostic mol. des pathogènes chez les animaux

7Laboratoire de Génomique Fonctionnelle etAmélioration Génétique (LaGeFAGe-UAA)

• Formation à la caractérisation moléculaire des plantes

8GAMBIE

International Trypanotolerance Center (ITC) • Diversité génétique des parasites des animaux• Sélection des animaux /résistance aux maladies

9 Biotechnology Laboratory (BL-NARI) -

10

GHANA

Radiation Entomology Center (REC-BNARI) • Lutte anti-vectorielle par irradiation

11 Plant Biotechnology (PB-BNARI) • Sanitation des accessions de plantes• Culture in vitro, mutation par Irradiation

12 Biotechnology Centre (BC-UGL) • Formation en sélection assistée par MM• Caractérisation Moléculaire des pathogènes

13 Biotechnology Laboratory (BL-CRI)• Culture in vitro chez les végétaux• Caractérisation des pathogènes• Test en milieu confiné /Biosécurité

14

MALI

Laboratoire de Biologie MoléculaireAppliquée (LBMA-UB)

• Production d’OGM et Biosécurité • Formation en Biologie Moléculaire

15Laboratoire d’Agro-physio-génétique et deBiotechnologies Végétales (LAPGBV-IPR)

• Production de semences par CIV / paysans• Formation

16 Laboratoire Central Vétérinaire (LCV-MEP) • Production et contrôle de vaccins

17

NIGERIA

Biotechnology Laboratory (BL - IAR) Culture in vitro (micropropagation, cryoconservation)Sélection Assistée par Marqueurs

18Biotechnology Laboratory(BL - NACGRAB)

Culture in vitro, surtout par système d’immersion temporairepar BioréacteurCodage à barre

19Biotechnology and Genetic EngineeringAdvanced Laboratory (BGEAL - SHESTCO)

Culture in vitro (micropropagation et surtout technologied’immersion temporaire par bioréacteur)Transformation génétique et stérilisation par gammairradiation, SAMBiodégradation de polluantsRecyclage de résidus

20

SENEGAL

Laboratoire Campus de BiotechnologiesVégétales (LCBV-UCAD)

Production de semences / Culture in vitroFormation

21Centre d’Etude Régional pour l’Amélioration del’Adaptation à la Sécheresse (CERAAS-ISRA)

Sélection pour la résistance à la sécheresse chez les plantes

22Institut Sénégalais de Recherche Agricole -Production (ISRA - Production)

Production en masse de vaccins

23Laboratoire National de l’Elevageet de Recherches Vétérinaires (LNERV-ISRA)

Mise au point de vaccins et contrôle

93

3.3.10 Dispositifs de biosécurité dans les pays abritant les laboratoires visités

Tous les pays abritant les laboratoires visités se sont dotés de cadres de biotechnologie et debiosécurité (tableau XVI). Cependant, au moment de l’enquête, trois pays (Côte d’Ivoire, Gambie etGhana) ne disposent pas encore de loi sur la biosécurité. Dans ce contexte, la Côte d’Ivoire et laGambie ne produisent pas d’OGM et n’en évaluent pas, contrairement au Ghana qui manipule lesOGM au laboratoire. Toutefois, aucun pays visité n’a émis de restriction sur les OGM.

Sept différents partenaires sont impliqués dans la production et l’évaluation d’OGM dans les autrespays qui les manipulent ; il s’agit de Monsanto, Tuskegee University, Syngenta, l’IRD, l’AATF, CSIRO,Australia et Danforth Institute, St Louise, USA. Concernant la formation, seule la Gambie ne disposed’aucune institution de formation en biotechnologie ou en biosécurité (tableau XVI).



RAPPORT FINAL › Evaluation des capacites de laboratoires de l’afrique de l’ouest en matiere de biotechnologie et de biosecurite


94

Tableau XVI : Présence de dispositifs de biotechnologies/biosécurité dans les pays concernés

PAYS

BURKINAFASO

COTED’IVOIRE GAMBIE GHANA MALI NIGERIA SENEGAL

Cadre deBiotechnologie oui non oui oui oui oui oui

Cadre deBiosécurité oui oui oui oui oui oui oui

Loi sur laBiosécurité oui non non non oui non oui

Productiond’OGM oui non non oui oui oui non

Evaluationdes OGM oui non non oui oui oui oui

Naturede l’OGM Bt coton - -

Bt Cowpea,high B-carot.

sorghum,high protein potato

CotonSoja

Insect resistant Btcowpea, cassavabio-fortifies with Vit

A &

Végétale

Partenaire Sofitex,Monsanto

- - Tuskegee University SYNGENTA

AATF & CSIRO,Australia &

Danforth Institute,St Louise, USA

IRD

Quarantaine oui non oui oui oui non oui

Serre P1(classique) oui oui oui oui oui oui oui

Serre P2 (OGM) oui non non oui non oui oui

Restrictionsur les OGM non non non non non non non

Institutions deformation enbiotechnologie

oui oui non oui oui oui oui

Institutions deformation enBiosécurité

oui oui non oui oui oui oui

IVDISCUSSION

RAPPORT FINAL › DISCUSSION


96

Les principaux laboratoires de biotechnologie de la région interviennent dans les six domainesd’activités suivants : 1) Biotechnologie végétale, 2) Biotechnologie animale et halieutique, 3)Environnement et biosécurité, 4) Agroalimentaire et sécurité sanitaire des aliments, 5) Ressourcesgénétiques et 6) Adaptation au changement climatique. Les six domaines regroupent vingt-quatrespécialités techniques, dont certaines ont été regroupées pour ne retenir que seize spécialités qui sontprécisées ci-dessous.

Dans le domaine de la biotechnologie végétale, cinq spécialités ont été considérées, il s’agit de (i) latransformation génétique et la production de semences OGM, (ii) la culture in vitro et la productionde semences ainsi que la sanitation des accessions de plantes, (iii) la caractérisation génétique desplantes et la sélection assistée par marqueur moléculaire (SAM), (iv) la détection et la caractérisationdes pathogènes de plantes et (v) la production de biofertilisants.

En biotechnologie animale et halieutique, quatre spécialités ont été définies, à savoir (i) lacaractérisation moléculaire des animaux, des vecteurs et des parasites, (ii) la lutte anti-vectorielle etanti-parasitaire, (iii) la sélection des animaux /résistance aux maladies, (iv) la production et le contrôlede qualité des vaccins.

Dans le domaine de l’environnement et de la biosécurité, deux spécialités sont distinguées : (i) l’analyse /évaluation des OGM en milieu confiné ainsi que l’étude du flux de gènes et (ii) la biodégradation depolluants et le recyclage de résidus.

Dans l’agroalimentaire et la sécurité sanitaire, on peut distinguer deux entités : (i) le contrôle de qualitéphysico-chimique et la microbiologique des denrées alimentaires et (ii) la sécurité sanitaire desaliments carnés.

Au niveau des ressources génétiques on distingue deux spécialités : (i) la conservation de semencesanimales et (i) la conservation des semences végétales.

Enfin, dans le domaine de l’adaptation au changement climatique, une seule spécialité est retenue ; ils’agit de la sélection pour la résistance à la sécheresse chez les plantes.

L’étude a permis de mettre en évidence les forces et les faiblesses de chaque laboratoire (tableau X)sur la base de douze critères. En tenant compte des spécificités de chaque laboratoire, l’analyse desrésultats nous permet de proposer (tableau XVII) la liste des laboratoires susceptibles de servir de centred’excellence dans ces différentes spécialités.

IV. DISCUSSION

97

Tableau XVII : Liste par spécialité des laboratoires susceptiblesde servir de centres d’excellence


RAPPORT FINAL › DISCUSSION

Domaine /Thématique Spécialités /groupe de spécialités Laboratoires proposés

Biotechnologievégétale

• Transformation génétique et productionde semences OGM

• Laboratoire de Virologie et de Biotechnologies Végétales(LVBV-INERA)

• Laboratoire de Biologie Moléculaire Appliquée (LBMA-UB)• Biotechnology and Genetic Engineering Advanced

Laboratory (BGEAL - SHESTCO)

Culture in vitro et production de semences(cultures perennes)• Sanitation des accessions de plantes

Culture in vitro et production de semences(cultures vivrières)Sanitation des accessions de plantes

• Laboratoire Central de Biotechnologies (LCB-CNRA)• Laboratoire Campus de Biotechnologies Végétales

(LCBV-UCAD)

• Plant Biotechnology (PB-BNARI)• Biotechnology and Genetic Engineering Advanced

Laboratory (BGEAL-SHESTCO)

• Caractérisation génétique des plantes • Sélection A. M (cultures vivrières)• Caractérisation génétique des plantes • Sélection A. M (cultures pérennes)

• Laboratoire de Génétique et de BiotechnologiesVégétales (LGBV-INERA)

• Laboratoire Central de Biotechnologies (LCB-CNRA)

Détection et caractérisation despathogènes de plantes

• Biotechnology Centre (BC-UGL)• Laboratoire Central de Biotechnologies (LCB-CNRA)

Production de biofertilisants • Biotechnology and Genetic Engineering AdvancedLaboratory (BGEAL - SHESTCO)

BiotechnologieAnimale

et halieutique

Caractérisation Mol. des animaux desvecteurs et des parasites

• Laboratoire de Biotechnologies Animales (LBA-CIRDES• Laboratoire de Biologie Moléculaire Appliquée (LBMA-UB)

Lutte anti-vectorielle et anti-parasitaire • Radiation Entomology Center (REC-BNARI)• International Trypanotolerance Center (ITC)

Sélection des animaux /résistance auxmaladies

• Laboratoire de Biotechnologies Animales (LBA-CIRDES• International Trypanotolerance Center (ITC)

• Production et le Contrôle qualité desvaccins

• Laboratoire National de l’Elevage et de RecherchesVétérinaires (LNERV-ISRA)

• Laboratoire Central Vétérinaire (LCV-MEP)• Laboratoire de Virologie et de Contrôle de Qualité Vaccin

(LVCQV-LANADA)

Environnementet Biosécurité

Analyse /Evaluation des OGM en milieuconfiné, flux de gènes

• Laboratoire de Génétique et de BiotechnologiesVégétales (LGBV-INERA)

• Biotechnology Laboratory (BL - IAR)• Biotechnology Laboratory (BL-CRI)

Biodégradation de polluantsRecyclage de résidus

• Biotechnology and Genetic Engineering AdvancedLaboratory (BGEAL - SHESTCO)

Agroalimentaireet sécuritésanitaire

Contrôle de qualité physico-chimique etmicrobiologique des denrées alimentaires

• Laboratoire de Microbiologie et Laboratoires Associés(LMLA-IRSAT)

Sécurité sanitaire des aliments carnés • Laboratoire National de l’Elevageet de RecherchesVétérinaires (LNERV-ISRA)

Ressourcesgénétiques

Conservation de semences animales • Laboratoire de Biotechnologies Animales (LBA-CIRDES)

Conservation des semences végétales • Laboratoire d’Agro-physio-génétique et deBiotechnologies Végétales (LAPGBV-IPR)

Adaptation auchangement

climatique

Sélection pour la résistance à la sécheressechez les plantes

• Centre d’Etude Régional pour l’Amélioration del’Adaptation à la Sécheresse (CERAAS-ISRA)

V

MISE EN RÉSEAUDES LABORATOIRES

RAPPORT FINAL › Evaluation des capacites de laboratoires de l’afrique de l’ouest en matiere de biotechnologie et de biosecurite


100

Il est évident que les laboratoires évalués, pour la plupart, n’ont pas la capacité de traiterindividuellement, de manière convenable et complète, les besoins qui leur seront exprimés par laCEDEAO. Mais ils ont des capacités complémentaires. C’est pourquoi il est indispensable de mettreen réseaux les laboratoires de mêmes spécialités autour d’un ”leader”, choisi par un groupe d’experts.De même, ces laboratoires d’excellence seront mis en réseaux avec les laboratoires du Nord (USA,Canada, Europe) et avec les Centres du CG pour leur permettre d’améliorer leurs capacités.

Le laboratoire leader, une fois identifié par un groupe d’expert, serait mis en relation formelle avec lesautres laboratoires de la même spécialité afin qu’ensemble ils puissent exécuter de façon concertéeles projets de recherche. Dans cette organisation des laboratoires de spécialités, la priorité d’exécutiondes tâches des projets régionaux de recherche devrait échoir au laboratoire leader. Toutefois, laréalisation d’une tâche spécifique ou d’une activité sera confiée au laboratoire du réseau qui enprésente les meilleures dispositions (techniques, géographiques, spéculation etc.).

V. MISE EN RÉSEAU DES LABORATOIRES

VI

TRANSFERT DETECHNOLOGIES

RAPPORT FINAL › MISE EN RÉSEAU DES LABORATOIRES


102

D’autres opérations ou actions doivent être entreprises afin de renforcer les capacités des laboratoiresde spécialité; il s’agit en particulier du transfert de technologies relatives aux actions de recherche auprofit de certains laboratoires des SNRA de l’Afrique de l’Ouest. Le transfert de technologies deva allerde pair avec la formation de chercheurs et de techniciens, la construction ou la réhabilitationd’infrastructures de recherche et l’acquisition d’équipements scientifiques de qualité. Dans laréalisation de telles activités de renforcement des capacités, le CORAF interviendra comme maîtred’oeuvre ou comme interface.

La formation des chercheurs et des techniciens, si elle est nécessaire, aura lieu dans le pays dulaboratoire d’excellence, dans un autre pays du Sud (CGIAR) ou éventuellement dans un pays duNord. Les frais occasionnés par la formation seront couvets par le CORAF, en collaboration avec lespartenaires institutionnels. Le CORAF définira, en fonction des besoins exprimés, le rythme des sessionsde formation et le nombre de personnes à former.

Le recrutement de chercheurs et de techniciens sera réalisé au niveau local, c’est-à-dire dans le paysdu laboratoire. Il sera organisé par les autorités locales conformément aux règles en vigueur en lamatière. Au besoin, le CORAF peut affecter dans le laboratoire des ressources humaines pour destâches et des périodes bien définies. Les personnes recrutées localement seront rémunérées par leslaboratoires au regard des dispositions en vigueur dans le pays ; celles recrutées et affectées par leCORAF seront rémunérées par cette institution régionale de recherche.

6.1 Des laboratoires du Nord vers les laboratoires d’excellence

Le transfert de technologies des laboratoires du Nord vers les laboratoires d’excellence de la CEDEAOse fera dans le cadre du renforcement des capacités des centres d’excellence, qu’ils soient leadersou secondaires, désignés par le groupe d’experts. Il tiendra compte des lacunes constatées, desbesoins exprimés lors de cette étude et des rôles attribués à chaque laboratoire. La coopération Sud-Sud sera prioritaire à la coopération Nord-Sud. Dans cette optique, il est nécessaire de définir aupréalable les termes d’une coopération avec les partenaires (laboratoires du Nord ou institutionsCGIAR). Les laboratoires des CGIAR installés dans la zone CEDEAO (IITA, AfricaRice, l’ICRISAT) ou ailleursen Afrique (INIBAP, Bioversity international, ILRI, etc.) sont incontournables du fait de l’importance deleur plateau technique et de leur mission.

6.2 Des laboratoires d’excellence vers les laboratoires du groupe de spécialitéou vers les SNRA

En fonction des besoins, les chercheurs et les techniciens du groupe de spécialité ou de laboratoiresdes SNRA se déplaceront dans les laboratoires d’excellence pour un renforcement de leurs capacités,notamment pour l’acquisition de connaissances techniques, pratiques ou théoriques, nécessaires àl’accomplissement de leurs activités de recherche. Des consortiums entre les centres d’excellence etles laboratoires des SNRA seront établis afin d’optimiser l’exécution des actions de recherche.

Afin de permettre aux centres d’excellence et aux centres de recherche de la sous-région d’êtrecompétitifs en Afrique et dans le monde, la démarche qualité selon la norme ISO 17025 ou la normeISO 9001devra être développée pour l’accréditation des méthodes d’analyse dans les laboratoires.

VI. TRANSFERT DE TECHNOLOGIES

VII

CONCLUSION ETRECOMMANDATIONS

RAPPORT FINAL › CONCLUSION ET RECOMMANDATIONS


104

La zone CEDEAO regorge de laboratoires dont certains ont un fort potentiel technique, équivalent ousupérieur à celui de certains laboratoires du Nord. Plusieurs de ces laboratoires ont bénéficiéd’équipements, aussi bien des institutions internationales (AIEA, USAID, FAO) que des organisationsrégionales et sous-régionales que sont la CEDEAO et l’UEMOA.

Le potentiel technique des laboratoires du domaine de la production animale est sensiblementsupérieur à celui des laboratoires du domaine de la production végétale. En effet, deux des troislaboratoires qui disposent d’un séquenceur automatique travaillent dans le domaine de labiotechnologie animale et quatre des six laboratoires possédant un appareil de PCR quantitativeexercent dans ce même domaine. Par ailleurs, certains équipements des laboratoires visités ont besoind’être actualisés et renforcés à divers niveaux. Seul le Laboratoire de Biotechnologie BGEAL-SHESTCOdispose d’un synthétiseur d’oligonucléotides, pourtant nécessaire pour les réactions d’amplificationqui constituent la base des techniques utilisées dans tous les laboratoires. Plusieurs équipements nesont pas fonctionnels, faute d’entretien par un personnel qualifié, et ne disposent pas d’un systèmede sécurisation de l’alimentation électrique. De manière générale, les laboratoires manquent delocaux de quarantaine et de serres (type P2), appropriés aux manipulations des OGM.

Dans la plupart des laboratoires visités, l’insuffisance des ressources humaines, tant au niveau deschercheurs que des techniciens, a été constatée. Le Laboratoire Central Vétérinaire (LCV-MEP) duMali, le mieux doté en chercheurs et techniciens, et le BGEAL-SHESTCO et l’ISRA-Production fontexception à cette carence.

Malgré ces faiblesses, un grand nombre d’activités de recherche et de formation sont menées dansces laboratoires, en collaboration avec certaines institutions partenaires de recherche et definancement. Cependant, pour que les laboratoires retenus au terme de ces travaux puissent jouerefficacement le rôle de laboratoire d’excellence de la CEDEAO et du CORAF/WECARD et devenircompétitifs au niveau régional et international, nous recommandons les actions suivantes :

1. Renforcer les capacités en ressources humaines (chercheurs et techniciens) ;2. Renforcer les capacités techniques (équipements) ;3. Aider à la formation continue des chercheurs et des techniciens ;4. Aider à la formation sur le plan international (ICGEB, ISNAR, etc.) ;5. Equiper les laboratoires de groupes électrogènes pour sécuriser les appareils ;6. Aménager (réhabiliter, construire) certains locaux pour les rendre davantage opérationnels ;7. Sélectionner une équipe de techniciens pour la maintenance des équipements ;8. Sélectionner une équipe de fournisseurs pour l’achat des produits chimiques ;9. Sensibiliser les pays à la mise en place de structures de quarantaine ;10. Renforcer/construire des structures de confinement et des serres ;11. Aider au renforcement de la coopération et/ou à l’initiation de nouveaux partenariats ;12. Mobiliser un financement auprès des utilisateurs finaux des produits de biotechnologie ;13. Accompagner les laboratoires dans la démarche qualité ISO 17025 et/ou ISO 9001 ;14. Garantir une certaine autonomie de fonctionnement des laboratoires par rapport au pays ;15. Instaurer des primes d’incitation aux coordonnateurs des projets régionaux.

VII. CONCLUSION ET RECOMMANDATIONS

ANNEXE

RAPPORT FINAL › ANNEXE


106

Tableau XVIII : Interlocuteurs des laboratoires visitésPA

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