CTB analysis～ user としての Athena ～

はじめにCTB 解析の流れ一般的な Athena の setupCTB 解析用の package と走らせ方　　　 -> 簡単な内容の説明ComBined NTuple とその解析の仕方

( 時間があったら )Event Display “Atlantis”

CTB 解析の流れCERN Advanced

STORage Manager

Reconstruction

(RecExTB)

lxatl*:/home/kojin/data/

ByteStream

I made Copy

ComBined NTupleROOT

Plots

Event Summery Data(LAr Only)

PyROOT

Athena

http://agenda.cern.ch/fullAgenda.php?ida=a044712

一般的な Athena の setup

CMT の setup　　　 CMT とは、 Configuration Management Tool の略で、　　　複雑な Athena の setup を簡単にするためのもの。

CMT を使って環境設定。　　　 Athena の package ,Gaudi,compiler に path が通る。

Athena の package の install　　　 lxplus(CERN) では、 check out という形で install　　　 lxatl 群 (ICEPP) では、 rsync もしくは、 tar で持ってくる。

• やること　　まず、 Athena を動かす directory を作る。　　　　 % mkdir ~/CTB　　次に、 CMT の Setup をするための script を動かす。　　　　 % source /afs/cern.ch/sw/contrib/CMT/v1r16/mgr/setup.sh

以上で CMT が使えるようになった。

• 確認　　 % which cmt 　　とすると、　 cmt=‘${CMTROOT}/${CMTBIN}/cmt.exe’ となる。　　これで、　　　　 cmt config , cmt broadcast … , cmt co … 　　などの command が使えるようになる。

CMT の setup　　　 CMT とは、 Configuration Management Tool の略で、

　　　複雑な Athena の setup を簡単にするためのもの。

• やること　　 先ほど作った ~/CTB/ 　に、 CTBhome, WorkArea 　 directory を作る。　　　　　 % mkdir ~/CTB/CMThome　　　　　 % mkdir ~/CTB/WorkArea　　　　　 % cd ~/CTB/CTBhome cmt コマンドで環境設定をするときには、 requirements ファイルが必要。　　　　　 % cp ~kojin/dist/ctbana/requirements ~/CTB/CMThome/ 中身は、　　　　　　　　 set CMTSITE CERN <- おまじない　　　　　　　　 macro ATLAS_DIST_AREA /afs/cern.ch/atlas/software/dist <- Athena の package があるところ　　　　 macro ATLAS_RELEASE “9.0.0” 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 <- Athena の version　　　　 use ATLAS_Settings v* ${ATLAS_DIST_AREA} <- Athena の setup に必要な package　　　　 macro workarea ${HOME}/CTB/WorkArea <- これから自分が作業するところ　　　　 path_prepend CMTPATH “${workarea}” 　　　　　　　　　　　　　　　　　　 <- 環境変数

　　　　　 % cmt config ; source setup.(c)sh -tag=opt なぜか、 lxatl では、次の設定が必要。 (lxplus では必要ないです。 )　　　　　 % export LD_LIBRARY_PATH=${LD_LIBRARY_PATH}:/afs/cern.ch/asis/i386_redhat73/usr.local/lib

• 確認　　　　　 % echo ${LD_LIBRARY_PATH} ${ATLAS_DIST_AREA}/…/lib , …/Gaudi/…/lib , …/gcc-atl-3.2/lib に path が通った。

CMT を使って環境設定。　　　 Athena の package ,Gaudi,compiler に path が通る。

Athena の package の install　　　 lxplus(CERN) では、 check out という形で install　　　 lxatl 群 (ICEPP) では、 rsync もしくは、 tar で持ってくる。

• やること　　　　　 % cd ~/CTB/WorkArea　　 lxplus では、　　　　　 % cmt co –r 00-00-51 Reconstruction/RecExample/RecExTB lxatl では、それができないので、　　　　　 % tar –zxvf ~kojin/dist/ctbana/RecExTB.tar.gz

• 確認と補足　　自分の workarea (~/CTB/WorkArea/) に RecExTB 　 package が展開された。　　もし、 lxplus に Account がなくても、　　この tar file は、　　　 http://isnpx0168.in2p3.fr/athena/　から Download できる。 Package の中には、次のような Directory がある。 …/cmt 　　　　その package 専用に athena を setup するための requiremen

t がある …/share 　　　 Athena を実際に走らせる jobOption がある。 Python …/run 　　　　実際に athean を実行する場所 …/src 　　　　 Algorism などの source code が入っている。 C++

Configuration と gmake athena.py という command を使えるようにする。

　　　必要に応じて、 Geant4,CLHEP,ROOT,MySQL 等に path が通る。

jobOption file の編集

athena.py 　～ .py

CTB 解析用の package と走らせ方

• やること　　　自分の WorkArea directory に Copy した、 package の cmt directory にうつる。 　　 % cd ~/CTB/WorkArea/Reconstruction/RecExample/RecExTB/RecExTB-00-00-51/cmt 　　　 requirements があることを確認して (use … というのが使う package) 、　　　 broadcast をつけて、 config , source , gmake をおこなう。 % cmt broadcast cmt config ; source setup.sh ; cmt broadcast gmake

• 確認 % which athena.py /afs/cern.ch/atlas/software/dist/9.0.0/InstallArea/share/bin/athena.py

athena.py に path が通った。さらに、　　　　　 % echo ${LD_LIBRARY_PATH} たくさんの path が作られている。 Geant4,CLHEP,ROOT,MySQL など。メモ　　ここで、　　　　 source /afs/cern.ch/sw/contrib/CMT/v1r16/mgr/setup.sh　　 　 　 source ~/CTB/CMThome/setup. (c)sh source ~/CTB/WorkArea/Reconstruction/RecExample/RecExTB-00-00-51/cmt/setup.(c)sh

　という 3 行を書いたファイルを作っておくと便利。次に login したときはこれを動かす。

Configuration と gmake athena.py という command を使えるようにする。

　　　必要に応じて、 Geant4,CLHEP,ROOT,MySQL 等に path が通る。

jobOption file の編集

• やること　　　　 RecExTB 　 package に必要なファイルの link を作る。　　　　　　　　 % cd ~/CTB/WorkArea/Reconstruction/RecExample/RecExTB/RecExTB-00-00-51/r

un

% ../share/RecExTB_links.sh % emacs –nw RecExTB_Combined_2004_jobOptions.py L10 RunNumber = 2102243 L14 FilePrefix = “daq_SFO-51_combined” L15 InPutDirectory = “/home/kojin/data” L113 InDetTBFlags.SiTBLineFitter=False L165 MuonTBNtuples.RpcDigit = False L173 MuonTBRecoAlgs.Muonboy = False L174 MuonTBFlags.MuonboyTBNT = False L306 ByteStreamEventStorageInputSvc.ReaderType = “Simple” L629 theApp.EvtMax=1000

• 確認 % ls –l たくさんの symbolic link ができている。

athena.py 　～ .py

• やること　　　あとは走らせるだけ。　　　　　　 % athena.py RecExTB_Combined_2004_jobOptions.py →(% athena.py RecExTB_Combined_2004_jobOptions.py >& test_CBNT.log &)

とするほうがお薦め。 ( いっぱい comment が出てくるから )

• 確認　　　　 >& を使って走らせたときには、　　　　　　 % tail –f test_CBNT.log とやると見れる。

• 解説 & 雑談

　　　　　　　　　 athena link集　

Ntuple 解析の前に……

Event Display “Atlantis”• やること % mv ntuple.root ntuple2102243.root 　　　　　　　 % emacs –nw RecExTB_Combined_2004_jobOptions.py L117 InDetTBFlags.JiveXML=True L118 InDetTBFlags.AtlantisGeometry=True L630 theApp.EvtMax = 100

• 動かす % athena.py RecExTB_Combined_2004_jobOptions.py >& test_JiveXML.log &

% tail –f test_JiveXML.log 終わったら、 ( 時間がかかるので次へ ) % ~kojin/scritps/.atlantis(_csh) % atlantis &　　　　　

ComBined NTuple とその解析の仕方• とりあえず TBrowser % root [0] Tbrowser b

• TFile で読み込んでみる (about SCT) % root [0] TFile *f = new TFile (“ntuple2102243.root”) [1] Ttree *t = (Ttree*) f-> Get(“TB/tree”) [2] t-> Draw(“sct_sp_y:sct_sp_x”) [3] t-> Draw(“sct_sp_y:sct_sp_z:sct_sp_x”) あとは適当に…

• Event Loop をまわすには [4] t-> MakeClass(“BaseClass”) [5] .q BaseClass.C の解説を参照。

Reference

CTB解析

解析環境解析ソフトウェア

SCT data 解析　　　　

CERN

CERN Advanced

STORage Manager

lxplus

ICEPP

CTB Real Data CTB MC Data

DC2 Data …

ATLAS CMS

ALICE….

…. SW

lxatl

tsukuba

/afs/cern.ch

/tmp

SW

ATHENA

ATHENA

SW

3259.36 TB

etc…CASTOR_HOME total 63.80 TB

7.5 GB

lxbatch

Interactive nodeCPU time threshold

ssh

bbftp , gridftp?

rfio (rfdir, nsls, rfcp)

mounted? (cd, ls, cp)

HOME500 MB

each PCs

Automatically 　creared

[ lxplus024 ] ~/athena %

Job was executed on host(s) <lxb0038>

job submit

%

bs

ub

–q

1n

w r

un

.sh

/castor/cern.ch

tape

/pool/lsf/kojin Temporally

Temporally

Ntupl

eSvc

.Out

put =

[ “FI

LE D

ATAFI

LE ‘/

tmp/

ntup

le.ro

ot’ o

pt=‘

New’”

]

rfcp /tmp/ntuple.root $CASTOR_HOME/

bbftp -V -p 4 -e "setoption remoterfio; mget /castor/cern.ch/…. ./" -u kojin wacdr001d.cern.ch

ByteStream

Svc.Input

analysis line

RDO

CTB Software in Athena

CBNT

GeneratorGeant4

PoolPool

SimDig

include RDO

Reconstruction/RecExample/RecExTB

Simulation/G4Sim/CTB_G4Sim

G4Sim

RecE

xTB_C

om

bin

ed_2

004

ex. sct_rdo_*** sct_sp_*** mdt***

in CASTOR

ROOT

Plot

CERN

ICEPP TSUKUBA

ByteStream

G4D

ig

DATA Anlysis

SimulationDigitization

Reconstruction

CTB setup

ly0 ly1 ly2 ly3

phi0

phi1

link0

link1