detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance
DESCRIPTION
Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance - Travaux Dirigés de la 3e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - RASON Marie-Ange et RANDRIANARIVELOJOSIA MilijaonaTRANSCRIPT
1
�������������� � ������ ��������������������� �� ����������������� � ������ ��������������������� �� ���
��������� ������������������ ���������������
��������� ������ ������������ ���������� ������ ������������ ��������� �������� ��������� ������������ �������� ��������� ����
��������������� ���������������������������������������������� �������������������������������
����������������������������������������������������������������������������������������������������������
2
������������������������������������������������������������������
������������������
�� ������
��������������� �� ���������������������� �� ������������������������������� �������������� ��������������
�� ������ �������� �� ������� �� ���
����������������������������� ������������� ����
�� ���� �� ����
3
�������������!��������������������� ��������������!��������������������� ����������� ����������
������������� ����������������� ����
!! "�#$%&'$%'$���$())(�*+"�#$%&'$%'$���$())(�*+
!! "�#$��,-.�*)++"�#$��,-.�*)++
� ���������� ���������
!! ��� ������/� ����� ���/������/�����0��������������� ������/� ����� ���/������/�����0������������
!! ��� ������������� ��������������� ���������� �����������/�1���� ������������� ��������������� ���������� �����������/�1�
&�����������2�/�������0�������� ����������&�����������2�/�������0�������� ����������
��$�������� ��3��������$�������� ��3������
���������������
���2��� ����4
"�����#
4
���������� ������� �� ���������� ������� ��
55 6�� ������� ��/����0���������/���7��������������� ��8����� �����6�� ������� ��/����0���������/���7��������������� ��8����� �����������������/�����������2�� �������������/�����������2�� ���������99 :����� ������ ����������;:����� ������ ����������;99 ���������;���������;99 �����<�����/���������� ��0���;�����<�����/���������� ��0���;99 ��!!��7����������;��7����������;99 ,�3 �����������/���������8�/���������7����;,�3 �����������/���������8�/���������7����;
55 ,��������� �������������������������������� �������� ��/����0���,��������� �������������������������������� �������� ��/����0������/��/�1�����0������/��/�1�����0���
5
�� �������� �� ������ �������� �� ��������������
����������� ����������������� ������#�'=�%�&$��,$-+�()�#�'=�%�&$��,$-+�()�������(�())*��(�())*
$�������������%�&'�&(�)) $�������������%�&'�&(�)) ���������������������������������� ���/�())*>�.*4?@?���/�())*>�.*4?@?!!?+?+A����A���� �����������������������3���������3������������%��������%�������� ())(>�@.4*.?B())(>�@.4*.?B!!.@.@
*������ �������������������*������ ������������������������� &���������=�%����&���������=�%���������������������� �������� *-+->�(.4C(+*-+->�(.4C(+!!(-(-,������=�,������=�����D����/�D����/������� �1�1 *-BC>�C(4�@@+*-BC>�C(4�@@+!!?*?*
* ������������* �������������� ����� � ��� ����� � �
����� �����
�� ���1/��
� ��������E�4
"������#
$������$������ ���������������������/��1�����������/��1���������������� %1������1%1������1*--+>�(+4�B@*--+>�(+4�B@!!-*-*
*��������������*�������������� ������������������ %��3���������� ��D����/���� �1 ())@>�+)4**-!(@
6
+���������������'����������������������������������+���������������'����������������������������������
7
+����� ��������!���������������+����� ��������!��������������� !����������!���������������� ��� ��!"�,�������� ���� ��!"�,�������� �
+
�1/�2�������!C�
�&A�/�����������&A�/������������ 3�������������� 3������������ "�,�����������"�,�����������
������
8
$�������-� �������������������������������$�������-� �������������������������������
��%��/���������������������� ���%��/���������������������� �����������8��8�� �����������������������3��������3���
�� %����������%����������$)./�$)./�����������������������������������3�������?)F�����3�������?)F�
9
A 3019 3126 3174 3221 3053 3288 2593 2464 3185 2963 3017 3174B 2582 2951 2315 875 1006 870 2472 2446 2484 2570 2772 2608C 1737 1767 1685 102 100 110 1678 1552 1557 1526 1716 1732D 482 415 595 120 106 101 702 651 541 695 762 795E 164 138 192 82 77 85 112 122 119 218 327 276F 96 133 94 90 73 75 66 72 87 110 155 131G 90 108 3040 78 104 3340 105 76 3552 111 122 2943H 103 100 3276 101 114 3045 77 104 3187 113 135 3017
Chloroquine Amodiaquine Mefloquine Quinine
(� ��� �����������������������������(� ��� �����������������������������
���� �������� �� �������� �������� �� �������������� ������������������������������
$������ �������� ����0�����1���������� � �� �����������
2��������������
2�������������
10
������������������������������������������������������������������
������������������
�� ������
��������������� �� ���������������������� �� ������������������������������� �������������� ��������������
�� ������ �������� �� ������� �� ���
����������������������������� ������������� ����
�� ���� �� ����
11
��������� ��������� �������� ��������� ������������� ��������� �������� ��������� ����
�$(3 �����4����$(3 �����4���
�$(3+���������5�� �$(3+���������5��
(�(�66�$(�$(
���� �-�"�,������ �-�"�,��������������������
�$(3(2%��$(3(2%�
G ���1/���������E4"������#
12
+�����4�����!���� ��������� +�����4�����!���� ���������
����/4$$����/4$$HHH����/����������7�HHH����/����������7���
13
����������������������������������
$�����78$�����78"""""" �,1��������I�J�������=��,1��������I�J�������=�%:%:!!�����3�������3����""$$"" ���� �����������J���� =����� �����������J���� =�%:%:!!� �������� ���������
14
�$(���+�����������������$(���+���������������� !���� ���� !���� ����
$���4���� �����������0�������������������� 0������8�� ������
+����4���� �����0���/������������� �������
���� ����������������� �0�������/�����<���������/� ���������� ������ 0�������/ ��7�0�������� ����=���/�3�������������K����/����13������������������0����������� 0������/����/�������������������7��������
(http://www.inrp.fr/Acces/biotic/biomol/techgen/html/telechar.htm)
15
�$(���+�����$(���+����
16
+�������������������������������������+������������������������������������������������������������� ����������������������������� �����
17
(�(�66�$(����$(������� ����������$(�������� �$(����$(������� ����������$(��������
��/��7������������������L���� ��/���0�������%�������0����/��7������������������L���� ��/���0�������%�������0��
��!!�%�% ���������������������������� ����������� ���� ����������� ���� /�������������/�������������0�����7�������������������� ��������������0�����7�������������������� ����������������/�������/����� 7��� �������/��7��� �������/��� ���8����0����1����� ���8����0����1����
���������������� ��������/��� ���/���������� ���������������� ��������/��� ���/�����������%�%��
���/4$$HHH����!�1���7�$�,M�$�%$����������$�/����N������0���$��/��$��
���������� ������=�������=�,�����,�����())@>�C.@4�@CB())@>�C.@4�@CB!!@+��/7����@+��/7����� 7��0����� 7��0���� ��������������%���������������%�
18
���� �-�"�,������ �-�"�,��������������������
������������������������������������������������������������� ��!����� ���������� ���������� ��!����� ���������� ��9�� ��9�� ��8���8�� � ��������� �������� ����<������/��������<������/����
�������� ����� �������� ����� 44
��O�3���������������/������O�3���������������/�������� /����������������3������ /����������������3�����13�����������13����������,��������,������������1������������ ��������1������������ ��������/����������/��7�����������/����������/��7����� ��2/���������2/�������
���/4$$HHH���������/���������7�$��3$/�����������$/�����/���/�/
19
20
�$(3(2%���(� �����2��������$(3(2%���(� �����2�������%����%������������ ��������� �
������������������������!������������������ ��!������������������ �� ������� 0�������������� 0������� ��&A�8���&A�8����������������� ���P1���������������������P1������������������
�/�<�������%=����7���������/��7� ������� � �/��������/�<�������%=����7���������/��7� ������� � �/���������:���������:��������� ������ ���� ���������� ����������� ��� ���������������/ ��7�0��������������������������/ ��7�0������������ 0������������� �������� 0������������� �������
� �����������/���������������������/�<�� � �����������/���������������������/�<�� � ����/���<�� � ����/���<�� ��������������/������������������/������������������ !�� �������������� ������!�� �������������� ������ !����������-�!����������-���������������������� ���������������������������������� �������������
������0��������� ��/����������0��������� ��/������������������������������� ���������������������������� ��9�� ��������� �����9�� ��������� ���� ����/������������/������������/������������/��������
21
*������� �������� ������ ��������*������� �������� ������ ��������������������������������
����/�����0�������������G<����������/�����0�������������G<������ �����������������������������7����/�����������������7����/����������������������������������7� 07� 0
"������ "������
�1��� ��������1��� ������� /7��7������������������?*=�?-=�/7��7������������������?*=�?-=�;/<;/<
%1��������%1�������� /7��7������������������*.=�/7��7������������������*.=�;/<;/<=�*.@=�*.@
'��7���2���'��7���2��� /7��/�����������������@C.=�@C+=�?@)/7��/�����������������@C.=�@C+=�?@)
�//���������4�//���������4
������������������������������������������������������������7���7� ��������������/���/� /� �������������� �����/� �������������� ������� ��/�� ��/���'���O�����������'���O��������
22
)������������ ��� ��� �����$(3(2%�)������������ ��� ��� �����$(3(2%�
@
%��������� ������ =���������� ���/��7�����������<���/7��7�������7����/�����
*4����0�������������������/��������3�����>�.��;.4��(#�� ������ ���7�������&A�>;6>6?6@4�� �����/�����7���/�������!*)B>�8�-�;@4��������������7����/����/� ��� ��������������
;///�� <A/��
*� ;�������>����?�����@�����.�����* 8�����7�����<�����A�����;/���;;���;>���;?���;@����;.��*
23
��� ��������"%B�)�.!���"���$�C?! ��� ��������"%B�)�.!���"���$�C?!
�?!����$���"C.! �?!����$���"C.!
;///��
.//��
..;��
<A/���
??A��
%������ ������ 4���������������������������� ���P1�������������������,6�M
,��������������7����������-))/3�������(�7��������?+?/3����C(?/3���,�����/����/���� ���P1����,6!M�����0������/� ���������/����������� ���1/���������� �����G%!*)B���*4����0������������������"��QMR�>�;4�������2$*�>A�����������!*)B�>�>4�������?�7��������'��!*)B�>�?4��(#4�� ������ ���7>�@�-�;/4��2��/��������������� ��7����/����/� ��� �������������>�<A/��4��������� ���/����� ������ � >�..;�����??A��4������������/��������������������
;��������>��������?�������* @��������.�������8�������7�������<���������A������;/������*
24
��� ���������� �������5 �5 �66)) �.!C"$���,�C?! �.!C"$���,�C?!
�?!C��"$�$,C.! �?!C��"$�$,C.!
%������ ������ 4�/�������������������������� ���P1���������������������!M
,��������������7�������� ��&A����-))/3�������(�7���������C(?/3����?+?/3��,�����/����/���� ���P1������!M����0������/� ����������/�������������������/���������%!*)B��*4����0���������������>;.4�2$*>A�����������!*)B�>�;84�?�7�������'��!*)B�>�;�-�.���� � ���� ���1/� /7��7�����!!*)B>�8'7'<';> ���� � ���� ���1/����2���/7��7����/������!*)B����� ����!*)B>�
;//��
<//��
??A��
..;��
<A/��
* ;������>������?�����@������.������8������7������<�����A���� ;/����;;���;>���;?����;@����;.�����;8���*
25
��� ����������� ��������+���+���66)) �.!C$$�,��C?! �.!C$$�,��C?!
�?!C��,�$$C.! �?!C��,�$$C.!
%������ ������ 4�/�������������������������� ���P1���'��7!M�
,��������������7�������� ��&A����B-)/3�������(�7���������CC-/3����??*/3���,�����/����/��� ���P1���'��7!M ����0������/� ����������/��������������������� �������%%!*)B��*4����0���������������>;74����������� �������� ����!*)B>�;�-�;84��2��/���������������������7����/����/� ��� �������������>�<A/��4��������� ���/����� ������ � >�..;�����??A��4�������������/�������������������������������������!*)B�� ��� � �� ���� �
<//�� <A/��
??A��
..;��
*��;���>����?���@���.���8���7���<���A��;/�;;�;>�;?�;@��;.�;8�;7�*
;//��