1
BiologistChemSketch/Satit P. 1
การใช ChemSketch V8สําหรับ biologists
โดย อ. สาธิต ปยนลินมาศ ภาควิชาเคมีอุตสาหกรรมคณะวิทยาศาสตร มหาวิทยาลัยเชียงใหม
วันท่ี 13 ธ.ค. 2549 เวลา 10.00-12.00 น.
BiologistChemSketch/Satit P. 2
ContentHow to install ChemSketch V8
วาดรูปสูตรโครงสรางทางเคมีสูตรโครงสรางโมเลกุลที่ซับซอนDrawing of scientific apparatusWriting of chemical reactionMolecular modelling in biological studies
End of lecture, Q&A , 問題
2
BiologistChemSketch/Satit P. 3
1.How to install ChemSketch V8
หลังจาก install โปรแกรมนี้ครบแลว ChemSketch ไดทันที ซ่ึงมี 2 commands หลักคือ structure mode และ draw mode อีกทั้งใชระบบ GUI (graphic user interface)
Tutorial manual:CHEMSK_TR.pdf (Technical Reference)Reference manual : CHEMSK_RF.pdf (Reference Manual)
BiologistChemSketch/Satit P. 4
FAQ in ChemSketch
สรางและเก็บ file = MS wordCopy Paste, Group, Delete Transcient error ใช Undo Embeded in MS word and PowerpointAfter finishing to pdf fileEdit and add are easier than before.
3
BiologistChemSketch/Satit P. 5
Structure mode in ChemSketch8
BiologistChemSketch/Satit P. 6
Draw mode in ChemSketch8
4
BiologistChemSketch/Satit P. 7
2. วาดรปูสูตรโครงสรางทางเคมี
O
O
O
O
O
O
H
H
H
H
H
H HH
H
H
H
H
D-Glucose structure
BiologistChemSketch/Satit P. 8
Structure mode/ template
5
BiologistChemSketch/Satit P. 9
molecular modelling in 3D
BiologistChemSketch/Satit P. 10
3D viewer in ChemSketch8
6
BiologistChemSketch/Satit P. 11
Embeded in MS word
BiologistChemSketch/Satit P. 12
ผลลัพธทีไ่ด
OO
O
O
O
OH
H
H
H
H
HH
H
H
H
H
H
Molecular Formula = C6H12O6
Formula Weight = 180.15588Composition = C(40.00%) H(6.71%) O(53.29%)Molar Refractivity = 37.54 ± 0.3 cm3
Molar Volume = 113.9 ± 3.0 cm3
Parachor = 352.9 ± 4.0 cm3
Index of Refraction = 1.573 ± 0.02Surface Tension = 92.0 ± 3.0 dyne/cmDensity = 1.581 ± 0.06 g/cm3
Dielectric Constant = Not availablePolarizability = 14.88 ± 0.5 10-24cm3
Monoisotopic Mass = 180.063388 DaNominal Mass = 180 DaAverage Mass = 180.157761 Da
ทําไดแลวงายจัง
7
BiologistChemSketch/Satit P. 13
3. สูตรโครงสรางโมเลกุลที่ซับซอน
Fused rings structure
O
SH
O
NH2N
NH
OH
Histidine
BiologistChemSketch/Satit P. 14
Template + Bond connection
8
BiologistChemSketch/Satit P. 15
Rotate + Template of radicals
BiologistChemSketch/Satit P. 16
Add side group from periodic table(-SH, =O)
9
BiologistChemSketch/Satit P. 17
Stepforward
ลองทําตามไดไหมครับสุดทายเปลี่ยน –OH to =O
O
NH2
N
NH
OH
OH
O
NH2
N
NH
OH
SH
O
O
N H 2
N
N H
OH
SH
BiologistChemSketch/Satit P. 18
4. Drawing scientific apparatus
Extraction for product purification
10
BiologistChemSketch/Satit P. 19
Lab Kit in Template window
เลือกเครื่องมือที่ตองการใชงานมีทั้งหมด 7 page in Lab kit only
BiologistChemSketch/Satit P. 20
5. Writing of chemical reaction for academic document
CH3Decomposition
2500C+ CH3
CH3
11
BiologistChemSketch/Satit P. 21
Chemical reactionเขียนสารตั้งตนเขียนผลิตภัณฑที่ไดเขียนสมการเคมี และสภาวะดวยลูกศร
BiologistChemSketch/Satit P. 22
6. Molecules modelling in biological studies
N
NH
NH
N
NH2
OGuanine
CH2
OH
CH3
CH3
CH3CH3
H
H
Vitamin D2
12
BiologistChemSketch/Satit P. 23
DNA building block unit
NO
OH
OP
O
OH
OH
N
NN
NH2
NO
OH
OP
O
OH
OH
NH
O
O
CH3
Adenine Thymine
BiologistChemSketch/Satit P. 24
RNA building block unit
NH
NH
N
NH
O
O
Xanthine
OHOO
OH
PO
OHOH
OHO
OP
2-Deoxyriboso-5-diphosphate
13
BiologistChemSketch/Satit P. 25
Referencesสาธิต ปยนลนิมาศ,“การใชงานChemSketch ของนักศึกษาเคมีอุตสาหกรรม ระดับบัณฑิตศึกษา,” ภาควิชาเคมีอุตสาหกรรม คณะวิทยาศาสตร ม.เชียงใหม, 29 พ.ย.2549.สาธิต ปยนลนิมาศ,“การใชChemSketch Lab 209342Petrochemical Industries,”ภาควิชาเคมีอุตสาหกรรม คณะวิทยาศาสตร ม.เชียงใหม, 2549.สาธิต ปยนลนิมาศ,“เทคโนโลยีตัวเรงปฏิกิริยาสําหรับเคมีที่พิทักษสิ่งแวดลอม,”LAB.Today ฉบับที3่5 ปที่ 2549Satit Phiyanalinmat, and Stoyan Karakashev,“The Spreading of Fire-fighting Foam in a Confined Chamber by Digital Image Visualization,” Chiang Mai J. Sci. 2006:33(3):283-291.
BiologistChemSketch/Satit P. 26
End of lecture/ ChemSketch V8
Questions + Answers
ChemSketch8 may change your writing and academic life becomes easier than before.Thank you for your attention.