Diego Canalejo Collado
Francisco Corzana López y Gonzalo Jiménez Osés
Facultad de Ciencias, Estudios Agroalimentarios e Informática
Grado en Química
2014-2015
Título
Director/es
Facultad
Titulación
Departamento
TRABAJO FIN DE GRADO
Curso Académico
Análisis conformacional de un glicopéptido en estado libre mediante dinámica molecular
Autor/es
© El autor© Universidad de La Rioja, Servicio de Publicaciones, 2015
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Análisis conformacional de un glicopéptido en estado libre mediante dinámica molecular, trabajo fin de grado
de Diego Canalejo Collado, dirigido por Francisco Corzana López y Gonzalo Jiménez Osés (publicado por la Universidad de La Rioja), se difunde bajo una Licencia
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αα
a la conformación de lámina β
–
–
mol=loadpdb “nombre del archivo de la molécula”.pdb
Lógicamente, si sólo se utiliza una “caja” de moléculas de agua, aquellas moléculas próximas a
“ ”
saveAmberParm mol “nombre”.tpp “nombre”.xyz
/home/usuario/amber12/bin/pmemd.cuda –O –i min1.in –o min_vacio1.out –p archivo.tpp –c / / / /archivo.xyz –r archivo.rst
–
–
χ