Download - Cluster Analisis NTSYS Jorge Jue 28
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Manual de NTSYSManual de NTSYSy análisis de taxonomía numéricay análisis de taxonomía numérica
Jorge NúñezJorge NúñezEditado por Daniel AndradeEditado por Daniel Andrade
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Matriz de datos Matriz de datos y su conversión al formato NTSYSy su conversión al formato NTSYS
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Datos (Score) en Microsoft ExcelDatos (Score) en Microsoft Excel
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Grabar como Microsoft Excel 4.0 WorksheetGrabar como Microsoft Excel 4.0 Worksheet
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Colocar los parametros de la matrizColocar los parametros de la matriz
Tipo de matrizTipo de matriz
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Colocar los parametros de la matrizColocar los parametros de la matriz
150
mar
cado
res
150
mar
cado
res
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Colocar los parametros de la matrizColocar los parametros de la matriz
128 entradas128 entradas
Grabar y cerrarGrabar y cerrar
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Abrir el NTeditAbrir el NTedit
Importar el archivo excelImportar el archivo excel
SeleccionarSeleccionary abriry abrir
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Matriz abiertaMatriz abierta
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Guardar matrizGuardar matriz
Grabar como archivoGrabar como archivoNTSYSNTSYS
Nombrar el archivoNombrar el archivoy grabary grabar
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Análisis de SimilitudAnálisis de Similitud
Abrir el programaAbrir el programaNTSYSNTSYS
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Ingresar a SimQualIngresar a SimQual
Seleccionar Seleccionar la ventana “similarity”la ventana “similarity”
Ingresar Ingresar a “SimQual”a “SimQual”
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Ingresar el archivo de datos“Click”“Click”
Ingresar el archivo de datos
Seleccionar el archivo Seleccionar el archivo y abriry abrir
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Seleccionar el índice de similitudSeleccionar el índice de similitud
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Nombrar el archivo de salidaNombrar el archivo de salida
“Click”“Click”
DICE archivo.NTSDICE archivo.NTS
Nombrar el archivo Nombrar el archivo y grabary grabar
SM archivo.NTSSM archivo.NTSJAC archivo.NTSJAC archivo.NTS
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OperarOperar
“Click”“Click”
ReporteReporte
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Análisis de AgrupamientoAnálisis de Agrupamiento
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Ingresar a SAHNIngresar a SAHN
Seleccionar Seleccionar la ventana “Clustering”la ventana “Clustering”
Ingresar Ingresar a “SAHN”a “SAHN”
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Ingresar el archivo de datosIngresar el archivo de datos
“Click”“Click”
Seleccionar el archivo Seleccionar el archivo y abriry abrir
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Nombrar el archivo de salidaNombrar el archivo de salida
“Click”“Click”
Nombrar el archivo Nombrar el archivo y grabary grabar
NJ DICE archivo.NTSNJ DICE archivo.NTSUPGMA DICE archivo.NTSUPGMA DICE archivo.NTS
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Seleccionar el método de agrupamientoSeleccionar el método de agrupamiento
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Seleccione o no “Find” Seleccione o no “Find” para obtener los resultados de los empatespara obtener los resultados de los empates
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Indique el número de resultados que desea obtenerIndique el número de resultados que desea obtenery operary operar
Indique elIndique elNumero de resultadosNumero de resultados“Click”“Click”
ReporteReporte
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Obtención del DendogramaObtención del Dendograma
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Ingresar a GraphicsIngresar a Graphics
Seleccionar Seleccionar la ventana “Grafics”la ventana “Grafics”
Ingresar Ingresar a “Tree plot”a “Tree plot”
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Selección del archivoSelección del archivo
“Click”“Click”
Seleccionar el archivo Seleccionar el archivo y abriry abrir
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OperarOperar
“Click”“Click”
ReporteReporte
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El DendogramaEl Dendograma
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Edición del DendogramaEdición del Dendograma
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Abrir “Plot Options...”Abrir “Plot Options...”
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“Titles”, “labels” y “lines”“Titles”, “labels” y “lines”
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OTUs por pagina (cont...)OTUs por pagina (cont...)
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OTUs por pagina (cont...)OTUs por pagina (cont...)
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128 Solanum phureja150 alelos marcadores SSR
Coefficient0.43 0.58 0.72 0.86 1.00
703800 703812 703767 703278 701570 702287 705328 705812 705811 704208 705253 705314 706023 703508 705803 703545 705498 705438 705378 705299 703507 705269 705809 704060 701025 703587 706166 703596 703547 705262
El eje “x”El eje “x”
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128 Solanum phureja150 alelos marcadores SSR
Coefficient0.43 0.58 0.72 0.86 1.00
703800 703812 703767 703278 701570 702287 705328 705812 705811 704208 705253 705314 706023 703508 705803 703545 705498 705438 705378 705299 703507 705269 705809 704060 701025 703587 706166 703596 703547 705262
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Análisis CofenéticoAnálisis Cofenético
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Ingresar a CophIngresar a Coph
Ingresar Ingresar a “Coph”a “Coph”
Seleccionar Seleccionar la ventana “Clustering”la ventana “Clustering”
![Page 38: Cluster Analisis NTSYS Jorge Jue 28](https://reader030.vdocuments.net/reader030/viewer/2022020101/54398789afaf9fb62e8b5093/html5/thumbnails/38.jpg)
Ingresar el archivo obtenido en el analisis de agrupamientoIngresar el archivo obtenido en el analisis de agrupamiento
“Click”“Click”
Seleccionar el archivo Seleccionar el archivo y abriry abrir
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Nombrar el archivo de salidaNombrar el archivo de salida
“Click”“Click”
Nombrar el archivo Nombrar el archivo y grabary grabar
Coph NJ DICE archivo.NTSCoph NJ DICE archivo.NTSCoph UPGMA DICE archivo.NTSCoph UPGMA DICE archivo.NTS
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OperarOperar
“Click”“Click”
ReporteReporte
![Page 41: Cluster Analisis NTSYS Jorge Jue 28](https://reader030.vdocuments.net/reader030/viewer/2022020101/54398789afaf9fb62e8b5093/html5/thumbnails/41.jpg)
Matriz cofenéticaMatriz cofenética
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Correlación entre dos matricesCorrelación entre dos matrices
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Ingresar a MxCompIngresar a MxComp
Seleccionar Seleccionar la ventana “graphics”la ventana “graphics”
Ingresar Ingresar a “MxComp”a “MxComp”
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Ingresar el primer archivo de la matriz de similitud Ingresar el primer archivo de la matriz de similitud
“Click”“Click”
AbrirAbrirSeleccionar el archivo ySeleccionar el archivo y
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Ingresar el segundo archivo de la matriz de similitud Ingresar el segundo archivo de la matriz de similitud
“Click”“Click”
AbrirAbrirSeleccionar el archivo ySeleccionar el archivo y
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OperarOperar
“Click”“Click”
ReporteReporte
r = 0.87r = 0.87
LevelLevel InterpretationInterpretation
0.9 0.9 ≤≤ rr Muy buenaMuy buena
0.8 0.8 ≤≤ r < 0.9r < 0.9 BuenaBuena
0.7 0.7 ≤≤ r < 0.8r < 0.8 PobrePobre
r < 0.7r < 0.7 Muy pobreMuy pobre
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Gráfico de la correlaciónGráfico de la correlación
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Gracias!Gracias!