LOGO
Servei de MicrobiologiaHospital de la Santa Creu i Sant Pau
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
au
Nombre i percentatge de tractament empíric inapropiat en la primera dosi i l'adaptació posterior a les 24 hores
Lueangarun S and Leelarasamee A. Interdisciplinary Perspectives on Infectious Diseases 2012 ,
Cont, Continuació de la teràpia antimicrobiana empírica.
Adapt, l'adaptació de la teràpia antimicrobiana empírica.
Tractament empíric inapropiat
La mortalitat en bacterièmia/sèpsia segons tractament empíric adequat o no
Ulldemolins M. Crit Care Clin 2011; 27: 35–51
•Gravetat de la infecció•Síndrome infecciosa / Focus d’infecció•Optimització del diagnòstic
microbiològic•Probabilitat de participació de
microorganismes resistents
Considerar:
Antibioteràpia empírica
Rellevància dels estudis de sensibilitat
NºSoques
Resistència en tants per cent
PEN CTX ERY CLI LEV VAN RIF TET
Estreptococ betahemolític Grup A(Streptococcus pyogenes) 41 0 0 9,8 9,8 0 0 0 17,1
Estreptococ betahemolític Grup B(Streptococcus agalactiae) 66 0 0 27,3 18,2 4,5 0 0 72,3
Estreptococ betahemolític. Altres grups1 15 0 0 40 33,3 0 0 0 26,7
Estreptococ grup viridans 235 21,3 8,9 41,3 18,7 6,8 0 1,3 23,4
Situacions on es fàcil predir la sensibilitat i per tant el tractament empíric
NºSoques
Resistència en tants per cent
AMP AMC CTX AZT1 IMP ERT GEN COT CIP NIT FOS
E. coli 2561 67,2 19,1 11,8 11,8 0 0,04 11,7 35,7 39,3 5 2
K. pneumoniae 494 100 22,3 15,4 15,4 0,6 1 6,3 16,8 19,8 39,1 8,5
K. oxytoca 86 100 10,5 10,5 10,5 1,2 2,3 0 1,2 4,7 3,5 7
P. mirabilis 269 49,4 10 6,7 6,7 0,7 0 17,1 41,6 40,1 100 24,5
Quin és el nivell acceptat per considerar que és un bon tractament empíric?
Rellevància dels estudis de sensibilitat
Tècniques moleculars (PCR)
EspecíficaÚnica/múltiple
vsUniversal
Convencionalvs
Temps real
Qualitativavs
Quantitativa
Quina metodologia usar- Mínima manipulació - No experiència- Ràpid (>2h) - Unitari
Microorganisme
Streptococcus pyogenes
Streptococcus pneumoniae
Legionella pneumophila
Haemophilus influenzae
Tècniques ràpides de diagnòstic de les infeccions respiratòries
FAMÍLIA SUBFAMÍLIA GÈNERE VIRUS
Orthomyxoviridae
Influenzavirus A
Influenzavirus B
Influenzavirus C
virus gripal A (FLUAV)
virus gripal B (FLUBV)
virus gripal C (FLUCV)
Paramyxoviridae ParamyxovirinaeRespirovirus
Rubulavirus
virus parainfluença (1,3) (PIV‐1, PIV‐3)
virus parainfluença (2,4) (PIV‐2, PIV‐4)
PneumovirinaePneumovirus
Metapneumovirus
virus respiratori sincicial (RSV)
metapneumovirus (HMPV)
PicornaviridaeEnterovirus
Rhinovirus
enterovirus (HEV)
rinovirus (HRV)
Coronaviridae Coronavirus coronavirus (HCoV)
Parvoviridae Parvovirinae Bocavirus bocavirus (HBoV)
Adenoviridae Mastadenovirus adenovirus (AdV)
MúltiplexDianes específiques
http://www.seimc.org/documentos/protocolos/microbiologia
MúltiplexDianes específiques
CLART Kit ® Pneumovir (GENOMICA SAU)
Seeplex ® kit de detecció RV12 ACE (Seegene)
FilmArray® respiratory panel (Idaho Technology)
Tècniques ràpides de diagnòstic de les infeccions respiratòries
The GeneXpert® (Cepheid)
BD Max (Jaguar; Becton, Dickinson and Co./HandyLab, Inc.).
The Verigene SP (Nanosphere, Inc., IL, USA)
xTAG® Respiratory Viral Panel (RVP) Products
MúltiplexDianes específiques
Tècniques ràpides de diagnòstic de les infeccions respiratòries
Conclusions
BM permeten la detecció de més virus que els mètodes
convencionals.
•Els resultats varien en funció de la població estudiada.
•Calen més estudis sobre la interpretació clínica dels resultats.
• infeccions múltiples
Plantegen qüestions
relatives a la significació clínica dels
virus detectats.
PCR Consideracions
Enterovirus Si En femta suggestiu
EBV Si Possibles falsos +
HHV-1, -2 Si PCR gold standard
VZV Si
Arbovirus No Serologia
Virus de la ràbia Si/no Serologia / PCR saliva o LCR
S. pneumoniae, H. influenzae, N. meningitidis
Si/No Gram i Cultiu
Bartonella Si/No Serologia. PCR del nódul linfàtic
MTB Si/No Mostres respiratòries pos. sónsuggestives
Ehrlichia/Anaplasma Si PCR de sang. En LCR menys sensible
Rickettsia ricketsii Si/No Serologia. PCR de la biòpsia cutània
Causes de meningoencefalitis MúltiplexDianes específiques
PCR Consideracions
Enterovirus Si En femta suggestiu
EBV Si Possibles falsos +
HHV-1, -2 Si PCR gold standard
VZV Si
Arbovirus No Serologia
Virus de la ràbia Si/no Serologia / PCR saliva o LCR
S. pneumoniae, H. influenzae, N. meningitidis
Si/No Gram i Cultiu
Bartonella Si/No Serologia. PCR del nódul linfàtic
MTB Si/No Mostres respiratòries pos. sónsuggestives
Ehrlichia/Anaplasma Si PCR de sang. En LCR menys sensible
Rickettsia ricketsii Si/No Serologia. PCR de la biòpsia cutània
MultiplexDianes especifiques
Causes de meningoencefalitis
PCR Consideracions
Enterovirus Si En femta suggestiu
EBV Si Possibles falsos +
HHV-1, -2 Si PCR gold standard
VZV Si
Arbovirus No Serologia
Virus de la ràbia Si/no Serologia / PCR saliva o LCR
S. pneumoniae, H. influenzae, N. meningitidis
Si/No Gram i Cultiu
Bartonella Si/No Serologia. PCR del nódul linfàtic
MTB Si/No Mostres respiratòries pos. sónsuggestives
Ehrlichia/Anaplasma Si PCR de sang. En LCR menys sensible
Rickettsia ricketsii Si/No Serologia. PCR de la biòpsia cutània
MultiplexDianes especifiques
Causes de meningoencefalitis
Diagnòstic de les meningitis víriques
Enterovirus i virus de la familia herpes
Múltiplex / SimpleDianes específiques
Esparcia, O. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 2011;69:153.
Diana universal
Diagnòstic de les meningitis bacterianes
Meningitis bacteriana(nº=108)
Sèpsia neonatal(nº=83)
PBE(nº=55)
Cultiu Molecular Cultiu Molecular Cultiu Molecular
Sensibilitat 78.1 90.6 70.0 60.0 80.6 45.2
Especificitat 100 100 100 100 100 100
VPP 100 100 100 100 100 100
VPN 36.4 57.1 96.1 94.8 80.0 58.5
CCD (%)* 80.6 91.7 96.4 95.2 89.1 69.1
Resum sensibilitat, especificitat, VPP, VPN y CCD
Diagnòstic de les meningitis bacterianes
Esparcia, O. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 2011;69:153.
Detecció de la resistència en M. tuberculosis
Importància de la tuberculosi multiresistent.Tècniques convencionals (4-6 setmanes).
Rifampicina: 81 pb rpoB
Boehme CC, et al. N Engl J Med 2010;363:1005-1015
Mecanismes de resistència β-lactàmics
Permeabilitat.
Sistemes d’expulsió activa.
Alteració de la diana.
Presència d'enzims inactivants.
BLEA
209
173 142
TEM-1AMP
CXM
CTX
CAZ
AMC
CF
FEP
AMC IMI
PTZ
CIP
NALCEPPIP
AZT
SHV-1 CTX-M-9
AMP
CXM
CTX
CAZ
AMC
CF
FEP
AMC IMI
PTZ
CIP
NALCEPPIP
AZT
TEM-12
1 mutació
AMP
CXM
CTX
CAZ
AMC
CF
FEP PTZ
CIP
NALCEPPIP
AMC IMIAZT
SHV-2
1 mutació
TEM-30
Mecanismes de resistència β-lactàmics
OXA-1
OXA-24
AMP
CXM
CTX
CAZ
AMC
CF
FEP
AMC IMI
PTZ
CIP
NALCEPPIP
AZT
Amp-C
AltresMecanismes de resistència β-lactàmics
• TEM-1/SHV-1 BLEAIRT.
Fenotips diferents de resistència poden ser deguts a mutacions
puntuals:
• TEM-1 i SHV-1, SHV-16 i CTX-M-13.Fenotips iguals deguts a gens
diferents.
• TEM, SHV, CTX-M, OXA, KPC, NDM, IMP, VIM... Nombroses famílies de gens:
Nombrosos subgrups dins de les famílies amb fenotips iguals i
diferents.
Alteracions de gens reguladors.
Mecanismes de resistència β-lactàmics
Consideracions vàries / Conclusions
IDbox System from GenturaDx
QIAsymphony RGQ from Qiagen
3M Integrated Cycler from Focus Diagnostics
Verigene® System from Nanosphere
PLEX-ID from Abbott
FilmArray. Idaho