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Níveis de organização das proteínas
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Configuraçao em trans de seus átomos de H e O – mais estável
A configuração cis é desfavorável em virtude do impedimento estérico entre os
grupos R
Y- (psi ) – ângulo de rotação entre o Cα e o C
ø (fi) – ângulo de rotação entre o Cα e N
Ângulos de rotação da cadeia polipeptítica em torno de um carbono alfa
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Região permitida – vermelho
Região adicionalmente permitida -
amarelo
Região generosamente permitida –
beje
Região proibida – branco
O programa usou dados de 118
proteinas para definir as regiões
permitidaas e proibidas do diagrama
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Estrutura em α- hélice
Raio X
Filme
fotográfico
O filamento de aminoácidos enrola-se
ao redor de um eixo, formando uma
escada helicoidal chamada alfa-
hélice.
o enovelamento é estabilizado por
pontes de hidrogênio entre átomos das
ligações peptídicas de qualquer
aminoácido, exceto prolina;
as cadeias laterais dos
aminoácidos voltam-se para fora da
hélice.
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Estrutura β
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antiparalela
Paralela, torção à direita
Paralela, torção à esquerda
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tipo 1 tipo 2
hélice-dobra-hélice “Zinc-finger”
Alças e voltas
Notar ligação de
hidrogênio entre os
grupos peptídicos do 1º
e 4º resíduo.
É comum encontrar Pro
e Gly nestas estruturas
Dobra b
Ligação com íons
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Beta-alfa-beta Só beta Só alfa
Barril beta Barril alfa-beta
Estruturas supersecundárias ou motivos
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Hélices e fitas β podem ser combinadas de várias maneiras
Estrutura Terciária
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Subunidade
(uma cadeia polipeptídica)
Proteína
(biológicamente ativa; dímero não covalente )
Estrutura quaternária
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Dobramento e estabilidade de Proteínas
FORÇAS NÃO COVALENTES
Pontes de H
-Aminoácidos polares
Ligações iônicas
- Aminoácidos carregados
Interações hidrofóbicas
-Aminoácidos apolares
Forças de Van der Waals
-Qualquer aminoácido
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Desnaturação - Renaturação
A sequência dos aminoácidos (não alterada na desnaturação) é o que determina a
estrutura 3D das proteínas – Experimentos de Christian Anfinsen com RNAse A.
• Condições diferentes das celulares
levam as proteínas à desnaturação
• Perda da estrutura pode levar
também à perda da função
• Calor, pHs extremos, temperatura (?),
solventes orgânicos, detergentes