Transduction; résistance aux antibiotiques médiée
par des phages• Rarement décrit
• Résistance à la méthicilline chez Staphylococcus spp.
• Résistance à l ’érythromycine chez S. epidermidis
• Multirésistance chez E. coli; géne de porine mutée
TransformationTransformation• 44 bacterial species 44 bacterial species including;including;– StreptococcusStreptococcus– EnterococcusEnterococcus– StaphylococcusStaphylococcus– EnterobacteriaceaeEnterobacteriaceae– PseudomonasPseudomonas– AcinetobacterAcinetobacter– HaemophilusHaemophilus– NeisseriaNeisseria
S. pneumoniae de sensibilité diminuée
à la Péni G en France (CNRP)
0,5 0,7 14 5
7
12
1720
25
3236
43
4852 53
48
0
10
20
30
40
50
60
19841985 19861987 198819891990 19911992 19931994 19951996 1997 2001 20022003
n = 44 470 souches
CNRP E. Varon, L. GutmannCNRP P. Geslin
Pneumocoque S Streptocoques R
Pneumocoque R Pneumocoque R
Pneumocoque S
Séquençage des gènes PLP souche R = Structure en mosaïque:
Alternance séquences conservées et séquences divergeant des souches S résultant d’échanges d’ADN entre pneumocoque et streptocoques Péni R, par transformation.
chromosomechromosome
BactérieBactériesensiblesensible
plasmideplasmide
BactérieBactérierésistanterésistante
plasmideplasmide
2 bactéries résistantes2 bactéries résistantes
plasmideplasmide plasmideplasmide
Transfert de plasmideTransfert de plasmide
PLASMIDESPLASMIDES
Biochemical mechanisms of Biochemical mechanisms of antibiotic resistance and antibiotic resistance and their genetic determinantstheir genetic determinants
++
TransposonTransposon
Resistance genesResistance genes
. Aminoglycosides. Aminoglycosides • • ChloramphenicolChloramphenicol. . -lactams-lactams . . GlycopeptidesGlycopeptides• • TrimethoprimTrimethoprim • Sulfamides• Sulfamides. Macrolides. Macrolides. Cyclines. Cyclines. Rifampicin. Rifampicin
Bacterial speciesBacterial species: Gram (+), Gram (-): Gram (+), Gram (-)
TnTnTn
Tn
P1
P2
Chr
Les systèmes de capture de gènes:
les intégronsintI1
attI
sul1qacE∆
resistance gene cassette (R gene)
integrase
Int
3'- conserved segment
attC
P ant
antP
attIintI1 sul1qacE∆R gene attC
intI1intI1
5'CS5'CS 3'CS3'CS
intI1intI1
5'CS5'CS 3'CS3'CS
gene cassette gene cassette
((PP22))PPantant
Integron Integron
ATB 1 ATB 1 ATB2ATB2SulSul
SulSul
qacqacEE
qacqacEE
.... as a source of cross-resistance
Integron Integron Species Enterobacteriaceae
P. aeruginosa, P. putida, P. cepaciaAcinetobacter sp., Alcaligenes spp.Campylobacter spp. ; Shewanella sp.Vibrio cholerae, Vibrio spp.Corynebacterium glutamium,C. striatum, C. casei, C.ammoniagenes Staphylococcus spp,Aerococcus, Brevibacterium
Antibiotic resistance -lactamsAminoglycosidesChloramphenicolErythromycinRifampicinTr imethoprimSulfamidesAntiseptics
Sp Sa Sa
Shewanella algae; Shewanella algae; le réservoirle réservoir de gènes de type de gènes de type qnrAqnrA
QuickTime™ et undécompresseur TIFF (non compressé)
sont requis pour visionner cette image.
QuickTime™ et undécompresseur TIFF (non compressé)
sont requis pour visionner cette image.
QuickTime™ et undécompresseur TIFF (non compressé)
sont requis pour visionner cette image.
Poirel, Rodriguez-Martinez, Mammeri, Nordmannn AAC 2005