dzialuk zmienność i struktura genetyczna drzew iglastych w ... · 11 loci w 2 reakcjach...
TRANSCRIPT
ZmiennoZmiennośćść i struktura genetyczna i struktura genetyczna drzew iglastych w Polscedrzew iglastych w Polsce
dr Artur Dzialukdr Artur Dzialuk
Katedra GenetykiKatedra GenetykiInstytut Biologii EksperymentalnejInstytut Biologii Eksperymentalnej
ZasiZasięęg wystg wystęępowania powania sosny zwyczajnejsosny zwyczajnej
ZasiZasięęg wystg wystęępowania i schemat powania i schemat zbioru sosny zwyczajnej w Polscezbioru sosny zwyczajnej w Polsce
MikrosatelityMikrosatelity jjąądrowe (drowe (nSSRnSSR))
11 11 lociloci w 2 reakcjach multipleks PCRw 2 reakcjach multipleks PCR
Sosna Sosna --mikrosatelitymikrosatelity jjąądrowedrowe
PrawdopodobiePrawdopodobieńństwo identycznostwo identycznośścici
PID = 0.0000000000000000018PID = 0.0000000000000000018
PID = 0.00000000000000018%PID = 0.00000000000000018%
SiSiłła dyskryminacjia dyskryminacji
PD = 99.999999999999999982PD = 99.999999999999999982
PD = 99.9999999999999982%PD = 99.9999999999999982%
ZasiZasięęg wystg wystęępowania powania śświerka pospolitegowierka pospolitego
ZasiZasięęg wystg wystęępowania i schemat powania i schemat zbioru zbioru śświerka pospolitego w wierka pospolitego w PolscePolsce
MikrosatelityMikrosatelity jjąądrowe (drowe (nSSRnSSR))
12 loci w 2 reakcjach multiplexmultiplex PCR
ŚŚwierk wierk -- mikrosatelitymikrosatelity jjąądrowedrowe
PrawdopodobiePrawdopodobieńństwo identycznostwo identycznośścici
PID = 0.0000000000000000000062PID = 0.0000000000000000000062
PID = 0.00000000000000000062%PID = 0.00000000000000000062%
SiSiłła dyskryminacjia dyskryminacji
PD = 99.9999999999999999999938PD = 99.9999999999999999999938
PD = 99.99999999999999999938%PD = 99.99999999999999999938%
ZasiZasięęg wystg wystęępowania powania jodjodłły pospolitejy pospolitej
ZasiZasięęg wystg wystęępowania i schemat powania i schemat zbioru jodzbioru jodłły pospolitej w Polscey pospolitej w Polsce
14 14 lociloci w 2 reakcjach w 2 reakcjach multiplexmultiplex PCRPCR
MikrosatelityMikrosatelity jjąądrowe (drowe (nSSRnSSR))
jodjodłła a -- mikrosatelitymikrosatelity jjąądrowedrowe
PrawdopodobiePrawdopodobieńństwo identycznostwo identycznośścici
PID = 0.00000000000000000255PID = 0.00000000000000000255
PID = 0.000000000000000255%PID = 0.000000000000000255%
SiSiłła dyskryminacjia dyskryminacji
PD = 99.99999999999999999745PD = 99.99999999999999999745
PD = 99.999999999999999745%PD = 99.999999999999999745%
ZasiZasięęg wystg wystęępowania powania modrzewia europejskiegomodrzewia europejskiego
ZasiZasięęg wystg wystęępowania i schemat powania i schemat zbioru modrzewia europejskiego w zbioru modrzewia europejskiego w PolscePolsce
15 15 lociloci w 3 reakcjach w 3 reakcjach multiplexmultiplex PCRPCR
MikrosatelityMikrosatelity jjąądrowe (drowe (nSSRnSSR))
modrzew modrzew -- mikrosatelitymikrosatelity jjąądrowe drowe
PrawdopodobiePrawdopodobieńństwo identycznostwo identycznośścici
PID = 0.0000000000000000000000776PID = 0.0000000000000000000000776
PID = 0.00000000000000000000776%PID = 0.00000000000000000000776%
SiSiłła dyskryminacjia dyskryminacji
PD = 99.9999999999999999999999224PD = 99.9999999999999999999999224
PD = 99.99999999999999999999224%PD = 99.99999999999999999999224%
WsobnoWsobnośćśćistotna statystycznieistotna statystyczniesosna zwyczajna f=sosna zwyczajna f=
śświerk pospolity f=wierk pospolity f=
jodjodłła pospolita f=a pospolita f=
modrzew europejski f=modrzew europejski f=
Nie można zaniedbać istnienia wsobności w obliczeniach prawdopodobieństwa zgodności.Nie można zaniedbać istnienia wsobności w obliczeniach prawdopodobieństwa zgodności.
Struktura genetyczna Struktura genetyczna ––osobniki nie sosobniki nie sąą rozmieszczone losoworozmieszczone losowo
Nie można zaniedbać istnienia tej struktury w obliczeniach prawdopodobieństwa zgodności.Nie można zaniedbać istnienia tej struktury w obliczeniach prawdopodobieństwa zgodności.
PrawdopodobiePrawdopodobieńństwo identycznostwo identycznośści dla badanych gatunkci dla badanych gatunkóów drzew lew drzew leśśnych nych ww porporóównaniuwnaniu do zestawu stosowanego powszechnie w genetyce sdo zestawu stosowanego powszechnie w genetyce sąądowej dowej do do genotypowaniagenotypowania czczłłowiekaowieka
Gatunek Liczba loci PID Człowiek – zestaw PowerPlex®16 (Promega)
Caucasian-Americans 16 1 : 1.83 × 1017 African-Americans 16 1 : 1.41 × 1018 Sosna zwyczajna 11 1 : 5.51 × 1017 Świerk pospolity 12 1 : 1.61 × 1020 Jodła pospolita 14 1 : 3.92 × 1017 Modrzew europejski 15 1 : 1.29 × 1022
Prawdopodobieństwo porównywalne z wartościami uzyskiwanymi w analizach człowieka !!!Prawdopodobieństwo porównywalne z wartościami uzyskiwanymi w analizach człowieka !!!