epidémiologie moléculaire

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EPIDEMIOLOGIE MOLECULAIRE DU PALUDISME Ex : suivi de la chloroquino-resistance Valérie ANDRIANTSOANIRINA Atelier Paludisme -IPM- EVALUATION par les FACILITATEURS

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Epidémiologie moléculaire - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Valérie ANDRIANTSOANIRINA - Etudiant/Chercheur - Institut Pasteur de Madagascar - [email protected]

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Page 1: Epidémiologie moléculaire

EPIDEMIOLOGIE MOLECULAIRE DU

PALUDISME

Ex : suivi de la chloroquino-resistance

Valérie ANDRIANTSOANIRINA Atelier Paludisme -IPM-

EVALUATION

par les FACILITATEURS

Page 2: Epidémiologie moléculaire

PLANPLAN

• avant la biologie moléculaire• avec la biologie moléculaire• exemple: suivi de la résistance à la chloroquine

(pfcrt)• avantages et limites • conclusion

Page 3: Epidémiologie moléculaire

Définition : étude de la répartition et des déterminants des évènements de santé dans les populations

Définition du sujet : Surveillance par méthode moléculaire des phénomènes épidémiologiques dont principalement l’apparition des résistances aux médicaments

INTRODUCTIONINTRODUCTION

Page 4: Epidémiologie moléculaire

Avantages : pas d’extrapolation sur autres espèces et expériences en labo

Inconvénients : • contraintes éthiques imposées par expérimentation humaine• Protocole lourd

– temps– argent

• Comparaison inter études (standardisation)

In vivo : essai direct sur l’hommeIn vitro : culture cellulaire

Epidémiologie avant la biologie Epidémiologie avant la biologie moléculairemoléculaire

Page 5: Epidémiologie moléculaire

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suivi de la chloroquinosuivi de la chloroquino--resistance resistance dans le mondedans le monde

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OMSOMS

Page 6: Epidémiologie moléculaire

Définition : mettre en relation les données recueillies avec la recherche des causes d’une

maladie sur le plan moléculaire

« Mutant = résistant »suivi d’une résistance� suivi mutation associée à une résistance.

Epidémiologie avec la biologie moléculaire

Page 7: Epidémiologie moléculaire

Suivi de résistance à la CQ (Pfcrt T76)

Marqueur moléculaire Pfcrt 76 : substitution de la : substitution de la Lysine K à la position 76 (K76) en thréonine T Lysine K à la position 76 (K76) en thréonine T (Chromosome 7) (Chromosome 7)

�� PrPréésents chez les isolats rsents chez les isolats réésistants et non chez sistants et non chez les sensiblesles sensibles

DjimdDjimdéé et al., 2001 : association entre le et al., 2001 : association entre le PfcrtPfcrt T76 T76 et det dééveloppement de rveloppement de réésistance sistance àà la CQ pendant le la CQ pendant le traitement.traitement.

(Djimdé et al., 2001)

Page 8: Epidémiologie moléculaire

Djimdé et al., 2001Djimdé et al., 2001

��SSéélection pour la T76 in vivolection pour la T76 in vivo

��AprAprèès traitement seuls les mutants rs traitement seuls les mutants réésistentsistent

Page 9: Epidémiologie moléculaire

Pourquoi ce choix ?Pourquoi ce choix ?

• déterminant essentiel de la résistance à la chloroquine Djimdé, 2001; Fidock et al., 2001

• Djimdé et al., 2001 : association entre le Pfcrt T76 et développement de résistance à la CQ pendant le traitement.

• outil de surveillance à la résistance à la chloroquine

Page 10: Epidémiologie moléculaire

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e la CQ

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Page 11: Epidémiologie moléculaire

Exemple 2: Madagascar

• Mutation pfcrt K76T par PCR/RFLP : grande première à Madagascar.

• 3,3% : 6/183 sur isolats de Plasmodium falciparumétudiés

• Génotypage du pfcrt est un outil utile pour la surveillance de la résistance à la CQ

Randrianarivelojosia et al., 2006Randrianarivelojosia et al., 2006

Page 12: Epidémiologie moléculaire

Intérêts et limites

• Intérêts :+ , �-������ �������������� ������� ������(�������

+ . ������ �������� ����(��������� �������������)

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Limites:Limites:00 *����

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Page 13: Epidémiologie moléculaire

Djimdé et al., 2001Djimdé et al., 2001

Exemple 2 : suivi de résistance à Mali

1424 patients, 1997-1999, la prévalence de pfcrt T76 est mesurée et comparée avec la parasite

Page 14: Epidémiologie moléculaire

• L’approche d’épidémiologie moléculaire : perspectives d’interventions stratégiques ciblant des facteurs de virulence du parasite

• Connaissance mutation � connaissance résistance� changement de lutte

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Conclusion et perspectives

Page 15: Epidémiologie moléculaire

Références• Greenwood B. The molecular epidemiology of malaria. Tropical Medicine

and International Health, 2000 volume 7 (12); 1012–1021.• Djimdé A et al. A molecular marker of chloroquine-resistant falciparum

malaria. N Engl J Med, Vol. 344 (4) January 25, 2001.• Djimdé et al. Application of a molecular marker for surveillance of

chloroquine-resistant falciparum malaria. The lancet, Vol. 358 (9285); 890-891, 2001.

• Abel. Apport de l’épidémiologie génétique pour l’étude de la susceptibilité/résistance au paludisme dans les populations humaines, Paris 1999.

• Schulte A. A conceptual and historical framework for molecularepidemiology. In : Schulte A.P et Perera P.F. Molecular epidemiology : principles and practices. London: academic press, 1993; 4-19

• Randrianarivelojosia et al. First evidence of pfcrt mutant Plasmodiumfalciparum in Madagascar. Trans R Soc Trop Med H, 2006

Page 16: Epidémiologie moléculaire

• Détection de la résistance aux médicaments

• Détection de la résistance à l’insecticide

• Différenciation entre rechute et réinfection• Cytokines, TNF…

• Analyse de l’origine du repas de sang

• Recherche de marqueurs génétiques de virulence• HLA cl I et II

• Etude de la corrélation génétique entre populations

de moustiques

• Etude de la multiplicité de l’infection• Malformation des GR

• Différenciation d’espèces et sous-espèces• Détection d’infections mixtes• Hémoglobinopathies

VecteurParasiteHôte

Applications de la biologie moléculaire à l’épidémiologie