âESKÁ SPOLEâNOST PROBIOCHEMII A MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII

ROâN Í K 3 9 ( 2 0 1 1 ) , â Í S LO 1

ISSN 1211-25261

Prosíme, zašlete svou POUŽÍVANOU

e-mailovou adresu na

registrace@csbmb.cz

Making connections in bio logical.

Your Favorite Gene powered by Ingenuity has:

A biologically relevant literature search tied to PubMed• Biological pathways and molecular interaction networks of all known interactors with • your gene of interest

The ability for you to click the line between molecules to see the manually annotated • connections between them

New gene regulations viewers• Much more comprehensive data from across the Web•

Research your disease or gene in YFG simply by searching on:

Save time searching biological information. Find products in the context of your research.

Gene Name • Gene Symbol• Disease • Homologs• Biological Functions • Biological Pathways• Metabolic Pathways •

Tissues• Cellular Components• Entrez Gene Name• Gene ID• Accession Number • RefSeq Number • TRC Number•

Best of all, YFG is FREE to use. Save time nd more information today at

wherebiobegins.com/yfg

Sigma-Aldrich spol. s r.o. Česká republika Tel.: +420 246 003 200 Fax: +420 246 003 291www.sigmaaldrich.com Slovensko Tel.: +421 02/555 71 562 Fax: +421 02/555 71 564

yourfavoritegene

BULLETINČ E S K É S P O L E Č N O S T I P R OB I O C H E M I I A M O L E K U L Á R N Í B I O L O G I I

http://www.csbmb.cz

MICHAELA WIMMEROVÁ - VÝKONNÝ REDAKTOR

Přírodovědecká fakulta MU, BrnoÚstav biochemie a Národní centrum pro výzkum biomolekul<michaw@chemi.muni.cz>

MAREK ŠEBELA - ZÁSTUPCE VÝKONNÉHO REDAKTORA

Přírodovědecká fakulta UP Olomouc, Katedra biochemie<marek.sebela@upol.cz>

IRENA KRUMLOVÁ

Česká společnost pro biochemii a molekulární biologii, Kladenská 48,160 00 Praha 6, tel.: 604 861 827

nebo ÚOCHB AV ČR, v.v.i., 166 10 Praha 6, Flemingovo nám. 2tel.: 220 183 205, e-mail <irena.krumlova@csbmb.cz>

Příspěvky zpracované v textovém procesoru Word, zasílejte e-mailem do sekretariátu společnosti.Prosíme, abyste do textu nevkládali ani obrázky, ani tabulky. Připojte je v originále, případněve zvláštních souborech, v textu označte, prosím, jen jejich umístění.

Adresa ČSBMB: Kladenská 48, 160 00 Praha 6tel.: 220 183 205

ISSN 1211-2526

http://www.csbmb.cz

http://www.csbmb.czhttp://www.csbmb.czhttp://www.csbmb.czhttp://www.csbmb.czhttp://www.csbmb.czhttp://www.csbmb.czhttp://www.csbmb.czhttp://www.csbmb.czhttp://www.csbmb.cz

O B S A H

ZPRÁVY SPOLEČNOSTI

Zpráva o činnosti České společnosti pro biochemiia molekulární biologii v roce 2010 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4M. Šebela: Profesor Pavel Peč sedmdesátiletý. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5

PŘEDSTAVUJEME PEDAGOGICKÁ A VĚDECKO-VÝZKUMNÁBIOCHEMICKÁ PRACOVIŠTĚ

Národní centrum pro výzkum biomolekul, Přírodovědecká fakulta,Masarykova univerzita, Brno . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7

RŮZNÉ

R. Černý: 200 let existence Karolinska Institutu ve Stockholmu . . . . . . . . . . . . . 14M. Šebela: Objevitel vitamínu B1. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18I. Králíček: Podzimní škola pro učitele . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20XV. setkání biochemiků a molekulárních biologů . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21The EMBO meeting 2011 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 225th Central and Eastern European Proteomic Conference (5th CEEPC) . . . . . . 23LABOREXPO 2011 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24Biotech 2011 & 5th Czech-Swiss Symposium with Exhibition. . . . . . . . . . . . . . . . 27

ZP R Á V Y S P O L E Č N O S T I

4 ■ Bulletin 1

ZPRÁVA O ČINNOS T I ČESKÉ SPOLEČNOS T I

PRO BIOCHEMI I A MOLEKULÁRNÍ B IOLOGI I

V ROCE 2010

Česká biochemie a molekulární biologie se i nadále úspěšně rozvíjí. Tak jako v minulostibyla činnost české společnosti pro biochemii molekulární biologii úzce propojena s činnostíNárodního komitétu pro biochemii a molekulární biologii.

Rok 2010 byl především poznamenán organizací XXII. Biochemického sjezdu v Martiněve dnech 8. – 12. 9. Sjezdu se celkem zúčastnilo 240 vědeckých pracovníků a studentů.Z ČR jich bylo 60, ze Slovenska pak 178. Bylo uděleno 29 cestovních grantů. Zaznělocelkem 76 přednášek a vyvěšeno bylo 124 plakátových sdělení. Doprovodné výstavy sezúčastnilo 25 firem.

Z dalších akcí české biochemie v roce 2010 uvádíme:

„Pokroky v protetice“ , Praha, ÚMG AV ČR, 30. 3.

„XIV. setkání mladých biochemiků a molekulárních biologů“, Brno, 20. – 21. 4.

„Konference mladých 2010, Devět skal, 25. – 28. 5./ ve spolupráci s ČSCHa firmou Sigma Aldrich

„Letní škola proteinového inženýrství“ Brno, 5. – 8. 9.

„Neformální proteomické setkání“, Liblice, 9. – 10. 11.

podzimní škola pro středoškolské učitele biologie a chemie“, Praha, ÚOCHB AV ČR,25. – 29. 10.

Mezinárodní akce 2010:

2nd European Chemical Biology Symposium“, Praha, 20. 5. – 21. 5.

35th FEBS Congress, Götheborg, 26. – 1. 7.

12th IUBMB Congress, Melbourne, 26. 9. – 1. 10.

The EMBO Meeting 2010, Barcelona, 4. – 7. 9.

ČSBMB v loňském roce vypsala dvě soutěže pro mladé vědce a členy ČSBMB. A to CenuJ. V. Koštíře (podpořena firmou BioTech, a.s.) a Cenu A. Beckmana (podpořena firmouBeckman Coulter ČR).

ČSBMB je členem FEBS a IUBMB. Společnosti byl udělen grant MŠMT v programu INGOpro účast zástupců společnosti v mezinárodních biochemických a molekulárně biologickýchkomisích a pracovních skupinách (FEBS, IUBMB). Projekty ČSBMB jsou podporoványi Radou vědeckých společností.

ČSBMB vydává potvrzení o členství v národní společnosti těm členům, kteří žádajío stipendia FEBS, IUBMB či EMBO a udílí cestovní granty.

Zapsala: Irena Krumlová – tajemnice ČSBMB

Bulletin 1 ■ 5

Dne 5. dubna 2011 se dožívá význam-ného životního jubilea známý český bioche-mik, prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Čistokrev-ný Hanák tělem i duší se narodil v roce 1941v obci Ptenský Dvorek nedaleko Konicev okrese Prostějov. Po absolvování jedenác-tileté střední školy v Prostějově studovalučitelství v oborech matematika a chemie,které absolvoval na Přírodovědecké fakultěUniverzity Palackého v Olomouci (PřF UP)v roce 1962. Jen na okraj, UniverzitaPalackého v Olomouci zahájila svoji činnostv roce 1946 jako pokračovatelka tradicestředověké olomoucké univerzity a Františ-kovy univerzity z 19. století. V roce 1953vznikla v Olomouci po reformě učitelskéhovzdělávání Vysoká škola pedagogická (VŠP)s fakultami přírodních věd a společenskýchvěd; na první z nich byla zřízena chemickákatedra. V roce 1958 splynula VŠP s UPa vznikla tak mimo jiné i PřF UP. Od roku1960 pokračovala Katedra chemie jakoKatedra anorganické chemie a metodikychemie, jejímž vedoucím byl prof. MečislavKuraš, a Katedra organické, analytickéa fyzikální chemie, jejímž vedoucím bylprof. Eduard Růžička.

Prof. Peč se stal na ústavu prof. Rů-žičky v roce 1964 odborným asistentem.Od 70. let se používal název Katedra analy-tické a organické chemie (KAOCH), kterýplatil až do roku 1996. Prof. Peč byl dlou-holetým vedoucím KAOCH až do roku1990. Katedra se profilovala jako vědecko-vzdělávací pracoviště, kromě výuky se podí-lela na řešení státních i rezortních výzkum-ných úkolů. Prof. Peč zde rozvíjel výuku bio-chemie v rámci odborného studia analytickéchemie. Jeho přednáška Základy bioche-mie, na kterou navazovalo laboratorní cvi-čení, úspěšně pokračuje do dnešních dnů

a tradičně se setkává s velkým zájmemu studentů chemických a biologických obo-rů včetně učitelských kombinací s chemiía biologií. Od 70. let profesor Peč vědeckyspolupracoval s prof. Lumírem Macholánemz Katedry biochemie Přírodovědecké fakultytehdejší Univerzity Jana Evangelisty Purkyněv Brně (nyní Masarykova univerzita).Systematicky se zabýval především substrá-ty a inhibitory rostlinných enzymů. V roce1975 získal titul CSc. na Přírodovědeckéfakultě Univerzity Komenského v Bratislavě.Absolvoval zahraniční stáže v Anglii (Facultyof Medicine, University of Manchester;1977, 1979) a Dánsku (Panum Institut,Kodaň; 1982). Na počátku 90. let se jehoklíčové vědecké práce věnovaly předevšímreakčně závislým inhibitorům („sebevra-žedné substráty“), tedy látkám, jejichž enzy-mová přeměna vede k reaktivním mezipro-duktům a končí inaktivací příslušného enzy-mu. V té době byl vedoucím Odděleníorganické chemie a biochemie KAOCHa začal realizovat svoji vizi samostatnéhobiochemického pracoviště. V roce 1996 seprof. Peč stal zakladatelem Katedry bioche-mie PřF UP a do roku 2006, tedy rovnýchdeset let, zastával funkci prvního vedoucího

PROFESOR PAVEL PEČ SEDMDESÁT ILETÝ

*5. dubna 1941

6 ■ Bulletin 1

katedry. V roce 1997 byl na Masarykově uni-verzitě jmenován profesorem pro obor bio-chemie. V této souvislosti je nutné připome-nout spolupráci s biochemiky prof. JanemKášem a prof. Pavlem Rauchem z Fakultypotravinářské a biochemické technologieVysoké školy chemicko-technologickév Praze a doc. Petrem Zbořilem z Přírodo-vědecké fakulty Masarykovy univerzity.Vzdělávací projekt TEMPUS financovanýEvropskou unií a koordinovaný prof. Kášem,na jehož řešení ostatní jmenovaní včetněprof. Peče podíleli, umožnil vznikajícíolomoucké biochemické katedře získatnezbytné přístrojové vybavení, materiálovoupodporu a stabilizoval lidské zdroje.

Prof. Peč položil základy vědeckéhosměřování na katedře, především v oblastibiochemie rostlinných enzymů, odkud sepostupně rozvinul současný vědecký pro-gram, jehož záběr sice vychází z tradičnírostlinné biochemie, avšak těžiště se přesu-nulo k proteinovému a genovému inže-nýrství, strukturní biologii a proteomice.Na konci 90. let přišel s myšlenkou reali-zace odborného studia biochemie na PřFUP. V roce 2000 získala katedra akreditaciMinisterstva školství, mládeže a tělovýchovy(MŠMT) pro výuku bakalářského a navazu-

jícího magisterského studijního programubiochemie, od roku 2006 může přijímat stu-denty i k postgraduálnímu studiu, garantujehabilitační řízení i jmenovací profesorskářízení v oboru biochemie. Pan profesor ne-únavně pokračuje ve svém vědecko-pedago-gickém působení na katedře. Je garantemodborných přednášek (Základy biochemie,Obecný metabolismu, Metabolické regu-lace) a seminářů, v nedávné době řešenímprojektu Inovace studia biochemie pro-střednictvím e-learningu v rámci činnostiEvropského sociálního fondu v Českérepublice vytvořil elektronické materiálypro výuku biochemie (dostupné onlinena http://ibiochemie.upol.cz). Za dlouhoudobu svého působení na UP vedl desítkydiplomových prací a vychoval řadu dokto-randů, přispěl k úspěšným habilitacími profesurám mnoha kolegů z oboru.Katedra biochemie PřF UP již od svéhovzniku získává a řeší grantové projektyMŠMT, Grantové agentury České republiky,Grantové agentury AV ČR, ale i dalšíchtuzemských či zahraničních poskytovatelů.V současné době jde o stabilní ústav, kterýmá perspektivu pokračování ve své činnostia ve svém poslání. Vize prof. Peče z 90. lettak došla svého naplnění.

Vážený pane profesore,

jménem Katedry biochemie Přírodovědecké fakulty UP, jménem Výboru České společ-nosti pro biochemii a molekulární biologii a jménem svým Vám přeji vše nejlepšík významnému životnímu jubileu, do dalšího profesního i rodinného života především hodnězdraví, pohody, spokojenosti, optimismu a dobré nálady.

Marek Šebelavedoucí Katedry biochemie PřF UP

Zpracováno s použitím vzpomínek a osobního archivu prof. RNDr. Pavla Peče, CSc.

Bulletin 1 ■ 7

PŘ E D S T A V U J E M E BIOCHEMICKÁ PRACOVIŠTĚ

NÁRODNÍ CENTRUM PRO VÝZKUM BIOMOLEKUL ,PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA,

MASARYKOVA UNIVERZ ITA , BRNO

ředitel ústavu: Prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.

zástupce ředitele: Prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.

Web: http://ncbr.chemi.muni.cz

Národní centrum pro výzkum biomolekul(NCBR) je nezávislý ústav v rámci Příro-dovědecké fakulty Masarykovy univerzityv Brně. NCBR vzniklo na počátku novéhotisíciletí jako pracoviště zaměřené na ná-ročné metody studia biologicky zajímavýchmolekul na úrovni struktury s atomovým roz-lišením. Od roku 2011 je výzkumná činnostNCBR propojena s výzkumem ve stře-doevropském technologickém institutuCEITEC (www.ceitec.cz).

Vědecké projekty jsou zaměřeny na stu-dium biologicky zajímavých molekul, zejmé-na proteinů, nukleových kyselin a sacharidůa jejich vzájemných interakcí. Hlavní akti-vity zahrnují výzkum v oblasti výpočetnícha teoretických metod, molekulového mode-lování, NMR spektroskopie, glykobioche-mie a proteinového inženýrství lektinů.

Jednotlivé výzkumné projekty se zabývajístudiem molekulárního rozpoznávání a inte-rakcí mezi hostitelem a patogenem, mecha-nismů regulace kvality RNA, opravnýchmechanismů DNA, studiem enzymu choline-sterasy ve vztahu k nervovým chorobáma ochraně proti chemickým zbraníma dalšími aktuálními tématy.

V centru působí 8 výzkumných skupin,ve kterých pracuje přibližně 30 výzkumnýchpracovníků a postdoktorandů a kolem60 studentů doktorského studia.

Centrum je dobře vybaveno modernílaboratorní instrumentací pro stanovení struk-tury biomolekul (NMR spektroskopie, protei-nová krystalografie), termodynamická a kine-tická měření a nanobiotechnologie. Vybavenípro experimentální studie doplňuje silné vý-početní zázemí pro teoretické studie.

8 ■ Bulletin 1

NCBR se významně podílí na vzdělá-vání studentů bakalářského, magisterskéhoa doktorského studia. V rámci centra jsouakreditovány studijní obory Chemoinfor-matika a bioinformatika (bakalářský, magis-terský v akreditačním řízení), Strukturníchemie (magisterský) a Biomolekulární che-mie (magisterský a doktorský). Studentivšech stupňů studia jsou zapojeni do vý-zkumných projektů pod vedením postdokto-randů a zaměstnanců ústavu.

STUDIJNÍ OBORY

Chemoinformatika a Bioinformatika(bakalářské studium)

Bakalářský studijní obor Chemoinfor-matika a bioinformatika připravuje vysoko-školsky vzdělané odborníky, kteří mají pře-hled o základních oblastech chemie, jakoje biochemie, anorganická chemie, orga-nická chemie, analytická chemie a fyzikálníchemie, a biologie. Navíc rozšiřuje jejichznalosti v oblasti uchování a vyhledáváníchemických a biologických informací.

Biomolekulární chemie(magisterské studium)

Magisterský studijní obor Biomole-kulární chemie připravuje vysokoškolskyvzdělané odborníky, kteří mají přehledo všech oblastech chemie a hlubší znalostbiochemie. Zvýšená pozornost je věnovánastruktuře biologicky významných molekul.Studium je zaměřeno na metody výpočetníchemie a molekulového modelování, struk-turní analýzy pomocí technik rentgenovédifrakce a nukleární magnetické rezonance,

biologicky zajímavé databáze a biologickéaplikace poznatků o struktuře a funkcimolekul.

Strukturní chemie(magisterské studium)

Magisterský studijní obor Strukturníchemie připravuje vysokoškolsky vzdělanéodborníky, kteří mají dobré znalosti pokro-čilých strukturních metod, kterými jsoupředevším nukleární magnetická rezo-nance a rentgenová difrakce v kombinacis molekulovým modelováním a metodamikvantové mechaniky. Důraz je kladenna experimentální a teoretické metody, kteréposkytují informace o struktuře molekulna atomární úrovni. Významnou součástívzdělávání je práce s databázovými systémya internetovými aplikacemi.

Biomolekulární chemie(doktorské studium)

Cílem doktorského studijního progra-mu Biomolekulární chemie je připravitšpičkové odborníky, kteří budou nejenspecialisty s detailní znalostí určité techniky,ale také tvůrčími pracovníky s širokýmrozhledem v oblasti strukturní biologiea s dobrými teoretickými základy. Absolventoboru získá hluboké znalosti a praktickédovednosti z jednoho či více odvětví, kteréprogram Biomolekulární chemie zahrnuje,tedy výpočetní chemie a metody molekulo-vého modelování, metody strukturní analýzypomocí rentgenové difrakce a nukleárnímagnetické rezonance, metody molekulárníbiologie a mikrobiologie, bioinformatika.

Výuka studentů probíhá v moderně vybavené počítačové laboratoři.

Bulletin 1 ■ 9

Přístrojové vybavení pracoviště:• 600 MHz NMR spectrometr Bruker

AVANCE• 500 MHz NMR spectrometr Bruker

AVANCE III• 300 MHz NMR spectrometr Bruker

AVANCE• Přístroj pro měření rezonance povrcho-

vého plasmonu – Biacore3000• Isotermální titrační mikrokalorimetry

VP-ITC a ITC200• Diferenční skenovací kalorimetr

VP-DSC• Analytická ultracentrifuga ProteomLab

XL1• Krystalizační robot Mosquito• Automatický dokumentační

a vizualizační systém pro vyhodno-cování krystaličních experimentůRigaku Desktop Minstrel UV + Hotel160

• Optický stereoskop Leica s CCDkamerou

• Automatický pipetovací robot TecanEvo 150

• Automatický zaočkovávač koloniíColony picker PM-1s

• několik purifikačních zařízeníAKTApurifier a AKTAfplc

• Mikroskop atomových sil Liquid phaseAFM Ntegra

• CD spektrofotometr Jasco J-815

Přístrojové vybavení pro ITC (isothermal titrationcalorimetry).

Přístrojové vybavení pro SPR (surface plasmonresonance).

Krystalizační robot Mosquito.

Počítačové vybavení:• Výpočetní cluster – 320 processor

cores (Xeon E5620, 2.4 GHz)• Výpočetní cluster – 72 processor

cores (Opteron 8431, 2.4 GHz,3x99GB RAM)

• Výpočetní cluster – 72 processorcores (Opteron 2218, 2,66 GHz)

• 3D vizualizační vybavení• Přístup k Akademickému výpočetnímu

centru (METAcenter)

Softwarové vybavení:• Quantum chemistry programs

(Gaussian, Gamess, Mopac, Spartan,deMON, CPMD)

• Molecular mechanics and dynamicsprograms (Amber, X-PLOR, PME-MD)

• Molecular visualization packages(WHAT IF, VMD, ICM, GRASP,RasMol, gOpenMol, MOLMOL,Gromacs, Spartan, Chimera, MidasPlus, MOIL-View, CCP4, Pymol, SPDBviewer, MolScript)

• Docking software (AutoDock, DOCK,ICM)

• Protein modelling tools (MODELLER,GRID, DelPhi, Promotif)

• "In-House" software for protein engine-ering, potential energy (hyper)surfacesand flexibility analysis (TRITON,CICADA, EEM and ABEEM solver,MOLE, MULDER, PANIC, DRIVER,COMBINE, ANALYSE, VADER,ECSTASY, AIDA, PEGAS)

VÝZKUMNÉ SKUPINY NCBR

Laboratoř výpočetní chemieProf. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.

Laboratoř se věnuje využití metod počí-tačové chemie a molekulového modelovánípro studium proteinů, nukleových kyselin,

sacharidů a dalších molekul nacházejícíchse v živých organismech. Užívány jsouzejména kvantově-chemické metody, mo-lekulová dynamika, metody pro výpočetvolných energií a protein-ligand docking.

Mezi zkoumané proteiny patří restrikčníendonukleáza HincII, kde je cílem zejménaobjasnit roli kationtů v aktivním místěa interakce s nukleovou kyselinou. Dalšímstudovaným proteinem je enzym acetylcholi-nesteráza a jeho reaktivátory. Intenzivněstudovány jsou také lektiny. Tyto proteiny sevyskytují na povrchu patogenních bakteriía významným způsobem se podílejí na jejichvirulenci. Ovlivnění vazebných schopnostílektinů je tak nadějnou možností jak snížit vi-rulenci a tedy nebezpečnost těchto bakterií.

Grafické rozhraní programu TRITON. Programslouží pro vizualizaci dat z výpočetních programů.

Struktura komplexu restriktivní endonukleázyHincII s molekulou DNA.

Struktura acetylcholinesterázy (1N5M).

10 ■ Bulletin 1

Významná část výzkumu je také sou-středěna na vývoj vědeckého softwaru.Na pracovišti byl vyvinut program CICADApro konformační prohledávání molekul.Programy EEM solver a ABEEM solverslouží pro výpočet nábojů na atomech.Grafický software TRITON byl vyvinutpro účely vizualizace výpočetních dat.Program MOLE je určen pro vyhledávánípřístupových tunelů do aktivních centerenzymů.

Laboratoř struktury a dynamikynukleových kyselinDoc. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.

Laboratoř provádí teoretické (výpo-četní) studium struktury, dynamiky a mo-lekuláních interakcí DNA, RNA a jejichkomplexů s léčivy a proteiny. V této oblastivýzkumu patří mezi přadní světová praco-viště, jak potvrzují publikace, které na pra-covišti vznikají, a jejich ohlasy.

Stěžejním předmětem zájmu je struk-tura a funkce katalyticky aktivních ribo-nukleových kyselin, zejména ribosomu.K pochopení role katalytických RNA a je-jich interakcí s proteiny jsou používánypokročilé přístupy kombinující kvantovouchemii s molekulovou mechanikou a jinémoderní metody výpočetní chemie a bio-informatiky.

Laboratoř nukleární magnetickérezonanceProf. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.

Zaměření laboratoře předurčuje vyba-vení laboratoře spektrometry pro NMRs vysokým rozlišením, nezbytným pro stu-dium bilogicky zajímavých makromolekul.

Hlavní zájem je soustředěn na struk-turní a konformační studium proteinů, nuk-leových kyselin a jejich komplexů. Dále jsoupomocí NMR studovány heterocyklickésloučeniny a přírodní látky v roztokui v pevné fázi. Experimentální zaměřenídoplňují teoretické výpočty využívající metodab initio.

Projekty řešené v laboratoři zahrnujíteoretické výpočty NMR parametrů (zej-ména kvantové výpočty tensorů chemickéhostínění pomocí teorie funkcionálu hustoty),vývoj nových NMR metod (přímá detekceuhlíku 13, metody pro studium oligonukleo-tidů, měření zbytkových dipolárních inte-rakcí), studium struktury a molekulovýchpohybů proteinů (jsou studovány virové pro-teasy, bakteriální RNA polymerasy, proteinyschopné vázat hmyzí a savčí feromony, do-mény buněčných receptorů) a nukleovýchkyselin, studium purinových derivátů (se za-měřením na přenos protonů a komple-xaci) a isochinolinových alkaloidů (ben-zo[c]fenantridiny, protoberberiny a dalšíalkaloidy rostlinných druhů Papaveraceae,Berberidaceae, Fumariaceae, a Rutaceae).

600 MHz NMR spektrometr Bruker AVANCE.

Obrázek vlevo znázorňuje strukturu ribozymu sezvýrazněným aktivním centrem. Vpravo je zobra-zen detail aktivního centra.

Bulletin 1 ■ 11

12 ■ Bulletin 1

Laboratoř glykobiochemieDoc. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.

Laboratoř glykobiochemie se věnujeproteinům zapojených do specifického roz-poznávání (lektiny) nebo syntézy sacharido-vých molekul (glykosyltransferasy) se zamě-řením především na proteiny z podmíněnýchmikroorganismů. Příkladem jsou lektinyz podmíněných bakterií jako Pseudomonasaeruginosa či Burkholderia cepacia komple-xu, které jsou odpovědné za většinu úmrtípacientů s cystickou fibrosou. Jiný směr jereprezentován glykosyltransferasami, klíčo-vými enzymy podílejícími se na výstavběneobvyklé a organizované buněčné stěnybakterie Mycobacterium tuberculosis, jež jeodpovědná za její vysokou odolnost vůčiběžným chemoterapeutikům.

Metodicky laboratoř pokrývá bioinfor-matické a molekulárně biologické přístupy,klonování a expresi rekombinantních pro-teinů v hostitelských organismech, studiumtermodynamiky a kinetiky biointerakcí po-mocí moderních metod (např. Isotermálnítitrační mikrokalorimetrie, Surface plasmonresonance či Enzyme-linked lectin assay)a řešení struktury komplexů pomocí rentge-nové difrakce.

Tato kombinace nástrojů nám umož-ňuje pochopit souvislosti mezi strukturoua funkcí a cestou mutageneze rozvíjet pro-teinové inženýrství lektinů pro jejich uplat-nění v bioanalytických a biofarmaceutickýchaplikacích.

Laboratoř rekombinace a oprav DNAMgr. Lumír Krejčí, Ph.D.

Laboratoř studuje mechanismy opravdvojvláknových zlomů, které představují nej-závažnější poškození DNA. Tyto zlomy jsouvyvolávány celou řadou příčin, zahrnujícíchgenotoxické chemické látky, ionizující zá-ření, replikaci poškozené DNA, nebo zhrou-cení replikační vidličky. Dvojvláknové zlomymohou být opraveny správně nebo chybně.Chybné opravy vedou k buněčné smrti,genové nestabilitě, vzniku rakoviny.Mechanismy oprav jsou v laboratoři studo-vány pomocí moderních biochemických,strukturních a výpočetních metod.

Laboratoř nanobiotechnologiíDoc. RNDr. Petr Skládal, CSc.

Laboratoř nanobiotechnologií je úzcespojena s výzkumem biosensorů na Ústavubiochemie. Je vybavena technikami AFM(atomic force microscopy) a SNOM (near-field scanning optical microscopy), pomocíkterých lze studovat biomolekuly, mikroby,nanočástice, biologicky modifikované po-vrchy, nanobiosensory a biointerakcena molekulové úrovni.

Krystalová struktura komplexu lektinu PA-IILa molekul fukózy.

Ukázka vybraných krystalů lektinů z patogenníchorganismů

Bulletin 1 ■ 13

Laboratoř interakcí proteinů a RNAMgr. Richard Štefl, PhD.

Laboratoř studuje mechanismy expresegenů a jejich regulace na úrovni ribonukleo-vých kyselin. Cílem je objasnit strukturnía mechanistické zákonitosti jednotlivýchkroků které probíhají při expresi genů, na-příklad ukončení transkripce a zpracováníRNA. Úplné pochopení těchto mechanismůmůže přispět nejen k pochopení exprese

genů, ale také k vývoji nových léčebnýchstrategií. K tomuto studiu jsou v laboratořipoužívány metody strukturní a molekulárníbiologie, zejména nukleární magnetickourezonanci.

Laboratoř procesování a degradaceRNAdoc. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D.

Zajištění produkce správných zralýchmolekul RNA je nutnou podmínkou pro fun-gování všech živých organismů. Poruchyv některých krocích úprav RNA napříkladvedou k závažným poruchám u člověka.Laboratoř se zabývá studiem molekulárníchmechanismů procesování různých typů RNAv eukaryotických buňkách. Dále zkoumáprincipy rozpoznávání vadných molekulRNA a jejich následné degradace. K tomutostudiu jsou v laboratoři používány nejnovějšímetody molekulární biologie, biochemie,kvasinkové genetiky a strukturní analýzy.

Přístroj AFM (atomic force microscope).

www.febs2011.itwww.febs2011.it

14 ■ Bulletin 1

200 LET EX IS TENCE KAROL INSKA INS T ITUTU

VE STOCKHOLMU

13. prosince 1810 podepsal švédskýkrál Karel XIII dekret o založení nové insti-tuce pro „vzdělávání kvalitních vojenskýchchirurgů“ dnes známý jako KarolinskaInstitutet (koncovka –et ve švédštině před-stavuje člen určitý). Důvody tohoto krokubyly komplexní. V roce 1810 průměrná délkaživota ve Švédsku byla 36 let, dětská úmrt-nost byla extrémní, Švédsko vedlo mnohéválky, poslední z nich byla s Ruskem o územíFinska, v níž v průměru jeden ze 3 zraně-ných vojáků zemřel. Všeobecně se tedypociťovala větší potřeba kvalifikovaných lé-kařů a stávající švédské univerzity v Uppsalea v Lundu nebyly schopny na tuto potřebureagovat. Přestože založení nové lékařskéakademie bylo silně motivováno potřebouválečných chirurgů, je třeba ovšem říci,že od založení Karolinska Institutu Švédskojiž žádnou válku nikdy nevedlo. Faktickýmizakladateli nové instituce byli 4 předníšvédští lékaři té doby – Anders JohanHagströmer, Carl Trafvenfelt, Jöns JakobBerzelius a David von Schulzenheim. Jezajímavé, že Berzelius, který je považovánza jednoho ze zakladatelů moderní chemiebyl původním vzděláním lékař a jeho přítom-nost mezi zakladateli této nové medicínskéinstituce minimálně symbolizuje významchemie a následně i biochemie v medicíně.

Plné jméno jubilující instituce se záhyustálilo na Kongliga Karolinska MedicoChirurgiska Institutet (Královský Karlůvlékařsko-chirurgický institut). Jde tedyo jakousi švédskou Karlovu lékařskou fa-kultu. V této souvislosti mohu s klidem pro-hlásit, že naše Univerzita Karlova se můžes větší pýchou ohlédnout za svým zakladate-lem Karlem IV, nežli je tomu ve Švédsku,pokud jde o osobu Karla XIII. Tehdy ve Švéd-sku šlo o soumrak královské dynastieHolstein-Gottorp. Karlův předchůdce na trů-

nu jeho synovec Gustav IV Adolf byl v r. 1809donucen k abdikaci s ohledem na výsledkysvé politiky (ztráta Finska a Pomořanska) a jižzestárlý strýc Karel XIII se ujal regentství.Vzhledem k tomu, že neměl legitimní potom-ky (nelegitimní potomci pro trůn nebyli uvažo-váni) byla jeho hlavní úlohou adopce vhodné-ho kandidáta na švédský trůn. Stal se jímJean Baptiste Bernadotte, Napoleonův mar-šál (vítěz od Ulmu, Slavkova i odjinud), kterýbyl původně Napoleonem pověřen přípravoutažení proti Skandinávii, což ale osud změnilna roli adoptivního syna Karla XIII a po jehosmrti nastoupil na švédský trůn jako Johan IV.Ironie osudu je v tom, že tento Francouzpůvodně prostého původu, který měl jakojakobínský revolucionář údajně na prsouvytetováno „Smrt králům!“, se sám pozdějistal králem a vlastně zachráncem královs-kého systému Švédska. Dynastie Bernadottevládne ve Švédsku dodnes a předáváNobelovy ceny.

Počátky Karolinska Institutu byly ovšemskromné. Sídlil v jediném domě (předtímkrálovská pekárna) v centru Stockholmuna ostrově Riddarholmen. (Pro ty čtenáře,kteří navštívili Stockholm uvádím, že sejedná o onen malý ostrov naproti stock-holmské radnici, který navazuje na staréměsto a na němž je kostel , charakteristickývysokou štíhlou věží s kovovou konstrukcíšpičky. V tomto kostele se nacházejí hrobkyšvédských panovníků od 16. století, pouzeslavný Gustav Vasa zde není, jeho hrobka jetotiž v katedrále v Uppsale). Již rok po zalo-žení získává tento institut licenci nejen na vý-chovu chirurgů, ale i lékařů. Od roku 1813se zde datuje výzkum a ten neprojektujenikdo jiný než Jöns Jakob Berzelius.Již v roce 1816 se Karolinska Institut stě-huje do větších prostor staré sklárny na NorrMälarstrand, poblíže dnešní stockholmské

RŮ Z N É

Now more than ever.

Beckman Coulter Česká republika, Radiová 1, 102 27 Praha 10

www.coulterfl ow.com

Gallios™ Flow Cytometer

MoFlo® Astrios™ Cell Sorter

MoFlo® XDP Cell Sorter

www.millipore.com/magpixwww.mecomm.cz

MAGPIX®Magnetická revolucev multiplexové analýzeDivize Merck Millipore společnosti Merck Česká republika představuje novinku

v multiplexové analýze – platformu Luminex® MAGPIX® a kity Milliplex® MAG

s magnetickou separací částic. Objevte kouzlo multiplexové analýzy – nyní v ještě

kompaktnějším designu a za dostupnější cenu.

Vaše výhody:

Jednoduchý pracovní postup založený na separaci magnetických mikročástic

Současně lze měřit až 50 analytů ve vzorku o objemu pouhých 25 μl

Kompaktní design šetří místo na Vašem pracovním stole

Cenově dostupnější varianta platformy Luminex®

Nejširší nabídka analytů na trhu (více než 25 Milliplex® MAG panelů)

Oblasti výzkumu – rakovina, metabolické poruchy, toxicita, neuroscience,

buněčná signalizace a další

Technická podpora

■ 10. května 2011 – Praha, IKEM Praha■ 11. května 2011 – Brno, Hotel International

Vážení přátelé,

dovolte nám, abychom vás pozvali na seminář firmy Roche věnovaný našim nejnovějšímproduktům a řešením pro oblast kvantitativní real-time PCR. Na semináři vystoupí následu-jící řečníci:

DDr. Michael Hoffmann (Global Marketing qPCR, Roche, Německo) – bude hovořit o real-timeqPCR systémech a designu qPCR reakcí pro detekci genové expreseDr. Franco Bertolucci (European Customer Support Center, Roche, Německo) – bude hovořit o kompletní automatizované izolační a qPCR lince s vysokým výkonemDr. Ofert Landt (TibMolBiol, Německo) – bude hovořit o detekci bodových mutací, provede srovnání různých typů sond a High Resolution Melting analýzy, včetně výhod a omezení jednotlivých metodikDr. Carsten Alsbo (Exiqon, Dánsko) – bude hovořit o detekci genové exprese mikroRNA pomocí real-time qPCR.Prezentace budou v anglickém jazyce.

Seminář je určen pro široký okruh zájemců o molekulární biologii a kvantitativní real-time PCR.V případě vašeho zájmu vás žádáme o registraci účasti na tomto semináři e-mailem na adrese: czech.appliedscience@roche.com. Registrace není závazná, slouží pro odhad počtuúčastníků. Děkujeme.

Podrobné informace o přesném času konání v Praze i Brně budou uvedeny ve druhém cirkuláři, nebo v odpovědi na registrační e-mail.

Roche s.r.o.

POZVÁNKA NA SEMINÁŘ– poznačte si do kalendáře

Bulletin 1 ■ 15

radnice (ta byla vystavěna ale až počátkem20. století) ve čtvrti Kungsholmen, kde insti-tuce působila dalších 50 let. V roce 1866pak byla stará budova stržena a byly po-stupně budovány budovy nové. Důležitý mo-ment byl rok 1875, kdy došlo k zrovnopráv-nění s univerzitami, tj. Karolinska Institutmohl také udělovat lékařské tituly, což do tédoby mohly jen univerzity.

Asi nejdůležitějším datem celé historieKarolinska Institutu je rok 1895, kdy jistýpodivín jménem Alfred Nobel, který vydělalobrovské peníze díky vynálezu a výrobědynamitu a který, když neuspěl v Paříži sesvým nápadem vybudovat zvláštní ulici, v nížby bylo pro kohokoliv možné spáchat asisto-vanou sebevraždu, ustanovil nakonec ve svézávěti, že 32 milionů švédských korun budeuloženo ve zvláštním fondu a z úroků sebudou každoročně vyplácet ceny za význam-né vědecké objevy. Jednou z těch cen jeNobelova cena za „fyziologii a lékařství“a o jejím udělení rozhoduje dle zmíněné zá-věti právě Karolinska Institut. Nobelovy cenyse začaly fakticky udělovat od r. 1901a Karolinska Institut se tak logicky dostalna výsluní zájmu o mezinárodní spolupráci.V současnosti Nobelovu cenu za fyziologiia lékařství („Nobelpriset i fysiologi eller medi-cin“) uděluje padesátičlenný výbor složenýz profesorů Karolinska Institutu. Vím, že žád-ný významný zahraniční vědec neodmítne po-zvání k návštěvě Karolinska Institutu v naději,že je o krok blíže pozornosti právě členůNobelova výboru. Dovedu si představit, žečlenové Nobelova výboru jsou intenzivnězváni na zahraniční pracoviště, kde jsou jimprokazovány různé pocty a možná i osobnívýhody. Jsem ale hluboce přesvědčen, ževlastní rozhodování o udělení Nobelovy cenyje vedeno výhradně na základě čistě vědec-kého přínosu kandidátů, protože jakékolivčachrování v tomto směru by vedlo okamžitěke ztrátě vědecké prestiže Nobelových cen,což se neděje. Je evidentní, že finančníčástka náležící k Nobelově ceně není malá,ale pro významné vědce to není to rozhodu-

jící. Rozhodující je prestiž ceny, která je nej-vyšším možným oceněním vědce na světě,a to si nepochybně členové Nobelova výborunechtějí nějakým svým špatným rozhodnutímnechat vzít.

Na Nobelovu cenu dosáhlo i několikpracovníků Karolinska Institutu, konkrétněpět (z celkového počtu osmi švédských ob-čanů oceněných Nobelovou cenou). Prvnímz nich byl Hugo Theorell v roce 1955. Tenvedl od r. 1936 nově založený Biochemickýústav. Nobelova cena mu byla udělena za vý-zkum cytochromu c, peroxidas, katalas,flavoproteinů a enzymů používající pyridinovékoenzymy. Dalším byl Ragnar Granit,neurofyziolog, který získal třetinu Nobelovyceny v r. 1967 za práce na chemické podsta-tě vidění. Ulf von Euler byl další fyziologs jednou třetinou Nobelovy ceny za rok 1970udělenou za objev neurotransmiterů a stu-dium jejich funkce a metabolismu. Zatímposledními nobelisty jsou biochemici SuneBergström a Bengt Samuelsson za rok 1982,a sice za objevy prostaglandinů a jim podob-ných biologicky aktivních látek.

V novém století, tedy dvacátém, seKarolinska Institut stává stále významnějšía prestižnější institucí. V roce 1930 švédskýparlament rozhodl o vybudování nové výuko-vé nemocnice, která dostala na návrhKarolinska Institutu jméno „KarolinskaSjukhuset“ a byla vybudována na severnímokraji Stockholmu ve čtvrti Solna. Otevřenabyla v roce 1940 a průběžně se v její blíz-kosti budovaly i nové ústavy KarolinskaInstitutu. Veškerá výstavba a stěhováníz Kungsholmenu do Solny bylo dokončenov roce 1945. Tím vznikl Karolinska Instituttak, jak jej poznala většina současnýchvědeckých pracovníků v biomedicíně, kteříStockholm navštívili. Cihlové budovy stříd-mé architektury roztroušené v parkovéúpravě skalního útvaru jménem Norrbackas úzkými silničkami a s omezeným počtemparkovacích míst. Strukturu z roku 1945později doplnily budovy další, ale prostorna další výraznější rozšiřování již chyběl.

16 ■ Bulletin 1

Nastala tedy ještě jedna, zatím po-slední expanze Karolinska Institutu. Nejprve,tuším že již v 60. letech, byla vybudována ob-rovská nemocnice v jižní části Stockholmuve čtvrti Huddinge. V 80. letech pak bylorozhodnuto o dalším budování nových částíKarolinska Institutu právě v Huddingev návaznosti na tuto nemocnici. Celý projektbyl tak trochu produktem sociálního inženýr-ství. Málo prosperující oblasti jižníhoStockholmu se čtvrtěmi plnými nezaměst-naných a přistěhovalců se měly změnit.Vzhledem k tomu, že i ve Švédsku se do-slechli, že věda je výrobní silou, byly investo-vány obrovské prostředky do nových budovs výzkumnými centry, která dostala do vínkui dostatečné prostředky na výzkum s tím,že se budou postupně přeměňovat na pro-dukující firmy nebo instituce, které samyfinanční prostředky vytvoří prodejem paten-tů, licencí apod. Zčásti se záměr zdařil,i když ten finanční výnos nebyl, alespoň promne, patrný. Problém byl také v tom, že tytéžosoby stály v čele státních (přesněji kraj-ských) výzkumných institucí a zároveň bylyspoluvlastníky soukromých „spin off“ firema vznikl tak (možná i oprávněný) pocit, žestátní prostředky nekontrolovatelně proudído soukromých rukou, byť podpora podni-kání s vědeckým základem byla smyslemprojektu a měla státní záštitu. Faktem je, žese na jihu vybudovalo mnoho dalších praco-višť Karolinska Institutu a přesunulo se tami mnoho studentů, při mé poslední návštěvěse tam učila již větší polovina všech stu-dentů. Byly vybudovány nové studentské ko-leje, část bytového fondu převzala student-ská organizace, nastal velký tlak na byty,

takže ceny ubytování stouply a kupř. prokrátkodobého návštěvníka bylo stále obtíž-nější získat potřebné ubytování. Na druhéstraně pochybuji, že díky těmto změnám ně-kdo z nezaměstnaných přistěhovalců žijícíchve čtvrtích Hallunda, Norsborg nebov sídlišti Grantorp ve Flemingsbergu získalpráci, byli pouze naředěni jinými obyvateli.V současnosti tedy Karolinska Institut rozvíjísvá obě centra – na severu v Solně i na jihuv Huddinge, přičemž momentální další vý-stavba se týká pro změnu opět severu. Bylorozhodnuto o velké přestavbě univerzitnínemocnice ve čtvrti Solna, té nemocnicez roku 1940. Protože není další volnýprostor, jde o přestavbu, tedy bourání stáva-jících objektů a jejich náhradu objektynovými, dle projektu velmi zajímavými.V tomto směru se nijak neprojevila celosvě-tová finanční krize a buďme rádi, že alespoňněkde je tomu tak.

Karolinska Institut se může hrdě ohléd-nout za 200 lety své existence a také tak uči-nil, hlavní záštitu nad oslavami přijal sou-časný panovník Carl XVI. Gustaf. Ve světo-vých žebříčcích, které srovnávají kvality uni-verzit a dalších vědeckých institucích seumisťuje kolem 100. místa, tj. na stejné úrov-ni jako Akademie věd ČR. Univerzita Karlovaje přibližně na 200. místě, další české insti-tuce jsou na podstatně nižších příčkách.Připomeňme si, že se jedná jen o většílékařskou fakultu s náležitým výzkumnýmzázemím, která je jediná lékařská fakultav hlavním městě, takže pro srovnánís českými poměry plní tedy roli všech třípražských lékařských fakult dohromady, byťs menším počtem studentů lékařství.

Bulletin 1 ■ 17

Roční financování Karolinska Institutu(2009) – celkové – 4 880 milionů SEK(tj. 13 miliard Kč). Z toho 2 085 milionů SEK(tj. 5,6 miliard Kč) je přímé vládní (institucio-nální) financování, což je 43% rozpočtu.57% jsou pak výzkumné granty předevšímz celostátní úrovně, dále z krajské a místníúrovně, od firem a také ze zahraničí.Povšimněme si, že roční financování před-stavuje zhruba desetinásobek hodnotybudov.

Každá naše lékařská výuková a vý-zkumná instituce si může provést srovnáníse svojí kapacitou a se svými finančními pro-středky. Já jsem provedl srovnání se svojilékařskou fakultou v Plzni, kde počty absol-ventů všeobecného a zubního lékařstvířádové srovnatelné. Nesrovnatelně vyššíjsou v Karolinska počty ostatních studentů,které v Plzni nemáme. Počty zaměstnancůjsou více než 10krát vyšší než v Plznia celkové finance institucionální má Ka-rolinska asi 15krát vyšší a získané grantové

prostředky 65krát vyšší. Také je třeba alevidět, že za ty prostředky pracovníci vytvořívědecké výsledky statisticky srovnatelnés celkovou produkcí naší Akademie věd.Máme tedy ještě co dohánět, i když při vhod-ném přepočítání bychom jistě dospělik názoru, že naši vlastní vědeckou produkcivytvoříme podstatně levněji než Švédovéve Stockholmu. Naše fakulta má za sebou65 let práce, Karolinska Institut 200 let.Doporučuji provést srovnání za dalších 135let a možná, že bude pro nás příznivější.Zatím navrhuji začít třeba u té chemiea biochemie a připustit si, že lékař, kterýchce něco výzkumně dokázat, ji skutečněpotřebuje. Vždyť i ty Nobelovy ceny za fyzio-logii a medicínu se skoro za nic jiného nežza tu „chemii“ vlastně nedávají, a to aniŠvédům.

Skal!Radim Černý

Současný stav nám trochu přiblíží čísla, která jsou pro mne dostupná za rok 2009.Celkový počet studentů promujících (ukončivších) v daném roce: 1488Z toho všeobecné lékařství 250

zubní lékařství 55ošetřovatelství 325speciální ošetřovatelství 372fyzioterapie 95laboratorní biomedicina 67porodní asistentka 65pracovní terapie 61optometrie 48aj.

Výuku a výzkum zajišťuje celkem 3875 zaměstnancůZ toho profesorů 328

docentů (senior lecturers) 148asistentů (junior lecturers) 219výzkumných pracovníků 685„postdoctoral fellows“ 117Ph.D. studentů 515laborantů a technických pracovníků 1005administrativních pracovníků 858

Budovy ve vlastnictví Karolinska Institutu – 190 tisíc m2 podlahové plochy v hodnotě553 milionů SEK.

18 ■ Bulletin 1

OBJEV ITEL V ITAMÍNU B1Kazimierz Funk*23. února 1884 – † 19. ledna 1967

V našem občasném seriálu o význam-ných osobnostech světové biochemie,kde se nedávno objevila jména jako JanHorbaczewski nebo manželé Carl Ferdi-nand Cori a Gerty Theresa Coriová, dnespřipomínáme jiného středoevropana, vědcepůvodem z Polska, který působil dlouhá létave Spojených státech. Kazimierz Funk (téžCasimir Funk) se narodil v židovské rodiněve Varšavě. Zmíníme-li, že východní oblastidnešního Polska včetně hlavního města bylytehdy součástí carského Ruska, dobovourealitu politickou, ekonomickou i sociálnípak není nutné blíže představovat. V roce1900 odjel studovat biologii a chemiido Švýcarska. Po doktorátu získával zkuše-nosti u významného polského chemika,Stanisława Kostaneckého, který byl pro-fesorem berlínské univerzity. Pracovalv Pasteurově ústavu v Paříži a na Listerověústavu preventivního lékařství (Bushey,Hertfordshire) v Anglii.

Při hledání příčin nemoci beri-beriobjevil v rýžových otrubách látku dnes zná-mou jako vitamín B1 (thiamin), jejíž existencinaznačovaly starší pokusy ChristiaanaEijkmana a Umetara Suzukiho. Není překva-pením, že autorem pojmu "vitamín", který bylpředstaven v roce 1912, je právě Funk.Vznikl zkrácením slov „vitální amin“ a odrážíprokázaný obsah dusíku. Z dnešního po-hledu je však zavádějící, např. vitamíny A čiK dusík vůbec neobsahují. Na rozdíl od pů-vodního anglického „vitamine“ se od r. 1920

užívá „vitamin“, aby byla potlačena nazna-čená souvislost s aminem (anglicky „ami-ne“). Klíčové pokusy proběhly s holuby,kteří trpěli polyneuritidou díky krmení loupa-nou rýží, která prakticky neobsahuje vitamínB1. Podávání substance získané přečiště-ním z alkoholových extraktů rýžových otrubvedlo k přežití i u tak závažně postiženýchjedinců, kteří bez aplikace vitamínu jakoléku pošli do 12ti hodin (viz dole uvedenácitace publikace z roku 1911 v J. Physiol.).Pokračující výzkum vedl k nalezení vitamínuB1 i v dalších potravinách např. droždí.Kazimierz Funk předpověděl, že nedostatekvitamínů může vést k mnoha dalším nemo-cem: křivici, kurdějím, pelagře.

Během první světové války odjeldo Spojených států (1915), kde se zapojildo výzkumu zaměřeného na využití vitamí-nů pro léčebné účely, získával granty(Rockefellerova nadace). V roce 1923 sevrátil do Polska. Do roku 1927 zde řídiloddělení biochemie Národního ústavu prohygienu ve Varšavě, pracoval napříkladna izolaci hormonu insulinu a věnoval sedále výzkumné práci na vitamínech. Zabývalse především vlivem vitamínu B1 na meta-bolismus sacharidů a úlohou kyseliny nikoti-nové. Díky nejasné politické situací v Polskupřesídlil do Paříže, kde nejdříve pracovalpro farmaceutickou firmu, později založilvlastní výzkumné pracoviště. Po odchoduz Evropy v důsledku vypuknutí druhésvětové války působil od roku 1940

Bulletin 1 ■ 19

ve Spojených státech, kde zůstal až do svésmrti. Založil zde např. nadaci The FunkFoundation for Medical Research (1947)a samozřejmě pokračoval ve výzkumnépráci. V poslední etapě vědecké dráhy se

Funk věnoval příčinám vzniku rakoviny.Je autorem několika stovek vědeckých pub-likací. Zemřel v New Yorku ve věku osmde-sáti tří let.

Zpracoval Marek Šebela podle veřejně přístupných textů Wikipedie, materiálů Polské akademievěd a vědecké publikace Funk C.: On the chemical nature of the substance which cures polyneuritisin birds induced by a diet of polished rice. J Physiol 1911;43:395-400. Fotografie pochází z knihyWielka Encyklopedia Powszechna PWN, Warszawa, Polsko, 1964, díl 4., str. 55; její použití je legálnídle polské legislativy o autorských právech.

www.febs2011.itwww.febs2011.it

PODZIMNÍ ŠKOLA PRO UČITELE BIOLOGIE A CHEMIE

V letošním školním roce se po ročnípřestávce opět konal další ročník Podzimníškoly pro učitele. Akce trvala od 27. do 29.října 2010 v prostorách ÚOCHB AV ČR.Celou akci zaštiťuje Česká společnost probiochemii a molekulární biologii s podporoufirmy KRD, s.r.o. a klastru MedChemBio.Společně s ostatními účastníky jsme uvítalidalší pokračování tohoto velmi zdařiléhosemináře určeného pro učitele středníchškol přírodovědných předmětů se zaměře-ním na biologii a chemii.

Během tří dnů jsme měli možnostvyslechnout řadu zajímavých přednášekna nejrůznější biologická, biochemickáa chemická témata: Malárie, HIV/AIDS,Chemická komunikace hmyzu, Biologickyaktivní peptidy, Regulace příjmu potravy,Klíšťata, Chemický pohled na aerosoly.Přednášek se ujali odborní pracovníciÚOCHB AV ČR. Zajímavě byl řešen právěvýběr přednášejících – od začínajících vědcůaž po renomované odborníky, kteří nás velmipoutavě seznámili s novinkami v daných obo-

rech. Součástí programu byla i návštěvanově otevřené Národní technické knihovny,kde jsme měli možnost obdivovat futuristickýdesign této budovy.

Kromě hlavního cíle: možnosti si dopl-nit či oprášit některé ze znalostí z danýchoborů, celá akce umožňuje nám učitelůmužší kontakt s odborníky. Velmi cenné jsouzávěrečné diskuze a večerní neformálnísetkání s vědci. Podzimní škola umožňujevýměnu zkušeností i mezi námi navzájem.Ze všech těchto důvodů se tedy jednáo akci, o kterou je mezi pedagogickou veřej-ností velký zájem. A tak není divu, že jeregistrační list zaplněn během krátké doby.

Závěrem bych rád poděkoval všemorganizátorům (zejména pak Ing. Krumlové)za chuť organizovat podobné semináře proučitele a všem přednášejícím za velmi hodnot-né a pro nás podnětné přednášky. A nezbývámi nic jiného, než se těšit na další ročník.

Ivo KrálíčekBiskupské gymnázium B. Balbína,

Hradec Králové

20 ■ Bulletin 1

Bulletin 1 ■ 21

Masarykova univerzita v Brně – Přírodovědecká fakultaČeská společnost pro biochemii a molekulární biologii

Vás zvou do Brna na

XV. Setkání biochemikůa molekulárních biologů

jehož každoroční součástí je i Sekce mladých– soutěžní přehlídka studentských prezentací v angličtině

Termín konání akce: 1. – 2. 11. 2011v konferenčních prostorách hotelu Continental Brno

Organizátoři konference:

Michaela Wimmerová – Ústav biochemie a Národní centrum pro výzkum biomolekul, PřF MU,UKB, Pavilon A5/317, Kamenice 5, 625 00 Brno, tel.: 549498166, fax: 549492556,e–mail: michaw@chemi.muni.czLibuše Trnková – Ústav chemie, PřF MU, e-mail: libuse@chemi.muni.czPetr Beneš – Ústav experimentální biologie, PřF MU,e-mail: pbenes@sci.muni.czPetr Zbořil – Ústav biochemie, PřF MU, e–mail: zboril@chemi.muni.czMarie Pokorná – Národní centrum pro výzkum biomolekul, e–mail: majka@chemi.muni.cz

e-mail konference: setkani@chemi.muni.czZasílací adresa: Přírodovědecká fakulta MU, Kotlářská 2, 611 37 Brno

Další informace na http://orion.chemi.muni.cz/setkani

Termín pro zaslání závazné přihlášky i abstraktů – 31.9.2011

22 ■ Bulletin 1

www.the-embo-meeting.org

ČSBMBvypisuje

4 cestovní granty

podrobnost i na www.csbmb.cz

Bulletin 1 ■ 23

Vážení přátelé proteomiky a proteinové biochemie!

Přijměte prosím pozvání na vědecké fórum

5th Central and Eastern EuropeanProteomic Conference (5th CEEPC)

organizované Proteomickou sekcí ČSBMB ve spolupráci s následujícímiinstitucemi ve dnech 19. – 22. září 2011:

Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v.v.i., Liběchov,Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i., Praha,

Přírodovědecká fakulta Univerzity Karlovy, Praha,Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého, Olomouc

http://2011.czproteo.cz/

24 ■ Bulletin 1

Bulletin 1 ■ 25

5. a 6. října 2011 Kongresové centrum Praha

LABOREXPO 2011

– Kvalitní doprovodný program s účastí předních českých odborníků a vědců

– Prezentace nejvýznamnějších dodavatelů laboratorního vybavení a analytickétechniky

– Rozšířená výstavní plocha

Pardubice/Praha, 1. 4. 2011 – Denně sednes hovoří o nutnosti aplikace výsledkůvědy a výzkumu do praxe. O tom, že vynikají-cích výsledků je v chemii a biochemii celářada, svědčí i to, že se organizátorům5. ročníku výstavy laboratorní techniky,vybavení, pomůcek a služeb laboratoří– LABOREXPO 2011 podařilo připravitvelmi kvalitní doprovodný program. Podařilose dosáhnout toho, aby se témata předná-šek kryla s nomenklaturou výstavy a dalazároveň nahlédnout pod pokličku laboratoří,kde pracují naši přední univerzitní profe-soři, vedoucí výzkumných týmů a odborníciz praxe.

Odborný doprovodný program výstavyLABOREXPO 2011 je připravován ve spolu-práci s Českou chemickou společností(ČSCH) a Českou společností pro bioche-mii a molekulární biologii (ČSBMB), kteréjsou zároveň odbornými garanty programu.Cílem je představit současné postaveníčeské analytické chemie ve farmakologii,biochemii, genomice a jejích praktickýchsouvislostech, uvést příklady materiálovéhovýzkumu a jeho úspěšného použitía naznačit jeho další trendy. Místem jehokonání je přízemí Kongresového centraPraha.

Je nasnadě, že současné disciplínyanalytické chemie jsou ve všech uvedenýchoblastech natolik propojeny, že se jednabez druhé neobejde. Již úvodní přednáškana téma Využití metody MALDI TOFv mikrobiologii, kterou přednese ředitelSVÚ Olomouc prof. J. Bardoň, uvede poslu-

chače do moderních biochemických aplika-cí hmotnostní spektrometrie. Na tuto před-nášku naváže dr. J. Turánek z VÚ veteri-nářského v Brně prezentací Farmako-logické aplikace nanoliposomů: využitípro konstrukci rekombinantních vak-cín, imunofarmak a cílených proti-nádorových preparátů. Hmotnostníspektrometrií v (bio)analytické praxi,s ohledem na lipodomické a medicín-ské aplikace představí prof. M. Holčapekz Univerzity Pardubice (UPce). Zajímavoubude jistě i přednáška prof. P. Hradilaz FARMAKu Olomouc o současné situacive farmacii z hlediska originálnícha generických farmak a praktickýchaspektů jejich dalšího vývoje.

Instrumentálním metodám se budevěnovat přednáška prof. B. Kratochvílaz pražské VŠCHT, který seznámís možnostmi RTG difrakce ve farmacii,materiálovém výzkumu a krystalografii.Na nových cestách elektroanalytiky seposluchači setkají s prof. J. Barkemz Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy(UK), jenž osobitým způsobem pohovořío nových elektrodových materiálecha jejich přednostech při analýzáchléčiv, polutantů a chemických kancero-genů.

Prof. P. Jandera (UPce) ukáže mnoho-stranné použití kolon HILIC, jako me-tody separace polárních látek, a naznačívelmi širokou oblast jejich použití.Prof. M. Kalousová z 1. lékařské fakulty UKnabídne zamyšlení se nad úlohou moderní

26 ■ Bulletin 1

klinické biochemie ve vztahu pacient –lékař. Mgr. S. Kukla z fy Merck představíněkolik triků a tipů na metody přípravuvzorků pro LC/MS analýzy.

Genetika je obor posledního desetiletía má i v tomto programu významné zastou-pení. Na začátku druhého dne zahájíprogram Mgr. J. Pačes z ÚMG Praha otáz-kou Jak se čte DNA a co je to metage-nomika? Na jeho prezentaci navážeDr. M. Bunček ze společnosti GeneriBiotech z Hradce Králové tím, jak dlouhábyla cesta od diagnostiky k syntetickéDNA. Analýza DNA je nyní veřejnostívnímána jako přední kriminalistická důkaznímetoda. Jaká přístrojová technika se k to-mu používá, bude tématem přednáškyMgr. V. Stenzla z Kriminalistického ústavuPolicie ČR.

Ing. R. Oros z fy Shimadzu seznámíposluchače se světem hmotnostní spekt-rometrie, která má významnou úlohu přivývoji léčiv, odhadu metabolitů a stanoveníčistoty účinných látek (API) v lécích. Pozvánípřijal i prof. Štulík z Přírodovědecké fakultyUK, který se zamyslí nad tím, jak mohoupomoci analytici biologům a naopak,neboť se zde rýsuje řada zajímavých otázek.

Velkým přínosem našeho materiálo-vého výzkumu se staly aplikace hydro-xiapatitové nano- a mikrokeramikydo zubních a kostních náhrad, kterýmise zabývá společnost LASAK z Prahya o kterých pohovoří laureátka ocenění Čes-ká hlava Ing. M. Strnadová. Jinou perspek-tivní oblastí se jeví i interkalační slouče-niny, vrstevnaté organofosfáty kovů –nové perspektivní anorganicko-orga-nické hybridní materiály, o kterých poho-voří doc. V. Zima ze Společné laboratořechemie pevných látek (UPce). Velmi přitažli-vou bude i přednáška Ing. Černohorskéhoz pardubické firmy RMI, který se bude zabý-vat takřka sci-fi aplikací mobilní spektro-metrie, což je nejmodernější analytickáhi-tech metoda v oblasti kosmické techniky,

lékařství, bezpečnostních a forenzních služ-bách a materiálové kontroly a výzkumu.

Sponzory doprovodného programu vý-stavy LABOREXPO 2011 jsou společnostiMERCI, Lach-Ner, Merck-Millipore – divizespolečnosti Merck a Shimadzu.

O tom, že je výstava LABOREXPO prooblast laboratorní praxe skutečnou událostíroku, svědčí i to, že se na ní představí nejvý-znamější dodavatelé laboratorní technikya vybavení u nás. Jejich zájem o letošnív pořadí již pátý ročník výstavy vzrostl nato-lik, že se organizátoři výstavy rozhodli rozší-řit výstavní plochu oproti předchozím roční-kům tak, aby byla jejich poptávka uspo-kojena. K dnešnímu dni je přihlášeno 65 vy-stavovatelů, kteří v celkovém součtupředstavují zástupce téměř 600 vý-robců a dodavatelů techniky, vybavenía potřeb pro laboratoře z celého světa.Výstava LABOREXPO je pořádána jednouza dva roky a je tak pro své návštěvníky jedi-nečnou příležitostí k získání velkého množ-ství podrobných informací a osobníchpoznatků o aktuální nabídce laboratorníhovybavení. Výstavu LABOREXPO lze protooznačit jako moderní profesní meetingpoint, který nabízí jak obchodní příležitosti,tak i možnost se profesně vzdělávat.

Organizátorem a hlavním mediálnímpartnerem výstavy je časopis CHEMA-GAZÍN. Vstup na výstavu LABOREXPO i jejídoprovodný program je volný. Sledujtestránky www.laborexpo.cz, na kterýchnajdete nejen anotace jednotlivých prezen-tací, ale i aktuality ze světa laboratornía analytické techniky. Můžete se zde záro-veň i předem se zaregistrovat jako návštěv-ník a získat tak řadu bonusů.

Kontakt:

CHEMAGAZÍN s.r.o.B. Němcové 2625, 530 02 PardubiceT: +420 466 411 800, 603 211 803E: info@laborexpo.czI: www.laborexpo.cz – www.chemagazin.cz

Bulletin 1 ■ 27

Urãeno pro vnitfiní potfiebu âSBMBV˘konn˘ redaktor: Michaela Wimmerová, MU Brno

tel.: 220 183 268Vychází 3 x roãnû

Sazba a tisk: grafické studio Venice Praha s.r.o.Bulletin ã. 1/2011 ze dne 15. 4. 2011

Evid. ãíslo: MK âR E 10260Toto ãíslo je hrazenofirmou Biotech, a.s.ISSN 1211-2526

EMBL: http://www.embl-heidelberg.deEMBO: http://www.embo.orgFEBS: http://www.febs.org

âSBMB: http://www.csbmb.cz

www.merck-chemicals.czwww.mecomm.cz

OmniPUR®Nová řada chemikálií pro molekulární biologiiSpeciální zaváděcí akce! Kupte v období 1. 4. 2011 až 30. 6. 2011 libovolné

balení z nové řady OmniPUR® a získáte druhé balení ve stejné nebo nižší ceně za

pouhou 1,- Kč! Pro bližší informace a kompletní přehled chemikálií z nové řady

OmniPUR® navštivte stránky našeho internetového obchodu www.mecomm.cz.

Vaše výhody: Chemikálie nejvyšší kvality

Všechny chemikálie řady OmniPUR® jsou testovány

na nepřítomnost DNáz, RNáz a proteáz

Použitelné v řadě aplikací, reprodukovatelné výsledky

Rozmanitost balení – od laboratorních gramových

až po výrobní kilogramová