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ESTRUCTURA DEL RNA

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ESTRUCTURA DEL RNA

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Estructura tipo A

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Distribución de propeller twist

B-DNA A-RNA y RNA

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Distribución de inclination

en DNA y en RNA (MD)

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Distribución de twist en

DNA y en RNA (MD)

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ESTRUCTURA HÍBRIDO

DNA·RNA

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Esquema estrategias anti-sense y

anti-gene

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Estructura terciaria

• El RNA intenta adoptar formas doble helice

• Al ser una cadena no autocomplentaria esto

genera

– Formación de loops, buldges,…

– Formación de interacciones no canónicas de las

bases.

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Estructura secundariaterciaria

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Tipos reconocimiento bases en

estructura terciaria de RNAs

Clasificación Leontis/Westhof

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Loops

Tri-loop tetra-loop penta-loop

Stacked-in

Looped-out

Kissing loops

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Motivos comunes en RNAs

• Tetraloops (GNRA, ANYA, UNCG) muy

prevalentes, estables y conservados,…

• Internal loop y bulges: Normalmente

puntos de pivote de helices (ej. TAR

domain HIV-1).

• Three-way junctions y pseudoknots: muy

comunes en RNA.

• Kink-turn (K-turn) muy prevalente da giros

muy bruscos a la estructura

(http://www.dundee.ac.uk/biocentre/nasg/kturn/Kcyl-desktop_Loop.mov)

N: aNy, Y; Y: pYrimidine and N puriNe

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K-turn

• Dos cadenas una de ellas hace un kink muy

marcado en la estructura del conjunto

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Estructura secundaria de un RNA(t)

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Estructura 2-D RNA(t)

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Estructura 3-D RNA(t)

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Ejemplo apareamientos RNA(t)

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El código genético

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Etapas aminoacilación RNA(t)

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Complejo Acyl-transferase RNA(t)

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Esquema traducción en un ribosoma

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Esquema de la traducción

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Ribosomas

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Estructura ribosoma