estructura del rnajsancho... · b-dna a-rna y rna . distribución de inclination en dna y en rna...
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ESTRUCTURA DEL RNA
Estructura tipo A
Distribución de propeller twist
B-DNA A-RNA y RNA
Distribución de inclination
en DNA y en RNA (MD)
Distribución de twist en
DNA y en RNA (MD)
ESTRUCTURA HÍBRIDO
DNA·RNA
Esquema estrategias anti-sense y
anti-gene
Estructura terciaria
• El RNA intenta adoptar formas doble helice
• Al ser una cadena no autocomplentaria esto
genera
– Formación de loops, buldges,…
– Formación de interacciones no canónicas de las
bases.
Estructura secundariaterciaria
Tipos reconocimiento bases en
estructura terciaria de RNAs
Clasificación Leontis/Westhof
Loops
Tri-loop tetra-loop penta-loop
Stacked-in
Looped-out
Kissing loops
Motivos comunes en RNAs
• Tetraloops (GNRA, ANYA, UNCG) muy
prevalentes, estables y conservados,…
• Internal loop y bulges: Normalmente
puntos de pivote de helices (ej. TAR
domain HIV-1).
• Three-way junctions y pseudoknots: muy
comunes en RNA.
• Kink-turn (K-turn) muy prevalente da giros
muy bruscos a la estructura
(http://www.dundee.ac.uk/biocentre/nasg/kturn/Kcyl-desktop_Loop.mov)
N: aNy, Y; Y: pYrimidine and N puriNe
K-turn
• Dos cadenas una de ellas hace un kink muy
marcado en la estructura del conjunto
Estructura secundaria de un RNA(t)
Estructura 2-D RNA(t)
Estructura 3-D RNA(t)
Ejemplo apareamientos RNA(t)
El código genético
Etapas aminoacilación RNA(t)
Complejo Acyl-transferase RNA(t)
Esquema traducción en un ribosoma
Esquema de la traducción
Ribosomas
Estructura ribosoma