プロテインアレイ 受託解析サービス

フィルジェン株式会社

High-Spec™

ImmuneProfiler™

世界最大級のヒトタンパク質 コレクションアレイによる プロファイリングサービス

一部のタンパク質はフルレングスではありません。短いアイソフォームタンパク質も多く含まれています。

ヒトプロテオームマイクロアレイ

HuProt™

>21,000のタンパク質を搭載

最先端の製造技術

世界最大級のタンパク質コレクション

ハイスループットで数千の相互作用を探索

標準的なプロテオーム最大87％に対応

Human Protein Atlasで定義されたタンパク質がスライドガラス状に搭載されています

抗GST抗体でプローブした21,000を超えるGST融合タンパク質を有するHuProt™マイクロアレイ

アプリケーション

体液バイオマーカー

プロファイリング

（血清、血漿など）

抗体特異性試験

タンパク質結合

DNA/RNA結合

ユビキチン化

リン酸化

小分子結合

翻訳後修飾(PTM)

アッセイ

0.02%

2.25%

3.36%

5.03%

搭載タンパク質の鎖長

Full Length

Truncated

Fragment

Mutation

Unannotated 89.34%

搭載タンパク質の特長

リシークエンスされたコンテンツおよび発現

製造および品質評価

接触性アレイプリンター NEW Arrayjet非接触性

ピエゾ方式プリンター

スポットの形態: ピエゾ方式のインクジェットプロセスは、高精度のマイ

クロアレイスライドを迅速に生成することを可能にし、正確な再現性と

均一なピクセル分布を有する優れたスポット形態を実現しています。

HuProt™マイクロアレイは、新たにリシークエンスされた

16,512遺伝子を含んだ>21,000のヒトタンパク質および124

のマウス遺伝子を搭載しています（ヒトプロテオームの

~81%）。組み換えタンパク質は、酵母（S. cerevisiae）

で発現され、精製されてスライドガラスにデュプリケートで、コン

トロールタンパク質と共にプリントされます。

GSTおよびHis6がN末端にタグ付けされたタンパク質を発現・精製

した後、従来のコントロールタンパク質（GSTやBSA、ヒストン、IgG

など）の他、線形回帰分析の使用や、放射線標識サンプルの解析、

異なる解析ソフトウェアの使用を可能にする新たなコントロールと共に、

スライドガラスにデュプリケートでプリントします。スライドは、追跡および

保存のために、バーコードが付されています。各マイクロアレイは、

GST免疫ブロッティング（全タンパク質の98％が各分子量を認証）

によってルーチン的に評価されています。

HuProt™マイクロアレイは、2種類のガラス表面（PATH™と

SuperEpoxy2™）で利用できます。ディスカバリーフェーズで同定さ

れたバイオマーカーから、フォーカスドアレイをデザインすることが可能

です。バリデーションフェーズへの費用効率が高く、迅速なアプローチの

ために、効果的なスライドフォーマット（最大2x7）を設定することが

可能です。

Arrayjet Ultra Marathon II（右写真）非接触性（インクジェッ

ト）のピエゾ方式プリンターを使用し、接触性プリント法よりも優れた

パフォーマンスでマイクロアレイを製造しています。

• 正確なスポットモルフォロジー（右図）

• 大規模なコホート研究用の大規模なバッチサイズ

• カスタム調製アレイの迅速な生産

• アレイ内およびアレイ間のばらつきの抑制

• 優れた再現性（下図）

HuProt™のヒトプロテオームのカバレッジ

酵素 83% 推定分泌タンパク質 85%

プロテインキナーゼ 89% 血漿タンパク質 82%

ペプチダーゼ 79% CDマーカー 83%

トランスポーター 79% 疾患関連タンパク質 81%

転写因子 85% 候補がんバイオマーカー 89%

推定膜タンパク質 73% 候補心血管疾患 91%

GPCR 65% FDA承認医薬品ターゲット 79%

核内受容体 94%

GSTシグナルのバッチ内再現性解析 GSTシグナルのバッチ間再現性解析

同一バッチ内2アレイ間の決定系数（R-squared）値 1年以内にプリントされた2バッチ間の決定系数（R-squared）値

HuProt™アプリケーションワークフロー例

HuProt™マイクロアレイは、研究および製造で使用される抗体の品質評価をめざましく進歩させます (P.6参照)

大規模な実験群/対照群研究は、

新規バイオマーカーを明らかにします（P.5参照）

White Paper: cdi-lab.com/High-Spec_White_Paper.shtml Video Demo: cdi-lab.com/Video.shtml

抗体をHuProt™上で1つ（またはそれ以上）のタンパク質と結合させる

マイクロアレイを洗浄し、蛍光二次抗体と反応させる

抗体-タンパク質結合を解析し、特異性を評価

サンプルをHuProt™と反応させ、自己抗体とタンパク質を結合

マイクロアレイを洗浄し、アイソタイプ（抗IgG、IgMまたはIgA）特異的な蛍光二次抗体と反応させる

抗体-タンパク質結合を解析

アレイスキャナー バイオインフォマティクス

抗体特異性 体液バイオマーカー

プロファイリング （血清、血漿など）

HuProt™マイクロアレイ

予測される

標的物

オフターゲット

交差反応

50ng 抗体/test未満 50μl 体液/test未満

相対シグナル強度

予測される標的物

統計的に有意な交差反応 （存在しない場合、抗体は単一特異性）

標的ランキング （HuProt™マイクロアレイ上の数千のタンパク質）

総タンパク質

免疫プロファイリングサービス（ImmuneProfiler™）

フェーズ1 – ディスカバリー

関心となる疾患患者サンプルおよび健常者サンプルを、HuProt™で試験します。各カテゴリにつき、50-100サンプル使用されるのが典型です。

バイオインフォマティクス解析の後、両グループのプロファイルが比較され、候補バイオマーカーが同定されます。

フェーズ2 – バリデーション

ディスカバリーフェーズで同定されたバイオマーカー候補は、フォーカスドアレイの作製に使用されます。スライド1枚につき、14-64アレイをプリントすることが可能です。これにより、劇的にコストを削減し、より大規模な患者サンプルコホートを試験することが可能です。

バイオマーカーの堅牢で迅速なバリデーションは、データのオーバーフィットに関連する問題を排除します。 バリデートされたバイオマーカーは、迅速にELISAベースのアッセイまたは他の商業的アッセイプラットフォームに移転することが可能です。

大規模なアッセイにも対応: 2段階のバイオマーカーディスカバリーワークフロー

ImmuneProfiler™の利点

ペプチドではなくタンパク質であること

世界最大のコレクション

一次（IgM）および二次（IgG）応答を検出

*IgAの検出にも対応いたしますのでご相談ください

迅速で再現性のあるアッセイ

少量の貴重なサンプルに対応

スクリーニングデータに基づいたカスタマイズが可能

HuProt™マイクロアレイを用いて、血清中の自己抗体候補を検出することで、自己免疫疾患（ループス、関節炎、クローン病、多発性硬化症

など）、がんや様々なヒト疾患における自己抗体（バイオマーカー）の発見を支援します。

抗体特異性プロファイリングサービス（High Spec™）

HuProt™による商用抗体の検証

商用抗体の特異性を検証したホワイトペーパーを公開しています

こちらからアクセス: cdi-lab.com/High-Spec_White_Paper.html

HuProt™マイクロアレイを用いて、抗体の特異性をアッセイします。本

サービスでは、ネイティブアレイおよび変性アレイを用いて、2通りの反応

濃度で検証するといったことが可能です。

ネイティブタンパク質アレイおよび変性タンパク質アレイで検証※

異なる反応濃度で検証※

*使用するアレイタイプおよび反応濃度をご指定いただけます。

HuProt™アレイは、交差反応する抗体の同定を支援し、開発段階

の早期にそれらを排除することによって、オフターゲット効果の可能性を

減少させます。これにより、標的に対して強い特異性を示す抗体にリ

ソースを集中させることができます。FDAは、非標的組織の抗原に結合

する抗体医薬品の深刻なオフターゲット効果の可能性を減少させるた

めに、新しい技術を直ぐに採用することを推奨しています。

その他のプロファイリングサービス、アレイ販売

CDIは、他にも様々なプロファイリングサービスを提供することで、研究を

支援いたします。

核酸（DNA/RNA）結合性プロファイリング

タンパク質間相互作用プロファイリング

タンパク質-小分子相互作用プロファイリング

HuProt™マイクロアレイの販売も行なっておりますので、ご自身でアッセ

イすることも可能です。

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フィルジェン 株式会社 受託解析部

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