flowcytometry analysis 123
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Flowcytometry Analysis 123. Morphology. Flowcytometry. May 7, 2010. Flowcytometry step 1. Flow 上機前準備工作. PB/ 骨髓血 / 骨髓 / CSF/LNs… 一般 3cc (heparin 綠頭管 ) 須打洞者,約 5cc 準備 mononuclear cells < 方法一 > 加入 Ficoll 離心 < 方法二 > 加入 NH4Cl RBC lysis ( 無核 RBC), wash 染色 - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
Flowcytometry Analysis 123
May 7, 2010
Morphology Flowcytometry
Flowcytometry step 1
3
PB/ 骨髓血 / 骨髓 / CSF/LNs…◦ 一般 3cc (heparin 綠頭管 )◦ 須打洞者,約 5cc
準備 mononuclear cells◦ < 方法一 > 加入 Ficoll 離心◦ < 方法二 > 加入 NH4Cl RBC lysis( 無核 RBC), wash
染色◦ PE 螢光強 , FITC 螢光弱 ( 所以想看什麼盡量用 PE)
福馬林固定 上機 (BD Canto-II 可測 8+2 色螢光 )
◦ 一般收 10,000 events◦ MRD 收 100,000 events
Flow 上機前準備工作
4
需打洞打洞,染色,固定,約需 5cc 的血 Tissue flow:
◦ 花生大小,切片完盡速丟入 N/S 或 RPMI◦ 須加入 7AAD 辨認細胞 viability ( 染不上色為活細胞 )
細胞存活 :◦ PB/BM blood 可保存於室溫 72 小時◦ Tissue 可丟入 N/S 中,亦可丟入 RPMI 存活更久
Sorting:◦ 目前借用中研院的 sorter (Coulter)◦ Sorting 後的細胞為活細胞,可做 cytogenetic 、 FISH 、
PCR
特別事項
5
Flow 原理— FSC, SSC
2-16° Forward Scatter (FSC)
“Size”
90° Side Scatter (SSC)
“Granularity”
FITC
GFP
PE
Cy3
PI
PerCP
PerCP-Cy5.5
PE-Cy7
APC
Tube FITC PE PerCP
# 1 (control) auto-fluorescence ( 不使用 isotope) CD45
# 2 HLA-DR CD11b CD45
# 3 CD5 CD19 CD45
# 4 CD56 CD38 CD45
# 5 CD16 CD13 CD45
# 6 CD15 CD34 CD45
# 7 CD14 CD33 CD45
# 8 CD7 CD56 CD45
# 9 HLA-DR CD34 CD45
舉例 : Myeloid panel
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檢體處理 :◦ Ficoll 會損失大量 neutrophil ,無法準確評估 mature myeloid cells◦ 可能會有 dying cells ( 各種 marker 都變弱 )
Lab:◦ 可能會有 doublets (2 cells connected)◦ 可能會有 auto-fluorescence 過強 ( 通常呈一直線 )◦ 可能會有 bubbles ( 飄在頂端 )
Analysis:◦ 可能會有 over-compensation 或 under-compensation◦ Plasma cells 極端脆弱,評估 % 實在不準,僅供參考◦ APL 很難判讀◦ Erythroid 在分析上很困難◦ Megakaryocytes 無法分析
Flow 可能的陷阱
8
華山派
劍宗 氣宗
歷史的分歧
Flow analysis-Fresh case
強調百分比 %
( 螢光 control ,受限於 cursor)
形態為重 (auto-
fluorescence control ,
不拘泥於 cursor)
Flow analysis-MRD
需要初診斷原始資料才好判讀
任何時刻偏離正常就是異常
Flowcytometry step 2
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記住位置 記住 gating 順序及意義 (R1, R2, R3, R4, R5)
基本 : FSC-SSC, SSC-CD45R2 R3
R4
R5
R1 NEC
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RBC/ NRBC 在哪裡 ?
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評估 myeloid maturation
DR-11b 呈一直線 CD16-CD13 呈鉤狀,且 neutrophil 應佔 20%
以下
Promye
Mye/Meta
Neu
An
tig
en D
ensi
ty
101
102
103
Neutrophil Maturation
CD45
CD16
CD33
CD13
CD117
DR
CD15 CD11b
I II III IV V
CD34
Myeloid series
CD10
AB
C
D
E
F
Phenotypic changesoccur together
on/off, up/down, splicing正常 : 跳躍式的 phenotype 表現
A
B
C
d
F
Cell death/ apoptosis
Each patient unique
異常 : 某些 phenotype 增加 / 減少
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Basophil
EosinophilNK
T-lym
17
記住 B cells 位置— stage 1234 記住 CD20-CD10 呈ㄣ字形
評估 B lymphoid maturation
CD19+
6 7
8 9
10 30 50 70 90 120
FSC -->
101
102
103
104
SS
C -
->
ML
101 102 103 104
SSC -->
101
102
103
104
CD
45
Pe
rC
P -
->
LymphMonoMyeloid
101 102 103 104
SSC -->
101
102
103
104
CD
19
-AP
C -
->
CD19+
101 102 103 104
CD20 FITC -->
101
102
103
104
CD
45
Pe
rC
P -
->
101 102 103 104
CD10 PE -->
101
102
103
104
CD
45
Pe
rC
P -
->
101 102 103 104
CD20 FITC -->
101
102
103
104
CD
10
PE
-->
III
III, IVT
III
III
IV
III
IIIIVT
18
B-lymphoid series
I II III IV
B lymphoid maturation
CD 10
FMC 7 CD 34
CD 45
CD 19
CD 20
CD 22 TdT CD 5
CD 23
Anti
gen E
xpre
ssio
n 103
102
101
19
Lineage infidelity◦ Lymphoid on myeloid◦ Myeloid on lymphoid
Maturational asynchrony◦ Immature antigens on mature cells◦ Mature antigens on immature cells
Antigeneic absence◦ Loss of marker that should be present
Quantational abnormality◦ Over-expression◦ Under-expression
Wells DA, Benesch M, Loken MR et al, Blood, 2003, 102: 394-403
異常的 flow 形態
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通則◦ FSC-SSC 的最左側有 cell debris 、 dying cells 、 erythroid ,不要
gate◦ Auto-fluorescence 處無法判讀 ( 通常呈一直線 )◦ 要常常注意 FSC (size) ,大細胞常常是 target cells
◦ 如果有多出異常 marker ,要注意是不是 doublets◦ Marker+ 會比 marker- 更重要,也比較容易將來當 MRD 的重要工具
◦ 報告 cell % 時,不同 tubes 可能會略有出入,以最有意義的那一管來報結果
◦ 使用 NH4Cl RBC lysis 後的 cell percentage 約等同於 NEC
◦ 善用 forward gating 與 backward gating ,及其他 gating strategy ( 選擇適當的 G1, G5…) 來幫助判斷是否 grouping/homegenous
◦ 想一想檢查 MRD 時 : 如果異常只出現在一管 ? 會是 lab error? 如果異常反覆出現在多管 ? 比較有信心
你需要背的幾點…
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Myeloblast◦ 與 lymphoblast 位置不同, size 也較大◦ CD34 、 DR 用來辨認 immature cells , CD34 先消失, DR 後消失
( 所以沒有 CD34+/DR- cells)◦ Myeloblast 需與 basophil 鑑別 (DR-/11b+)◦ Myeloblast 如果有 aberrant CD19+ ,常為 M2
Myeloid maturation◦ 依 DR-11b 與 CD13-CD16 的形狀來決定◦ Promyelocyte 多時 ( 如 APL 或 maturation arrest) , fluorescence
很強,正常情況下 promyelocyte 約占 8% (>15% 表示 left shifting)◦ Neutrophil 為 CD15+ ,但此管的 CD34+% 比較不準◦ CD16 是 GPI-anchor protein (for PNH)
你需要背的幾點…
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Mono◦ DR+, CD14+ 是最重要 marker ,也會 CD16+◦ CD33+ ( 強過 myeloid)◦ CD16 是 GPI-anchor protein (for PNH)◦ Monocyte 某一 stage 會帶有 CD4+
Eosinophil◦ Eosinophil cap 是一大特徵 (SSC-CD45)◦ Eosinophil 在 FSC-SSC 的最左方◦ CD16-CD13 的位置也很有特色
Basophil◦ SSC-CD45 位置與 myeloblast 接近 , 但 DR-/11b+◦ CD16-CD13 的位置也很有特色◦ (RBC 與 basophil 沒有 CD38)
你需要背的幾點…
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Lymphoblast◦ CD34+ 為 stage 1 , CD34-/DR+ 為 stage 2 (1+2 就是所謂
hematogone ,在 regeneration 時常常很旺盛 )◦ TdT 也是不成熟細胞的表徵 ( 出現在 TB ,極少在 myeloid)◦ 以 cCD79a 來辨認 B-lineage, cCD3 來辨認 T-lineage
◦ BM 裡沒有 T-lymphoblast ( 所以任何 BM immature blasts with CD2/3/5/7... 都是異常 ) ,只有 T-lymphocytes, NK cells
◦ CD1a 為 thymic antigen ,是不成熟 T 細胞的表徵
◦ 大部分的 B-ALL 是 CD10+ (Common ALL)◦ 大約一半的 B-ALL , CD45 表現為 dim ,甚至 negative
你需要背的幾點…
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B-lymphocytes◦ Light chain restriction 大多用 CD19+ 搭配 κ 或 λ 看, low grade 較明顯, DLBCL 常常較 dim
◦ DR+◦ 正常人本來就有一小部分 CD19+/CD5 dim 的細胞 ( 所以可解釋 CLL)
T-lymphocytes◦ DR- ,但 activating T or NK 會 DR+ ( 所以 DR+ 會出現在 B 及
activating T or NK , DR- 的 aberrant T cells得優先考慮 T-lymphoma)
◦ CD45+ ,且比 B 強
NK cells◦ cCD3+ ,但是 CD3- , CD5- ( 與 T cell 重要的不同 )◦ CD2+ , CD7+ , CD16+ , CD56+ , 11b+◦ 位置也很特別,靠近 myeloblast 處 (SSC-CD45)◦ Activating T or NK 會 DR+
你需要背的幾點…
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Plasma cells◦ 因為很脆弱, % 一般不準,只能看有無◦ CD38 bright( 通常在天花板 ) , CD138+◦ Light chain restriction 大多用 CD38+ 或 CD138+ 搭配κ 或 λ 看◦ Myeloma cells: CD45 dim ( 所以落點特殊 ) ,大多 CD56+
如果 CD25+ ,考慮HCL 或 ATLL
Erythroid◦ CD45-, CD38-, 幾乎全部的 marker 都陰性 (RBC 與 basophil 沒有 CD38)◦ 很難判讀 , 因此 flow 無法確診 M6 ,也很難與 MDS區分
打洞◦ 打洞後需要另外拉 control組才能判讀
Tissue flow◦ 活細胞為 7AAD- ,我們只判讀 7AAD- 的細胞
你需要背的幾點…
Flowcytometry step 3
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