genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije
TRANSCRIPT
![Page 1: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/1.jpg)
Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije
Marija Špehar
![Page 2: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/2.jpg)
Uvod• Genetsko unaprjeđenje
– Učinkovita proizvodnja mlijeka željenog sastava
– Niska stopa izlučenja krava (zdrave i dugožive krave)
– Odgovor na selekciju koristeći podatke iz kontrole proizvodnosti
• Genomsko unaprjeđenje– Dodatno korištenje genetskih markera (SNP)
![Page 3: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/3.jpg)
Provođenje selekcije
• Velike farme– Uvoz kompletnog stada (genetskog materijala)– Proizvodnja 1 do 2 laktacije (velika stopa
izlučenja)– Provođenje vlastite selekcije
• Male farme– Dugovječne životinje – Odabir bikovskih očeva (preporuke Saveza)– Uvoz sjemena
![Page 4: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/4.jpg)
Nacionalno gen. vrednovanje
![Page 5: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/5.jpg)
Međunarodno gen. vrednovanje
Validation criteria :- N daughter min. : 20- N herd min. : 10
![Page 6: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/6.jpg)
Genetski napredak
Genetski napredak =
Genetski napredak je kumulativan i zahtjeva vremenaSelekcijske odluke donesene danas će biti vidljive kroz nekoliko godina
![Page 7: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/7.jpg)
Genomsko unaprjeđenje
• Genetsko unaprjeđenje– Učinkovita proizvodnja mlijeka željenog sastava– Niska stopa izlučenja krava u stadu (zdrave i
dugožive krave)– Odgovor na selekciju koristeći podatke iz kontrole
proizvodnosti• Genomsko unaprjeđenje
– Dodatno korištenje genetskih markera (SNP-ova)
![Page 8: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/8.jpg)
SNP čipovi
![Page 9: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/9.jpg)
Zašto genomska selekcija?
• Izračun gUV već pri rođenju životinje koja je genotipizirana
• Pouzdanost procijenjene gUV ~ 70 %• Kraći generacijski interval (2-3 godine)• Korištenje više mladih genomski testiranih
bikova
![Page 10: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/10.jpg)
Referentna populacija bikova Ocjena SNP efekata
Genotipizirano tele
![Page 11: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/11.jpg)
Genomska UVPedigre index
![Page 12: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/12.jpg)
Broj testiranih bikova prije i poslije genomike
Izvor: https://rodica.bf.uni‐lj.si/web/gov/1603/dw/porocilo.pdf
Smeđa pasmina
![Page 13: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/13.jpg)
Mogućnosti
• Prije genomike– Progeno testirani bikovi – Mladi bikovi s pedigre indeksom (PI)
• Poslije genomike– Mladi bikovi s DNK testom (genomskom UV)– Točnost procjene GUV ~70% u usporedbi sa PI
~35%
![Page 14: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/14.jpg)
![Page 15: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/15.jpg)
Primjena genomske selekcije• Uključivanje u sustav genomskog testiranja
Njemačke i Austrije (Italije, Češke i Slovenije)
• Harmonizacija uzgojnog programa• Povezanost uzgoja
– Odabir bikovskih očeva – Dugogodišnji uvoz steonih junica– Sjeme bikova za u.o. na hrvatskoj populaciji
krava
![Page 16: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/16.jpg)
Broj genotipizirane teladi
![Page 17: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/17.jpg)
Walbaso; uzg. Đurđica Baršić
Uk. SI Mlijeko Meso Fitnes126 112 111 122
![Page 18: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/18.jpg)
Wamures; uzg. Zlatko Mužinić
Uk. SI Mlijeko Meso Fitnes128 120 107 114
![Page 19: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/19.jpg)
Record; uzg. Igor Mihaljević
Uk. SI Mlijeko Meso Fitnes126 118 115 105
![Page 20: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/20.jpg)
Zondar; uzg. Ivan Imbrišić
Uk. SI Mlijeko Meso Fitnes120 116 103 111
![Page 21: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/21.jpg)
Mozilla; uzg. Damir Horvatić
Uk. SI Mlijeko Meso Fitnes130 121 96 125
![Page 22: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/22.jpg)
Uk. SI Mlijeko Meso Fitnes132 130 108 104
Vigor; uzg. Igor Mihaljević
![Page 23: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/23.jpg)
Hevin BB ; uzg. Emina Burek
Uk. SI Mlijeko Meso Fitnes124 127 96 104
![Page 24: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/24.jpg)
Ekonomske koristi za uzgajivača
• Genetski testovi i programi parenja
• Veliki izbor sjemena bikova (svojstva i cijene)
• Korištenje mladih genomski testiranih bikova i preko 50%
• Visoke cijene za genomski testirane junice
![Page 25: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/25.jpg)
![Page 26: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/26.jpg)
![Page 27: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/27.jpg)
Koja je junica najbolja ???
![Page 28: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/28.jpg)
Primjena genomske selekcije
• Uključivanje u sustav genomskog testiranja Njemačke – Genotipizacija ženske teladi i provedba
zajedničkog genomskog testiranja s njemačkim partnerima
– Ugovor o provođenju genomske selekcije između SUHUH i DHV (svibanj 2015.)
– Genomska UV izražena na njemačkoj skali
![Page 29: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/29.jpg)
Broj genotipizirane teladi
![Page 30: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/30.jpg)
![Page 31: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/31.jpg)
Mogućnosti
• Početak uvođenja genomske selekcije • Zadovoljavajući rezultati • Kako dalje
• Kriteriji odabira• Broj genotipiziranih životinja
![Page 32: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/32.jpg)
Genotipizacija cijelog stada
Genotipizacija potencijalno najboljih životinja
Genotipizacija potencijalno najslabijih životinja namjenjenih izlučenju
Genotipizacija ciljanih životinja
![Page 33: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/33.jpg)
Kako dalje ???
• Interbull - Implementacija genomske selekcije za male HOL populacije (IgHOL)
• Potencijalni partneri u projektu– Irska, Belgija, Slovenija, Hrvatska, Češka,
Portugal, baltičke države (Estonia, Litva, Latvija), Slovačka, Južnoafrička republika, Izrael, Urugvaj, …
![Page 34: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/34.jpg)
Prednosti IgHol projekta• Formiranje zajedničke referentne populacije više
država• Genotipizacija krava i njihovo uključivanje u
referentnu populaciju bikova
• Ravnopravni položaj svih članica• Jeftiniji postupak provođenja genomske selekcije• Ubrzani postupak odabira kvalitetnih grla• Povećana točnost procjene genomske UV
![Page 35: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/35.jpg)
Zaključak• Povezanost nacionalne i međunarodne
selekcije– Zaštita dosadašnjeg selekcijskog rada– Mogućnost zaštite genetskog materijala– Očuvati mogućnost selekcije za uvjete našeg
okoliša• Nedostaci
– Gubitak genetskog materijala– Dugoročna ovisnost– Gubitak utjecaja na selekciju
![Page 36: Genetsko i genomsko unaprjeđenje populacije](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022012015/615a2903eb08a372105b8c85/html5/thumbnails/36.jpg)
Dobro je znati
• Procjenjene UV su alat za selekciju još uvijek uzimati u obzir i vanjštinu, zdravlje, …
• Praktični problemi– Životinja nije na popisu (izlučeni ili netočni
podaci)– Uzgojna vrijednost se može kroz vrijeme
promijeniti– …
• Kombiniranje genomske i “klasične” selekcije