getting started with vnmr 6.1c

309

Upload: others

Post on 09-Feb-2022

6 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Getting Started with VNMR 6.1C

������������������������� ���������������

��������������������������������� ������!��"��#���$

Page 2: Getting Started with VNMR 6.1C

�������������

������������ ������������������������������������

������������ ������!��"��#���$

Page 3: Getting Started with VNMR 6.1C

�������������������������� ������������������������������������������������� ������!��"��#���$

�"�������������%&�'���(�)�����*���*���������������������������&�$���(�&++�+������������������� �*���,����-������������������������.����������#���$�(�/�+���+������"����+�+� ���*��0������������������������� �������� �������1!���� �����������������+���0�������� ���������

&��*� ���*������������*%������������� �����������������������0������������������

2� ��� �*� �����������%���"����������!�3���)"�����!�����������.���������!�4�����4������������!�5�����������!�6"�����**�����2� ��� �*��������%��� ���*����*��*��2� ��� �*��+����%�3������*�

������0��� $���!�$���!�$��$����������!�)� �7�$��.���������!���*��&*��!���*�������� 87�8��'���79��8871����%::����"������� � ��&**���0���������"�+��������+��������/����+�������

2�����������������������+� ��������������� �����**�� �� ;�+���+������*��"�+�������������*����*���*���.���"��!��������������*�������������+�������� ��� �����������������������+� �������������������+�+���� ������������������!��<������+�������*��+���� ��� ���������+���������� �� ���� ������� ������������������+�� ����+��������������*�������� ���0�+������������������������� ���������������"���������0��������;�� ���0�������������+� ������������������"����*����*���!���� ����!����+���0����������+�������������������*����*����������0���������������*� �����������������������+� ����� �� ����+�� ����+�������=���������+������� ��"�������*� �������+����������������0��������������0���������������)� *��������������+� ������+�����������*���������������� �*������������������+��+�������������������

������ ���!������������!�����������!��������!�>�����!����� ������!�/�)2?����!�/�)2?!��@!�@,!����!�����!�����@!�����)!������!�����>)!��&>)�&,�))!�&���,� ;!�&������!�&��������!�*���62!�&�!���+���������0������+����+����;��������+����;�����������!�)� ����!��*����!��36!��������**!�/*���!��&�!��&��������!����3!���+��5�������0������+����+����;��������+����;���������� ���������!�)� ����+��&��)�����������*��A<���+��������0������+����+����;����A<���+�)�����������,23�6���������������0������+����+����;����@���<���������������<�A4���+��<�A4��A�663�������0������+����+����;��������+�"���)� ��A��������+� ����������������+� ������������0������+����+����;��������+����;���������������� ��"����*+����

Page 4: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

�����������������

�� �����������������������������������������������������������������������������������������������������

������������ ���������������������������������������������������������������������������������������������������������

�������� ���������������������� �����������������������������������������������������������������

�������� ������� �� �������������������������������������������������������������������������������������

������ � � �����!�"�������������������������������������������������������������������������������������#

������$� � ������������������� ��!������������������������������������������������������"�

������#� � ���������!!��#���#�� �������������������������������������������������������������

������%� $��%������������&'%���!���� �������������������������������������������������������(�

������&� )�*�������+���� ��������������������������������������������������������������������������������

������'� +����$���� ��������������������������������������������������������������������������������(�

������(� +� %,� -�$,������-���#�$���������������������������������������������������������������

�������)� �������-�����������-���#��������+�������������������������������������������.�

�*�++,�������������������������������������������������������������������������������������������������������������/�

����-�������������������������������������������������������������������������������������������������������������������/�

Page 5: Getting Started with VNMR 6.1C

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

Page 6: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

0�1,����������

�� �����������������������������������������������������������������������������������������������������

������������ ���������������������������������������������������������������������������������������������������������

�������� ���������������������� �����������������������������������������������������������������

���������������� ��������������������������������������������������������������������������������������������� $7

.����������������������������������������������������������������������������������������������������������������� � $7

��������������*�� ���������������������������������������������������������������������������������������� � $8

���� ��+� ���0���0������+�������������������������������������������������������������������������� � $9

��$�/����)������ ����������������������������������������������������������������������������������������������������������������� $9

������������������������������������������������������������������������������������������������������������� � $9

�����!�4������+!���+���������������+�*�� �������������������������������������������������� � $1

����3���*��� �������������������������������������������������������������������������������������������� � $1

/���0���*���*�����+���������������������������������������������������������������������������������������� � $'

��7�&+"�� �+�5��������������������������������������������������������������������������������������������������������������� $

B�����0� �������������������������������������������������������������������������������������������������������������� � 7�

��*�����;��0��������������������������������������������������������������������������������������������������������� � 7�

6<������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ � 7�

��*���*���*���+�5)3�� ���������������������������������������������������������������������������������������� � 7�

��*���*��/���*���+��������3���� ������������������������������������������������������������������������� � 7$

�&>)�&,�))��� ���,��0��0���������������������������������������������������������������������������� � 7$

A������*��� ��*�C�+��������� ��������������������������������������������������������������������������� � 77

��8�)����+� ��������/�)@���+�����5�*��� ���������������������������������������������������������������������� 77

/�)@�5�*�������� ���������������������������������������������������������������������������������������������� � 78

����3��� ���������+�5�*��������������������������������������������������������������������������������� � 78

���������&+��������������+�A�����/��������������������������������������������������������� � 7�

��������+��������;��0�3��� ����������������������������������������������������������������������������� � 71

/����,��������������������������������������������������������������������������������������������������������������� � 7'

�������� ������� �� �������������������������������������������������������������������������������������

$���6������0���+�6<����0����� ��������������������������������������������������������������������������������������� 7

2����������� �������������������������������������������������������������������������������������������������� � 7

2��6<������� ��������������������������������������������������������������������������������������������������� � 8�

$�$����;��0�����������������.������������� �������������������������������������������������������������� 8�

������3�"� ������������������������������������������������������������������������������������������������������� � 8�

������#����������������������������������������������������������������������������������������������������������� � 8$

4������+� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������ � 8$

��������������+�*�� ��������������������������������������������������������������������������������������� � 87

����3���*��� �������������������������������������������������������������������������������������������� � 88

���+��+����+�������������������������������������������������������������������������������������������������� � 88

A������*����+���� ���������������������������������������������������������������������������������������������� � 8'

������ � � �����!�"�������������������������������������������������������������������������������������"�

7���& ��"����0���� �� �������������������������������������������������������������������������������������������������������� 97

Page 7: Getting Started with VNMR 6.1C

)��*�������������

%�����&������'(��������� ��� ������� #���$

A�����0���� ���������������������������������������������������������������������������������������������������� � 97

�*����0���� �� ��������������������������������������������������������������������������������������������������� � 97

7�$�/���0���� �� ��������������������������������������������������������������������������������������������������������������� 98

�����0������+��+�6<���������������������������������������������������������������������������������� � 98

�������C��0����3�6<��������� ��������������������������������������������������������������������������� � 99

7�7��������C��0�������������6<���������� ���������������������������������������������������������������������� 9�

��� �����0���+��*�����0�������������6<���������� ������������������������������������������� � 91

��*;������������������������������������������������������������������������������������������������������������ � 9'

������$� � ������������������� ��!������������������������������������������������������"�

8������;��0��������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ��

)����� ��"�����0��������������������������������������������������������������������������������������� � ��

8�$��������C��0���������������� ������������������������������������������������������������������������������������ �8

8�7����������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� �8

8�8���������������� ���������������������������������������������������������������������������������������������������������� �9

8�9������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ �9

8������;��� ������� ��������������������������������������������������������������������������������������������������������� ��

8�1������������ ���������������������������������������������������������������������������������������������������������������� �1

������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� � �1

�� *�����*� ����������������������������������������������������������������������������������������������� � �'

�*"�����*� ������������������������������������������������������������������������������������������������ � �'

�3���*����D��� ������������������������������������������������������������������������������������� � �'

�3���*����D��� �������� ��+���������������������������������������������������������������� � �

$3���*����D��� ������������������������������������������������������������������������������������� � �

$3���*����D��� �������� ��+���������������������������������������������������������������� � 1�

&��*� ���������+������� ����������������������������������������������������������������������������������� � 1�

8�'�& D���������� �������������������������������������������������������������������������������������������������������������� 1�

8� ���� �����0������� �������������������������������������������������������������������������������������������������������� 1�

�3�3������� �����0������ ���������������������������������������������������������������������������������� � 1�

)����� ��"���3�5)3�3���*�������E+�����0���������������������������������������������������� � 1�

�3���� �����0��������������������� ��������������������������������������������������������������� � 1$

)����� ��"�����0����0�����E�������0���� ������������������������������������������������������� � 1$

)����� ��"���3��� �����3���*�������E+�����0������������������������������������������� � 17

$3�3������� �����0������ ���������������������������������������������������������������������������������� � 17

$3���� �����0��������������������� ��������������������������������������������������������������� � 17

$3�)��������0������� �����0������ ������������������������������������������������������������������� � 18

)����� ��"��$3���*�������3���*������������E+ �������0�������������������������� � 18

)����� ��"��$3�3���*������F� ���������E+ �������0���� �������������������������������� � 19

)����� ��"��$3����;��� ;��0����������E**$+����0���� ���������������������������������� � 19

$3����;��� ;��0�&������� �����E**$+����0���� �������������������������������������������� � 19

$3����;��� ;��0�6+�������E**$+����0���� ������������������������������������������������������ � 1�

$3����;��� ;��0�5�*������E**$+����0����������������������������������������������������������� � 1�

$3����;��� ;��0�3���*�������E**$+����0���� ������������������������������������������������ � 1�

8����3���*��������� ����������������������������������������������������������������������������������������������������������� 11

�3�3����3���*����������������������������������������������������������������������������������������������� � 11

�3�3����������*����������������������������������������������������������������������������������������� � 11

�3�3���*����C���*� ���������������������������������������������������������������������������������� � 1'

�3��*�����0������ ����������������������������������������������������������������������������������������������� � 1'

�3�3����3���*���� ��+��������� ��������������������������������������������������������������������� � 1'

Page 8: Getting Started with VNMR 6.1C

)��*�������������

��� ������� #���$ %�����&������'(���������

$3�3����3���*����������������������������������������������������������������������������������������������� � 1

$3�3���*����C���*� ���������������������������������������������������������������������������������� � 1

$3�3����������*����������������������������������������������������������������������������������������� � 1

$3��*�����0������ ����������������������������������������������������������������������������������������������� � '�

$3�3����3���*���� ��+��������� ��������������������������������������������������������������������� � '�

8����&��*�C�������� ���������������������������������������������������������������������������������������������������������� '�

&��*�C������� ���������������������������������������������������������������������������������������������������� � '�

6<��������*�&��*���������� ������������������������������������������������������������������������������� � '�

&������� �36�2�&��*���������� ����������������������������������������������������������������������� � '�

&������� ��A?�&��*���������� ���������������������������������������������������������������������� � '$

&++:����� ������� �������������������������������������������������������������������������������������������� � '$

)����� ��"��&++:����� ������E�++�����0����������������������������������������������������� � '7

�������*���������������� ������������������������������������������������������������������������������ � '7

�������*������5�����3��������������� �������������������������������������������������������������� � '7

�������*������� ��+�3������������������������������������������������������������������������� � '8

�������*������2���+�3���������������������������������������������������������������������������� � '8

�������*������� ��+��������� ���������������������������������������������������������������������� � '8

�������*������,����&���0����������� ����������������������������������������������������������� � '9

3� ��"�*����������� ������������������������������������������������������������������������������������������ � '9

�0��������������� ��������������������������������������������������������������������������������������������� � '�

�0��������$������ ��������������������������������������������������������������������������������������������� � '�

�0��������7������ ��������������������������������������������������������������������������������������������� � '�

8��$�5�*�������� ����������������������������������������������������������������������������������������������������������������� '1

5�*�������������������������������������������������������������������������������������������������������������� � '1

3��� ���������� �������������������������������������������������������������������������������������������������� � ''

3��� ������ ��+������������������������������������������������������������������������������������������ � ''

5�*���)������������������������������������������������������������������������������������������������������ � '

5�*���2��������� ������������������������������������������������������������������������������������������������� � '

5�*���3��������� ������������������������������������������������������������������������������������������������� � �

5�*���3����� ��+����������������������������������������������������������������������������������������� � �

5�*���� ��+��������� ���������������������������������������������������������������������������������������� � �

8��7�� ��+������������������������������������������������������������������������������������������������������������� �

�����0������������� ������������������������������������������������������������������������������������������� � �

������#� � ���������!!��#���#�� �������������������������������������������������������������

9���������+�� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� 7

������+�6������������������������������������������������������������������������������������������������������� � 8

������+�&�0������������������������������������������������������������������������������������������������ � 8

9�$�������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� 8

����������6����� �������������������������������������������������������������������������������������������������� � 9

����������3���*��� ���������������������������������������������������������������������������������������������� � �

������������*���,����������� ������������������������������������������������������������������������������ � �

����������6�����,������������������������������������������������������������������������������������������ � �

9�7�������+�,����6+����0���+�������� ��������������������������������������������������������������������������� �

9�8��� ���&���������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������� '

������%� $��%������������&'%���!���� �������������������������������������������������������(�

������������0��������*�� ������������������������������������������������������������������������������������������������� ���

�*"�����*� ����� ���������������������������������������������������������������������������������������������� � ���

���*��.��0��� �������������������������������������������������������������������������������������������������� � ��$

Page 9: Getting Started with VNMR 6.1C

)��*�������������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

���*����������� ������������������������������������������������������������������������������������������������ � ��$

���*��2����� ��������������������������������������������������������������������������������������������������� � ��7

��$�6F� ���0���+�)�������0��������*�� ����������������������������������������������������������������������������� ��7

2��6F� �������*�!��������������*������0��������������������������������������������������� � ��8

2��)�����������*�!��������������*������0�������������������������������������������������� � ��9

2������0�������*�!�����������*������0���������������������������������������������������� � ���

��7������"��0��������������������������������������������������������������������������������������������������������� ��1

,� ������������������������������������������������������������������������������������������������������ � ��1

2��,�������������������������������������������������������������������������������������������������������� � ��'

2��� �**�&���������������� ��������������������������������������������������������������������������� � ��

2��� �**����+��+���������������������������������������������������������������������������������� � ���

2����������*� ��+������������ ��������������������������������������������������������������������������� ���

2��,��������������>��������������������������������������������������������������������������������������� � ��$

��8����"��0���+�)�������0���������������������������������������������������������������������������������������� ��$

2�����"������������ ��������������������������������������������������������������������������������������� � ��$

2��)������������������������������������������������������������������������������������������������������������ � ��7

��9�/���0�������5�*�����+�2���*������������������������������������������������������������������������������������ ��7

����2����0������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ��7

2��2�������������������� ������+�/�)2?����� ���������������������������������������������� � ��8

2����0����������������������!�����������!��������!����� ������������� ��$9

2����0�����������/�)2?���+��@��������� ���������������������������������������������� � �$1

��1�������0��������*�� �������������������������������������������������������������������������������������������������� �$'

��'�A�����C��0�,� ;� �������������������������������������������������������������������������������������������������������� �7�

,� ;������!�>���!���+������� ��������������������������������������������������������������������������� � �7$

,� ;�������*������+���������������������������������������������������������������������������������������� � �77

,��"��0�,� ;����������������������������������������������������������������������������������������� � �77

�����0����6<���������/�*� ;�+� ������������������������������������������������������������������� � �77

���*��&���*� ;������������������������������������������������������������������������������������������������ � �77

A�����C��0�&���*� ;� ���������������������������������������������������������������������������������������� � �78

5�**�A�����C���������������������������������������������������������������������������������������������������� � �79

,� ;�,�"�*���+��������+�6�����.��+*��0������������������������������������������������������ � �79

,� ;�,����2�������������������*�������������������������������������������������������������������� � �7�

�� �&+F�����0��������������������������������������������������������������������������������������������������������������� �7�

����>��+������ ������������������������������������������������������������������������������������������������� � �7�

�����+�����������0� �������������������������������������������������������������������������������������� � �71

4������+�6����� ������������������������������������������������������������������������������������������������ � �71

�"��0���+������"��0�������*���� ����������������������������������������������������������������� � �7'

�����*�6��*������������0���������������������������������������������������������������������������� � �7

&�������+�������0���������������������������������������������������������������������������������������� � �8�

������0��������������&������������������������������������������������������������������������������ � �8�

���������+������&�������� ���������������������������������������������������������������������������� � �8�

/����3�����+����������+������&�������� ����������������������������������������������������� � �87

)����� ��"��&�������� ���������������������������������������������������������������������������������������� � �88

5�**��&������� �&�������� ������������������������������������������������������������������������������� � �89

#� ;0����+�&���������������������������������������������������������������������������������������������� � �8�

.��+�����&�������������������������������������������������������������������������������������������������� � �8�

��� ����������/���������������#����� ���������������������������������������������������������� � �81

������0�3������������*��>���������� ��������������������������������������������������������� � �8'

Page 10: Getting Started with VNMR 6.1C

)��*�������������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

�����/���0�����& D������������+����������������������������������������������������������������������������������� �8'

A�����0��������+������������������������������������������������������������������������������������������� � �8'

����� ���0��������& D��������������� ������������������������������������������������������������� � �9�

��;��0������� �������3���*��� �������������������������������������������������������������������������� � �9�

����0��0�������������*���������������������������������������������������������������������������������� � �9�

,A�4�3���*����������������������������������������������������������������������������������������������������� � �9�

/���0�*� ;���D����5��+�,� ;������� �� ���������������������������������������������������������� � �97

/���0�������������,� ;�5��D��� ������������������������������������������������������������������� � �97

���*��,� ;��0� ������������������������������������������������������������������������������������������������ � �97

5)3:�� �����������0����+���� ����������������������������������������������������������������� � �99

)����� ��"������������&+F�������� �������������������������������������������������������������������� � ���

������0��������5)3� ��������������������������������������������������������������������������������������� � ���

������0���������� ����� ������������������������������������������������������������������������������ � ���

.)��3���*������������������������������������������������������������������������������������������������������ � ��$

�����������0�/���0�����/*���G�������������� ��������������������������������������������������������� ��9

.��+�����A"��"���������������������������������������������������������������������������������������������� � ��9

)������ ��#�<� ���������������������������������������������������������������������������������������������������� � ��9

������0� ��������������������������������������������������������������������������������������������������������� � ��1

)����**��0�����5����������� ���������������������������������������������������������������������������������� � ��1

5*�����3��;�/��� ����������������������������������������������������������������������������������������������� � ��1

6���*��0�����& D������������+��� ������������������������������������������������������������������� � ��'

2�����0�����������A�����+�A�������������������������������������������������������������������������� � ��'

���$�>��+�����&����������0� ������������������������������������������������������������������������������������������ ��

������&� )�*�������+���� ��������������������������������������������������������������������������������

1��������0�5��D��� ���*���+ ����������� ���������������������������������������������������������������������� �1�

5��D��� �������0���������������������������������������������������������������������������������������������� � �1�

2�������������+�3� ���*�������������0������������������������������������������������������������� � �1$

�� ���*����+��� ���������������������������������������������������������������������������������������������� � �17

1�$������0���*����D��� ���*���+ ����������� ������������������������������������������������������������� �17

���+��+�2�����*�������������� ����������������������������������������������������������������������� � �19

������+�����������0������������ ������������������������������������������������������������������� � �1�

2���H�����I���� ���� ��������������������������������������������������������������������������������������� � �1'

A����"��2�������������+�3� ���*��0������������ �������������������������������������������� � �1'

3� ���*�����+������������������������������������������������������������������������������������������������� � �'$

2������������*���+�������*� ��������������������������������������������������������������������������� � �'8

2������������*���+���������������������������������������������������������������������������������� � �'8

��*��+�5��*+�>��+������*���+������������ ������������������������������������������������������� � �'9

1�7��������0���+�6+����0�6<���������2�<��5�*����������������������������������������������������������������� �'9

�������0���+�6+����0���2�<��5�*������������������������������������������������������������������������� � �'9

3���*����0���+�.��+*��0���2�<��5�*������������������������������������������������������������������ � �'�

1�8����������0�& D������������������������������������������������������������������������������������������������������� �'�

)��������0�& D������������������������������������������������������������������������������������������������� � �'�

������0�3����0����& D������������������������������������������������������������������������������ � �''

B������0�& D���������� ������������������������������������������������������������������������������������� � �'

������+�& D��������� ����������������������������������������������������������������������������������������� � � �

������0���+�������0�& D��������� ���������������������������������������������������������������� � � �

������0!�.�*���0!���+�&������0�& D�������������������������������������������������������������� � � �

3������� ��������+�A"���*������������������������������������������������������������������������������� � � �

&������� ���� �����0���������������������������������������������������������������������������������������� � � $

Page 11: Getting Started with VNMR 6.1C

)��*�������������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

& D������������������+��� ������������������������������������������������������������������������������ � � 7

� ��"���>���� ��������������������������������������������������������������������������������������������������� � � 8

.�������*� �������������������������������������������������������������������������������������������������������� � � 8

5�*������� ����� �������������������������������������������������������������������������������������������������� � � 9

������& D��������� ������������������������������������������������������������������������������������������ � � 9

& D���������)����������� ����������������������������������������������������������������������������������� � � �

& D�����������������+������������������������������������������������������������������������������������� � � 1

����6����������0��� ������������������������������������������������������������������������������������ � � 1

������,�"�*�&��*��������������������������������������������������������������������������������������������� � � 1

1�9�&��*���0�3�0���*�5�*�����0� ����������������������������������������������������������������������������������������� � 1

2��������3�0���*�5�*�����0� ��������������������������������������������������������������������������������� � � '

������*����3�� ������������������������������������������������������������������������������������������������� � �

)�*����3�� �������������������������������������������������������������������������������������������������������� � $��

��*�2����3��������������������������������������������������������������������������������������������������� � $��

����� D���������3�� ����������������������������������������������������������������������������������������� � $�9

���"��0�B��+�������&����� ���/���0�3������������������������������������������������������� � $��

2��&��*��5��D��� �������+�B��+�������3��� ���������������������������������������������� � $�1

������'� +����$���� ��������������������������������������������������������������������������������(�

'������0����0�5�� ��������������������������������������������������������������������������������������������������������� $�

'�$�)����� ��"�����0����0�������������������������������������������������������������������������������������������������� $��

'�7�5�������2�������������� ���������������������������������������������������������������������������������������������� $��

'�8�������0������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ $�$

����������������� ���������������������������������������������������������������������������������������������� � $�$

&���������&*0������� ��������������������������������������������������������������������������������������� � $�7

�� �����3���*��� ��������������������������������������������������������������������������������������������� � $�7

'�9�&+"�� �+�3������� �����0� ���������������������������������������������������������������������������������������� $�8

5)3���������������������������������������������������������������������������������������������������������� � $�8

5��D��� ��������0� ������������������������������������������������������������������������������������������� � $�9

3������� �����0������+�� ��������������������������������������������������������������������������������� � $�9

,���������+� ����� ���������������������������������������������������������������������������������������������� � $�9

�*"��������� �����5�*�����0����������������������������������������������������������������������������� � $��

)����*��"��5)3�� ������������������������������������������������������������������������������������������������� � $�1

������(� +� %,� -�$,������-���#�$���������������������������������������������������������������

���)����� ��"��5)3���+��� �����3���*��� ���������������������������������������������������������������������� $�

3���*��������������������������������������������������������������������������������������������������������� � $$�

�*�����0� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������� � $$�

�$�)����� ��"��5)3�3���*��� ��������������������������������������������������������������������������������������������� $$�

5)3�3���*���������������������������������������������������������������������������������������������������� � $$�

������**��0�����������+�5)3�)��������� ������������������������������������������������������������� � $$$

)����� ��"��5)3����+����0������������������������������������������������������������������������������� � $$7

)����� ��"��������0���+�� ��������������������������������������������������������������������������������� � $$7

�7��� ;�+���+�����������+�5)3�3���*�����+��*�����0� ������������������������������������������������ $$8

�� ;�+�5)3�� ���������������������������������������������������������������������������������������������������� � $$8

����������+�5)3�� ������������������������������������������������������������������������������������������� � $$9

�8�)����� ��"���� �����3���*���������������������������������������������������������������������������������������� $$9

)����� ��"���3��� �����3���*��������� ��������������������������������������������������������� � $$�

������**��0���������������+��� ���*�)��������� ������������������������������������������������ � $$1

)����� ��"���� ���*����+����0���+��������������������������������������������������������������� � $$'

Page 12: Getting Started with VNMR 6.1C

)��*�������������

��� ������� #���$ %�����&������'(���������

)����� ��"��������0���+�� ��������������������������������������������������������������������������������� � $$'

)����� ��"��)���0��*��������+�� ����������������������������������������������������������������������� � $$

)����� ��"��J�������+�5�����A�+���#��������� �������+�� �������������������������������� � $$

�����0�����)���0��*���*��� ��������������������������������������������������������������������������������� � $7�

�����0����������� ������������������������������������������������������������������������������������� � $7�

)����� ��"��)�����3���*�������������������������������������������������������������������������������������� � $7�

�9��� ���*�3���*�����+��*�����0� ������������������������������������������������������������������������������������ $7�

3���*��������������������������������������������������������������������������������������������������������� � $7�

����� �*� �*��&+F�������� �������������������������������������������������������������������������������� � $77

,����,�����0������������������������������������������������������������������������������������������������������� � $78

,�������*������ ������������������������������������������������������������������������������������������������ � $79

������ ��0�������������������������������������������������������������������������������������������������������� � $79

�� ���*��*�����0� ����������������������������������������������������������������������������������������������� � $71

3���*���,������ �������������������������������������������������������������������������������������������������� � $7'

���)���0������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ $7'

3���*����0�)���0��*��������������������������������������������������������������������������������� � $7'

#���*��������� ����� ������������������������������������������������������������������������������������������ � $8�

)���0��*������������������������������������������������������������������������������������������������������ � $8�

)���0��*��0����������������������������������������������������������������������������������������������������� � $8�

)���0��*�3���*�����+��*�����0����������������������������������������������������������������������������� � $8�

�1��*�����0������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ $8$

�*������A������ ��������������������������������������������������������������������������������������������������� � $8$

�*�����������0�������� ���������������������������������������������������������������������������������������� � $87

�*���������*��������+����+����������������������������������������������������������������������������� � $89

�*� ���0����*��������������������������������������������������������������������������������������������������� � $89

��*����������0� ��������������������������������������������������������������������������������������������������� � $89

�*�����0�����������,�������+�2�<��5�*��������������������������������������������������������������� � $8

�'��*���3���0������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ $9�

�������D�������������������������������������������������������������������������������������������������� � $9�

������0��*���3���0������������������������������������������������������������������������������������������� � $9�

�������C��0����*��� ������������������������������������������������������������������������������������������� � $9�

&+F�����0���+��������0��*����������������������������������������������������������������������� � $91

��"��0�A�F� �����+�����0��0�A�F� ���C�� ����������������������������������������������������� � $9'

����0��0������������������*���3���0�������+��� ������������������������������������������ � $9'

����0��0������C����������*���3���0�������+��� ��������������������������������������������� � $9'

�"��0�?�����*�������������������������������������������������������������������������������������������������� � $9

�������0�?�����*��� ��������������������������������������������������������������������������������������������� � $��

6<����0��*���3���0���� ��������������������������������������������������������������������������������������� � $��

� ��������0������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ $��

����/����������**��*��,����3�����0� ����������������������������������������������������������������������������� $��

�������)� �������-�����������-���#��������+�������������������������������������������.�

��������;��0������3��� ���������+�5�*��� ������������������������������������������������������������������������� $�7

3����*��3��� ��������������������������������������������������������������������������������������������������� � $�7

�������0���+�������*����0�3��� ������� ������������������������������������������������������������ � $�8

�������0���+�������*����0�5�*��� ���������������������������������������������������������������������� � $�8

���$������0�3���� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������� $�9

6<���������5�*�������������������������������������������������������������������������������������������������� � $�9

�"��0�3���� ������������������������������������������������������������������������������������������������������ � $��

Page 13: Getting Started with VNMR 6.1C

)��*�������������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�"��0������������ �������������������������������������������������������������������������������������������� � $��

�"��0��������*������0���������������������������������������������������������������������������������� � $��

���7������"��0�3���� �������������������������������������������������������������������������������������������������������� $�1

/���0���!����!���+�������������"��5�*��� �������������������������������������������������������������� � $�1

/���0��36�5�*������0�����������"��3���������������������������������������������������������� � $�'

����� ���0��"�+��������������� ��������������������������������������������������������������������� � $�'

/������������5)3�5�*��� ������������������������������������������������������������������������������������� � $�'

���8�2����������0�3����/���0�6����������+�*���62� ������������������������������������������������������� $�

2����������0�3����/���0�6����������������������������������������������������������������������������� � $�

2����������0�3����/���0�*���62� ��������������������������������������������������������������������� � $1�

5�*������<��������������������������������������������������������������������������������������������������������� � $1�

)��������0�2������������������������+����������������������������������������������������������� � $1$

6����������0��������*���62� �������������������������������������������������������������������������� � $17

���9����"�����0�3����#���������������������������������������������������������������������������������������� $18

���"�����0�2�<��5�*��� ��������������������������������������������������������������������������������������� � $18

���"�����0�3����5�*������������������������������������������������������������������������������������������ � $19

3� �������0���,������� ������������������������������������������������������������������������������������ � $19

�����������6<���*�������*���62����������������������������������������������������������������� � $19

���"�����0�#��;���3���� ����������������������������������������������������������������������������������� � $1�

�������0���� �2����A���������� ��������������������������������������������������������������������������������������� $1�

��+��0�2����������>�����!��@�8���!���+�@,�������� ���������������������������� � $11

��+��0�#��;���3����5�*�������� �2�� ;�2���� ������������������������������������������������ � $1'

�����0���2���������������;� ��������������������������������������������������������������������������� � $1'

��"��0�3�������������+��� ���������"���5*�����3��;������������������������������������ � $1

���1�����������0�3�������������������������������������������������������������������������������������������������������� $'�

����������0���+�/� ���������0�5)3�3����5�*��� ������������������������������������������� � $'�

����������0�3�0���**��5�*����+�5)3�5�*��� �������������������������������������������������������� � $'�

����������0�3���*����� ����������5)3�3���� ������������������������������������������� � $'�

�*�++,�������������������������������������������������������������������������������������������������������������/�

����-�������������������������������������������������������������������������������������������������������������������/�

Page 14: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

2� ����3�����

�����������0���!������!���+�&��� ����+�6*� ����� ��� ����������������������������������������������������������������� �$�

������������3���*��� ������������������������������������������������������������������������������������������������������� �$1

������������ ��/����)������ ��� �������������������������������������������������������������������������������������������������� �$'

�����������36�2��*��������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� �$'

������� ����+����������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� �$

���������5����*� �����+���� ������������������������������������������������������������������������������������������������������ �$

���������5�*����� �����A"��"����� ����������������������������������������������������������������������������������������������� �79

�����������������������+�*��� ������������������������������������������������������������������������������������������������� �87

�������������3���*��� ������������������������������������������������������������������������������������������������������� �88

�������������������+�����+�)��������+��������������������������������������������������������������������������������� �89

���������������������#��������������������������������������������������������������������������������������������������������� �8�

���������2��� �*�����������3���*������dg����0���������������������������������������������������������������������� �81

�����������A�A,6���+�������**����+����� �������������������������������������������������������������������� �8'

������������� ��/����)������ �����+�������������������������������������������������������������������������������������� �8

�������� ����;��� ���������+���A������+����� ��������������������������������������������������������������������� �9�

�����������36�2��*�������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� �9�

����������) ���������*���+��������+����� ���������������������������������������������������������������������������� �9�

������������� ��/����)������ �����+�������������������������������������������������������������������������������������� �97

�����������A?��������C���������+���� ���������������������������������������������������������������������������������� �91

���������.�B���������C���������+���� ��������������������������������������������������������������������������������� �91

������������*��3�����)�+� �������������������������������������������������������������������������������������������������� ���7

��������2/�6�)�265&�6�����*����������������������������������������������������������������������������������������� ���9

���������������2����0����+���Kqtune����0���L�� ��������������������������������������������������������������� ���1

���������������*�3���*�����+����������2����3���*���� ���������������������������������������������������������� ���'

������� �2����������*�����*�Kqtune����0���L�� �������������������������������������������������������������������� ���

�����������**�3��������������������5��D��� ����� ���������������������������������������������������������������� ���

�����������**�3���������5����������������������������������������������������������������������������������������������� ��$�

������������������+�>��+�������*��� ����������������������������������������������������������������������������������������� ��$�

�����������**�3����������������;��������������������������������������������������������������������������������������� ��$�

���������� �*��������*�������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ��$$

����������2������*������������+���� ���������������������������������������������������������������������������������������� ��$7

���������.�*����**�3���������� ��������������������������������������������������������������������������������������������� ��$9

��������������)��������������,A�4�3���*���Kacqi����0���L�� ��������������������������������������������� ��$'

�����������������������*����+���Kspinner����0���L�� ������������������������������������������������������ ��7�

�������� �& D������,� ;�3���*����Kacqmeter����0���L�� ���������������������������������������������������� ��7�

����������,� ;�5��D��� ��& D������������+�������������������������������������������������������������������������� ��79

����������& D������������+���Kacqi����0���L����������������������������������������������������������������������� ��8

����������&����"����+�& D������������+���� ���������������������������������������������������������������������������� ��9�

����������,A�4�3���*������+���Kacqi����0���L�� ��������������������������������������������������������������� ��9$

����������5��+��0�,� ;�� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������ ��98

Page 15: Getting Started with VNMR 6.1C

+�������,�&����

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

����������A�����0���*����5)3:�� �����3���*������+���Kacqi����0���L�� ������������������������ ��99

�����������*��$�5)3�������0�3���*��������*������Kacqi����0���L�� ������������������������������� ��9�

����������&�������������+�6+���������*�Kacqi����0���L�� ���������������������������������������������������� ��9

������������ ��������5)3:�� �����3���*������+���Kacqi����0���L��������������������������������� ����

�������� ��� �����3���*������+��������)�&�Kacqi����0���L�� ������������������������������������������� ����

����������.)��3���*������+���Kacqi����0���L�� ���������������������������������������������������������������� ���$

����������&������+�����+���Kacqi����0���L�� ��������������������������������������������������������������������� ���7

����������/*���G���������������)������ ��������*����+�3���*��������������������������������������������� ����

��������������������0������� ���*����+���� ����������������������������������������������������������������������������� ��17

������� ��& D���������������������������+��+�2�����*����D��� ��� ������������������������������������� ��19

������� ��>����� �*���*����D��� ��3���*���Kdps����0���L�� ������������������������������������������������� ��11

������� �3���*������������������*�Kdps����0���L������������������������������������������������������������������� ��11

������� �����������#���������+���Kdps����0���L�� ���������������������������������������������������������������� ��1'

������� ��,�0� �*������+��&!�#!���������+��+�2�����*����D��� ��� �������������������������������������� ��1'

������� �&���������������0���������K����������$L�� ������������������������������������������������������������������� ��1

������� ��&���������������0���������K�����$����$L�� ������������������������������������������������������������������� ��'�

������� ��2�����������������*����+���� ���������������������������������������������������������������������������������� ��'8

������� ��& D������������+���Kacqi����0���L����������������������������������������������������������������������� ��''

������� ��.)�����+���3����0�& D���������Kacqi����0���L�� ��������������������������������������������� ��'

����������& D������������������+���Kacqstat����0���L����������������������������������������������������� �� 7

����������& D���������������+���KAcqstatus����0���L�� ������������������������������������������������� �� 8

���������3�0���*�5�*������������+����&��*�0�5�*������ �������������������������������������������������������������� �$�$

����������)����� ��"��5)3�3���*���Kdf����0���L����������������������������������������������������������������������� �$$�

����������)����� ��"���� �����3���*���Kds����0���L�� ������������������������������������������������������������ �$$�

�������� ���*����*� ��������+���Kcolor����0���L�� ������������������������������������������������������������ �$8�

����������$3���������*����*� ��������+���Kcolor����0���L���������������������������������������������� �$81

����������$3�&���*������*����*� ��������+���� ��������������������������������������������������������������������� �$81

����������)��0����*����*� ��������+���� ������������������������������������������������������������������������������� �$8'

�����������*���3���0�������+�������������������������������������������������������������������������������������������������� �$9�

�������������+����������� �������*�� ��������������������������������������������������������������������������������������� �$9�

�������������+��������3������+���������#��+������+���>��+�� ����������������������������������������������� �$9$

����������0����6+��������+������������������������������������������������������������������������������������������������� �$98

����������menu�5�*��� ����������������������������������������������������������������������������������������������������������������� �$99

�����������*�����������+������������������������������������������������������������������������������������������������������� �$99

�������� �)������������ ������+���� ���������������������������������������������������������������������������������������� �$9�

����������2�<��)��������+���� ��������������������������������������������������������������������������������������������������� �$9'

�����������*����"�����+���� ���������������������������������������������������������������������������������������������������� �$9

Page 16: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

2� ����0�1,�

��������6������0���+�6<����0������������������������������������������������������������������������������������������������ �7

�����������)������ ����+�3���*���2��*���������������������������������������������������������������������������������� �8$

�����������������������K����������7L� ��������������������������������������������������������������������������������� ���

�����������������������K�����$����7L� ��������������������������������������������������������������������������������� ��$

�����������������������K�����7����7L� ��������������������������������������������������������������������������������� ��7

���������� ��*�4������������,����6+����0� ���������������������������������������������������������������������������� � 1

������ �&�������+�& D����������� ����� ������������������������������������������������������������������������������������� � '

��������&�������+���*����������� ����� �������������������������������������������������������������������������������������� � '

��������&�������+��*�����0��� ����� ������������������������������������������������������������������������������������������� �

��������&�������+���� �����0��� �������������������������������������������������������������������������������������������� �

�����������*��2����3������ ����������������������������������������������������������������������������������������������������� ���$

������������*������0��0�������+����+������������������������������������������������������������������������ ���8

��������������"��0���������������������+����+����������������������������������������������������������� ���1

��������������5�*���� ������+������������������������������������������������������������������������������������������ ���7

���������������2����0�������+�� �������������������������������������������������������������������������������������������� ���8

������������*��������0�������+����+������������������������������������������������������������������������� ��$

������� �,� ;�������+����+������������ �������������������������������������������������������������������������������� ��7$

���������.���0�������&+F��������������+����+����������������������������������������������������������� ��7'

������������������*��������0�������������*���� ��������������������������������������������������������������������� ��8�

�����������+����������+��+�����>��+������������������ ������������������������������������������������������ ��8$

���������.�<�+� ���*���+�����������>������ ������������������������������������������������������������������������� ��87

��������)����� ��"��& D���������������+����+������������ ��������������������������������������������������� ��8

��������>��+���������&"��*���*���������������������������������������������������������������������������������������������� ��1�

�������& D���������5��D��� ���*���+�������+����+������������ �������������������������������������� ��1$

��������& D�����������*����D��� ���*���+�������+����+������������������������������������������ ��18

��������6<���������2�<��5�*��������+���������������������������������������������������������������������������������� ��'9

������ �������+����+����������������& D�����0�3�������������������������������������������������������������� ��'1

��������5��*+���������& D������������������+���K� D��������0���L� �������������������������������������� �� 7

��������3�0���*�5�*�����0�������+����+������������ �������������������������������������������������������������� ��

����������<�������*��������sw*oversamp���+�np*oversamp� ������������������������������������� �$��

�����������0����0���+�5�������2���������������+�!��� ���!���+������������� ������������������ �$��

���������������0��� ����������+����+������������� ������������������������������������������������������������ �$�$

���������&+"�� �+�3������� �����0�������+����+������������ ��������������������������������������������� �$�8

��������)����� ��"��5)3�3���*���������+����+������������ �������������������������������������������������� �$$�

���������5)3�3���*�����+��*�����0�������+����+������������������������������������������������������������ �$$8

���������)����� ��"���� �����3���*���������+����+������������ ����������������������������������������� �$$�

������� ��� ���*�3���*���������+����+�������������������������������������������������������������������������� �$7$

����������� ���*��*�����0�������+����+������������ ������������������������������������������������������������� �$77

���������)���0��*�3���*�����+��*�����0�������+����+������������������������������������������������������ �$7

����������*�����0�������+����+������������ ��������������������������������������������������������������������������� �$8$

Page 17: Getting Started with VNMR 6.1C

+�������)��*��

%�����&������'(��������� ��� ������� #���$

������������;��� ���������� ��������*�� ���������������������������������������������������������������������������������� �$9$

����������*���3���0����2��*�� ����������������������������������������������������������������������������������������������������� �$97

����������0����6+�����#�������������������������������������������������������������������������������������������������������� �$99

��������5�������&"��*��*������*���3���0���� ���������������������������������������������������������������������������� �$9

�����������������&��� ����+�������+����+������������ ���������������������������������������������������������� �$��

���������/����������**��*��,����3�����0�������+�� ������������������������������������������������������������� �$�$

������� �3��� �������+�5�*��.��+*��0�������+����+������������ ������������������������������������������� �$�8

���������3��������0��������+����+������������ ������������������������������������������������������������������� �$�9

���������3���������"�*�������+����+������������ ����������������������������������������������������������������� �$�1

���������6����������+�*���62�3����2��������������+�� �������������������������������������������������������� �$�

��������� ���������������������������������������������������������������������������������������3�������"�������������+���$18

������ ����0���� �2����A����������������+�� ����������������������������������������������������������������������� �$11

Page 18: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ������� #���$ %�����&������'(���������

�� ���������������

2�����**����0�������0���+� ����������� ����**���������������*�����+����������������*���������������� ����������� �����+��<�*����������� �������������+%

.������/ .����+������ �#��������,��������1 ������� �������� ����%��������� ����,#��� �,�������4�� ����#����������!�� �������!�, -���� ����������%��%��� �#�!����

�������/ ������+������ �#��������,��������1 ������� �������� ����,#��� �,����� ����� �#�!��������*��%!�������,� ���#����

5�������������

�"��#���$��%&��&'������(���&�����������������&�!�&����&�!�)������(�!��������

&%��$�������)���*�+������&�(&)��,�'��$��$����'�����!�&�'��$����(�%�(�'������

����'$����������)����!�#�&������%��,��������&%�������!�)��%(���!����

�������������&%��$�������)���*��������)����&���"����,�%&�(���&)��%������&�(&)��,�

'��$��$������(���&��*

.������/ $�� �� �������!%,����#�����������#�!�#���,�#����� � ����� �%���!�6�� ���#�%�� �������%��� �!� ����!������� �#������"7��� �%���!�������!�����������,����������!������

2�������� ��+� ���0���0�����������0��������������0���0���� ����*+������� ������� �������������������� ��+�� ��� ���;���������������*����+�������� ��+�+�"� ����� �������������� ���������+�����*��*��+�"����*� *������+� *������

�� ���;���������������*+� ����*����������������*����"�+�+���������� ���;��������� ��������� ���� �������� ���;��������� ���������+����������������� ���������� ��� ��� ���;������ ���;���������������*+��*����*����������������������� ������+�+�� �����������*������;���������0�������<�����������0���� ����*+������������������*���������� ����+����*���������*+� ���� ������������� �������+��������������+��0����<������

�����������������*������*��+������������0��������������C����������� �*�9�0��������������*+��2����0�����*�"�*�����*+���� �� ;�+�������������0������������**�+�

.������/ 8��%�!���,��14��� ���� �#�������(7��� �%���!�������!�����������,����������!������

2��������0���0���� ����*+��������+��0�������0��������� �����F� ��� ��������0�����*!�����!�����������������0���� ��������*�!���� ���� *�+����������+���������*�!��*� ����� ��D�������!� ��������+�0��� �*��+���!�����*� �����!���+�����*� ������/�*�������������+!��� ����F� ��� �����++��*���*�������+��������0���!� �����0�������*���������*���F������+��<�����"��+���0��������������!�+����!���+������ ��+� ���0���*����+��2���0�������������������������F� �!����������������0��������� ���������F� ���

A�*������������0���� ��������*�E�*���� �!��*������!����+!������0���� ������*��������*!��� �E����*+�������+������������������+�������0�����)�������F� �������� ;����������0��������� ����+� ����������*���������"�+�������+!� ���� ������������"� �������������� ��

Page 19: Getting Started with VNMR 6.1C

-,.)/��.�-0)12�

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

5������������� �9���������:

�����������������*������*��+������������0��������������C����������� �*����0��������������*+��2����0�����*�"�*�����*+���� �� ;�+�������������0������������**�+�

.������/ ��, �*��,���#�!�����������%�� ����,� ��,,���!�����*��%!��������� ����!�6���������,��#4� �!��� �

3��0��������0��"�*��0�������� ���;�**������F�����<��������+������������������#���������;��0�����+���� ������!������������������������������������ ��*� ���+���������� ;�������� ����*���

.������/ +������ �1 �������%��� ����!�#� ������� ���!����

&������������C�+���+��� ������ ��*+���F������������*����+���0���D����������+���������**��������������������������0�����������+:������"� �� ����� ������������������C�����������"�+������������!�)� �����+� ������0��������D����+�������*���������� ���0�������������+����������������������� ����������������������������������������������0�����������"� �����������������"� ������ ���

.������/ +�������%�������������%�� �������,�!!�1,���� � �����!� �

A���������������*�����*��0���������������������� ��������������;������F�������+������������<� ������!��<�*�����!���������

.������/ 2�����������!!�#����, ������������������!������*������

)��������0����+���������*+�D��� ��K��++����������� �����0��������������������������+����L!�*��"���������������+����*����++�����*����������*������������0���0����� �������+*��+���*� ���<�0����������� *���+���� �� ������0����������*������������<��������3�����������������*������<�0���*�"�*�����������������*�

.������/ )���#���,��!���������������������������� �%����������1�# �

)�� ���� �������������+�!���*������+������0��� ��� ����������F��������*����������������"����*� ����������+��"���������*������+������0����<�������������������������0�����)����*������������0��� ���� ���������+�!����;�����+�������+� �*����������!����� ��**����������;�������*������+��������������������� ��+�

.������/ +������,��6�#���������%%���1����,�

/�*���������������������"�+������������0���!���"���*��;�+�������������������*��?��� ��*+������F���+������������*��������������F� ����������� �**�����������������

.������/ +�������'���#�����1��,����������;����%��������� �!%,��#�����������1,����!%���������'%���!��� �

&�����*����������F� ��+������ ���0����������������� ������*+�����< ����"����������!���� �� �������;���������*�������0*������+� �������F��������*���0�0*������+���<� ��������*���2���"��+��������C��+!������*������������C��0���+����*��0����������������*���������+���0���"�����*���������������<���������

Page 20: Getting Started with VNMR 6.1C

-,.)/��.�-0)12�

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

5������������� �9���������:

.������/ ��%%��������!��������#�%������������!���%%���������

2�����0����+�������������0�� ���������0��"������+� ��*+������"��������������D��;���������������0����� ;������*��0����F� �!���F����0���������*���+� �����0���++��!�+��0��������*�������������0�����+���*����0���������������+������2��������!�������0��������������������+�������*���������������������+�%������������������+�+���������� ��*��0�����������������"���������*�0����*��+���������*�������������������������&��-����������������+����*��

.������/ +��������!����������,�����,�� ���������������1� �

2�����*����"�*"������"��������������������0����������0�����+���*����"�����������&���������������������0���� ���������������������� �������C�!� �����0��*� ;�0���������"������������+�������*���<�����"��+���0�����������0�����)�� ��*+��*��� ���������++���+��0��������*�������������0�����+���*����0��������������+������6< ��������������������0������0��������*���!���� ������������������*����"�*"��������� ���+��������"����������

.������/ ���!����� ��������!���1,��*��������1� -�6��%�������1� ����%,�����'��%��#��������,��!� ���������

A���������$������+�7����.C�98������0�������*�!�����+������� *�+�������"��*����*����"�����������)��������0����+���������*+�D��� ��K��++����������� �����0�������������������������+����L���+�����"����������������������*� �!�������*����0������*+����������**��"����+���+�����!�������*����F����0������;�����+�����������������*�����+��������0�����3����0���*�������"� ��0!����������������������������"�+!���**��� �����**������������ ��������+����������� ��������0�"���������������*�����*��+������������0����

�������������

�"��#���$��%&��&'������(���&�����������������&�!�&����&�!�)������(�!��������

&%��$�������)���*�+������&�(&)��,�'��$��$����(���&��!�&�'��$����(�%�(�(���&�������'$���

�������)����!�#�&������%��,��������&%�������!�)��%(���!�����������������&%�

�$�������)���*��������)����&���"����,�%&�(���&)��%������&�(&)��,�'��$��$����

��(���&��*

�������/ 8��%�!��������!�#��-�)0����#����#������# -���#������� ���� �#������"7��� �%���!�������!�����������,����������!������

2��������0���0���� ����*+��������+��0�������� ��+� ���0���0���� �����������0���� ���+����� ������*�����+��;����+��������2������*+� ����*���+���0�����������������0���� ���+�������+���� ��+��� ��+�!��������� ���**����� �����K&2�L� ��+�!���+�����*����*���� � ��+����������������+��� ;������ ���������*������ �����*�����+���0�����������������0��������

�����������������*������*��+������������0��������������C����������� �*�9�0��������������*+��2����0�����*�"�*�����*+���� �� ;�+�������������0������������**�+�

Page 21: Getting Started with VNMR 6.1C

-,.)/��.�-0)12�

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

������������� �9���������:

�������/ 8��%�����$ -�9���,�#��������2��0)�����6 ������:�1� ��#�����"7��� �%���!�����������!������

&"��+��D��������+���0�����+����*�������;�����0�����K�� *�+��0�����,�����;����������L���**�����������������0�����>�����**�!�;����������������+�����9�0������������������������0�������������������������&��-�������������������0�������*+��*����

�������/ ���6���,��!���#������������ �,��!���� �#��, �

� ��+��������+��0����������*����������������0�*�"�*��2������+��0����**�"��������������� �������� ���0��������������� �������������������������������)���������+��0�������������0�������*+� ���0��������*�!� ���� ��D��*����+���������� ����������*��5��*������� ���� ������ ���������������*����+��0�� ��*+�����*������<�����"���D��������+���0��

�������/ �������%������ �,�# �����7%������!%,���� ������,�*��# �%��1� �

A�����������������*�+����0�����������*������!���"������������������*��������������*�D��+���������2�����0���������"��*��*����������������*���������**�+�������*�D��+����������/���������������������0�������������������������0�����������*������

�������/ 0�6���,����� ������#� �������9&�+:�%��������� ��������#�#�!������� �� �������,�����������!%����� �

�����0����+�+���������� ���������+�����D��"�*�������������� ���0���������������+������+�������+� �"�������������� �����������������&*��!���;��63���� ����������������;��0�����������<����+� ��*�� ���� �������������� ;�������� ����*��

��#��73��*���� �&!� ��������,�����

2��� �"������������������������������������������+������D��� ��K��L�����0������"��0������������ �"���������+�����0��������������������*��+������ �����+���� ������*�������������������� ��������������������������+������� �����������������0������������+����������������������"��*�����������0�*������� �"����0���������������)�����������������M������������*������������������������������������ ��+�����������+��������"��*������������������D����������

Page 22: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

�����������

2���������*����+���0��+����� D����������������������� �������������0������������0������*������������ ����������������������0����������K�������������M��������*� ����������������� ;�0�L��2��������*� ��������������**����0� �������%

G ���������!�HA"��"����������������!I������+� ������������������������������!����������������� �!��+"�� �+���������!���+�����������+�/�)@���*���������0���C�+�

G ��������$!�H����#��� �!I� �"�����������0���+��<����0�������+����;��0���������������������� ��������

G ��������7!�H/���0�>,)36!I��<�*������������� �������� �!�������������� ��+���0��+�������*;�����������������

G ��������8!�H/���0�������������������!I� �"��������0�����������������������������������!��������������������� �����������*�������������������

G ��������9!�H/���0�����������+���+�!I� �"������������ ���������0����� �����+���+����������� �����+�!��� ���!���+�����������������0��

G ���������!�H��������0��������6<��������!I�+�� ��������������������������������<��������!��� *�+��0���������0���+���������0���������*�!������0����������!��������0���������*�!�������C��0�*� ;!���+��+F�����0�������

G ��������1!�H& D�����0�3���!I� �"����������0�����������!�����0��<�����������<����*��!����������0�� D��������!���+����*���0�+�0���*���*�����0�

G ��������'!�H3������� �����0!I�+�� ���������0����0���� �����!�5���������������������!�������0!���+��+"�� �+�+������� �����0�

G �������� !�H3���*��!��*�����0!���+��������0!I� �"����5)3���+���� ����+���*��!��*�����0!�����0������!��������0!���+������ �����**��*��*����+�����0�

G ����������!�H�����0!������"��0!���+���"��0�3���!I��<�*��������;��0������+��� ������!���*��!���+�+���!��� *�+��0�6�������!���0���� �����!���+�+���� �����������

2��������*��*��� ����������0*������� �"����0� ������������������+�����������

���������,����������

2�����**����0����������*� ��"���������������+������0������**����������*�%

G Typewriter-like character���+�������������+�/�)@� �����+�!�����������!�+��� ������!���+���*�����������������<��������������*��5����<���*�%

2���shutdown� �����+�����������/etc�+��� �����

G Typewriter-like character���*����������<��+���*���+��������� ����!��� *�+��0�������<��� ���+��������� ������������������ �����+���5����<���*�%

Self test completed successfully.

G 2�<������������������0*�+���� ;��������������<�����������������*��5����<���*�!�������������<����seqgen�s2pul<.c>!��������0�����H.cI������<�����������*!���+������0�seqgen�s2pul.c����seqgen�s2pul������� �����**������������

G ,����������<�� ��������0� �����+������<!��<���*����������������!����� �� �+�!���+�����*����������*���������������*��0��������������+������������0���2��������������*���������<����+����������;������������������������*!�����*������� �������� ��"�������������K�� ��

Page 23: Getting Started with VNMR 6.1C

1����'� ����

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�������� ����������������0����+0��������� �*���L!����� ;�*����K\L�����������+�������� ��!���+�����*������� �������+����������<��*���������<���2���������������**��������*������������0������������������������� ;�*�����������������������*������+!��< �������������� �� �+�!�����*+������������+�������������0�����*�����

G #� ������������0�����������;��������D����+����������+�����*������"���� �����+����*���������<������������������;������+!������������������;�����**������������+���*����� ������������������&�����+��2���� ��"��������"��+����������0����������� �����H����������������;��I������0�����������������������*��

G 2�<��������� ���0������K*�;�����������0����L��+����������������*����������������������������������������"�����"���������������������������� ���.*/��������� &����������+�� ����������������������������������������

�����������,

2���������*�����*+���*������0���������+����*������0�����������;������������������� �������������������+�����������A�������������������*����������*+���"���� *�+�%

0 1�2��� ������������ �

0 ���������3���4����� ��

0 ���������3��&��������� ��

0 ���������3��)����

0 � ����&))������-)������%���(�

0 � �������-&�))���

0 � �������&�����&%�'����������&�

&**���������������*������������+������������������������2����������*�!�����������������+�������+������**�����������*�!���+�������������� ������������*�������*������"�+�+���*���������������� ���"����������0��������������;����������+������� ������

0 %� �����������%�����!������ ��!

)���������������������*!���������������������������� ����+���+������+�����������������������������*���&��*� ��*������������������� *�+�������� ���!����������<���;��������+�K��������+��������������������0������**������*�L!��������!����� ������!�/�)2?����!�/�)2?!���+��@�%

G ������ ������+�������������������� �����������������*+�����������

G /�)2?����!�/�)2?!���+��@��������� ���������*������������� �+�+����������� ����

G ����������+����� ����������������������*���������� ������������������ �+�+���������������*

Page 24: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

���������� ���������������������

� �������������� ������%

G ����H������������ ��������������!I��������0�

G ��$�H/����)������ �!I���0��$9�

G ��7�H&+"�� �+�5�������!I���0��$

G ��8�H)����+� ��������/�)@���+�����5�*��!I���0��77

��� ������������%�����!������ ��!

2���������������� �������� ���������������� ������������������F��������%

G 5&���(&)�����(�&����;������������� �����*��������� ��������!�������� ��"��0���������������������������+������+��������&���� �!������;���������F���������������������������������������*��

G ����,���)�(&��&���(�2����������������������� �����������������.����+�������!����!������!��������� �������!�+����+��0����������+�*���+� ����0������������������ ��������!������������ ����*�� ��������+�0���*���+����K��+������D��� �L� �� ��������+�!����*������!����D��� ����������C���!�����������*���!���+�������������*���������������< �������������� ������*���� ��*��<����������������D�������� ����0����0�������������� D������������+����!�������**�����*�����+�����"���������� ����*��+�����

G ����(&���(�����)�����(�2�����0������*+��������������+����"�+���������*����0���� ����*+��/������� *���+�������� ��+����������0����*�0!��������+��0���������*��������+��������0���!� ���������� �����*� �� ��������+����*������������**�������� �����*��������������������0!� ��*��0!���+�*�����0���������*��

G -&"��(�2���������������������������������������*����+�+��� ����������"�*��0���������������������C�����+����������������������"��*��*�!��� *�+��0�����+���+���+����� ���*���������������**��������"��0�������� *��������*�"�� ���������� ���0��0�����������������������*���������*�������������0���� �"���+�������������!�H��������0��������6<��������!I�����*�� ���0��0����������+������0���������������������� *������+�� ����+�������������**�����������*����������������

<� ���!%����

2�������� �������!�����+����������� �������������;�������!� �����*��������� ����������2���������������������� ������������������� ��������� ���������0������+���*���� ����!�������������������!���+�;������+��2����������������+�"� �����������+� �+���������� �����H/����)������ �!I���0��$9��

&���+�����0��������+��;�������;��������� ���������+����������������2�������+��+����;�������� �������������+�+��;�+��"�����������+������+�����0���� �����������������"��0���+������������0�+�����)���++������*�+���������0������� ������!����� ��+����+�+��;�+��"�� ������

Page 25: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� 2"��"����������������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�++�+����������������&��3�A��+��"��������*�������"��*��*�!��������*� �*���������������;!����������**��0����� �������"����������������+��������������������������������!��*������!��++������*�������!���+������� �����������������*�� �������++�+������������ ��������

����� ��!��� �,�

2������������� ����*�� ������������*� ����� �!��� *�+��0�������������!����*������!���+��� ��"���!������**������ ���*���� ���������������;������������(4������&��(&)������/������������� D��������� �������� �����*�������*������+������0��������� D������������ ����K�����0������3�0���*�& D���������������**�������+!���*����D��� ��������**�������+!�& D���������������**�������+!����A����������+!�+����+��0��������������L!�+�0���C��������0��*�K�����0���������*�0����+�0���*� ��"���������&3�L!���+��������� �**����������+������+�� �*������������ �������K�����.:�7������ ���������������������+����������0L��2���� D��������� ������������*������������*���������� �����*������������������+���0��������0�������

6� ��������� ����*����������� �����**�+���������������� �����!���� �� ����������*�����D��� �� �����*����������������0�����+����������������2����������� ������ ����������������������� ����������+������ D��������� ������������������+����+���%

G ������ ������+������������������������6�������!������ �����*�����������0����+� ������������ D��������� ������������+�

G ����������+����� ����������������*�������6�������!����� �����*���������6������������+�

G /�)2?�������+�/�)2?����������������)���0������+�*��;������0������ ��+� ���������������� D�������������!�;��������.����& D���������,��;!����.&,��2���� �����������"�+�����$��#���������������� ��+����� D��������������������+��

)��*�������0�������*�����D��� ����"�*"��������0� ������������������������������������!�+� ���*��!���+��� ��"����2������������������+� �������+������D��� ������������D��� ����*� ��+�K��������������sfrqL����������� *��������0������"�+��)������������ ����������������*� ����� �!������������D��� ��K�������������������!�����������������������D��� �L����������������+� ���*����)����+���������������*��0�������*� ����� ������*���!�����������������*���0�����������*� ;����D��� ���������������**�������������+������������D��� ���&�+��������+���*"����������+��������� �����K�*����0��������� ��������� �������������+���*� ;�+L�������������+������������ ������*� ;�+����������+���������������� �����������*"����

/�������0������ �����*�������"��*��*����������� �����������������������!��������!���+����� �����������������"������ �����*���2���������������������++������*� �����*����������� ������ *�+����+����+���*��0�������+���!���0������+�*���� �����*���������������������������+!���+�+� ���+�*��������*������*�����!���+� �����*���+����+�� �E�� �� �����*�������������

&���"������� ������� �������*����������0����+���������������� ���� ����*�!������������������������"������0�����������2�������������������"��*��*�������������������!��������!���+����� ���������������

��������������������+�����0�����0��+�������+��������������������������*����C�����+������**����*� ������E*�D��+�!���*�+�!���+����0��0��5�����*��+����*+�0��+�����K�5>L��<���������!�������������������"�����������������������5>���+�*���������������������������0��������7� �����*�������������� ���������+�/�)2?���+��@������������8�� �����*����������/*���G����������������))���������������+��������������8� �����*��

Page 26: Getting Started with VNMR 6.1C

��$ 0����1������ �

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

��%�����#����������������#�$��1�

2�������� ��+� ���0���0������+������!��*����0����������!����� *���*����*���+��2�����������+� ����0����������������� ������������+����� ����+��*� ����� ��+�����������������������5�0����������������������������"�����������

A����������������������*�� ���0���!���������M���������������� ����������������0������+����������������������������*�������������*����������������������0�����/�+�������� �� ������ ��!��������������+������������+�����*� ����� �**����� ����������*����+��<���������+�����+��5����������������K+����+��0���������������������L!�������������������0���+���<���+��0���������������!��������0������!��������0���*� �������� ������� ��������������������0����������"����+�+� ���*�� �����*��������������!���+��������0�0����;��������� �����*�������������"������������������0��*����+����������0��� �����*��

G A�������� ������+�/�)2?������������!���+�0���*�+���*����������2/�6�)�265&�6�����!����� ��+����������0����*�0�����������+��*�������*�����!����������*� ��+��������3��*����������������� ������*�������+�0���*�+���*���� ��"�������������0� �� ���!���*� ������ �����*!���+����������������"����������� �����*�+����0��������������������

G A������������!��������!���+����� ��������������!����*� ��"����������������������H���+*���� �������I���+� ��������������0����*�0������0����)������ ����<�K�)#L��&���+F� ������00*������ �����������0����*�0�����)#���*� ���������������������+���*�������*� ��"�����������������0���������������0�������5��������*����������!��������� ����������������������������/�)2?���+��@��������������������*���+���*������������������

���������!�H��������0��������6<��������!I�+�� �����������������0���� �+������5���+����*�������������**��0���+������0�������!�������������������������*�������+����������������

��� � ���=�������

2�������� ������������������� ����������� *�+�����������������0�*���+"�� �+� �� ����!��� *�+��0���*���*���<��������� �����*���!���*�����;��0!����+����0!���+��������� �D�����0��2���������!�����"��!�����+���0��+���������������������+!���������������������������2������ ����������*��+�� �������������������� ������������+����������������0��������+�"� ��%����������!�����;������+!���+�����+���*��������������������$!�H����#��� �!I�� ����������+����*�+�+�� ��������������������������� ����+�����+���*���

������������

2�������� ������������������� ������������������� �������������;��������������������������������������������0���!� �**�+������2������������������ ;�0�����������+����� D��������!���� �����0!�+���*��!���+�+�������*�����������������������0��������*� ������E*�D��+�!���*��+����*+�0��+�����!���*�+�!���+����0��0��

��������"��*��*�����������"�������%

G 2�������@�"�������������+��������������������0�A������+���2����������������3��;����6�"���������K�36L����+����0���"���������K�������������+��������@ ���+��������L��2����"��������**�����������������������������������;��������!�@ �������*�!�����������*� ����������� ����������������� ���������� ���������������� ��������������+!�+������� ����+�+����0�� D��������!��������+F����+!���+������<����������D����+���������������*� ������

G 2�������)�"�����������"��*��*���������;��������������)#�!���+���������>)�"���������������+�+������*� ���>����� �����;��������������)���+�����>)���"����������**���������������� �����*�����!�*��;!���+����*������������@�"�������

Page 27: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� 2"��"����������������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

��������� ��0���!������!���+�&��� ����+�6*� ����� �

)����=0>=���)�"((�� ��!

����������-����������-���#������ ������ ��!

�����������������

��������������

� �!���"#�$%����&

����!�����'����%����

(������)*

����!�����&$���+

���������

,#�$

-�.���

/�!0��#��.

1����

�����.���2&

3������4$�5�#��.�+���#�

-�.���

1����

�����.���2&

�����2�&�#�6

7����������

��%�#�

1���%�#�"���&

0+����#&�#�����&$���+-�.���

3������

���#�

��&������

+�#�

&$���+

$�5�#��.�+

���&�#�

�����"���

%����&

��%�#�

��&������

+�#�

"#�$%����&

8�����������������9

Page 28: Getting Started with VNMR 6.1C

��$ 0����1������ �

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

��� �-�8� 1���#-���#���!��������� ���#�,�

2����������������������������������0�+�"� ������� �����*�������������� ��������������������������+���*���� �����K�*����0����*������ ������ ������ �����**�+����������L��

A������;������+!����������� �����+�!�����������!���+��������*��������� ����������������������+������������

2����������*�����������������+�*����������**� ���� ��������0���+� ��������+�+���*���!�����**���*� �+���<�������������� ��������+���*����2��������� ������+�/�)2?�����"�����������������+�*��+���*����� ������������������������������+��������������������"�����*������������������!�*� ;�*�"�*!�� D��������!���+������������������������� ��� ��"����� �����*������������!��������!���+����� ������������������������+� ��������������0����*�0!������0����)������ ����<�

�����+� %,� �������

2�������+���*���� �������������������������������0����������+�����5�0����$������������� �*� ����0����������������� ������

2���+���*������+�"�+�+��������"���*����+�����2���������������!�0����� �����+��!���+���<�����+����������� �**���*�����"����*���,�;����������+����0��������!����������+���� ��������"�+!�����C�+!���+��"��� *���+��

2������+��������+�� ����+�����!���+������0��������������*!�� ��+��0��������������+��+�����������

�������� ����3���*��� ����

-���

(���+��&

�����

�����&�$��2�$

$��2�$

������&

$��2�$

��:�$��2�$

7�;��&�����������&�$��2�$

���������5�

7�;��&������

$��2�$

0*)����#���

Page 29: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� 2"��"����������������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

A����������@�"�������������!�������� �������������� ��K����5�0����7L�������� �**��������������������� �����

)���������������� ����0���+������������� D��������!��������������+��*����+�����������!�������0�����+���������� �����������+���*�����������������+���E����& D������������������+�����+�����& D������������+����#�������+�����������������5�0����$�

)����������������������0������������3��;����6�"���������K�36L!������36����*���!���� ���� *�+����� ���������*����� ��"�������!����������5�0����8����+���*���+����������������������� �����

2���������������� �����������������+�������������� �**�+�����'&2��(���A�������� �*�������!��������;��� �� ��������������;��������������0�+���0���2���+����*��+���0����������������*�0����+�������������+������0��+��"��������� ;0����+!������������;��� �� ������ ������C�+�*� �**��

A�������F� ������������**��������������������+���*���� ������� *�+��� �������� *���+����+�����2��� �**�!��� ��� ������������ ����*����+�������������������������0�� ������

� ������,��%,��5��#��

?��� ��� ����0��������0����� �����+�����������**��������!�+�"�+��0������������!����!����������+����� ��0����� �*��������+:��� �*������6� ������� ���������+���+����+���*������������

- ��"����&����'��������

&��������� ��������*���*�����+��������!���*����������� ���������;�+���������������?��� ���� ��"�������������������+���*�� *� ;��0������������������*������������������)������������������������������������<���������!�+���*�� *� ;��0������������������������ �**��F����������������������<���������������"���� ��"��������������0��������������������������+���+���������+�

�������&���*���*�����'���

2�� ��������*���*�����+���!�+��������**����0���� �+���%

��������� ��� ��/����)������ �

��������� ��36�2��*���

/�-'����#

Page 30: Getting Started with VNMR 6.1C

��3 -'"�� �'�,�������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

�� �*� ;����������!�����!����������2������+��������������!�������������5�0����9�

$� �*� �����������������������+� �*���������������������������������������������0����� �����+���

�*� ���&�,����

2����*� �������������� �����+��!�+��������**����0���� �+���%

�� �*� ;����������������������������

$� �*� ;������������ !����!���������������������5����*� �����+��!����������5�0������

7� �*� ;�������� ��������+��0������������ ���������������"�#�!���#��$!�����%!!�����!!�&���%!!���+����!%��6<����������+������ *� ;��0�'�����

��*���*�����'���������'��

2�����*���*�����+�����"������������ �����**�+����������**����0� �����+�%

G setgrid���������������������������+� �*������������0����� �����+����

G fontselect�����������5����*� �����+������������*����������+��������������������������

G jwin���� �**�+������ ��+���*�� *� ;��������*���������������������+����������2������ ����� ��+������� ��"��������� ����������+�����+�������������������� ��"�������������*� ��+����+��!��� *�+��0���jexp� �����+������ ��������jwin� �**��setwin����� ��"����������*� ��+����+����2���0*���*������������curwin���+�mapwin��������������������������������������

��� )#�����#�3������

2���+������������� ����������������+"�� �+���������0���������!��� *�+��0�D�����0!���*�����;��0!���*���5)3��<���������!���*��+��������!��&>)�&,�))��� ���*��0��0�!���+��������*���� ��*�C�+����������

������� � ���+��������

��������� 5����*� �����+��

Page 31: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� 2"��"����������������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

?������

������**���**�������������������+���������������4�����!��������!�������������������;���������������������������� ����������������!��"������ �� ������ ��������� �������� ����� ������������*��� �������+����*���5����<���*�!�������������0�"��������������� �����+�����*�������� �������+�������*�����������?���+���������+�������������������*������������!�����������+� ������ ��+��������������� ��+��*�����+����������� �����+������������������*��������**��#� ����������������*���������**�� �����0!������������D����������������D�������+���������������������������� ������+�+�������������������;�K�������� ���!������*�����L�����������&����������������� �� ����+!������*����������H+���!I���+����� �����"��������������<�����;�

&������������������<���*�����D�����0���������������� ���������+����� D����������-����*�;���*�����0!��������+�������� �� ����+������������� D������������������0�������������������������<�����������+����������� �����+��������������� D����������)������ D������������������0�����������������!������ D���������������D����������������+����*���)������ D������������������0����!������� D�����������D���������������*����� �������� D�������������������+!���+����������������������#� ������������ �*���� D��������� �����;������������!�������������"�������� �������D�����0��������������������0���������������F� ��+� ���*������������������ �������� D��������!����������**�;���������������<��������0����

����������D�����0������**���������� ���+���D������������ ��*� �����+����������������������

��,���� 6���

/�*�;��D�����0!���� ��� ������D������**�!�������*�����;��0������������������������**��������*��������� ��"���������� ����2���+������������� *�+��������������� �����������+��� ����� ������!��**������� �� ������� ��"��������������������A�������� �����������!������ D��������� �������M����������0�������������*�����;��0!���� ���**����+����� D��������!�+������������!���+�������� �� ;��0�����*�������*���)���++�����!�����/�)@���������0�����������+������������� ���������**������*���*�����;�!��� ������������0!��*�����0!�+������� �����0!���+� ������ ����������������� ��������!�����**���� ��+�����������������!��"�������������0*����� ������

��*�����;��0����*�;��D�����0������������� �E����+��������"�����+�����;�����������0���� ��*��)�����0��� ����"�� �����+������������������ D��������!����*��!�������������0!���+������+������� �����0�D�� ;*�� �������������� ����������� ����� ��"������*�������*���-����*�;��D�����0!�������*���������*�E��**�����������������������������+�������"�������������)����������������������D�������D������D�����0!���������D����+��)����� ������� ���*����+�����+����*����+���"�*"�����*�����;��0!�������������������**�

��*�����;��0���������*���������!�����"����)�������*� �� ������ ��!�������������������+���0��+��������������*���*��+������� �����0����������������*�������*��'��$�����������(&�,�&%��$��� ����&%�'���2���!����*��������������*�������"���������������������*������ ��+������ ����������+���"���*����������������0���$3��������������������������������!�����������������*�����������0*����������+����*���*��+������� �����0����;������������0*���������*�

��� ���������� �����0����������������������*�������+�������������0�����������0�/�)@��5����<���*�!��������������"��������+���*��0�$3�5����������������������K52L���������������0�����?������������������������K����������L���+������������+��!���� �������������� ������ ���������������/�)@���������0�����������������������������������0���������*��+������/�)@�K��<���+�����!� ����*���!��� �L��2���!����� ����+�����������*�����D��� ����������������������������������� ��������*������*������5�������������������� ��+��

)������"���������*������������������� �����������������0��������������� ��"���� ;0����+���+���)��������+�����<�����*��*��0���������������������!��� ��������'4�:�'4�$3�5����������������!���������������� ��*+������������+����������� ;0����+���+�!�*��"��0������

Page 32: Getting Started with VNMR 6.1C

��3 -'"�� �'�,�������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

������ ��"�� �������������������������������<��� D������������+���������� ���*�+���*�����+��*�����0!��� ���������������������������� ;0����+���+����������������+�������������*�� �������-&�))����

������������������������� ;�0�!�����������*������������������������������������������������������������������� ��������0���!���+�������������& D������������+����2�������+�����������*� ;��0���+��������0!�5)3�+���*��!���+������� ��"�������������+F��������K)�&L��#� ����������� ��"��������������������������+��!������������������*����*�����;��0�� ��"�����2���!��"������*����*��0��������������� �����0!����� ����������������<������*����+����������������0�*� ;��0���+��������0�

&'%���!���

���� ��������!�*�;���**�� ��������!������ ������+�������������0��<�����������5��������������!�����+�������������0���C�������+�����*��0����������*������)�����!�����6���)���������+��� ����!������+��;!������� ���������������+�+�������������+��2���"�*������������������������������������ ��+���������+������ ������+�������������*������ �**� ��+������**���� �**� ��+��6� ���<����������������������K���������HExp:I��������������*���������������������+��L!���� �� �������!�$!���������� ���������������������<�������������exp1!�exp2!�exp3!���+��������3����������<���������� �����*+�+�����������������+����

2���explib����0����0�"�����"������������<�������������������������+���*����0���*������������<����������������<���!���������C�!���+����������������������� �������+���� �������+����������<����������

&���<�����������������!�����*�������*�!������������������+����K����5)3L���+�������� ����+�+����K��������������+���� ����L��2���!������������� ����������������������H��"������+���I�����������������0����52������������� �����0=��������0���*�+��������*����������� ��+��6� ���<����������*����� �������������+���!�����*������*����+������������� �**� ��+����������<���������KF����*�;��������������*����� �����������*����"�*������������������+L��3�������������������<�������������*���������������������<�����������+���0����������� D����������2���!�����<���������������� �**�������� ���������������������+���������0�E���*� ����������+�������*������������0�� D����+!���� ����+!�����*����+�������+�������������+���!��������*+������"�+������������������*�!�������0������<����������������������������+����

��,��%,����,���#�3=+ �

������<������������D�������������0�������������5)3����*���+������ �������������0������"������������������������������������5����<���*�!����������������� ����������������������������� ������������+���������������������%�7�°�!�9�°�!�1�°�!���+� �°���)�����+����� D�����0�����������������������+���!�������������*����� ���������,������� ������temp��������������0�"���������� ����"�*��+���������"�*���%�

temp=30,50,70,90.

2��������������<�������������������**�������+���������0*���<����������A���go� �����+��� ����"�*����0����� D�������������**����������<�����������A��� �����+� ���������+���������������**�������� ���!����� �����+����+���*����**�������� ������������ ���������*�������*�!����� �����+�����*����**�������� ���!���+����� �����+������"���**�������� �����������**���**����������������������� ���0�� D��������� ������������+������������!���;��0�����������*����+� ��"������������+�������������0���*�����+��� �*���������!�������C��0�����������!��� ��

Page 33: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� 2"��"����������������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

��,��%,������,���#���� ���+���

�������������� �����+������*�����+��*��������*���*����������+��������������&����*���+������ ������������*������������0�����������������5����<���*�!�������������������������� ��������+������������� ���������������������*�!������������������������+�����+�������� ���*���*��+����������?������������������������� ����������������������������!��������+�������������*����

A�� �����!������������ �*��������*������ D����������� ��+�������!���� ������!��*�����!���"��������+��;!�� D�����������<��+���!���� ���!��*��!���"�!���+��������#����������� �+��������*��������������� ������������������������)��� D�����0�������� ����!������<���*�!�������*+������������� ������������������ ��+�� D���������K���������� *���!�����������*�����D��� �!�������������*�L!���+��������� �����������������*�������� ��+��������0�� D����+��A�� �����!�������������� �������<���+�+������������������+��������!������ �!������������

2������*�������*�����;����������+�����������������+����K�� �������� �����0�����������+�� D�����0��������L!�������������K�������L��<�����������5����<���*�!�������������go����� D�����+�������exp1*���<�!�F����exp2�����������0�jexp2���+��������0����������<����������2����������jexp1������F����exp1���+���� ������+��*���������������� �����Kexp1L����*�������� ��+�Kexp2L��������0�� D����+��

2����**��������� ��+��<��������������������+�K�"�������0�������� ��+�������**�����0�� D����+L!�F����exp3�����������0�jexp3!���*� ������������!���+����������������<������������ ������ D������������������0����!�������<���������Kexp3L����D����+���������+������� ��+!�F��������������������������D�����0����"����*��+�� ����+���������� ���0���� ;����exp1!���� ��������!������������jexp2����*��;���������+���!����������������������������������!���+��������)������text� �����+�������+������������������ ����*���� ���<��������!�����explib� �����+�����*���������F�00*���**���������� �����������������

�)@=)2�==�������2�������

&�)(&���������0*�� �����+������+��*� ������������������� �����+����+�������������������*���������;������+��������*�����+����+��*�����������!����� �������������� ���������� ������������������!���������<�����*�������*��

��������"�������������� ���������*����+!�������+�����+������"�������������������+!���� �*���*����+���*���������� ����!���+����;�����"��$�����������0���*���*�+����������D��� ���2���� ������+������������0

pl pscale pap page th=20 printon dll printoff

��� �������������+���� �*������������ ���������*����+��� �!�������������������*������ ��������������*����+�9����������9��������N�

2���������������� ���������� ��� �����+�������<� ����������<� ����������������*����+� �����+����+�������������2����������������� ��� ���������� ��"�����������!��� �����plc13!����plc!����F����c�������"������������ �����������������!����������������������������<� �*��*�;������������������� �����+��

�� ���������<�����"�*�����+���������������"���������� ��*���*�����D��� ���<��������������������"��*��*���2���!������ ��"�������*��7����� ��������������� D����+!��������0�apt��<� ����������� ���apt�����������������&�2��<����������A�!��������0�������� ��"�������*��.���� �������+������0�cosy�����������$3��A?��<������������ ��� �����+�� �������*������������� ���*�<�������� �����+����+�������������

�� ������������������������������������� ���*��0��0�� �**�+��&>)�&, �))�K�����&>���� ��)����������������*���+�&��*�����,��0��0��))L������������*�������������&>)�&,��������<�����*���������*�*��0��0������� ����������������������*��*������%

Page 34: Getting Started with VNMR 6.1C

��4 1����'� ��������0�15���'�����,�*��

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

G ���0������0�*��0��0����������!�*�;�� ��+������*������������

G 3��� ��� �������;����������������������+���!��� ��������;����0���!�����0��*�!���+����D��� ����

G ��������������������+����"�����*�������� �����������0�����

/�*�;���&>)�&,�K�������+� ����������&>)�&,�))L!���� ���������+���*���"�*���*��*������0��������������+���+�!��&>)�&,�))��� �������������+����������������<� ����������<�����*������+��)�+��+!�����������������+��+� �����+��������������������������������������&>)�&,�))!���+����������������������**������������������+���������*+���"����������������+���������������������������+������*�*��0��0���� �������

#���+����**����0� ����������� ������C�+�����*0������������+����� D���������������*����!��&>)�&,�))��*����**����+����� D�����������+����*�����������*��;�+������+����"��� D��������!��� ���� �*� �����*�����������*� ��������� ���������,�����

A��������������������0����������������&>)�&,�))����������**����������������� ������+��� �*���<� ���+����������;������+���������� ���**�� ������0����� ����3��������������+���*������"���� �*�� �*�N�-���������

vs=vs*2

3��������������+���*������� �����*�9�O����������� ����N����*�������

f wp=0.5*sw sp=sp+wp/2

?��� ����"���������������*�� �����������0����+��� �*�����������;������+�����*+�����*�;����� �������$1N�2����������0�������**����0���+������������0���������0���������%�

r1=1 r2=1 repeat r1=2*r1 r2=r2+1 until r2>7 r1?

�&>)�&,�))����+�� ����+����+����*�������������*�� �������-&�))�����/�������������������+���������<�����0��������������++������������� �������������0*���� ����0�+����*�������������&>)�&,�))�

�%�����,��%����,�;�#��������

�� ���+"�� �+!���� ��*�C�+��������������"��*��*���������!��� *�+��0�������**����0��������*��� ;�0�����*+����������%

G #�������������������#���������������*��������������+��� �*�����*�C���3!������+������+���!����"�+��0���0��*����*���+�!����D��� �!���+�*�����+��������**��������� �**����0���� ����������� ���

G 3���������������������������� D�����������+����*�������������+����������������+��������� �������������0�������*���0��+������ ��������+�

G 563 ����������+�� �"���� ������ ���� ��"������������"����*������������*��*�"�*������������"�����563����*�C���+����������������������"�������������*� ������ ������ ���� ��"�����<���������

G 2& ��������������*��������0*����*����<���������������*�+��

��A =����#������������=B���#������3�,� �

2��� ���������������������� ;�0���������������&����1� �������0���"��������!���� ���� *�+�����A�9�1�K��M�����*��������������/�)@L!�����A������+������+��36����+����0���"���������!���+�+��;�������*���� ������*� ;���+�5�*������0����

Page 35: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� 2"��"����������������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

����������������+���������������*������� ��������������������� ��������������*����!�A������+���!��36!���+�/�)@��< ������������������������������"�+����<�����"�����������������������������+� ��!��������*������+����+� �����

��=B�3�,��� ��!

,�;��������0��*�"�*�������!�+������������+��;��������+������*��!���� ������������*"�����0���C�+������+��� ��������2���/�)@���*���������������+������**��+��� ��+��������������� ����!�������**���*�����+�+��� ����������������� �� �**����0���C�+������������*�"�*�+��� ����������������*�������*����K/L���+���������root��2���root�+��� ������*������*�� ���������**�������+��� ���������+���*���

�����+��������� ���#�3�,�

5�0����1������+��0�����������������������/�)@���*����������������������������������0���������������)������+��0���!�����+��� �������vnmr!�home!���+�usr�����������������+��� ����������root�K/L��2���+�������������+��� ����������������*�"�*����+��� ����������root!����*��������*� �+�����������������+��� ���������%�/vnmr!�/export/home!���+�/usr��

4�����0�����*� ��������+� ������������������+��� ���������+���*������+�������������*���*�����������0������+������+�����/�)@���*��������%

2���/vnmr�+��� ����� ��������������������+��� ������!��� *�+��0%

/vnmr ����������**��������������K����*����!�/vnmr����� ���**����*��;����/export/home/vnmr!����vnmr�����*����������+��� �����home�

/export/home �������������+����*��*� ���������������M������+��� ��������

/usr ���������/�)@�*�����������+���*����������� ���������*��

acqbin ��������� �����+����*���+��������+����� D������������ ����

acrobat �����������*�����+����+����������������� ����������

bin ��������� �����+�����+��������������<� ���+������/�)@�

fidlib ���������+��� ������������5)3�+������+�������������*�������� ���������+������� �� ��+������� �����0���������� �������������"��*��*�����0�����������*�+������������������<���*������+��������������*�0��+�����������0����������������������� ������������������������ ���������0�������������!�����+��������+������������+��� �����

glide ���������������*������+����������� �������������� ��

help �����������*����*���������������������������

kermit ����������������*� �+�����������*� ������ ����������0����kermit���+�������*���+���*����*��kermit.doc�

lib ������������������*��������!��� ���� �**� ����������������!����+����������+��>�

maclib ��������������������<����*���������������� ��������������������&>)�&,�))�*��0��0���2�����*��� ��������+����+����������������+������������K+�� ����+����H���������&+��������������+�A�����/����!I���0��7�L����+�����+�

manual �����������<����*������"�+��0���*���������0����� �����+��

menulib �����������������������������������������������&>)�&,�))�*��0��0���2�����������+������������ �����+����������������

nuctables �����������<����*�������*��;��0�������� *������+������*����0���������������������������������������+�+� ���*������D��� ����������������������+����*+������0����������

Page 36: Getting Started with VNMR 6.1C

��4 1����'� ��������0�15���'�����,�*��

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

��������� 5�*����� �����A"��"���

<)�

myfids

vnmrsys

exp1

exp2

seqlib

psglib

maclib

global

hetcor

hetcor.c

plcosy

bpt1cosy.fid

t1data.fid

text

procpar

fid

vnmr1

user A

user B

user C

export/home

usr

/

vnmr

fid1d.fid

fid2d.fid

conpar

devicenames

menulib

"�#�

2�������6

root

acqbin

bin

fidlib

acrobat

glide

help

kermit

lib

maclib

manual

menulib

nuctables

parlib

psglib

seqlib

shapelib

shimmethods

shims

stdpar

userlib

log

/export/home/vnmr

� � �

Page 37: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� 2"��"����������������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

#���+���������+��� ������!����*�����������*����������/vnmr�+��� ��������������������%

����� ��!�)#!��� ���������#�������� ��

2���/export/home�+��� ����� ������������+��� ����������� ��������������������0�"��������������������������������K�����&!������#!��� �����5�0����8L��6"��������������������*�C�+����������� ��*����������+�vnmr1!�����������������������+�����������!�����H�����I���������������������K����������*�����/�)@���������+������������;����������������+��+�C�+������rootL��2���!�vnmr1����������*�������������������������� ���0��������*�������+��������/vnmr�+��� �����

)���++�������������0����������������+�����������!�vnmr1�����*�������0�*��������������!����������������������������<���������!���� ����+���!��� ��2���� �����*����������"�+�+��������+��� �����vnmrsys!���� ���������+������������vnmr1�+��� �����K��+���������**�����!����/�)@��������*�0�!����/export/home/vnmr1/vnmrsys)��

2���vnmrsys�+��� ����� ����������������������������*���*����A������������<�����������*���Kexp1!�exp2!��� �L��������+�������"�+�������������������������+��������0�� D����+������� ����+=���������*�����������"����*��+�� ����+���"���*�+��� �������������*����<����+��������/vnmr�+��� �������������+��������+�����%�seqlib!�psglib!�maclib!�menulib!���+�shims��2�����+��� ��������������+�������"�+���������(�%�(���*�����D��� ��!��� ���!������!���+������"�*�����

2���!����������������������+�"�*������������*�"��������������plcosy��� ��!���� ���*�������A?���� ����!������������+����������������� ���0������������������� ������H����I����������

parlib �����������*�������������������������������������� ����*�����D��� �!���������������������������������"�*�������D������������<��������� �������� �**�+�������������*��

psg ������������� �� �+��������*�����D��� �������������

psglib �����������*�����*+��0��������� �� �+��*�����0�����������*�����D��� �������*��+������������������2�������*��������&���<� ����*����*�����D��� �����+��������������� ����*�+���� �������� ��������+��0���*���������seqlib�+��� �����

seqlib ��������� ����*�+���*�����D��� ������+���������������������������&���*�����D��� ����������+�����+������seqlib���*�������+�������������

shapelib �����������*���������+��������������+����������*�����D��� ��0����������K�>L����������

shimmethods �����������*������������������+�������� �������������0������������+��&���������������+��+������+����������*��+�K����H&+F�����0�����!I���0���7�L!����������� ��������0�����+!����������*0�������������������� ������0� ���������+�

shims ����������������������������0���6� ��������0��� ��������+����������� �*��������������*"���!������������F�������������� �*���+�����

stdpar �����������������������*��!��� ������+����������� *���!������ ���������������+��+��������������������������� *����

userlib �������������� ���������+���*�������*�������������������*�������+��������/vnmr�+��� ����%�maclib!�psglib!�menulib!��� ��

conpar ������������������������������**�+!��������� ���0���������+�!����� ����0��������������������*��conpar������+����+�������*� ������ ���0����2���������������!��� ������������ ������������D��� �!����� ����������**���������+���� ���*� �+���������������*��

devicenames &���*��*�����0�������*�� ��� ������������������+��*��������+��+��������0���� �����������+�"� ����������� ��+��������� ��������K��������������� ���������������;�+���0������"���6�������L��

Page 38: Getting Started with VNMR 6.1C

��4 1����'� ��������0�15���'�����,�*��

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

�������&����������������������+���������������� *���� ���� �*������� ����*��������*�����D��� ��hetcor� �������*��*��+����������������� ���0��������������A� ����������"�������������"��������������+������*�!����������������+������������vnmr1� ��� ����������������+��� �����/vnmr/seqlib!�������������� �����*������**��������

5���**�!�����*������+�global��������+������ ������M��+��� ������2������*�� ���������������������������� ����������**����������M���<���������!���+������+���������+��������������+��5����<���*�!����*������������������������ �������������� �������exp1���+� ��������� �������exp2!�����������������*������������*��������������������������*�����!������������������plotter��������+����global���+������������exp1����exp2�

�������������������������������������F���������������������������+���0���������������������*�*�����vnmr1��������� �� �����0�������*"�������� ������0��++������*���*��������++������*������������)������� ���!������ �����+�*��"��0�����/vnmr���*��������*+�����������������"�+�+�����������K��*�����D��� ��!��� ���!��� �L!����*���������������������+��� ����������������/export/home/vnmr1/vnmrsys���*����

A�������������+���������������0��������������������������������� ���� ��������������0��������������+�"�+��*�+��� ������2���� �������*����!������<���*�!���������������*�����0���C�+������+��� ������� �����/export/home/george�K������george� ��*+����userA����5�0����1L!���� �� ����������������������������*����������+����/export/home/vnmr1�

2�����"�����D����������!�����������*+�+������������+N�?��� ��� ��������+��� ���������*���������*� ����������������������� ����!������� ������ ��������D����*��������+���������������������������K������*�����������������������������������L��&�*�0� �*��*� �!�����"��!�������������������M�����+��� ������&��������*�������"��������������+���������+��� ����� �**�+�data�������/export/home/username/vnmrsys/��)��5�0����1!������<���*�!�����+��� �����myfids���������� �����+�����������������+��� �������������vnmr1���+�������������+��������������+���������5)3���

&�5)3�������������0*����*��������+��� ����������������**����0���*��%

G fid� ����������������+������������5)3�K�����������*�L�

G procpar� ����������������������+����� D�������+���� ��������+����K����<����*�L�

G text�+�� ��������������*������<���������K����<����*�����������������������L�

G log� ������������� D���������*�0�K����<����*�L�

5)3����"�� ����������*� ��������� �����+��� ��������������� ����+��������������������*���+����/�)@������������������������*����*��!�������D�������� ��*� �����+��

$��� ���#�����5��6����+�������

)��/�)@!�������$���������*�����+��� ����������*�������+��� ������������*�������������������*�"�*��������*���������K����root�+��� ����L���+�������*�����+��� ������2�����*+�������!�*���������� ����"��+��� ����������������+��!��������0������H/I�K���������*���������root�+��� ����L!�������� �����+��� �������������+������H/I!���+�������������������*�����+��� ������������*�����������5����<���*�!�����������������global���*���������*�������0������5�0����1!����/export/home/vnmr1/vnmrsys/global�������0�����*�����+��� ����������������� �**�+����"�&�������$��� ������"������*����+�+��� ��������������0*�!����D���������

2���"��+��������+��������������*��0������������ ������*�!�/�)@����"�+������� �� �����������'&2�������(�&,��2������;��0�+��� ������������ �������+��� �������������H���I�2������������������������+��� ����������������!�����������/�)@� �����+�pwd�K���������;��0�+��� ����L���+���������*������������+���*���+��2�� ���0�������������+��� ����!����������� �����+�cd�K ���0��+��� ����L����������������������+��� ������������������������

Page 39: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� 2"��"����������������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

5����<���*�!��������������cd('/export/home/vnmr1/vnmrsys')�����������!�����+��� �����vnmrsys��� ����������������;��0�+��� �������� ��global��������*���������+��� �����/export/home/vnmr1/vnmrsys!����� ����������������������F����global�K��0�!�cd globalL��������������������/export/home/vnmr1/vnmrsys/global�����*����������global��������*���"��������� ��������������������*���"���������� ����������;��0�+��� ���������� ��������*����0��������*���"�����������*������*������������!������������*���"����������������;����������������������*���+����;��0�+��� �����

� ���2�1���

2������������������0�����*������!��*� �+��������userlib�+��� ����!� ����������������������*�������*����������������+��������+��� �����/vnmr%�maclib!�psglib!�menulib!��� ��2�����������������������*����������������"�+������ ���������������� ������������������������������*�����D��� ��!��� ���!������!�����+��*�������0����!��� ��

/���� ����������������������*�������+���+� �� ;�+����� �������� �����+� ���������������+��+�!�������������H����������������I�2��� �������������������������+������*����+� ����������!����������������������*� �������������"� ������������������*��������������� ����� *�+������ ����������M��������������!������*!�5&@�������!�����++�������������������**��0�����������D��������!��������������������*�0���+����+�����

2�����*��userlib/CONTENTS����"�+�������*������� �*�*�����0�����**���*������������+��� ������!���0�������������������K���������� �����*���L�+�� �����������������*�������� ���*����+� ����������������� ����*���������+����������*�"����+��� ����!��������*����������������������������*�����������H.READMEI������+�+��2�� README���*����**������������������+�������*�!�0�"���������0�����*��"��"������������������!���+��+�������������*�����������K��0�!�������*����*�����;���������������� �����*�������������D������*���������*������L��5���**�!���*�����������"�+��������� �����*�����������K�����F������+������������"���<�����0��� ���!���*�����D��� ��!��� �L���"��������� ����+���*���������userlib/manual�+��� ���������� ���*���������� ���������������������������*�����D��� �!��� ��!��� ��

����*���������� ��������������0������������*�������������*������!���+��������������0��������*��������*������!���������+��������userlib/README���*���/����������� ����0�+�����++��������"�*���������������*������� �� ������� ����������0��������*������!����F� ����*�����������D������������������"�+��0���*����+� ��������������� �������������������+��������*��2����3�A�� ��������0������*��� ���������� ������� ��������������������������*�������������������������*�� �������&�����&%�'����������&�����������**������

0����+�������)�������'����'������

�������*���������+�������������*����������+���������+�������������������"� ����������������&**���0������������������*���������+������������+�����������������!���*�����<�*� ��*��������+���+��������� ��������0�README�+� �������

?�������������+�����������������0�������������*����������������������������������+�������������0���C�����!��������������<�����������������������������������

��������������!�)� ����������������������;�����������������������������������������;��+!��<������������*��+!����������� �������������*�����+�������������*��������2�����������*����+���������+�H�����I���+��������������������������;�����������D��*���!���*����*���!���+���������� ���������������������� ��������������

)������"�������**�������!�)� �����*���*���������� ����D������*!���� ��*!��� �+����*!�+��� �!������+��� ��+���0����������;��+�������0����������������������������������������*��������

/�����������������*�������������*����������**� ����������� ����� �������������������+� ��+�������

Page 40: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

��������$� ������� ��

� �������������� ������%

G $���H6������0���+�6<����0����!I��������0��

G $�$�H���;��0�����������������.������������!I���0��8��

?��� ������;�������������0��������+�����������+��%

2�������+�������0�����**������� ���0���*���?��� ���������� ��"�����+����������!�����"�����<���+��!����� ���*���������0��*���&�������!�������**��*������� �������/�)@� �����+�������+�������������0��������� �������������;��

��� &����������#�&'����������

)������� ����!������������0�������*����������0������������� ������������**������!���+������������*;��������������;������������F��������+������+�����������0�������������)�������� ����!�����"��!�������������������;���+"����0���������*�0�����+�*�0����������������/�)@!�����������+����;�������������������+��<��������2�����������+�������������������+������+��������� ���!���� �������2��*����*��������� �����+����+������������������ ����+�������������0���+��<����0�����

0������������

#������*�00��0����������������!������������"��������������K���������username����������**����0���� �+���L�����0��+�����������������+�������������2�������+��+������������������**�+���������vnmr1�����*����� ����0���+����������!������������������+������������������*��+�����+�������������**�

��� �������������� � ��������������� ������+���+�

������� 6������0���+�6<����0����

�!!��#acqi A��������& D������������+��

acqstat<(remote_system)> A��������& D������������������+��

login username ,�0������/�)@����������������0�"���K/�)@L

logout ,�0��������/�)@�K/�)@L

exit ��**�����vnmrexit� �����+

vnmrexit 6<������������������

������ ��!����������P������P�6<������ 6<������������������

6<��������������36����*��� 6<������������������

Page 41: Getting Started with VNMR 6.1C

��������$� ����#��� �

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�� )������0������36�������� �!�����������������������������*�0������+���

A��������!������login�����������+���*���+!��������������������������K�������������������������������������������0�����������;��L%�login: username

)��������������������+���*���+�������+��������login�������!����������� �����+�login���**���+�������������������K��0�!�login vnmr1L�

$� )��������������0������36�������� �!�������������������+���������������+����+�����+�����������������;����A��������!������password ����������+���*���+!�������������������+%Password: userpassword

5����� �����!�������������+��������+���*���+��������� ��������������������

)��������;���������;����������0��������������������������+!����������0�Login incorrect

����������+�������������0�"���� �������������������)������� ���!�����������������������������������+��������+��

A��������������0��*�����K��*�����36����������0L!�������������������*�0������+�����+������������"�����������+!���������������������������������+��������"�����������+���+������� ���������� ���������%New password:

5�**�������+��� �������������� ������2����������+������������*�������<� ���� �����*��0���+��� *�+�����*����������*������� � ���� �������+����*��������������� ������� ��*� ���� ����KQ!�R!��! S!�T!��� �L�

&����������*�0������� ����+!�"����������������+������ ����0����������*����������+�����������������������������������������!��� *�+��0��������� �**���������0����������������+�+���*����0���������������� ��

)���������� ����0���+���� ���� ��+��������� �����������+������������� ������������ D��������!�����& D������������������+�����+�����& D������������+�������*+��������������������������� �������������������A�� �����!������������ ����0���+������+��������������*��K������������ ���� ��+��������� ��������L!����������+������**�������������*��������

7� )���������������& D������������������+���������������+���������������!����������� �����+�acqstat�����������������+����������������

&*�������"�*�!���"�������������������"����������;��� ��K������ ;0����+���������� �"���+�����������+���L!��������������+���*+�+����������0��������������������*��������������������������������������*+�+����������0�������������������*����"��0�����������+������+������0�*�0���& D��������������!�����������������������������������!��������*�����������������������

A�!�����36���������**�+!� *� ;�������� ����������"����������� �������������*����!������ *� ;��������& D������ ���

8� )���������������& D������������+���������������+���������������!����������� �����+�acqi�����������������+����������������

?����������� ���� ��+��������� ���������������������+�����������

0��&'�������

�������/ � ����, ������,,������%����#��������'����������#�,��������)� �������!����#�������� ��,� ����������%��#��,� ��

Page 42: Getting Started with VNMR 6.1C

$�$ ���6��&�����������������7������������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

�� �������������������� ��+���*���+!���;���������������**����0�� �����%

G )���36���������**�+!� *� ;�������� �����������������*����������+������**����0�������� �����0��9�����<�������

G 6���������������������+������� �����+�exit�

G �*� ;��������������P������P�6<������

)������& D�����������+�& D������������������+���������������!����������*+��������� �**��D�����

$� )������& D������������������+���������**�����!� *� ;��������6@)2������������������+������ *�����������+�����+�D�����������0����

?�����������������������������**��������/�)@����+����0�������!�*�00�+������+�������������������)���++����������������;��� ��K������ ;0����+���������� �"���+�����������+���L!���������������"�����+����������������0�����*�;���� *� ;��������<���+��������**��������+������� ������������ ��������� *���+����0������

7� 2�� *�����������+����0�������!���"�������������������"����������;��� ����+��������������+���*+�+����������0��������������������*������������������������3��0�����������+������+������*�����6<�����������������������������������������0�*�0���+���+��������*����������������������

&�+��*�0���<������������������������Please confirm exit from window system

��+������������%�6<�����+���� �*

8� �*� ;����6<������������*�����������������

2���/�)@���������������� �������������������!������<���*�!NMRlab:vnmr1>.

9� 6��������� �����+�logout�

2���*�0�����������������!������<���*�!�NMRlab console login:

?�����������*�00�+�������������������

��� 5��6���������������������<� ���!%����

2������ �����+�� ����������������������������� ������������������������0��������������+�"� ��%����������!�����;������+!�����������������+�*��K��������**��������L!���+�����+���*������������6� ������������������� ��������+�� ����+����+����*��*��0��������������+� �����������;��0�������*�������+�A������+��������36��2��*��$�*��������� �����+����+������������+�� ����+����������� �����

��� ��+�����

2����������������������������������0�+�"� ������� ��������������� ���� �*�������� �*��2���*������������+���0��������� ���� �*�+�"� ����������������0���**�������������������� ��*���� ;��0�����+������D����+����������+���0�=�����"��!�����������+���������*�

�����������"�����������!��� ������ ��������+��0*����"���� ���������+���*���� ������2��� �������������������������**��������������� ;��������"������������������!��������!���"��0������������������������*������"��������������������������*������������ ������

Page 43: Getting Started with VNMR 6.1C

��������$� ����#��� �

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

��� ��������

2�����������������������������!���� ������H *� ;�+I�����������0�+�����������������*�!��������+�����+���������������������������������%

G 2�����%��"���&���������������K�������������+���������+�<����0����������0������+�+�������L��������0�����**�����������������������*� ���0� ��� �������������!�� ��"����0����+���!�����������0� ������!���+�����*���� ����������� ���*����+���� *� ;��0�����*��������������+��00��0����� ���������������*�������������*+�+�����

G ����������!�����(�����"���&�������������������',������ ����+������"���� �*�� �*�E"���� �*�� �*������������ ����!������������0��*!������$3���� ����!��� ��

G ����������!�������$��"���&���������������������� ����+���������������� ��������� ��+� ��������+�������� �**�����+�������*� ���0��<�������������3���+�$3���� �����

2��� ��������+���0������������������������+���������������������*�������������0����� �����+�����+����������0�������**+������������������������ � ������������ ���

&���� ��*������������*������+���0���������������������������& D������������+����� �����������0�����"�*��������������)��������"������ �������"�����(RU��������K������R������������!���0�!�(�UL���+����������������*����������!�����"�*�����������+� ��������������������������������)������������������0���������!�����"�*����� �������������+�

�� ��� ���� ��������**����+�� ����+���� ��F�� ����������������*�"�����������������������������������������"����������� ��������������������+����0���"������������"�+�+������!�)#�!����>)��

8� 1���#

2������������������� �����+�!�����������!���+��������*��������� ����������������������+����������������0����;������+��2���;������+��������*������;������+�����+������������ ��������!������;��������*���������+��������!���+������������� ��*�;���!��� �����������*!�3�*���!�#� ;��� �!���+��������2�������� ��*�;������������� �*��*�������*������+����0� �����+������������������+����H������+�,����6+����0���+�������!I���0�� �� �"��������������������;������+�

������ ����)������ ����+�3���*���2��*�

�!!��#errlog 3���*����� �������������������0��

flip &*�������*���� �"�����+� �� ��*�dg����0���

glide 3���*������ �������� ��"�����+��

large /���*��0��0����� �����+��

small /������**�0����� �����+��

$���!����errloglen�V����0��S ����������*�����������������������0��+���*��

pslabel�V�����0S ��*�����D��� ��*���*��������������������+��

������ ��!>,)36 A������� �������� ��"�����+��

��������� 3���*����������������

5*�� &*�������*���� �"�����+� �� ��*�dg����0���

���C� ����0����C�����0����� �����+��

Page 44: Getting Started with VNMR 6.1C

$�$ ���6��&�����������������7������������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

2����������*������������������ �����;���!�*���*�+�5�������0��5 !�����������������������;������+��2�������� ������;���� ���������+��������*�������"��������������������*� ���0���������������������������������2�������� ����+�� ����+�����������*���

2������� �*��������;�����������*������+���������;������+�K,�����,�����������;������+�L���+�������� �����;����5������5�$������������+������������ ��������*���*��������;��0��������A������+�������/�)@���"����������5����<���*�!�����������0����� �������"��������+�����+�������������0�����A����K,1L�;��� ���0����������+������������ ����2��+��������������!���������� ��!�������������� �������"�������� �����+�������A����K,1L��A�������"�������+����������������������������+���!���"������ �������"����������������������+�����+�����������5�����K,9L�;����

��!��������� ���#�,�

2����������*�����������������+�*����������**��� *�������������+� ��������+�+���*���!�����**���*� �+���<�������������� ��������+���*����&*����0�� ����+���+��������������������������������� �!���������������������+�*��� ���**�� ���� ���+��� �*������������ ����*�!����������������� ��������*�;������������������������������ ��

2��������� ������+�/�)2?�����"�����������������+�*���������������5�0����'��5�����������������!�������+�*�� ��������������**����0���+� ��������+�+���*���%

G �2���+� �����+���*����������������������"�����*�������������������

G 3�0���*����+����+���*������������������������������2� �����**����

G &��*�0����������������+���*��������*� ;�*�"�*�

G &�B!�,A�4!��)�!��5>!���+����A�5,���+� ������+���*������������������ D��������!�*� ;!�����!���*��+����*+�0��+����!���+��� ��"����"���*��!������ ��"�*��

G @�2!��5>!��!� �!��'�!���+�$1����+� �����������.&��6,���+���*��������������������������������!���"������0��������!���+����������������������� �����*����2��������+���*����������������������������������� �����*�!�+����+��0������������������ �����*�� ����0���+���������������

2���/�)2?�"������������������������������+�*��+���*������������������*� ;!�����!������"�������������!�+� ���*�������������!�� D��������!���+�����"��*��+��)���++�����!���������������������"�� �°!������"���'�°!�+� ���*�� �°!���+�+� ���*���'�°�������������������������2�����+�*���*��� ����������*� ;�*�"�*�������

����������!��������!���+����� ��������������������������*�0�����+����������������0����*�0������0����)������ ����<��)������*�0���������!���������*����������������0!�)������*�0�������*�����0!�������������������������������D�����+�������)������*�0����������+�!���������������������������D�����+������

��� ���� �� ��� �� �

����

��

������������������������������������������

���

���

��� ��

���

���

���

��� ��

���

���

���

��� ��

���

�������

���

���

��� ��

���

�������

�������

� �� �� �� �� ���

U���=

��������� ��������������+�*�

Page 45: Getting Started with VNMR 6.1C

��������$� ����#��� �

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�����+� %,� �������

2�������+���*���� ����������������������������������������0����������+�����5�0���� ������������� �*� ����0������������������+�����������+���*���� �����������*�00��0���������+�������������������K���� ����0���+������ D��������L��

�����**�+�� ��������������+����� ��+��0����������������������5�0���� !�����*�;�����������+����0��������!����� �����"����+� *�����������+�����������������

����#��#�5��#��

2�������+���*���� ����� �����������������������+�����&����������������� ������+�������!������!���+������������������������+�����2��������+��������������������������������+�������������������� �����"����������0*��������������� ������2���0����� �����+���������������++*���������� �������+����������������������� ������������dg����+����

)���������������� ����0���+������������� D��������!�����F����������������+��*�������;�������!�������0�����+���������� �����������+���*�����������������+���E����& D������������������+�����+�����& D������������+����

���������'��

A��������������!���������������+���� ������������������*����������������+���*��������**������������*����� ��**��*�����+������������������*���������������*������5�0����������������������� �*�����������+�����0���*��;�

��������� ����3���*��� ����

-���

(���+��&

�����

�����&�$��2�$

$��2�$

������&

$��2�$

2.������"���

����#����&

Page 46: Getting Started with VNMR 6.1C

$�$ ���6��&�����������������7������������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

6� ������������������������+���+���*������������������������������������������%

G 2���������*����������������*������������������������������������������������ �����������0��������������� ��������������*�������������������������*�����D��� ����D�����+�����������������KHSeq: s2pulI����5�0������L��2�����D��� ���������������+��������pslabel������������2����������*���� �������������������+� ������������� ��������<����������������KHExp:3I����5�0������L��2��������������������������<��������� ������*��+���*���+��������� ����!���� ����������<���������������������� ��� ������*�� �����*��.�������+�����������+�����������<������������+�� ����+���*��������������0������D����*������������������0�����+�����������*��������+���������������� �*������0�������������<� ����0!��� �����HFTI��������5��������������������������0��������HCONTI�������� ��������*����������0�+�����

G 2����� ��+�*����+���*�������� ��������*����+����0�73�+����+���*����)����������� �����73�+���!������� ��+�*��������*��;�

G 2���� ��**��*�����+������0�����**�����+����+���*���������������0��!��� �����HAcquisition�CompleteI��������"�*�����������������!�������+���*��������������0��!��� �����HError�in�Input�from�Terminal�I�2����+"����0�������� ��**��*�����+���������������������0������� ��**�+��������"���!���� ������������"�+���� *� ;��0��������� ��**������*��0�������+������������+����?��� ����+�����<�������������+��������0�*�0����0�������<�������������� ���������"������0�����*����������������!���+�������������0�������0�����������������������������6+��������

A�*������@������**�������������������� ��**��*�����+����A�������������+���*��������0*��*������*���)������@���������**�+���������������!����������������� ���0��������C������"��������<����� �������������+����2�� ���0����������������*���������������+��!���������$HOME/app-defaults/Vnmr���*�����~/app-defaults/Vnmr����������<���+�������+� ���0�������������K���������������� ������� �L����������+��������*VNMR*errorLines��������2����������� ��**��*�����+�����������0*��*�������+��!� ���0������*VNMR*errorLines������������������ �+��0�����*�������������!� ���� ����

)������� ��**�����������������!�����errlog� �����+�+���*��������*�������������������0����������dg����0�����2���0*���*�����������errloglen� �����*����������������*�����+���*���+!�����*������������+����*���errorloglen��������������*�"�����*����+��������� �����+������������**����0� �����+%

create('errloglent',”integer','global')errloglen=20flush

������������������������+�����*�����"�+��������������������������<���������������0�������+�+�����������*� ��������������

1��������'��

#�*�����������������+��!��� *���+��������<!�����������������+����2�������+������������*���*� �������������� �����+�!���+������������� ��"������������� ���������������

Seq: s2pul Exp:3 Index: 1

���������� ���������+�����+�)��������+��

#p=-70.1754rp=64.1578

Page 47: Getting Started with VNMR 6.1C

��������$� ����#��� �

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

A��������������!������ ��"�����������+��������"��0������������������������������������������+������+��������0�����*������������������2��� ������K�����**���<L��� �������*�+������+� ������������� ��������������+���������������������;������+��

&����������������!����� ��������"������������0�����+� ����0����� ������������������������������0�����������;��������������������+��������*��������������������+�� �����������0���0������� ����������������*� ;��������� ������������0�������2���� ����*������������+���������*�������������������+��������� �� �����+��&��������������������+!����� �������� �� ;������*������������+����� ���� �������<���+������� �����������������

����������������9!�H/���0�����������+���+�!I�!�������+����*�+�+�� ������������������0� �����+����+������������������������������+��!��� *�+��0��+����0���������������������;������+�

�����������#������

#�*����������������+����������������������������������������6� ��������� ����+���+������������������5�0������������������� �*������0��������������������������+������������K������������ ����0���+��������� ��������!����& D����������������L%���������������������������������!���*�������������������������K��� �����+���*���+���� *� ;��0����������������������������������������������L��

2����;������*� �����������������������!� *� ;��������+�����+����������������������*�������������������������2��������������������0���C�+��������������������+�����������������*�;�*����**����+�������"���!�����������������������������������"����*�!� *� ;��0�������������������������*+�����0���������"�����

5����<���*�!�������������<������������� *� ;��������6<�������������!������������������+���*���+���������� ���������������������������������5�0������!�����6<������������������������"�����?���D�� ;*�����*�C������� *� ;��0���������������������������������������;���������������������������� *�+���6<����������������������������K*���*�+����6<������L��2�������������������<���������������*+� *� ;�������������!������ *� ;��������!���+�����**�� *� ;����6<��������

&������������+�������������+�� ����������� �����������������*�!������**������������

�����W������W�()�!�*"�+����������8!�H/���0�������������������!I�+�� �������**���������������������������+��+��������

2���*���*���+�� ����������**�������������������������������� ������ ������C�+�����*� �*������2������ �+�������+�� ����+�������������*�� �������-&�))�����

%����� �����'��

#�*������������������������������������0����� �����+����)����������+�������+���*���+�5)3�!���� ���!� ��������*���!���+�������������������+�����2���0����� �����+����*���+���*������*������������5�*�������������������������������*� ��+���� ��� � �����+�������+���*��������������������������+��������<�*����+������0���������������*!������������ ������������������������� �����������+���*���+�������������

2���0����� �����+��� ����������������**!������� ������0����� �����+�����+�����dg����0���� ������"����+�����������������!����*��0�!������� ������0����� �����+��� �"��������

���������� �����������#������

Page 48: Getting Started with VNMR 6.1C

$�$ ���6��&�����������������7������������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

��**�� ������?��� ��� ���0����C��������0�������������������������������0��� �����+�����������������+��%

G 2����*��0������0����� �����+��������**������ ����!���*� ���������C��������������������������������������������large� �����+��

G 2����+� ��������C���������0����� �����+�������������**���C�!���*� ���������C��������������������������������������������small� �����+�

G 2���*�������*���� �"�����+� �� ��*�����dg����0��������������� �"���+��������0����� �����+��!� *� ;��������5*���������������������������������������������flip� �����+�

)���������������<� ����0��� �����+!��������������������� ����������������� *� ;��������0*������������������+��"�������0����� �����+���

'&����&���

&��������������������� ������������dg����0���!���� ��������+����+���*�������������*����!�*����*����!���*����*��!���+��������*��������� ��������������5����<���*�!��������0�����dg� �����+�����������������+������+� �����+���*������� D�����������+���� �����0��������������+�������"�*�����������dg����0��������*������5�0�����$��

2���dg����0����������� �*�����&���������+��=���<��������� ������*�������������������*���������������������� ������������������������dg����0������0������+� ������������������������ ������+���*���+���������0*��� ������)������� ���!���� ��**��������������*��0������+0������������+����KA��������������!������ ��**���������*�������������L��*� ;��������� ��**�����������������������������"���������*����������� ��**�+��������"����

?��� ����+�����<�������������+��������0�*�0����0�������<�������������� ���������"������0�����*����������������!���+�������������0�������0�����������������������������6+��������

) *������������'&����'��

2���2 *�K2��*�������+�,��0��0�L�"����������+0�K2 *�+0L����"�+������������ ��"����������+����A���������+0�����"��*��*���������������������!�����2 *�+0����"�+����� ������� �����*���!��� *�+��0������� ��"�������������+F�������������"�������������������++���������� �������������

��������� 2��� �*�����������3���*������dg����0���

Page 49: Getting Started with VNMR 6.1C

��������$� ����#��� �

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

2���2 *�"��������������dg����0��������+����������tcl/bin�+��� �����������������������+��� ������&�2 *�� ����� ������������������2 *�"��������������dg����+����������;����������������������+���*��������� ��"����+��**���� ������C�������������*������

)������2 *�"��������������dg����+����������� ��"�!�����tcl� �����+��������+����������0�5��������������������������2 *�� �����!������ �������-&�))����

����(������$������(��#�����1���&'

2���dg�������� �������*� ��+����������0�����/�)@���"���������*�"�����*��vnmrtext����������**�������������dg����0�����2�����**����0�*���������� �login���*����*� ������������� ��"��dg����+��%setenv vnmrtext $vnmrsystem/tcl/bin/dg

�����(������$������(��#�����1���&'

)������ ������������������"�����*�����������#� ���� ������������������!�������������� ��"��dg����+�����**������*� ��+�

�&�%��������$�����1���&'

2���dg����+������������*����� ����0�����������*��?��� ���� ��"������������*��������*�������*����*+��0�+��������'��!����;�����+��������0�����*������������������"�����*���*������/�����������*������"�������������+��������+0����+�����+� �������������"�������������5�������������������������� ����0����0�����dg����+��!�����H�������C��0�����)����� ��"��+0����+��I���� ��������������������-&�))���������*�

�2�2+.���'�������**����'���

)��A������+�������������0!����������������0������+� ��������������� �*������ �����+���*������������ �����������**����+���!��A�A,6���+����!�������������5�0�����7��/�+����36!�������� ���������������+�+�

2����A�A,6����**����+�������������� �**�� �����+������A������+�������������+����*�0��������K+������ ���������������+��������������� ����*�L��2�������+���������+��������/�)@���������0�����������+���*���+��0����� ������0����� �����Hsu command succeeded for user AI����Hstarting Acqproc�I�2�����������������0��!�+���*�� *� ;������A�A,6�� ������������*������������������3������D���������A�A,6����**����+��=����������!�������������0������������������������ ;0����+�������;��� �!� �����0��������+���0����� ������ ��**���������� ������.���"��!����������������0��36!����� ���D������������+���

2����������**����+���� �������*����������� �**�� �����+������A������+�������������+��#� ������"����/�)@� �����+���������������+�����������**����+��!���������� �����+�����������������������+������������+������������+��0����� ������0�����������������+���*���+���������������+����&0���!�+������D������������+����.���"��!����������������0��36!����� ���D������������+���

5���+����*�����������������+������+���A������+���!�����������*� .openwin-init�

�%�����,�5��#��

)���++�����������������+��+��������+����+�� ����+����"�!���������������+��������������*�!������������ ��������**�����������D����*�������������������������;��������������

���������� �A�A,6���+�������**����+���

Page 50: Getting Started with VNMR 6.1C

$�$ ���6��&�����������������7������������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

�������� �**��������������������������������������������������������*����+���������������������& D������������+�����+�������� �������������� ���������������������������"��*��*��������������;��� ��������������������������������;��� �!��� *�+��0�����A�*���!���**�2��*�!��*� ;!���+���������� ���������

- 8������������'���

)��������������������F����������+��*�������;��������������� ���� ��+��������� ��������!�������0�����+���������� ����� ���������+����������������*�� D������������+���%

G 2���& D������������������+���+���*������������������������������������+����� D��������%�)��+��������0�� D����+�������������������+*�N�.���������������������"������� ���*���+�K�2L!���+���������������������+� ���*�������������������<��������N��������������������0�����+N�������������*� ;�*�"�*N�2���& D������������������+���������� �*���������������+����/��������������+������+�� ����+������������8�

G )������& D������������+��!�������"���������*������������� ������������ D��������� ����*���A�������� �����������!���������+��� ���������������������������A���������������!���� �����*������ ��"��KHCONNECTEDIL���������� D����������������������0������)������& D������������+��!����������� ���������+�����F� ����+������������*���K����������+���������"��*��*�L!�����������������������+����!��+F��������*� ;� �����*!���+��+F��������"������������0��+�������/��������������+������+�� ����+������������7�

#����� D������������+����������������� �**��������������������������������������� ����0���+������ D���������K������+�����������L��2�������������������+� *�������������+���!�����H6������0���+�6<����0����!I���0��7 �

%+19.�1����� ��"��- 8�����������'���� �����&����'��

2������ �������� ��"��+����� D�����������+���� �����0����+��!����������2��*���8!����� ��"���+���� *� ;��0��������>,)36�������������������������������������������0�����glide� �����+�����������������+���

���������� ��� ��/����)������ �����+��

Page 51: Getting Started with VNMR 6.1C

��������$� ����#��� �

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

����������������7!�H/���0�>,)36!I��������+����*�+�+�� ������������������ �����+���

���6��� ������

��������+�����������0���������� �����*���������������������;��� ������!����������5�0�����9��

2��������������;��� ���������+���;������*� ����%

�� ��"�������������������"����������������������;��� ��������������� �����K������������+����������L�

$� ��������+���*+�+����������0��������������������*��������;��� ����������������

7� ��������������*+�+����������0������������������+�+��0����� ���������������������������

8� )�������������������������&����**������0*�����������0��������!�����*����*���������������������������*� �������������&�������"���*��� ��+�!��������+����������������������0�������������+��

)�����������������������������**������0*�����������0���������K�������!��������0�������+�/��*����������������������;��� ������L!��������������������������2������������������!� �������������*+�+����������0������������+��*�+�����������������+�������0��������������!�� ��������������0*�!�����*������������������!��������"������ ��������������������������������������������+���*����������������

.����������������0������ �����*��������������;��� ������������������**�������*�����D����*�����%

& D�������������� A���������& D������������������+��!����������������� D������������0�����+�� ����+����"��

����A�*��� 3���*�����������<��"�����������**��������������������*���� *�+��0��**��������������������� ����&))������-)������%���(����+��**�������*�����D��� ��������������������� �������-&�))���������*�������������*��"����������0��������**��������������D�� ;�������"�*���������*���������0�������������

���� & ��"�������������+���*������+����)����������+���*�������*���+��� ��"�!���*� ���0������ ����������� ��+������� ���������+���*���K������*�����*���!� *� ;����6<���������D���L�

���0���� A������������������������� ��� ��!��� *�+��0������������*����0����%

��**�2��*� &**����������������� �����������/�)@���������0�����������������������+�����**�2��*����+���������������������� ���!�+�*���!� �����!���+��+�����*��!�+���� ;���!��������� ���!� ���0���������+�!������������ ������0���0���������������� �������!���+�������

�*� ; 3���*������ *� ;������ ���������������+�������������!������<���*�!��������������*�0����+�0���*���*� ;�������� *� ;�� �������������0�����������������������������*� ;�����������������������**���� ������C������

�������� � ���;��� ���������+���A������+���

Page 52: Getting Started with VNMR 6.1C

$�$ ���6��&�����������������7������������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

�9.�����

���0����� ����*������� ����+�����������36����*���!����������5�0�������

�*����&���'�2�����&����'���

6� ������������+������������ ����� ������ *���+���+� ���0�+���������**�� ��������� *���+!��� �����+��� ���0�����������**!�+����� ��"��� ��!�������������5�0�����1��2���� �����������*�

�������������+���������������+��������*+�*�;�������� �������� ��

2�� *���������+����������!���"������������ �������������*������������+0������������+�����+� *� ;�������0��������������������*������������������������*� ���*�������������������&*�������"�*�!����� �����"������ ��������������������+��������������� *������+����������������A����;���K,1���������;������+�L��������;������+�

2��������������������� ���!���"�������������������"�������+�����+�� �����+��������+���*�� *� ;�����*����������;����������������A����;���K,1L��������;������+�

�������/ �������*���-�������0�1����*�������2�3������*�+�������+4�5�����������-������+�6,��0��������%�����!�6��% �#������#�%���!���� �����������,�1��� ��=� ����'�����!����,� �#�����-�����1��� ���,,�����1��������������������#�#� 6���#�#������,,�1�������%��#����,� ��

2��� ���� ����������<����������������������������� ������+����������+����������+���K����� ��� ��������0��������+�H������I�����������L���+��������**���������� �+�������H6������0���+�6<����0����!I���0��7 �

��������� ������� >�"������������+� ����������������+�������/��������� ��������������;��0���+���������*������������������������� ����������0���0������������� ;0����+�

���������� �36�2��*���

���������� ) ���������*���+��������+���

Page 53: Getting Started with VNMR 6.1C

��������$� ����#��� �

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

Page 54: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

��������3� � �����!�"��

� �������������� ������%

G 7���H& ��"����0�>,)36!I��������0��

G 7�$�H/���0�>,)36!I���0��98�

G 7�7�H�������C��0�������������6<���������!I���0��9��

��� ������������������� ��+���0��+�������*;������������)���� �*������������!�� D��������!���� �����0!���+��*�����0����;��2�� ������C����� �!�������������������*�1�2��� ���!���� �� ���������������+����*�+�+�� ����������������������� ���

��� )�����������!�"��

��������������������� ��������� �!����������5�0�����'!�����������"��*��������������������������+����

&�������� ������������ ��"���+!�������� �������������������������������� ����������00*�!��**����0�������� �����+�����������"�+������"���������++��������+����������+����

�%�������!�"��

2�������������� �������������� �����+��!�+��&������������**����0�� �����%�

G �*� ;��������������������������������������

G 6��������� �����+�glide���������������������+����

,� �����!�"��

2������"��������� �������������� �����+������������+���*�������;�����������0����������0!� *� ;�����������������������������������������������2������0��� ;�������� �����+��!� *� ;��0������������������������������������ �����+�glide�

2�� *����������� �����0�������������*��0������������0!���;���������������**����0�� �����%

G �*� ;��������()�!���������

G 6��������� �����+�glide('exit')��

���������� ��� ��/����)������ �����+��

Page 55: Getting Started with VNMR 6.1C

��������3� 0���&�%+19.

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

?�����0��������;�+���� �������������������������<������ ����������C��0�������*��glide_defaults�K+�� ����+�������������*�1�2��� ������������ �L�+������������������������������������� ���������������+���

��� � �����!�"��

2������ ��������� ����;�����������0���� �������������������<�����*��������6� ���<���������� ����+���������������������� ��������������<� �*�������������������A�*������������*��������������D����+���������� ���<����������������*���%

G )���������������*��

G ������������<�����������+���*"����"�������6<�����������������+����

G �*� ;��������>���������

��� �� ���������������� �����*�� �����<�K*���*�+���� �L���+���<��������%�����!�������!�>�!�6<��!���+�.�*���5���+�� �������������� ������������������!��������������1�2��� ��������*�

��������������#��#�&'%���!���

&����� �*����������������� �����+�� ����+����������**����0����������������� �+��������������0����3��������������+������ �*���������

�� )��������� �������������� ���������+���*���+!� *� ;����������������������������������������

$� )��������� �������������� �!� *� ;������!�,��

2���6<�����������������+������������������� �����

7� /���0�������0���������������!� *� ;��������������������*���*�+�(),���#��!��

&�������������*��������"��*��*���<�������������+���*���+��

8� ��**������0�������<���������*���������*+��0�+����������0������������������+�+��00��0������������������0������ ��� �����*�����������0�������������������������-��!����.�������������0�*�0���+��

9� /���0�������0���������������!� *� ;��������������������*���*�+�Solvent��

&�������������*��������"��*��*����*"��������������

�� ��**������0��������*"����*���������*+��0�+����������0������������������+���"��0������������������0������ ��� �����*�����������0�������������������������'.'���������������0�*�0���+��

1� )������������������������*�������������"��0�����+���������������<���������������*�!� *� ;�����������*+�*���*�+���/��0�����������*�������������������+���0��������0�

2����������<�!���� ����**����������+��*��0��������������������������� ����!� *� ;����������<���*�������*���*�2�<���A��� *� ;�������������������������������K��+� �����L�����������������������<���2��� *� ;����0�*�0�����������0*�����+���+����������������2����� *� ;����0�*�0���������������*�����5���� *� ;����0�*�0�����������������<���)���**� ����!���0�*�0���+���<�����+�*���+���+����*� �+������������������������� ���� ����K�� *�+��0�������� �����L����*���*��*������<���������������+�

'� )�������������������������� ����������+��F� �� �����*���!����������������������+��F� �������������������+��%

Page 56: Getting Started with VNMR 6.1C

3�$ 0���&�%+19.

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

G )��������*����� ������*�����������0���!� *� ;��������(1� !������������F� ����������*�����<�!�����������������*����+� *� ;�����2����!��������������������������*�������������0����

G &*�������*�!����������*�� ���0���������� ��+���������������!�����������*� �����������������*�������������*������!�����0��������*+�*���*�+�3� �!����

G )������+��������"��������������������+��F� ��������������������� ��������!�����)��������+�6F� ������������������+���*���+���+��������+���������**������������������*���

� �*� ;�������!�,������������<������������6<�����������������+����

& D���������+����������0��������������������� �������*��������0������������������A� ������ *� ;�����!�����6<�����������������+���+���������!��������������+�>������������ ����� ��"�!���+��������������������+������������

��� 2������+����*��"�*���!� *� ;����4������������ ��������� ������ D���������� ������

2������������**�����*� ;!���������!�� D����!���� ���!���+��*�������+��������0�����+����*��������������

���������&���

��� ���<���������� ����*������� ����+����������enter����0�����2����<�����������*�� �����+����enter����������"�+������+��� �����������������������5����<���*�!����� �����+�enter('abc')� ���������+��� ���������+�abc��&���*������+�abc���+���������+��� ���������+�abc.macdir���**������������+��� ������abc����������<��������������������!���+�abc.macdir�������� ����*���+�������������������������������������

� ��!�;�������+�&'%���!���

)���++����������������"����*�����*���+�� ������!���� ����������������� ������C���<�������������������!������<���*�!������ ������������0������������������ �������������+����*���&������<���*�!�����������������+����*������������� �������� �������3��������������������$8��?��������*�!�����"������D����� �� �������+���+��������+���*������ �����?��� �������������� �������3��<�����������+���+������������������� ��������0���� �%

�� 5�**����������������0�� ��������H�����0������+��+�6<��������!I���0��98!�����������+���� ������0���������3!� ������'����� �.���������8��

2������������������+������������2�������+��������������������������� �������������� ����+����������+������������������������ ������ ���0�+��2��������+��������������������������������������+�����������+���������������%

)��������������+�!����� ������C��� D��������!���� �����0!���+��*�����0������������+���*���+�����������������+����������������������0�� D������������������>����������#�� *� ;��0������*���������������� �����������+��!��������������+������ *���+���+���������������"�*����������"�+�������**������������+�����������**����0�������

)�������� ��+���+�!������*��� ���0������������!�������� *� ;��0��������3�������������($����������+��!���������+����*��� D�����K������ D����L�+���!���� ��������+������������ ����+����������������*�������+���������������� ����+�������������K������������ �����������+�����������������+�����+����%� *� ;��0����3���������& D�������������+�����*��� D�����!� *� ;��0����3��������� ������������+�����*����� �����!���+� *� ;��0����3����������*�����������+�����*���*�����2�����**���������������*���<�*������������ ����� ���0��0������������L

$� �*� ;��������0 5�������!�,������������������������������+����2���& D�������������+������+���*���+�������������������� �������������$8���K�����������������������

Page 57: Getting Started with VNMR 6.1C

��������3� 0���&�%+19.

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

"���!���������� ��**��������������0�����+������������+������� ��**���������"���L��)��������<���*�!� ���0����������������� �����������$8���������� *� ;��0��������*�������������+�����������������+�����0�����#� ;��� ��;������+�*�������� �������"�*����2���������������"�*���������

7� �������������+���!� *� ;��������'����������������<�����+���"������ ���0��� &��&��(��(2�&���$�� &�"���&�����$����&�����������,&��'��$��&�(4��������))������,*�

�*� ;��0����3����������;��0��� ���0����������D��"�*��������������0�����go� �����+������� ��� D�����������0���������������������� �����0������������+��

8� �*� ;��������-�� ���������������������������������+����2������ ������������+�������������������� �������"�*�����������5����������������+�,����#���+����0��2�� ���0������"�*���+���*���+!�+�*������������������������#� ;��� ��;��!������������"�*��!���+� *� ;���������������

9� �������������+���!� *� ;��������'�����������������"������ ���0�����+��<���� &��&��(��(2�&���$�� &�"���&���������,&��'��$��&��&(�����$������))������,�'��$��$��

�)�����,&��$#��($&����K�������������*������������*������� ����+�����*���+����������<��������L��

�� �*� ;��������-��!������������������������������+����2����*�����������+��������������� ������C��0��*���*����������;������ ���0������������

1� �������������+���!� *� ;��������'�����������������"������ ���0�����+��<���� &��&��(��(2�&���$�� &�"���&���������,&��'��$��&���&���$������))������,�'��$��$��

�)�����,&��$#��($&����K�������������*������������*����;���++������*��*��������������� ����+�+���L�

'� 6<����������������������+������ *� ;��0�������������+��������0������0*����������������������������������������������� �������������� �����+���

� ���������������"�� �������**��������������������� D��������!���� �����0!���+��*�����0!� *� ;�����4������������������� �������������� ��������������� D����������

2���+������**����� D����+!���� ����+!���+��*����+�����0�����"�*����������������������������������+����

��� � ��!�;�����!1��������&'%���!���

)���++���������������0���� ��� �����������"�*��������3��<���������!���� ���**�������������*� ��������������� ��������������"�*�����������*��������"��*��*���<������������+���������*�� ������C���� ����*� ��+��<����������&������<���*�!���������3�������!��A?!���+�.�B���<�������������������*�!�+��������**����0������%

�� A��������6<�����������������+��!����+�� ����+����H�����0������+��+�6<��������!I���0��98�

$� �*� ��&������&����!� !���(),���#��!�����������6<��������������

7� 6���������������������/��0�����*+��?������������**���������+�+��������+��� ���������������� ���**�+������**���������+!�����!�~vnmrsys/data�

8� �*� ;������!�,����������"������+��+���������������������+�� ��"��������������������

9� �*� ;��������0 5������ ���������������& D�����������������+���

Page 58: Getting Started with VNMR 6.1C

3�3 �������:��&�������������.;���������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

�� �*� ��������� ���*����+��!���������������������!���*�<������+�*�����+���*�����0*���������������*���2������ ���*����+������� ��������**�������+������**��<���������=�������������*� �������������+���*�����������3���� ������

1� �*� ;��������'6�7�������������������������������<�����������*� ����������

'� )�������������+��!����������5�0����� !���������*�������������������� ������������������������������������� ���������+����������������� ����������������A?��<����������2���"�*������������� �������������������+�������+���������

� �����������"����+������� ��� ��!� *� ;�����68������������������������+������ *���������+��++������A?��<�����������������<���������*�����2���*�������+���*���+��������������<�����+�����+����������������������A2A����+��A?�

��� �*� ;��������&�9'�����������������++*��������������<�����������*� ����������������������.�B�� ������C���������+������������5�0����$��

��� ��;���������*� ��������+� *� ;����68�����++�����.�B���<����������������*������������������������������<�����+���

�$� �*� ;��������'�������������������"������& D�����������������+���

�7� �*� ;����������+��������0������0*�!������������������������������ ��!���� *��������������������

�8� �*� ;�����4������������������������ �������

$���� ������#�$,��������!1��������&'%���!���

������� �����0���+��*�����0��������� �**���������������� �� ������������<�����������2����3����������� ���������*�������� ����+���+��*����+!����������A?�K������������L���������������"���<����������������"�+��������+����+��� ������������������*��K��� ����+���������"��&�����*+�����������������+��L��2����� ������+��*����������<���������!�����+������������

���������� �A?��������C���������+��

��������� .�B���������C���������+��

Page 59: Getting Started with VNMR 6.1C

��������3� 0���&�%+19.

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�� �**�+���+���� ��� ��*�����0�� ����������������;����3���� �������� �**�+���+���� ����+��������������������3��;����6�"���������K�36L��������������

� �**��&�9��������9.

#�������� �**��0�+���!��������� �����+�listenon��������"�����"����*�������0�"���K�� ���������� ����L������������ �+����������;�

2���� �**�+��������������36�5�*�����0��!�+��������**����0������%

�� ����0���������+��� ����������� ������+�������������+�

$� 3���*�� *� ;������ �����������+�����+�+����K5)3L����*��+���+���� ��������+���!�����0���� �����0������������K�� *�+��0�������������������� �����0��� ��L���� ������������+����������+���������7$������1���&'��+��������(��&��"�������%&��$������&��*�

� �**��&�9����0���&����������

2���� �**���+���� ����+��������0����������!�+��������**����0������%

�� �*� ;�����������������������������������������������

$� )���������������*���+���������+����+��� ����!� *� ;��������.0�0����������������� ��+�*�"�*�������)�����������*���+���������+�����+�+��� ����!� ����������������������� ��+�*�"�*������

7� )���������+�����3&2&�������!����+�����������������+��� ����� ��������0�����+������������������ �**���+���0�*�0��������� *� ;��0����������������*�����������������

8� �*� ;������!�.��� !��$���������� ��+�*�"�*������

9� 5��+�����������������+������*��������������*��+!���0�*�0�����!���+� *� ;�����3�������������������� ��+�*�"�*����������� �**�+������+���� �����0�����������!��� *�+��0�������� �����0��� ���������

�� 2����� ��������+���!� *� ;������������������������������������*�"�*��������+������ *� ;��������0�!�-�� �������������������� ��+�*�"�*������

&���������+���������������� ����+!���������*����������������������������� ��"��+���*���K�3����$3L!����������� ����+F���������<�������!�"���� �*�� �*�!�����������*+����������;��0������*�������������������������3���4���������+����*��������������� ��"��$3�+���*���

1� ���������+���*�������������+F����+���������������� ����!� *� ;����0�!�,��!���������� ��+�*�"�*����������*������� ������*��+���*���+������������������� �����

)����0������*�������3���� ���������"��*��*��K������� �������+����+��� ����L!��������**�����*����+��*��0������+0����������$3���� ����������+�������������������

5�,6�%�����

������������1�2��� ��������*�����+����*�+������� ������������������������H��*;�����I��<������������+�������� �*��������������0�������� ��������� ��

Page 60: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

��������4� � ������������������� ��!

� �������������� ������%

G 8���H���;��0�����������!I���0�����

G 8�$�H�������C��0���������������!I���0���8�

G 8�7�H���������������������!I���0���8�

G 8�8�H��������������!I���0���9

G 8�9�H���������!I���0���9�

G 8���H���;��� ������!I���0�����

G 8�1�H����������!I���0���1�

G 8�'�H& D���������!I���0��1��

G 8����H3���*��������!I���0��11�

G 8����H&��*�C�������!I���0��'��

G 8��$�H5�*�������!I���0��'1�

G 8��7�H� ��+�������������!I���0�� ��

,�;���������������!�������������������� ;�0�� �������������+��������0���;������+������������ �����+����+�����������!������ �����0���� ����������� D����+!���� ����+!��*����+!��� ��#�����������������*����� *�+�������<�����"�����������������!���� �����������������"�+����������������������������**���� �������������������*���� �����������������0���������� ��������E�<��������������!�� D��������!�+������� �����0!�+���*��!��*�����0!����*����!���+��������������������**������*���������������������� ����������������������������������*���*����������������������;������+�

2����������������������"�+�������< �**������ ��������������������������0���� D�����0������� �����0�+���������*���*���������������0��)�����M���� ����������;���������wft�������� �����+��������������������0����0��������5)3���+���5����������������!��� �������������������;�+�>��.+�?����&"��%������*���<�*���������)���*������M���� ����������;���������dpcon����+���*������$3� ��������*��!��� �����������������;�+����������*�������"��*��*���

/���0��������������������*� ��������*�E��"��������������������� ������������������"�������+�����+������������!������ *� ;�K�������������������������+���*����L�����*�������������������������2������ �����;����5�!�5$!����5'��� ���������;������+� ���������+��������*�������"�������+�������*� ���0�������������0��������������������**��������< �����������������������K+�� ����+���������� �����H��������������!I���0���9L%�;���5����*� ����������������!�5$���*� ����������$!�5'���*� ����������'�

3���������������������+*��*���*���������������������!�������������� *���������������������� �*���������� ��� ����**�+����*� ;��0���������������*���*�+�.�*������������������������K��� ������*������"��*��*�L� ����������*��� �����������+���*���+����������<�����+����2����� ��������"�+�������<�*������������� ������������������������+��<�*������������ ���������������������������������������������������������������"�����

Page 61: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

A�� 5��6����5��������

&���**������!������������������ ��� �������� �����*����������������� ������2������������!���� �� ��������*� ��+���*���������0�����������K��+����������� �����;���L!������������������������&*����0������*���*����+�� ��������������������������� ������C��*��K�������������*�� �������-&�))���L!���������� ������+������ ���0��+����0���������������

,� ���+���*����������������������������������������������$���������������� ��� ���"����+����+��0��������� �������������+���*����2���+����*������������������!���� �� ��������������**����0��������%

2������������� ����*��������� ��"���+���� *� ;��0������������������������������������������������?��� �����;����*� ��������������������������������� *� ;��0����������������������������0������������5�(5'�;���!������<���*�!������*� ������!�������5$�

��;��0�����*� ���������������������� ��������+������������������������������*� �����������������5����<���*�!����������*� �����������������!�������**����0��<������������������������!� �**�+������ ��+�������������!����*� ����������������%

#�� *� ;��0���������������������K����������0�59L��������� ��+�������������!����������������������*� �������� ��+�������������E���������� ;�����������������+�

���*��*�!����� ���+���*���+�C������������!��� ��������������� ����*����� �������� ���������� ���0�������������������5���������� �!�2��*��7����*�����������%����"������������������������������K����H�������C��0���������������I���*��L�������������������� �**��������������������+��*���+��������*����

)�������������!����� ����*��� �**����������� �*����������������0�menu(menu_name)!�������menu_name�������������������������K��0�!�menu('workspace')� �**������������;��� ������L��������������"������������� �����+=������<���*�!��������0����� �����+�files�+���*��������5�*��������������5�����������������������*��!�*��;��������/vnmr/menulib�+��� �����

������������*� ���0�������� �*�����������������+� ����������������� ����!�+����+��0�������� �������"�*������ �����������������!�������������������+���!���������������+��������*���� �����5����<���*�!�������� ��������������������!�������� ������+�3���*����������������������*��;���������������������<�����������*+���3����$3�+���!���+������+���*������3����$3��������������������������<����������

=�����������$�����! ����������

2���������������� �������������������������� ��"�����0����Edconi!�df!�ds!�ll2d!��� �E����������������������������������������������������������2��*��7��� *�+������������0�������+��������2���������������0����!��������������0���������K��0�!�dconiL���� �����������0�������������0����+���������������������������!��� �� ����*������ �**�+����������������������������������������������*����+����2��*��7�

Page 62: Getting Started with VNMR 6.1C

4�� ���6��&�����������

��� ������� #���$ %�����&������'(���������

������� ���������������K����������7L

����C���#��,���#�1������,�1�, �!��� ����������1������#� %,� ���������!����

$��!�����������9�,�� �%�� ���:-�%����."�)1����)�*- ����,�!#- @2=+&- ���������- <�,%- 3,�%- �� �;� )�*�

����������9��!�����������1���������$��!������!���:-�%����."�5��6 %��� ����% )�*���� $���� +� %,� )��, ;� 3�,� ����

5��6 %���������9��!�5��6 %����1��������������!���:-�%����..2�1��� &'%� &'%� &'%A &'%" &'%. ��������� +�,���

����%������9��!�����%�1��������������!���:-�%����.�<�-+,� ��-+,� ���,�� -��,���� ��*����� )%%���#� )�*����

���,�� ���,�����������-�%����./<� <� �� ��" 3�� $�� ����� ������

��,�������,�����������-�%����./+,� +�� ���;��� +��� )������ ����� ������

�+�$�, ����*����������%�����-�%����./)$0 +&$0 =�&$0 �=��� ��$�2 �����=+ �+ ������

�+�$�, ����*����������%������#�� �����-�%����.�+�$�2 ��&<� B$�2)� ������+ �+ ������

�+�$�, ����*����������%�����-�%����.���> ��>$� <&0�� ��&�> ��&�> �+ ������+ ������

�+�$�, ����*����������%������#�� �����-�%�����(+?��> <&0�+D =�)+?0 <���+D 0��> �+ ������+ ������

)%%,������� ���#������-�%�����(����#��# =!����� ������

)�*����������9��!�)�*�����1��������������!���:-�%�����(�����0�!� @� @�-5� @�-$����#���5� )���!����

�+�+����$���� ���������9��!�$���� �1��������������!���:-�%�������+� %,� �3=+ ��,����$���! )#4�5�������� 0��� ��! 5�����-0��� ��!

=������������+�3=+�+� %,� �����E#�%�����!-�%��������' =!������ &'%��# �� + ��,� $�� � ������

�+�$���� ����$���!���������%�����-�%���������50 �� �,�� ����#�� 7F)� 3�C�!�,, ���!�, 2���� ������

=�����������5�������������E����%�����!-�%��������'���# ,1 1 1 � � ��� ������

=������������+��%�����!�+� %,� �����E# �%�����!-�%��������' $����=������, 3�,, %��% ���6 $�� � ��'� ������

9���������������-�����:

Page 63: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�+�+����$���� ���������9��!�$���� �1������������������:-�%���������,����$���! )#4�5�������� $�� ��3� 0��� ��!�3� 3�,,�0��� ��!

�+�$���� ����$���!���������%�����-�%���������50 ����1�,, $ ��#� 7F$< 3�C�!�,, ���!�, 2���� ������

�+�=����������!�$���� ��������-�%�����A�,�����% )#4�5�������� 3��0��� ��! ��%����

=�����������5�������������E����%�����!-�%��������'���# ,1 1 1 � � ��� ������

=������������+��,�����%�+� %,� ����������E#�����%�����!-�%�����A��' 0���� $��4 &'%��# ��#��� $,�� $��6 ������

=������������+�+� %,� �$��4�����������E#�����%�����!-�%�����"<%��49!�': <%��49 �!: �%��49!�': �%��49 �!: $,�� ����,

=������������+�$��6�$��6�������������E,,�#�%�����!-�%�����"7��� )2�� ,�#� *�&�#�6 '�����

�+�$��6�$��6����)���!���������E,,�#�%�����!-�%�����"@�: 1��� /�#�%� ,�## @��+ 72��&� '�&�� '�����

�+�$��6�$��6����&#�������E,,�#�%�����!-�%�����.@�: -��� ��%��� ,�## 0#��� 0�%���� ��:� '�����

�+�$��6�$��6����3�,������E,,�#�%�����!-�%�����.'��2 '��2���:� >�������:� @������,�#� '�����

�+�$��6�$��6����+� %,� �����E,,�#�%�����!-�%�����. 2�1� 2���% 2�@�: 2���# �+�7## 2��## '�����

�+�+����+� %,� ������9��!�+� %,� �1��������������!���:-�%������/��$ ���������5� -�&&�.� ��A� '������&& 1#�� -���

�+�+��������%�,����������-�%������*0 '�.��� @0 7����+�&� 72��/� 72���� 72��>1 '�����

�+�+� %,� ���;����,�����������-�%�����/��"� 0����� '�.+� ,�##������� '�����

�+�$,�����������-�%�����/1#�� ���#� 1�1���%& 1���%& 7##�1���%& 1���& 1�.� '�����

�+�+����+� %,� ������#�� �����-�%�����/����& ����.��#& *&&+ *&&� 7/ '�"������ '�����

�+�+����+� %,� ������9��!�+� %,� �1��������������!���:-�%������0�#���-�� 0������ �%�.� ��A� -�&&�.� '������&& 1#�� -���

�+�+� %,� ���;����,�����������-�%��������"� 0����� '�.+� ,�##������� ,�##�$��+������& '�����

�+�+��������%�,����������-�%������*08"�9 *08" 9 ,�#2� ,�#2� ,�#2�� '����� ���%�#�A� '�����

�+�$,�����������-�%����/(7##�0������& 1�&=�B�#6 �%�.� 7##�1���%& 1���%& 1�.� '�����

�+�+����+� %,� ������#�� �����-�%����/(������2�1#�� ,��-�2� 1 '�"������ 7��#6A� '�����

9���������������-�����:

������� ���������������K�����$����7L

Page 64: Getting Started with VNMR 6.1C

4�� ���6��&�����������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

)��, ;�������9��!�)��, ;��1��������������!���:-�%����/�):��������# *)1� 0B�� 722!��� ��%�#����� *����5�#����� '�.�&

&'%�������,�)��, � �����-�%����/�� �1��� � �7��#6&�& ���1��� ���7��#6&�& 1#�� 1���� '�����

)���!�����+&$0�)��, � �����-�%����/�1����&& *�&�#�6 1#�� )2�� 1������� ,�##�7��#6&�& '�����

)���!�������>�)��, � �����-�%����/��*��������&� ,��2�0����#�����& 1#���0����#�����& '�2�&�#�6 '�����

)##G��1����������-�%����/�0#��� ���������5��-�2� 722��������% �������� -���%�%

=�����������)##G��1����������E�##��%�����!-�%����/�@�: ��#��� ):���2 &��$� &�� &�5� ������

�%�����!�,���������������-�%����/�������6&��% �+�$�1���%& ����1���%& ��%�#��� B��.���# ��:�

�%�����!�,������3�� ��+�������������-�%����/�7@ 7@0 7�@ 7@0* 7�@0 7�@ ��+�� ������

�%�����!�,�����������#�+�������������-�%����/A7@0*) 7�@0* 7�@0 7�@�0 7�@� 7�@�0 ��+�� ������

�%�����!�,������0���#�+�������������-�%����/A7C 7C� 7C� 7C�D 7C�� 7C� ��+�� ������

�%�����!�,�����������#�� �����-�%����/A#�&� ����%& �&&�.� 2�&�#�6 ������� ��&��5� E������ %���

�%�����!�,������2����) ���!��������-�%����/"## �&��## �&��"��&��� ������&&�.� ������� ������ %���

+������,����������-�%����/"�&���������&� �&��-��� ,�� '�&�#�& �+�$�,�� 1#�� 722!���

����� ����������-�%����/.�:4#����� :4&;���� :4#�. 2�4#����� 2�4;��2 2�4�:� ��:��'�

����� ����������-�%����/.64#����� 64&;���� 64#�. 2�4#����� 2�4;��2 2�4�:� ��:� '�

����� ����������-�%����/.2�4#����� 2�4;��2 2�4����� 2�4�:� �#�� 2�������� '�����

3�,� �����������9��!�3�,��1��������������!���:-�%����/�����*�������6 ,�#����"� ���� ���2 *��� *�#��� -��� '�����

+������� �����-�%����//0+��.� *�"��#� ����*�"��#� 1����� �%� �%� -��� '�����

+������� ������#�� �����-�%����//�-' 0��������$ '�����

3�,� �=���!����������-�%����/�@6���A� @6�*��� '�����

3�,� �0�%������-�%����/�*�������6 ��A�& >���� '��2�7## '�����

3�,� �+��������-�%�����(���2 ��5��,�* �+�$��+�%& ���2��+�%& ��5��+�%& -��� '�����

3�,� �+���������#�� �����-�%�����(���2�1���%& ��5��1���%& '�����

3�,� ������#�� �����-�%�����(*�&�#�6 )2�� 0��6 '���%� '�����

9���������������-�����:

������� ���������������K�����7����7L

Page 65: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

A�� � ��!�;�������������� ��!

��������������������+���*����*����������������������� ������ ������C�+�����*� �*������)��������������������� ������C��������������+���*����*���������"�+�+�������������*�� �������-&�))�����2���+�� �������������������+���*����*����������������*����*�����������+����*��"�����������*��+�������������������

A�� ������ ��!����%71 7���%

2�����**����0��<���*����;������������0��������� ��������� �**��0�����������+�+���!���� �����0���!�+���*����0���!���+��*�����0�����>�������0������� ���<� �*�����+�� ����+����0��������*�������������0�������������2����0�������0������0���!������0�������������+��������� ��� ��������������"��*��*����������*��0����������?�����0����*�������0���0������0�������<���*������0�������� �����;����������+��������������

�� )��������������������!� *� ;���������#����

$� ������0��������������������K����*�������������������L!� *� ;����������**����0��������%������W���!�.��� !��$�W�-����!��

2���0����� �����+�����������*�������+��� �������K����������������*�������*���� ���� ���L���+���*���K������L��2�������������+���K������������������� ����L���������������������������+��� ���������������� ������*��

7� �*� ;�������������������� ��������������-����!������������*����������0��HDirectory now /I��������������������������+���

8� �*� ;��������������vnmr/������������������"�����"�+��!������ *� ;����'%������

?������������������vnmr�+��� �����

9� �*� ;��������������fidlib/������������������"�����"�+��!������ *� ;����'%������

?������������������fidlib�+��� �����

�� �*� ;������������������fid1d.fid������������������"�����"�+��!���+������ *� ;����+�!����W�3����W�-�� ����W������:��#��

&���� ��������������������0����� �����+���

1� �*� ;����"�)!�W�.� �����

7�� �*������������+���������� ����

'� ��"���������������������������8�������+� *� ;�������%����������������

2���"���� �*�*���� ��������"�������������������� *� ;�+�

� ��"�����������������������������9�������+� *� ;�������$����������

&��� ��+�"���� �*�*����������������������������� *� ;�+��

��� �*� ;����(),�����

&���<�����������������0����������������"���� �*� ���������**���������+���

��� ��"���������������������"������0�����������;�������7�8�������+���������*������������0����� �����+�����*� ;�����(��������������������������

2���"���� �*�� �*�� ���0����������0��������;���������*� ���������������� *� ;�+������������������

�$� �"������������� ���������"��0�����������+���������+����������*���!�+��� �*����+������������0�����������;�!���+� *� ;����� ��������������0����

Page 66: Getting Started with VNMR 6.1C

4�4 ��������������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

�7� )�������������������������������*�����!��*���������� �������� *� ;��0���+�!����W�-��!�W�-��!�W�� ����W�-���#��W�-����

A�A $��!����������

2����������������������*������"��*��*�����������������������������������2����;���� ��� �!���"������������ �������"��������������*���*����������� �����+�����+���+� *� ;�K������+������+���*����L�����*������������������/�*�;���**������������!�������� �����;�����������;������+� ��M��������+������;����*� ��������������������2�����**����0� ��� �����������+��+�����������������������

A�" ���������

A���**�������������!������������������������������������!��� �����������"���������� �*��������������� ���**������������� ��������� ��+��)����������;�����������������������������!��������������������������;��������� ���**�����������������0������� ���������������� ��������� ��+�����**��������������0�������������������������������������������!����� ���"����D�� ;*��0�������������*� �����������������������������*� ���*����

2��� ��� ������������������������*���������+���*��������� ��+�*�"�*������!��� *�+��0������ ��+�������������!���� ���������<��������������������������������������*������������������+��� �*��������������������������������� �������������*�������������� ���*���+��2����;���� ��� ���������������������+��**�*����������!���"������������ �������"��������������*���*����������� �����+�����+���+� *� ;�K������+������+���*����L�����*������������������

8���&� ��(����&�

&�����& D &�����K���������L�����<���������K� D��������L� ������*��������0�����

��� �*���+ ��� �*����� ������*��� ��"�� �����+!���+��**� �����+�����+��0���������������!���0��+*������������������� �����+���������������+������0������;������+!���������������!������������������������

>,)36 & ��"������������ �������������� �����+����&�������� ������ ��"���+!� *� ;��0��������>,)36����������00*���������� �������������� ������������*�������*����++���K� ���**���*� �+���������� ;�������������+���L���+�+���*���+�K����0����������������������������+���L�

��������� 3���*������������������������*��������������������K��0���9L�

.�*� 3���*���������*��� ������������� ������*��� ��"�������

5*�� &*�������*���� �"�����+� �� ��*�������<�����+����/��+����������0����� �����+��� �"����������<�����+���

���C�� ����0���������C���������0����� �����+����)������0����� �����+���������**�K����0����� �����+�����+�������<�����+��� ������"����+�����������������L!� *� ;��0�������C����*��0�������0����� �����+������ �"���������������� ������&*�������"�*�!��������0����� ��� ��������*��0�!� *� ;��0�������C����+� �������� ;��������+����*����C�����������0����� �����+��� �"����������<������������+��!�����5*����������K���"�L������������+�����*�������*���� �"�����+� �� ��*�������<�����+���

& D� A��������� D������������+����)��������������������� ����0���+������ D��������!�������**���������������������

Page 67: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

%�����&������'(��������� ��� ������� #���$

2����������������� ��"���+������*� ���0����������������������������������������������0����� �����+�menu('main')�����������������+���

A�. 5��6 %��������

&**�+����� D�����������+�+������� �����0����+��������0���������������*���;����� �**� ��"�*���������6���)�����6<������������"��������exp1������0��exp9��A�������!��**��< ����exp5� ���������+�����0�����*����������<����������Kexp5�������+������������ �����++:������ ����+�L��&��������������!���������F����+������K��� ���� ��+���L�������� �*����<��������!��������� ��� ������������������<������������+����� ���� ;���+����������������<����������� ��+��0������������+���

�*� ���0����;��� ���������������������+���*�����������;��� ������!���� ������*����������+���*������� �������*��������<���������!����� ����������<��������!���+� ���������+�*�����<�����������*���Kexp1���� �����+����+����*����+� ���������+�*���+L��?��� ����*���������menu('workspace')����+���*����������;��� �������

8���&� ��(����&�

���;��� � 3���*����������;��� �������K��0����L�������*� �������������<���������K���;��� �L����������+�

���� 3���*�����������������K��0���1L��������������������������+����� D���������

& D���� 3���*�������& D����������K��0��1�L�������������+����� D�������������0����������"���*���+���

��� ��� )�����3��<������������� ��"�!�+���*��������3�3������� �����0������K��0��1�L�������� �����0�+����K���0����0!�5����������������L��)����$3��<������������� ��"�!�+���*�������$3�3������� �����0������K��0��17L�������� �����0�+����K���0����0!�5����������������L�

3���*�� )�����3��<������������� ��"�!�+���*��������3�3����3���*��������K��.��L�����+���*���������"����*����� ����+�+����)����$3��<������������� ��"�!�+���*�������$3�3����3���*��������K��.���L�����+���*���������"����*����� ����+�+����

&��*�C� 3���*�������&��*�C����������0��'�L������ �������"���������� ���*����*��������*�!��� *�+��0����������*�����!�+� ��"�*�����!���� ���*��++:������ �!���0�������!���+��<��������*����*�����

5�*� 3���*�������5�*�������������K��0��'1L����������"�����������+���!��+�����*��!��� �

���� 3���*�������� ��+��������������K��0�� �L�����������K*���� �����L� ��� ��!��� *�+��0�������0�����*�����D��� �!�������0�������������/�)@����**!���+��<����0�����

8���&� ��(����&�

,������ 3���*������������<�����+���������C�!���*�����D��� �����+!���+���<������<�����0��<����������

6<��$!�6<��7!��� -�����<���������exp2!�exp3! ���!�exp9��

���������� ��������������<��������!�����0������������"��*��*���������

3�*���� 3�*��������<��������!���������0����������������

Page 68: Getting Started with VNMR 6.1C

4�< ����������

��� ������� #���$ %�����&������'(���������

A�� ����%�����

�*� ���0������������������������ ��"������������������!���� ��������+���������������������<����������2�� ���*�������������!��++������*������� ������+���*���+�������������������������*� �������� *���!���*"���!���+���*�����D��� ��

����%�����

2���������������������*�����������0���������<���������������� ��� �������+�����0��<�����0��<���������!������<���*�!����� ���0��������H�����*I��3� �������<���������������&�2��<����������?��� ����*���������menu('setup')����+���*�����������������

8���&� ��(����&�

.�!�3�*7 ������������+��+���������<���������������3�*7������*"�����

��7!�3�*7 ������������+��+� �������<���������������3�*7������*"����

�� *���!�*"��� 3���*��������� *�����*� ����������K��0���'L�����������������+��+��<�������������0������������*� ���� *������+���*"����

�D��� � 3���*��������3���*����D��� ������������K��0���'L������*� ������D��� ���������*��������3���+�$3���*�����D��� ���

&�����+� 3���*�������&��*� ���������+�������K��0��1�L�

& D���� 3���*�������& D����������K��0��1�L�

Page 69: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

���,�� ���,�����������

2����� *�����*� �������������������"�*������������������������ *��������������tn�����0��������������������!������+���*���������*"�����*� �����������2����� *�����*� �������������� ��"���+������*� ���0������� *���!�*"���������������������������!�����������0����� �����+�setup!��������������0�menu('nucleus')�

��,�������,�����������

2����*"�����*� ���������������������*"�����������"�*�����D�����+������������!�����������������������������������������2���������������� �**��� ��"���+��������*� ������������ *������������� *�����*� �����������������������0�menu('solvent')�

�+�$�, ����*����������%�����

2����3���*����D��� ���������������"�+����������������"���3��<������������+�� �����������������$3���+��++������*��3��<�����������2������������� ��"���+���� *� ;��0���������D��� ��������������������������������menu('psgset')�

8���&� ��(����&�

.� ����� *���������.�

.$ ����� *��������$.�

��7 ����� *���������7��

��9 ����� *���������9��

5� ����� *��������� 5�

�7� ����� *��������7���

A���� ������������H6������� *�������)�������%I���+�������� *������������"�*���

����� 3���*�����������������K��0���1L�

8���&� ��(����&�

�3�*7 �����*"���������3�*7�

3$A �����*"��������3$A�

#��C��� �����*"�����������C����

3�A �����*"��������3�A�

& ����� �����*"��������� ������

A���� ������������H6������*"���%I���+��������*"������������"�*���

����� 3���*�����������������K��.��L=

8���&� ��(����&�

&�2 ���������&��� ��+��������2������*�����D��� �������.����*���*�����*� �����

36�2 ��������36�2���*�����D��� �������.����*���*�����*� ����!���� ������+����0!���+���0��*������ ������

)�6�2 ���������)�6�2���*�����D��� �������.����*���*�����*� �������+���0��*������ ������K�������D��� ����������*��+�������������� ������L�

Page 70: Getting Started with VNMR 6.1C

4�< ����������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

�+�$�, ����*����������%������#�� �����

2����3���*����D��� �������� ��+������������"�+��������������������������3��<�����������2������������� ��"���+���� *� ;��0��������������3����������������3���*����D��� �������������������������0�menu('psgset1')�

�+�$�, ����*����������%�����

2���$3���*����D��� ���������������"�+����������������"��$3��<������������+�� ������������������3���+��++������*�$3��<�����������2������������� ��"���+���� *� ;��0��������$3����������������3���*����D��� �������������������������0�menu('psgset2')�

#)�A� ��������#������*��������������������*�����D��� ��K�������D��� ����������*��+��������������������!��������!�������� ������L�

$�/, ��������$�/,���*�����D��� ��������������+��+�������*����<���������

������3 3���*��������3���*����D��� �������� ��+���������K��*��L�

$3 3���*�������$3���*����D��� ������������K��0��� L�

����� 3���*�����������������K��0���1L�

8���&� ��(����&�

3$�/, ������������+��+�+� ���*�����*�����D��� ��

6�.A ����������*�+�������� �����*�����D��� ��K��*�����*� ��*������������������������*�+����������� ������������**�+L�

@�A,& �������� �������*���C��������*�����D��� ��������*�+��K��*�����*� ��*������������������������*�+����������� ������������**�+L�

������3 3���*��������3���*����D��� ������������K���"�L�

$3 3���*�������$3���*����D��� ������������K��0��� L�

����� 3���*�����������������K��0���1L�

8���&� ��(����&�

�A? �������������� *���� ����*��������*�����D��� �!�����*����"�*���

�A?� ���������������������"�!������������������A?���*�����D��� ��

.62�A ���������������� *���� ����*��������*�����D��� ��

�A6? ���������A6�$3� ����*��������*�����D��� ��

A6? ���������������0��������A6�$3� ����*��������*�����D��� ��

�3 3���*��������3���*����D��� ������������K��0���'L�

�����$3 3���*�������$3���*����D��� �������� ��+���������K��*��L�

����� 3���*�����������������K��0���1L�

8���&� ��(����&�

Page 71: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�+�$�, ����*����������%������#�� �����

2���$3���*����D��� �������� ��+������������"�+����������������"�������$3��<������������+�� ������������������3���+��++������*�$3��<�����������2������������� ��"���+���� *� ;��0�������������$3���������������$3���*����D��� �������������������������0�menu('psgset3')�

)%%,������� ���#������

3������������*� ���������+���0�"��� ��������<�������+����������� ������+�����������������"������������**�+��2���&��*� ���������+����������������+������*� ���0�&�����+������������������!��������������0����� �����+�menu('appmode')�

A�/ )�*���������

3����� D��������������"������������+��� ��������������+����������& D�����������2���������������� �**��������+������*� ���0�����& D����������������������������!������*� ���0�����& D����������������������������!��������������0����� �����+�menu('acquire')�

8���&� ��(����&�

3B�A? ���������A?������+���*��D���������*����+���*�����D��� ��

.62$3- ���������������� *����-�����*"�+�$3���*�����D��� ��

)�&3B2 �������� ������ ������ ���� ��"����$3�K$3�)�&36B/&26L���*�����D��� ��K�������D��� ����������*��+�������������� ������L�

.A�$3- �������������� *����-�����*"�+�$3���*�����D��� ��

2A�? ������������*� ����*������$3���*�����D��� ��K�������D��� ����������*��+�������������� ������L�

�3 3���*��������3���*����D��� ������������K��0���'L�

�����$3 3���*�������$3���*����D��� ������������K���"�L�

����� 3���*�����������������K��0���1L�

8���&� ��(����&�

���+��+ �������������appmode����'standard'���+������������*��;�������������maclib!�menulib!���+�help������������+��+�+��� �������/vnmr/maclib! /vnmr/menulib!���+�/vnmr/help�

)��0��0 �������������appmode����'imaging'���+������������*��;�������������maclib!�menulib!���+�help����*��;�����������0��0�+��� �������+�����+�������������������systemmenulibpath���+�syshelppath��������*��;��0������������+��+��������+��� �������

����� 3���*�����������������K��0���1L�

8���&� ��(����&�

����2��� 3���*������������� ��������<�����������;������� D������������������+�������<�����0������������

>� #�0������� D����������������������D�����+������� �����0�

>�!���� #�0������� D��������!���+����0�����+�5���������������������5)3��������� �**�������� D������������ ���*����

Page 72: Getting Started with VNMR 6.1C

4� ��� �����&������

��� ������� #���$ %�����&������'(���������

A�� $���� ��������

2���+���������+������� �����0�����������������*�!�+����+��0�����������������3����$3��<������������� ��"��

�+�+����$���� ��������

2����3�3������� �����0������������� �**��������+������*� ���0�������� ������������������������������������3��<������������� ��"�!������*� ���0��������� �������������������3�3����3���*�������!��������������0����� �����+�menu('process_1D')�

=������������+�3=+�+� %,� �����E#�$�����!

2���)����� ��"���3�5)3�3���*��������K������������df����0���L�������� �**��������+������*� ���0�����3���*���5)3����������������3�3������� �����0�������������������0����� �����+ df<(index)>��)�� �**�+���������index����������������0�����!�����+�����+�5)3���������������*���5)3��<��������������*� ��+=����������!����� ���������+�<�������+�

>�!������+� ���� #�0������� D��������!���+����0�����+�5���������������������5)3������+� �**�!��������� ��bs���������������� ���*���+�

&������� #�0������� D��������!���+���� ����+����� ��+��0�������������������wbs!�wnt!���+�wexp�

8���&� ��(����&�

3���*���5)3 3���*�������)����� ��"���3�5)3�3���*��������K��*��L�

�*� �������� 3���*��������3���� �����0���������������������K��0��1$L�

&+F����0����0 3���*�������)����� ��"�����0����0������K��0��1$L�

2�������� ���������������0���+�5��������������������������**���� ���!���+������+���*�������)����� ��"���3��� �����3���*��������K��0��1�L�

���0��!�2�������� �����������0���+�5��������������������������**���� ���!������+���*�������)����� ��"���3��� �����3���*��������K��0��17L�

8���&� ��(����&�

#�<�FB'F�������

)��*���*�+�#�<!���*� ������ �������K0�����������<���+�L�)��*���*�+�������!���*� ������ ������K0��������� ��������+�L�

)��0������FB'FJ����)��0�FB'F���)��0

)��*���*�+�)��0�����?�2���*����������0������5)3�)��*���*�+�J����)��0?�+���*����������0������5)3�����**�C����)��*���*�+����)��0?�����"���������0������5)3�+���*���

6<���+�FB'F5�**

)��*���*�+�6<���+?��<���+����������������� �������K��<���+�L�)��*���*�+�5�**?�+���*�����**������K ��������+�L�

����� &+F����������������+���+����������+���*���+�5)3�

3� �*� 2�00*������+���*�������������� �*��

����� 6��������������� ��"��������0���+��

����� ���������*���������� ��"����������������0�����df����0����

8���&� ��(����&�

Page 73: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�+�$���� ����$���!���������%�����

����������� ������������������������+��+�"�*������������������������������������3���� �����0����������������������������� ����������+������+������"�+�K��0�!������fn=8000L��&�����������������*� ����!����������������3�3������� �����0�����������������������������2����3���� �����0������������������������� ��"���+������*� ���0��*� �����������������3�3������� �����0�������������������0����� �����+�menu('procpar_1D')�

=�����������5�������������E����$�����!

2���)����� ��"�����0����0������K������������wti����0���L�������� �**��������+������*� ���0�����&+F����0����0����������������3�3������� �����0�����!��������$3�3������� �����0�����!�����������$3�)��������0������� �����0�����!��������������0����� �����+�wti<(index)>.�)�� �**�+���������index����������������0�����!�����+�����+�5)3���������������*���5)3��<��������������*� ��+=����������!����� ���������+�<�������+��2������������������������0������*��

8���&� ��(����&�

����2 �*�����**����0����0������������

���*"� �*� ��+����*������*����������� �����������������

#���+�� �*� ������+��+�*��������+����0������������

�W&��FB'F�W�.

)��*���*�+��W&�!����� �������������*����"�*�����+��)��*���*�+��W�.!����� ����������������������"����+���2���"�*��������������������dmg�+���������������������*���*��

5�%���** �*� ��5������������������D�� ;�����������

�����* �*� ��5�����������������������*���C������������

,��0� �*� ��5������������������*��0�����������������C������**��0�

����� 3���*��������3�3������� �����0������K��0��1�L�

8���&� ��(����&�

��<����+ )� �������5)3:���������0������+�<�

*� �*� ��*��������+����0�����<��������*����0����0����0���"��0�"�������*����������� ������

�� �*� ��������**� �����������0���"��0�"����D����+�������**�

��� �*� ��������**������� ��������K��*�����������**����� ��"�L��

0� �*� ��>������������� ��������

0�� �*� ��>������������� ��������������K��*�����>������������� ������������ ��"�L�

�� �*� ���++���"�����0����0� ��������

����� ���������*���������� ��"����������������0�����wti����0����

Page 74: Getting Started with VNMR 6.1C

4� ��� �����&������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

=������������+��%�����!�+� %,� �����E# �$�����!

2���)����� ��"���3��� �����3���*��������K������������ds����0���L�������� �**��������+������*� ���0�����2��������������������������0��!2������������������������3�3������� �����0�����!��������������0�����menu('ds_1')����ds� �����+��

�+�+����$���� ��������

2���$3�3������� �����0���������� ��"���+������*� ���0�������� �����������������������������������$3��<������������� ��"����������*� ���0��������� ������������������$3�3���*���������)�� ����*������������+������0������ �����+�menu('process_2D')�

�+�$���� ����$���!���������%�����

����������� ������������������������+��+�"�*�����������������������������������$3���� �����0����������������������������� ����������+������+������"�+�K��0�!������fn=512L��&�����������������*� ����!���������������$3�3������� �����0�����������������������������

8���&� ��(����&�

#�<�FB'F������

)��*���*�+�#�<!���*� ������ �������K0�������<���+�L�)��*���*�+�������!���*� ������ ������K0����� ��������+�L�

���)���0��*�FB'F5�**�)���0��*�FB'F�����)���0��*

)��*���*�+����)���0��*!���+�������0��*�+���*���)��*���*�+�5�**�)���0��*!�+���*����**�����0��*���0�����)��*���*�+������)���0��*!�+���*����"������������0����

6<���+�FB'F5�**

)��*���*�+�6<���+?��<���+����������������� �������K��<���+�L�)��*���*�+�5�**!�+���*�����**������K ��������+�L�

����� &+F����������������+���+����������+���*���+���� �����

���; ���;� ���������������K��� ��������+�L������0����K��<���+�L�

����� 6��������������� ��"��������0���+��

2� )����� ��"�*���+F������������C����*��������*+�

����� )����� ��"�*��+�������������"������0��*��������������

3� �*� 2�00*�������+���������+���*��������� �*����*���������� �����

,"*:2*� )����� ��"�*���+F����lvl���+�tlt������������

���)�� �������0��*�� �*��0�

����� ���������*���������� ��"����������������0�����ds����0����

8���&� ��(����&�

�*� ��������� 3���*�������$3���� �����0���������������������K��*��L�

&+F����0����0 3���*�������)����� ��"�����0����0������K��0��1$L�

������5$� �����������3�52����������5)3�����**���������0��*��0��$�+���������K��*��� ��"������������������"����+�L�

2���������5$� ������������**��������������������������5)3���*��0������$��<�����+�+���*�������)����� ��"��$3���*�������3���*�������������K��0��18L��&��� ������*��� ��"�����0����0���� �������������+�

5�**�2��������� ������������**������������������!��������*��0��$!�������*��0���!�����0����� ������*��� ��"�����0����0���� �������&��������+������� �����0!�+���*�������)����� ��"��$3���*�������3���*�������������K��0��18L�

Page 75: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

2���$3���� �����0������������������������� ��"���+������*� ���0������*� �����������������������$3�3������� �����0�������������������0�menu('procpar_2D')�

�+�=����������!�$���� ��������

2���$3�)��������0������� �����0���������� ��"���+������*� ���0�����2���������5$���������������$3�3������� �����0�������������������0�menu('process_IF')�

=������������+��,�����%�+� %,� ����������E#�����$�����!

2���)����� ��"��$3���*�������3���*�������������K������������dconi����0���L����� ��"���+������*� ���0�2���������5$����5�**�2����������������$3�3������� �����0�����!������*� ���0���*��������������$3�)��������0������� �����0�����!��������������0����� �����+�dconi�

8���&� ��(����&�

����2 �*�����**����0����0������������

�����** �*� ��������**����0����0��"����������*��5)3�*��0���

����+� �*� ��H����+��� ��I����0����0�

�W&��FB'F�W�.

)��*���*�+�&�!����� �������������*����"�*�����+��)��*���*�+��.!����� ����������������������"����+���2���"�*��������������������dmg�+���������������������*���*�

5�%���** �*� ��5������������������D�� ;�����������

�����* �*� ��5�����������������������*���C������������

,��0� �*� ��5������������������*��0�����������������C������**��0�

����� 3���*�������$3�3������� �����0������K���"�L�

8���&� ��(����&�

��*������� 3���*�������)����� ��"��$3���*�������3���*�������������K��*��L�

&+F����0����0 3���*�������)����� ��"�����0����0������K��0��1$L�

5��2��������� ���������� ��+�5�����������������������*��0����

���� ��� 3���*�������$3�3������� �����0������K��0��17L�����������������5����������������������

8���&� ��(����&�

#�<�FB'F������

)��*���*�+�#�<!���*� ��������������� �������K��<���+�L��)��*���*�+�������!���*� �������������� �������K ��������+�L�

2�� � �*� ����� ��+���*�����+��

���F 3���*�������)����� ��"��$3�3���*������F� ����������K��0��19L�

6<���+�FB'F5�**

)��*���*�+�6<���+!��<���+����������������� �������K��<���+�L�)��*���*�+�5�**!�+���*�����**������K ��������+�L�

�+��� ����������*����$3�������0��+���*�������� ������������������

�*�� �*��� ���������� ��

���; 3���*�������)����� ��"��$3����;��� ;��0�����������K��0��19L�

����� ������������"����������

Page 76: Getting Started with VNMR 6.1C

4� ��� �����&������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

=������������+�+� %,� �$��4�����������E#�����$�����!

2���)����� ��"��$3�3���*������F� ����������K������������dconi����0���L����� ��"���+������*� ���0��������F���������������)����� ��"��$3���*�������3���*�������������

=������������+�$��6�$��6�������������E,,�#�$�����!

2���)����� ��"��$3����;��� ;��0�����������K������������ll2d����0���L����� ��"���+������*� ���0��������;���������������)����� ��"��$3���*�������3���*�������������

�+�$��6�$��6����)���!���������E,,�#�$�����!

2���$3����;��� ;��0�&������� ������K������������ll2d����0���L����� ��"���+������*� ���0�����&������������������)����� ��"��$3����;��� ;��0�����������

8���&� ��(����&�

.���F�K��<L .���C����*����F� ��������������<�������������������� �����D��� ��

.���F�K���L .���C����*����F� �����������������+���������������� �����D��� ��

����F�K��<L ����� �*����F� ��������������<�������������������� �����D��� ��

����F�K���L ����� �*����F� �����������������+���������������� �����D��� ��

1#�� �*��� ����������F� �����

��� �* 3���*�������)����� ��"��$3���*�������3���*�������������K��0��18L�

8���&� ��(����&�

&��� 3���*�������$3����;��� ;��0�&������� ������K��<�L

6+�� 3���*�������$3����;��� ;��0�6+��������K��0��1�L

5�*� 3���*�������$3����;��� ;��0�5�*�������K��0��1�L

3���*�� 3���*�������$3����;��� ;��0�3���*��������K��0��1�L

����� 3���*�������)����� ��"��$3���*�������3���*�������������K��0��18L�

8���&� ��(����&�

#�<�FB'F������

)��*���*�+�#�<!���*� ��������������� �������K��<���+�L��)��*���*�+�������!���*� �������������� �������K ��������+�L�

���; &������� �**���� ;����;��

��*��� &������� �**��+������������;�����+����+� �* �*����"�*�����

6<���+�FB'F5�**

)��*���*�+�6<���+!��<���+����������������� �������K��<���+�L�)��*���*�+�5�**!�+���*�����**������K ��������+�L�

#��� �� ;����;����+� �* �*����"�*�����

&+F��� &+F�������;�����+����������������"��*���

���� 3�*�����**����;������������;����*��

����� 3���*�������)����� ��"��$3����;��� ;��0�����������K��0��19L�

Page 77: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

%�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�+�$��6�$��6����&#�������E,,�#�$�����!

2���$3����;��� ;��0�6+��������K������������ll2d����0���L����� ��"���+������*� ���0�����6+�����������������)����� ��"��$3����;��� ;��0�����������

�+�$��6�$��6����3�,������E,,�#�$�����!

2���$3����;��� ;��0�5�*�������K������������ll2d����0���L����� ��"���+������*� ���0�����5�*����������������)����� ��"��$3����;��� ;��0�����������

�+�$��6�$��6����+� %,� �����E,,�#�$�����!

2���$3����;��� ;��0�3���*��������K������������ll2d����0���L����� ��"���+������*� ���0�����3���*�����������������)����� ��"��$3����;��� ;��0�����������

8���&� ��(����&�

#�<�FB'F������

)��*���*�+�#�<!���*� ��������������� �������K��<���+�L��)��*���*�+�������!���*� �������������� �������K ��������+�L�

���; ���;����;�K ��������+�L����"�*����K��<���+�L���� ������� ������*� �����K�L�

/����; 3�*�������;�K ��������+�L����"�*����K��<���+�L���� ������� ������*� �����K�L

6<���+�FB'F5�**

)��*���*�+�6<���+!��<���+����������������� �������K��<���+�L�)��*���*�+�5�**!�+���*�����**������K ��������+�L�

�*��� 3�*�������;����+�"�*�����������;��������� �������+���*��������

������� �����������;������������0*�����;�

,���* �������������+�*���*����;�K ��������+�L�������;��K��<���+�L�������9� ���� ����*���*�

������� �������������+�*���*����;�K ��������+�L�������;��K��<���+�L������'�� ���� ���� �������

)��� �����������������������<�����+������������;������������� ������

���)�� ���"�*����� �*��0�

����� 3���*�������)����� ��"��$3����;��� ;��0�����������K��0��19L�

8���&� ��(����&�

��+ ��+����������������;���*�

��+�2�<� ��+��������<�����;���*��

������2�<� ��������������<�����;���*��

#� ;���5�*� ���������������*��������+� ���� �����������������;���*������������*��

����� 3���*�������)����� ��"��$3����;��� ;��0�����������K��0��19L�

8���&� ��(����&�

���;FB'F.+��;

)��*���*�+����;!��������HUI��������*� ����������� �����;�)��*���*�+�.+��;!���+��K+����������L���HUI������ �����;�

������FB'F.+����

)��*���*�+������!�����������;����������<������� �����;�)��*���*�+�.+����!���+��K+����������L����;���������

��#�<�FB'F.+�#�<

)��*���*�+���#�<!����������<�������������������0����+����0�������"�*��������������;��)��*���*�+�.+��;!���+���������<�

Page 78: Getting Started with VNMR 6.1C

4��� 9���*��������

��� ������� #���$ %�����&������'(���������

A��( +� %,� �����

2���+�������������������+���*������+�����������"�+�+��2��������+���*���+�+����+����������������3����$3��<������������� ��"���

�+�+����+� %,� �����

2����3�3����3���*������������ ��"���+������*� ���0�����3���*������������������������������*�����3��<������������� ��"���������������0����� �����+�menu('display_1D')�

�+�+��������%�,����������

2����3�3����������*��������������� ��"���+������*� ���0����������0�����������������3�3����3���*���������������������0����� �����+�menu('massage_1D')�

��,�*FB'F.+�,�*

)��*���*�+���,�*!�����������;�*���*���<������� �����;�)��*���*�+�.+�,�*!���+��K+����������L����;�*���*��

��&** ����HUI!�������!���<!���+�*���*������**����;��

.+�&** .�+��K+����������L�HUI!�������!���<!���+�*���*������**����;��

����� 3���*�������)����� ��"��$3����;��� ;��0�����������K��0��19L�

8���&� ��(����&�

����� 3���*��������*��3���� �������+�� �*������������ ��"���+F������������**���+�

)����� ��"� 3���*��������*��3���� �������+��**������������� ��"���+F��������

�����0� 3���*��������3�3����������*�����������K��<�L�

�C�� 3���*��������3�3���*����C���*� ����������K��0��1'L�

���� ���� 3���*��������3�3������� �����0������K��0��1�L�

�*��� 3���*��������3��*�����0������K��0��1'L�

����� 3���*��������3�3����3���*���� ��+���������K��0��1'L�

8���&� ��(����&�

3�� 3����� ���� ����+�+���*���������*� ��+���� �����

�0��� &������� ���*� �����������;���0��������������*� ��+���� �������+�+���*�����������*��

#� ������������������+�������*���� ���� ���������0����� �����������0��*�����������������+������������;���0������3���*�����������*���0���� �����

&��������� ���������������� � �* �*���������������� ���*�����������������!������+���*�����������*��

&+F�� &+F����"���� �*�� �*�!������+���*���������� �����

&+F�) &+F��������0��*�� �*�!������+���*���������� �����

&+F��� &+F������+�������*��!������+���*���������� �����

����� 3���*��������3�3����3���*��������K��.��L�

8���&� ��(����&�

Page 79: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�+�+� %,� ���;����,�����������

2����3�3���*����C���*� �������������� ��"���+������*� ���0������C�����������������3�3����3���*���������������������0����� �����+�menu('size_1D')�

�+�$,�����������

2����3��*�����0���������� ��"���+������*� ���0������*������������������3�3����3���*���������������������0����� �����+�menu('plot_1D')�

�+�+����+� %,� ������#�� �����

2����3�3����3���*���� ��+������������� ��"���+������*� ���0�������������������������3�3����3���*���������������������0����� �����+�menu('display_1D_2')�

8���&� ��(����&�

,���� ���+���*�������*������*���������� ����:��0��

������ ���+���*������� �������������� ����:��0��

�0�� ���+���*���������0�����*���������� ����:��0��

5�**� ����� ���+���*���������**�� ����:��0��

������ 3���*��������3�3����3���*��������K��0��11L�

8���&� ��(����&�

�*��� �*���������*� ��+���� ������)����������0��*���� ������*��+���*���+!��*�����������0��*������**�

�*� �*�������<�����*���������� �����

.�������� �*����������������*���������� ������������� ��*������������������*�����0�+�"� �������.��*������ ;��+��*������

������� ������������������������*���������� �������������������0�H6�0*����*��0��0�I��������

&**������� ������������������������*���������� �������������������0�H������� I��������

���;� �*������;����D��� �������"�����;��

��0� �*����������� ������*���������+��*�����+� ���0��������

����� 3���*��������3�3����3���*��������K��0��11L�

8���&� ��(����&�

,����� 3���*���*���������� ���*�*�������D��� ������+����*���+����2�������������th�������+��������*�����0��������*+�

)���0��*� 3���*���*�����������0��*�����������������0����� ������������������0��*���������������)������������intmod='partial'!��"��������������0��*����*����+��)��intmodX'full'����intmod='offY!��"��������0��*����*����+��2���ins������������ ��������+�"��������������*�����0��������0��*����*���+���

3��� 3���*������ ��������C����**���������� �*����+������������ �����

3���� 3���*������ ����������������� ��+F��������������������������ho���+�vo��3���*������ �*����+���������������� �����

Page 80: Getting Started with VNMR 6.1C

4��� 9���*��������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

�+�+����+� %,� �����

2���$3�3����3���*������������ ��"���+������*� ���0�����3���*������������������������������*����$3��<������������� ��"���������������0����� �����+�menu('display_2D')�

�+�+� %,� ���;����,�����������

2���$3�3���*����C���*� �������������� ��"���+������*� ���0������C����������������$3�3����3���*���������������������0����� �����+�menu('size_2D')�

�+�+��������%�,����������

2���$3�3����������*��������������� ��"���+������*� ���0����������0����������������$3�3����3���*���������������������0����� �����+�menu('massage_2D')�

&��FB'F�.

)��*���*�+�&�!����� �������������*����"�*�����+��)��*���*�+��.!����� ����������������������"����+���2���"�*��������������������dmg�+���������������������*���*�

������ � ������ ��������� ���������������������� ������������������C����������� ���� �*�������� �*��

����� ��������������3�3����3���*��������K��0��11L�

8���&� ��(����&�

��*������ 3���*��������*�$3� �������+���*���K �*������0��������L���+��**������������� ��"���+F��������

�������� 3���*����������$3� �������+���*��!� �������*������*�������������K�������+������*����������������*�� �*������L�

)��0� 3���*���0���� �*�����0����+��**��������� ��"���+F��������

�C� 3���*�������$3�3���*����C���*� ����������K��*��L�

�����0� 3���*�������$3�3����������*�����������K��0��1 L�

���� ���� 3���*�������$3�3������� �����0������K��0��17L�

�*�� 3���*�������$3��*�����0������K��0��'�L�

���� 3���*�������$3�3����3���*���� ��+���������K��0��'�L�

8���&� ��(����&�

,���� ���+���*�������*������*���������� ����:��0��

������ ���+���*������� �������������� ����:��0��

�0�� ���+���*���������0�����*���������� ����:��0��

5�**� ����� ���+���*���������**�� ����:��0��

5�**������2�� ��� ���+���*����������������������� ����:��0�!�����*��"��0������ �����������������������+�*����������� �����+����F� ������

������ 3���*�������$3�3����3���*��������K���"�L�

8���&� ��(����&�

3�K�$L 3����� ���� ������$3�+���������*��0������$��<���

8���&� ��(����&�

Page 81: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�+�$,�����������

2���$3��*�����0���������� ��"���+������*� ���0������*�����������������$3�3����3���*���������������������0����� �����+�menu('plot_2D')�

�+�+����+� %,� ������#�� �����

2���$3�3����3���*���� ��+������������� ��"���+������*� ���0������������������������$3�3���*���������������������0����� �����+�menu('display_2D_2')�

3�K��L 3����� ���� ������$3�+���������*��0���������<���

5�*+� �������������0���*���������C������K�����A?!��A?�!��A?7!�3B�A?L�

5�*+F� ������������������C���������-�����*"�+�$3���� ����K����.62$3-!�.A�$3-���������������L�

5�*+ ������������������C���������$3�)�&36B/&26�K�������$3!����$3BL�

����� ��������� ���*�+�������89°�K����.A�$3-L�

�����*�C� �����*�C��"���� �*�� �*������$3�+���*���

����� 3���*�������$3�3����3���*��������K��0��1 L�

8���&� ��(����&�

&**���������� ��* �*������ ��������*���������� �������+����

�����A�*� ��* �*������ ��������*����������������"�� �������+����

)��0� ��������0���� �*�����0�������+��������<���������K,����-��!�B����-��!����)�;-��E+�����������;���������*������L�

&**�������� ����������������������������

������ �*���������������������*���������� �������������������

��0� �*����������� ������*���������+��*�����+� ���0��������

����� 3���*�������$3�3����3���*��������K��0��1 L�

8���&� ��(����&�

�� ;�+��*�� 3���*���+������� ;�+���+�����������+���+��**������������� ��"���+F��������

5����+��FB'F5$���+�

)��*���*�+�5����+�!���*� ����������<�������������C����*�)��*���*�+�5$���+�!���*� �������$��<�������������C����*�

&��FB'F�.

)��*���*�+�&�!����� �������������*����"�*�����+��)��*���*�+��.!����� ����������������������"����+���2���"�*��������������������dmg�+���������������������*���*��

������ � ������ ����������+���������!����� �������������������C���� ���� �*��������������� �*��

&��*�C� &**���$3����*����!��� *�+��0�*����*�����0���+��������� ��A?� ����*����������

������ �������������$3�3����3���*��������K��0��1 L�

8���&� ��(����&�

Page 82: Getting Started with VNMR 6.1C

4��� -��*�:�������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

A��� )��, ;������

&�"����������+�������*��������*���������"�+�+�������!��� *�+��0��<��������*����*����!��������� �36�2���+��A?����*����!���� ���*��++:������ �!����������*�����!�+� ��"�*�����!���+���0�����������*�����

)��, ;������

2���&��*�C����������� ��"���+������*� ���0�����&��*�C���������������������������������������0����� �����+�menu('analyze')�

&'%�������,�)��, � �����

2���6<��������*�&��*�������������� ��"���+������*� ���0�����6<��������*���������������&��*�C��������������������0����� �����+�menu('t1t2anal')��

)���!�����+&$0�)��, � �����

2���&������� �36�2�&��*�������������� ��"���+������*� ���0�����36�2���������������&��*�C��������������������0����� �����+�menu('dept')��

8���&� ��(����&�

6<��������* 3���*�������6<��������*�&��*����������K��*��L�

36�2 3���*�������&������� �36�2�&��*����������K��0��'�L�������**���� ���*��+����0� �����*������

�A? 3���*�������&������� ��A?�&��*����������K��0��'$L�

&++:�� 3���*�������&++:����� �������K��0��'$L�

���*����� 3���*��������������*����������������K��0��'7L�

3� ��"�*����� 3���*�������3� ��"�*�����������K��0��'9L�

�0�� 3���*��������0���������������K��0��'�L���+��������� �����+�expl('regression')�

8���&� ��(����&�

2����� ���0��!�5����������������!��������� ��5)3������7��+��������

2��&��*���� ������������<��������*�*������D���������*���������� �����;����������� ��������+�������������7��"�*���

2$���� ���0��!�5����������������!��������� ��5)3������7$�+��������

2$�&��*���� ������������<��������*�*������D���������*���������� �����;����������� ��������+�������������7$�"�*���

�*�� ���+� ��������C����*���� ;�+��*������������� �������+���������<��������*����*�����

����� ��������������������������������<��������*�*������D���������*�����

����� 3���*�����������������K��0���9L�

8���&� ��(����&�

��� ��� ���0��!�5����������������!��������� ��5)3��������+��������

3���*�� 3���*������� ���������� ����K�+���+�������+���+L�

Page 83: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

)���!�������>�)��, � �����

2���&������� ��A?�&��*�������������� ��"���+������*� ���0��A?��������&��*�C��������������������0����� �����+�menu('auto2D')�

)##G��1����������

2���&++:����� ����������� ��"���+������*� ���0�&++:����������&��*�C��������������������0����� �����+�menu('addsub')�

�*�� �*������� ���������� ����K�+���+�������+���+L�

6+�� 6+������ ����+���� �����������������������������.!��.$!���+��.7����;��

�������� �������+����0������������� �������+��������dept.out���<����*��������� ��������<���������+��� �����

5�**�&��*���� ��� ������� ���!��*������+���+���� ���!��+������ ���!��*����+���+���� ���!���+��������+����0�������������K�� ��� �������������������*� ����� ������� ���*����+���+�"�+��**������������������9L�

����� 3���*�����������������K��0���9L�

8���&� ��(����&�

$3�,����,��� ����������$3�*����*�����0���+�+���*����������;�����������+ �������0���!����dconi������ ��"�������������*� ���0�������������

5��+������*������ ������������������� �$3��A?����*������2������*�����������������������������������*����$3�*����*�����0!���� ������������������+��������3���*�����������*���������� �����

�*��������*������ ������������������� �$3��A?����*����!�����0��������������������������*����$3�*����*�����0!���+��*�����������*�����������*�������&� ��������*�����������*����+���������������!���������$3��*�����0������K��0��'�L���**����+���*���+�����**�������*� ���������++������*��������������++�+���������*��!����� �**��F������ ��������*����

�+���*�� 3���*����������*�$3� �������������+��**������������� ��"���+F��������

����� 3���*�������$3�3����3���*��������K��0��1 L�

8���&� ��(����&�

�*��� �*���������++:������ ���<���������Kexp5L�

)����� ��"����+� 3���*�������)����� ��"��&++:����� �������K��*��L!���;��0����� ������*��� ��"����� ��������������������+������ ����������������������"����*���*� �+�����������++:������ ���<������������������ ��+�������

&++��� ���� ���������� ��"���++������������� ���������� ���������������++:������ ���<���������

����� � ���������� ��"�������� ������������ ���������� ���������������++:������ ���<���������

������� ���������� ��"�� ��������������������������������� ���������� �������+�������� �������������++:������ ���<���������

8���&� ��(����&�

Page 84: Getting Started with VNMR 6.1C

4��� -��*�:�������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

=�����������)##G��1����������E�##��$�����!

2���)����� ��"��&++:����� �������K������������addi����0���L�������� �**��������+���� *� ;��0��������)����� ��"����+����������������&++:����� ������!������*� ���0�����&++:�����������������3� ��"�*����������!��������������0����� �����+�addi��

�%�����!�,���������������

2����������*����������������������������������<������� �"����0��*�������������������*�����������������*�������2����������*�������������������� ��"���+������*� ���0����*�������������&��*�C��������������������0����� �����+�menu('spins')�

�%�����!�,������3�� ��+�������������

2����������*������5�����3������������������� ��"���+������*� ���0������������������������������������*�����������������������������0�menu('spins1')�

8���&� ��(����&�

�#�<�FB'F������

)��*���*�+�#�<!�0�����������<���+����������� �������)��*���*�+�������!�0��������� ��������+����������� ������

��*� � �*� ������ ������!��++:���!��������*����� ��������� ��"��

�6<���+�FB'F5�**

)��*���*�+�6<���+!��<���+�������������� �������K��<���+�L�)��*���*�+�5�**!�+���*�����**������K ��������+�L�

������ &+F����������������+���+����������� ��"����� �����

�����FB'F����FB'F�++

)��*���*�+����!���*� ����������*����� ���������������+������� �������������� ���������+������++:������� �����)��*���*�+����!���*� ����������*����� ��������������������������������������������� ���������������++:������� ����)��*���*�+��++!���*� ����������*����� ������������������������ ���������+������++:������� ����

���"� �"����������*����� �������������++:�����<�����������+���������������*���������

����� �������������*�������������������"��0���������*��

8���&� ��(����&�

��������� 3���*��������������*������5�����3���������������K��*��L������*� ����������������

���������� 3���*����������������+��**������� ���0���

��������� ������������*�����������������Ksminf!�smaxf!�slw!�svs!���+�niterL���������� �������+���*���

���*��� �������������������*����������0����� ������������������

A��0���* 5�������������������+�+���*��������<���������*���� �����

��<� 3���*��������������*������� ��+���������K��0��'8L�

8���&� ��(����&�

7@ �*� ������������������&#�

&#� �*� ��������������������&#��

&$# �*� ��������������������&$#�

Page 85: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�%�����!�,�����������#�+�������������

2����������*������� ��+�3������������������� ��"���+������*� ���0�����A��������������������������*������5�����3����������������������������0�menu('spins1_2')�

�%�����!�,������0���#�+�������������

2����������*������2���+�3������������������� ��"���+������*� ���0�����A��������������������������*������� ��+�3����������������������������0�menu('spins1_3')�

�%�����!�,�����������#�� �����

2����������*������� ��+������������� ��"���+������*� ���0�������<�����������������������*�����������������������������0�menu('spins2')�

&#�3 �*� �������������������&#�3�

&$#� �*� �������������������&$#��

&7# �*� �������������������&7#�

A���� 3���*����������*������� ��+�3���������������K��*��L�

����� 3���*��������������*����������������K���"�L�

8���&� ��(����&�

&#�36 �*� ����"��������������&#�36�

&$#�3 �*� ����"��������������&$#�3�

&7#� �*� ����"��������������&7#��

&$#$� �*� ����"��������������&$#$��

&7#$ �*� ����"��������������&7#$�

&7#$� �*� ����<�������������&7#$��

A���� 3���*����������*������2���+�3���������������K��*��L�

����� 3���*��������������*����������������K��0��'7L�

8���&� ��(����&�

&@ �*� ��������������&@�

&@? �*� ��������������&@?�

&@$ �*� ��������������&@$�

&@?J �*� ��������������&@?J�

&@$? �*� ��������������&@$?�

&@7 �*� ��������������&@7�

A���� �����������HSpin System?I���+��������������������"�*���

����� 3���*��������������*����������������K��0��'7L�

8���&� ��(����&�

*��� 3���*���*�����0����*�������������*������

8���&� ��(����&�

Page 86: Getting Started with VNMR 6.1C

4��� -��*�:�������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

�%�����!�,������2����) ���!��������

2����������*������,����&���0��������������� ��"���+������*� ���0�����&���0�����������������������*������� ��+����������������������0�menu('spins_assign')��

+������,����������

2���3� ��"�*��������������� ��"���+������*� ���0�����3� ��"�*��������������������&��*�C��������������������0�menu('fitspec')��

������ 3���*����������������+��**������� ���0���

����0� �������dla����0������+�+���*��������������*������,����&���0�����������K��0��'9L�

+���*�� ��* �*������+�+���*�����������*���+���� �����

������� ������������������"��������C��������+�+���*�����������*���0���� �����

�����"� 5�������������������+�+���*��������<���������*���� �����

����� 3���*��������������*����������������K��0��'7L�

���� 3���*�����������������K��0���9L�

8���&� ��(����&�

** ����������*����*�����0�������� ���������� �����

����** /�������*����*����*�����0������������� ����������*��������0�������

���������� /���*����+� ��"�*������������������ ����������*��������0�������

���������0� �������assign��� ����������0��*����������������"��������C�������������dll����nll�*�����0�

������� ���������������"��������C��������+�+���*�������*���0���� �����

����� 3���*��������������*������� ��+���������K���"�L�

���� 3���*�����������������K��0���9L�

8���&� ��(����&�

/���,����,��� ��������*����*�����0�������� ���������� �����K�����"�+���� �* �*���+!���� ��"�������+���*���+�*���L���+���������*�����0�������������0�������������+� ��"�*�������slw����������������������+���+������������**����*�����������+���*���+���� �����

/������; /�����*��mark1d.out�K �����+��������H���;I�����������*�������� ��"�*��+���*����0������ ����L���������������0�������������+� ��"�*�������)�����;�+��������������0*�� �����!�����������������������+����������*�C���������D��� ������+���������������*�!������slw�������������������+���+������������**����*�����������+���*���+���� ������)�����;�����+������������� ������!������"���0�����D��� ��������� �����������������;����D��� �!���+�����+������� ���������*������+��!�������**����0�+����������������0�*������+��������+���������*��������������� �����

5�� 5������� ���������� ���������0����� ��������������0������������K����**����������������$L��2������0���*���� ����������������"�+����exp5�����������*��*�������������++:������ �������������

���*�� 3���*������������� �����*����������*��������

����5�� 3���*�����������*���+���� �����

8���&� ��(����&�

Page 87: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

����� ����������

2����0��������������������������������������������������������0���0�����������*������2��+���*��������0����������������������+���*������+�����������regression.inp���*�!� *� ;�����&��*�C�������������������������!������ *� ;���������0�����������2��������� ����*������� ��"���+�����������0�menu('regression1')��

����� ����������

2����0��������$���������� ��"���+������*� ���0�������<�����������������0����������������������������0�menu('regression2')�

����� ����������

2����0��������7���������� ��"���+������*� ���0�������<�����������������0��������$�������������������0�menu('regression3')�

�*�� �*����������0���*���� ����!���������*���+���� ����!�������+�"�+��*� ���������!���+����������� �����*���

&++:�� ����0���������)����� ��"��&++:����� �������K��0��'7L���+�+���*����������0���*���+�����*���+���� ����

8���&� ��(����&�

<�*����� ��������+���*���+�+������������0��������*������6��<���� �*��

<��D���� ��������+���*���+�+������������0���������D����+�6��<���� �*��

<�*�0 ��������+���*���+�+������������0��������*�0������� �6��<���� �*��

+��*����� 5����������0���*�����������+�������������+�+���*���

+��D��+ 5�����D��+���� � ��"���������+�������������+�+���*���

+���<� 5������<��������*� ��"���������+�������������+�+���*���

��<� 3���*��������0��������$������K��*��L�

� 3���*�������&��*�C�������K��0��'�L�

8���&� ��(����&�

��*����� ��������+���*���+�+������������0��������*������,��<���� �*��

���D���� ��������+���*���+�+������������0���������D����+�,��<���� �*��

��*�0 ��������+���*���+�+������������0��������*�0������� �,��<���� �*��

+��*����� 5����������0���*�����������+�������������+�+���*���

+��D��+ 5�����D��+���� � ��"���������+�������������+�+���*���

2�4�:� 5������<��������*� ��"���������+�������������+�+���*���

��<� 3���*��������0��������7������K��*��L�

� 3���*��������0���������������K���"�L�

8���&� ��(����&�

+��*����� 5����������0���*�����������+�������������+�+���*���

8���&� ��(����&�

Page 88: Getting Started with VNMR 6.1C

4��$ ,�*�������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

A��� 3�,������

&�������������0����������������+*��0���*�������� �����*������0����5�*���������������������������������������0�����files� �����+��2�����**����0����*��������**�files������%

G 2����;���� ��� �����������!���"������������ �������"����������������+� *� ;�K��������+���*���������������L����������*�����������������

G 2����*� ��������;�����*���������*�������+���*���+���*�������!���"������������ �������"�������+�����+���*��������+���������*�������������������� *� ;������������������������������ ���0��������"�����"�+����2��+���*� ������*�����!� *� ;��������0�����5�*����������������*����H/”��������������������+��� �������

G ��������������������������������������*��������������*� ��+��2����*� ���++������*���*�������!�����*�� *� ;���������

G )������+��������*� ������*��������������D����+!�����+���*���������������D������0��������������������*�����������������������+���

3�,� ����������

2���5�*����������������� ��"���+������*� ���0�����5�*���������������������������������������0����� �����+�files�

+��D��+ 5�����D��+���� � ��"���������+�������������+�+���*���

+�� ��� 5����� ��� � ��"���������+�������������+�+���*���

+���<� 5�������<��������*� ��"���������+�������������+�+���*���

�*�� �*�������+���*���+�+������+� ��"���

+�������� 3���*�����������*�������������*��������������<�����+���

����� 3���*��������0���������������K��0��'�L�

8���&� ��(����&�

���3��� ���� )����+��� ����������������*� ��+��������files�+���*���K+��� ���������"����H/I���**����0������������L!�������� ������������� �������+��� ������)��������"��M����*� ��+���+��� ����!�����3��� ����������K��*��L����+���*���+��������������*� �������� �������+��� �����

5�*��)��� 3���*���5�*���)����������������K��0��' L����*����������*���������� �������+��� ����!������+������C�����+���������+��� ������

2��� 3���*���5�*���2���������K��0��' L�������+���+��������������K�������������!�H�����0!������"��0!���+���"��0�3���!I���������������������������L

,��+ 5��������;������������������files�+���*�����+������ *� ;�����������������)��������"����*� ��+�����������������������������+���!��� *�+��0�+�����������>�����!��@!����@,�������!����������������������+�+�������*��+�+���������� ��������<����������)������������������������������!��������������������*��+�+�

3��� 3���*���5�*���3���������K��0�� �L������ ��� �������� �����0����+������+���*���+���*���

3�*��� 5��������;���������������*�����+:���+��� ��������������files�+���*���K+��� ���������"����H/I���**����0������������L���+������ *� ;�����������������6� ��������������"�����;�+!��� *�+��0����+��� ���������+������� �������!����+�*���+�

8���&� ��(����&�

Page 89: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

+������� �����

2���3��� �������������� ��"���+������*� ���0��������3��� �������������������5�*������������!������*� ���0��������������3��� �������� ��+��������!��������������0����� �����+�files('files_dir')�

+������� ������#�� �����

2���3��� ������ ��+������������� ��"���+������*� ���0������������������������3��� �����������������������0 files('files_dir_2')�

���� 3���*�������5�*���� ��+���������K��0�� �L������++������*���������

����� 3���*�����������������K��0���9L�

8���&� ��(����&�

����0�� ����0�����������+��� ������5����!����;���+��� ��������������*���+���*���K+��� ���������"����H/I���**����0������������L���+������ *� ;�����������������)��������"����*� ��+���+��� ����!�������� ������������� �������+��� ������)��������"��������*� ��+������������!��������������������D������0��������������������� �������+��� �����

3����*� ��� �������+��� ������������"�*����������������defaultdir��)�����*�"�*�������������������*�0���+��� �����

���3����*� )������ *� ;���������������+���"��M�����;�+������������!����� �������+��� ������� �������������"�*����������������defaultdir��A��������!����������"�����;�+���+��� �������+������ *� ;�+���������������!�����+��� ������������;�+��� �������������defaultdir��)������� ����!���������"�*������defaultdir����+���*���+��&������������������+�����������

������� ������� �������+��� �������������������������� �������+��� �����

.���� ������� �������+��� ��������������������*�0���+��� �����

��� ������� �������+��� ����������������������+��� ����!���� ����������������<���������!�maclib!�menulib!��� ��

����� 3���*�������3��� ������ ��+���������K��*��L�

����� 3���*�������5�*�������������K��0��'1L�

8���&� ��(����&�

���� ������� �������+��� ��������������������������+��� �����

0��������$ �����������HNew directory (enter name and <return>)?I!������ ������+��� �������������������������+���+��������� �������+��� ��������������������+��� ������)��+������ �����**�!�����files�+���*�����**���"��������������� ������������� �������+��� �����F���� �����+����������

'����� 3���*�������3��� ����������K���"�L�

8���&� ��(����&�

Page 90: Getting Started with VNMR 6.1C

4��$ ,�*�������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

3�,� �=���!����������

2���5�*���)�������������������� ��"���+������*� ���0�����5�*���)������������������5�*��������������������������0�files('files_info')�

3�,� �0�%������

2���5�*���2������������+*���/�)@���������*��K���+���������� ���!�/�)2?����!�����������!��������!����� ������!�/�)2?!���+��@���������L��2���5�*���2������������� ��"���+������*� ���0�����2������������������5�*��������������������������0�files('files_tape')��2���tape�����������+�����������+�"� ��������*������0����� ����������������������� ��+�������+��������������������

8���&� ��(����&�

#���C� ������������������������ �������+��� ����������C���,��0������*�������*����+�*�����5������+��� ������!�������C���������������������������+��� ���������� *�+�+������0����0�������C����������������2�������*���0������+�*�������+���*���+��������������<�����+����

#��3��� ������������������������ �������+��� ������������+������ ������*������+����+!������������������� ���*����+����+�*����+�*��������*���0������+�*�������+���*���+��������������<�����+���

����� 3���*�������5�*�������������K��0��'1L�

8���&� ��(����&�

3��� ���� 3���*�������� �����������������������0������ ������*��*��+�+�������������+��"����� ��/�)@�tar�������+��������"����+��� �����������!����������������������������+������+���������+� �������*�����0!������������������������������ �������0�

�C�� �������������C������� ��������������� �������+��� ������2���������������C�������*� ��+�����������*�!����;����������������������������files�+���*�����������+������ *� ;�����������������2�����C������������������������;�+�����������+��������������<�����+����2�����C������� ����������������+��� ���������� *�+�+������0����0�������C������������+��� ������

����� ����������������� ��������������� �������+��� ��������������2����������*� ��+�����������*���������!����;�������������������������files�+���*�����������+������ *� ;�����������������A�*�����������������������;�+��������������������������

��+�&** ,��+� �����������������������0��������������� �������+��� �����

����� 3���*�������5�*�������������K��0��'1L�

Page 91: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

3�,� �+��������

2���5�*���3������������� ��"���+������*� ���0�3�����������5�*��������������������������0 files('files_data')�

3�,� �+���������#�� �����

2���5�*���3����� ��+������������� ��"���+������*� ���0�������������5�*���3����������������������0 files('files_data2').

3�,� ������#�� �����

2���5�*���� ��+������������� ��"���+������*� ���0�������������5�*��������������������������0�files('files_main2')��2�����;�����*�!��*� ������������ �������"���������*���������+� *� ;�����*������������������2�����*���������**�������������"�����"�+�����������;�+��2��+���*� ������*������!� *� ;��������0����

8���&� ��(����&�

,��+ 5��������;�������*���������files�+���*�����+������ *� ;�����������������)��������"����*� ��+�����������������������������+���!��� *�+��0�+�����������>�����!��@!����@,�������!����������������������+�+�������*��+�+���������� ��������<����������)��������������������������*�!��������������������*��+�+�

�"��5)3 �����������HFile name (enter name and <return>)?I���+���"��+������� ��������<���������������

�������� �������� ����������������������shim�+��� �����K����shim�+��� �����������������������+��� ����L���+����������shim�+��� �����K����shim�+��� ����������������������+��� ����L�

,��+����� 5��������;�������*���������files�+���*�����+������ *� ;�����������������)��������"����*� ��+������������������������+�������!��������0����*��+�����������������+��������������+�����A��������!��������0��������������������������������+����������+�������������*��+���������������������������

�"������ �����������HFile name (enter name and <return>)?I���+���"����������� ��������<���������������

���� 3���*�������5�*���3����� ��+���������K��*��L�

����� 3���*�������5�*�������������K��0��'1L�

8���&� ��(����&�

,��+������� �����������;��0�������*���������files�+���*��!���+������ *� ;�����������������)��������"����*� ��+����������������������+���!��������������������������+��������*��+�+���������� ��������<���������

�"�������� �����������HFile name (enter name and <return>)?I���+���"�������������������������� ��������<���������������

����� 3���*�������5�*�������������K��0��'1L�

8���&� ��(����&�

3���*�� �����������;��0���������������*����������files�+���*��!���+������ *� ;�������������������+���*���������*����������;�+��2����� ��������������������������<����*�����*��

Page 92: Getting Started with VNMR 6.1C

4��3 � ��'�������������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

A��� �����#�� ����������

�*� ���0������������������������ ��"���������� ��+�������������!��������������++������*� ��� ��������+��������**���������������������������� ���0�������A�������!�����������������������������**�������*�����6<������!���� ����������*+��������*����������������������+��������������������������������������� ������������+�������������?��� ����*���� ��"��������� ��+������������������������0�menu('main2')�

�*� ;��0�����������!��-�������5��� �����������������������������&3����0����

����������������

2��������0����������������� ��"���+������*� ���0����������0������������������� ��+���������������������������0�menu('configure')�

6+�� �����������;��0���������������*����������files�+���*��!���+������ *� ;��������������������+���������*����������;�+��2����� ��������������������������<����*�����*��

���� �����������;��0�������*���������files�+���*��!���+������ *� ;���������������������;���� �������������*���������;�+��?���������;�+�����������������������*��

����� �����������;��0�������*���������files�+���*��!���+������ *� ;��������������������������������*���������;�+��?���������;�+���������������������������*��

����� 3���*�������5�*�������������K��0��'1L�

8���&� ��(����&�

��������*����D��� � ���������&3����0����K���������� ������*L�

�����0��� 3���*������������0�������������K��0�� �L������+��������������� ����0�������!��� �������*� ���0����*������

/�)@ A����������������/�)@����**��2�������**��� ���������� ��"����� ���!��������+��0�������������������������������+!�����������0���������������������*� ��B���!����������������*�+��������������������� ������+�+���*�����������������K��0���9L�

6<������ 6<��������������0���!���������0������/�)@����**��&**�+���������������������������*���������"�+�

8���&� ��(����&�

����A������3�"� �� �����**�����������+��*�������������+�"� ����������"�������+�����+����� ��"�����������������

�*� ���*����� �*� ��������<���*�������������*�������/vnmr/devicenames�

�*� ��������� �*� ��������<�����������������*�������/vnmr/devicenames�

.��+���� 6���������config����0����K���������������+������������vnmr1����������config����*������� ���������������������������������+����� ����0�������L�

����� 3���*�����������������K��0���9L�

8���&� ��(����&�

Page 93: Getting Started with VNMR 6.1C

��������4� 0���&�������������������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

Page 94: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

��������=� � ���������!!��#���#�

� �������������� ������%

G 9���H������+�!I��������0��

G 9�$�H����������!I���0�� 8�

G 9�7�H������+�,����6+����0���+�������!I���0�� ��

G 9�8�H�� ���&���������!I���0�� '�

������+�!��� ���!���+������������ ������������+���������0��������������������������+��!���� *� ;��0���� �������������������������������������!�������������0�"�*���������� ��"�*������������ �����+��������� �����+�!��� ��!���+����������������������+�����������������+��!������� �**�+�����(&))���)&���

&�(&))����������D����������"������ �������������+��&�)(&�����*�������D����������"������ �������������+!����������� ���� ����� ������ ������C�+������������ ������������� �� �+��������+�*���"��*��*��K��;��0� ���0������ �����+�� �����*�����+������������������� �����������������*�������� ����+��4��L��&��)���������������� ���������� �����+����;��

2��� �����+���+���**����� ��������**� �����+�!��� ���!���+�����������!����*������������������+��!���������������+���� �!��**���� ��������&)�� �����+�!��� ���!���+��������������*���2���!������������������������ ����!���+�������������*���������*�!����������"�+��0������������������������� ���0������������������������ �����+���+���4����������+!�����"��!�������������������������������+���� �����"�+���� ��"������������ ��������������������������������+!�������� �*����!������������;�����������������"�������������������� ���0�����;������+�

5���+����*�+�+�� �������������**� �����+�!���������� ���!���+�����������!��������������� ����&))������-)������%���(��

"�� �!!��#

������+������� ���������"�����*�������������*��������� � ���� �����K��0�!�go!�jexp1!���+�dconL��������+�� ������+�"�+�+����������������!������**���%

G �&))����'��$��&���)�����(�2��� �����+�eject!������<���*�!�����+���������*���

G �&))�����4������&���&�)&����)�����(�2��� �����+�svf�K��"�����5)3���*�����+��;L!������<���*�!���D�����������������������������������5)3���*���2������+�+���0����������� *���+��������������������0����������<�svf(file)��#� ���������*��������������<�������0!�������*������������D����+��������� *���+�������0*��D��������;�������������+%�svf('/export/home/vnmr1/mydatafile')������������+�"�����*���K�� ���������������L�+��������D������������0*��D�������)����������������0�������������D����+!��� ����0�����������������+������ �����

G �&))����'��$�&���&�����)�����(�&�0��+��<���*����������ds<(index)>�K������0*�+���� ;�����+��������������*���0������L��2��+���*������3���� ����!����� �����+�

Page 95: Getting Started with VNMR 6.1C

��������=� 0���&�����������'���'�

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

���ds��.���"��!������������������� ������"�������� D����+!���������������������� �����������+���*���+� ��������� ����+!����������� �����+�ds(3)��

G ����(��#��(&))����(�&�������� ��"�� �����+��������������������������;��0��������������D����������5����<���*�!���������� �����+�dot1����������+!������������+���*�����������������������������0��+������������������������0������7���<����������

�!!��#�&���

������+������������+���������0����������������� �����+!������0����� �����+���0�������K��������������L���������������!���+�������������0�����������;����2���������*+���"����������� �������������� �����+��������+�����*����������������K��0�! �ds (3)������ ���� �L���������������� �����+� ������������+������������������������D������*��<� ������������������0��� �� �����+����������� ��K��0�! �����ds(3) pl pa���+������������L��������+����+������������ ����*�����������������+����������K��0�! nt=16 at=2.0 goL��

�!!��#�)���!���

&�0����������� �����+�� ����������������E������ ���+������0%

G �)��(���)����� ����������0���������*�K�*����0������0�����������������������+�������*L!���+� ������������+�������������������+� ���*�������K��0�!�16!�16.0! 16.5L��

G �����������+�����0�����+��������0��� *���+�������0*��D��������;��K'...'L!��� �����'SAMPLE 12'����'3456'��

&��� ���� ���� �������������������������0*��D������������;�!�������������� ��*� ���� ����!��� ����������0*��D������������;!������������ ��+�+���������� ;�*����K\L�������� ���� ��������������� *���+������������<�������0!������<���*�!

'You can\'t enter a single quote without special care'.

2������������� ;�*���� ���� ��������*������������0!���������������+���� ��K��0�!��98������������'A\\B'L��

&��+�������� ���0������!����������0��� ����������0�����������������0�����+���������������5����<���*�!��������0����� �����+�text!�������������� ����������*��������� ���<���������*�������� ������������� ��������<����������2���!������ ��+�������*�����������+�+���!�������������� ���������text('SAMPLE 307-3May')��

������<����0��������������������!�����������text� �����+�F����+�� ����+��)�������� ����!�����"��!� ���������� ��� �"�*�����������<�������0�������D����+��5����<���*�!����� �����+�����*����� ��������*������pcon��)���������������*�����*������������"�� ��������������������������"���<��������!����������������pcon('pos')��2�����<�������0�'pos'���+��������*�;����������������+�������2�,'&��*�&�;�����+���������������+��<� �*�����������������������*����+����*�����

"�� $���!����

������������������"����"�����*�������������*��������� � ���� �����K��0�!�nt!�temp!�axisL��2�����������*�������������������������%������� ���+������0�������� �����������������������!����*�������0������������������ �**� ��������������������*��������

������ ������������������������� �**������0���!��� �����nt�K��������������������L!� ������������+�������������������+� ���*�������K��0�!�16����16.0L�� ������� ��������������*���� �����*������������K��0�!�1e3����������7����2.5e-4�����$�9�����8L��

Page 96: Getting Started with VNMR 6.1C

=�$ ����������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

����<���p!�d!���+�k���"�������0�"���������**����0�������0��������������0������� �����������%

G 2���p������<������*�����������������������������5����<���*�!��������0�sw=10p�����D��"�*��������������0�sw=(10*reffrq)�

G 2���d������<������*������������������������������*���"���������+� ���*������D��� ���5����<���*�!��������0�sw1=10d�����D��"�*��������������0�sw1=(10*reffrq)�

G 2���k������<������*�������������������������+���5����<���*�!�fn=16k�K������0�����5�����������������������������;L�����D��"�*�������fn=(16*1000)������!�����"��!������fn=16k�����������**�� �* �*���+���������������$=����������!�fn=16k�� ���**�����������5�����������������$��������7'8�

2�����+��������������p!�d!���+�;�������+���������bootup��� ������������ �����+�unit��&++������*������<��� ������+�����+���+�p!�d!���+�;� ��������+�����+����������unit� �����+�

��������� �*��<���������� ��� �������������������������������<��!�������� ��������!������<���*�!�sw=10p+tof–2k��

&������0�������������;�����"�����*��*��0����*��������� ������0������"�*����2��������0�������*������� *���+�����������0*��D������������;��K'...'L��5����<���*�!�����"�*������dmm�K+� ���*�����+�*��������+�L���0������'c'!����*������"�*������dm�K+� ���*�����+�L���0������'nyy'��������*������� ��������������"��"�*�������'y'�����������+�'n'��������

#��������0��������������������'n'�"�*��!� ������������� ���������������� ����*���������0�H�����+�����I�2�������������temp������������������������������<���*���2����*� ���������������������°�!������temp=60=�������������������������������0�*�����!������temp='n'��&�������������������+�� ��"���+����������0�����"�*������'n'� �������������������*���������� �"�*�������������0���"�*������'y'��5����<���*�!�������� �������"�*������*��������+����0������9�K����!�lb=1.5L!����� ���+�� ��"����*��������+����0������lb='n'��&������D�����lb='y'���**�������������"�*������lb����1.5�

$���!�����&���

&**����������������������+�������������E������������������������������!�����D��*����0�!�����"�*��!���+����������������������;����5����<���*�!����������������������sw��������!������sw=1000���+��������������A����������������������������0�*�����!������temp='n'���+��������������2������������������������������������������������!������������ ���������������������������� ����+�����������������������*���������=������<���*�!������nt=16�dm='yyy'�temp=40���+��������������K2���"��+�������������������������*!��������0�����������;����������� ������������*+����������+���+���**����������������+��< ���������� ��*� �����L�

����������� ������������+�����������0�������������"�*������������+���� �������#���������� ��������������+������0������������ ������������+������������������5����<���*�!��������0 nt=1,1,1,1����dm='nnn','nny'���;���nt����dm����������+������������5�����������������*�����*����� �+�������"�*���!���������*+���������array��� ���

2�� ���0������� ��� ��*������������������+����������!����"�+��������������+�<�����D�������� ;����K[...]L����� ���������*������K��0�! nt[3]=2��������������+�"�*����������nt����������$L����*���*���*������������������� ����*�������*����+�����++�+�����������0�������������"�*�����&0��������0�����nt��<���*�!�nt[5]=4,4,4,4 �++���*�������9!��!�1!���+�'��������nt���������+����������"�*�������� ������������*����������8�

Page 97: Getting Started with VNMR 6.1C

��������=� 0���&�����������'���'�

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

$���!�����+� %,�

2��+���*������� �������"�*�������������������!�������������������������������!���**���+������D�����������;�H?I�K�������0�����������;������������+L��5����<���*�!�������+�����"�*������sw!������sw?���+�������������+���*��������"�*������sw��/�*�;�����������������!���*����������������"�*��� ��������D�����+�����������

)����������������������+���*���+�������������+����������!��������������+����������������*�����������+���*���+��5����<���*�!����nt����������+!��������0�nt?���0���+���*������������0��Hnt=array of 8 reals�I

2��+���*��������+�"�+��*��*�����������������!����"�+��������+�<�����D�������� ;����K��0�!�nt[3]?���0���+���*���Hnt[3] = 2IL�

������������������� ������H�����+����I����������0������������������'n'��2���+���*�������������������������������+�������������������H����/��+I���**���+��������� ���*�"�*�������������������5����<���*�!����lb�������������9���+�������������'n'!��������0�lb?���**�+���*���lb= Not Used (1.5)�

$���!�������,���2�!�������

�����������������"�������� ��+�"�*������0����2�������������nt�K��������������������L� �����������0���"�!������<���*���&��������0��������������**�0�*�"�*�������*���������������������0���0������������������������������<�����"�*����&�������������0������*���+���*���+��<�*�����0������ ���*�"�*�������0��+�������������������

�������������� �����������!�nt��������<���*���0���!�����*�����+��������0���!���+�����������0����������������+��������+�+��������������������0����

���������0������������ �����*���������������������+������0�"�*�����&��������0������������"�*����������������������������"�*�������+� �����������������0�!���+�������������������� ���0�+�����*��*�!�������*�0������������ �����*���������������������+� ���� ������&��������0������������ ���� ���������0� ��������0��� ���� ������������������������������������+� ���� �����������*�0��������������+� �����������������0�!���+�������������������� ���0�+�

6������0����������������������"���������+��������� ���5��������� �!����temp=60����������+!���������������������0�*���+�����*����� D������������������+����������go� �����+��������*��������+����������� �����+�su�����<� ���+�

$���!�����&��� �2�!�������

��������������!��� �����ct�K���������� ���*���+�����������L!� ���������������+����������;������+��&��������0������������ ��������������������������*��������+� ������������������0���������������0��������������**���+�

"�� �!!��#�2����&#��������#�������

?��� ������������� �����+�������������� �����+��������������"����*������+��6+����0��������"�������� ������� �����+������ ���*����+����������������;���!���� ��*�;���!���+�;��� �������������5���+����*�!���"��������������������������������+��!���*+�+��������������*�;��!���+�������������0��������������������������������� �������������+���

������������������+����� �����+�cat('/vnmr/psglib/noesy.c')����+���*���������� �*�����*�����D��� ���?�������0�������������������������+!�������������������*������������+������������������� �����+��0����������������������������*��0���*������!����� ���

Page 98: Getting Started with VNMR 6.1C

=�3 ������'�+����.'����&���'�������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

�������������������;���K���;�+�▲L����������������*���K��*+�+��������������*�;�����+������������������;��L������ �**������ �����+��

6� ������������������������������;������������������*��!��������"�����*��������� �**�+�K����;��������H�I����������*����������+��0�����H���"����IL��3����+��0������������ ��������"������������0!��������������*�����0���� ;���+������������"���*�������������"�����"���*��������)������0���� ;��������!�����+����������;���K���;�+ ▼L����������*�����"������������<��*�����5����<���*�!��������0�������*���������*���������*�����"����� ;�����*�������+������+��������*�����

A� ��������"���� �**�+������"�����*���!����� ����+�������*���������������;���%

)������������� ���*����+���������0�����+�����+� ���� ��������������*������� ���� �!��������������������*��������������*�����2��� ������+����������"����������"�+����������+��������*���������������������������

������+�*�����+����0�����*���� ��"��������� �������*���!��������!��������������"��������+���������������������������)���������� ����������������*�����������������0!�������*���������!����������*�.�����������������������!�������3�*����������������� ���� ���������+����������!������������� ���� �� ���� ����!���+������������������

����������*�������������������+�+��0����� �����������0�*�0����������+����� ���� ����������� ������ ����+����������������;����������"��������0�*�0���+����+����� ���� ����������������������;�������������������$����������������*� ��+���� ������+�: ���� �����

2��*��8��������C�������;���� ������+�� ����+����������� ����������������������;���� ������ ������ ���0�+����������/�)@�stty� �����+�

,��������� ��"��*�������� ���� ����K�*�������%�������*�.L�

�0�������� ��"����0������� ���� ����K�*�������%�������*�,L�

3�*�������#� ;��� � 3�*������ ���� ����

������*�/ 3�*���������������*����

������� �� ��*�4������������,����6+����0

8� ,���������!�������*�. ��"��*�������� ���� ������������+�*����0

������*�,��������� ��"�� ������*����������"��������+

������*�#� ;��� � 3�*������**� ���� ������������ �����

�0��������!�������*�, ��"����0������� ���� ���

������*�3�*��� 3�*�����**� ���� �������**����0� �����

▲!�������*�� � �**� �����+����"����*��������+

▼!�������*�� ��"�������<��*���

3�*���!�#� ;��� � 3�*�������� ���� ���

������*��������������� ��"�� ����������������������������

������*�/ 3�*�����������*���

����� 2�����������+��������*������������

6�+ ��"��� �����������+����*���

��� 3�*�����**���*� ��+� ���� ����

�����!��������������$ ������ ���� ����������������*� ��+���� ��

/�+� /�+�����"��������������+�*���

Page 99: Getting Started with VNMR 6.1C

��������=� 0���&�����������'���'�

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

"�A ������)���!�����

������<���������� ��������������+��������0��� ��������*��+�������������������������!������+�����0���������� ���!�������������0���������������� ������������������� ���������"��*��*���2�����F�����������+�"�*���+������������������������ ��������� ����������������������������������*�� ���0���!���������� ���������+�+��� �*�������������������+����+�������+�+�

2�����**����0����*������������� �����*����������������� ����� ��+��0��������%

G 2��*��9�*�������������+�� D����������� ����

G 2��*����*�������������+� �*����������� ����

G 2��*��1�*�������������+��*�����0��� ����

G 2��*��'�*�������������+���� �����0��� �����

5������������������������������������� ���!������������������������������ ����������� ����&))������-)������%���(������<�������������� �� �+������������ ����������maclib�+��� �����

������ &�������+�& D����������� ����

����� autolist* ��������+������� �����+�� D��������

c13<(solvent)> &�������+� ������� D��������

capt<(solvent)> &�������+� ��������+�&�2�� D��������

cdept<(solvent)> &�������+� ��������+�36�2�� D��������

f19<(solvent)> &�������+��*�������� D��������

getdim:dimensions ������+���������*��������<��������

h1<(solvent)> &�������+��������� D��������

hc<(solvent)> &�������+����������+� ������� D��������

hcapt<(solvent)> &�������+�������!� �����!���+�&�2�� D��������

hccorr<(solvent)> &�������+�������!� �����!���+�.62�A�� D��������

hcdept<(solvent)> &�������+�������!� �����!���+�36�2�� D��������

hcosy<(solvent)> &�������+����������+��A?�� D��������

p31<(solvent)> &�������+������������� D��������

* autolist(<option,>experiment1<,experiment2<,experiment3,...>)

������� &�������+���*����������� ����

����� AC1S-AC11S &��� �*����������� ���

ACbackup ������ ���������������*������������ �*��������

ACreport ��;���� ;������ �����������*�����*�

Page 100: Getting Started with VNMR 6.1C

=�4 �� ���-���������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

������� &�������+��*�����0��� ����

����� pacosy �*����������� ��A?����*����

plapt<(13Cexp_number)> �*���&�2����*����� ������������ �**�

plarray �*���������+��3���� ���

plc<(pltmod)> �*����� ��������� ����

plcosy* �*����A?����+��A6?��������� ������������ �**�

plh<(pltmod)> �*������������� ����

plhet2dj* �*����������� *����-�����*"�+�$3���� ������������ �**�

plhom2dj* �*��������� *����-�����*"�+�$3���� ������������ �**�

plhxcor* �*���@!.� ����*������$3���� ����

plot �*������ ������������ �**�

plot1d �*�������*��K����������+L��3���� ���

plp<(pltmod)> �*����������������� ����

* plcosy(<'pos'|'neg'><,><levels<,spacing<,exp1D>>>)

plhet2dj(<'pos'|'neg'><,><levels<,spacing<,exp1D>>>)

plhom2dj(<'pos'|'neg'><,><levels<,spacing<,exp1D>>>)

plhxcor(<'pos'|'neg'><,><levels<,spacing<,exp1D_H<,exp1D_X>>>>)

$���!����parstyle�V�����0S �������������*������*��

������� &�������+���� �����0��� ���

����� autostack &������� ���� ;��0�������� �����0���+��*�����0�������

c13p ��� �����0�����3� ��������� ���

cleanexp<(file1<,file2<,...>>)> ���"���*+���*�����+�+��� ����������������<��������

cptmp<(file)> ������<���������+����������<��������������*�

f19p ��� �����3��*���������� ���

get1d<(experiment)> �*� �����3��<���������������� �����0

get2d<(experiment)> �*� ����$3��<���������������� �����0

h1p ��� �����3����������� ���

hregions �*� ������0��*���0������������������ ����

integrate &������� �**������0������3���� ����

isadj<(height<,neg_height>)> &������� �����0��*�� �*���+F�������

isadj2<(height<,neg_height>)>:sf &������� �����0��*�� �*���+F������������������������

p31p ��� �����3��������������� ���

proc1d ��� ��������*��K����������+L��3���� ���

proc2d ��� ����$3���� ���

procarray ��� ����������+��3���� ���

process >����� ��������� ���� �����0

procplot &������� �**����� ����5)3�

rttmp(file) �����"���<���������+����������<��������������*�

stack(mode) 5�<���� ;��0���+��������� �����0���+��*�����0���� ���

svtmp<(file)> ��"���<���������+����������<��������������*�

$���!���� pkpick�V�����0S ���;��� ;

stackmodeZ �� ;��0� �����*�������� �����0�������+��3���� ���

Z stackmode VY����C����*Y!Y"���� �*Y!Y+��0���*YS

Page 101: Getting Started with VNMR 6.1C

��������=� 0���&�����������'���'�

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

Page 102: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

���������� $��%������������&'%���!���

� �������������� ������%

G ����H��������0��������*�!I��������0��

G ��$�H6F� ���0���+�)�������0��������*�!I���0����7�

G ��7�H�����"��0��������������!I���0����1�

G ��8�H���"��0���+�)�������0����������!I���0����$

G ��9�H/���0�������5�*�����+�2���*����!I���0����7

G ����H2����0����������!I���0����7�

G ��1�H������0��������*�!I���0���$'�

G ��'�HA�����C��0�,� ;!I���0���7��

G �� �H&+F�����0�����!I���0���7��

G �����H/���0�����& D������������+��!I���0���8'�

G �����H������0�/���0�����/*���G�������������!I���0����9�

G ���$�H>��+�����&����������0!I���0����

2������� ������������������������+���������� �**����������+���������������

.�� $��%������������!%,�

�*���*����+������� ���*���������+�����������*���*������*���+����+��0����*�����������������*��������������+���+����������+����������������!���+����������������0������+����+�*� ;����������+������������������*;���0���� ���� ������*��������������0*���!�0*���������*"���!���+���*"����������� ���� ��������� ��� ������������+�����������������������"���������������*+�����0����������������*���������*�!�����������������������������������������*������������2���������������������0!�����"����������+������������*��0�*��+����+����������� ������� �����**��0��������� ������������ ���� ����������

��,�������,������

���*��� ������������������*�D��+����������*��������)������� ����!�������**�������*�����������0� ������+�������*�������2�����*����������*+���� ������������������K+����������� ���������������*�L���+��"��*��*�����+��������+�������2�������������� ������������*� ;�+!��������!���������*� ;��0����������+��������������+��������+���*"���!���������*�����������������������+���������*� ;!����� ��**������*��0����� ���*��������������*����������� �����*�����+���*"���������+��������+�� �����!� �*�������!������*���� �*���+�!���+�3�A�

Page 103: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

��!%,��<�����

6<����������������+� �* �*��������������������*�D��+� �*����*��0��������������*���������������������*��0���������������"�� ��*����������C����+����� ����2������00������� �*����*��0������ *�������9� ������������+��+�����+���+�������� ���*�������!���+�������8� ���������.:� 5���������*"����"�*�������������*������9�����������+�7����*����������������������+�D�������������"��0�������+����� ����

�+� ������������*��"�*����������������0���� �� ��������������**�����*���� ����������� �����+���0��*��������+������+��������������������������� �!����������������������������������������0��*��)���� �!�����**�������+���8��*�����*����**����*���������������"��������������������*������+�*���+���������*���+��*���������+���**��2���D���������*��0��������������"���������������+�0��+�+��������*��0�������������**���;������������������������**�"�����������������*�����0�����������*+��������0���� ������������������'��*�����*�� ������+���������������������*�������*����8��*����"�*����

5������������*�����+����������������0�����!�����*�������*+�����������+�������������������0�������� �����������*���&��"����1��*����������*���*���������"�����������*��*��0������*��0���������������������������������������+�������*���?�������*+���;���"��������*��������������������0�����+������������������"�*��������0�����*��������������0���

5�����*��+�9$'����979��������������������� ���0��*�0�!����� �*�����*��������"�*�����*����+����2��*�� �����*+�����*� �+��������+����������������������*�!�������+������������+����� �������������������������������0����������������������������������������������*�������

��!%,��$� �����

/�������+�������+� ��������"�+�+����������������*������������������������*������������5�0����$������������+�������+� ���������������� ���������������������+�9��������*���������2���*��0���������������"��*��*������������������+�9����"���������

)����������������*��0���&�����9�����1�'� ����

2������ �+��������������������9�������������0�����*��0������������A������������C�����+��������������+��������*��*��

G �*� ���������������������*��0���*��0�����*������+� ���+����������0���!���+�*�������������*������*���������*���������������D��*������H��<��������*��3����I�*���������������**���9��������*��������

2���*��0���������������������������*��0���������������������������*�����������*+������< ��+��$8�����)���������+��������*�����������1��*������*"������������������!����� ��� ����������*�D��+�"�*����������� �������� ��+�������2���� ���������������*����������� ��"��� ��*!���+� ���+�������� ������*���������*�

)����������������*��0���&��������*��)���

&*�������"�*�!��������0���������*�� ���0��!���������*�����������*�� ���������+�����������������������+������������������������������������2������� �+���!������**���+������**�����*����*� �+������������!�����*��������"���������+� ��*������*�������������+!��� �������

������� ���*��2����3�����

�&��)� �����$ ���$�:����;

1���µ, 9���� �'����K�9(� ���L

����µ, 8$��� �9����K�7(�1���L

9���µ, 7���� �$����K��(�8���L

8���µ, $'��� 9 ����K9'(�$���L

Page 104: Getting Started with VNMR 6.1C

��$ .>� ���&���'�1�������&��������*�

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

������0����"�������+��������+����������*��0����������*�!�����������*+����"����*���*���������0��� ������������ ���0��0�����*��!��"������������*"���� ���0��

G )�������������������������������������+�0���*����������������+���������0�����������������*����*+��0������������:����� ���������������������������+�'��$����&(��&��<�&������������������� ��������������!������������0�+�����

2�������*���������������*�����������+��)�������� �����������������*��+�����������������������������*�<���+��������*����+������������;���� ;��*�0��*���������������*���)����!��� ;������������������� ������������**�������������������������������*������������ ;��0��,� ������C������������+���������������0�+����������+�����������������*�<��0�

��!%,��0�1�

5���**�!���������*���*�����������������D��*�����������*����������+���� *�������������+������� ����������������*"������ �������������*��* ���*!���**���+������ �����*������0�����������������������������*� ��0�����������������������

.�� &4���������#�=� �������������!%,�

A������������!��������!����� ������!������� ���!�/�)2?����!�/�)2?!���+��@����� ����������������������� �������:�F� �!�������� �������������D�����+���������+�������+����������������"�+�� �������� �����*��������*���F� ����!����������!��������0!�*� ;��0!���+��������0��2������ ����� �"���� �������� �����**�+�����*���F� �������+������������2��*�����*��������� �����+����+��������������*���+��������*�� ���0��0�

��������� ���*��3�����)�+� ����

Probe Bottom

Liquid Height for Best Resolution

Place Flange Here

10 mm3.1 ml

5 mm0.7 ml

124 mm133 mm

CLCenter Liquid Volume on This Line

Maximum SampleDepth

106 mm98 mm

Page 105: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�����*� �����*�����F� �������+���������������*������"�+�+������ ��������������������������*�������������+��������*�������� ������!����������������0*���� �����+�+������������*����� �������� �����*�������<����������+� ���*������+���������A������������+����� ���������� ���������!������*� �����*����������*�������������+��������*�����*���������������*��������� �����*�����+���������**�+���������������

�*�+���������+������������������*��������������+��F� �����

0��&4��������!%,�-�5�����������!%,��������

?�������*+��*������F� ��������K�"�������������*��������������0���L��������������*������ �������������*���2����F� �����������������+������+!���+��� �������� �����*!���������*�!�����������!��������� ;������������������������������*��?��� �����������"����������*����+����*� ����������������������*��

0���&�����1��������'��

&��*��������**�����������������������*������ �����*����+�������������**�+�

G 6�����e�����������������+���

0���&�%+19.

&��*��������**�����������������������*������ �����*����+�������������**�+�

�� )��������� �������� ��"�����+��������������!����������������0�glide�����������������+��������� *� ;��0��������432.(�������������������������

$� �*� ;����(),���#��!�;����/��!�W�(1� !�W�'�����

0���&�����- 8������������'��

&��*��������������� ����0���+������ D�����������������������*������ �����*����+�������������**�+��

�� )������& D������������+��������������!�������acqi�����������������+��!������ *� ;��������'���� !������������������+�������������������

$� )������&��,6�����!� *� ;���������1� !��������

�������� ���*������0��0�������+����+�����������

�!!��# acqi* )����� ��"��� D���������+���*��

change ������ ���0������*���<������������� D��������

e, eject 6F� ������*�

i, insert )����������*�

sample ������ ���0������*�!�����������<���������

* acqi<('par'|'disconnect'|'exit'|'standby')><:ret>

$���!���� loc�{0, 1 to traymax} ,� �������������*���������

traymax�{0, 9, 50, 100} ���*�� ���0����������C�

Page 106: Getting Started with VNMR 6.1C

��$ .>� ���&���'�1�������&��������*�

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

�����*�.>� ����

&��*���������������'��$&�������� �����*����+�����������������&��,�����)����(����&��&�$���,���)��

G �����������*� ;��������������������������*����*�0����������0����������������0����)������ ����<�

0��=� ��������!%,�-�5�����������!%,��������

�������������0�������*�!���������*�������0��+��**��*������+�������������������*���+��� �������� �����*��&���������"���� ��+�+�*��!�����������0�������������+��������������*�!��**����0���������������������������*���

2����������0������*����������������������������"�+�+�������������������!������ �*��*����������;��0����������9���������������*!���� ����������**�������������#� ������������������*��������+��������������0������ ���������������*!���������������+����+�������������*��*��*������0������"��+�����;��0������ ���� �������+����������� ��� �*�0��+���2����� ��+����0��+������������������������������*�+�����������������0� �*��+����A�������������0�����*��0��������������*!���� �� �����*+�9�!�������+������������!����*������� �����*���������������*������ �������������������;���������*� ���� ����+��*�0���������������������*��������� ������������ *������*���� ��

0���&�����1��������'��

&��*��������**�����������������������*������ �����*����+�������������**�+�

�� ��������������*���F� �����K�"�������������*��������������0���L��������������*������ �������������*���

$� )��������������*������*� ��0���������������������������������*�

7� 6�����i���������������������+���

0���&�%+19.

&��*��������**�����������������������*������ �����*����+�������������**�+�

�� )��������� �������� ��"�����+��������������!����������������0�glide�����������������+��������� *� ;��0��������432.(�������������������������

$� �*� ;����(),���#��!�;����/��!�W�(1� !�

7� )��������������*��

8� �*� ;����2����!�W�'�����

0���&�����- 8������������'��

&��*��������**��������� ����0���+������ D�����������������������*������ �����*����+�������������**�+��

�� ��������������*���F� �����K�"�������������*��������������0���L��������������*������ �������������*���

$� )��������������*������*� ��0���������������������������������*�

7� )������& D������������+��������������!�������acqi�����������������+��!������ *� ;��������'���� !������������������+�������������������

8� )������&��,6�����!� *� ;���������!�

Page 107: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�����*�.>� ����

&��*���������������������������� �����*����+������/��+���*���������0�� ���������������������

�� �����������*� ;��������������������������*����*�0����������0���������������0����)������ ����<�

$� )��������������*������*� ��0���������������������������������*��������������*���

7� ��&'�,���*����������*� ;������������*��*��+������������*���������������������� ���*���*����*����+!� *����������������������������������*��������������+��������� ��+����������*���������������*��

0������������!%,�-�5��������!%,��������

A�*�������������*�� ���0������+����*�+����������0�traymax=0����loc=0�K��������+����0�+���������*;�������������L�����*+��������;����������*������+�� ����+����"��

G )��������*�� ���0���������������+�������*������F� ��+�����0���� �!�����e��� ��!��������& D������������+��!����� ���0������*��0������������������;�����0���� ������*��������������0����������������<������*�����*��+�+������������*�� ���0��!������**��*� ������ �����������*�����*� ������C�����

G )��������*����� ���0�+������**��K����0���������������������0����*�0�������������0����)������ ����<L!���������*�� ���0�����**����**�����;��������"���������*���������������+���**����������������*�����������0������������*� ������������������ ��"���+��

2�����**����0���� �+����� ���0����*����������*���������������������*�� ���0���������������� ��������������*�� ���0����������������3���4����� ���������������+� ���0��0������*���*������*���

0���&�����1��������'��

�� �*� ����������*���������������������������������*�������

$� 6�����loc=n change�����������������+��!�������n��������*� �����������������������������������������*����������;���K��0�!��������"����������*�����*� ������9!�������loc=5 changeL�

2���change��� �������"�����������*�� ������*�����������������+��*� �������������*����������������+�������� ���0��!��������������+���������"����*����� ����+!���������*������*� �+��������*� ���������2�������*�� ���0�������������� ;�������������*���������*� ��������� ����+����loc���+���������������������������

2���sample��� ���������������� ������+������������change!�spin!�lock!���+�shim!� ��"�����������������0��������������*�������������������������*�� ���0���

0���&�%+19.

�� )��������� �������� ��"�����+��������������!����������������0�glide�����������������+��������� *� ;��0��������432.(�������������������������

$� �*� ;����(),���#��!�;����/��!�

7� )��������� ��������,� �����!�����������*� �����������������������������*���*� �+�

8� �*� ;����'�����

2������������ �**���������������+��������������� ������+�� ����+���������change� �����+����"��

Page 108: Getting Started with VNMR 6.1C

��3 �����"��&��������������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

.�� �����������$���!��������

&������0�"�������!���������F����+��������<��������������������� �*����������������������2������������������������ ��"������*���������� ���0�+��2���!���������������<���������������"��F������������+!������������������������� ������EF��������������� D����������

)������F�������+���� ���0������������������������������������"������<��������������+�������������������<���<��������!������ ������+��������������0����������������������������������+���K��0�! pw=6 nt=16L����������H�����0�5��D��� ���*���+ ����������!I���0���1����+�H�����0���*����D��� ���*���+ ����������!I���0���17�������+�� ����������������������������

)��������������������"�������� ���0�+!����� ��*+��������������������������������!��������� ��������������+����*+��������� �**����������������������+�� �������<� �*�!�������*����������<�����*�!������<���������������������+���2��������������� ����������� ����E������������������<�������������0���"�+���������������!��� *�+��0���������+��+�����������������������+�����������2��*������������C������� �����+����+���������������+����������� �����

2����������$���!�������� �

���������������������0���C�+��������������������*�����+��*� �+����+��� ������%

G 3��� �����/vnmr/stdpar� ������������+��+��������������������+����������� *����5����<���*�!�/vnmr/stdpar/H1.par� �����������������������������0����������.���� ������+�/vnmr/stdpar/C13.par� ������������������������7����� ����

�������� �����"��0���������������������+����+�����������

�!!��# addpar* &++���*� ��+������������������� ��������<��������

cd<(directory)> ����0�����;��0�+��� ����

dg<(template)> 3���*���0��������� D��������:��� �����0�����������

dg1 3���*���0��������+���*�������������

dg2 3���*���0��������7�+:8������ �����*:73�����������

dglp 3���*���0��������*���������+� ���������������

dgs 3���*���0���������������+����������������������

fixpar ����� ������������ ���� ������� ������<��������

fixpar3rf ��������������������������+���� �����*

fixpar4rf �������������������������������� �����*

fixpar5rf ������������������������������� �����*

lf<(directory)> ,������*���������� �������+��� ����

paramedit(parameter<,tree>) 6+���������������+���������������������������+����

paramvi(parameter<,tree>) 6+�����������������+����������������0�"���+����

rtp<(file)> �����"������������

setup<(nucleus<,solvent>)> ������������������������� ��<���������

userfixpar �� ��� �**�+������<���

* addpar<('2d'|'3d'|'3rf'|'4d'|'downsamp'|'fid'|'image' |ll2d'|'lp'<,dim>|'oversamp'|'ss')>

$���!���� dg�V�����0S ������*�+0�����������0�����+���*��

dg1�V�����0S ������*�+0������������0�����+���*��

dg2�V�����0S ������*�+0$�����������+���*��

dgs�V�����0S ������*�+0������������0�����+���*��

file�V�����0S 5�*�����������������������

Page 109: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

G 3��� �����/vnmr/parlib� ��������������������������������� �*����<���������!��� ���� /vnmr/parlib/dept.par���+ /vnmr/parlib/hmqc.par�

G 3��� �����/vnmr/tests� �����������������������������������+��+�������������!��� �����/vnmr/tests/H1lsph�����*�����������+�/vnmr/tests/C13sn�������0��*����������

G ���*��*�!���������������!�+��� �������stdpar���+�parlib���������+��+������"������������vnmrsys��2�����+��� ������������������������������0������������������������������<���������������������+������������������������������"����"�+�������**�!�������"��������������������������������+��� ������K����������!�H�����0!������"��0!���+���"��0�3���!I��+�� ���������������"�������+����L

0��2� ��$���!��������

?��� ���*�����������������������0������������������������������0�����lf� �����+�

0���&���������������

�� �*� ;��������������W�����

2���5�*��������������������������**����0��������%

)������0����� �����+���������*���������*�����+�+��� �������K����+��� ���������������"�����*�������������+!������<���*�!�stdpar/L��������� �������+��� ������

$� 2���<����������stdpar����tests�����+��+����������������������!��������+����������/vnmr/stdpar����/vnmr/tests��2���<������*� �*���������������!��������+�������������������������������+��� ������)��������� ���!���������������*�������������+��� ���������������2�� ���0��+��� ������!� *� ;������!�.��� !��$�

2���3��� �����������������������������**����0��������%

7� ������+*�� *� ;����-����!�����*�����������������������*�"�*�+��� ����������������������K��0�!�vnmr/L��

)��������"����"�+�����������������������������+��� ����!� *� ;��������.������������������+����*��+���*���������*���������

8� ��"��+��������������+��� ��������������K��0�!�stdpar/L���� *� ;��0������������������������<�����+��� ��������������������������*�������������������������������������"������K������+����+��;��������������������� ;0����+!������� ;0����+����+��;���+������������������L���+������ *� ;��0����'%�����

��������������������*����� ���"������������������������+��� ���������������5����<���*�!�������������+��+���������������+��� �����/vnmr/stdpar!��������������������������� �**��������**����0�+��� ������%

C13.par/ F19.par/ H1.par/ H2.par/ N15.par/ P31.par/

0���&�����1��������'��

G 6��������� �����+�lf<(directory)>�������directory��������������������+��� ����� ��������0��������������������K��0�!�lf('/vnmr/stdpar')���lf('/vnmr/tests')L�

Page 110: Getting Started with VNMR 6.1C

��3 �����"��&��������������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

2��*��������������������K��������<���L��������������+��� ����!�������cd!������lf��2��� �����+�cd�����������0������ ���0����������������+��� ��������+����*��

0������,,�)� �$���!��������

?��� ���������"������<�����0���������������������������������A� ����������������������� �**�+!�������<�����+���+���*��������������"�+�� D�����������+���� �����0���������������������������������<������������+���

0���&�%+19.�

��� �� ����*���������+����������"��+�����.���"��!���������������+����������"����*��+��������������������+�5)3�����������������**����0����������������"��+������������ �%

�� & ��"������� ����� *� ;��0�����432.(�������������������������

$� �*� ;����+� ����

7� )������� �**���������+��!������������**�������������5)3���*����������������

8� �*� ;����+�!���/��

2���+������*������� �**�+��)������+��������� D����+��������� �!���� .def���*��������*����� �**�+��������� ��

0���&������9.�,�*������&��

2���������+� ���������+����������"��+�����������������!�5)3�!�����������*����2����������������+!�����listenon��� ����������!�����������"������!��<� ���+��)����*��������"�*��������0�*�����+��������������!� ����+���������0�listenon���������*� �*�login��� ����3��������**����0����������������"��+����������36%

�� ����������36�5�*������0����������0������36����*����

$� >���������+�����+�+��� �������+�+���*�� *� ;��������+�����+����������!�5)3!�����������*��

&�����������"����*� ��+�����+�����+�5)3���*�!���������� ����+���+�+���*���+� .def���*���K��*���� D����+��������� �L�����������"�+��������� ���

0���&����������������

�� 5�**��������������8����"������*�����0��������������������0������������������������������������������������������������+��� ���������������������"���!������������������8!���0�*�0�������������������*����������!���+� *� ;����+�!����

$� �*� ;����3����

0���&�����1��������'��

6��������� �����+�rtp<(directory)>!�������directory��������������������+��� ����� ��������0��������������������K��0�!������ �**���������+��+������������������!�������rtp('/vnmr/stdpar/H1')L�������������++��0���� .par������<�����������*����������0�rtpL�

&���������0��0��������������������� ��������<��������������rtp�K�������*����� ������ �����rt! rtv!���+�convert)!������� ���fixpar������������ �**���<� ���+��2������ �����;���������**����0�� �����%

Page 111: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

G /�+������*+����������� ���� ������� ����+��� �� �*�������������+������� ���+�������������+����������������������� ���������

G ��������file�������������+� �**������fixpar3rf!�ixpar4rf!���+�fixpar5rf �� ������� �� ;����������<����� ������**�� D����������������������*���+������������+!�������!���+���������� �����*�!������ ��"�*��K������� �����*��<�����������������������+��������"�*��������������������numrfchL��&������������������+������������������ �����+!� ���� ����C�+!���+�������*�C�+���������������������� ����

G ��� ;��������� ���userfixpar��<������)�����+���!�fixpar������������� ����2�����**�������������� ���������� ������C�����������������

2�������������file� ��������������*�����������������������������������+������rt����rtp��� ����2��������������������������������go� �����+���������+�

G )������������������������������������+��Kauto='n'L!�file�������������'exp'�

G )��������������������������������+��Kauto='y'L!�file���������������������������+��� ���������������+������������+�

0������,,�����#��#�$���!��������

2�������������������������"���*������ �������������*������������*� ������+��+�����������������A� ������ *������+���*"����������*� ��+!������������������������������+�������<�����������D�����+!� ���*�������������������0����������������������+�+� ���*�����+!�������� ��������.���+��7�!������<������������� ��0����2���

0���&�%+19.

�� )��������� �������� ��"�����+��������������!����������������0�glide�����������������+��������� *� ;��0��������432.(�������������������������

$� �*� ;������!�,�

7� /���0�������0���������������!� *� ;�������������0*�����������0����������6<�������������������������+����&������������������� ��� ����� �����Proton�1D���+�Carbon 1D��

8� /���0�����*����������������!� *� ;���������<���������+�����+�

9� /���0�������0���������������!� *� ;�������������0*�����������0�����������*"��������������������+����&������������������� ��� ����� �����CDCl3���+�Acetone��

�� /���0�����*����������������!� *� ;����������*"����+�����+�

1� �*� ;����������!�,��������������������������������+���

0���&���������������

�� �*� ;��������������W���!�,�

2��������������������������������**����0��������%

$� )������������.�����7���<���������������3�*7!� *� ;����&�<'.'������'��<'.'��!�����������������A��������!� *� ;����"� ����<���/��!�

Page 112: Getting Started with VNMR 6.1C

��3 �����"��&��������������

��� ������� #���$ %�����&������'(���������

2����� *�����*� ������������������������� ��� ������� *��%

7� �*� ;���������� *���+�����+!������������� *��������������������*����+!� *� ;����A����������������+����������� *����

2����*"�����*� ������������������������� ��� �����*� ;���*"����%

8� �*� ;����������*"����+�����+!�������������*"��������������������*����+!� *� ;����A����������������+�����������*"�����

0���&�����1��������'�����'�����������

�� 6�����setup�����������������+����

2����� *�����*� ������������������������� ��� ������� *��%

$� �*� ;���������� *���+�����+!������������� *��������������������*����+!� *� ;����A����������������+����������� *����

2����*"�����*� ������������������������� ��� �����*� ;���*"���%

7� �*� ;����������*"����+�����+!�������������*"��������������������*����+!� *� ;����A����������������+�����������*"�����

0���&�����1��������'���2�*�

G 6��������� �����+�setup(nucleus,solvent)�������nucleus���� ���������������0������� *�������������*����������+��� �����/vnmr/stdpar=����� �**��H1!�C13!�P31!���+�N15!���+�solvent���� ���������������0�������*"�����*����+����������*����������+��� �����/vnmr/solvents=����� �**��CDCl3!�C6D6!�D2O!�DMSO!�Acetone!�CD2Cl2!���+�CD3OD��

5����<���*�!�������������������������+���� �������<��������������3�A�+�����������*"���!�������setup('C13','DMSO')��

0����������,����#�$���!����

5��� �����������������<���������!�����addpar��� ��� ���������*� ��+����������������++�������� ��������<���������

0���&�����1��������'��

G 6��������������������� �����+�����++�����������%

addpar('2d') 5�����$3��<��������

addpar('3d') 5�����73��<��������

addpar('3rf’) 5�����7�+���� �����*

addpar('4d') 5�����83��<��������

addpar('downsamp') 5���+�������*��0�+���

addpar('fid') 5�����5)3�+���*��

Page 113: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

����������0��������� ����+!�addpar�+���*���������� �������������������������������+�� �����������addpar��������� ����&))������-)������%���(��������*���������������������� �����+�������� ��addpar���0������

0��2� ��$���!�����@���%

?��� ���+���*���"�������0�����������������������������<�����+�������0�����dg� �����+����������������� ����dg1!�dg2!�dgs!���+�dglp%�2��������0������������dg!�dg1!�dg2!���+�dgs� �����*���� �����������������+���*���+���������� ���������������������������������������K��0�!��)����dg� �����*����������������0�����+���*���+����)(&�dgL��2�<���+������paramvi(parameter)��� paramedit(parameter)������"��*��*��������+�����0����������0������������������������������*�� �������-&�))��������+����*��������������+�������������������

0���&�����1��������'��

G 6��������������������� �����+������ ��%

.�A ��!��������#�=� �����������$��1�

)��������������������������������������������"���������������� *�����0!��������+����;���������������"��������������+���������������� ����������������������������"��*��*�!���*��0�����*����������������0�"��������������������������*� ���-&"�����������&������������������������������������������

0����!��������$��1�

2������"�����������!�����+���������+�������������������������*���������������������

�� )��� D������������������0����!����������� D����������6�����dm='n' su�

$� )��������*�����������������!�����"����������*��

7� ���"������ ��*��0�*��������������*�������*���������������

8� ���"������ ��*������������ �**������� ��+���������������2��� �**�!����������� ��*�������*� ;!������"�!���+�+� ���*�!���+��2� �����*��2����2� ��*������� ����� ��*��

addpar('image') 5������0��0

addpar('ll2d') 5���$3�*����*�����0

addpar('lp') 5���*���������+� ����!�� D���������+��������

addpar('lp,1') 5���*���������+� ����!��������*� ���+��������

addpar('lp,2') 5���*���������+� ����!�$�+����*� ���+��������

addpar('oversamp') 5����"������*��0�+���

addpar('ss') 5�����*"���������������

dg 3���*���0��������� D�����������+��3:$3���� �����0�����������

dg1 3���*���0��������+���*�������������

dg2 3���*���0������������+���+����������� �����*�������������K���� �**������������ ��+���+�����+�+� ���*���!������ ��"�*�L���+�$3���� �����0����73�+��������������������

dgs 3���*���0����������������+�����������������������

dglp 3���*���0��������*���������+� �����������������

Page 114: Getting Started with VNMR 6.1C

��= 0���&�������,�*�����'�)���*����

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

���� ��+������ ���� �������������*�� ��������������*� *�����)������������� ����!� �����**������"�������������������**������0���� �� ���+��"������"�+�+��)������������� *���!��D���C������ ���� ����������*�0����

9� ,��������������;���*�+����**���*����������*+����������������������������������0������+�!�������������������������������+!���+�0��+������*��*���������������0����������������������+��&��������������0��������+�� ���!�����"��������������2� ���� �������������0*����������������������������������������

0��=� ��������$��1�

��������������������������**����������"����������������"�*���� �+�������"��

.�" � ����$��1��3�,� ���#�0�!%,���

2��*���$��������C������������� ������+������������ ���� ��+��������������*���������������������*�1�2��� ������������ �������������������������0���������*���

.�. 0����������$��1�

�����������**��������+������0�"������������������ �����������+��������������������2��*���7��������C����������� �����+�� ���� ��+�����������0���������3������������*�������������*�����"��+�������������+��+�������������������0��

���*������&��

)��0�����*!������������������*���+������+����������������� *����K�������*������*��������� �����������������+� �����������"�����L!���*�������**�����������0����+���������0����������������� ������������ �*�������*���

&���< �����������������*��� ������������� ���0������H�����*I���0��� ���*"�������������0*������ �����*��!��� ���������������*����������������������)�������������������+����������0��� ���*"���!��� ������3�*7!���+��������0*������ �����*�����������������+!������������+���*��0������0�������� �°���*�����+���������� ���������������������

������� ������5�*���� ������+�����������

����� �addnucleus<(nucleus)> &++������� *��������<�����0���������*�

addparamsZ &++�������������� ���������������*�

addprobe<(probe_name<,'system'>)> �����������������+��� �������+���������*�

getparam(param<,nucleus>):$value �����"�������������������������*�

setdecpars ���+� ���*��������������"�*�����������������*�

setdec2pars ���+� ���*���$������������"�*�����������������*�

setparams(param,value<,nucleus>) ������������������� ���������������*�

updateprobeZ /�+������������*�

* addparams(param,value,nucleus<,'tmplt'><,'system'>)updateprobe(<probe|'tmplt'><,'system'>)

$���!����probe {string} �����������

Page 115: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

5������0*����*����<���������!������+������0����������������**� �����������������+������������������0��*����������K��� ��������**���*���������0���7�°���*��!������<���*�!���������������+�+���������� �°���*��L������������� �������������� ����**�������**��

?���������"�*��&������*�

�������*��0�� ���0�������+������������D��� ��������������"���� *�����������+���+��������!��� ��������� ���0�������7������9�!�����++������*� ���0�������+���������D���������"�*��0��� ��*�!��� ��*�+� ��*��*� ���+��������������������**���%

G &��� ��+��������������*������������0�����9���!�����!���+�19���.C���������

G &��� ��+������������+���������*������0����*�0������������������!��������!���+����� �������������������+�����������0����)������ ����<�

G &��� ��+���������������� �����������0���� ����*��������� ���������������������������"�� �� ������������������������

2���D���������"�*��0��� ��*������&�� ���0�+������� ���� *���!�������*����������+����0���������D��� ����K�����<���*�!�8�����'���.CL!�����**�� �"����0����� �����������K���� ��"�L�������D��� ���&���� ���� �� ��*��+������������ �**������ ����0��*���������!�����������"�����������+����� ��������� �°���*���*��0���

0��0����$��1� ������������0����#���=0>�*�+

�������������������6!������� ���!���+�/�)2?������������� ����������+������0������2/�6�)�265&�6�����*��������0����� �*������������0����0����qtune�

0���&�����)0�.�1�).,-�.�����*

������� ����������+�����0������ ��*�����*� �**�+�����2/�6�)�265&�6!����������5�0����$$��2�������*����*� ���+�����������������0���� ����*��������� ������������+��*�������*������������*���2�������*� ��������������**����0�+���*���!����+����!���+������%

G &���������������������*��������2/�6�)�265&�6�+���*��!����� ���0�*���*�D��+� �����*�+���*���������������������� �*�"�*�����������E�����+�0���*����+����������� �������������+���*�����+����������*�0�����������������*��0������"�*��������+��0�����+�0���*����+����

�������� ������2����0�������+�

�!!��# btune 2��������+���+� �����*�������� ������!����� �����*�����������

ctune 2�����7�� �����*�����.:�7������ ������

dtune 2����*� ;� �����*�������� ������

go* �������<������������� D��������

htune 2�����.� �����*�������� ������

qtune >����� �*������0����*���������� ������+�/�)2?����

sethw('tune',n) �*� ������ �������������������+�

su �������������<������������� D��������

tune* &���0�����D��� ������������� ��� ��+�/�)2?����tuneoff 2�������������0���+��������� ������

* go<(<'acqi><,'nocheck'><,'nosafe'>)>

tune(freq1<,freq2,freq3,freq4>),tune(ch1,freq1<,chan2,freq2,.>)

Page 116: Getting Started with VNMR 6.1C

��� )����&����������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

G #�*�������+���*��������������0*��+�0������+�����*���*�+��.&����+�&226���2����.&�����+���� �������������������A55����������� �����*�����0�����+�K�!�$!�7!��� �L!���+�����&226�����+���������������������������������K���*�0�����������2/�6�,6�6,�;��������*+����������L��2��������������������*� ��+����������������+#��2�����<��������������������1 �+#!���� �������*� ��+������������0����'��&��"����+���*����� �����+��������������������������0�����"�*�������������+�����

G &������*�������0��������������*��������+���+� �����*�0�����+���#��������������*���*�+��A#6�-97$��

2����0�������������������� �������/�)2?����������������0�����2/�6�)�265&�6�����*���;���������**����0������%

�� ������������� �����������������"�������� *�����������������

A����!����������������*���+������������� ���� ���� *���=�������!���� ��+����������������������0��������<���������K������������1!�H& D�����0�3���!I�����������������L��

$� /���0�������������������� �+����0�"�����*������������������!� ���0��������� ��*������ ��+�������������� �����*������*�����������������*���������*+�������*����+����0����������0���� �+����%

G ������ ������+�/�)2?�����$��!�7��!����8����������%�3�� ���� ������ ��*�����������.�#��+�����������#�#��+������������������������������0���� ����*��������� �������� ������� ��*����������A#6�-97$��������������2/�6�)�265&�6�����*�

G ������ ������+�/�)2?�����9��!����!����19���������%�3�� ���� ������ ��*������������A#6�-97�������������������+���+�������*������������� .: �5�-97���������������������*������������ ������� ��*����������A#6�-97$��������������2/�6�)�265&�6�����*��2����+�� ���� ������ ��*�����������A/2�/2������K-97�$����-97�$L���+� ���� ������������2/�6�A/2�/2�-97$7������

7� 2��������+�������"��*��*���������������������D��� ���/���*������������������������D��� �������������������������+��Ksu����tune)!�����2/�6�)�265&�6�����*���**��������;��������������0���������������������0������ D��������� ����*��

G 2��������������+�������������go����su��6� �������go�������su��<� ����!����� ����*���� ��"��������D��� �������� �� �����*�+�����+����������<����������2�������D��� ���*����� ����������������+�+����0�������2������*����*���������������*����������������������� �����*���*� ��+���+��������� ����+�����������%

5���+�� ����������������������������!��������������� ����&))������-)������%���(��

G 2����� ��+������+�������������tune����������+�� �����������tune��������� ����&))������-)������%���(������+����*���2���������0���������������� ��

������*�� tn sfrq tof

������*�$ dn dfrq dof

������*�7 dn2 dfrq2 dof2

������*�8 dn3 dfrq3 dof3

�������� 2/�6�)�265&�6�����*

1 3

CHAN

ATTEN

PROBE

J5321

TUNE INTERFACE

100

300

0

400 500

1000

600

900

700414

Page 117: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

%�����&������'(��������� ��� ������� #���$

����*�������<��go����su� �����+��<� ������2���tune� �����+�����"��*��*����������� ������+�/�)2?���������������*���

8� �����������.&��������������*��������+���������������������������� �����*����������������������������� �����*����

2����������������������0���� ������������� �����*��2���2/�6�)�265&�6�+���*�������*+���������������!���+�������+���+� �����*�0�������*+������*�����K)������*�0����*�����!� �� ;����� ���� ����������� ��*������������������ ���� �����L

9� ����������&226��������������*��������+��������!�1!����'�

�� )���� ������!��������������������������� ;�����������������������������������������**�����������*���������� ����� ;���������+�+����������������+�����+��� *�����

1� 2���������������&������������0���� *������������0�����+!�������������������2/�6�)�265&�6�+���*�����**�+� �������

'� ����������&226�������������*��������+�������'!������ ���������������0�*�"�*��������"�������������������0�����*������������+���*���+��������2/�6�)�265&�6�+���*��������� *�������C�������������*��

� 3�� ���� �����������0���� ���������������0������.&��������������*��������+����������K3����0������*���� ������������������!��.&����������������������� D�����������**��&������**���+�L

��� � ���� ��������� ��*���������������0���*���������������**���%

G ������ ������+�/�)2?�����$��!�7��!����8����������%�3�� ���� ������ ��*��������A#6�-97$��������������2/�6�)�265&�6�����*������� ������ ��*���������.�#��+�����������#�#��+������������������������������0���� ����*��������� ��

G ������ ������+�/�)2?�����9��!����!����19���������%�3�� ���� ������ ��*��������A#6�-97$��������������2/�6�)�265&�6�����*������� ������� ��*����������A#6�-97��������������� .: �5�-97�������!���� ��"��������������0���*�������2����+�� ���� ������ ��*���������2/�6�A/2�/2�-97$7��������+� ���� ������������A/2�/2������K-97�$����-97�$!���������������L�

&�����������!�������+���+� �����*�0�������*+����������

��� �������������������"�������� �� �����*���������������

5����������������������������������������**��������+������0�������������� ������+�/�)2?����!�������������������*� ���-&"�����������&��

0���&�����%����� �*�������)����&����&����@8����A

2������ �����+�� ���������������������0����� �*������������0����0���!�qtune�K���������5�0����$7L!�����������������������������������0��qtune�����"��*��*����������� ���!���+�/�)2?����!����������6!���+����������������������

qtune������������������ ����������+��������������������� ��"�������0������+���������"�+������������������������������� ���0���+�������������D��� ���2�������0����������� ��**�������*����������0������������� ���*� ���+� ��*� ����0��������!��� ��������0��0��������

&�����������������������������������+�!��������*� ��+����������������������������������0������+��� �����*� ���*�����+����+��� ��+���+�+�0���C�+���������� ��"��� �� �����%�&�������������������� ��"���+��� ���������*� ��+��������2�;��0�����K�������L� ���*�<���������+���������������� �����D��� ��0�"�����+����������������������*� ��+�������"���������D��� ���&� ��*�����+��������� ��� ����D��� ��K����**���������D��� ����������� *���������������������������"�L����*� ���*���*�������������������D��� ���2���� D���������������������������������0��

Page 118: Getting Started with VNMR 6.1C

��� )����&����������

��� ������� #���$ %�����&������'(���������

����+�����+����D��� �����0����+�0�������+����������*� ��+������������� ��"�*���2�������� ����+F���� ������������������������ ��"�*��+����0������<���������

7&�7�����-&"��'��$�4����

2������� �+����+�� ���������������������qtune����0������������������������

�� ��������������������������0%

������ ������+�/�)2?�����(�*��"���������� ��������������"����+��

��������������+�������������(� ���� ��������**����0� ��*��%

G ����� ������������������ ��*�����������������K-9��$����-97�$L�������2/�6�-98�$� ���� ���������������+�����������0����*�0��

G ����� ������������������ ��*�����������������������K-9��$����-9��7L��������2/�6�-9��8� ���� �����

G ����� ������������������ ��*������������� ��"���K-97�7����-9��7L��������B�2/�6�-98�7� ���� ����

��� ������0����)������ ����<�(� ���� ��������**����0� ��*��%

G ����� ������������������ ��*�������������K-9��$!�.��#�+����&��!���������-����!�##������!L����-98�$!�2����

G ����� ������������������ ��*�����������������������K-9��$!�.��#�+�2<!����-9��7!�,��#�+�2@L����-9��8!�2����

G ����� ������������������ ��*������������� ��"���K-9��7!�.��#�+�A��!����-97�7!�,��#�+�A��L����-98�7!�B������2D�.�:,��#�+�A���<�

$� 6�����tn='n'�su!�������n���������� *��������������+�K��0��tn='H1'L�

7� )�������������������+��!�������qtune(gain,power)!�������gain���+�power�����������������0������+�������"�*�����2��� �*�������������qtune(20,65)����������� ������+�/�)2?����!���+�qtune(0,15)������������������+��������������>�����**��������������*�����0����"�*������������*������������0����������"�*������������*���)��qtune����������+�����������0������!�����+����*��"�*�������9������gain���+��������power��������+��

2���2����3���*�����+�2����������*����+��������!�����*������5�0����$7��2���2����3���*������ ������+��������������������D��� ��������� ��������<���������KsfrqL�

��������� ������2����0����+���Kqtune����0���L

Page 119: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

2�� ���0������0������+�������"�*���!� *� ;�6<����������2����������*�����*���+�������������qtune� �����+�����������������������"�*����

8� )������.��,��$����*+!���*� ��������������#����

G 5�**�+���*�������������������;����*�C���*�;��0����!�������������5�0����$7�

G ������*�+���*�������*���������������+���*������������0������� �*�"�*����������+��������0����!�������������5�0����$8��������������0��"��������0��������D��� ���!�����������*�+���*��������������������*� ��+���������+� ���������D��� ����������������+�!�����������*�+���*��������������"���0�����*� ��+���������+����� ����������D��� ����"���*�+���*��� �����*���������2����������*�����*�����+����*�+����������*�+���*�����+�!��� *�+��0� ������!�0��+!���+����;����

9� )������0��������*+!���*� ��6�����6::��

)���������A�!���"�*�����*�+����� ������"��*��*����+�������+����0�������+��������+� ��������� *�������������������*� ��������������� ����������������������+��E�����*������������ �������������+!����� *��������������������*� ��������������� �������2�������+�����+����*������������������������*� ;����+�� �����*�������������*� ����������������+���������

2������������+��� �����*������D�����%

G &����+�������;������������� ��������

G 2�������������+���**�����0������������ *���*��+�� �����*�������������*� ������<��������������0��*�

G &����0��������D��� ����������������������K���!���+�����D��������������+�������������������+�L�

�� �*� �������;����������������������D��� �������� ����������������������������������**����K��������������������"��*��*�����������*�+���*��L%

5�!�#�

����%���������

��������� ������*�3���*�����+����������2����3���*��

������������*������

Page 120: Getting Started with VNMR 6.1C

��� )����&����������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

�� )������2����������*�����*�K����5�0����$9L!� *� ;�������������0*����<�������������������;����������������**�+���������K5�0����$ ��������������;���������L��

5��������+����*��������0����;���!���������H2��/����������!�>��+!���+����;���!I���0���$��

�� )����������!���*� ������������������D��� �������� ���������������0������������

&����;��� ��������+��0����������*� ��+����D��� �����������������2����3���*������+���

1� )������2����������*�����*!������"�*���������������������������,��!�� ���!���+����������*+���������2����������*�����*��

/���0�����+#�� �*������**���� �*������������������0���������H2��&+F�����������!I���0���$���

'� &+F���������������+���� �� ��� ���������*����� ���0�����2����3���*������+����/���������� �� ��� ���������� ����������+������������+�������� �����������*���/������������ ��� �������� ����������+�������������;��� �����+�����������

2���+���+���*���+��������2����3���*������+���������������*���*��������������*� ��+�����������D��� ������0������"�+��2���+���������������;������������ ��� �������������+�� ����� ���0�������������� ��*����������������������+��� ��"����2�������C����*�*� �������������+����������������D��� �������� ��*���*��������������*� ��+��2���0��*���������������0��������� ����������+���������������;�K��� ���0L����*�� �������0�����+����������+�����+����D��� ���

� &����������������������+!� *� ;�()�!��?����������+�������0��������<���������

������� � 2����������*�����*�Kqtune����0���L

��������� ��**�3��������������������5��D��� ���

Page 121: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

7&�����(���������+�4���(,

2��� ���������D��� ���������������������D��� �������� �������������������������+��&�*������� ���������D��� ����������������������������**�+����������������2����������*�����*�K����5�0����$�L��2����*����������D��� ����������+��������������nuctable���*���

�����������������D��� �����������������������*+���**�����������+�����*������������������2�������*��������**���<�����������*+��

�� )������'��!������*+!� *� ;�������������0*����������������**�+��������!��������*� �������D��� ��������D��*�������� *��������������D��� �����������

$� &+F�����������D��� ����������0�������"�*��������������������*+������� *� ;��0�����=���+�>���������

2���(����U���������+� ����������� ����������"�*������������+����������������

)������ ���������D��� ����������������+������� ���0�+��������(����U�������!���������+���*���+���<������������D��� ���)����������+�"�*�������������� ��������+�������� *�������D��� �����������**�+��������!�������� *�������+���*���+��

)���������� ������������� *�������������������������������D��� ��*�����!�������������+� �����+�����**����������� ������������� ����+!����������0�����+�����**�����!���+���������������0����**���������)��������� ����+� ������������������������D��� ��*����!����������0�����+�����**�����!���+���������������0����**��������

7&���=�����$�����

2�����������������������+��!�����.C!����+��������2����3���*����

�� 2��+� ����������� ������������������������<�����������������!$!9���!$�!��� �!���������,������*+!���������"�*������ *� ;�����(����U��������

�����0�������������*��������������.C� ���������������0�����+�������������+���������������0������������

�����0�������������������������<���������� ���������������0�����+�������������+���������������0������������

�����0���������������"�*��������+�������<�������������������D��� ���� ������������������+� �����!����������0�����+����������!���+������������0������������

$� )�������,������*+!� *� ;�������������0*��������������������**�+���������K����5�0����$1L�

• �*� ��3��!��,�����������������������"����������"�*���

• �*� ����)�#�#��,��������;��������� �������������������������������������<������**����*�����D��� ����

• �*� ��'��������������*����������D��� ���������0���+������;���������������������������������0��*��2����������������D��� ��������� ������*����*� ��+� ���������D��� ���2������+����������*����� �� ;��0��������*� ��+����������������������������������;��0��������������������D���������<�+����D��� ���

��������� ��**�3���������

Page 122: Getting Started with VNMR 6.1C

��� )����&����������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

7&��������&�!����!�����2��

����������+����;������������������2����3���*�����+��������+��������������������������+�������������������+����;�������� �*��� �+�+���+��������D��� ����������������� ������+���*���+����������������������2����3���*����������!�0��+!���+����;��� �����*�����������"��*��*�����������*�+���*���

�� �� �(�)������'���������*+!�����2����������*�����*����"�+��������� ��������+���K����5�0����$'L

G �*� ��6::��������� ���������������������� �����������+���*���+��

G �*� ��3�������+���*��������0*�� �������������� �������������D��� ���2������D��� ������������������ ��������+�������0��*����*���+�������������D��� ������+���*���+����������������������2����3���*������+���

G �*� ��?�)����+���*������� ������������������������6<���+��������K����������0���������������������������0�L��&���������0��������<���+�+!����� ��������+������ ������ ;��������A�����+���2������D��� ������������������� ������!������**��������+�*�����+�������0��*����*���+��!�����+���*���+����������������������2����3���*������+���

@��#�(�)������4�������*+!���*� ��6::����6��K����5�0����$'L���� �����*���0��+�+���*����������2����3���*������+����2���0��+���*���������+��0��������*� ��+�������*�"�*�������������0������2���0��+�+���������*���+��������+�����0�������������0������

���6�� �(�)���������@����!����@���!���+����@��������*+�!�����2����������*�����*����"�+������������;�����������;��0���<�+����D��� �����6� �����;�����������**�+���������K����5�0����$ L������*���������������� *�������D��� ������+��������������**�+����������6� �����;����*�������������������*+������������0������D��� ��

?��� ����������;�������������"��0���<�+����D��� ���!������<���*������������ *�������D��� ���������+���*������+��������?��� ��������"������������!���+��������;������**����������+�+��������!�+����+��0���������������������D��� ������������0�� ����+�������� ��������<����������

&��������0���������������;�������"�*���������+���������������D��� ��*������ ���������������0�����+�������������+����+� �����������������0��

7&��$�����$������(���(��

?��� ��� ���0������"���� �*�� �*���������2����3���*������+��������*� ���0�������������+�������� �*�+������*���������*�0������� ��������K����5�0����7�L�

��������� ���������+�>��+�������*�

��������� ��**�3���������

Page 123: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�� )������� �������*+!�����2����������*�����*����"�+�������� �*��0���+��%

• �*� ���?�������"�+����*�0������� �� �*��������������+#��

• �*� ��3�����������*������� �*�����������������������

2���+#�� �*����������+������+������������� ��������� ���+F��������

$� )��������)����*+!��������"�*������������������������*�����������2����3���*����

�����0�����<�"�*��������+��������*������0������������������+���������������0���

7� )�������!�,����*+!��������"�*����������������������������������������+�"���������;�������� �������� �*��K+#����*�����L��������,��<����������2����3���*���

������*��������;��0��������0��������������������� ���������*��0���������**���

�����0��� �*��"�*��������+��������*������0������������������+���������������0��

>���(����&�

������B��� ����+�����������������"�����B����+�����+�����������D��� ������������������ �� ����+�"�+�+����������*�����������+��+����

�� �����������������������2����������*�����*!���*� ��B� �* �*�����%�A��

2��� �������B�"�*�����+�������������D��� ����������������������������2����3���*������+��!���+�������C����*� ����������������������*���

$� )������2����3���*������+��!�����������++*�������������������*� ����������C����*� ������������������*����K���*� ��+�������*�"�*������+���������������� ��*���L��2���B� �* �*��������������������������������2����3���*������+���

2���B������������������+��������+������**���%

G 2���������������+������*�������������������+���*�����+�+���0������������������������� ���2������D��� ��+���*���+���!��������!���*������ ����������������D��� ��+������� ������������������?����������;������������� ����������D�����0�B���������������

G 2����*������������������+����������2��������������;�������*�"�*������������C����*� �����������������*���!�������<��

���<����������+������������D��� ���������**������������0��������*� ��+��������������

G 2����������D��� �����������"��������0��*�*�"�*����6D�������������ω����+�ω$�

[6D���\

G B���� �* �*���+������6D�������$!�������ω���������������������D��� �

[6D��$\

G 2������������ �� ;�����������*���������K������������������+��L�������*������9�+#���*�����������*�����)������������������!����� �* �*���+�B�"�*����������� �����!���+���!����������!������������+�K���������0�“- - -”����������������B�"�*������*+L��2���������� �����D��� �!�����"��!�������**�0�"���

���"������$��7�����,���)

&�2������*������������+�������"��*��*������ �*�������0���������������������0����������0�*��+!���������*��+�K���+�"� ������ ��+L!���+���9������*��+�

���������� �*��������*�

Vmax

5������������

Qωr

ω1 ω2(���������������������X

Page 124: Getting Started with VNMR 6.1C

��� )����&����������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

2�� �*�����������������������

�� ��������������������������0%

������ ����/�)2?�����(�,��"���������� ��������������"����+��

�������������+�������������(������ ��������**����0%

G ����� ������������������ ��*�����������������K-9��$����-97�$L��������2/�6�-98�$� ���� ���������������+�����������0����*�0��

G ����� ������������������ ��*�����������������������K-9��$����-9��7L��������2/�6�-9��8� ���� �����

G ����� ������������������ ��*������������� ��"���K-97�7����-9��7L��������B�2/�6�-98�7� ���� �����

��� ������0����)������ ����<�(� ���� ��������**����0� ��*��%

G ����� ������������������ ��*�������������K-9��$!�.��#�+����&��!���������-����!�##������!L����-98�$!�2����

G ����� ������������������ ��*�����������������������K-9��$!�.��#�+�2<!����-9��7!�,��#�+�2@L����-9��8!�2����

G ����� ������������������ ��*������������� ��"���K-9��7!�.��#�+�A��!����-97�7!�,��#�+�A��L����-98�7!�B������2D�.�:,��#�+�A���<�

G 6�����tn='n'�su!�������n���������� *��������������+�K��0�!�tn='H1'L�

$� �*� ;�����'������!����������������2����������*�����*��2���2������*������������+���������K����5�0����7�L�

?���������������� �*������������������������**����0���+��%

G �����2���

G A����2���

G 9��A���2���

2����������������������*���"��*��*������������+����

2������0�������������*�� ���� ����� ����� �����������*����2��������!�������**����������*�����"�����*+� �*���������������������������<���������������������+��

7� )������'���� !�������*+!���*� ��6::����6�����+����*���������*�� �*��������� ���� �����!������ ��"�*���2���+����*���������*�+�

)��"�*�+� �*�����������*������������������!���������������������"��*��*��

8� ����� �����������0�*��+%

G ������ ������+�/�)2?�����(������ �����������0�*��+������������������

G �������������+������������(������ �����������0�*��+����2/�6!�-98�$������������+��K��������+�L����������0����*�0��������������0����)������ ����<� ���� �������������0�*��+����-98�$!�2����

9� �*� ;������%��!����!��������

�� ���"�������������0�+�"� ����������������������

1� ��������*��+�����������������!� *� ;�����6,������!��������

���������� 2������*������������+��

Page 125: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

2������0����+�"�+���������**����0������������ ��������������7$����D��� �����+����+������7$��<�����������2����+����������0�+������������0������*������+���������&���������0��+�������� �**� ��+!�����& ������������� ������"��*��*���)��&3���"���*���� ���!���������0������0����������

'� &��������������������0���0��*�K������0��*���**���������0������*������D��� ��������������0�����D��� ���L������+�������� �����&3���"���*��!� *� ;�����0 �,!���������

� &��� ����9������*��+%

G ������ ������+�/�)2?�����(������ ������9������*��+������������������

G �������������+�������������(������ ������9������*��+����2/�6!�-98�$������������+��K��������+�L����������0����*�0��������������0����)������ ����<� ���� ������9������*��+����-98�$!�2����

��� �*� ;����� ��6%#����!��������

2������0����+�"�+���������**����0������������ ��������������7$����D��� �����+����+������7$��<�����������2���+����������0�+������������0������*������+���������&���������0��+�������� �**� ��+!�����& ������������� ������"��*��*���)��&3���"���*���� ���!���������0������0����������

��� �*� ;�����0 �,!����������+�����"������9������*��+���������������������

�$� &������**������������������������+!� *� ;�������/����������

2����*+� �*�����������*���������"�+��� .bak���*��!���+����� �*�����������*���std_ed.cal!�std_es.cal!���+�std_er.cal����� �* �*���+��2�������*������������+����$vnmrsystem/tune/tunecal��)��������*��� �����������"�+!��������0�������+� ������������+���������������0��

�7� �*� ;�����'������������

7&�����&���$��-�#�&������"��&��+���

)��������"������� ���� �� �*�����������*����+�+������������������������� �*��������������!����������������"����� �*�����������*��%

�� �*� ;�����'������!����������������2����������*�����*��2���2������*������������+���������K����5�0����7�L�

$� �*� ;�����+��!����?� @�,���������

Page 126: Getting Started with VNMR 6.1C

��� )����&����������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

2������0�������*� ����������� �*�����������*����������� .bak���*����)���������0����+�����������+��**���������� ;�����*��!���������������0����������

7&�����&���$������������"��&��+����

�������� ;�����*��� �����������**�+���� �����0�������**����0� .cal���*����������������� ��������+��0� .sys���*��%

G std_ed.cal����std_ed.sys

G std_es.cal����std_es.sys

G std_er.cal����std_er.sys

2����������������������� �*�����������*��!� *� ;���������������#� ;�����������2������0�������*� ����������� �*�����������*����������� .sys� �*�����������*��� �����+����������������**�������

������� ��(����&���&%��$��7�����&��&��-���

2��0������*����+�� ��������������������������+����*+���������2����������*�����*!� *� ;�����&��,�������������������0�����������������&���**�+�������������*��������������������5�0����7$�����������*� ���������� ���������������������������

0������$��1� ����1�������*�+4�1������708-�1������-���1�����)))

5������� ��������������!�����btune!�ctune!�dtune!�htune!���+�tuneoff��� �����������������+����������������������������+�����������0�����������������������*��btune���+�tuneoff������������������ ����������0�������

G A����������������!���+����� �����������+���+��������!�btune������������������+���+������������!�+��� ���0���������9�������������������D��� ��sfrq�U�tof���������������#����������0�btune!����� ������ ��*�����������0����*�0��tuneoff���������������������������

G A������ ������ �.:�7���������!�htune���������������.������������!�+��� ���0���������9���������������������������tuneoff�������������������������������*��*�!�ctune���������������7�������������!�+��� ���0���9�������������������������!���+�tuneoff���������������������������

�������/ ��, �*��,���#� �������%�� ����,� ���,#����������,��6�������,��)�����������, �����#�,��6�������,�����#�!�����*��%!������#���� ������������ �,� �

G A���**����� ��������������!�dtune��������������*� ;�K$.L����������������������0�����*� ;� �����*��

G A���**����� ��������������!������� ���sethw('tune',n)�������+��������**�����btune�Kn����8����9L!�ctune�Kn����$L!�dtune�Kn����7L!�htune�Kn�����L!���+�tuneoff�Kn����������L��sethw�������������**��������+�������������+��� �*��

2������ �+�������*����������� �*���������0������� ��������������5����������������������!�������������������*� ���-&"�����������&��

��������� .�*����**�3��������

Page 127: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

2����"�����*�)����&�����.�0/�*��!��.�0/��5!��.�0/!�## %.�1�1�$���

2�����<���*������������������������7���2�������������������� *���!�������������������������� *����������+����'C13'�����������

�� -��������������������<�����������+�������tn='C13' su�

$� ��"������ ��*�����������##� ���� ����K-97�$L��������2/�6� ���� ���!�-98�$��������������0����)������ ����<������##������!�-����!����-98�$!�2����

7� ��"������ ��*�����������##� ���� ���!�-9��7����������������������0����*�0��������2/�6� ���� ���!�-9��8!�F�������"������������������0����)������ ����<������-9��7!�,��#�+�2<!����-9��8!�2����

8� 6�����btune�

9� 2������������������ ���������2/�6�����������

�� &+F��������2/�6� �����*�;������������+����0�����+��0�

1� 2�������������"�� ��*������0���+�����*�������������� �����������������+��0�

'� 2�������������"�� ��*���� ���0���+������������������������+��0��&+F��������2/�6�;����������+�+�

� ��� ���� ;���+������������������������"�� ��*������0���+���+����������"�� ��*���� ���0���+�����*������ ���"���������*���������������������+��0��A� ����������������������+!�������tuneoff�

)�����������0�����������!���������������������������� ����+���������������������������+��0��������������0�������������+�

��� �������������� ��*���������������0���*�������������+�������������������� ������)��

9� ���*������*�)����&�����.�0/�*��!��.�0/��5!��.�0/!�## %.�1�1�$���

�������/ �����������������#����%,������,-�����6����������� �,������������������%��1��#�������#�#����%,������,����,���-����,����1�������� �!%,����#�#����%,������,��&'�� �����������,,�#�!�������� �!%,����#�����#����%,������������%������ ��+�������0��%�������-�����%��1��#�������*���� ����������������,�����3���!�'�!�!�%����-�� �����,�� ���(�3<������"�2$��

�� -��������������������<�����������+����������� tn= H1�su�K�����.L��� tn= F19�su�K����� 5L�

$� ��"������������������� ��*������������.� ���� ���!�-9��$!����������0����*�0��������2/�6� ���� ���!-98�$!��������������0����)������ ����<������-9��7!�.��#�+�������!����-98�$!�2����

7� ��"������������� ��*�����������������������0����*�0�������� ��<��*������0�F� ;�*���*�+�2/�6!�-9��8!��������������0����)������ ����<������-9��$!�.��#�+�2<!����-9��8!�2����

8� 6�����btune�

9� 2������������������ ���������2/�6�����������

�� &+F��������2/�6� �����*�;������������+����0�����+��0�

Page 128: Getting Started with VNMR 6.1C

��� )����&����������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

1� 2��������+� ���*��� ��*������0� �����*��������������������������0����������+��0��&+F��������2/�6�;����������+�+��A� ����������������������+!�������tuneoff�

'� �������������� ��*���������������0���*�������������+�������������������� ������)��

�������2����"�B9� ���*������*�)����&�����7B�3��%.�1�1�$����

�� -��������������������<�����������+�������tn='H1' su�

$� ��"������������� ��*������������.� ���� ���!�-9��$����������0����*�0��������2/�6������� ���� ���!�-98�$!��*������������0����*�0�

7� ��"������������� ��*�����������������������0����*�0�����������.� ���� ���!�-9��$!��������2/�6� ���� ���!�-9��8L�

8� 6�����htune�

9� 2������������������ ���������2/�6�����������

�� &+F��������2/�6� �����*�;������������+����0�����+��0�

1� 2��������������� ��*������0���+������������������������+��0��&+F��������2/�6�;����������+�+��A� ����������������������+!�������tuneoff�

'� �������������� ��*���������������0���*�������������+�������������������� ������)��

�������2����"�����*�)����&�����7B�3��%.�1�1�$���

�� -��������������������<�����������+�������tn='C13' su�

$� ��"������ ��*������������7�� ���� ����K-97�$L��������2/�6� ���� ����K-98�$L�

7� ��"������ ��*������������7�� ���� ����K-9��7L����������������������0����*�0��������2/�6� ���� ����K-9��8L�F�������"�����

8� 6�����ctune�

9� 2������������������ ���������2/�6�����������

�� &+F��������2/�6� �����*�;������������+����0�����+��0�

1� 2���������7�� ��*������0���+�����*�������������� �����������������+��0�

'� 2���������7�� ��*���� ���0���+������������������������+��0��&+F��������2/�6�;����������+�+�

� ��� ���� ;���+��������������������7�� ��*������0���+���+������7�� ��*���� ���0���+�����*������ ���"���������*���������������������+��0��A� ����������������������+!�������tuneoff�

)�����������0�����������!���������������������������� ����+���������������������������+��0��������������0�������������+�

��� �������������� ��*���������������0���*�������������+�������������������� ������)��

0������$��1� ������=0>���#��B�7��� ��!

5���/�)2?���+��@���������!�������������������*�������� �������+����������������������������������������������������+��

Page 129: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

.�� �%�������������!%,�

A������������ ���!������������!�����������!�/�)2?����!�/�)2?!���+��@���������!���+��������������+����� �������������������� �����*!������������*������������+!�����*����������+�����������������+������0�*��������*���������0��2���� ���*����������������+� ���+�����������%

G )������,A�4�+���*����������& D������������+���Kacqi����0���L!������ ���*����������������������*�������*� ;���0��*�K���0���������������0�*���+!������**������������0�*���+!���������+�������L!�����5�0����77�

G )������& D������������������+���Kacqstat����0���L!������ ���*���������0�"��������**�������������0�*��������+� ������

G )�������������������������K�������*���������������������������������!��������!���+����� � ����L�������������0����*�0�������������0����)������ ����<��������������������!�����������!��������!���+����� � ����!������������������������������������*�0��%

)��*�0���������!���������*����������������0�

)��*�0�������*��;��0!���������*������������0����������������*������D�����+������

)��*�0����������+�!����������������������0���0�*���+��������*������D�����+������

A������������+����� ������������������������������� �����*!������������������ �����**�+�����+F�����0��������+*��"�*"�����������0����*�0��������0������+� ���+�����������*�0�����+������+*��"�*"�����������0����*�0�

?��� ����+F��������������������������������+����������& D������������+����2��� �*�����������������9�������������������+�$�($������9����������

2����������������*����+���Kspinner����0���L����"�+������������+� �����*!��<��������� �����*!���+�*�������+������0������+�����������*� ����!�����5�0����78�

2��*���8�*����� �����+����+��������������*���+�����+F�����0�����*���������0��

0���&�����1��������'��

2���spin�(&))�����0�*���������*���������0�� ��+��0��������spin��)����K����������������spin� �����+���+���spin����������L��2���spin� �����+��*���������� ���D��� �!�+� ���*���������!���+��������������2���"�*����������spin�������������� ���0�+������������*������������+��������������� �����+��spin!�go!�ga!�au!����sample����������+��2���!�����"�*������spin���������� ������*������ ��������<����������2���dgs��� ���+���*��������0���������������+����������������������!��� *�+��0�spin*�2��������

���������� ����)��������������,A�4�3���*���Kacqi����0���L

Page 130: Getting Started with VNMR 6.1C

��< ������&��������*�

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

����+� ����*��������+��������������������+��+���������������������0�"����� *����K�������� �"���+�*����L��

&��*��������**�����������������������*������ �����*����+�������������**�+��

G 6�����spin=# spin!�������#��������+�����+������������5����<���*�!��������0�spin=15 spin��+F�����������������������9�

)��spin������������������ �*���"�*�����+����������*� ;�����������in�����������'y'!��������0���0�*��������� �� ;�+��������� �������������& D������������������+��������������������������������0������������0�0�������������0�*�����!�F����������+�������*� ;����*�����)��in�����������'w'!���������0����0�������+�����������������+�0�������������0�*�����=�����"��!�� D����������������������+��)��in�����������'n'!��������0���� �� ;�+���+���0�*���+������������������������������+����� �� ;�+�������������

2���spin��)���� ����*�������������'n'!���� ����+� ������������������������+F�����������������+���������� D�����������0�����2������������**����**��������������0�*�����������*����������+����������!������ D�����������**����������������0�*���������� ����)��spin='n'���+�in='y'!���*��*� ;�*���� ������� D�����������������

2���in����������� ����������������+*�������*� ;�*�"�*���+�������������+���������5���+����*�!�����H,� ;�,�"�*���+��������+�6�����.��+*��0I������0���9��

0���&�����- 8������������'��

&��*��������**��������� ����0���+������ D�����������������������*������ �����*����+�������������**�+��2��������������������"��*��*�����+�������������

�� )������& D������������+��������������!�������acqi�����������������+��!������ *� ;������������� �������������������+�������������������

$� �*� ;��������,A�4��������

2���,A�4�+���*����������������������**����0��������*���+������������!�����5�0����77%

G 2����)�������K��������������������+���*��L

G &����+������������ ���*��������0�����+�K���������������������0����� �����+��L

G ������*������ ���0��0�����"�*����������spin�����������K���������������������+���*��L

2��� �����*������ ���0��0�spin� ���������������+������������� �������"�*������spin�K����������D�������� ;���!���0�!�[ 20]L!����*�+�� �����*������+F�����0�����"�*������spin!���+��������������K*���*�+�(�U!�(8U!(��U!���+�(�8UL��*��������+F�����0�����"�*������spin�

�������� ���*��������0�������+����+�����������

�!!��# acqi* A��������& D������������+��

acqmeter<('host')> A��������& D���������+��

dgs 3���*���0���������������+����������������������

spin ��������������������<��������

spinner A���������������������*����+��

* acqi<('par'|'disconnect'|'exit'|'standby')><:ret>

$���!���� in {'n','w','y'} ,� ;���+�����������*� ;

spin {0, 5 to 39, 'n'} ���*�����������

Page 131: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

7� ��� ;����������������������������)������������*� ��+��&*��� �� ;����� ��������������0�����+�+���*���+���������� �������������,A�4�+���*���

8� 2���+F��������spin����������!��������������������������+�%

G 3��0����������� ������� ����������*�+�� �����*����������*��������������������������*+�+�����2���"�*��� ���0��������������**�����������������"���

G �*� ;��������(�U!�(8U!�(��U!���+�(�8U��������������D����+���*� ;��0����������������������*�����������������+� �������spin����������������������������������=� *� ;��0������������0������������������ �������spin�����������������������������������

5����������������������!���������H,A�4�3���*��!I���0���9��

0���&������������������*����'��

2���spinner� �����+������������������������*����+������� �����*��������*���������0!�����5�0����78��5������������+��!������������� ������������+����������+!���+��<��������� �����*�����������0� �����������+������2�������!��������<�������������F����F����+���������spin��������������������"�*������������������ ��������������0�����+!���+��������0����������spin����'n'���+������go!��������������+���**�������� ���0�+�

A������������ ����������!���0������+!���*�+�����*������*���������0���+�*�������+!�*�D��+�����*������*���������0������������+��� �������� �����*��2���spinner����0���� ���������+������*� ����������������������

�� 6��������� �����+�spinner�����������������+���

2����������������*����+������������

$� �������+�����+��������0�����+���� *� ;��0�����+�����+���<�����2�����������A����+���������������+�"�*������.C�

7� 2��+����*���<���������*� �����*�����������0!� *� ;��������������<�����&**�������� �����*��������<��������������0���&������������������+����+�K��+���+L������*� ��+��

������<���������*� �����*�����������0����+����*�+!����� ��� ��������������������������������+*�+��������������E��������0���������+����� D������������������+�

8� �*� �������������� �����������!�*�������+�K*�D��+��������������0L!���0������+�K��*�+��������������0L!������������ ����������������*� ������

)��������*� ����0������+!����� ��� ������������������������������*���������+������������+��

)��������*� �������������� ��������*� ����!�����������*����������������*+�"�*�����������**������������������������ �������*�+��������������0�

5���������0������+����������������K��0�!��&L!�������**����0�������������������"����������*������+�������"������������+��������+���0�%

���������� �������������*����+���Kspinner����0���L

Page 132: Getting Started with VNMR 6.1C

��C 2�����:��&�+� 6

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

G 2��������*�����*� ��+���������������������+�����������+������������"�*������������������

G )������������������+�+��������C������+����������������0�������C���!����������*�����**��������������2���������������"������������������������������ �����������*��

G )�����������������������������0�����+� ������������ ��+!����������*�����**��������������2���������������"��������� �������+��������0������ �����+����������������������*���

.�/ �%��!�;����2��6

/�+��� �������� �����*!�����*� ;�������������������������D��� �������*�������������� ��������������������� ����*+�0�������+������������� ��+� ���0���0����+�������*��*��������������� ���0���+�������<�����*����������� ���,� ;��0���;�������������� �����*+��������+����������������+��������+���*"���� ��� �+�����������*� ;����D��� ���

2���*� ;�*�"�*� ������"����+�����0�����& D������������+����������& D���������+��%

G 2��"��������*� ;�*�"�*��������& D������������+��!�������acqi�����������������+��!� *� ;������������� �������������������+������������������!���+������ *� ;��������,A�4���������2���,A�4�+���*������������

G 2��"��������*� ;�*�"�*����������& D���������+��!�������acqmeter�����������������+������Acqmeter������/�)@����**��&����+�����������K���������5�0����79L��������0����������0�����*� ;�*�"�*���*� ;��0������������0��������������������+���������+����������������������������**�����������+���*����2���+������������������������������������������+���������**������������*��������+���*���K�*������5�0����79L�

2����������*� ;�������C��������� ���� �������;����+������������*� ;�����������������*���+��;���������������� �*�����*"������+������� ��������������*������������������������� ������������+���������������� ����������0������*�����������������K��0�!�����������0�lockgain=30�lockpower=24;��2����������������+��������;������ ������*����su!�go!�����D��"�*���� �����+����0�"���

)���������� ��������0�������������+!������������������������������������*�*� ;���0��*�������*��+F�����������������+�������� ���"��������<�����*� ;����*���+���2���� �������*�����������*�����������0� ��+�����!���+���������������������0��������������**����������+#�*������2�������������������*� ;�*�"�*����0�"����+��������7���������+��������+�*� ;���*"���������**����������0����+��������+���� ���� �*��< ���0��+��������+�7$Z ����������*"�����2����7�� ���"������+�*�!���������������� ��+������� ������+�������������9��� ��+�������3�*7���+�*��������������"�� ������*"������2���**�������*���*�!���������*����*� ��������*� ;������!��������� �������C����������������+��

2������ �����+�� ����������*� ;������������Klockpower!�lockphase!���+�lockgainL���+������+�� �����������+����� �����**��0�*� ;��,� ;�*��������� �������� �����*�����*���+�� ����+��2��*���9�*���������*� ;� �����+����+������������+�� ����+����������� �����

�������� � & D������,� ;�3���*����Kacqmeter����0���L

Page 133: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

2��6�$����-�@���-���#�$�� �

/�+��� �������� �����*!�*� ;������!�0���!���+����������������������*� ;�����������Elockpower!�lockgain!���+�lockphaseE�����������**����0�*��������+��������C��%

G A�������� ������+�/�)2?����!�*� ;����������������'�+#�K�'������**������L!�*� ;�0������������8'�+#!���+�*� ;���������������7���+�0������������C��������������+�0���������+#=��������C������*� ;������������8�+�0�����

A���������������!�*� ;���������������8��+#�K8�������**������L!�*� ;�0������������7 �+#!���+�*� ;���������������7���+�0������������C��������������+�0���������+#=��������C������*� ;������������8�+�0�����

G A������ ������!�*� ;���������������8��+#�K8�������**������L!�*� ;�0������������7��+#!���+�*� ;���������������7���+�0������������C�����������������+#���+��������C������0����������+#=��������C������*� ;������������8�+�0�����

G A��/�)2?���+��@�!�*� ;����������������7�+#�K�7������**������L!�*� ;�0������������1��+#!���+�*� ;���������������7���+�0������������C��������������+�0���������+#=��������C������*� ;������������8�+�0�����

������� ,� ;�������+����+�����������

�!!��# acqi* A��������& D������������+��

acqmeter<('host')> A��������& D���������+��

lock ������&���*� ;��<��������

readhw* ��+�� D������������+�����"�*���

sethw* ���� D������������+�����"�*����K*� ;���*���+L

* acqi<('par'|'disconnect'|'exit'|'standby')><:ret>readhw(par1,par2,...)<:val1,val2,...>sethw(<'wait'|'nowait',>par1,val1<,par2,val2,...),sethw('lock','on'|'off')

$���!���� alock? &������� �*� ;�������

in {'n','w','y'} ,� ;���+�����������*� ;

lockacqtc? ,� ;�� D�������������� �������

lockgain* ,� ;�0���

lockphase* ,� ;������

lockpower* ,� ;������

locktc? ,� ;������ �������

shimsetZ 2���������������

z0* J�����*+���������

* alock {'y','n','a','auto','s','samp','u'} on ������ ���@�alock�{'y','n','a','s'} on ���� ������!��������������lockacqtc {1.2,4.7,12,48,in sec} on ������ ���; lockacqtc N/A on ���� ������!��������������lockgain {0 to 48 dB, 1-dB steps} on ������ ���;lockgain {0 to 30 dB, 10-dB steps} on ���� ������lockphase {0 to 360 degrees, in 1.4-degree steps}lockpower {0 to 68 dB, 1-dB steps} on ������ ���;lockpower {0 to 40 dB, 1-dB steps} on �������������locktc {1.2,4.7,12,48,in sec} on ������ ���;locktc N/A on ���� ������!��������������shimset {1,2,3,...14} on ������ ���; {1} on ���� ������shimset {1,2,3,...10} ����������������z0 {–2048 to 2047, or –32768 to 32767}

Page 134: Getting Started with VNMR 6.1C

��C 2�����:��&�+� 6

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

A���**����������< ���������� ���!������������!�����������!���+��������!���+����� ������!�������0�*� ;������������Klockpower=0L����������*� ;���*���!��������!����*� ;�

2���J�����*+��������������������z0���*+������ �������������0��������J��������0��2���*���������z0�����($�81����$�81!��������������!������������������shimset������������!�$!������!���+(7$1�1����U7$1�1����shimset�����������7������0�� � A�������������!��������������+����������������!�shimset��������A������ ��������������!�shimset�������J���������� �������

2���readhw� �����+����+��������������� �������"�*�������*� ;��������������������������� D������������+������2����;��������������*� ;�"�*������������ D������������+����!���������sethw� �����+�

2��6������,������#

&����������������+�������"��*��*������ �����**��0�*� ;%�

G ,��"��*� ;�������� �������������

G �������<�����������*� ;�+��

G /�������*������*� ;�

G /���������C��0�����*� ;�

G ����������**�������C���������*� ;�

6� �������+����+�� ����+����������**����0������������ �������&++������*��� ������+�� �������������+*��0���+�*� ;�*��������� �������� �����*�

2�������2��6��������������������

0���&�����1��������'��

G 6�����alock='n'

)������*�����������C�+�&���*� ;��������"����*����*� ��+!�*� ;���������*����+�������������������������������*���)������*��*� ;��������"����*����*� ��+!��������������*��*� ;�����������������*���������������*� ;���*"�����

�����������&'%���!������,��6�#

0���&�����1��������'��

&��*��������**����������< ���!��������!���+����� �������

G 6�����alock='u'

,� ;����+�� ��"���+������������������ D���������

��!%,��)���,��6

���*��&���*� ;�����"��*��*����������������!�����������!��������!���+������� ���!�/�)2?����!�������� � ���������������������� �������+����/�)2?���+��@����������+�������� ����%

G ������������*��&���*� ;����� ������������ ���� ��J��"�*��������������!�����+���������+F����*� ;������!�0���!����������

Page 135: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

G .��+���������*��&���*� ;����� ������������*� ;�������� ���"�����������<�����*������������0�!�������0��������*� ;����������7�+#�����������������"�*���+����0��������� ����+������������0�����*� ;��������� ;�+���������*� ;��������������+���+� ������+��A� ������0�C�+!��������������*� ;�������������0�C�+�����*�����*��&���*� ;������*� ��+��0�������������C��0�����*� ;������*� ��+��

&�+��0���������+���������*��&���*� ;����������������*� ;���0��*���**����*����� �������*�"�*!�������������������������*� ;� ���������������+������������*� ;��������2���� �����"�������������� ����D��� ���+����0!������<���*�!����������0������������

0���&�����- 8������������'��

&��*������*�����/�)2?���+��@���������� ����0���+������ D����������

�� )������& D������������+��������������!�������acqi�����������������+��!������ *� ;������������� �������������������+�������������������

$� �*� ;��������,A�4��������

2���,A�4�+���*������������2���,A�4��������������������������+���*������������� ��� ��%����!���!���+������

7� �*� ;���������

0���&�����1��������'��

&��*������*������**���������������������&���*� ;�K���������������+����!��������"�L�+����+�����������������

G 6�����alock='y'

&���*� ;����� ��"���+������������������ D������������������������*���+�������� ��"���+�

�%��!�;����)���,��6

A�����C��0�&���*� ;���������������� ���+�����������*0�������������� ���������*+��"���������**����0�����J��K���������+�������+���������*��&���*� ;L!� ��������*� ;!���+��������� �**���+F�����*� ;���������+�0����K��������*� ;������L��

0���&�����1��������'��

G 6�����alock='a' �� alock='s'�

)� alock='a'!����������0�����0������ ���<���������K�� �������������������� D��������L!���������������� ������������*� ;���0��*������ ������!���+������������C���*� ;���������+�0����K�������������L������"������� D��������������������+������go!�ga!�au��������������� ����������������������0�����go!�ga!����au�

)��alock='s'!������������� �������alock='a'�� ����������*�������������*������F��������� ���0�+���+��� �������� �����*���+�go!�ga!����au����������+�K����������**���F� ���0������������0�������*�!�������������� ������;������� ;��������� �������+�alock='s'������������ �L�

)��z0������� ��"����+������������������*� ;���������������������������lock� �����+�������������0�����alock�����������������������������"�*��!������autolock����� ������������*� ;���0��*���� ���0��0�����*� ;����D��� ���5�0����7���������<���*�������*� ;����D��� ��� D������������+���

#���������������� ������������D��� �������� ������+����������*� ;����D��� �!�����������*� ;����D��� �� ���0������������*��������&���*� ;����������!����D��� �������������� D�����������**������������������������������ ���0������ ���0������ �*������������ ������

Page 136: Getting Started with VNMR 6.1C

��C 2�����:��&�+� 6

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

��D�������� ���0���������*� ;����D��� �����������9����!���� �� ��� ���������*���������� ���������;������0��0�*� ;����D��� �������*��������*��������������*� ��&���*� ;����������alock������������)������&��� ����*�����������*� ;��<��������!���� �!����+���������!�����*� ;��<������������ ���*������ ����������*� ;�������������� ���*���+�

0���&�%+19.

�� )��������� �������� ��"�����+��������������!�������glide�����������������+������ *� ;��������>,)36�������������������������

$� �*� ;�������������� ���

7� �����������<�����������+���*"����

8� �*� ;��������������������

9� �*� ;���������������� ���

�� �*� ;��������& D������ ���

1� )������,� ;��0����*+!� *� ;����&����

J�!�*� ;������!���+�*� ;�0��������������C�+�

3�,,��%��!�;�����

5�**�������C������������������ ���*����������C���������*� ;�������������&���CC��*�0� ������*� ;��*0������������������������������� �����*���� ���������+���������+������<� ��������� ����+������������������������K�����!������!�0���L��������� �**����+�D�� ;*���������0����*����*�����5�CC����*����������+�����������0����������+������<� ��������� �����D��� ����+������+F�����0���������+��������2�����CC����*����������*������+����+������������0���������������*� ;���� �����5����!�����������������+������������� ���)�������<� ��������� �� �������������+!���������+������������+F����+���+��������������*��;�����������<� ��������� ���0�����2�����������������������C�������*� ;�����������"��+�����������!�������C�������*� ;������!���+�������C�������*� ;�0���������������*�����0���

5����D��� ���!�+� ���*���������!���+������������������*�������+����0���**�������C������

0���&�����1��������'��

G 6�����lock

����������������**�������C�������������&��,���������+������+�����������C��0�����*� ;��������)��alock='a'����'s'����������+!���*����������+�0�������������C�+�

2��6�2���,���#��%����%��#�&�����<��#,���

2���in����������� �����*�����������+*��0�����+����*� ;�*�"�*���+����������+!���+���� ����������� �������������;�������+����*� ;�*�"�*����*������������������*���%

���������� ,� ;�5��D��� ��& D������������+���

Page 137: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

G 'n'������������������ �� ;��0���������� D��������� �����������0��+*�����������*� ;� �����*�������������+��

G 'w'���;�������������� �� ;�����*� ;�*�"�*���+��������������+��&�������0������0������++�+��������*�0���*���������*� ;�*�"�*���**����*���������������+�����*�"�*�K������$���������*� ;������L�����������spin���������������������������� �*���"�*�����+��������������+�0�������������0�*�����=�����"��!�� D����������������������+�

G 'y'���;�������������� �� ;�����*� ;�*�"�*���+����������+��& D��������������*��+��������*� ;�*�"�*���**����*���������������+�����*�"�*�K������$���������*� ;������L�������spin������������������ �*���"�*�����+��������������+�0�������������0�*������

2���in����������� ������������������������ ���� ����%

G )������������� ���� ����!����������� ���� ������� ����������� ���������*� ;����*������+������� ��+� ���� ������� ����������� ��������������������*�����

G )�����������*������ ���� ���!������ ���� ������� ���������������� ����������������*� ;���������������*�����

2��6�2��%�0�!���� ����������,

3����0�� D��������!�����lockacqtc���������������������&(2��&&����)��(&�����!���������� �������������� ������*� ;����+�� ;� ���� ���+�������� ������������0���� ����*+��A���������� �������/�)2?����!�lockacqtc����1!�2!�3!����4!���� �� ��������+���������� ��������������$!�8�1!��$!����8'��� ��+�!������ ��"�*���A����/�)2?�����@�!�lockacqtc����1����2!����������$����� ��+����������������!���+����� �������+����������lockacqtc�

��������������������������������0����� D���������K�+*�!�*� ;�+���*��!������+���*��!�5)3�+���*��!���������!��� �L!�����locktc�����������K�����"��*��*���������������������+����� ������L� �����*������*� ;������ ���������2���"�*��������locktc���������������������lockacqtc�

2����������������+�����������**���<���������������������2��������������������*������"�*�������lockacqtc�K4����������� �������/�)2?����!���+�2�����/�)2?�����@�L���+�������������"�*���K1�����**��������L�����locktc ������������������+�������<�����2������������"�*���!����� ��� ������������������������������+�0�"�������"�*�������������0!������<���*�!�create('lockacqtc','integer','global') setlimit('lockacqtc',4,1,1,'global') lockacqtc=1. ?���+���������+���� ����������������������

.�� )#4� ��������!

�$�)�(&�����������**���0���� ����*+�����+���� �� �*������������������������ ����*+��)���������0!����� ������������������� ��*������+F����+������;��������0���� ����*+��������0����������������*������������ �����**�+�+�0���*�������*�0� ��"�������K3&��L���0�*������������������������������ ��*� ���������6"�������������������*����������+� �+������������0���������������� ���0�+!��������� �������������+F���������������

���!�@��#����

2�������������� ���**��������+� ��*��������+�����+��� �*��+�� �*������������� *�������������������&� ��*�K���������� ��*�L����������*+�����*�0��+��*��0������<������������0������� �**�+���J��<��*������0��+�����KJ�!�J$!�J7!��� �L�����*�����������*+�������*�0��+��*��0�����

Page 138: Getting Started with VNMR 6.1C

�� -'>�����&�����

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

���������������0���*��<������� �**�+�@���+�?���+��*������0��+������K@�!�@?!�@$?$!�?�!�?J!��� �L��2������*+�������� ��*�J��KHC���C���IL��*�������������*���0���� ����*+�

6� �������0��+�������� �����**�+���������������������=������<���*�!�����@�������0��+�������� �����**�+��������������������+�x1��5���J����+�J$�0��+������������������������������������� �%�z1���+�z2!���� ����������H����I�0��+�����!���+�z1c���+�z2c!���� ����������H �����I�0��+�������)���++�����!��������*+����������� �����**�+����������������z0��2�����**�������������0��+�������������������+���*���+�����������0�dgs!���� �� ����������0������������������������������+���*���+��

3����+��0��������"�*����������shimset����������!������"�*�������0�������($�81����U$�81���������(7$1�1����U7$1�1!��������"�*������C�������+� ��0���� ��������2���*������������ �������0��+���������*����+��������� ����&))������-)������%���(��

2����� ���readallshims����+���**�������������������+�������+����������"�*������������������������������������ �����������������������2������������+�+����+��������shimset� ����0���������5�����������������������/*���G���������������!�readallshims����� ��"����*��������+���������������������� ������ �������������*�+��readallshims���������"��*��*��������� ���������������

2����� ���setallshims��������������������� ������������������������������+������setallshims�����D��"�*��������������0�load ='y'su�������������������0��**��������+���������������������**���������su�K�����������!�+� ���*��0!�������������������*�C�����!��� �L��2������������+�+����+��������shimset� ����0���������5�����������������������/*���G���������������!�setallshims����� ��"����*��������+���������������������� ������ �������������*�+��setallshims���������"��*��*��������� �������

�����# ������!!���

3����+��0��������������!�����0��������+F��������� ��������+������������ �����������������������������*���+��������� ������+�%

G 3��� ��;������+������

G �����"��0����"����������"�*���

G �����*����*��������+�

G )����� ��"����������

G #� ;0����+���������

G 5�**���������� ���������

G .��+�����J����������

G >��+�������������

6� �������+����+�� ����+���*����2��*�����*��������� �����+����+������������+�� ����+������������0��5�����0�����*�+�� ��������������������0!�������������������*��,���)���)�������&��

������0�����0�����/*���G�������������������� �"���+���������*�����H������0�/���0�����/*���G�������������!I���0����9�

8� 1���#�&���

����"�*���� ������������+�H������+�I�� ������������ ���0�������� ��"���������� ��"��� ��+��0��������������0��������load�����������

Page 139: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

0���&�����1��������'��

�� 5����� ��������������"�*���������������� ���0�!����������������0��+����������������������������"�*���K��0�!�z1=247L�

$� 2��*��+���������"�*���!������ load='y'�su.

���������#���������������!���,��

���"����������"�*���� ������������"�+���+����+�������� ��������<����������5��������������������������+����+��0�����*���K�����<���*�!���*���������������+�*����L!������������� ���*���*������� ������2���+��������� �������� �����**�+������0��+�����������*����������������"�*�������������+��������*�����������0����������=����������!���������"�����(���,����������"���*+������"�*����������������0�����������*���

)��������������*������������������������"���������*�����������������������*���;�**�+�������������������*�� �������*��������� ����������!��������0� ������������+�����������������������+�����������"���������*���2������+�������*� ��+����������0���������������load='n'!�������0�+������*��+����������"�*�����)�!�����������������+!�����������������������������;����!�������������������*����������������������0��������������;�����"�*�����2�������+�������������"��0���������������"�*���!��������������0�"�*�������+�����+!���+������������0�load='y'!���**���+����su�

�������� .���0�������&+F��������������+����+�����������

�!!��# acqi* A��������& D������������+��

dgs 3���*��������Q����������������������0����

diffshims(shimfile1,shimfile2) ��������������������������K���L

diffshims shimfile1 shimfile2 ��������������������������K/�)@L

dshim<(file)>,dshim('method'|'help') 3���*����������H�����+I������0

gmapshim<('files'|'mapname'|'quit')> �����0��+����������������0

newshm )����� ��"�*�� ����������������+

readhw(par1,par2,���)<:var1,var2,���> ��+�� D������������+�����"�*���

rts(file)<:status> �����"������� ��*�������0�

sethw* ���� D������������+�����"�*����K�������*���+L

shim ���������&���������<��������

stdshm )����� ��"�*�� ������������������+

svs(file)<:status> �"������� ��*�������0�

* acqi<('par'|'disconnect'|'exit'|'standby')><:ret>* sethw(<'wait'|'nowait',>par1,val1<,par2,val2,...)

$���!���� gmap_findtof V'n','y'S 5��+���������������������0��+������������0�

gmap_z1z4 V'n','y'S >��+����������C��C8!��������0������+���������

hdwshim�{'n','y','p'} .��+������������0�K����"��*��*�L

hdwshimlist�{'z1','z1z2x1y1'...} ,��������������������+������������0�

load {'n','y'} ,��+�����������+���*���+������

method {file in shimmethods} &�������������+

shimset�{1,2,3,...14} 2���������������

shimspath {absolute path} ������������M��������+��� ����

wshim {'n','e','s','g','f','f#'} ���+�������������������

x1, y1, z1,... ����0��+������@�!�?�!�J�! ���

z0 {-2048 to 2047, –32768 to 32767} J�����*+���������

Page 140: Getting Started with VNMR 6.1C

�� -'>�����&�����

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

����������0�� �����������+�������*� ��+��������� ��������������������!���*"���!�����*�����0��!��� *���������0���� ���"����������&�����������!����������������*+������"�+������� ����*"��������%�cdcl3!�acetone!��� ��

0���&�����1��������'�������"���������*������&�

G 6�����svs(file)!�������file��������������������*��������"��0������ ��*�������0��K��0�!�svs('acetone')L�

)��file�����������*��������!�svs��������������"��������*���A��������!������"���������*�������������M��shims�+��� ������)�������+��� �����+���������<���!������"���������+��� ���������+��������shimspath������������)��shimspath�+���������<���!������"���������*����������������shims�+��� �����K���"�+�+�������������������������+��������L�

2����� ���diffshims(shimfile1,shimfile2)� ������������"�*����������������������������������������+�������������������*���������������0�svs�

0���&�����1��������'�����������"���"�'��������*������&�

�� 6�����rts(file)!�������file��������������������*�� ��������0������ ��*�������0��������������"�+�K��0�!�rts('acetone')L�

)��file�����������*��������!�rts���������������+�������*�����������"���A��������!���� �� ;������������*�������������M��shims�+��� ������)�������+��� �����+���������<���!���� �� ;������������*���������+��� ���������+��������shimspath������������)��shimspath�+���������<���!����������"���������*����������������shims�+��� ������&�����������*�����������"�+!�rts������load='y'������ �*������*��+��0��������������

2���rts� �����+��*����<��� ����������������������"�*������������������������+�����������"�+�������� ����svf����svp���+������load='y'������ �*�����������D�����*��+��0�����������K2��� �����+��su!�shim!�go!�ga!���+�au�������load='n'�������"�����������D��������+"�������*��+��0��������������L�2���!����������*�������������������������������������+���+������������ ��+�������������� ��������*�����<��������������*���+���������������+���+������+!�������0��������������������� ������������*�C�+����������"��0����������"�*����������������*��������

�������������������������"�+!����������������shims�+��� ���������������+�������!���*���������������������"�*������"������� ���0�+��2���� ���*������ ��������������*���*����+����load='y'���+�su!�shim!�go!�ga!����au����������+��)��load='n'!��� ��������������0�������0�������������� ���*������ ����������+�������������� ����+�������������������������� ��������<����������&*��!����load='y'!�����& D������������+���+����������������������

$� 6<� ��������listenon��� ���

7� & ��"�����36�

8� �����������*������0���������������*�������+�0���������+��� ���������� ��������������*��������������������"��

9� /����������������+���*�� *� ;����������*�������

�����,�&!�,���������!!���

2������������*���������+��������0��������+F����������������������������������*����*��������+�!���� ������ ����+����������& D������������+����5���������� �+������������0��������+�!�����H5)3:�� �����������0����+���!I���0���99��

)���������+�!�����������������+���������� ��"�*����*� ����+�+���*���+��������� �������������������������"������� �����*������� ���������+���������**���+F������������0����������*��

Page 141: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�����"��0���*� ;�*�"�*!����*������5)3�+���*��!�������*��������� �����+���*����������� ������5������**������������H��� ����I��������0!�����������+��������"��������������������K�������������*��������"��0��*+�"�*���L=�����"��!������� ������*�����������������*���*�������������� ������"�����������������������+�������0��;�**�*�"�*�!��������������*� ��*�������**����������+���������������0�������*�� ���0����

)���!���#����!!���

,�;��*� ;��0!��������0� ������+���������**������*���+��+�� ����+��&�������+��������0������������������+!�����"����)�� ��������������+�������**����0�����%

G ����(��#�����&�$�)�(�A�����0�����& D������������+�����+� *� ;��0���������������������������.)��+���*���K+�� ����+������0���88L�

G 8(2�&�������&�$�)�(�6������0 method=file shim K��0�!����������*�����z1z2!�������method='z1z2'�shim)�����������������+���K+�� ����+������0���8�L��2���������+�������*�0�����������0�����lock� �����+�������**�������C���������*� ;������������

G +���,����&)��(����&�$�)�(������0���������������wshim�K���*�0�������alockL����������0�����0�������� D����������������������� D����������K+�� ����+������0���89L�

G 5�'�����&�$�)�(������0���������������hdwshim�K+�� ����+������0���8�L��&"��*��*����*����������� ���������������/�)2?���+��@�������������������J� �������0����+������2���������+�������*�0����������+���������*��&���*� ;�

��������������������������+��������0������������+�K�< �������+�����J��&�������L!������� �����**�+������������ �����������������0���� ����K�� ������ �����+�� ����+����+����*���������D��� ���� �����L%�

G >����,�&�(����&��%&��$�))����(�2���D��*��������������*+�����0������������������������+��������0����������+���������0�"�����+�����D��*���������������0�������������� �� *��������������������0������������ ����+��

G ���$&��������&��$�)�(�5�����������H����;��0I������������*�����!��+F�����������J����+�J$��������� ����!���+����������+�'z1z2'����*+������*� ��+��)������������ ��"��&����������+�!������������������<������+��� �����*�������**�+�������������������������*� ��+��&�"��������������+��+�����������+�������"��*��*���������vnmr/shimmethods�*��������?��� �����������dshim��� ������+���*��������"��*��*������������+���?��� ����*��� �������������������������+���+�����������������������shimmethods�K����vnmr1!�������������*+����/export/home/vnmr1/vnmrsys/shimmethods�����*����!����~vnmr1/vnmrsys/shimmethods�

)������+� �+������������ �*��������+����������������;!�������*+��������������"����������������+��+��������������������� ���� *���������� �����������*� ��*��

&������� ��������0���*����������������������0�*� ;���0��*������� �����������C��0���� ���� ��������������+��)��������0����*� ;�������������+!������������0���� ���� ����� ��������*���*����� ������������ �����0���H��"��0����0���I��� �������� �������������� ������*� ;�����������*�����*� ;�*�"�*���<���C��!����+���������**�!������� *���������*� ;���0��*����**����������**����������+��2������**����+��� �*��������������������������������� ��"����������0��*����*���+���� �������*�����*�������*� ;�����������*�������������������*����������!��� ������� �**�����!���+��"�����**��+� *������

&+F��������������<�����*� ;�*�"�*����������*� ;���������������������������� ��"���2�������������������*� ;�*�"�*���� ���0������0��+�����������������������"�����������������������0� ���!���+������������������� ��������0�������������*���*���������������0�*� ;��������������*�� �� ;�+����+���������0��������*� ;�*�"�*� ���0������������������� ������������������ ���0�������+#����*� ;��������/���**�!�� ������+���������"�����*�����'�����9�+#�*����������������3�*7!������<���*�!�����������������������+�

Page 142: Getting Started with VNMR 6.1C

�� -'>�����&�����

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

���!!���������������)��� ��!

)���**������������������ ��������0!��������������� ��"�������������� ��"�!��������� �� ���!������������0� ��������!�������������������� �����2������� ������&������������������������������� ����+��������������A��������������*��������������������0������E0��+������+N�)��0��+!���*�����**� ���0������+���������+��������������������0��������+������������=������+!�*��0��� ���0��������� ��������2����� ��+��������0��+��������������*�����*��������N��*���*�!����������������+�����+�����*�����!��������**������������������&���������������;�������������� ����������<����������+���������+���������*������<�������������������� ����+�+�0����

&�����������2��*���1!������� ��������������"�� ���������"�*���%�#�K��+L!�,�K*����L!���K��+���L!�2�K��0��L!���+�6�K�< �**���L��K2���*����� ����*��������������+�������������0� ���������"�*���������������������+!�+�� ����+���*���L

&���**� ��������� ���������������*������!������<���*�!�,�W�����+� �������*������������0� ���������K���������������<�� ��+����������������������+�����+�"�*���L���+�����+������+��0� ���������K��+������H�����*I������D��*���L��2�0�����+��< �**����������*�����+������<�����*����0������*������������������0�����0�����*���������"��������*�������+�����+�

2���!������������� ���������������*����������������+��������������"���������+*��������������+������������ ����������0����< �**��������*�����!�������0������ ���������������0���+���+��0�����������,�W���)������������ ��"��&����������+�!������� ��������������� ����+��������**�+��������������� *� ;��0������������������������.)��+���*����

2������������������� ��������0��������� �������������� ���������2��������!����������;������������+� ��� �����*�0��������������*���������+�+���+!��������� �*��!�����5)3��������0!����� ��� ������ D��������������at���� ����+���������������������*���&��� D�����������������$��� ��+��0�"�����*������0������������*�����������9�.C!�������*��������������*+������ ����������������������0��������0��� ����������)������������ ��"���������0���+������0�acqi!���*��������������������� ������������� �����*�������������%�,�W��!���W��!���W�2!���+�2�W�2�K#���+�6�������� �����*�L��

2����������0� �������������*+���"������� ����������*�����*�!���*����������������� �����������*��������+� �+��)�������������0� ��������������� ����+����2!������<���*�!���+����������������������������!�������������**��"�����**���������+��2������� ����**!�����"��!���;��*��0��������������������0� ������������,���+��������� ����+�

���!������# ����)��� ��!

&�����������+� ���������������<�������0� �������+��������*�����������������������M�����������M��shimmethods�+��� ������2������<�������0���**��������������+���������������������� ������+�� �����0������������0������+��������+������*��������� *�+�%

G 2���������+�����������������

G �����<��������������������*������

�������� ���������*��������0�������������*���

�����&� ������ ��(&))����������

#����� #�+ ���+� �����������0������"�*�����"��*��*�

,����* ,���� 6<������ ���0���������*�����0��

������ ��+��� 2��� �*�����*�� ���0�

2����� 2�0�� ���*������+�����+����"���"���0�

6����� 6< �**��� ���*������+�����+�*�����������$�.C

Page 143: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

G �������+�*�����������*� ;�*�"�*�����*��0��

G �� ��������0��+������������������+���+����� ������������+������������0�

&� ���*���������+� ������������������������*������!���������+���� ��������+����������+������������ �*���K��0�!�f,ry,t600,szq:cmm;L��2����*������������0���� ����� ��� �0��+��������0��+������������������+��������������<�sxx:cyz!�������s��+����������������������������������!�xx���������� ���� ���� �+����������� ��� ������0��+��������0��+����� ����������!�c��+������������� �������������������������!�y���������������0� ��������!���+�z��������+�����+���+��0� ���������

2��*���'�*���������+��+����� ���� ���� �+������������0��+����� �������������

������������+�� ���������������shimset������������������� ����&))������-)������%���(��������*������������������ ��������������������

2�����**����0��<���*������������������0��������������+��+�����������+�%

G szq:cmm;�����������������J�����+�J$�����������+���������+���� ���������

�������� ��+����������+��+�����>��+�����������������

�����

�&�� �������

5�6��(�)�

�&��

z1 J�� 0000008

z2 J$� 0000020

z3 J7 0000040

z4 J8 0000080

z5 J9 0000100

zq J��!�J$� 0000028

zt J��!�J$!�J7 0000068

zb J��!�J$�!�J8 00000A8

za J��!�J$�!�J7!�J8!�J9 00001E8

ze J$�!�J8 00000A0

zo J��!�J7!�J9 0000148

zc J��!�J$�!�J9 0000128

zm /������*� ��+�0��+����� /����������+

tx @!�J� 0010004

ty ?!�J� 0020004

t1 @!�?!�J� 0030004

t2 @!�?!�@?!�?J!�@$?$!�J� 03B0004

tz @!�?!�@J!�?J!�J� 0270004

tt @!�?!�@J!�@?!�@$?$!�?J!�J� 03F0004

t3 @!�?!�@J$!�?J$!�J� 5030004

t4 @!�@J!�@7!�@J$!�J� 4450004

t5 ?!�?J!�?7!�?J$!�J� 1A20004

t6 @?!�@$?$!�J@$?$!�J@?!�J� A180004

t7 @!�?!�@J!�@?!�@$?$!�?J!�@7!�?7!�?J$!�J@$?$!�@J$!�J@?!�J�

FFF0004

ta @!�?!�@J!�@?!�@$?$!�?J!�?J$!�@J$!�J� 53F0004

tm /������*� ��+�0��+����� /����������+

Page 144: Getting Started with VNMR 6.1C

�� -'>�����&�����

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

G sza:clm;�������������**�J�0��+�������������*����������+���� ���������

G szt:clm,szb:clm,szq:cmm;������������J��!�J$!���+�J7��������*����������+���� ��������!�����������J��!�J$�!���+�J8��������*����������+���� ��������!���+�*���*�������J�����+�J$�����������+���������+���� ���������

� ��7+����#����!������# ����)��� ��!

2�������������+������*��+�������������������������+����������������H����+��+I� ��*�0������0�=�����"��!������������������������������������ ��������0���������������0�������0���������������������������"�+�+��5����<���*�!�������0����������������J�!�J7!���+�J8����*����*+��0�J$���<�+��

2���**�����������������!� ������� ��������������������� ��*�� ��������*� ��+���� ������ ���0���1�+�0�����<�+� ���*�K�������L������������+������������� ��*�+��0�������2��*��� ��

2�� ������ ���������+�����������<���*�!����������� ���������+��0���������J���������������+������8��������������+�0���K�������������0��L���+������J8���+�J7���������������+������'���+�8!������ ��"�*�!���������� ��+�+�0��!���� ��0�"���������*�����$�K����������<�+� ���*���������L��2���������������+�0������������ ���������������������0����+�����+��2���!�������"���+�0�����<�+� ���*�������������������0�J�!�J7!���+�J8����00000C4��2������������������������<�+����<)�����)�K�������������D��"�*���L���;��0�szm00000C4����������+�+�����+��

�����<���*�������������*� ��+������+�%

G stm0A30004:clm;������������J�!�@�!�?�!�?J!�?7������*����������+���� ���������

G szm0000108:cmm;������������J�����+�J9��������+���������+���� ���������

2����;�����������������+������������+��+������0��+����� �����������!�������<�+� ���*� �+�������� ������+��+� ��*�0������0����*����+������������+� �*�������2��*���'��

2�����**����0� �+�������*�� �����*�������������� �������������� ��������0%

G l�������������0��������*� ;�������+��������5)3�K+����*�L�

G f�������������0��������5)3�������+��������*� ;�K�� ;0����+�5)3��������0���������"��*��*���������������!��������!���+����� ��������������L�

G f:0,90�������������0��������5)3������*��������������5)3��"�*����������0���5�**����0����������������� �����������+���������������5)3��������"���������0������+����������0�0��+����������� �����+���������������������+����������*��������������9������!���� �����0���������"�*���������������������������5)3�

G ry�K������������L����������������������

G rn�K�����������L�����������������������

G dx��������+�*���6����+��+��������� ��+����������*� ;�����*��0�����������������*� ;���*"����7����+�7$Z ���*�<���������������� ���������*��������������� ��������0�����������0��+�����*�����������������*���������)�����������!��������� ��������0���**�������������������*���)������*��0!������������0���**��� ������� �����*�����+���������dx��**����

�������� .�<�+� ���*���+�����������>�����

DC�

CD�

DC���

�D�

��

C�

�D

C���

C�

CD

C

D�

D�

D�

D�0

D�

D 0

D

D�

� � � � � � � � � � � � � � � � � � � � �

Page 145: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

������0����������������+�*�����+� ���������+������������������������������<�������0��)����������������+������0�dx!�������������������� �**���������������*� ;������������+��������+�*���� ��+��0*���

G tx������������<������������0���������6��� ��+���A� ��tx�������!����0�"������**��������������*���������������������+������0!�F�������dx�0�"���������*� ;�����*��0������"�*������**�������*�����������*� ���0�+��)��tx�����������!������������0���**���� ��+�����+�����������*����0���� ��������

G q��� �**������*0������M���������*���������������������������0��������D�� ;*���q�������� ;0����+���������������;�����������0���� ����*+���������������+����0��<�������������*��0�+���������������0������������+�������������wshim������� ����A�*�������������������������������+����**����0�����*������q�����<� ���+������������<��������M���������� ��������&�������������+�������**���q=�����"��!�����sz1�KJ����*�L���+�szq�KJ�!�J$L������������������ ��"�����*���*������������+��������**���q!�������������� ��"�����������+� �+�

�����+���������������+����������shimmethods���*������0�����<���+������� �����vi��2����� ����newshm���+�stdshm����"�+����������� ��"�������+����+������0�����������+���������������*�;�������*���<����*��!���� ����"���������� ��+���C�!�������<�������<����*����C������������������+�����$'� ���� ������

2�����**����0��<���*�������� ���*���������+�����+�����������+�%

G szq:cmm,rn,stz:cmm,ry,szq:cmm;������������J��!�J$���������+���������+���� ��������!�����������������!������@!�?!�@J!�?J!�J���������+���������+���� ��������!����������������!���+�����������J��!�J$���0�����������+���������+���� ��������������0�����

G d50,szq:cmm,d150,sza:cmm;��������������*���"������9��� ��+�����*���������0�J��!�J$�!���+�������������*���"������9��� ��+�����*���������0��**�J�0��+�������/�����+���������+���� ��������������0�����

G t60,szq:cmm,t240,sza:cmm;������������J��!�J$����������� ��+����<����!������������**�J�0��+��������������<��������8����������/�����+���������+���� ��������������0�����

G f,ry,t600,szq:cmm;�������������������������+�5)3������J��!�J$���������+���������+���� ��������������������������<�����K�����"��*��*��������� ������L�

G t60,sza:cmm,q,t30,sz1:cmm;�K�����wshim='f20'L�������������**�����������**�J�0��+��������������� ��+�!�����������J���&������"����$��5)3�!������J������7� �� ��+��

G sza:cmm,q,t30,szq:cmm;K�����wshim='f10'L�������������**�����������**�J�0��+������K����������������L���+����������������J�!�J$��������������� ��+���"������ 5)3��

=�����������)��� ��!

2������������������ ��"��&����������+�!����������& D������������+��!�+��������**����0%

�� A��������.)��+���*��

$� /������������������;�������������� ��� ������� ���������������0!�������������J��

��+�J$�0��+�����!���+���*� ���� ��������!��� �����,�W���

7� �*� ;���������������������������.)��+���*���������������&��������

Page 146: Getting Started with VNMR 6.1C

�� -'>�����&�����

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

&����� ���*����������������������������!����� �����*� ����+��������� ��������������0��+��������+���0����������������������� ���!�������� ��������������������������� �������������������5����������������������!����������H.)��3���*��!I���0����$�

)��+�����+!������� ��"��&����������+������*����*��������+��� ����*�����������������+��2��������� ��"��&����������+���������� �*��*�������*����0�"����������������*����������������������&����������+�������*���"���������� ���������+���������0��+��������+���+��������� ��+��������� �����+�����������C������*������+�������������*�����0����

3�,, �)���!�����)��� ��!

)��������**���������� �&����������+�!���������������wshim� �����*�������������� ��������0�� ��"�����wshim� ������ ��������������0!��������0�����������������+����� D��������!��� ��������0������ �� ���������������+�����������������+����� D��������!�������������� �����+�go!�ga!�au!�������� �������0�������������� �����+��

0���&�����1��������'��

G 5����������������*� ;���0��*!�����wshim����'n'!�'e'!�'g'!����'s'!������%

'n'���+� ���������������� ��������0������������+��6"��������wshim�������������"�*��!������������0���� �+������� ����+������������������method� ������� ��"���+��������0�����shim� �����+�

'e'���+� ������������� ��������0����+�������������<������������������+����� D���������

'g'���+� ������������������ ��������0���������������$�))�������+������*�����������0�����0���������������<��������!���**����0����� ���0���������*������0������������� �����*�� ���0����2�������������method�����0����+��2����"�*�������"��*��*����*������������������+�����������+����������go!�ga!����au� �����+������H>��+�����&����������0!I���0���� !������������������0��+������������0������������0�����������+�

's'���+� ������������� ��������0����+������*�����������0�����0���������������<��������!���**����0����� ���0�����������*������0������������� �����*�� ���0���

G 5����������������5)3!�������'f'����'fn'�Kn ����������0��L!������%

'f'���+� ������������� ��������0����+�����������������+���� �**� ���������� ��������������������������*���5)3��<���������K�����"��*��*������������������!���+����� ������L�

'fn'!�������n�����������0��!���+� ������������0����+�������������+���� �**� ���������"����n���5)3��5����<���*�!�wshim='f16'���**���������������� D�����0�5)3���!��1!�77!��� ��2���������+������*����*�"�������������+����$3��<����������K�������*������+�����������������!���+����� ������L�

0���&�%+19.

�� )��������� �������� ��"�����+��������������!����������������0�glide�����������������+��������� *� ;��0��������432.(�������������������������

$� �*� ;������!�,�

7� �����������<�����������+���*"����

8� )������&���.)�����*+!� *� ;����7(��

9� �*� ;������!�,�W�'��!�#�W�0 5�����

�� �*� ;����.��W�'�����

Page 147: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

���6�����#�)��� ��!

#� ;0����+�&����������� �����**�+������������������method���+����� �����+�shim��2��������� ���*������ ;0����+�&�������������+���������"�+������������ ������������������������������"����2������������������� ��������0�������+����+����0�������������*�� ���0���+����+���������*�"�*��������0���������D����+������������� �*�������*�!����� ���0���������*�����0��!���+�������<����������+�����+������������0��

G 5����"���0������0����������+�����������*������ �������������*��0�����**�����+���� �*����0��!�����*��z1z2��������0��������**������� ������

G )������*�����0�����0���"���!����������+�allzs��������������+������������������*���*�!���������<���������0����������������������������0��2���������+�������������J�!�J$!���+�J8!������J�!�J$!���+�J7!���+�����**��J����+�J$��

2�������+��+����������������stdpar/h1���+�stdpar/c13���"��method��������z1z2��)���������+������������������0�����������*���� ������������������*� ������!�����*���� �**���������������������!� ���0��method����allzs�K����������������+�������������+�"����0L���+���"�������������������!��"��������0��������0���*���������������

0���&�����1��������'��

G 6�����method=file�shim!�������file��������������������*���������+��� �����shimmethods�K��0�!�method='z1z2'�shimL�

2���shimmethods�+��� ������� ����<�����&������ �����"�������"���� �������shimmethods�������������*�shimmethods�+��� ������&����������+�������������������+������*���*� ���+��������/vnmr/shimmethods�+��� ������2�������M�����"����*�������������� ��+�������������0�"��������+��)�����������+������������+������������M��+��� ����!����������+��� �����/vnmr/shimmethods�������� ��+�

������0������+�� ���������+������ ���������������0���0�������5����<���*�!��������0�method='lz12m'�shim shim����*+� ��������������+����������*��lz12m�KJ�!�J$��������0L����������+!������+� ���+�������� �+�!���� ������� ������!���+��������0�method='lz12m'�shim�method='nsm'�shim shim shim ���*+� ��������������������+����������+��� ����+������� ��+������+�������������

<��#�����)��� ��!

.��+�������������������+��"����� ��+��0������� ��������������"�*"�+�

�����1�2�-�������

2���hdwshim���������������*������� �����+��go!�ga!����au��������������+�����H���+����I������������0!���� �����+��������0���������������*������������+���������������������0����� ��"����*�����*������*�����D��� ������<� ����0%

G )��hdwshim='y'!��������0����� ��"����*��+����0�����������+�*������������*�����D��� ���

G )��hdwshim='p'!��������0����� ��"����*��+����0���������������������������*��!�+�����+������ ���0�����������*�"�*���**���+��������*���K��0��presat.cL��

������0�+����0������D�����+�*�����������������������*���� ������� ��"���+��������0�����hdwshiminit()����������������������+�*����������������������*����������0����������z1 ��������+����*���

)����������������hdwshimlist���� �����+!��������0������������� ����+�*�������������������������A�*��������**����0������������**���+%

z1!�z1c!�z2!�z2c!�x1!�y1

Page 148: Getting Started with VNMR 6.1C

�� -'>�����&�����

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

������0����+�������������+������z1!�z1c!�z2!�z2c!�x1!�y1!���0��+*�������������+��������� �������������������+����hdwshimlist!���+������������+������ ���������������"�*�����$���� ��+���2�� �����������Kz1!�z2!�x1!���+�y1L������� �����+�+������������������

0�1)/���'��5��������������D��������&�7��'�����

2���hdwshim���������������*��� �����+��go!�su!�au!��� ���������������+���������J� �������0����+������.��+������������0������������ �**��������+�+�+����0���������������������0�

�.�0/?�������*��?���2�%.�1�1�$�����6&��%&

.��+����������������0���������"��*��*��

0���&�����1��������'��

G 6�����hdwshim='y' su

A�������� ���!����+������������0�����������������<��� D���������+����0�����������+�*��!���+������������� D������������ ���*����

A��/�)2?���+��@�!������ �����+�������������+�����J���������0�

G 6�����hdwshim='p' su��

A�������� ���!����+������������0�����������������<��� D���������+����0���������������������������*��!���+������������� D������������ ���*�����

A��/�)2?���+��@�!������ �����+�+��������� ��"�����������0�

G 2��������������+������������0!�������hdwshim='n' su�

5��������! ����� ����������������� �

2�����**����0���00������������*+������������������������������0!����� ��**�������������������������*��0������������������ �����*�%

G ���"���$����)�����������$���(�/���J����J9!�������*��J�!�@!�?!�J@!�J?!���+�������*��J$@���+�J$?��2������� ������J1���+�J'�K��+����*���� �**��J�L������������**�����������������*�������������*��

G �$�)����'������$����)����&%���%%�������&)��,�(�/���J����J9!�������*��J�!�@!�?!�J@!�J?!���+�������*��J$@���+�J$?�

G �$�)����'��)����&%��$���)����&)��,�(�/���J!�J$!���+�������J7�

G �$�)����'��)����&%���%%�������&)��,�(�/���J����J8���+�������*��J9!�@!�?!�J@!�J?�

G �$�)�%&�'�����������&��(������������������������������+� �����0��+�*��������������������������*��0�����������<�!�����;�J���+�J$!���+������"����J9���+�J1����������C��������+����������������������������KJ���+�J$��������+�����������;�+����J9� ���0�����������������������$��� �����������L��&�����'����� ����� ������������++���+����<��*�0��+�������+� �+���������+������������*��+�������+����J9!������J1���+��������������J7����"�+��0�����������

2����"�����+����<��*�������KJ$!�J8!�J�!���+�J'L����� ���������������������������+��*�������*����K����0��������������L��&**����������������"�����+����<��*������� ������� ����������*�������*�����+��!������J$���+�J8�����0��������������9������*����*�"�*���+����"�!�J������0���������������������*����*�"�*!���+�J'�����0����������������7������*����*�"�*��2����"�����+����<��*���������**�������������������*+��<�� ����*������������*�����*���������8��������*��0��!������� �� �����������������**� �����*�����������*�����+��������� ��*������������"�*���

Page 149: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

#��������������������J8����������������������� �����+��*�������*�������������*���������������������8������A������������*��+��������0���������������������+��+�*�����������������������������+��*���������0��*��������0��������+��2��������� �������������+��*�������������� ����+���������� ��+�����������0���� ���� ������*����������� ��������������*��0�������������5�������*�����+���8����!������������"���������J9�J1������J��J'�J8�J$� ������������������+��*�������*���!�������������*����������+�����������+���������+� ����������D���������*���+����������� �����+��������"��������*�0��� ���0����������*��0��������

���!!����+���������!%,��@��!�����

������00���������������"��0���������*�%

G �&#�����$���)���)�������(�J!�J7!���+�J9����+������ ���������������"��

G �$&����������(��������:)&#������;��$���)����(�J$���+�J8����+������ ������ �������������"���2�������+������J���+�J7�������<�+���+������ ���*�<!�������������+������ ������*���*���������0���"���)����������������J���+�J7�����+��"���������"�������������*�������**�+���!��������������+��"�����0���"��������������������*������������������������0���*�������������*�!��*������������**����0� ���0���K�������0������*���������������������1���µ,�����*�������+������1��'���L%

1���µ,��������µ,%���"��J$�U9��3&����������+���"��J8�U$9��������1���µ,����9���µ,%���"��J$�U$�����������+�J8�U����������

2���J$���+�J8� ���0������ ;���**����������*��"�*���!�����������*���"�*����+����+������������+������)���������������������������� ���0��0�����*��0���������������;������������������J$���+�J8� ���� �����!�������+F������������� ���*�<�J��J7�J9������� ������������+�+�

.��( � ��������)�*�� ������5��#��

2���& D������������+��!��*��� �**�+����������� ��"��� D������������+������acqi����+��!����"�+�������� �����*�����!��� *�+��0%

G 2�����0�����*���������0������+�����

G &+F�����0�*� ;�

G �*� ���0������*������������ ��������0!���+��+F�����0������"�*������������*��������0������*� ��+�

G 3���*����0�����5)3������� ����������*������

G ����0��0�����������"�*���������� ��"�*��K�����"��*��*���������������!�����������+����� � ������������L�

G ������**��0������F� ������������������+��F� ����������*��K��*�������������� �����*����+���������������L�

2��*��$��*��������� �����+����+���������������� ����+��������������+���

�%����������5��#��

2���& D�������������������� �**���"��*��*�������������������������������������+��A��������!������������& D������������+��!�����������acqi� �����+�����������������+���

2���� �����**����������acqi� �����+!��������������������� ����0���+������ D��������=����� ����������acqi������+�������������6������0�acqi������+������������ ���������������0��HCannot�run�acqi!�acquisition�communication�not�active�I

Page 150: Getting Started with VNMR 6.1C

���� 0���&�����- 8������������'��

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

)���� ���!�acqi� ������0�"������������"�*������+��������������� ����������*�������������0�

- 8��#�����

/�+��������*� �� ������ ����������� ��������!�������������������!����& D�����������������������������������

.���"��!�������������+�����������������������������+����*��������+���������������**�����!���������������������� ����0���+!����������M��bootup��� ������������ ���0�+����;����acqi�������������0!��������������� ����0���+����+��������������)������+��������������& D��������!���+���������������������� ����0���+��������� ��������!�������acqi('standby')����+���*��������������

6������0�acqi�����������0������������ �����+�*���������������acqi����0������+�K������� D������������������0����L�+���*�������& D������������+��!����������5�0����71�

����( 2���H+�� ���� ��+I�& D������������+��!���� ��������**���������+����������� �����+�acqi�����������+!����*��0����<������)��������������*� �+��������& D�����������������������������

A���**����������< ���������� ���!������������������ D�����������+������ *� ;��������& D��������!��������+���+����������������

������� )����� ��"��& D���������������+����+�����������

�!!��# acqi<:$ret> A��������& D������������+��

acqi('par') ��+���*� ��+���������������acqi

acqi('disconnect') 3�� ���� �������acqi����0���

acqi('exit') 6<���acqi����0���

acqi('standby') �����acqi����0������+������������+�����+�

gf ������������������5)3:��� �����+���*��

goZ �������<������������� D��������

su ���������������<������������� D��������

Z�go<(<'acqi'><,'nocheck'><,'nosafe'><,'next'><,'sync'><,'wait'>)>

$���!���� dmgf VY�"YS &���*����"�*���+���*������5)3�+���������� ��������acqi

phfid V(7������7���+�0!Y�YS J������+���������0� ����������������np�5)3

���������� & D������������+���Kacqi����0���L

Page 151: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

A�������� �����������!������������������ D�����������+������ *� ;��������& D��������!���������"����+���*� ���������������!�����*������5�0����7'!���������

A���**��������!������acqi������*���+�������������+����������������!�������**��������*��������������& D������������+������ *� ;��0��������& D���������

)��acqi������ �����**��������+!�����& D��������������������������"��������

2���������������,A6������������� ��& D������������+�����*� ;��0������������� ����������acqi����+������+�����������+�����& D���������������������������������������������������*�

�����������������)�*�� ������� ��!

&��������� *� ;�����& D����������������������acqi� �����+!�����& D������������+��!����������5�0����71!����+���*���+����������0�����+������������������+���*����2���������*����+���������"���������������������*� ��+���� *� ;��0����������*����������������%

)����������� �����*����+�������������**�+!�����& D������������+����*��� ������������&��,6�����������������**����0� ��� ��%

��6�����������������+� %,�

&��������;�� ��� ����������,A�4!�5)3!��� ����!���+�.)��+���*���!����� ������������������+��� ���0����+�������+� ���+�� ��������;���*� ���

2����;���� ��� �������+���*��!�����D�� ;���������������� �������������"������������ �������������������������� ��� ����������!������ *� ;��� �����������*������������������

2�������������0����� ��� �������������%

�,A6� �����������& D������������������������������������������������2������� �����+�acqi('disconnect')�����D��"�*������� *� ;��0������,A6���������)��go����su��������+�����������������+��!�acqi�+�� ���� �����+�����������������������!���+���������� �����+����������+�������������

,A�4� A���������,A�4�+���*���K+�� ����+������0���9�L�

5)3� A���������5)3�+���*���K+�� ����+������0���99L��5��������5)3�+���*��!����� �����*� �������� �����+���*���K+�� ����+������0�����L

.)�� A���������.)��+���*���K+�� ����+������0����$L�

,&>6� >�����������*��0���0����� �����+����2������0�����������*�������!������<���*�!�������������0����*��0�����0������������������0�������������+��������+���������"������� ������2��������������������+��+���C��0����� �����+��!� *� ;������&,,��������K���� ������������&,,��������������������*� ���������,&>6�����������������,&>6�������������*� ��+L�

������� 2��������������F� �����!�������������������*������*��*��+���!���������������������*���+���������&���������*����������+!��**�������������+���*���+��0����

�F� �� 2�������������F� ��������+��*���+������������F� ����������*������������������&������������!��������������+��������!���+�������*��)��������������+�K����������*�����������&�������������*� ��+L�������� ��������0�

���������� &����"����+�& D������������+��

Page 152: Getting Started with VNMR 6.1C

���� 0���&�����- 8������������'��

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

�� ��"������������ �������������������������������

$� �*� ;����������%������������������ � *�������0���**�������*�� ��� ���

2��������������������������+��������0�*�������%

�� ��"������������ �������������������������������

$� .�*+�+����������$����������������&���������������������������������������� ��� ����"��*��*��

7� ��������������*+�+����������0�����������������&������������ ���������������+��00�+�������+������������!��� ����*� ������������������0�*�0���+����������� ��� ������+�����������0�*�0���+!���*�����������0�����������?���� ��� �������*� ��+���+�����������������+����������

��������$���!�������,��

)�� ���0���������+�����*� ;!�����!�0���!���+������������������������,A�4!�5)3!��� ����!���+�.)��+���*���!���������"�*���������������+����������*����� *� ;��0������,A6���������)������ ��������<���������������������������load��������'y'!����������"�*�������������������+����������<���������

.���"��!���� ���0������lockpower���+�lockgain�������+���������K��0�!��������0�lockpower=lockpower-10L!�����& D������������+���+��������*������������ ���0�����������+�� ���� ��+����������<���+��2��0�����������"�*��������������& D������������+��!���������������su������+� *� ;��������& D���������������������

)�� ���0������lockpower���+�lockgain�������+����*���������& D������������+��!�����������������*������������������ ������������ *� ;�+!�����acqi����0�������+���**���������+�*� ;���������������������� D��������� �������!����������������0�lockpower=10 su!������ *� ;��0�����0�������������������lockpower��������������acqi��2���������+����+�����������load�����������

����� ���0��������+���*���������+���������+��� �������K���� ��**�����5)3������*��0�+�*�����������+L!�����������������������������"���2������ �����������������������*��������������������*��0�����"�������������*�����������������������0��������������0���������5����������������+������"�����0���������*��������������������������!����������������<����+�����������0����� �����+��!��������� ��+�

2�8�+� %,�

2���,A�4�+���*���������������������B0<����������� *� ;�+����������& D������������+����5�0����7 ������������� �*�,A�4�+���*����

&�����������������,A�4�+���*�����������������������*���*�+��,A6!�5)3!�.)�!���+�,&>6E�������������������+�� ����+����"���#�*��������������������������)�!�,A�4!���+�K�������**�L�&��,6������%

G �)�����������*���������0�������+����

G ,A�4������*� ;�������!���!���������K���������"��*��*����*�����/�)2?���+��@���������L���*� ���0������ ����������+���������*��&���*� ;!���� �����+�� ����+������0���77�

G &��,6� �����*����������0���+��F� ���0�����*����������� �����*����+�������������**�+��2�������������+�� ����+����"��

Page 153: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

2��� �����*����������������+�������������*� ;���0��*���+!���*�������!����� ������������������*� ;!�����!���+�����"�����*��������������K�2�����������+���*���+���*���������vttype�������������������L����*���������+�����+�������������� ��+������%

G ,A�463����+���*���+����0��������*� ;�+!��A2�,A�463������**������������0�*���+!���+�,A�4�A55������+����*� ;���������

G �)�%�R�K������R�������� ����������������!������<���*�!��)�%��9L����+���*���+����0���������������0������0�*���+�K���������.C������������D�����+�"�*��L!��)��R������**������������0�*���+!���+��)�%�A55������+�����������������������

G �2%�R�K������R�������� ����������������������°�L����+���*���+����0���������2������0�*���+�K������������������������9�°�������������D�����+�"�*��L!��2%�R������**�������������������������������0�*���+!���+��2%�A55������+�����2��������

2���*������� ������������,A�4�+���*������+��� �������� �����*������ ���0��0�����"�*�����������*� ;������������z0!�lockpower!�lockgain!�lockphase!���+�spin�K�������*��������������+����� ������L��2��� �������"�*�������� ���������������+���*���+���������������+�������*�+�� �����*�K������C����*���������������*�+���������������������������*��������"�*�������������������L��2���"�*�������������������� �����**�+���������*�+�� �����*� �������*����+����+��00��0����������� ������� ����������*�+�� �����*����������*��������������������������*+�+�����

)��C�������� ��"�!������acqi���������lockfreq��*�+��:�������������������+����������0���C���*�+��:��������������2������0�����±$����.C��#�����������*���**�+����.C!���+��**�������*� ;����D��� ����������+����+������ �������������.C!�8�.C!����.C!���+��8�.C��5��+�����*� ;����

���������� ,A�4�3���*������+���Kacqi����0���L

Page 154: Getting Started with VNMR 6.1C

���� 0���&�����- 8������������'��

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

�<� �*����������������������������*+����+��0�*� ;�����0�C���.���"��!���������� ���!�����0����*�������������*����������*� ;����D��� ����������<�����*��$�7�.C!���� ���0����������*� ;����D��� ������.C�����"���$�.C���0������� ���0���������D��� ��������������*� ;� �� �����������������

&*�������"�*�!�����"�*�������� ������������ ������ ���0�+���� *� ;��0������������������������;�+�(�U!�(8U!�(��U!���+�(�8U�K����������� ������!�lockgain���*��������(��U����������+���� �����*�������������!���!�$�!����7�L��6� �� *� ;������������%�����������������������������������������"�(�������"�*��������=��� �� *� ;������������$�����������������������"�*����������5����<���*�!�����++��8������������������lockpower!���"������������ ������������������(��U�����������������������#�����$�����+� *� ;�������0������������������ �����<�!���"�������������������(�U��������������������������+� *� ;�����*�������������� ��

� ����,��6��*����3��#�2��6��� ������

)������������+�&��,���������� ���!����� ������+�����*� ;���0��*����������� ���������0������������z0������������������*� ;����D��� ���)��������������*� ;����D��� �!������*�����������0���������� ���0���*"�������+�*�����+F���������������*� ;�����������*+������D����+�

2�� ������z0!����������� ��"����z0=���� ������*� ;����D��� �!����������+�� ��"����z0��)��z0������� ��"�!��������������������������*� ;����D��� ��������+�����*� ;���0��*��)��z0����� ��"�!�����������������z0��

2��� ��"����z0!�������z0='y'=����+�� ��"����z0!�������z0='n'�

*6������������

A�������� ��������������*�!�������0*���*����������!�lkof!�����������++�+������� ;� ���0����������*� ;����D��� ������*���0������ ���0������������*"���!���+������� ���0��� ����+����������0����+������0��2��� �������*� ;����D��� ���������������������������0*���*�����������lockfreq���+�lkof��2�������������lockfreq���������.C��2�������������lkof�����.C=����*�0�������sfrq���+�tof!����dfrq���+�dof��lkof����� ������� �����������������������%�����*� ;�������� ����*����+�acqi������������� ��������

������������acqi�+�� ���� ����������<��������� ���*����!����� ���0���lkof�������*� ����������*� ;����D��� ��������� ����*�!����z0������� ��"��

� ���� ������������2��6�3��*����

A����*�������� ������+��������������+����������������!�����*� ;����D��� �� �������������������sethw� �����+��2����������*� ;����+����!������������**����0� �����+%

sethw('lockfreq', <lockfreq value>)

2�����������������*� ;����D��� �����������0�����C��

#�������������go!�lock!�shim!�su!���+���*���+� �����+������������*� ;����D��� ��������� ����*��������� �������"�*����������*� ;���D������������A�������� ��������������*�!������"�*��������������������"�*������lkof!��������������������<�����

��!%,��2��6���

6����*�����0�*� ;�����0�����*����������*�*� ;��0����������,A�4�+���*����2���*��������� �������������� ���*����+������������������ *��������+���������������� �����*+�����������*� ;����D��� ����������������������� ��+!�����*��������*+�����*���K������������������

Page 155: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�����!�+����+��0��������*� ;�0������+�*� ;������L��2����������������� �!�����0����������������������������"����������*�����5�0����8����������������� ���0������������+���� �������0��+���� ��

2�����**����0���� �+�����������+��0�*� ;������**��������� �*%

�� ��;�������������*������������+���+������+�������*���������0���*����������������D����+�

$� )������,A�4���������������������������+��!� *� ;����������������

7� /���0������*�+�� �����*!�(�U!�(8U!�(��U!���+�(�8U��������!�����������0�"�*����+��� �*�!���������*� ;��������+�*� ;0���!���+�*��;�����������������+�*�"������������������0��*�

2���� ���*�"�*������+�+�����*� ;��������+�*� ;0����+����+����������� �� �����������������+��������+���*"���!�������������������+��������+���*"���E��������������+���������������������*� �*�E��+�������*�<������������������+����������&������������!�+������������� �� ����+�������������C��0���������+�0���=�F����*��;��������������"��

8� )��������������������"��K��������F���������L!� *� ;��������(��U������������J������*������+�� �����*����"����������

9� )������;�������� �� �����������������*� ;���*"���������0�!�����0������������9�O!������+��������*� ;��������

)������*� ;����������������0�!�����+����������� *����� ����H��������+!I�������0��*��� �**�����K0����+������+�������� ;���L!���+�������+���� �*����������*����*� ;��2��� ���� ������������*� ;����������+���� �*�����+��������!�������������*���*������������������� ������������������*����������+�������������*"�����

�� &+F����J������*�������0��*� ���0�����������������"����������������**���*���*�����)��������*"������� �� �������+!�����*�������������������"������������� ������������*� ;� ��+��������������� ��+�

1� )������,A�4�����!� *� ;���������������

2�����0��*�����*+���"�������+�*��;�*�;���������������� ��+��0�������5�0����8���)������*� ;���0��*�+���*������+�����������������������������������������0��*��*�����+������+!��� ���� ��*� ;��������������������*�� ������2���+F���������!���������.)��+���*����� ������������� ��������������������������������*�;����+� �������������+���*��������������+F����������*� ��C�:���:0�:������������.)��������������.)��+���*���

���������� 5��+��0�,� ;

B��')�B�7�0)

Page 156: Getting Started with VNMR 6.1C

���� 0���&�����- 8������������'��

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

3=+G�%�����!����!!����5��#��

2���5)3:�� �����+���*��������������������������5)3����������� *� ;�+����������& D������������+�����������"�+����������*������5)3��������0��2�����*����5)3��������0����+���������������5�0����8����+�������*��$�5)3��������0����+�����������������5�0����8$���*� ;��0����������*���������*��$����������������������������+���*�����00*����������������������*����

��*��$�5)3��������0���������"��*��*������@�����/�)2?����������������"����������������+���������7������5)5A��)������*��������"��*��*��������� ������!��������!�����������������������

#��������*� ���0�����5)3:�� �����+���*��!�����<������������������������������������&����<�������������� ���������+��)�����������+������*��+���������*��<��������!������������*������������+��6������0������� ���gf�������������������<�������������+���*����������acqi����0��������+�����������������+����� D�������������������<����������/���0�gf����"����� �������� D����������"����������� �����0!��� ���������� �����*���+������������� ���0���

2��� �����+�go('acqi')� ���������+�������+����gf�������������� �����+�+��)������0�gf���� �����*������ D������������+���!����������������alock���+�wshim�����+����*�+!�load�����������'n'��2���"�*������nt����������*�"���=������<��������� �����������+�������*������*�����*��"������5)3:��� �����+���*����2��� �������"�*�������lockpower!�lockgain!���+�lockphase�������������������acqi��������+��&���0����Kgain='n'L� ���������+!���������*����+���������������� ���������������5)3�

,19�������&����'���@��*���A

5�0����8�������������� �*���*����5)3:�� �����+���*����)������������0�5)3:�� �����+���*��!�����5)3���������"�+������0����� �����+���������� �������������+���*���

&���������������5)3�+���*�����������������������E�,A6!�,A�4!�.)�!���+�,&>6��2������������������+�� ����+������0���9���

#�*����������������!��������*���!�������������*���*�+������+�2�$���2��������������+F������������������������������&3�����������+���*���+=������<���*�!��8P���������������8������������������&3����;����**�� �*���������+���*����

���������� A�����0���*����5)3:�� �����3���*������+���Kacqi����0���L

Page 157: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

��������� ��������������������� ��� ���,�*���+��������%��2���*���*�������� ������*��� ��"��+���*��������0�*�0���+���*� ���0��������%�������������� ���0�������5)3:�� �����+���*������+���*���������� �������������5)3�K+�� ����+������0�����L�

2��������0�����������&,,:,&>6������������������*���������������**��������������� ������������*������+���*��$�5)3��������0��������0��������5)3����+�� ����+������0������

#�*�����������������������00*����������K������������.#����+�(��2�A������5�0����8�L��KA������)�A�&�������!���������0����������������������!�����������**����0������ �����H��*����)������ ��IL��2��� ������*����*� ��+� ��� �����+���*���+��2�����00*��������������������*�����*��������������������� ��� �����0*����+�����+%

G ��0*���������+���*��������*����� D����+�5)3��&���**�����<���+� ���������&3��*�����!���+�������������**���*�������+� ��������C�����������������&3���)������+���*������+����� �*�+!�����&3��*����������+� ���+������������+�*������������+���*���

G ��%%�2��������+���*�������������+�5)3�

2�����00*������������������*���*�����*�����������������(��2���+�>��+�A�����*� ;��0������������������*�������������������00*�������+���*������0��+�*������"��*����0�����5)3�+���*����2���0��+�*������������"�+�+���������+�������������0��������� ������ ���0��0�����������

��*����1������ �

A�������� �����������!����������0������������0*�:����+���+�>��+����� �������������������00*������ ���E�����0��*�&"0����� �����������0������������0*�:����+����� �!���+������������� *������ �����������0����������>��+����� ��

����������0��*�&"0����� ����������+���!�������*�����D��� ��������*� ;��C��KbsL���������������������������0�+����������������� ��"�����0�����������0��*�&"0���������+����!������������������������2�� ���0�����������������0��*�&"0�����������!� ���0������bs�������������+�����gf������+��������� �+���

��������� ��*��$�5)3�������0�3���*��������*������Kacqi����0���L

Page 158: Getting Started with VNMR 6.1C

���� 0���&�����- 8������������'��

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

����������������� *������ ����������+���!�����+����*�������� � *��0���**���������+����Kcp='y'L���+���**� � *�������������"���bs�������������"�������0��*�&"0�������������������������� *��������!�����+����*�������� � *��0���**���������+�����Kcp='n'L�

5����������������0�������*���*������2�� ����+���+�!���� �� �����*�����+���*����������5)3�����������+����2�� ������������ ��� ��%

G �*� ;��0���������*����+� �� *�������������� ��������!�����+����*��

G �*� ;��0���������� � *�������*����������� ���������� ��K����*��L���+��������"�������� ��K�����**��L����������� ��� ������ ������+�

G �*� ;��0��������������;��� �������5)3��������������� �*���K����*��L���+���+������������"�����5)3�K�����**��L��2����*� �������� �������5)3!� *� ;�������������0����

��+������������**����0� ��� ��%

G �*� ;��0��������+������������5)3�+���*����������+�����+�!�����*�������*�������*�+�����������2���+���+���*�����+����*�����;�������� ������+���*���+=��������!�����"�*������np�������**�����0���������+����������� ��������������+�

G �*� ;��0�����������0*�� ��"���������������+��+�5)3�+���*�����+�!�����+����*��

G �*� ;��0��������+���*�� ��"�������������"�*����+���*���������������������*�����������5)3���"�*����

2���5)3�+���*������ �����**�+��������� D��������������������� ��"�����������gf����go('acqi')� �����+�����<� ���+���+����������� �����0������������lsfid!�phfid!���+!�����������!�dmgf��2���gf��� �������� �����+�+�������+����������0�go('acqi')�+��� �*���/���0�gf����"����� �������� D����������"����������� �����0!��� ���������� �����*���+������������� ���0�������0������� D���������������������� ����� ��"���������& D������������+��������������<� ���������gf����go('acqi')������0������������������� �����0�������������� ����� ��"�����acqi������������<� ���������acqi('par')��

2���*���������*��������5)3�+���*������+��� ����������������+������������� ���0��0��������������������%

G .)���������*� �������0������������������������K��������<L������������**���+F����+�K��0�!������<��*�C������������������5�0����8�L�

G <�����������00*���������0����+����������������+F������������������*� ���0�<7$� ���0��������� �������������(�U�(8U�(��U�(�8U����(7$U�(�$'U�(9�$U�($�8'U�

G ��������������*��+�������������0�"�����������*� ;�*�"�*�������� ���������������K"�*�+���*���������lockgain!�lockpower!���+�lockphase�������������������*����+L�

G ���������������*��+���������������"�*����������<����+��������������������� ���������������

#�*�������.)��������������������� �����*���6� ������� �������+F����+�������������������+���<�����"�*����������������������������0����������"�*�����*� ;��0���������������������$�����������������������"�*����������������������=� *� ;��0������������%�����������������"�(�������"�*������������������������

>�����**���������������!����!��������������*�����J�K�������0L������!���������������+���"������*����������������0������!���+���������*����*� ;�������������6� �������������������*+�����+F����+����0�"����<���������0���������+�H����I�K���������������+��L���+�*� ;�������������+F����+������������*��

2��������������������������+F��������*� ;��� ��"���0���������������������������5)3�+���*������+������������������+F�������������"���� ��"���0����

2����� ���gf����"�+����� ��"������������������������������ ��"��� D������������������gf����������*��+����*�������0���!��������0�*�����!���+��� ��"����������*���������!������wshim='n'���+ alock='n'!���+�����������acqi('par')���+�go('acqi')�������

Page 159: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

������������& D������������+��� *��������������5)3����������� *���+!�����������**���� ��������gf����go('acqi')������<� ���+�

2��� �*�� �������������0�acqi�������5)3�+���*�������������**����0%

�� ��;�������������"��0��+���������������� D�����0������ ����������ga�

$� ����������� ��������� �����*�!�������gf�

7� �*� ;������������� �����������**���+��������5)3��������

,19�������&����'����@��*��$A

��*��$�5)3��������0���������"��*��*������@�����/�)2?����������������"����������������+���������7������5)5A��)������*��������"��*��*��������� ��������������������������

��*��$����"�+����������0���������������5)3���������� ������5�0����8$�������5)3��������0���*� ��+�

2�����*��$��������������������������0�+����� ����+������������������������������������**�+������������*� ���0������������������������*�����������������+� ����������������"�*������������������������������5�������:��������������������*� ;��0��������������������������0������������������ �����������"�*���������������������!����*�� *� ;��0������������������++*�����������������00*�������5�������:��������������������������+� �������2�����C���������� ��������+������������������*� ��+���� *� ;��0�����*���������0�����������������������5�������:�������������������A��������0�������+��� ��������+������ ������ �����+�����+����0�������*��$HOME/.acqirc������"�*���� ����*����������+�+��� �*��������������*+�����������������+���*���+E�������+�������������������+���*��+�����������+�"�*���

�*� ����������������� *�+�+����B�� ;����������*+��0�����������;���+�������*�� *� ;��0���������������������������������������+�����+��������������3���0����������� ��������� ��+������+���*� ���������������2������������������*� ��+�����+���*���+���0�*�0���+��2�����������*� ��+��������������������C�+������B�� ;��������� ��"����+����������&������������������ *� ;�+�

&����������0�����������+�����+������+�����*���������*���5����!��������+��������"������� �����+���+���"�+!����+�� ����+����H6+����0�&�������������+�I���*����2������*� �������+����!���*� ���������+��������������!���+� *� ;������&��������

2�������������������������*����������� �����*�����*��**����������*��+!���"����+�+�*���������"�*�����������+���*�����*� ;�����*��������������������*��+!���"�!����+�*������������+���*�!���� *� ;�������0���������������*� ������*����������������������2���#���������������������������0�������������������"�*���������������������������� �������������������� *� ;�+����������*������������������K2���#�������������������0�"�� ���� ������*����������3������� ��������������������� ���0�+���*� �������#��������������������������������� ��+��������������"�*����L

2��������+���*���� ���������������5)3������� �����������*�����!�+����+��0��������������������*� ��+�������� �����*�����*��A��/�)2?�������+��*+����������!�����+���*���+�+���������0��*��"���0�+��"���nt������������

��*��$�1������ �

A�������� �����������!�����������������00*������ ���!��������� *����+��0��*�&"0!���<���������3������� ��������� ���&�����������*����������� �!�������**���������������� � *����+:�����0��*��"���0������+�����"�����������������

2���"���� �*�� �*����� �����**�+��������/����+�3��������������+���������C����*�� �*���������6<���+���+�������������������6� �� *� ;������������������������� ���0�������� �*��������� �����������

Page 160: Getting Started with VNMR 6.1C

���� 0���&�����- 8������������'��

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

2�����*!�)��0�����!���+�6�"�*���� ��� �����������**����������"����������� �����*��*���!���������D�����������������������������D�������������� �����*��

2������������������D��*������������������0!�����������+���������������+�������5)3���"�*���!����+���*���+��������B��*���������!����������5�0����8$�

2��������D��*������� �* �*���+����������������������5)3���"�*�����2���*��0������������������������������*������"�*���������������D��*���!����������*��� �*�+��������������*�����0����*� ;��0�����������*�C��������������������� �*��0��� ������ �������������<��"�*���+���*���+����������2���"���� �*�� �*���������0���������������� �**���+F����+����;��������������� ����"�*������"����

.'����&�-�������������'�

�*� ;��0�����6+�������������������*��$������ �����*�����*�+���*��������&�������������+�6+����!����������5�0����87��

&�����������)��$&�� �����������������������������������)������6� ���*������������������+�������C�������"�*�����������*� ��+�0���������������2����*������������<� ���+������+���������������������*������"�*�����2��������������*������������������M�������+������*� ��+��������6*����������*+��2���������+���������*���������������=�������������6*���������*+���*� ������ ��������� ������*������0� ���0�+�

�������������� �*����*�����!������������*� ������ ������� ��*�����������C�������*� ���0�����+�����+�����������������������*������������������K&���*� ��+� ��*� ������+���*� ��+������*� ���0�����0�������������������L�2�����������������������������������+����**������������������ ������������������������������0������D��*������+������ ��� ���������������0��������;������ ��"��0�� �� ���������

2������������������������*��������������+����**���������������*��+!���"�!���+�+�*��������������+���&������+�����������"�+����������� ���������+�

���������� &�������������+�6+���������*�Kacqi����0���L

Page 161: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�� �����9���*��

5�0����88�����������5)3:�� �����+���*������+�������������� �*���� �����+���*���K��*��L��2������ �����+���*��� ����*������"����+������*��$��2�����������+�������������������+���������������������������5)3�+���*����< ���������"���� �*�� �*��0��������������+��������*���*���!��������������������*���� ������K��0�!�<8�����������+���������*���*��+����8L����*���*������"��*��*���� *�+��<�!�<$!�<8!�<'!�<��!���+�<7$��2��������+�+��������������*� ������"���� �*�� �*��0���*���*�����

2������ �����+���*������ �����**�+���������++������*������������sp!�wp!�dmg!�rp!�lp!�rfl!�rfp!�vs!�vp!�sw!���+�fn��2��������*�������������� D�����������������������������+�� ����+���������5)3�+���*������*������������ �����+���*����5����������!��������5������������������������fn����0�������������84!���������+� �+�����84��

2���������������������������� �**����������acqi������acqi������������"�;�+��2���� ��������D����*����� ���0�+���+�������0�������acqi������gf����acqi('par')��2��������<� �*�����*�0�������������������5)3������������������������acqi�

=�����������$���!�����)#4� �!���

)�������� ��"�������������+F��������K)�&!������"��*��*���������������!��������!���+����� ������L!����������*�����D��� �����+�����go('acqi')����gf� ��������������������� �����ipulse����idelay!���������������������phfid����������������A2�/63!��������*���*�+��&�6,������������������0����������5)3:�� ���������������������**����0� ��� ��%

G ������*� �������������+F�����������������������������*��������*����������+F��������+���*���+����������*�������"��0�����5)3��2����*� ��+�������������������+F���!���*� ����+��������� ��� �����������.)��������&��������������������+���*��������������������+F�����0��������������������������2���� ��������������������������"�*��!� *� ;������������0���������������������������������������"�*����������������� �����=����+� ��������"�*��!� *� ;����������*�����������������������+��&+F�������������������+����������������+�� ����+����"����*���������� �������

G )�&���*� ��������� ��"�������������+F�������������� �����������������*�+���*������������"���*�+�� �����*���+�������� �������������5�0����89�������)�&���*� ��+�������*�+�� �����*����+�������� ������������������������������phfid����+���*����

6� ���*�+�� �����*���+�������� ������������������������������������*����K������0���*������ ���������*� ��+�"�*��L!���� �����"��������*���*�����+���������� ����������������+F����+��#�� *� ;��0�������0������������������������*���*!����������������������0��������������������� �������+F����+�������� ���������*�����D��� ���?��� �����*� ������������������������������������+������*�+�� �����*���+�������� �������������**��+F�����������*����*� ��+������������2�������!������������������"����������������+��������+F����+!����� ����������������"�� ��������*� ��+��������������������������+����2���

���������� �� ��������5)3:�� �����3���*������+���Kacqi����0���L

CLOSE

Page 162: Getting Started with VNMR 6.1C

���� 0���&�����- 8������������'��

��� ������� #���$ %�����&������'(���������

"�*�����������������������+���*���+�������D�������� ;��!��� �����[10.0]!����������0�����������������������

)��������*�����D��� ��������������������*���*��ipulse�����������!������<���*�!���+����������*���*�������"�+�+��������+���������ipulse�����������!������0*���*�+�� �����*��������������+� ���0��0�����"�*������������*�+�� �����*����� ����**���*��������*�������*���5��������������������������)�&�����������!������ �������-&�))����

���!!�����������3=+

2���������0�������������0��������5)3�������������+�����������������������������0��������*� ;��)��0�����*!������+F���������������+�����������������������������������5)3!���������������*���+���2�����������0*�� ���������������������������������0������ ������������0��*������0����������5)3�� ���������5)3�+���*���

#��������*��� ������������**���������+������*� ���0�������������������!������nt��������1���+�����d1Uat���������<�����*�����!��������������� ��5)3������0��+���0��*��������������������0�����0���+���������������������+���������"�+��������df�+���*����2����������D������+F�����������pw��A� �����������������+!�������gf���+�0��������������� ��"��5)3�+���*�����*� ����*���������*��$�5)3��������0�

���!!������������%�����!

&��������������0����+���������+���������������H ���� �I���� ����!�����������0�������������0����������� �������������������"������5���������������!��������� �����+�+����������**�������+�����*������������0*���������+��?��� ����������;���������������*�����+F��������������������+������"���������� ������������ �����

&���00����+���� �+���������������0����������**����0%

�� ���phfid=0�

$� 6�����go����� D���������� ��������� ���������+��<���+�����+���*�������� �������������;K�L�������������

7� 6�����gf�

8� )������& D������������+��!� *� ;��������� ��P�5)3�P��� ����

9� )��������� ������������������� ���� ��"���� �*����������!��+F��������"���� �*�� �*����*���*������������������+�+������������

�� )���������� ���� ����������D����+!� *� ;����)�&���������&�6,�����!�������+F��������+��������*�������"�������!���� ��������0�������� �����

�������� � �� �����3���*������+��������)�&�Kacqi����0���L

0�B�)

Page 163: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

1� �*� ;����������������&�6,�����!�����������������������*����!�����0�����*�������������������;��������������0� ���������

'� )����������*���������*� ;�+!��+F����z0����������������� �����

� )����������������;�� ���0����������+���*���K�� ������*�����0�sp:wpL!���;������ ���0��������������������0����� �����+�ds����+���*���������� �������+��*�����0�������D����+�������������

�����������"����������� �����+���*��!�������gf����acqi('par')�������+����� ���0����������& D������������+����2���� *� ;����,A�4�P�5)3��2�����<��+���*�������*+����*� ������ ���0���

�<=��+� %,�

2���.)��+���*��������������������.)������������ *� ;�+����������& D������������+����5�0����8�������������� �*�.)��+���*����2��������������������������������+���8�,A6!��B0<!�,�*!�,&>6L���+�������������+����������������*���������*�K.)�!�<�!�����!�������+F�������!������!�*� ;0���L������+�� ����+����"����*���

)����������������*����������)����+�.)�������%�

G �)�����������*���������0������������2�������������+�� ����+���������� ����� �"����0�����,A�4�+���*����

G .)�������������+������������0%������*���+����������������*��������0!���+��������+������������������� ��������0��6� �����+�� ����+���<��

�����*���'�

)�����������*���+�!���������<������� ������+���*���+������+F���������/���0�����.)������������*� ������������������+��+F�����0������"�*������� �"���+����H5)3:�� �����������0����+���!I���0���99��

���������� .)��3���*������+���Kacqi����0���L

Page 164: Getting Started with VNMR 6.1C

���� 0���&�����- 8������������'��

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

-������'�

)�������������+�!����������������������+��� ���0�������������������+�����������K���������5�0����81L%

G 2&2��������������������������0���� �����������������0�������!������������*���*� ���0������2A����*� ;��0����2A����**�����������������0��

G B/&,)2?��������*� ��������������0� �������E*�����K,L!���+����K�L!������0���K2LE��+�������+������+�K�����<���*�!�,�W��������������������*������������0���+���+��������+�����������0L��2�����*� ����������+�����������������������������*��������������H������0��������������&�������!I���0���8�����������������������

G &/2A.)���������*+��������*� �������������� ����������������� �������+F����+������ ������������������ *�+��J��J$!�J��J8!���+�&,,��A��)���&���*� ����������+�����������������������������*����!����� �����������!�������������0����������+����������������������0���� ����������+� �������!�����*���*��������2A����������������� �**�� ���0����� ;����2&2�

A�� ���*����������������0���+:���*� ;��0�����������!� *� ;������,A6��������������������������� ��������*��"������� D�����0�������������������������0����������������������<������������������������+������*�� D����������������*�+��0�����

������&��������+� 6��&��*

������������0��������*� ;!����������������������������������*� ;���0��*���������+F�������������������0���6� �������������0� �����*������ ������������0������� ��*������� �����*���0���� ����*+�0��+���������+���������+��� �������)������������������;�������������J�+��� ������������**�*��������"���� �*�+��� ��������������������+�����������������������������������0��������������*��������������������� �������J������������0���������+������ �**��

�� 2��������������0�� ��*+�������������������;�K��0�!������������������������ ���0�+L���+��������� �������������������0���������"�������������� ���*�������*����+�������������� �*���������������������0�����*+����������"�+����������shims�+��� �����������������0��������

2��������"������������0�!�������rts(file)!�������file��������������������*�� ��������0���������� ��*�������0��������������"�+��file� ���������������*��K��0�! rts('H1lshp')L!������� �� ������������������� ����������!������� �������������*���������K��0�!�rts('export/home/vnmr1/vnmrsys/shims/H1lshp')L��������������+�� �����������rts��������� ����&))������-)������%���(������+����*������������������������ ��������������*���������������*��������*�������

2���rts� �����+� ���������������������0�����������*������������������������������ ��������<�����������+����� load='y'������ �*�����������D�����*��+��0�������������������su� �����+�K�����������*���+� �����+�L�

$� 6�����su�

2���su� �����+�����������������������+����������� ������ �����������������!��� *�+��0����������������0������F����������"�+!�����+�����������������+����� D�������������!����������;���� ���0������������������0������0������& D������������+��!������������0�����������+�����*����� ���0���������������0��0����K����0�acqiL!�����������0��������������������0�K*�;� z1=200L���**���+����load='y' su!��������0��������������������������+�!��������0����������"��0�����*����������������0��

���������� &������+�����+���Kacqi����0���L

Page 165: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

7� ��;���������������������������*�!�������������������0�������� ���� ������+!���+��������������������*� ;�+����������+���������������� �����������*� ;���*"����

8� ��� ;����������*� ;���0��*����������������+��������,A�4�+���*������+����2�����0��*������������+�������� ���0������*� ;������������������K��+#L���+�����*� ;�*�"�*� ���0�������������������� ���������������*� ;�0��������� �������

9� )������.)��+���*������+��������������!� *� ;�����.)������������������& D������������+��������������

)������.)��+���*������+��!������� ���0�����U8������8��������������0�����J����)������*� ;�*�"�*�0������������������������!� ����������������+��� ���������*�����*�"�*������<���C�+�K������*��0����� ������!�����������+���0���������**L��

&�����������!����������������*�� �����������������"�*�������� *������� ���� �!����� ��� *� ;��������J�����+�J$��K���� ������ �����*������J����+�J$L�������������*�������0��*�*�"�*������<���C�+��

�� ����0������������0�����J$�����U8������8���+� ����������������+��� ���������*�����*�"�*������<���C�+�

1� &+F����J���������<���C�+�*� ;�*�"�*=�������+F����J$�������������������������������������"����� ��������*�����*� ;�*�"�*�0���������0�����)������*� ;�*�"�*��� �������������!�+� ������*� ;�0������+������ ������������+F����J�����+�J$���,� ;�����������+F����+������*� ���0�C�:���:0�:������������.)��������������������������������*� ���0��������������+�����������������.)�����+���

'� &+F����J����+�J$�K���������J� �����*�L���������������������*�����*� ;�*�"�*������<���C�+�

)������� ����!������ �� *�+��������������0=�����"��!�������������������� �������������������������J� �����*����+���������������������2������������������+����;����������������������������� �+�������"����00������2������!������������*��0�������0��J�!�J$!�J7!���+�J8��������"�*������*�����*� ;���0��*������<���C�+�����������**����+�������������0��*�����������+�0��+�+� ����+����*���.�� �!�������**����0���� �+���������00����+��������� ��+�*�"�*�����������0%

�� &�����J����+�J$���"��������+F����+�������<�����*� ;���0��*!�������+��������*� ;�*�"�*!��+F����J7��������+��� ����!��������U8!���+��������������C��J����+�J$�K�������"�*�L�����*�����*� ;���0��*�����������<����������������*�"�*��������*� ;���0��*��)������*� ;���0��*������0�����������������������K������������������������+���L!� �������� ���0��0�J7�������������+��� ������6"���� ���0�����J7�����������**���+����������C���������J����+�J$�����*�����*� ;�*�"�*�����������<�����

$� ������������������J8��2������!� ���0��J8��������+��� ����!������������C��J����+�J$��)������*� ;�*�"�*�+��������0����!� ���0��J8�����������������+��� �������+�������C��J����+�J$���������������*�������0�����������*��*� ;�*�"�*�����������+�

7� ����������������+�$��������"�*������*�������0�����������*��*� ;�*�"�*�����������+�

8� 2����������������������+�0�������0��������������������!��������������!���<���C��0�����*� ;�*�"�*������� �������2�������������+�0�������0���� ���0�������������������0���**�����*�����*� ;�*�"�*���������0�����������*���)��*� ;����*���!��� ����������*� ;�0����

9� 2���������������������+�������C��J����+�J$����+�� ����+����"�!�������������������������K��������������������L���+���������C����������������������*�������0�����*� ;�*�"�*�����������+�

5�������*������� �� ;!����� ������������������*�������������*��K�.�*7����+������� �����������.���+�+��<�������+���������C���������7�L���+��<����������*���������������;�� �������������������� *��������������0���*���� �!����� ��**����������*���������������99O���+�����O����

Page 166: Getting Started with VNMR 6.1C

���� ������&�0���&�����0*���E�������������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

��������*����;����0����&*����<�������������0�����������������0���+����+����������������((����(��7�������-&(�����������*�������������������������������������+��

.��� ���!!����� ���������,��� �!�����!�� ��!

2���/*���G������������������������<�������������+���0��+����� ���"������0��*�"�*��������*������0��������"���*��0������*��"�*�����K��0�!�������+�������L!����0������������������0���*������0��+����������������������������!���+�������"�+����������������������+� ��*����+�����*����������

/*���G�����������������0����+���������������� �������������+��**��������� �����������"��*��*����*� ������/*���G�������������������A�5)>����+��������������/*���G���������*��3���������������������+����2���/*���G�������������� ������ ���� ��+����������������$�������� ����*���������/�����-�����������0�������*���0�*������K�L�����+��2����� ���� ����������������+��)������������� ����<�����������!���������������������� ����*������*+����"����*������������+��!�����������<�����*+�����������+�

�������/ =�����,��� �!�� ��!� ��!�����1��������,,�#���!�����)�*�� ���������#��-�#������ ������� ��!���,���1� ��#�±��(((�+)������ �

<��#�������������

2����������������������<����8'� �����*��������"�+�� ������������8 � ��*������������������������������������������������ ��7'����7 ������0��+����������0�������+��6� ����������<��*������0��+������������+� �+�������*���0� ������������*�������*������������$�+��������� �����*�!���+��� �����������+��*�0��+�����!������������+��������� �����*�����������8'� �����*������<���������2���+��������������� �������������������**���+� �����*�������� ��0��+����������+��� �������� �����*���+���� �*������+�������+� �������������K����������0���*L�������*�����0*�������0��+������5����<���*�!�����+��������������� ���������������J$�0��+���������+F����+�������������J$�0��+��������+� �+�����������*������������������0��+�����!��� �����J�KXJ�L����J��

&��������� ����<����"�+�����"���������*� ���*�!����� �**���� �+�+�;�������� �����*����������0��+�������2���������� ����<��*������"�+����������������������������������0!�"�����0!���+��� �**��0��������7�����������������*�����+��;��6� ��������������0��+��������������� ��������+������ �����*�!�������� �� �����*���"��0������0�����±7$1�1�3&�� �������2�����**����0�0��+���������� �����**�+%

=����������'

2���������� ����<�K����5�0����8'L����������**�+���*���� �������+�������**����0� �����*�%

G 5�"��;�����������0��+���������0�������������*� ��+������00*������ ����

G 2����+���� �*���00*������ ���!��� ��*���*�+�?6:�A�

&<��*% J�!�J!�J$!�J7!�J8!�J9!�J�!�J1!�J'

�+��*% @!�J@!�J$@!�J7@!�J8@!�J9@

?!�J?!�J$?!�J7?!�J8?!�J9?

�$!�J�$!�J$�$!�J7�$!�J8�$�K�������$�X�@?L

$!�J$!�J$$!�J7$!�J8$�K������$�X�@$?$L

�7!�J�7!�J$�7!�J7�7�K�������7�X�@7L

7!�J7!�J$7!�J77�K������7�X�?7L

Page 167: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

%�����&������'(��������� ��� ������� #���$

G 6�0����������%��A36!�#&�4!�5),6!�,A&3!��)6�!�2A6!�3)52!���+��:5��&����**���+� ��������"���� ���������������0����������������������� ��"��

2����A36!�#&�4!���+�5),6�����������*� ���������������+�%

G �A36���+���**������������������ ����0�����������������+�����+���*���� ������������0�������00*������ ���������*� �� ����0����������������

G #&�4���+����;��������0��+����� �����*�� �����*�������0������;������)���������+�!�������00*������ ������*� �����;�����;�������0��+���������0������!���� ������+���*���+��������+���*���� �����+��� �*�����"������;�����

G 5),6���+��*�������������*��+�����!�"���!���������������� ��"���2A6]5),6���*��������������*� ��+����������00*������ �����2�������*��� ������������������+��������,A&3!��)6�!����2A6��������!������ ��"�*���)���+����*������������,A&3����2A6����������!�����/�]5),6���+�2A6]5),6���*���������������+���� �*��)������ ���0������������D����*����+����������<�����0�0��+�����3&��"�*���!�/�]5),6���������������

2���*��������������������0��!����� �����:�����0��+����� �����*�K�:5L�������!����� ��"��������������#&�4���+�����5),6���+���

5�*���$������0���7������"��*��*����������������0���/����� ����&�������������*���!���� �� ���������**�C����!���������������*���!���� �� �������� ��"��0�+������"�*�����5�*������������+������3A���������+���8��#��*�����+��;������+��"��� �����*�����������������������������������2������**� �"�������*����������0����+0��������������� ��+� �0��������������"�+����0����� �������������������*�����+��;������+��;������������������+�����0�3A�"�������9��������0�������������� �*�����������*�����**���� ����+���������+��;�������������<�����0��*�����+��;�� ��������+������0�����3A�diskcopy� �����+���������� �����������0�3A�"�������7�7������0���=������<���*�!������ diskcopy a: a:������������� �*����*�����+��"����� ����0���+�������+��"��&�

A������������*� ���*������������������A36���+���**�����������*� ;����������� ���������������)������������������� ��"���+!��**�;���!�������!���+���00*�� �����*����+����0�0�+�����*������A36!�#&�4!���+��)6������������������*�������*��������+��)������*���������*�����+����*��K��������L�����*� ;����������������� ����<���������A36���+���2��������������� �������+��������J������*�:J��+����*���������

&�����/*���G������������������**�+!�J��������� �����**�+�"�������& D������������+���������*�����������/*���G���������������� ����<��&**�������*� ;�����������Elockpower!�lockgain!���+�lockphaseE������� �����**�+������0������& D������������+����2���"�*������J�� ���0���������U79��� ������3&�������������9����.C���0����K������U8$�������������.C���0���L����������*� ;���*"���� ���0���������3�*7����� ������+���2��������������0��+�����������*������*��0��� �����**�+������0������& D������������+����

���������� /*���G���������������)������ ��������*����+�3���*��

-B*) @7�< ,��) �B7* /�)> ��B') *'�,� 0!,

����������

�)�

�B

������������

�)�

�B

+A"B�23(�C��<�

��6+(B�23(�C� ��

D ���!�E FINE

Page 168: Getting Started with VNMR 6.1C

���� ������&�0���&�����0*���E�������������

��� ������� #���$ %�����&������'(���������

.�������*�KJ�0��+����L����+� ��������<�����*��������>: �����*+�K���� �**�� O���������"�������0����C���������0�������������9������+���0��*��� �"������� �O��������8����L���+����� ��"���+���������������������������� ���������*��;�+����A<���+������������������������

���!!���

)�����������*�H �����I�+���*�����+�!��� �������0��+����������� ��������+�������� �����*��2��� ������ �����*����9��������������������"����������� ��������+��0������ �����*��&**�0��+�����3&�����"�������0�����±7$1�1=���;����������+������+���������0����**� ����������������������"��������� ���6� ���������0��+�����3&�����������+���� �*���+���*�0� �*���*�������5����<���*�!��� *� ;������+F�����������J$���"�������������������������0��!������J$� ������KJ$�L���+�J$��������"��0�������������������������+��� ������5����������!�J8!�J�!���+�J'��*�����"��������������������������+��� ��������J$��2����"�����+����<��*�������KJ$!�J8!�J�!���+�J'L�����F��;�����*� ;����*��0�!���++��� ���0���������+�=�������"�������������F��;�+� ����������� �**�����������+���J8!�J'!�J$!���+�J���

�������0��+���������*���!������*��������"���������"����+������� ��!��������0������+���0��+������ �����0�*�������� ������3&��������2�����**����0���00������������������+%

G J�%����� ��������*��K����������������L�

G J%������������*��K ���������%����� �����L�

G J$!�J7!�J8%����� �������������!���� ��"��������������

G J9!�J�!�J1!�J'%����� ��������*��

G �+��*������%����� �����!����������������*���< ����������@���+�?�

�����������������0��+���������+� �+�����������K����������0���*L�����������0������+�����F� ��"�*��0�������+�����������������������������������"������������)�������+F���������<��*�����!���������*+�������*����� �����J����������� ���0�����������0��+������K�����<���*�!�������� ���0��J8!������������C��J����������� ���0����J$L��)���++�����!�������������+������'�O�����������0������ ���� ��+������J8�����0����A<���+����������������������*�� ���� ��+������J$����������0�/*���G���������

=� ��,,��������3�� ��$��1�

������0��������������*� ��"��0�+�����*����������+���������*+�������0!�������������*��������������*������������*���������1:�$�.C�K��������L������+����������������������O �.�*7����� ������+��K&2���.�*�������������*�L��J���+�J$����� �**�� ���0�����������KJ���������+��������(1�������!�J$�������(8��������L!�����J7!�J8!�J9!�@!���+�?���**����+��+F���������2�����0������+�����+��*��������������� �**�� ��"��0�+�������������"�*��������������� ���+������������ ���� ��� �**����+�����*+�������������������+F����+������**��K��*��@!�?!�J@!�J?!���+�������*���$���+�$�����*+����+��+F�������L��&�����*����<���C�������������*� ;�*�"�*��������"���������������� ����� ���������

3,�%% �+� 6�� �

6"����/*���G����������*���������*+� �������'7����������*�����+��������$��������*����2������������*����� *�+��7 ������0�����*���K*.strL!�7 �+�"�+�����*���K*.divL!���0��+����� �����*� ����0����������*��K*.himL!�������� ��*��������� ����*��K*.resL!�������� ����0����������*��K*.cfgL!���+������������*���Kfile0.dac���+ file1.dacL� file1.dac������� ����������������"�*�������������.�*7�*�������������*�������������� �*����������2����$��������*������������������*���$�����7�Kfile#.dacL��

Page 169: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

&�"������������ ������������������*�����������+����������������A��K���0������*�����+���*��������L��)���������������*�����������0���������*�����+��;!������A��"�������������+�������+��)������ �����*��������������A��"����������������*.him!�*.res!���+�*.cfg����������*����)������&��� �����*��������������A��"����������������*.div���+ *.str���*����� �������������*��������������������������������������**��������+�������0����+����+����

2���readultra��� ������+�������������*�����������/*���G������������������������*�����+��;������������;�����������������K��0�!��������0�readultra(6)����+�������������*���L��6������0�readultra�����������0���������+���**�������������������*����#����������0�readultra!������*�����+��;�����<�� ��+�������������+����/pcfs��������������;���������5���+����*�!��������������+�� �����������readultra��������� ����&))������-)������%���(��

)������*���������"��������!�������������*������������ �����������������������*�����+��;������� �����������M������� �*����������*��� ���������������)��������"��������!��� ;����*�����+��;�������*�������0��+��+����2����� ;����������+��;��������+��������������/*���G�����������������**�+%��������������;����������� �������=������������������������������#� ;���+��;�� ����������*����+���������3A�����+� ������������0�����3A�diskcopy� �����+��

�������/ 8��%�,�%% �#� 6 ���� ���!�����!������#������+�����������#� 6�� � � ��%��1,�����#�!������!������ ��!����������,# �

����� ���0��0��*�����+��;�!������"��������**����0���� �+���%

�� �"������ ������������"�*���������������������$��"��*��*���������*���

$� ,��+������*�����

7� ���"������ ��������*��������������+��"����+�����+����*�������������������������*��������������+��"��� &��&��&������$��(&��&���&���$������%(��"&6�'$����$�������&�%�&��,�����$����#��

&��1,��������)�*�� ������5��#��

2��������� ������ �����**�+����������& D������������+���������+�������������������� ����<��2������*����������� �����*!�������������+����������������������� ����<����� ��"����������+����*� �����������/��������A�+��� ������������?6:�A���00*������ �������00*�������0�����+���*���$7$�26�)�&,��A36��������������� ��+���*���� ������2�00*������?6:�A����� ���������?6���������������*� �����������*���+���2���������� ����<�� �������**�+���*���$7$�26�)�&,��A36�6�>&>63��2����"����������������*���+�!������������+�����������+����������#*��;���������������������� ����<��

0������������ ��!�����#���

2����������������� �**��*������� ���������*���< ����������������� ���

)��)����2������������

/���������**����0���� �+�������������+��������/*���G���������������%

�� �"������ ������������"�*���������������������$��"��*��*���������*���

$� ,��+������*����

7� 2����������������0��*�0���+��� ;������� ����������������������������*������� ;�����������������������*��

Page 170: Getting Started with VNMR 6.1C

���$ %��'�����-����������&

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

)��)����2�����������

3��������**����0���� �+������������������������������ ;���%

�� ������������ ;������� ���������������������

2�������0��*�0�������������� ������*+�����������+����������*� ;�����+���������������*��������������������������������*������*+�+���*���������+�*�0������+�����0�����*�0����2����������������� ������������������������������*����;��������<�����*��������������3����0�����������!��**���0�����+� �����!��������+����"��������0������������������������� ����<!���������**��*�0���+�0�����������������������������**������������*���������+��*���*�����+��;�������������������*�����+��"��

������������������� ���*���!������������ ����<�+���*������"���*�������������0�����+� ����0�����������A������+�+����*����*�����������+�+����0��������

$� �������������*�D���������������������� ����<!��������H���I����+����0�0��������0�������������*� ;�

�����������0�������������*� ;�+����0�0��!������������������+�*�0�������"����*��+���*���+��������������������������*� ;�����+������������)�������%�(��,��&)������������������+�*�0���������������**����������

.��� @��#�����)��� ��!!���

>��+����������������0����"�+�������+!��������� ��+F�����������������������������������)�������"������*���*���������������0����+��������!��*��������0���������������"����*������������������0��2��� �*�0��+����������������0�����������*���������������!���+��**�����������+��������������� *� ;��������������������

>��+����������������0�������*������+�������������������<��*�0��+������KJ�0��+�����L��5���������*�0��+������������0!����5>����*��������+������������� �����+�+����������������0��+������� �"������������� ���.���"��!�������5>����*��������+����������������"��*��*�!�0��+����������������0� ��������������+�����0�������������*�0��+�����KJ������������������������ ��*L��5��������+����*�������������������������������*�0��+����!���������������� �����H.�������*�>��+�����2���I�������� �������H�5>���+�*���A��������I�������������*����������3���4����� ���

>��+����������������0������+�����������������0��������+��"��������������*��������+���������"�*�������+���*"������5����D����������*��!������������������"�+������� �������0��*������������0��5���+��������+���*"����!�0��+������������0� ��������������+������������������ �����+�����������0��*��3���������0��+������������0����������*��������������*�������������*� ;���*"������������0*�!������0�������� �!���� ���� *�+���������F�����������*"������������������������������������

�������0��+����������������0�������5>�����"��*��*������**��������� ����0���+���������5>�� ��������3���������0��+������������0������*���"��*��*����������� ���!�/�)2?����!�����������!���+�������������������+������������ ������!�/�)2?!���+��@���������!��� �����*� ;�����*����+���*+� �����*���������D����+������������+���������0��+�����

Page 171: Getting Started with VNMR 6.1C

���������� ��������&��������.;��������

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�������0��&����+�������0��+������*�����D����+������������+���������0��+������������0�������� ����0����������D���������������������C�+����2��*��$��

5��������������������������������0������+�������0�0��+������������0!����������� �����H>��+�����������0I�������� �������H�5>���+�*���A��������I�������������*����������3���4����� ���

������� >��+���������&"��*���*���

�,���) ��������$�)��#��"����,

������ ���!�/�)2?���� �.����$.�������5>����.�������*�

����������!�������� �.����$.�������5>����.�������*�

/�)2?!��@�!����� ������ �.�������5>���*�

���&�������+�+���������0��+������������0���+�*����D����+�����+���������0��+������������0�������5>������������*����&�������+�*�D��+�:��*�+���������� �����**�����+���������+�+���������0��+������������0���+�*����D����+�����+���������0��+������������0�

Page 172: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ������� #���$ %�����&������'(���������

��������<� )�*�������+���

� �������������� ������%

G 1���H�����0�5��D��� ���*���+ ����������!I��������0��

G 1�$�H�����0���*����D��� ���*���+ ����������!I���0���17�

G 1�7�H�������0���+�6+����0�6<���������2�<��5�*��!I���0���'9�

G 1�8�H���������0�& D��������!I���0���'��

G 1�9�H&��*���0�3�0���*�5�*�����0!I���0��� 1�

��� ��������3��*���� 7��,���# $���!���� �

���������� ��������� ����0���+������������������������<��������!���+�������*������*� �!��������0!�*� ;�+!���+�������+!������������+�������*� ����������������� D�����+�����2����������������� ��������*� ���0�������������2�������������������D��� ����*���+����� �E������0����������������+���C������������ ���*����+����2����� ��+����������*�����D��� ����*���+����� ���2�����**����0��� ����� �"�������D��� ����*���+���������������*�����D��� ����*���+�����+�� ����+����H�����0���*����D��� ���*���+ ����������!I���0���17�

3��*���� ��������

2��*��$$�*��������D��� ����*���+��������������+���*���+� �����+���

������0����������"�������8�7!�������*� �����������D��� �����������������"�� �����*���+�����+� ���*�������+����+��������*����������*����"����������������2����� ����������������0����D��� ���������������**����������=������<���*�!��������0�tn='H1'���*� �����������������D��� ���#���������*����"�������!����������*��+����sfrq�����0����������"�*����������.����D��� ����;������������ *�������*����������+����� D���������������D�����+����������go� �����+!�����"�*������sfrq����� ������+����������������������������*� ;�KlockfreqL!���*"���!���+��������**��������KtofL����0����������������*����D��� ���

)����������� ����!������tn='H1'����������+!������.����D��� ������0������;�������������� *�������*�!��������������setfrq� �����+���� �**�+����������������setfrq�����+����*�� ���������������D��� ��������������*�����������������������������*� ;!���*"���!���+����**����������+����������������*�������������������sfrq��2�������*�����������������+����� D��������������D�����+������go!�������������+F���������������"�*������sfrq�������+�+��)�����������+�!�����"�*������sfrq�K��+�dfrq!�dfrq2!�dfrq3!�dfrq4�����+� ���*���L���������<� �����D��� ���������**�������+��2����������������������������� ������������������D��� ��������+�*�������������+!���������������*�!����� �* �*�������������� �*��!���� ����������+��������"�*������sfrq!������<� ���&*��!�+�����������������+� �������� �**�+�*������������������!���+����� ���� �����D��� �������� ������+����������������+���**����;����E�����������*���������0��+�*������������� �� ��

Page 173: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

)�������������*������lockfreq���������������*� ;����D��� ��������� ���� �*�������+�����������"�������0��*���A������������!��������!������� ���!�/�)2?�������+����� ��������������!�lockfreq��������������������� ���*�+������������D��� ����������+�� �����������lockfreq��������� ����&))������-)������%���(������"�*�����A��/�)2?���+��@��7���!�8���!���+�9����.C��������!�����*� ;�����������������D�����+���������������������������*����� �����2��������� �����������+�����+F��������*� ;����D��� ������������*+�+��������������������0������������*+�������� �����*�K����z0����������L��2����������0�"�*���������������� ����"�����%�$����.C������������� �**�������������$��!�7����.C������$��=�8����.C�������89!�9����.C������81 !���+������.C�����97�'89�K*� ;���������C��L��&���������*+�+� ���!�������������������������+������+����*���������*� ;����D��� ���/�+��������*!�+������+������������!�������**��������+���� ���0�������"�*���

2���rfband�����������K����**����������< ��������������!��������!���+����� ������L���+� ���������������+�������������� �� �����*%�'h'���+� �����������0��������+������� �����*!�'l'���+� ���������*���������+!���+�'c'�K���� �* �*���+L���+� ��������������������� �* �*��������� ���� �����*���������+!�����+����������*� ��+����D��� ���2���"�*������rfband����������������������0�K��0�!�rfband='hlc'L���������������� �����*�+��������+�������������� ���� ���!������� ��+� �����*���������� ��+� ���� ���!��� �

2�������������rfchannel�����"��*��*�����0�"���"����+�� �����*�����"���������*� ����������� �����*���������������+�� �����������rfchannel��������� ����&))������-)������%���(������+����*��

0��� !��������#�+����%,���$� ��������

2���movetof<(frequency)>��� �����"������������������������������������tof������������� ������� ��������������!�+�����+����cr!��� ��������� ���������������� ������)��

������ & D���������5��D��� ���*���+�������+����+�����������

�!!��# centersw ��"�� ��������� ������������ ����

minsw �+� ����� ���*���+����������������D����+

movesw<(width)> ��"����� ���*����+���� ��+��0���� ������

movetof<(frequency)> ��"��������������������

sd,sd2,sd3 ���+� ���*������D��� ����� ��������������

sda sd2a sd3a ���+� ���*������D��� �������

setfrq<(channel)> ������D��� �������� �����*�

setsw(downfieldppm,upfieldppm) ������ ���*���+��

$���!���� cr�V������S �������� ��������������

delta�V������!����.CS 3������� ������������D��� �� ������

dfrq!�dfrq2!�dfrq3,dfrq4�V������!�����.CS 2��������������D��� �����+� ���*��

dn!�dn2!�dn3,dn4 V�����0S �� *�������+� ���*��

dof!�dof2!�dof3,dof4�V������!����.CS 5��D��� �������������+� ���*��

lockfreq�VY�Y!���������!�����.CS ,� ;����D��� �

rfband�V�����0�����0�Y�Y!�Y*Y!�Y YS 5����+�������

rfchannel�V�����0�����0�Y�Y!�Y$Y!�Y7Y!�Y8YS )�+����+���� �����*������� �����*���*� ����

sfrq�V������!�����.CS 2��������������D��� ����������"���� *���

solvent�V�����0����:"���:��*"����S ,� ;���*"���

sw�V������!����.CS �� ���*���+��

tn�V�����0����:"���:�� ���*��S �� *�������������"�������������

tof�V������!����.CS 5��D��� ������������������"�������������

Page 174: Getting Started with VNMR 6.1C

<�$ �����&���*����8��� ���*���' ����������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

������� ��0��������+!�movetof���������������������� ��0��)����������������� �����������������������D��� ��+��� �*�!�����������������0����� ��������������!���������"�*�����������frequency���0�������2�������"�+����� ��"������������+������"��0��������������������D��� �������+������ ���������� ���*����+���

2����� ���sd����������������+� ���*����������dof�����*� ������������+� ���*���������� ������������������������� ���������*��*�!�sd2������dof2!���+�sd3������dof3!����������� ��+���+�����+�+� ���*�����2������� ����������������� *�������������E����+� ���*����� *����Kdn!�dn2!����dn3L����������������tn�

2������������������+� ���*����������"�*���!����������� ���sda���������������+� ���*��!������� ���sd2a����������� ��+�+� ���*��!���+������� ���sd3a�������������+�+� ���*����2������� �����*���������������� *��������������

�%�����,�5��#��

�� ���*����+�����C������+F����+������������� ���*���+�������������sw�K����5�0����8 L��2������ ���*���+���+������������������*��0����������+���!���� ��� �����������������2*sw�������������� ��+�K� ���**��sw� ���*�<�������������� ��+L��2�������*��0����������*���������������+!��������+��� �*��������������"�����K;����������������������������H+��**�����IL�

��������� �������+���*���+!������� ���movesw<(width)> ��������������������cr���+�delta���� �* �*������������� ���*���+��������+��������������������������tof��)��������� ��0��������+!��������*����+F����+��2����� ����*��������sp���+�wp����+���*���������� ���*����+����6������0���width���0������������ ����������� ���*���+����**������;��0�����+F���������������� ����������������+�������� ��������

2����� ���setsw(downfieldppm,upfieldppm)���������������������sw���+�tof���������0�"������ ���*����+����setsw��*���+����������� ��0�

2���centersw��� �����"������� ������������� ���������������� �����

2���minsw��� ������� ����������� ������������;�!����������*������� ��+��0*�!���+������ �**��movesw���� �* �*�����������������������������tof���+���������� ���*���+���sw��

��� ��������$�, �7��*�����7��,���# $���!����

2����� ��+���������������0��<���������*���������������������*�����D��� ����*���+����� ���2��*��$7�*�������*�����D��� ����*���+��������������+���*���+� �����+����+��� �����������<������������**����� D����+�����0�����*�����D��� ��;����������������+��+�������*��!����$�/,��2���s2pul��� ��� ��"��������� ��������<����������������<���������������*������$�/,��5�0����9�������������������������*�"��������������*�����D��� ����+�����������������*�����D��� ����2�����*�����D��� ���������������+������������������seqfil�

���������� ����������0������� ���*����+��

�������

tof F

sw

Page 175: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

������� & D�����������*����D��� ���*���+�������+����+�����������

�!!��# dmfadj<(tipangle_resolution)> &+F����������0*������*�������������������+� ���*��

dmf2adj<(tipangle_resolution)> &+F����������0*������*���������������$�+�+� ���*��

dmf3adj<(tipangle_resolution)> &+F����������0*������*���������������7�+�+� ���*��

dmf4adj<(tipangle_resolution)> &+F����������0*������*���������������8���+� ���*��

dps<(file)> 3���*�����*�����D��� �

ernst(t1_estimate<,90_pulse_width>) ��* �*��������6�������0*����*��

hoult ���alfa���+�rof2�� ��+��0����.��*�

p1(flip_angle<,90_pulse_width>) 6�������*�����+�������p1����+�0����

pps<(file)> �*�����*�����D��� �

pw<(flip_angle<,pulse_width>) 6�������*�����+�������������+�0����

s2pul �������������������������+��+�$���*�����D��� �

time<(<hours,>minutes)> 3���*����<������������������� �* �*������

$���!���� alfa�V��������������!������S ����*���+�*����������� D��������

at�V������!������ ��+�S & D�������������

ct�V������!�����������������*�S ����*���+�����������

d1�V������!������ ��+�S 5�����+�*��

d2�V������!������ ��+�S � ��+�+�*��

dhp�VY�Y!������S 3� ���*�����0������������� *���������*�����

dlp�VY�Y!������S 3� ���*���*�������������� *���������*�����

dm!�dm2!�dm3,dm4�V�����0S 3� ���*�����+�

dmf!�dmf2!�dmf3,dmf4�V������!����.CS 3� ���*�����+�*���������D��� �

dmm!�dmm2!�dmm3!dmm4�V�����0S 3� ���*�����+�*��������+�

dpwr!�dpwr2!�dpwr3!�dpwr4 V������!���+#S ������*�"�*�����+� ���*��������*���������*�����

dpwrf!�dpwrf2!�dpwrf3�V������S 3� ���*�������������

dpwrm!�dpwrm2!�dpwrm3�V������S 3� ���*���*��������+�*����������

dres!�dres2!�dres3,dres4�V������!����+�0�S 2�����0*������*�����������5>�+� ���*��0

dseq!�dseq2!�dseq3�V�����0S 3� ���*�����D��� �

fb�V������!���.CS 5�*�������+��+��

gradtype�V�����0S >��+����������@!�?!���+�J��<��

homo!�homo2!�homo3,homo4�VY�Y!Y�YS .���+� ���*��0� �����*�����+� ���*��

np�V������!� ���������+������*���*�S ����������+����������

nt�V������S ��������������������

p1�V������!������ ���� ��+�S 5�������*�����+��

pad�V������!������ ��+�S ���� D���������+�*��

pfgon�VY��Y���Y�Y������� �� �����*S �5>����*���������:���� �����*

pw�V������!������S ��*�����+��

pw90�V������!������S ��+�0������*�����+��

rof1�V������!������S � ��"���0����0��������� �+��0���*��

rof2�V������!������S � ��"���0����0��������**����0���*��

seqfil�V�����0S ��*�����D��� ������

ss�VY�Y!(7$1�'����7$1�1S ���+����������*���

temp�VY�Y!���������� �*����S ���*�������������

tpwr�V������!����+#S A����"��������������������*�"�*������*����������

tpwrf�V�����8� 9!�8� 9������<�S A����"������������������������

tpwrm�V�����8� 9!�8� 9������<�S A����"��������������*��������+�*����������

vtc�V�����9�!���� �*����S ������*�������������� �����������

Page 176: Getting Started with VNMR 6.1C

<�$ �����&���*����8��� ���*���' ����������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

����#��#�0��7$�, ��$���!����

2���**����������+������������������������0�����0���������<��������!���������������pad!������� D���������+�*��!�������+��pad��������**�����������9��� ��+���2������������� ���*������������������������������;����� ���<�����������

2����������������<������������������������+��������D��� ���������0��������+�*���d1!����������*���p1!���**���+������+�*���d2!���+�����������*���pw��&�����+��+�������rof2�K������� ��"������L���+�alfa�K������� ��"�����L!�np�+���������������� D����+��"����������+����at��� ��+���2������� ��������������+�ss�+�nt������!����������+����� ���**��� D����+���*��+����0�����nt������������������������+�����+����0�����������ss�H����+�������I������������

2���alfa�+�*����������� D��������� �������������"�����*��������D��*������������������alfa���+�����<�+�������D��*����1/(beta*fb)��2���"�*������beta�+����+�������������������+�����*��������������������+� ����������������������������������*� ��+����config��������������� ���!�/�)2?����!�/�)2?!���+��@�����������#� �������������*�+�*����������� D�����������������������alfa���+�1/(beta*fb)!�������������*�����������������+�*��������+�H�����*I�"�*�������������0�alfa���0���"���������������+�� �����������alfa��������� ����&))������-)������%���(������������� �+����

fb����������*�������+��+��!����.C!����+��������������+�����*����!���� �����"���������������0�������D��� �������������� ���*�*�����������H��*+��0���I����������� ������2�������+��+�"�*������fb������O�������������*������������ ���*���+���sw��2���fb���������������������� �**�� ���0�+������"���������� ���*���+���sw���� ���0�+!���+��������������**�������������������+������������&�����sw���������� ���0�!�fb�������� ���0�+������+���������"�*���

2�������������np����0�����**�� �* �*���+��������� �**�������sw����at���� ���0�+��)��������� �*�������������+��������������+�����+!�����"��!�np� ������������+!������� �� ����at���� �* �*���+�����+����sw���+�np����*�������at������0�"��������������+�������������������*���*�����$�K������ ���!�/�)2?����!���+�/�)2?��������L�����8�K����������!��������!���+�>6�)�)�$������+��@�L���**�������+F����+��������� �**��K� ���**��+����+��������������������+!��������������+�� �����������at��������� ����&))������-)������%���(�L�

������� �� & D���������������������������+��+�2�����*����D��� �

��

�����

����

��

����������

���������

���������

���������

���������

���������

pad d1

p1

d2

pw

at

ss + nt

pw rof2 alfa at

,�*

����&%�����

'����5��

Page 177: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

%�����&������'(��������� ��� ������� #���$

ss������������������ ���*�����<� ����������������*�����D��� ������� �������+����+���� �**� ������������������� D�������������������*�+�����)������*���5)3��<��������!����ss������������"��"�*��!���������+����������*�����������*��+���������������������������5)3���*�=����ss��������0���"��"�*��!���������+����������*�����������*��+������������������"����5)3�

nt������������������������������������ D����+E�����������������������������H� ���I���������+������;����������<����������2��������������+��������� D��������!�����nt������"����*��0��������!�K��0�!��� L��2�������������ct�K����H ���*���+�����������IL�������������������*���������������� ���0���+����0����� �������������<���������������*� ���������������� ���*���+�������������

5���H�����*I��3���!�p1���+�d2�����C�����2�������������d1�K���+�����**����� �"���������0����C�������� ;�����D��*������L����������C���������**!���+� ��0���������*���*�����D��� ���������*������pw�µ����**���+�������� D��������������at!������ ��+��

#�������� ����*��!������� ��"������0���+���������rof1�µ���rof1���������**����<�+�������µ���A�����������������������*����������������**��H�*��;�+I����0�"�����������������*����0��*���������!�K����!���������������+���������������� ��"�����������+���L!���*�����D��� ��������������������������������� ��"�����������+���������������� �����������������������*�������**����������*�����������**������������������������������������*�����������*�����D��� ������������������������������������rof1�

A��� ������+����� ��������������!������� ��"����������+����0�������*�����D��� ����+������*��+����0�at��2������*������ ���������*��;�+��������������������*��0���������������#*��;��0���+����*��;��0��������*� ��*��+���������+���*����

&�������������*���*�������� ����*�����D��� �!������� ��"������0���+���������rof2�µ�������������� D�����������0�����)��H��*�������;�����0�I����� ������������K���;�����������0�����0��������5)3L!��� ������0�rof2� �����+� ������*����������������*���

2�������������pw90������������*��0���������� �°���*��!����µ���2������������������������+������*�����D��� ���+��� �*�!�����������+���������������� �����+���������������������0������� ��*��<�����������)������*������+���� �����������������0�������������*���������������"�*������������*�����+������+�0�����������+����µ��������0���������������������������������*����������������������+��������� ����������������*�!������!���+��������

�!!��# ������������$���!����

>�"�����+�����+��*�����0*�����+�0����!�pw(flip_angle<,90_pulse_width>)� �* �*����������*�����������µ����+�����������������"�*��������pw!�K��0�!�pw(45)����������pw���*������89°)��)����������������pw90��<�������+������ ��+���0���������������+!�pw90������;���������� �°���*����&��������+��� ��+���0�������������pw90�����*��*�!����� �����+�p1(flip_angle<,90_pulse_width>)��**���������������������������p1����+�0�����

2��� �����+�ernst(t1_estimate<,90_pulse_width>)�������������������������7����������������;���������������+��� �°���*�����+���+��������+������������������pw90���� �* �*����������������KH6����IL���*�����+����2�������pw����������+���������������������*���)����������������pw90��<�������+������ ��+���0���������������+!�pw90������;���������� �°���*����6������0���"�*������������� ��+���0�������������pw90��2���6�����pw�0�"���������*��������"�������������� � *����������������������!����+��������+����d1��� at�������������������������ernst� ����������+��������6�������+����&��&�+�����!���#*��(�*������!���!� 7���$!�K� ��L�

2���������0���������������alfa���+�rof2!������������������**�����������*���*��!� ���������������������������*������������������*���������� �� �����2���hoult��� ��������������"�*�������+�� ����+����3�)��.��*�!�A*����*����&��� �%����K� '7L��

Page 178: Getting Started with VNMR 6.1C

<�$ �����&���*����8��� ���*���' ����������

��� ������� #���$ %�����&������'(���������

2���time��� ������������������ D�����������������������<��������!�����0����������������d1!�d2!�d3!�mix!�null!�at!�ni!�sw1!�ni2!���+�sw2�������� ��������<����������#���������0�����D�����+��������������������time(<hours>,minutes)!������� ��� ����� �* �*����nt�����������������*�� D����������������������<�����*��������D�����+����������*��*�!�����exptime� �����+����������������<���������������������� �������seqfil!�����0����������������������� ��������<����������exptime� ����*�����������������<���������������������� ����+���*��K��0�!�exptime('s2pul')L�

2���dps� �����+������+� �����0����� �*�+���*������������*�����D��� �!� ���*��������������������������������������dg�+���*���K����5�0����9�L�

2�������"�+�����D�� ;���+������*� �� ;�����<���������*� ��+����������������0�����0�����<����������dps��*���+���*���������+���*���������� ���������0������������*������*� �������������*�"�*�!������*� ;!�������������0����0!������"�������������������!���+��������������������2���pps� �����+��*�������������+���*����

2��������������������������� �����������������0��� ����������������dps�+���*��� �����*�����*!����������5�0����9$��2��������*����"�+��� �����*��������������*�����D��� �����+���*���+!�����������0!���������������������������!���������������������������*���*����+�"�*�������������� *� ;��������0�������������*�����D��� �������������++*��������������!�������������������+���+���*�����������������������������0������

������� �� >����� �*���*����D��� ��3���*���Kdps����0���L

������� � 3���*������������������*�Kdps����0���L

Page 179: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

2����������������������������� ��+����+��!����������5�0����97!�������**��������������� ����0�����������������

0��� ����� �����%�

6"������*�����D��� �� ������+�"�+�+�*�0� �**�������H�����+�I����������2�������+��+�������*�����D��� �!������<���*�!� ������+�"�+�+�������������5�0����98��2������D��� ������������*�0� �*������+�!��������+�����������+��0�������&!�#!���+����2����������+���������+���� �����**��0�����+� ���*���H������I�K�����**��������H��������*I�������!�+�� ����+�*������������� ������L��

5����<���*�!�����������������+� ���*������������+����0������+�&!����+����0������+�#!���+�����+����0������+����/���0�����*������n������0�����H��I�������H����������!I���+�y������0�����H���I�������H���������!I���� ��*+������+�� ���������+�����+�+� ���*�������������'yyn'�������0�dm='yyn'���**���*� ��������<��������!���� ����������������� *���� ������0������+� ���� ���*�+���� �����������A6!����������������� *���� ������0���������+�������*"�������������������<�����������dm='nny'����*+�0�"���������<������������������+� ���*�����*�����+����0������+��!������ D�������������!���� ����������������� *���� �������*+������+� ���*�+���� ��������������A6�

�1 �����0��� !��������#�+����%,����$���!����

A���**��������!�������������������*�"�*���������������0�������������!���� �������������� �����**�+������0��������������������������5�0����99���+�5�0����9�������� ������ ��������������������� ����0������������+�����������������

2�������������tpwr���������������"�������������������!���� �������+��� �������� �����*�����������������*���������*��������tpwr� ������0�"���"�*���������������7!���������(�������7!�+����+��0�����������0����������������������������������������)������� ����!��7����������<�����������*���������

2���������+� ���*�����+������������dm�+����������������+� ���*���������%����dm='y'!�����������+� ���*��������!���+����dm='n'!�����������+� ���*�����������+������A�������� ������+�/�)2?������������!�������0�dm����'a'����'y'���� �������������� ����������+���)���������+�!�����+� ���*���������0���+������+���+�*���������������+�������+����*� ����������

������� �� ���������#���������+���Kdps����0���L

������� �� ,�0� �*������+��&!�#!���������+��+�2�����*����D��� �

d1

p1

d2

pw

at

A B C

Page 180: Getting Started with VNMR 6.1C

<�$ �����&���*����8��� ���*���' ����������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

��+�*��������D��� ������*��*�!�������0�dm����'s'���� ������������� ����������+�������� ������+� ���*���������0���+������+���+�*���������������+����������0�����0����������+�*��������D��� ���2���'s'���+�'a'�"�*������"��������0���*����������� ������+�/�)2?��������������A��/�)2?���+��@���������!�'s'���+�'a'������D��"�*�������'y'��2��������������dm2!�dm3!���+�dm4���� ��������*�0���*�����dm!��< ����dm2����;����������� ��+�+� ���*��!�dm3������������+�+� ���*��!���+�dm4���������������+� ���*����

&������� �������/�)2?����������� ����0���+����������������������������� �����*��2���������������*�"�*���� �����**�+��������tpwrf�K���tpwrmL������������2������������������*��������+����������+#��&�/�)2?�����@��������� �������������**�� ����0���+����������������� �����*��2���������������*�"�*���� �����**�+��������tpwrf������������2������������������*��������+���������+#��A��������������������*�!����������0�����+�������������������������������������+�������+���������"�������������!�tpwrf���������������������������)�������������������������������!�����"�*��������������� �����������!�����*����0������������

2�������������homo���������������� *����+� ���*��0� �����*���������������+� ���*����A�������� �������/�)2?������������!�������0�homo����'y'���� ����������������� ��"������0���+!���� �����+������� �����**��0����������"��,�A��K*� �*��� �**����L�*�����2���������+� ���*�����!����*�����!���+�������*����������0���+���*�����dm ='y'��)��dm='n'!����0����0������������0��*����;����*� ��������homo='y'!���������������dmm�����*+�����������'c'����� ������������"��K��L���+�*������������0�homo����'n'���� ���������0����0�

A��/�)2?���+��@���������!�������0�homo����'y'���*� �������������+�+� ���*��0!���� ��������������������������� *����+� ���*��0������� �������� ��"������0���+��������������+� ���*���������������0�homo����'n'�+����*���+� ���*��������������0!���� ����������������������������� *����+� ���*��0�������� ����������� ������+� ���*����������+����0�� D���������

�����1�2�-���2�������*���&6&��%&?�"����##��+����#&

/C'4�?�"���&6&��%&�$��+��#�&&�0��%�#�"���&

��2@�#�����

���������?�&���&��"�

F ���� ��2@

&���&��"� �2@

tpwrm,dpwrm,dpwrm2,dpwrm3 tpwr,dpwr,dpwr2,

��&��5���+����#�

2�����#����+����#

������������4#�����&���&��"�

��������2@&���&��"� �2@

dhp

dlp?�if dhp='n'

+�����

+�%�

�>�%�:=

�� tpwrf,dpwrf,dpwrf2,dpwrf3

��������2�/C'4�?�"���&6&��%&�$��+�#�������%�#�"���&���������������������������������������������

�����������������������������������������������

����

�2@�#��������������� F ���� ��2@

&���&��"� �2@

�������2@����

B������#E�tpwrf,dpwrf,dpwrf2 tpwr,dpwr,dpwr2

&���&��"�

dpwr3,dpwr4

������� � &���������������0���������K����������$L

Page 181: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�������������2���������&6&��%&

#�$����2

+�.+����2

���2@

��2@

dpwr/tpwr��4��2@?�&���� �2@

tpwr/dpwr��4��2@?�&���� �2@

+�%��2�����#�� �×

dpwr �4��2@?�&���� �2@

���2@�#�����&���� �2@

���2@ ���2@�#�����&���� �2@

���2@�#�����&���� �2@

%.�1�1�$��������2���2�&6&��%&

%.�1�1�$���� ! �0�&6&��%&

#�$����2 ��F� 1

+�.+����2 �,?�

������=��2@

&���&��"��=��2@

��2@�#�����

����� ��� ������=��2@

&���&��"��=��2@

tpwr

tpwr,dpwrdlp

#�$����2� �0�

+�.+����2�

+�%��2�����#��

�=����� �>�2�����#��

"�##���$�����#&�&

��������

&���&��"�

dlp

&���&��"�

dhp�"���2�����#��.���$��

������� �� &���������������0���������K�����$����$L

��2@

tpwrf/dpwrf

− ������2@&���&��"� �2@

��

���2@�#�����

&���� ��������

tpwr/dpwr

+�.+����2

Page 182: Getting Started with VNMR 6.1C

<�$ �����&���*����8��� ���*���' ����������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

A��/�)2?�����������+������������������������$����7�������� ������+�Kapinterface=2����apinterface=3L!�homo�+�������� �����*�������0��*�������0=�����������������������*�"������*������� �����**�+������������������ *����+� ���*��0�Ktn��D��*��dnL������������ *����+� ���*��0�Ktn������D��*����dnL����������� ���A��������������������������������� ������+�Kapinterface=1L!�homo='y'��*��� ����������+� ���*�����0��*������� ������+���������������"����0��*������������0�������������������

A�������� ������+�/�)2?���������������*�!���������������homo2����������� ��+�+� ���*��!�homo3�������������+�+� ���*��!���+�homo4���������+���������+� ���*��� �����*���������������+� ���*��������D��"�*���������������������homo��homo2����;����� ��F�� �������������������������dm2!�dmm2!�homo3����;������������������dm3���+�dmm3!���+�homo4����;�������dm4���+�dmm4�

A������������!��������!���+����� ������!�homo��������������0��>���+�K����L�+� ���*��0�������+���������������������� *����tn�����.����� 5!���+�����+� ���*�����+��dm�����������'y'��

�������/ +����%,���%������������������������ ������ ������1,��%��1����,,�#�!��������%��1���),�� ������,, ���,�1���������7%�����#����%,�����������#��'���#���������� ���%������0���!�'�!�!���,������dpwr�������((7-��((7-����A((7�<;� ��!��������,�������!%,������������#����%,���������,��� �1���� ������A�-������ %��#��������%%��'�!���, ������� ���%������������� ����dpwr=49������������� �#����%,���-��� ���� ����%��������1 �!�� �������������%���%������0�� � ��� �!�'�!�!�!� �1���#4� ��#��������config�%�����!�

A��������������� *���������*��������������������+� ���*��� �����*!���������������dhp� �����*������+� ���*�����0��������*�"�*���+���������������dlp� �����*������*���������*�"�*!�����**������������ *����+� ���*��0��dlp������*��� ��"�����dhp='n'��dhp����������������$99�K��<����L������ �*������+!�����*��������������� ��� �"�*�������dhp�����*+���� �*������+������+� �**��������������� �*����������������+������� ������������dlp���� ������+#�����������������������+� ���*��!���*�����������*��������"�*����

)���++�����!�������� �����������+���+����������������������� ���0������������!�dlp� �����*���������������������"����8�+#������$7����������*������������� ������������������5������� ��������.:�7���������!�dhp� �����*������������� *����+� ���*��������%���9������������dlp� �����*����������+� ���*��������%������$�81��

A�����������D�����+��������*���������*�������������������+� ���*��� �����*!���������������dpwr����������+� ���*��������!���� �������+��� �������� �����*��dpwr� ������0�"���"�*���������������7!���������(�������7!�+����+��0�����������0����������������������������������������)������� ����!��7������������*������<������������.���"��!����������������������*+�����������+������;�����������<��������$�������������*��+�������� ���*����������2�������������<����!���� ��*����������"�*�������� ������������+�������������������dpwr!� �������+F����+��������config����0�����2��������������dpwr2!�dpwr3!���+�dpwr4 ��������+� ���*������������������� ��+!�����+!���+��������+� ���*��� �����*�!������ ��"�*���2���������������� ����*�����"�����������<�������+F����+����config��dhp���+�dlp����������� �����*��������������!��������!������� ���!�/�)2?����!�/�)2?!���+��@�����������������*���������*�������������+� ���*��� �����*��

)���������������� ����0���+����������������������������������������������+� ���*���!�����+� ���*��������������*�"�*���� �����**�+��������dpwrf!�dpwrf2!���+�dpwrf3�������������������������!��� ��+!���+�����+�+� ���*���!������ ��"�*���3� ���*������������������������*��������+���������+#���������� ������+�/�)2?������������!������+#����/�)2?���+��@�����������

Page 183: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

������ ���!�/�)2?����!������������!�����������!���+��������������������� ����0���+������*��������+�*����������**���������������2���*��������+�*���������������� ������������������������tpwrm!�dpwrm!�dpwrm2!���+�dpwrm3!�������tpwrf!�dpwrf!�dpwrf2!���+�dpwrf3�

+����%,�����#�

2���dmf����������� �����*��������+�*�������������������+� ���*���Kdmf2����������� ��+�+� ���*��!�dmf3�������������+�+� ���*��!���+�dmf4����������������+� ���*��L�����0�����K�������*L��&,2J����+� ���*��0��&����� �*�������0�����+� ���*������*+������0���γ.$!�dmf�K���dmf2����dmf4L�����*+������������D��*�8Zγ.$:$π����1/pw90��)��f�K���� ����L���+��+� ���*��0!�dmf�K��+�dmf2����dmf4L������� ��"�����/�)2?!������ ��"���������������!��������!������� ������+�/�)2?�������������K��������� ����&))������-)������%���(������+����*�L��2����� ����dmfadj!�dmf2adj!�dmf3adj!���+�dmf4adj��+F��������"�*�������dmf!�dmf2!�dmf3!���+�dmf4!������ ��"�*�!����������0���"������0������������0������*��+� ���*��0�

������0����������"�������8�$!���0���� ���� ���0����������+���������"�*����������������������dmm!���� �����������������+� ���*�����+�*��������+���&*����0��dmm='c'����**����������+� ���*������ ����������������0*�����D��� ��+� ���*��0!�����"�*�������dmm='s'���+�dmm='e'�������"�����"����������������������*��0���"�*�+���+!�������+!�0����������������������0���#����������"�������8�$!�dmm='s'� ��*+�������+���������&,2J����+� ���*��0��2����������*��0�������%�dmm='w'������������+���� �������&,2J����+� ���*��0���+�dmm='f'������������+���� ������������K���� ����L�+� ���*��0��

�"���*����������� �����+� ���*��0�� �����������"��*��*���������������!��������!������� ���!���+�/�)2?���������������+����� �����������dmm%�dmm='g'������>&��+� ���*��0!�dmm='m'�������,6�����+� ���*��0!���+�dmm='x'������@?7$�+� ���*��0��������������+�� �����������dmm��������� ����&))������-)������%���(��������������+�*��������+����"��*��*��

)����������+��+�������*�����D��� �!�dmm������**������F���������0*��H�����!I���� ������+� ���*�����+�*�������������������**���� ���0�+�+����0�������*�����D��� �����*���*�������������������*�=������<���*�!�dmm='ccw'�0�"������0*�����D��� ��+� ���*��0�+����0�������������������������*�����D��� �!���+��&,2J����+� ���*��0�+����0�� D����������2��������������dmm2!�dmm3!���+�dmm4 ��� ������������������������ ��+!�����+!���+��������+� ���*���!������ ��"�*�!����dmm�+������������������+� ���*����

5��������������������"������0��������������+� ���*��0� �����*!�����dmm����'p'������*� �����0������*��+� ���*��0�����0��������"������0����������2����� ��������+� ���*��0���D��� ��+����0����������+������"������0������������0������*��+� ���*��0!���������dseq�������������������������+� ���*��!�dseq2����������� ��+�+� ���*��!���+�dseq3�������������+�+� ���*����2��������������dres!�dres2!�dres3!���+�dres4� �����*�����������0*������*���������+�������������0������*��+� ���*��0���D��� ��������������!��� ��+!�����+!���+��������+� ���*���!������ ��"�*���������������*�� �������-&�))���������������������������������*��� �����*������"������0����������

2�����**����0�"�*������������ �*�����+� ���*��0��������������!��������!������� ���!�/�)2?����!�/�)2?!���+��@���������%

G .����� *����+� ���*��0������*���������*������%

dm='y' 3� ���*�����+����

homo='y' .����� *����+� ���*��0���

dmm='c' 3� ���*�����+�*��������+����� ������������"�

dpwr=5(15 3� ���*���������*�"�*����0��Kdlp!�dhp������� �����*L

Page 184: Getting Started with VNMR 6.1C

<�$ �����&���*����8��� ���*���' ����������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

G .������� *����+� ���*��0������*���������*������%

G .����� *����+� ���*��0������ *���������*������%

G .������� *����+� ���*��0������ *���������*�����%

2�����**����0�"�*������������ �*�����+� ���*��0�������� ��������������%

G .����� *����+� ���*��0������*���������*������%

G .������� *����+� ���*��0������*���������*������%

G .����� *����+� ���*��0������ *���������*������%

G .������� *����+� ���*��0������ *���������*�����%

dm='y' 3� ���*�����+����

homo='n' .����� *����+� ���*��0����

dmm='w' �&,2J����+� ���*��0

dpwr=40 3� ���*���������*�"�*�Kdlp!�dhp������� �����*L

dmf=10000 3� ���*�����+�*���������D��� �

dm='y' 3� ���*�����+����

homo='y' .����� *����+� ���*��0���

dmm='c' 3� ���*�����+�*��������+����� ������������"�

dhp='n' 3� ���*�����0�����������

dlp=15(25 3� ���*���*���������*�"�*����0�

dm='y' 3� ���*�����+����

homo='n' .����� *����+� ���*��0����

dmm='w' �&,2J����+� ���*��0

dhp=70 3� ���*�����0��������*�"�*

dmf=9900 3� ���*�����+�*���������D��� �

dm='y' 3� ���*�����+����

dmm='c' 3� ���*�����+�*��������+����� ������������"�

dpwr=6(20 3� ���*���������*�"�*����0�

dlp=0(1023 5��������������� �����*����0�

dm='y' 3� ���*�����+����

dmm='w' �&,2J����+� ���*��0

dpwr=45 3� ���*���������*�"�*�

dmf=10000 3� ���*�����+�*���������D��� �

dlp=1023 5��������������� �����*�

dm='y' 3� ���*�����+����

dlp=1500(2047 .���+� ���*���������*�"�*����0�

dm='y' 3� ���*�����+����

dmm='w' �&,2J����+� ���*��0

dhp=0.5,1 3� ���*�����0��������*�"�*

dmf=9900 3� ���*�����+�*���������D��� �

Page 185: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

0�!%�������7��,���#������,

5������������D�����+�����������������*�"�����*�������������� �����**��!�����temp� �����+�����������2�����������������*����+��!����������5�0����91�

2���2�����������������*����+��� ���������+�����������**����0���������%

G 2�������������������� �����*�

G ��������������� �����*������������ ����+����������������+�0�������

G 6���*�������������� �����*�����������������<�������������0�����temp�������������+�����su!�go!�ga!����au� �����+����+��� ����

G &*�������"�*�!�����������<��������� �����*����������������������+��**�����*������2�����������������*����+��!����������5�0����91!�K��+����� �����+�sethwL������������������������

G ��������������������� �����**������������������������ ��*������� ���� ��+������������

)��������������������� �����**�+���*�������0������2�����������������*����+��!������ ������K��������;����������������������������L� ��������*� ��+%

G 3���*�����������0����� ��������� D���������

G ����� D�����������+�+���*�����������0�

)���<��������� �����*���������������������*� ��+!������������"�������*� ���������������+�+��� �����������������������"�!���+�������*� ������������� �������������;�����������������������������������"�+�+������������������tin��

0�!%�������7��,���#�$���!����

5������������D�����+�����������������*�"�����*��������������� ������!�����temp����������������������*�M����������������������(�9�°����+�U� °���temp='n'�+����*�������� ��������&����������������!�vtc!���������������������� �������������&��"��vtc!�"�����*��������������0����*���������0�����������������!����������������!���+�������������������*���#�*���vtc!�0�����������+������������0������������< ���0���� ;���K������ ��*�+��������������< ���0���*��+L!��������������������!���+������������������vtc�����*+��������+����+��0���������������������������0�������*�����+������2���0�*������

5�������������������������������������������*���+�����������!�������������� ����������"�����*������������������������������������*����������3���4����� ���

������� �� 2�����������������*����+��

Page 186: Getting Started with VNMR 6.1C

<�3 �������&���'�.'����&�.;���������)�;��,�*��

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

$�, �#�3��,#�@��#�������,���#�$���!����

5������������D�����+�����������������*���*��+�5��*+�>��+�����K�5>L���+�*�!�����pfgon�0*���*����������������������5>����*�������������������������������@!�?!���+�J� �����*���5����<���*�!�������0�pfgon='nnn'���**���5>����+��������������������*���������������**� �����*�!���+�������0 pfgon='nny'��������������*������������������������J� �����*���*���&�su����go� �����+������������������ ��"����pfgon��&����������������!�gradtype!���**�������5>����+�������� �� �����*��������

5������������������������������5>���*���+�����������!�������������������*����������3���4����� ���

��� ����������#�&#������&'%���!����0�'��3�,�

6� ���<����������������� ����+�������������*�� ��������0�������*� ;������<�������+�� ��������������*���2��*��$8�*����� �����+���������;��0�������<�����������<����*���

����������#�&#��������0�'��3�,�

2����������<����������� ��������<��������!�����text(text_string)��5����<���*�!����� �����+�text('24 Sep 1997')��*� ���������**����0�*���������<�������������*�%24 Sep 1997

2���*� ����������������*���������<�����������<����*�!�����������������+���*���� ;�*����K\\L�������� ;�*��� n�K\nL���������������0����+������������*�����5����<���*�!��������0����� �����+�text('30% Menthol�in CDCL3\\SW Probe\\24 Sep 1997')������������**����0�������*����������<�������������*�%30% Menthol in CDCL3SW Probe24 Sep 1997

2���++������0*��*���������<�����������+�������� ��������<�����������<����*�!�������atext(string)�K��0�!�atext('Series 10')L������+������������0����������<����*�%Series 10

2����������<���+���������+���������<����*��������� ��������<��������!�������textvi��2���textvi��� ���*���������+���������<����*���������������0�����/�)@���<���+�����vi��)���������������+���������*�����������<���+����������������vi!���������/�)@���"���������*�"�����*��vnmreditor���������������������+��������������K��0�!�emacsL���+����������� ���edit(file)�������+����textvi��������������+�� �����������edit�������������*�� ����&))������-)������%���(��������������������������

������� 6<���������2�<��5�*��������+�

�!!��# atext(string) &����+������0�������� ��������<�����������<����*�

ctext �*����������<��������� ��������<��������

edit(file) 6+�������*��������������*� ���*���+����

gettxt(file) >�������<����*�������������������*�

puttxt(file) ��������<����*�����������������*�

text<(string)><:str_var> 3���*�����<���������������<������ ��������<��������

textvi 6+�����<����*����� ��������<��������

Page 187: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

2�� *�����������"���**�������<���������*�����������<����*��������� ��������<��������!�����������ctext� �����+�

+� %,� ������#�<��#,������0�'��3�,�

2��+���*���������<����*��������� ��������<��������!�������text��������������0�������

2�����������<���������+������*��������� ��������<��������!�����gettxt(file)!�������file����������������������+������*���2�<�� ������������"�+����������*�����+��;������������������<���������K��0�!�gettxt('vnmr/fiblib/fid1d')�0������*��fid1d)�

2����"��������<����������� ��������<��������������������+������*�!��������� �����+�puttxt(file)��2�<�� ��������+���+����������*�����+��;������������������<����������

��A $����!����)�*�� �����

3��������� D����+������0�������� ����go!�ga!���+�au!������0���������� ���� ��������0�go!�ga!���+�au!���������0������������������K������������������!���*� ������7�;�����������L��2��*��$9�*������ D�����������*���+� �����+���+������������

=����������)�*�� �����

2���������� ����������������� D�������������go!�ga!���+�au%

G go�� D����������+������+���������������� �����0��2������go���������������������!���*� ������>����������������& D����������

G ga��������� �**����������������0���+�5��������������������������������5)3���������� �**� ��+��2������ga���������������������!���*� ������>�!�������������������& D����������

G au��**������������**���������� ���+��*�<��*��+������� �����0����������������������+����0������<����������2������au���������������������!���*� ������&������� ���������������& D����������

6� ������������� ������������������� D������������������������5)3�!����+��������+��������� D���������������������go!�ga!���+�au��*�������������"���*��++������*���� ����������������������0�+����� D��������%

G 6� ���� ����<� �������������� �����+��� �������������<�����2������������usergo!����� ���������**�����������������������0�����*� ��+����������������<����������2����� ��+�������� ����������������������+����go_���**���+����������������������*�����D��� ��K�����seqfilL����������+�K���0�!�go_s2pul����go_deptL��2������ ����**����������������������<��������� ��+������������+����������� �*�����D��� ���

G )������������������ ����������+��;���� ���������� ���*�����3����$3�5)3�+��������������� D����+!�go�������������������������������������������0����+������������� D����������������������� �����2���"����+���������� ����!�������go('nocheck')�

G A�������� ���!�/�)2?����!���+�/�)2?!�������*�����D��� ��*��0��0�� ���������������� �� ;���������� ���0������������5����"��������+��"����+����0�����*�����D��� �!�����������*�"�*������� ����� �����*����������+������� �����+�K��0�����+�����.!�� 5!����$.=�*������+����������������0��� *��L��6� �����+�������� ����+�������� ��*���������������,������������ ��*� �������< ��+������+�����+��������*�����

2������������� ������������������������+���0�����������+���*���+��D���������A���������������0���������*��������������*�����+����������������� �+����**��+�����+������+�*���K����� ��+�L�������+��������*���K����� ���� ��+�L��2����� ��+� ���������������

Page 188: Getting Started with VNMR 6.1C

<�4 ���������&�- 8��������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

������ ������+����+����������������& D�����0�3���

�!!��# aa &������ D�������������������

acqdisp(message) 3���*��������0��������� D����������������*���

acqmeter<('host')> A��������& D���������+��

acqstat<(remote_system)> A��������& D������������������+��

Acqstat <rem_sys> <-f file> <&> A��������& D������������������+���K/�)@L

au* �������<������������� D�����������+���� ����+���

autolist* ��������+������� �����+�� D���������

calcdim ��* �*����+�������������<��������

errlog 3���*����� �������������������0��

expactive<(exp_number)><:ans> 3�������������<�������������� ��"��� D��������

explog 3���*���*�0���*������<��������

ga<('nocheck')> �������<������������� D�����������+�52���������*�

gmapshim_au ������ D��������������0��+������������0

go* �������<������������� D��������

go_sequence ��*�����D��� ���������� ��� �**�+����0�!�0�!���+���

halt &������ D����������������������

jexp1, jexp2,...,jexp9 -�����<�����0��<��������

noise* ��������������*�"�*����5)3

ra ������� D���������������+��������� �����+

react<('wait')> � �"��������������+����0��������� �����0

sa<(option|number)> ����� D��������

showstat<(remote_system)> 3���*���������������������� D����������������K���L

showstat <remote_system> 3���*���������������������� D����������������K/�)@L

unlock(exp_number) ���"����� ��"��*� ;���+�F�����<��������

usergo 6<����������������� ��� �**�+����0�!�0�!���+���

wbs(string) �� ����� ������������������������� ���*���

werr(string) �� ����� ����������������� ���

wexp(string) �� ����� �����������<��������� ���*����

wnt(string) �� ����� ����������nt������������� ���*���

* au<(<'nocheck'><,><'next'><,><'wait'>)>autolist(<option,>experiment1<,experiment2<,experiment3,...>)go<(<'acqi'><,'nocheck'><,'nosafe'><,'next'><,'sync'><,'wait'>)>noise<(excess_noise<,last_noise<,block_number>>)>:r1,r2,r3,r4,r5,r6

$���!���� acqstatus�V �+��������S & D���������������

arraydim�V������S 3�������������<���������

bs�V�(7$1�1�����������!Y�YS #*� ;���C�

celem�V������S ����*���+�5)3��*������

date�V�����0S 3����K�����/�)@�������L

dp�VY�Y!Y�YS 3���*����� �����

errloglen�V������S ����������*�����������������������0��+���*��

gain�VY�Y!�����������+#S � ��"���0���

hs�V������������� �������+S .�������*���*���

hst�V������!������**��� ��+�S .�������*�����

probe_protection�VY�Y!Y�YS ����������� ����� �����*

wbs�V�����0S ������*� ;���C�

werr�V�����0S ����������

wexp�V�����0S ������<��������� ���*����

wnt�V�����0S �������������������������

Page 189: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�����������������*�"�*��������+� ���*���������0��"�*�������+� ���*�����*������+���������0����������������������*�"�*������*�����*�"�*��������+� ���*��0��#������������� ��+������� �����������������0����������������0���+�����������<����������

#� ���������������� ����� ��*+����"�������������0� ��������<���������!���������� ����� �����������+��������������*������������0�go����������'nosafe'�;�����+!�K����!�go('nosafe')L��2�����0���������������� ��������������*�� ������+�������������0���������������probe_protection��������������'n'�

G A�������� ���!�/�)2?����!�/�)2?!���+��@�!�������*�����D��� ��*��0��0�� ����������0��+�����*�"�*� �� ;���������� ���0����������������0��+�������2����0��+����� �� ;��0����� ��"���������������)):)))�0��+��������+����������@?J�0��+�������5����"��������+��"����+����0�����*�����D��� �!�����*�"�*������� ��0��+��������� �� ;�+��0���������+�����+��������*�������2��� �������������������0��+������������������������**����������������������������2���������*�����$O�+���� � *��*������5���**�!����������+������ ��5)3�� ���*�����!�����+���� � *�� �������< ��+�9�O�

G �����"���+��������� D����+!����� �������+������� ����+����������/�)@�*�"�*� �*��+�����+������������������� D�������������������!����������������0����� ��+��������+�������� D����������2���date����������� ������������+������������ ����+�

2�� �* �*��������+����������������<��������!�����������calcdim� �����+��2�������*������������������arraydim������������)������<������������������+!�arraydim�����������+� �����������C����������������

2���celem�������������+� ������������������� ���*���+�5)3���������<���������������go����au����������+!�celem��������������&���� ��5)3�� D������������ ���*���+!�celem������+���+��2���������������������������*���� ��F�� ����������wbs!�wnt!�wexp!���+�werr���� �����0��� ����K����&������� ���� �����0������0��� �L�

���!!����+���������)�*�� �����

A�������� ��������������*�!����� �����������& D������������+�����������������������*�����*������ D������������������0������2������ �+������������**���%

�� )������& D������������+��������������!�������acqi����������������+��!����������5�0����9'�

$� 6�����su!�go!����au�������������� D���������

)��������"�� ���� ��+�acqi�������� ����*����+����������� D��������!�acqi����+�� ���� ��+��?��� ��� ���� �����acqi����*��� D������������ ��+��

7� 2�������+����0������ D��������!� *� ;��������.)���������

2������������*���������������� ������������������0��������*�

2�����**����0������������������� �����*�����������.)�����+���K���������5�0����9 L�+����0�� D��������%

G 2���C�:���:0�:�������*������*��������� ��������*� ;��������������������������*�

G 2����������������*�

G 2���*� ;�0�����*�+����+F�������

������� �� & D������������+���Kacqi����0���L

Page 190: Getting Started with VNMR 6.1C

<�4 ���������&�- 8��������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

?���������������������� �����������������+��������������� D����������2��������!����vnmr1������������ D��������!���*������� D������������ ����������0����vnmr1� ��� ���� ��������� ����*�����*������� D������������������ ��"���)������*�0�������vnmr1����������� �����������������@�+���*����������*!����� ���������acqi���+������**� ���� ��������� ����*�����������@�+���*����������*�

?��������)�*�� �����

/�+�������� �� ������ ��!�������+������*�������"��������� ��������������������������������<�����������������0*������*���6� �����������������go!�ga!����au!������������������+�����������������<������������ ������*��� ��"���)�����!������<��������������������������0��� ������ ��"�=����������!����������<������������HD����+!I���+��������������� ��������<���������K��+����������"����*��D����+��<���������L���� ���*������������������0���������������� ������D������ D��������� �����+��Kgo!�au!��� �L����������������<���������+��� �����K��0�!�exp1L!�������*���*��shim� �����+�� ������D����+�

2����"������<�������������������+��������D���������<������������������������+��������� D���������������!�����������go('next')� �����+��2���� �����+��*��������������� �������� �����C��0����� �����+��<� ������������������������������<������������������ D�����������������2��� ���*������������ �����C��������������������0������<�������������������+��������D����!�����������go('sync')� �����+�

6<����������+���������+�����**������������+�������������������)��������"��������+�����<������������exp1!������<���*�!�������0������������*�������<������������������**��+������+�����!�����0�������������*�����*��!������������**�������<���������K����������+� ���*��0��<��������L����exp2��,����!������exp1����� ���*���+���+�exp2����� ��"�!����� ��*+��������������+��<��������!���+�����exp3�������������+�����������

���������<������������� ��"�!�����**����������< �������������� ���!����� ��������������& D������������+����������!���+�����su� �����+�K��� ��������+������������������ ������������+��������������������� ���0��!������������0!��� �L��������*�"���!��������*+����D����+����������+���������������<����������A�������� �����,���)�!�,&��(���$�)�&��,&���)����'$������(4������&���������&�����K����H������0�3����0����& D��������!I���0���''L�

������� �� .)�����+���3����0�& D���������Kacqi����0���L

Page 191: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

�����#�)�*�� �����

2���autolist��� �������������������������� �����+��<��������������<� ����0������<����������0�"��������0���������+�������������0��� �����+�� D��������!������<���*�!�autolist('h1','c13','dept')��2����� ���au�����<� ���+������������autolist���+�����*+���������� *�+�+����������0����������autolist�

2���������������<�������������+������������*���������������<��������!���������wexp�����������

2�����"������������D����+��<������������������0�������+��������������<���������!���������'wait'���0����������������� ����go!�ga!���+�au��'wait'���� ��������������� D�����������**����������+�����*�wexp���� �����0��������<�������������������+�

/�������'next'���0��������� ���0��������� �����0���+�������<�����������'next'����������<�����������<�����*����K��������������������D����L������ D����������'next'��������������*����� �����+�� D������������+���������������

)��������+��<������������������������+�����+������������*��������������������� ��+��<��������!��������������'wait'���+�'next'���0������������au�

2���resume� �����+��������*����<������������������������+��������� D���������������!��"����������wexp���� �����0��������<������������������������+������au('wait')�������������������+��resume� �����������*����������� �����0��� ����<��� �������0�����������������������������<���<��������!��+�������+����au('next')! �������**������������� �����0����+��

���%%������#��� �!����)�*�� �����

&���<�������������������������������+������ D��������� ������������+����������sa� �����+��)�������<������������������0������<� �����!����� ����������;����)�������<������������� ��"�!�������������+���+�+��������������+��A������������"��*��*�������������0������<��������������"���*��������� ����+��*� ���+����0�� D���������K��*������������������������������+��������������+����� ��������������L%

G &��������+����������<��+����� ���*������KctL!���0�!�sa����sa('ct')�

G &������*���*���������"�*������ctE ���������+���� ���*������������ � *����������������0!���0�!�sa(4)�

G &��������+����������<���*� ;���C�!���0�!�sa('bs')�

G &��������+����������<�� ���*����5)3!���0�!�sa('nt')�

G &��������+����������<�� ���*���������*��"�� � *�!����������*�������*� ;���C����������� ���*���������**�5)3��������������*��"�� � *�!���0�!�sa('il')�

2��� �����+�ra������������� D���������������+������sa��

������<��������������D����+!���������"�������sa���+�ra��������� ���*�<��)������<������������� ��"�����exp1���+�D����+����exp2!��������0�sa������exp1�������������<�����������+�����+����*����0����� D������������exp2��6������0�sa������exp2!�����������������+!�����"���exp2����������D����!������������� ���0������ ��"���<������������6������0�sa����������<�������������������������� ��"������D����+������������ ���

6������0�ra�*�;���������*������������<����������������� ��������������+��)��exp1�����������+������sa!�������������F����+����exp1����������������� D��������������ra��)�������exp1���+�exp2������������+������sa!����� ���������������������K�������L!�+����+��0��������������������F����+����exp1����exp2����������������ra��������*���������<����������������+������ra�0���������H��+��������D����I�����������<������������"��������+�����������������

Page 192: Getting Started with VNMR 6.1C

<�4 ���������&�- 8��������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

$�� ���-�<�,����-���#�)1�������)�*�� �����

A� ������ D������������������0����!����0�����**�� ������������ ���*�����=�����"��!���"���*������������ ��������� D������������*���2��������������+��� ����������!��������+��� ������"���*��!���������������������������������������������aa�������sa� �����+�

2��������� �����������K��*�L�+��� ���+�����"���*������������������dp='n'���+�7$����������dp='y'���+�������+���������������������0�MAX. TRANSIENTS ACCUMULATED

6< ������+���������*� �� ������ ��!�dp='y'�����*+�������+�����**�������K�����*��������� �����H3������� ��������+�A"���*��I���*��L��A"���*����0�dp='y'���������*������3��Kdsp='r'L����������*�������0������������8���������������

&��������*�������"�!����dp='n'!������� ���0��������<������ �*��0� ��������mxconst�����++��++������*�� �*��0�K�������������� ����&))������-)������%���(������+����*�!��� *�+��0��� ������!�����������0�mxconstL�

)������ D���������������������������*�����������+�K�� ���������� �������0��*��������������������������+������ ����������<����������������"�+����*���L!�����aa� �����+����������� D�������������*+�������+�K�������7�����7�;�����������������������������L��)�������<������������� ��"�!�������������+�����+����*�!��**�+�������+�� ��+�+!���+������<����������������������+��������������&���+���� �**� ��+������������*�����*� ;���C���������������������+��)������werr���� �����0����+�����+!��������� �����0�� ���!���**���+��������D����+��<�����������2���*�0�������!���+�����5)3�+��� �������������file��������+����;����������+�������������<������������������

&�������!������� ��"�������������������� D���������������"��wexp���� �����0�� ���������+����werr���� �����0��2���halt� �����+�������"�+�+����������������������������<���� ����!�H&������� ���� �����0!I����������+����*�����wexp���+�werr���� �����0�

/�+�������� �� ������ ��!������������+�*��������������������go����������+���+������ D������������������+��3����0����������!������� ����������+����������*� ��+���*�����D��� ����������0�0�������+��2���������0�����+��������*�������HPSGI���������0��������������*���� �����������������������+����&��aa����halt� �����+������+���+��������� �� ������ �������������������� D������������� ��"���������������+����������������� �����0������������� ������+����������0��HPSG abortedI���������

/���aa����halt���*���������+��������������������+����������*� ;���C�������0��������;����*� ��������������+�����������������������*�����*� ;�����������=����������!�����+���������������"��*��*����

+����$���� ������#�����,��

��0*����� ������K������!�dp='n'L��������*��+���0��+����������0*�����*� ��������*���+�������0��0��#� �����3��K+�0���*���0��*���� �����0L� ���0�"������$����������+������������0*��� D��������!������������+������C���������**������+������*���2��� ����*����**�+��� ���������� ��"���*���������+�������+����������������6"�����������3�!���������+��+��������&3������+�� ����������� �**���"���*������������������������2��������!�dp='y'����������������+�������0��

A"���*����0�dp='y'������dsp='r'�K���*������3�L����������*�������0������������8����������������.��+�����3��� �*�������������������dp='n'��������������**������"���*����&��������*�!����������+"����0���������+�����3������+�� ��+�+�

/�+�������� ��+������!�dp='n'���������*��2���������<���*�����H�*���I����0��0!���������*����������������������� �**����;��!�����0�"����*��0��+�����������+�������� ��+��������)���������<���������!�����32���������K+������������������+�������!����� �**�����

Page 193: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

������L� ��������**�+�������������+*��� D����+����0*�������� D�����������2���dp='n'���+��+���*������� ��� �����������32��������!��� ������0����������������� ����������������<����������)���� �� �**�������<������������ �����**��+���0��+�����"��+��"���*����0��������!�����dp='n'���+�� ��� ������������0��+������C��������� �������$�����+����� �*��0������������+���������� ������������������**��"��*��*����0��*�����*��������+��2����������D������ ����������� �� �**������ � *����+�������������������"���0��0���**��"���*����������!���������dp='y'�������**���������*�����������������������

)���!�����$���� ���

2���<������+��������������<���������������0����!���������������bs���+����� �� �����������H�*� ;���C�I�������"�+�+��2���+����������������������+����+���� ��������!���������� ����������+������ D��������� ����������������������������bs����������������������!������8!������ D��������� ����������������� ��+!��������"�����8�����������!�������"�+������� ���*���+�+��������������������������������� �������������������+�������������������+��;���*��K�"��������0����*����+���L��2���!��"����bs�����������!������+���+�"���������������<���������������0���������"��*��*������"�����0������������!�������� ������ ����0��������������� ���������2����0�wft�K������������'!�H3������� �����0!I��������0�����+�5����������������L���� ���������� �������5)3�����������*����bs��������������+�+���*�����������*���0���� ������������� �����

2������� ���� ��������+���������� !��� �������������� �������� ���+��� �������"�������+����������������������+��;!�����0���������������wbs!���� ��������H������*� ;���C��I�)����������wbs='wft'���+�����������au�K�����������(�?�1����2���>"����������������& D���������L!�����������**��0����� ��������H������*� ;���C��K�������!������bs���������������� ���*���+L!�������������� �����wft�I������"�����8�K��������"�������"�*������bs���L�����������!�����5)3������������ �**������������+���+�������� �����+���*���+��������� ������&��� �����+������ ��� �������� �������"�;�+����� ����������� �**��K���0�!�wbs='dfid'L�+���*�������5)3��������"����bs�������������)��� D������������������+����go����ga!�wbs���� �����0��������**���������������0�����wbs� �����+!�K��0�!�wbs('wft')L��wbs���� �����0������*������+����*�+�����������0�wbs('stop')�������0�bs='n'���������������0������ D���������+����*���������*� ;���C�������0����%�"�BC�C!��������&���&�����2�&��,����$������&%��$���6���)���!���*��%��$���6���)�������"&������&��&���)����&�!�

���'����"���&��*�

2���������������������������������� ���� �����0����+������*�%

G ��������5)3�����������+!����D����*���������������������������� �**������������+��?��� ���� ���*������������������wnt�K����H�������������������������IL����������!�K��0�!�wnt='wft'L��2��������� �*���� ����!������ �!������������ �**����������+��������ga� �����+!���� ����������� �������

G �������������������5)3��������0�� ���*���+!���������������������"����������� �*���� ��������� ������������+�����**��������5)3��������0���������������0���$3��<�����������+!��������**�����+������"�������� ���*���+!����������������������$3�����������K������*��+���������*���!��������������*����������3���4����� ��L��5�������������������wexp�K����H������<��������IL����������!�K��0�!�wexp='wft2d'L��

G ��������� D���������������� ���!������ ���� ��"��� ������������+������*���?��� ���� ���*������������������werr�K����������L����������!�K��0�!�werr='react'L�

&��*�0�������wbs!����� �����+��wnt���+�wexp��������������0��������������� ���� �����!��"���������go����ga!���������������� ��������� ����+������������������wbs!�wnt!���+�wexp���+�����au� �����+�

Page 194: Getting Started with VNMR 6.1C

<�4 ���������&�- 8��������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

)�*�� ����������� �5��#��

2���& D������������������+��������**������������������ �**���������� �����������������������+��)����������+���+��������������!��������������������<���+!��������������������0�acqstat���������*� ���0�& D���������������������������;��� ��������

5�0������������������� �*�& D������������������+�������������������+��2���+���*��� ��� �������� ����*+������ D���������������������������!������**����*+�����������*�����+���*���+�+�������������+����� ����0����������������������������������������������������������

2��*��$��*���������������*�����*+�!��������+�� ������������� �����*+��

���������� & D������������������+���Kacqstat����0���L

������� 5��*+���������& D������������������+���K� D��������0���L

+���� ��(����&�

2&2/ ������������������� D���������2���"�*����+���*���+�����*+������*���<�*��������K���0�!�H������0IL�����������< �������%�H& ��"�I����������������� D��������� ��������������+��������� ����*���������� ��"�����!���+�H)�� ��"�I������������acqstat� ������ ������ �������������� D��������� ��������������������� D��������� ����������������<� ����0�

B/6/63 �����������<����������D����+������*���*��go� �����+�

/6 ,�0��������������������������<������������������ ��"�

6@� ��������������� ��"���<���������K���0�!�exp1!�exp2!�exp3L�

5)3 ��������������5)3�����0�� D����+����������������+��<��������

�2 ���������� ���*���+�����������

36� 3� ���*��������%�A�!�A��!�>���+

&��,6 ���*��������������0�����������������������+�

,A�4 ,� ;�������%�A��!��0�*���+!������0�*���+

*�"�* ��������*� ;�*�"�*

����*������2��� 6�������+������������<�����������**� ���*���

�������0�2��� �������0������K�!�!�L�����*������<��������� ���*����

3��������+��� ,��������������+������������������+����+��;�

�)��6 �������������%�A��!��0�*���+!������0�*���+

& ���* & ���*�������������+�

�����0 �D�����+�������������+

�2 ������*�������������������������%�A��!��0�*���+!���������0�*���+�K����2���������������������+�vttype=2L

& ���* & ���*�������������K����2���������������������+�vttype=2L

�����0 �D�����+�������������K����2���������������������+�vttype=2L

Page 195: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

2���*��;��������& D������������������+��� ������ ���0�+�����0�����& D���������������+��!���� ��������������5�0��������A������������+������ *� ;��0�������0�����������������������������+������& D������������������+�����+���*� ���0������������

2��D��������& D������������������+��!� *� ;������������C����*��������������������������+��������������0������������������+���*� ��B�������������������������&*�������"�*�!���� *�����������+���������� ��!� *� ;����������"����+������0*���������������*��������������+������������*�����������������������������������"��������� D�������������������+����0���!���������������+������+���*�� *� ;��0������ ������������*�����������������

���������@���

,���0���������*��*���!���0��+����� ����0������*��� ��� ���������������������*���!��� *�+��0��������+�*������+����������!�*������������"���!���+��<����*��������������� ������2�����0����0���!�����������������+!� ��� ������� ��"����"��*��+���+� ����D���������*����+�����������&���0���� �����*�����**�������������"�� �����*�����������������**������+��� ���0���+�+�0���C��0������0��*�����������+��"��������������*���

2�������������gain�������� ��"���0���!������gain=60������������0�������0�����������*��� ���*��� ��"���0������+�gain=0�����*�������KA���������������+����������������!�0�������0����������7'�+#=��������C������0�������$�+#��A������ ��������������!�������0������� ��"���0�������gain=40��A�������� ������+�/�)2?�����9���!�����!���+�19���.C�����������*�!����� �����**��*������*�����0�����gain�����'����������������0�*������+������"���� *���L�gain��� �������������������$�+#��gain='n'�� ��"�����&���0���!������� ������0��������������� �**���+F����+������������������ D������������������������"�*����&���������� D�������������������+!�������0�gain='y'�������**��������"�*������gain����������+���������0�gain���**���+������D�����������;�K����!�gain?L�

<�!� %��,

.�������*��������� ���������� ����������0�������������������*����+��"������+�KH����*�+IL���� ��������������"�������0����C�������������������������������+� �������+*�����C�����2�������������hs������������������*���*�������"�����������������������*�����D��� ����)����������*����� ��"���+��������hs����������!�K��0�!�hs='yn'L!�����+���������������0��+�������*������ �����**�+������������������hst��

���� ���������������+��������"����������*����hs���������'nn'=����������!���������0������0�����+���*���+������go!�ga!����au� �����+��hst�����0����+������������ �������

���������� & D���������������+���KAcqstatus����0���L

Page 196: Getting Started with VNMR 6.1C

<�4 ���������&�- 8��������

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

3�,��$���������

2���+������������ ������K����+���������������������������+���0�����+�������������0������*�������*�L�����*+������ ��������������<���������������������������2�����"�������������*��������� ���!�������������<���������*� ;���������2�����������*� ;��������*�������������M������+��� ���������+�lock_N.primary!�������N���������<���������������!������ ��2���+��� ����� ������������*� ;���+�!��������������!���+�����)3����������� ������� ��������*� ;����������<����������2���*� ;���+����������**�������������+�����0�������������������0����+!��� ;0����+!���+�� D������������ �����0��

�� ��������������������*��������� �**��������������������� ����������� �����+�������<����������"��*��*����+��� ��������������� �����������������������!��� ����� �������������������������� ��+����*� ;!� ������0�����*������+�lock_N.secondary��2������*�� �����*����� �����+��� �!������������ �������D������*�� �������������������*� ;����������� ����������*��� ����+������*����+����+�*���+��� ������� ������� ���*���!�������"��������������*������������+��������*� �� ������ ���

2���"����+������������ �������������������<��������!����������� �����+unlock(exp_number)

������exp_number�����������������������<���������K���0�!�unlock(3)��/���unlock���*���������;����������������*� ;���������<���������������*�=��������!�������� ���������������*� ;���������<������������*��0����<������)������*� ;������� ��"�!����� �����+�unlock(exp_number)�����"�������*� ;������������� ����+��<�����������+�F����������<����������)������*� ;�������**�� ��"������������*� ;������*� �+���������<���������������������������!����� �����+�unlock(exp_number,'force')���� ���**������"�������*� ;���+�F����������<����������2���force������������*������������*� ;�����<�����������+����**� �� ������ ��!����"�+�+������������"����������������+��������"������*+������ �����+���������� ����� �����+���0�������*+� ���*���*��+�������<���������*� ;��0��2���������+�������*������������� ��������� ����*� ;�+���*���<���������0��+���������

������n�����������������������<����������)���������0�����shell� �����+!�+��������������*+ ��+� ���� ����K�� �������D�����������;��������������;L����������<����������?�������*+��*����������*+������ �����+���������� ����� �������������*+�+�������<���������*� ;��0� ���*���*���2���������+�������*������������� ��������� ����*� ;���*���<���������0��+���������

��!����)�*�� �����

#�0�����0�����������"�������8��!� �����*����� D������������������*���������������� �������!��������*!�����������*����*������2��*��������������������0�������������������������+�"� ��!��������������*��,���)���)�������&�!���� �� �����������������������������*����������0�����

&**�+����� D��������� �����+��������������+��2�����*��� D�����������*���+���������������0�������������������������������������*��������&�����& D�������!��� ������������������������ ��������0����������������������0�����������������*���"����������2����D��"�*����;������+� �����+�aa������� �����*�����������������*������������@�8�7!�������������� ��"���������0�����0�acqi�����������������+!��*����0��������� ���������������0� ��*+����� ���*����+��������0����������������wshim���+�method��������������go�������������� ��"���������0�����0�acqi������**����������+��������@�8�7���+�*�����

5���������������� �������!����� ������������������Acqstat� �����+!���� ������+�� ����+����"���5�����������*������������ ��������!�� ������������<����������������������"�+�+����������showstat� �����+��2���� �����+�0�"�������������������������������& D��������+����������������0����� �*���������A��������������� *�+���������0����� �����+�explog��A������ �����������������������D��"�*���!�����������*����������*�!� �����+ shell('cat '+curexp+'/acqfil/log')������������� ���*������*�����

Page 197: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

shell('tail +curexp+'/acqfil/log')����������������*������+��������*�0���*���6�������������*�������� �����+��+���*������������<�����+������� ����������������<���������*�0���*�!���� ������������������<���������������������+!�������������������+!���+�K���+���L������������+�����

3����0����� �������������� D��������!��*� ;���C�� ���*���������0�����+�5)3� ���*���������0���K��+������������0��!�����������L���**�����������+��2���"�*������ ���*�����**������+���+�������������*��������5����**��<���������!����������������wbs!�wnt!���+�wexp�K��+����� ����+� �����+��wbs!�wnt!���+�wexpL������ ��"�!�F�������������������� D����������������*� �**��

2��������������*���*����������������)������ D���������������������+����������� ������������������!����!�Hvnmr1!I���������*�00��0����������*��������*������Hvnmr1I������+����������������� D����������)������ D������������������0����!���������� ���������������� D���������������*������H�������*� ;���I�������"�+�+�

����������0*������!������� ��+���������������������������+������������<����������)����������H��!I����!��<���������7�Kexp3L����������*��"��������� ��������!�������**����������*��������*�����F����exp3����������*�0�������������������������*!��� �����������<������������H*� ;�+�I�)���������������<��������������� ��� D���������������0������0!�������**��������*��������� �������� D����������2�����������*����*������������������*�����������������jexp� �����+�K���0�!�jexp2L�����������������*��"��������� ������������F��������<��������������� ��� D����������������������� ��+��0�����D����+��

)���������0������+������!������������*����+������*����*����������� �������<� ���+�������*�%

�� 5����/�)@!�������ps -ef�

,����+���������H��� �����I����������������0!����������H��� ����������I�������������������� �*�����������*�����0�

$� ,��;������������ �����������0����Vnmr –mforeground...!���+������������� �������������*��0��0������������ �����

7� 6�����kill�-3�#!�������#����������� �����������������������"�����������

2���kill -3� �����+� ����������"��������������������0����������� ������������� ����������������������0���������+�����+�exit=��������!���������+��*���������������"����**�����+������+��������������+�������<����Kkill -9!���� ���������� �����!�+��������+���������+���������������������� �+���L��

8� &������������ ���������"�������������������<���+!����� ������������������������������*���+������������<������������� ������

)�*�� ������=���!�����

)������������������ D��������������"�+������"���*�*� ������%

G )��Acqproc����� ��"�!�����/�)@� �����+�Acqstat�+���*�������� ��������������������� D������������ �����

G &��&�))�*�0���*������ D���������� ��"�������/vnmr/acqqueue/MasterLog��2������*����������"��*��*����������� ������������

G &��&�))�*�0���*������*���;�������~user/vnmrsys/expn/acqfil/log������ D������������+����~user/vnmrsys/expn/acqfil/sulog������<����������������

6� �����������*�0���*�����**�������������*"�������������������4�������������������������+��;����� ������������*�0�F����+�

Page 198: Getting Started with VNMR 6.1C

<�= -��*���&�9�&���*�,�*�����&

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� �

2���expactive� �����+�+����������������� ��������<����������������� ��"��� D����������2�������*�������+���*���+����*����7��

)�*�� ����������� ��#�

�����"���wbs!�wnt!�wexp!����werr���� �����0�� ���!������ D��������� ��+�������������������+�������� �����0�����"��*��*���������������������acqstatus��2����� D��������� ��+�������������������+���������������%���H+���I� �+����+����H�����I� �+���2���+���� �+������������acqstatus[1]���+����������� �+������������acqstatus[2]���� ���� �����;��+���������� �����+����+��0��������� D��������� ��+�������&������<���*�!���werr��� ��� ��*+���� ������� ��*���� �����0����������<������������������������������ ���*���+��2����������������������������� ������*+���%�if (acqstatus[2] = 200) then

"do special processing, e.g.dp='y' au"endif

2���� D��������� �+�����+�������������0������*����+��������+�� ���������������acqstatus������������������� ����&))������-)������%���(��

�����&������� ���

2���errlog� �����+�+���*������*������������������ �������������������0������������<�����+����2���0*���*�����������errloglen� �����*����������������*�����+���*���+��)��errloglen��������+�����+!�errlog�+���*�������*��������+����*��

��� ��2���,�)��, �

2��� �����+�noise<(excess_noise<,last_noise<,block_number>>)>��������������������*�"�*������5)3��/���0�pw=0���������������*���0��*����� ���*���+!����� ���� D���������K�������L�������������/���**��������np=4096��������� ������noise������������������������� �*����*�����������������!���������0�����������������*�"�*!�+ �*�"�*!��� �������� �� �����*��2���������������� �������������+����"�������������0�����gain!�"�������������0�����fb!��� �!���������**��������+��0�������

)������excess_noise���+�last_noise���0������������� *�+�+!�������������+���� �* �*����������������0���%�������������������0��������������< ���������!���+������� ��+��������*�����������+�������D������������&�����+���������0������ ������ ���������*� ;��������K����+����*������L�

2�����**����0���0���������������+������5)3�������*�"�*������������%

G r1����������������*�+ ��������

G r2����������������0������+ ��������

G r3����������������*�����������

G r4����������������0����������������

G r5��������������"���0������������

G r6���������������� ����0�� �����*�����*�� ��

��" )%%, ����+�����,�3�,������

2���+�0���*���0��*���� �����0�K3�L� �����*��������������"�+����������������!��� ����� ��������������*�"�*�� ������������ ����!������"�+�����0��*�� ��� �!��� �����+�+����� �

Page 199: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

�� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

���0�!���+��*����������*������3������**����"�*"���������**����0������������!��**������� �������������� �**����������+��������3����������%

G 2��������������������&#��)��������+�����A"������*��0�������� D�����0�+���������*��0������ ���*���+�������0���*��0�������������+������������5����<���*�!�������+���� �**� ���0����'�4���+�+���������������������9�;.C���� ���*���+��!�������4���+�+������������ D����+��������;.C��)��3�������!�����������������$���������"������*��0��&���+"����0������"������*��0��������������������+� �+�������������������������������������������+������5)3�������+�������*�����������+������������KH+�0���C������������IL�����������*�0����+�0���*� ��"������K&3�L��2���������������*������ ���������0����������0�!�����������H���*I�����������0�����*�+��������&3��������**!���������*���������7�������&��������+"����0����������+�0���*���*���������*+� �����*����+�����������������5)3!�*��+��0����������������������������3����������+�������������+� ���������0��������������� �����

G &����������"������*�+�+�������� D����+!�������<����������������*�����������%�����������������+��������0��*!����5)3!��������"����0��*����+�������������D��� ���������+����������*�+�����+���� ���*���+����3�0���*���*���������+�����+����������*�����0��*0���������+��������������� ����� ����������������*�����2�������� ����� �����!�������������������*���� �����=�����"��!���������� ���*�<�������*������� �������+�����0��������������������� ����� �����!�����*��0������� �* �*�������������D����+��)�������<���*������"������*��0����"�!�����+�0���*���*�������*+�������+����H ������I��**����D��� ���������+������9�;.C���� ���*���+���

G 2�������*�������������&'��)��������+�����3�������*��0�K�����������������+�������H+� �������IL���������+� ��0���������������+������������������5)3���������������� ���**����D����+�������� ���*����*������������ ��������� ���*���+���K����������������������������*+���"�� ���������������+��������+�3�L��&0������������0���������<���*�����"�!���������*�5)3����*+���"��'�4���+�+�������������+�������*�+�������*�+���� ���*���+������9�;.C�

0 %� ���+�����,�3�,������

2�����������������3�����"�+��+�0���*���*�����0�+����0������ D������������+���%

G )�*����3��������������������������;�������������������+�0���*���*�����0���+�+�������*��0�����+����*���������� ���"������*�+�5)3��������������+���������� ����*���A�*������+�0���**����*����+���+�+�������*�+�+������������������+��;��2����+"����0������������*����3���� *�+������� ���������+��;������0����+������+�����+���*������� �������&���������*�+���+"����0�����������++������*�*��+�����������;���������)�*����3�������������� �������*��������**���������������������� ���������

G ��*������3���������+�+� ���+�����++�+���� ������ ���������**�+������������������+���� ���������������K�� ��������������� ���L������*��������+�������������������"���0��0��2����+"����0���������*������3���� *�+������� ���������+���������0����+� ��������*����������*��������+��<����������K�� ������������������++������*�*��+��0�����������;�������L��&�+���+"����0��������������������������������"��*��*����� �����*����*������+�0���*���*�����0�

&���������������3�!������ D���������3�!�����0����������+�0���*���*�����0���+�+�������*��0���� �������������5����������������� �����+��ft���+�ft2d��2���+�0���**����*����+���+�+�������*�+�5)3� �������������"�+����+��;��2����+"����0�����������������0���*�5)3���������*����+�����������0���*��<��������!���*���*�����*� ����������+�0���*���*�����0�����������*�!����*������������<���������*���������� ���*�<������+���*���� �����!���+������+�����+���*������� ����������������*���2��������+���+"����0���������*��0��+��;������0����D����+��2�������*�+��;������0����D��������������+��� �*����*���*��+���������"������*��0��� ���!���� �����0��������$������0���'������� D���������3�������������� �������*��������**���������������������� ���������

Page 200: Getting Started with VNMR 6.1C

<�= -��*���&�9�&���*�,�*�����&

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

)���**����������3�!�������0��*����������**����*����+���������"������*�+���� ���*���+������������*�0�������*�����0���*����

2��*��$1��������C������� �����+����+���������������� ����+������3��

�����,���+�$

2���"�*����������������dsp���� ������������������3������+����� D��������%�'i'�������*����3�!�'r'��������*������3�!����'n'�����������&����0*���*����������!�dsp����� ���3����������������**��<������������+�����*+��������0���������������+����� ����0�����������������!��� ��������3�����+���������"��*��*��K�� ������������������ ���L!���������+��������0�����**�����������+���� ��� ��

�����**�!�3�����;��D�������"����*����������������0��+*���������������dsp�����������'i'����'r'!������"������*��0��� ����K��������������oversampL������������ �**���������������<������**���+�"�*��������"���sw����������+��2���!�����������������������sw!�at!���+:���np�������������*�������!����������������+����+������������� �**���"������*������������<���������!���+������+�0���**����*�������+�+�������*�������+����� ��+��0����������*� ��+�sw���+�np������������

)���������������������+����*��3������������� �*����<��������!�����oversamp����������� �������������'n'���+��"������*��0���+�3����������������+��A�����+�����+!�����oversamp����������� �������������+��� �������� ������������"�*���*���������������<�����K��0�!�oversamp=4L��#�������+!�����"��!������oversamp�������������������<�����"�*���������<�������sw����������+����������<���������

������� 3�0���*�5�*�����0�������+����+�����������

�!!��# addpar('downsamp'|'oversamp') &++�3�������������������� ��������<��������

digfilt(exp_number<,option>) ������+�0���**����*����+�5)3��������������<��������

movedssw ������������������+�0���*���*�����0���+�+�������*��0

moveossw ������������������+�0���*���*�����0���+��"������*��0

pards �������+�0���*���*�����0���+�+�������*��0�����������

paros ��������"������*��0���+�+�0���*���*�����0�����������

$���!���� at�V������!������ ��+�S & D�������������

def_osfilt�VY�Y!Y�YS 3����*��"�*������osfilt

downsamp�V������!Y�YS 3�������*��0��� �������*��+�������+�0���*���*�����0

dscoef�V������S 3�0���*���*���� ����� ����������+�������*��0

dsfb�VY�Y!����������.CS 3�0���*���*�������+��+�������+�������*��0

dslsfrq�V������!���.CS #��+�������*���������������+�������*��0

dsp�VY�Y!Y�Y!Y�YS 2�������3������+����� D��������

filtfile�V��*�S 5�*�����5)�+�0���*���*���� ����� �����

fsq�VY�Y!�Y�YS 5��D��� ��������+�D��+�������+��� ����

np�V������S ����������+����������

oscoef�V������S 3�0���*���*���� ����� �����������"������*��0

osfilt�VY�Y!�Y�Y!�YYS A"������*��0���*�����������*������3�

osfb�VY�Y!�������!����.CS 3�0���*���*�������+��+��������"������*��0

oslsfrq�V������!����.CS #��+�������*����������������"������*��0

oversamp�VY�Y!������S A"������*��0��� ��������� D��������

sw�V������!���.CS �� ���*���+������+��� �*��+��� ��+�+��������

Page 201: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

��� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

=�,����+�$

)�*����3�����*����+�0���*���*�����0���+�+�������*��0��������� D����+�+������������������0�����+��;������������� ���������A�*������+�������*�+�+����������������+�����0�����������+��3�����������+���������0�����+��;������������ ���������%�����+�0���*���*�����0���+�+�������*��0��������� ���*���+��������������������������������������� ����"��+�����*� ;��K����� �������������$3��<��������L������������� ��������+��;��&++������*���� �����0�+����+����0�� D��������!��� �����wnt!��*����++�������������� ������������2������� �����0� ���*�������������+��������+�������+��<������������+�+����+������������������������� ����������+�������������������+�

)�*����3������ ��"���+����������0�����0*���*�����������dsp����'i'��)��dsp�����������������������������'n'!�3�����+����*�+��)��dsp='i'!�������0�����oversamp����������������"�*���0������������������������ �*����<��������� ������������<���<��������������������"������*�+!�+�0���**����*����+!���+�+�������*�+��� ;����������*� ��+�sw������������"��0�������+��;��

A������������ ���!���*����3����� ���*���*�� �������*������������*��"��0���+�������������0���+����������0����� D��������������sa���+�ra��A��������������������������� ���!���*����3���������������*����������*��"��0����� ��"��Kil='y'L��&*��!����� �����+�sa� ���������+���������� D��������!�����ra� ������������+���������������

)��-��*��1�*����9�

�� 6���� dsp='i'�

2���������������*����+�0���*���*�����0���+� �**�������� ���paros���� �����������"������*��0������������oversamp!�oscoef!�oslsfrq!�osfb!���+�filtfile�����*����*����3������ ��"�!�������*�������+��+�������������fb�����������H����& ��"��I

$� ��������������sw���+�at��������"�*����+�����+�������������*���� �����

7� &����D����+!��+F��������"�*������������"������*��0������������oversamp!�oscoef!�oslsfrq!�osfb!���+�filtfile%

G oversamp���� �����������"������*��0��� ����K�'����*���L���������� D����������&��������*�!�np*oversamp�+���������������� D����+��������������sw*oversamp��A� ������+�����������������������+������������� �������!�������+�0���**����*����+���+�+�������*�+����0�"��np����������+������ ���*���+������sw��sw*oversamp���+�np*oversamp�����*�����+��������"�*����0�"������2��*��$'�%

2�����<�����np*oversamp����0�"�������+���*����� ������+����Kdp='y'L��5���dp='n'!���*���*������"�*������$��2���"�*������oversamp���0������+�������+� �����+�����������������+�������+��<���������!��� ������������� �����������������+�����+�*�����������������0�oversamp����'n'� �����������*�� D���������������+������������+�0���*���*�����0

������� ��<�������*��������sw*oversamp���+�np*oversamp

�,���)�6�)�)�

sw*oversamp�6�)�) np*oversamp

������ ��� 9���;.C $�

����������!�������� ����;.C $9��4

/�)2?����!�/�)2?!��@� ����;.C 9�$4

���� �������#���+���+ ����;.C �$'4

���� ��������.:�7� $7�;.C �84

Page 202: Getting Started with VNMR 6.1C

<�= -��*���&�9�&���*�,�*�����&

��� ������� #���$ %�����&������'(��������� ��

G oscoef���� �������������������� ����� ���������+��������+�0���*���*�����2���+����*�����7.5*oversamp+1��&�*��0������������� ����� ������0�"�������*����������������� ������=������**������������� ����� ������0�"�������*��������������0��+��*� ��������2���"�*������oscoef�+�����������+������� ���0�+������oversamp���� ���0�+��� �����oscoef������������ �**���+F����+�����������0�"����*���� ���������������������������0��+*�����������"�*������oversamp�

G oslsfrq�������+������*� �������+�������*���������������� ������+��������������������������D��� ���oslsfrq������� ����+����.C���+����;���� ��*�;��lsfrq��&�������"��"�*������oslsfrq���*� �������0���������*+�������������������������D��� �!���+�����0���"��"�*�����*� �����+������*+���0�����2���oslsfrq����������� ���������+���������������D��� ��������+�D��+�������+��� �����K����H���"��0�B��+�������&����� ���/���0�3�!I���0��$��L�

G osfb���� ����������+�0���*���*�������+��+����)��osfb='n'!��������+��+���+����*������sw/2��&�"�*���*���������sw/2���F� ������D��� ������������+0������������� ����=���"�*�������������sw/2��*��������������+���0��*��������D��� ���������+�����±sw/2�

G filtfile���� ����������������������*����������������*������������K5)L�+�0���*���*���� ����� �������2�����*���������������������Y��vnmrsys/filtlib�+��� ������2�����*���� ����� �������*���������<����*��������������*���*���� ����� ���������*���������*�<���*������������� ������*����������+��2����������+����*����*���� ����� ������ �* �*���+�������!�filtfile�����*+��������������������������0�K''!�����!��������0*��D����������������� ��������������L�

8� )��oversamp�������������"�*���0�������������!�������<���<�������������"������*�+!�+�0���**����*����+!���+�+�������*�+��������sw���*� ��+������������"��0�������+��;��

&������ D�����0���+����������������+�0���*���*�����0!�����moveossw��� ��� ���������+��������oslsfrq���+�sw����������������"�*���������"������*��0���+�+�0���**����*�����0�����������0�������������� �������*� ��+������������� ��������������ds�+���*����?�������������**������oversamp�������������������"�*���

���,70�!��+�$

��*������3�!��"��*��*����� ���������������K�� ��������������� ���L!����*����+�0���*���*�����0�+����0�+����� D��������!����������������0�����+�������������������������� D��������� ���������3��������*��0������������+��������<�������������8���;.C!����������<������"������*��0��� ��������'��2���!������� �*�1�;.C���� ���������"������*�+�������� �������91=���$9�;.C���� ���������"������*�+�������� �����������&��"��sw=200000!��"������*��0�K��+���� �����*������3�L��������������*����+������������ �**��+�� ��"���+�

A"������*��0�*��������������� �����+�0���C���������������������� ����!�������������������"������*��0����+�����&��*���0���!������ ������+� �������;�+������"���������������������*����0��*����������K:�L��������6D��"�*���*�!�������������"������*��0���+�+�0���*���*�����0���**����+� �����������:�����*������� ��"���0����"�*�����

)��-��*����*�)����9�

��������*������3����������������**�+������������!��� �����������*+�������dsp?���� �� ;���������*������3��Kdsp='r'L�����������������������5�����������������!���������������������� �**�� �* �*������"������*��0��� �������+�����������<��������������0����*������3������������������**���������������������������

2�������3��������������0*���<��������!�����oversamp='n'=���������3���� ;�������������<��������!�����oversamp='y'�

Page 203: Getting Started with VNMR 6.1C

��������<� - 8�����&�9���

��� %�����&������'(��������� ��� ������� #���$

2�����������3��H���������*�!I������**���������<����������K����*�����+� �+��������������� ;�����0���L!�����dsp='n'*

)����������*�)����9�&���*�,�*����

2���+���������+�0���*���*�������������*��+���������*������3���2�������������!�����&��*�0-���D���*���!�����+���0��+������"������*��� ���� ������� ��������+������*����*�0���*����!����*������0�+�0���*��� ���*�0����������"������������*�0���*��������"���������2���&��*�0-����+�0���*���*��������*��������������������+�K������� ���*���0���������������L������������*�0���*���!���+������������� ��������������������+�K������0���������+��������� �������������*����+����L��2����0�"����������D������������� �������������������� �������+���+� �+�H��������*+���I� ������+���������*�0���*����!�����++������������������"���������:���������������"�*����+�0���C������������

����� �������0�&��*�0-����+�0���*���*�������������*�0���*�����K����5�0�����$L!��������������������0���H���*I����*�0���*���!������� �������������*�������+��+���fb������O!� ������+��������*��������� �������+��!������+���������"�+�����������*�����*�������� ������������ ���*���0�����������������2������ �����!�����"��!� ��������0���� ���������������*+�������������� ���������������&��*�0-����+�0���*���*���!�����"��!�������*�������+��+���K����7�+#������L������������<� �*��sw/2��������������������������*��:��� ������������ �����

2����� ��+���������+�0���*���*�������"�+�+!�����#�� ;��**���*���!������� ���������� ������ ���� ������� ��K������*��+������������L����������&��*�0-������*������+�����*�������"��� *�������������+0������������� ������2��������� �+���*�����0����� ������������<�������������*������������� �!�����"����/��������;��0������H����*�I���� ���!��� ����������0��� � ������+�!�����*+��������� �����������**!������������;��������0��+����� ����0����� ���������� ���������������!���������*�������������*�����������#�� ;��**���*������������������0��+������������*������������+����������&��*�0-����+�0���*���*����

� �

���

���

���

���

���

� ��� ��� ��� ��� � ��� ��� ��� ��� �

��

��������� ��������������� ������ ����� �������

���������

����

���� ���

Page 204: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ���������� ������ ���

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

����� ����������def_osfilt������������������������������� ��� ������������'a'������ ������� �'b'������������� ���� �����def_osfilt!�� ������ ������������������" ������������ �����������������#�����!�osfilt!�� �'a'� �'b'�� ������������������ �����������������������#�����!����� ������������� ���������

�� ���

����� ���� �� $����������� ������������������� �������������������

oversamp!����������� ����������������������� ������ ��������#������ ������� �������$����������������" ������������oversamp��� �������$����� ��������� �������� !���������������#����������� ���%&���� ���� �����������������#������ ������

$��������!��������������� ��� �� �� �

� ���������������!����������� �� ������������������ �����������!�� ���������

������������������� ��������������������� �� �����oversamp�����������oversamp����� ��'��� ����(!������� ��������������)����oversamp�������!����������� ��������������������������� ��������� ���������������oversamp=50������!����� ������������������������������������������������������� �������� ����������!�

�������� ����� �� ����������� ���������� $��������������� ������ �%*+!�� ������

������ ������������ $����������oversamp����� ��'��� ����(��������������������� $������������� �� ��',�� �-,������������ �� ���������������������������

����������������� ������������������������������������������� �� $���������

���� ��

����"�#����$��� ���%

.��/�����%&����� ��� �������������������0�������������#���������0������ ��� �

��0������������������������� �������� ������np�������������acquire�������������!�� ������0�������������br24�����flipflop����������� ����������������������� ����� ����������������� ����!������������ ����%&���������oversamp='n'����� ���������� ���0�������������������� ��������������0�����1��� �������� � ���������

������� ���%&���������#������!���������� �� ����0������ ���%&�

&�$������������� ������������������������� ���%&�� �dp='y'!���/�����%&�� ����������������2����3� ��45� ����0��$����� ��',������ ����������� ��0���� �������

����������������� ��� �������� ������ �����������������!����������� ����������������� �

� ���±6'(57��'45�������������±8'-'77��'',���1�� ���� ��!�������������$�����������������',/����������9�������� ����45/����������9�

� �dp='n'!����2����3� ��45����� ����� $���������������!���� !��������������$�������6'(5(�

�� ���� ��0���� ���������������dp='y'���������������������������� �������������������������������������� ������ ���������$������������������� ����� ���

#������������ ����!����!���������������� ��#������!��������������� ��-,:5�

����������'6'*'',�!���������������������������� $�� ������$��������� ������

��������������� ������������'6'��������� ������ ������� �������������

� ��� ���$�������� $�� �!������������ ������� � ����������������������������������������

1��� ������ ����� ������-,:5���������!���������� �� ����0������ ���%&�

��������� ������$ �$������ $�� �� �������������������;����%&���������

$���������������$���!��� �������� ��������������������#���������������������

���������!��������������������� ��������������������������������$���0����4,�

� ����� ����� $��������1���� ����� ������$���0������������� ���������2� ���3�

�1�������!�������������������������!�� ������� ���!����������� ���������� �������

���� ��� ������1����� �������� ���������� $�� �������� $��������1���%� ��!�

������� ��������������������� ������ �������$���<���������$�� ��� ��'�8��=9����

� �8,��=9����������2 ��/ �/����3���������������������������� ������������� �������

Page 205: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� �'()������ �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

����������������� ���������9������������ �������0������������ �����������������

�����������������!����� $�� ������ ��������� ����� �������!���������������������

��������������������� �� ���������%&������ ������

>$��� �������!������� �������������������������� ����!���� ������ ������������������

���������������$���$������������������#������ ������$���!�$���� �������������� �

�������������������������#���������������������!�� ���� ����� ��������������� ��

����� �����������$������������ �������� ��$ ������� $�� �������������%&!�����

� ���� ������� �� ��������������� ��#��������� ������������������� �� ��������

$����� ������ $�� �!���������$�������� ���������� �������������� $�� ��

���� ����

���#������������ �$!� �� ����������$������ ���%&������������������

$������������������������ �� ������ �������������������������������������������/� /

� ���������2��� �3���� �������%&���������������������� ������ �����������?����

������������������������������������!��������������5�� �4,!� �$��',������ ������

$�� �!���������� ���$�����������������������

�� ���*�#� �+%%)�%

��� ������ ��������������/�����%&������2� ���3��1�!����� ���������� �� ����� ������

�������������0����/�������������������� ������������ ���������������!����������

����������������������np������������������� �����1�� ����������� ����%&���������!���� ������������� ������������� ������@+A.� ���������������������� ������������

@+A.��1����.��/�����%&��1�����������������#��� ����� �����45/� �6'/���!�

�������� �����$���� �����������dp��

��� ������ ���������%&������� ���2� ���3��1�������������� ����������������������1��

dp='nB!�����1����������45/������#��� ����� ���)�� �$!����dp='yB!�����1��������6'/������ ������� ����� ���!�� ��6'/������#��� ����

@+A.�� �����������1�������������!������ ������/������ ���������� ����

� ������������������� �

,- �����**����%����%�.� &�+������� ���� �#����$

������ �������������������������/�����%&�� �������� ��� ������@����C�����/

� ����9 /��������������������������������� ��$���������������� ��� �������

������ ��0������������������������� �������������D�����������������������

� ��0���� �����������������������0������ ���������� ���� ������� ����� ��

�������

A��������� ���������������� ��� ������������� ���� ����������hoult�����calfa���� ��� ���?���������0������ ��� ����� ��������������������� ���������������0����/�������������������lp�� ��9 ���������������������� �� ��� ������� �����������0���������� �������������� �������������� ����� �����������������������������

�����$�$����� ��alfa�

���������0������ ��� ����� ���� �� ���������������������� ������������������������

��/�����%&������ �� ������ �������� ������� ����alfa�����rof2E

4� %�������������2� ���3�� ����$�$����� ��alfa�����rof2!������!�alfa=6 rof2=2;��������!����� �������� ������������������$������������������ ������$����%&���

'� ���������������������������� �����

6� >���crof2�� ����������rof2�� ������lp��������9 �

Page 206: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ���������� ������ ���

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

-� .��0�������������� �$���������lp����� ��9 ��

���������������!������������� �������� ������� ���� ���� $����$������!�� ��

��������������?��������� �alfa�����rof2!�������������� ������� �� ������������!����alfa=alfa–0.5 rof2=rof2+0.5 ga��� ���� ��$������� ������!�� ���� �����������������$�����$�����������sw������ ��������#����� $�����������������

���calfa���� �������� ����� ������� ����������%&��calfa�� ������alfa�� �����������$���� ���� ���5�µ������������?�����rof2�� ���������� ������������� �lp=0��1����$���� ��alfa� ������������������$�������� ����� �������������������� $���� ��!����crof2�� ���?������0������ ���������� ����lp=0�� ����� ������ �������������������$���� ��alfa�

������������� �

���� �������� ���� ����0������ ����������������������� ������������ ������$���

��������� �� ���������������������������������� ����������1��������������$��

� ������������������������������� ������������ ������������������ ����ft�����ft2d�� ����������� ������������� ���������#������������������������������� ��������������������������� �������������� ��?������ �� ����� ���

����� �!�� ������� ��9��� �!������������ �!�� �$���������� �!�������� ���� �� �

����������������

& ����0������ �������������������������������� ���������������%&!��������������� ��

����������� ��� ������������ �������9������������ �� ��

��������� �� ��� ����0������ ���%&���������� �� ���������E

4� ��0������������������sw�F�+G������������sw������np�F�+GH������������np)�I�dscoef/2�J!������+���� $������������� �

1��� ���������� ��!�� ���������np�F�+G������������np�����������������np��������������������������dscoef/2�

'� �����������������������0���!���������� �pards�� ����������� �����������downsamp!�dscoef!�dslsfrq!�dsfb!�����filtfile��������� ������������

6� %��������� ����������������������������������������� �������� ��

�������#������������1����������!������� �movedssw������������ �������������������������� ��������ds�����������������& ���� �����$��������� ��� ��������� �� ���������������movedssw�� �����!������������������ �� ��E

K downsamp������������� ��������������� ������������������������������ �#����!����������������������������� ��4,,��=9�����downsamp����� �',!�� ��������������������������������������� �8��=9������������������

sw �������������������������������������� �����������������0����sw�*downsamp��%������downsamp�� �4���� ����������������������������������������������������dsfb����� ���� ������������%������downsamp�� 'n'���� ���� ���������� ����������@+A.����� �������������������

K dscoef����������������� ��� �������������� ������� ������� ������������� ��54��������������� ���� ��������������� ��� �����������$����

������������������ ���!������������������ ��� �����������$���������

������ ����������� �����L���$��������������� ��4::�� �6::�� ���������

������$�� �������� ��$������������ �����������?���� ���������

� ������������� ���dscoef�� ��� ������ �������������downsamp����������!�������dscoef������� ������������?��������@+A.�� ���$������

Page 207: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� �'()������ �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

��� ������������������������� �����$���� ��downsamp����������� ��������������������dscoefGdownsamp/2�� �����������������������������@+A.�������� �����dscoefGdownsamp/2�� ���� ��������

K dslsfrq��������� ������������������������������� ��������� ����������������0������tof���dslsfrq���������������=9������ ������������lsfrq����� ����$�$���� ��dslsfrq����������� ���������� ���������������0����������������$�$������������� ��������� ������������

������������� �������� ��������� ���������������0�����

K dsfb����������������������������������!�������������� ������ ������ ���������������������������������1� dsfb='n'!�����������$����� �����������������������������������$����?�����0���������������� ��

���������!�����������$������������ �������������������0������ ������

��±�sw*'�K filtfile���������������� �������� ����������������� �����1.���������������� ��������������������������������B��vnmrsys/filtlib����� ������������ ������������������#����������� ����������� ��������

�������� ���#���������� ������������� ����� �������������������

� ����������������������@+A.!�filtfile��� ���������� ����������������''!����!��� �������0� ��������� ����������������

-� ���������������$������!��������������� ����������������������

��$����������������� �digfilt(exp_number<,option>)�� �������������������������1���� ��� ���#���������������������������$�����? ������

��� ���#�������������������svf�� ������� �������������������������1��� ����������� ������ ��� ����$���������������digfilt���� �� 'nodc'!�'zero'!�����'t2dc'��M������ ��� ������� ������������� ��� ������� ��������������������ft!�wft!�ft2d!� �wft2d��1��ct=1!����������� ���������� ����dcrmv='y'������������� ��������1��proc='lpB!������������ ���������� ���� �� �������������������� ��9��� ���������� ���� ���� �� �����������������

8� ���� ��������������������������� �������� ���� �����������wft!� ����������� ��'���������!����������wft2d�������������������������� ��������������������������������� ���� ������� ������1�����!�� �$���������� �!������

������ �!��� ��9��� �!�������1������!����������� ��������������������

������� ��� ���#����������������$�����������svf�� ������

�������������������������������� �

+ �����!�+A.�����������0��������������$����������� �����������!�����

��������9 ���0����������������0�������������������������������������������

������������� �����oslsfrq�������������������%&���� ����������������� ���� $����������������������� �� ������������ ������������� �������������

� ����������1������������ �� ���������������������0������������0����/������!� �

2�������!3�0������������ ���

�0����/�������0������������ ������� ������� $����tof�� �?���� �����������������������������������������oslsfrq�� � ��������������������������0����������������� ���!����������������� �� ������������������������������0����/

����������������� ���������������%&���� �����

K 1����/�����%&���������dsp='r'!�fsq='y'�!�oversamp�������� ����������� ��-!������ ����������� �������� � ��oversamp/4��������� �������/�����%&����������������� � ��-��������� ������������%&!��������������0����/������������

oslsfrq������� �� �����������������$������� ���� �������������������

Page 208: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ���������� ������ ���

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

K 1������������%&���������dsp='i'!�fsq='y'�!��������������0����/������������� ������������������

������������������ ������������������������

�����+�,�����% �#%

4� �����%&� ������������dsp�� �'r'� �'i'�

'� %��fsq�'y'�

� �����������������oslsfrq�� �1.25*sw����� �������������������0������ �tof+oslsfrq�?������ ���0������ ���1�����������$���� ��oslsfrq��������!������������������fsq�������� �'y'�

�/ !0 1��2�����/ !0 1���% �#%

4� ������ �����������%&�����$������!����dspF'i'�

'� %��fsq�'y'�

� �����������������oslsfrq�� �1.25*sw����� ���������� ���� ������� �� �����������������oslsfrq������������������0����������������� �������������������� �����������0���!� ����������������������0������������1�����������

$���� ��oslsfrq��������!������������������fsq�������� �'y'�

0�+"1��)%���% �#%

��M+1�"�����������!��������%&������oslsfrq�����������

4� %��dsp�'i'��

'� %��oslsfrq�� �1.25*sw!������ $�tof������������� ����

� �� $�tof!�� ������������ ����������� �����$����������0������ �������������������� �������� �������������tof����������������� �����������0���!���������������������������� ����� ���� �� ��������oslsfrq�� ��������0������ ���� �#����E

status(A);obsoffset(tof);delay(d1);...obspulse(pw,oph) /* last pulse in sequence */obsoffset(tof+oslsfrq);

6� >���fsq='y'�� ����oslsfrq�

0�+"13��2 ��3�����/�+�+��������% �#%

��M+1�"!�@N./%!������� ���������������!��0����/�������0������������ �����

� ���$�������

�� �����()�'��%

� �������0����������#���������������0����� ��������tof���������0������ �!������� ������0���������� ����������������������� ��

�0������������������ ����������� �� �� ������������� ��������� �����0������

�� ���������!��������������0������������!��������oslsfrq�� �1.25*sw�� ��

Page 209: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� �'()������ �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

��������!�� ���������� ����fsq='n'��O������������������� ���������0����!�� ����������� �������� �!��������������0������������������� ����������������

���� �����������!����������� �47,/���������

Page 210: Getting Started with VNMR 6.1C

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

!&�� ���4� �������������

%��� ����������������E

K 7�4�2;�������������� �!3����������

K 7�'�21������$�;�������!3�����'44�

K 7�6�2� �������� ���� �!3�����'44�

K 7�-�2&������!3�����'4'�

K 7�8�2��$����������& ������!3�����'4-�

�������������0���!�����#������������� ������������������2��������������� �3�� �

����1�!������������� ��� �������� ������ ���!������ �������� ���� �!����������� ���

� ���� ���������� ��������� ������������� ����� wft������������� �������� ���� �����)����� ������ft��� ��� �������� �������� �����������������������������

!" #�����������

�����':��������������������� �������� �������������� ��������������������

������ ���������� $���������� �� �����������E

K lb����������#� �������������������� ����$�$������$��������������� ����������=9!������������������� ��������������������#� ������������� ����������$�

$������$����� ���� ����������������� ���

K gf������D������������� ������!������ ���!�������������D�������������� �� ������ ��exp(–(t/gf)2)�

K gfs��������������� �����D�������������� ��exp(–((t–gfs)/gf)2)�

K sb�������������� ������!������ �������� ����$�$�������������������� ������ ��sin(t*p/(2*sb))���������$�$��������������0����������������� �� ������ ��sin2(t*p/(2*sb))�

K sbs�������������������� ������!������ �����1����� ��������������� ����� ������������������ ����� ������ ����� �����sin((t–sbs)*p/(2*sb))�������!�����0��� ������������� ���������������sb���������$�

K awc�������������$����������� ��������������������� �������awc�� �����$���� �������������������� ���1��������������������������������#� ������������� �������������

���D�������������� ��

����������������������� ������������������������ ������ �����������������!� ��� ��

� �����������������������#� ������������� �!�������������� �$ ���� ���������

������ �!�����1�����!�������������������� ���� �����������!������������������

�������� ������������ �����wft�� �������� �� $��������������������������� ��� ����!�����$������ ���������� �'n'��� �� ��������1���$�������������������� ������������dg����2� ������3

Page 211: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ���4� �� ��$�*'�%%�

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

���� ���������������� ������� ������� �� ��������!�#� �����������D��������

��������!���� ������� �� ���� ������������������� ���������������� ���� ����������

����#���������������������$�������������������� ������D���������� ��9��� ��

������gfs='n'�!������������� �D�����������������!� ������ �������������lb����������,�!������������� �L ��9������������!���������������������� ��� �$ ���� ���

����������������� ������������������� �$ ���� ��� ���!�������������� �����

� �4��� ���� ����������� ������� ���/$����'��#��������1���������!����������

������������������ ����������������������������!������� ����������������������

���0���������$���������0������

���� ������resolv<(a,b)>������������� ��a 0����� �,�4�����b�0����� �,�6���� ����� ������lb=–0.318/(a*sw)!�����gf=b*sw!������������������2�� ����3�$������ ����� ���� ������������������lb�����gf�������������a�����b�������� �������������������

%$������ ��#����������������������������� ���$����������� �������� ��������

�������gaussian!�pi3ssbsq!�pi4ssbsq!�sqcosin!�����sqsinebell�

���������wtfile�����$�������� ������������/��������������������� ��)�������������� ������������� !"��� �������

� ����� ;������������� �������� ��� ������!�A�� �!�����&������

$������ft* � �������� ��4������

resolv<(a,b)> %��� ���� �����������������

wft* ;�������������� ��4������

wti<(element_number)>

1������$���������

* ft<(options,><'nf'><,start><,finish><,step>)>, ft('inverse',exp_num,expansion)wft<(options,><'nf'><,start><,finish><,step>)>, wft('inverse',exp_num,expansion)

%�����gaussian %��������������D������������ �������� �

pi3ssbsq %�������*6��������������/�0�������� �������� �

pi4ssbsq %�������*-��������������/�0�������� �������� �

sqcosine %��������������� ���/�0�������� �������� �

sqsinebell %��������������������/�0�������� �������� �

����������awc�PB�B!�����Q ������$����������� ��������������������������� �

dcrmv�P�����Q .� $���� ������� ���1�����������������

fn�P� �� ��'�����Q � ������������������������������ �

gf�PB�B!�����������Q D�������������� ������������������������ �

gfs�PB�B!�����Q D��������������� ����������������������������� �

lb�PB�B!�����Q L���� ����������������������������� �

math�PB�B!�B�BQ � �������� ������������

sb�PB�B!�����Q %������� ����������������������������� �

sbs�PB�B!�����Q %������������� ����������������������������� �

wtfile�PBB!����Q M�/������������������������������������� �

Page 212: Getting Started with VNMR 6.1C

4�� + ���' �5��6��& �

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

!& '���������#�����

���wti�� ��������� ����������$�������� �������������������lb,�gf,�gfs,�sb,�sbs!�����awc���1��wti������������������index�����������������������! wti(3)�!����������1�����������������/�1��#��������������)� �����!������������#���������

� ������wti�� ��������������!��������?�;��������������4�������& �������A��!�������'�������& �������A��!� �������'��1��� ����& �������A��

���������wti��������!���������������������� �� ��������� ����������$��������������� ������ ��������E

>�������� �������������������� ������� �� ��E

�����������$���������������������������������� $�������� ������ �� ����

��� ������������������������������� ��� #�������������������� ������� ���+��

$������ ������������������������ ������������+ ����������� ���������!�������

���� �2� �����3!������ ������ ���������������������������� ��

� ���?�����1������������������vf�!������������ ������� �������������1��� #��� ���?���������������������vs�!������������ ������� �������������������� #�

��������� ������� ������� ������� ������������� ���������� ���������!�������� �

� �������������������������� �� ���� ���������� �����������

!( ������������������

���ft�� ������� �������� ��� �� �� ��1������� �������������������� �����1���� ��� ���������� �������� ���������������!�������� ������wft��� ���ft�����wft��� ������������������� ���� ����� ������ �����������lsfid�����phfid!����������������������$���������1�������� ������������������������� $�!�#��������wft('nodc')����������������$��!����������dcrmv�������������� ���� ��� �� $������� �����$������ ������1������ct=1��

� ����� �������� ���� ��� ���!����������fn������������ ��� ������ ���� �������� ���������� ��������� ����� ��������!��������������������� ��

���� )�����������������4567-!�6'(57!� �58865�� �������������45O!�6'O!�����5-O!�

���O����0��$������ ������������������������4,'-������� ���� �� ������� �fn����'n'�������$������������������ �$������������ ������np������0���!���������

�#����� 1�����������1�*���� �������#�

�� %���������� ������� �#� ������������������������$�$����

��$��� ���� �����������

�� %���������������� ���������������$�$������$���0����

�������

��� %���������������������� �������� ���������������������$���

�� %��������D������������� �������

��� %��������D������������� �������������� �������D������������

� ��������������$��

��� %��������������$����������� �������

��� .������ ��������������� �wti���������

Page 213: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ���4� �� ��$�*'�%%�

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

� �� ���� ���������� �0����� �np���������������fn��1��fn�������������np!� ����fn����'n'�����np����� ����� �� ���� !������������� ���������������� ������������������$����� ��9 ��#�����!��!"���������������� �#�������9 /��������� �����)������

� ������������������� ��� $������fn�

!) �����

&�������������������� ���������� ������������ ������� �������������)�������

������������ �������� �������������6,����������������������� ������ ���

&� �������� ���#�� �������� ���� ��� ������� ����� ������!����� �������

$��!"�������!"������� ��!� �������������! ��!"��%��������!������$����1����� �������

����!������� ��� ���������������2��/����3��������������� ���������������2 ��/

�/����3��� �� ��� �������������������������������������!�������������������

� ������ ���������� ������� �� ������� ����������

����������������

���� ���� �������������������0��������������� �� �������������������������� �2��#3������� ����������� �� ���� ���������!���� ������ ����� ����E

�������!�"����$��� ω & �����$'�""��ω (�� �θ )�! ��!"��%�$'�""��ω (����θ H>0��6J

���� �������� ���������������������������������������������� �� ���0����E

θ &�rp +�*ω−ω0) * lp H>0��-J

���lp������ �����/ ������������rp������� �9 / ����������� ����������������������������

���� �� �������������� �������������>0���� ��-E

K rp�������+��"$%�!",���",�"�������������rp�����������������������������0�������

K lp�������+��"$%�,���",�"�������������lp����������������������������� ��������������� �� ���0�����

������$�����������������lp�����rp���������?����E

K L������������!������������������������������������������� ������!�

����������� ������������������!�lp=–150���

� ������ &�������%������ �����������&������

$������aph<(args)><:ok,rp,lp> ��� ����������� ����������

aph0<(args)><:ok,rp,lp> ��� ����������� ��9 / ����

aphx &� �� �����9����� �������������

av %����� ���/$����� ������������������������ �

ds<(index)>, ds<(options)> ����������������

ph %��������� ������������������������ �

phase(phase_change) �������0����/���������������

pwr %��� ��� ������������������������ �

����������lp PR65,,�� �I65,,�������Q ����/ ����������������������������� �

rp�PR65,�� �I65,�������Q S / ����������������������������� �

Page 214: Getting Started with VNMR 6.1C

4�7 $&�%�

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

K ��������� �������������������� �� $������������aph�� �����!������� �����9��� �������0����/��������lp����������0����/����������rp��������!����������������� �������������� ��������aph0�� ������ ������?�����rp�����aphx���� � �����9���������������������� ����aph�� �������aphx�������� ������aph������������������� ������$����� �lp��1��lp����������aph������������ ���������������$�������4,������!��������������$������������������

aph0������ ���

���� ������phase(phase_change)���������������� ����������������������������������phase_change�� ���������$���� ��rp!������ $��������#�������rp�� ������65,°�

������������������

������ ����������������� ������aph�����aph0���$���������������$�������E

K ;���������������� �� ��������������� ������

K %����������$��� ��������/� /� ���������������

K 1��$�$ ��������������������������������$������������� �� ������ ��������

��� ������

K %������������$���������������������%�������������������>&��#������� �

�����$�����$�������� ���������������������������������� �����������������������

� ������� ������� ����������� �����!����������� ���������������������������

��$��������������������� ����

������ ����������� �������������������������������������������������� �����

����!�������������������������!���������������� ��������� ���������������������

����� ���������� ����������������lp������������� ������������������� ���� �2� ���3��������������������� �9����� ����������E�� ���!���$��!����������

��������������� ����������$���� ��������������� ��������� �������$������ ����

���������������lp�����rp����������������������� ��������������� ���������������������� ��������������

��� ��������� �������������������2����������3�������� ���� �������� ��������� ����

����� ����99������� ������������ ��������� ���������������� ���������������

������ ���������������$�� ����������/� /� ������ !����������������!������������

����0����������99��� ������� ���������� ������� �� ���������������� ��� ����������

���� ������aphb���� ����������������.��� ����� ���� �",��",����� �����������"$��� �� ���� ���� ���� ��������� ������

��������������

����������������������������������� �� ��� �� ������%��-$���!.��� ��E�

K ����'������"�!�!.�� �,������������������ ������ph��1�������� �!������������������������������������������������������lp�����rp��

K ������������.����� �,������������������ ������av��1�������� �!������������������������������������ ������ ����0���� �

�������!�"����$��� *ω) &�*�����$'�""���*ω)�)�! ��!"��%�$'�""���*ω//01�

K �����2��� �,������������������ ������pwr��1�������� �!���������������������������0��� ���������������������������������������� ����$����� ���

K ����'�����"���� �,������������������ ������pa��1�������� �!������ ����������������������������������������� ��������������� ���������������������� ����

Page 215: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ���4� �� ��$�*'�%%�

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

����������������������������������������$���������� ������ds!������������������������$����������������������� ��!����� ��� ������������������:!�

2�������!�&� �����!�����&������!3��� ���������������������������� ������������� ���

������������������ $��

!* ���������������������

��������� ��� $����$����������� ������!���������������� ���� �!��0�������������!�

����������� �!����������$�����1���������64����������� ������������

�'��������������

���������lsfid������� �����������������/�������������1���1��lsfid�������� ���$���� ��������'n'!�����1��������/����������lsfid�� ���#�� ������� ���������� �� �������� ���� ������� �������$����� �lsfid��������������0�����np/2�

���������phfid������9 / ���1����������� ��������1��phfid�������� ���$���� ��������'n'!�����1���������� ��������phfid������� ���������� �� �������� ���� ������� ���

���tmove���� �� $��������� �� ������������������lsfid<� ���� ����������������� ������������������� �������������� ������1�!��������tmove�� ���?�������������lsfid�

� ������ ��$����������& �������� �����������&�����

$������addpar('lp') ������������ ������������ �������������� �

addpar('ss') ������������ ����/� ������ �$����������� �

dglp ��������� ��� ������������� ��������

ilfid 1����$��1��������������� ������

parfidss ������������ ����/� ������ �$����������� �

parlp ������������ ������������ �������������� �

tmove L��/�������1��� ����/� ��������

����������lpalg�PB�����B!B������BQ L���������� ����� ��������np������� �

lpext�P����Q L���������� �������#���� �����np������� �

lpfilt�P����Q L���������� ��� ���������� �������������np�����

lpnupts�P����Q L���������� ������� �������� ��������np�����

lpopt�PB�B!B�BQ L���������� ����� ����������#���� �����np�����

lpprint�P����Q L���������� ������� ���������np������� �

lptrace�P����Q L���������� �� �������������

lsfid�PB�B!�����Q +���� ��� ���#�� ������ ����/������np��1�

lsfrq�P����!����=9Q �0����������� ������������������=9

phfid�PR65,�� �I65,!�������Q S / ����������� �������� �����1�

proc�PB��B!B��B!B��BQ ���� ��� ������� ��np��1�

ssfilter�PB�B!�4,�� ���*'!����=9Q ��������������� ���������������� ���������������1�

sslsfrq�PB�B!���������=9Q ���� ��� �$��/���������� �� ���������

ssntaps�P4�� ���*-Q +���� ��� ���������������������������

ssorder�PB�B!�4�� �',Q �� ��� ��� ������ ����������������������1�

strtext�P4�� ���*'Q %�������� ����� ������������ �������#������np�����

strtlp�P����Q %�������� ����� ������������ ����������� ��

Page 216: Getting Started with VNMR 6.1C

4�� ��5�'����� ��$�*'�%%�

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

��������� ����

���������lsfrq��������0����������� �������������!����=9!�������������$�$����������������������������������������� ����������������� ����$�$�����������������

�������� ��������� ����������lsfrq� ���������������� ����� ��� ���#��1������!��������������������������������� �������� ���� ������� ���

��������������%������

���������� ��������@+A.����� ����������������� �� ��� �������� ���� �!�����

��������$����� ����������� $���������proc������E�

K A ���+A.�����<���������������������0���� �� ��������!� ������!���������!�M+1�"����!��� ��������!�M+1�"!�@N.!�����D��������� ���<

�����0�����������! ����"�����%���������2��3��0������������ �������������

������� � �� � ��������������������!� �-�����%!����� ������������ �������

�������������������������� ����������� ���#������� �����������1���%���������

��� �������������� ����� ���#�� �������� ���� �!�������proc='ft'�

K % ������ ���!�� �������� ��� ������1��������!���0������� /

0�������������������������� � �� � ���������� �������+��"�!���%!����������

�������� ������%����������������� ����������������� �������� ���� �!����� proc='rft'��M��convertbru�� �� �$��������������������4,!�2%� ���!�.��$���!�����A $��������!3�� ���������

K � ��������� ����������������� ���!�������� ������� ��������������� ������ ���

����� ��� ������2����������� �!3���������������#������ ���proc='lp'��������� ����������� ���� ��

+�����������

.������/� ������������0������������������+A.�#������������$��� ������E

K >����� ������������1������������ ������� ���� ��� ��������������������!������

������������������� �!�� ��������!����������� �/����������>$�� ���������

���� ��!��������� �� ������� ������������$ �����

K �����0������ ������ �������1��������$����� ��� ��� ���� ��� ����������� ��

���������!��������� ����� �� ��������� �������� ����������

� �������� ������ �� ���������� �$���������!"�������,!$�!�"��������������2� �3�����

������1��� ������9�� �����0������������������������������!������������������

��� ���� ��� �#��������1�����������$������� ���� �2��#3������������2���3�

� ������ ������� ��������� ���� ���������������� ��� �������� �� ����������� ���!�

���2��!���� $�3��1���������� �������� �������������������

1��@+A.!������������ �������� � �������������� ����� �������� �� ����!�� �

������ ������ ��� ��� �������2��� $�3��1�!�������������������������������

� ��� �������� ���������������������1�������������� ������������������

proc='lp'�������������� ft� �wft�����������1��� ��� ������� �������������������1�!�������� ������� �� �� ��������� ft('noft')!��������� ��������������� ������ �������� �� �����#��������������� �������� ���� ���" ������

� ����������� ����� ������1������������lp=0 rp=0!� ���������������� ���������������lp=0 rp=90�

%��������������� ����$ �$��� �$���������� ��0���� ���� ���� ������ ���������

����� �������������1�!������$ �$��0����������� �������������������� ������

Page 217: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ���4� �� ��$�*'�%%�

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

������� � �����9������ �� �����9��� ���!� ��������������� ��������!�������������

���������������!�?����������������/�0��������� �������������� �� �$����

����������0����� ������������ ��� �� ��#������������������������!�����

���������������������� �addpar('lp')�������������������dglp�������� �parlp������� �������������addpar('lp')���.��� ������64�� �������� ������������� ����������>������������������������������������������� ��

�� �",��",����� �����������"$���

� �� �� ���#�� ����!������������ ������$�����������������$������ �<�����

#��������������!������ ���!�������������������������

M����������� ���� ���� �� �������� ��������������������� ����!����� ��

����������� ���������!������� �=��������?��!�.�����!�;�A�A�T��� $U!�

�������$��� � ���!�3�� ��"������"�!���!�-58/-74��4:78��

������ �,�������������

+�� ���� �$���������� ��������0�����#������������������������ ��������

� �$�������� ����$�������������� ������������ ��$��� ���!�� �$!�

#��������� �$���������� ��� ��� ���������������������������� �$��������

���������������� �������������������������� ������������ �$�������

@+A.���� � ������ ���� ������� �� �$����������� ��������������������E

K �1���������!������������� �/�0������������ ��!���� �/����������������������������

� ������0�����1��������������$�������������������������������� ���������

��������� ���������!���$���� ������� �/� ������ �$�������������� ���� �/

�0�������������������������������������������������������������1���������

���������� ����� ��������1��� �� $����� �$�������� ������� ������� ���

����� �� ��������1����$������ �$��/�����������������

K 1������� ��!�������9����9 /�0������������ ��!������0�����1�������� �� �/

����������!�������������������1����������������� ��� ��������������������

������ssorder�!��������� ��� ������������������ ����� ��������1�������������������� ��� $����� ������1�� ����������������������#������ �/� ������

���� �������� �� ��������1��� ��������� �$��/�����������������

���� �$����������� ���������ssfilter!�sslsfrq!�ssntaps!�����ssorder�� �� ��� ��������1�������������� �� ��#���������������#�����!�����������

��������������addpar('ss')�

����������ssfilter�����ssorder���������� ������� ��� ������ �� ��E

K ���9����9 /�0������������ ��� ��� ��������������� ���ssfilter�����ssorder������� ���$���� ��������2+ ��M���3�

K ��������� �/�0������������ ��� ��� ��������������ssfilter�������� ���$���� ��������2+ ��M��3�����ssorder ������� �2+ ��M���3

K ���9����������� ��� ������ �������� ������ssfilter�������� �2+ ��M���3

���������������� ������ �/��������������������������������������9��� ��� ���������

� ����������������������������ssfilter!�sslsfrq!�����ssntapsE�

K ���$���� ��ssfilter��������������������������� ������ �/������������������ ���� ��������1��� ���������������1���1����������$�������4,,�=9�

K ���$���� ��sslsfrq������������� ���� �� ��������� ������ �$��/���������� �� �������������%������sslsfrq�� ���� �/9 �$��������������� �$��/���������� �����sslsfrq�=9��%������sslsfrq�� �'n'������������$������ �$��������������� ��������� ����������������0������

Page 218: Getting Started with VNMR 6.1C

4�� ��5�'����� ��$�*'�%%�

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

K ���$���� ��ssntaps����������������� ��������� ��������������� ����������������������������$�������4'4��������$������������� ��1�� �np/4������ ���������������!������������������������ ������������������������ ��� �����������

� ��� �����!���$������� ����������������� ���������� �/�0������������ ���

��� �!������������������������ ����9����9 /�0������������ ��� ��� �!���$����

�����6�����'4���������� �������

������ �����!�������9��� ��� ����������!����������ssorder������������ �� ������ ��� ���������� �������������������������1������ ����������� ��4�� �',�����

�������$�������2+ ������$�3�1��������� ��� ����������!�ssorder����� �������

���0������� ���������������9��������������������������� �$�������� $�� ������#����

���� �������������������1���������������� ���?����lsfrq� �sslsfrq�� �� $����� �$�������� ��������±�,�'�=9� ��������� ����������� � ������ �������� �$���������� ���������� ��� ���������������$�� ������� �����!���������������� $�� �

���� ������������ ����� �$�������

'����������'��

���ilfid�� ������� �$��������������1���������� ����������1����������$��������1����;�����$ ���������#������ ��nf��1��!����� ��np�� ����!�ilfid�� �������������� ����������1�� ��np*nf�� ������������������������� ������������$������������������ ���#�� ���� ������ �����nf��1���������������������0������� ������������1���1���������������� ���� ���#�� ����� ������ �����nf��1�������������������0���������� ��������1�������� ���� ����������� ������ ���#�� ������

���� ����ilfid���?�����np�����nf!����� ��� ������ ������������������sw��

�������� -����������������������������������,��.�����������������������������

��������������'��,�������������!

� ��������� ���� �� ��ilfid!��������������#����!���� ����� ���� �",��",����� �����������"$��

Page 219: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ���4� �� ��$�*'�%%�

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

Page 220: Getting Started with VNMR 6.1C

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

!&�� ����� ������.�������.��������

%��� ����������������E

K :�4�21������$��1������%�������������!3����������

K :�'�21������$��1���������!3�����''4�

K :�6�2%����������;����������1��������������&� �����!3�����''-�

K :�-�21������$�%�������������!3�����''8�

K :�8�2%������������������&� �����!3�����'64�

K :�5�21������ �!3�����'67�

K :�(�2&� �����!3�����'-'�

K :�7�2&� �������!3�����'8,�

K :�:�2&������!3�����'5,�

K :�4,�2M�/� �� ������L���������!3�����'54�

�������!��� �����!������������� ��������������������$������9������$������>�����������

���� ���������� ���� ��� ����!��������#����� ��!������ �������� �!������

������� ���������� ����� ����� ������������ ������������ ����

/!" '����������'����� ��������������

����������$���������� ������ $���������������������df�� ����� ��1�����������������ds�� ����� �����������������1�������������� ������� ����!�� ����������������������1�� �������������������������E

K >����� ������� ������������������������������$���� ��� ���������������)�

������������������������������� ���������� ������������������������

�������������������� �������� �� ������������������������������ ������� ��

� �������������������� �� �������������

K &�����$���������������2��������3�� �#����!��������vs=500���������������$����������� ���������������������� �8,,�����1������ ���������� �2#��3����

2��������� �3����������2����������� �3�� �� ������

K >���������� ��������������������������������������������L������ ���������� ��

����������������������������� �� ������������������������� ����� �����������

���������� �������������$ ������������������� ����������� ����� �����

��� ��� ����� $�������� ���� ��� ������� �������������������������� ���

���� ���M����������� �����!�������� ������� ��������� ��!����������������� �� ��� �

��� �!�� ��������#���������� ��������� ���� �!�� ���?����������������������

���������������1�� �������!������ ������ ���������������

������ ������������������������������������ ���� �#����!���������� �� ����

���������������� ������������������ ������ ������� ����1���������!����� ���

Page 221: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

���� ���������������!������������� ��������������� �� ����M������ ����$��������

������� �� �����!���������� ������� �� ��������� ����������� �� ����������� ���

���� ��� ��������� ����������������������� ��������� ��������

�����������������

�1������������������������� $������������� ��������������1���� �����������

����������������2�� �3��������wf�������� ���1�������sf ������ ���1����%�������!������������� ����������������������������������wp�������� ���� �������sp������� ���� �������������������������� ��������=9������$�������!�

wp=1000���

�������� ����������������� �� ����������������axisf��� ��1����������� �axis��� ����������������)���������� ������ ������������������ ���� �������!������0�����!�����axisf������������������� ���)�axis���������������������p������!�h��=9�!� �k���=9���� ��1���������!����������vf�����������$����������� �������������

� ���������������!����������vs�����������$������������%������������������� �������������� �E�

K 1������ ����9���nm����������� �!��������������������������������� ����������� ���!�������������������� ����9��� ������������vs��������� ������� ���

K 1�������� ���/����������ai��� �!������������ ����������������������������������� ���?����vf� �vs�� �� ������������$������������������ ��������� ����������������� �� ��#������� ��� ��!������������ ����������

#��������

���� ���� �� ������������� ������������������ ������� $���������2����3�

������!�wc�������� ������������sc������� ���������� ������������������ ������������� ��1���������!����������vpf�� ���� �������1����������$�������)�� ���������������!����������vp � ���� �������������$������������io �������� ������� ���� ������������������������ ��������������������� �������������

������

����������� ���� ��������������2������ ������������� ����)3��������������������������

��������!� �� ��������������� ������������� ������df� �ds!������������������ ���� �������������������������� �� ����� �����1�� ������������� ����� ���� �����

��������������1�� ���� ��!�������������������� ��� ������1�� �������� �����

��������� ������� �������!��������������� ��������������������������������������1�� �

������� �������������� ����������

@��������������!����������� ������������������������� ������� ���������

���� �������������� ���?�������$��������������ai�� �!������������������vf� �vs����� ����������� ����������������1��nm�� �!����������������� �������������������������������������������� ��� ��/�����

���#���� ��� ������������ ���� ���������� $����������wysiwyg��������1��� ��� �������� ��������������� ������������� �!��������� ����������� �$��!����

wysiwyg�� �'n'��������������������������� ������� ��� �������������� � ������������ ������ ����� ����2������ ������������� ����3��������!�������wysiwyg�� �'y'�

Page 222: Getting Started with VNMR 6.1C

��� + ���' �5���+����%����

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

/!& '����������'��������

���df<(index)>�� �����!� ����0��$������ ������dfid<(index)>!��������������$����������� �� �����������1���� ������4��#������� �� �'��

#������!�������������1��������$�����������������������#������������

��������� ��������������!������� ������� ���������������������� ����������

�1��������4�������& �������A���

����1��������������������������� ��� ���#������� �������������������������

lsfid������1�������� ������ ������9 / �� ���������������� ��������������������������phfid�

�����6'�������� ��������������������� ���������������������$��1����������

�'���������%��

�����56��� �����������������������������1��������������$��������� ��

� ����� 1������$��1����������� �����������&�����

$������df<(index)>, df<(options)> �����������������1�

dscale* ��������������� ��������� ��1�

* dscale<(<axis><,vertical_start><,display_start><,color>)>

����������axisf�PB�B!B�B!B�B!B�BQ �#��������� ��1����������������� ��

crf�P����!������Q ��������/� �������� �� ���� �

deltaf�P����!������Q ������� ���� ����/� �������� �

lsfid�PB�B!�����Q +���� ��� ���#�� ������ ����/����������1�

phasing�P4,�� �4,,!��� V� � �� ���������� ���������������$��������

phfid�PB�B!R65,�,�� �65,�,!�������Q S / ����������� �������� �����1�

vf�P4R5�� �4:Q @����������� ���1�

vpf�P����!������Q �����$������� ���� �� ���1�

vpfi�P����!������Q �����$������� ���� �� ������������1�

���������� 1������$��1�����������df�& ����

Page 223: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

������� �� ��������������������1����������A������������ �� ��������� ����� ����������

������������ ��� �� ��������� ������ ������ ����� ������ ����������E

�������� ��������� ������ �� ��E

$��������$�����������'��'�����

������ ����� �� �������� $�������� ���� ������������������������ �� �����

� �����������$��!������������ �� ������ �������������� ������������� �������

� $���� ������ ���� ���A $���������� �����������������crf��

&��������������� ������� ��������������� ������ �� ��������� ����� ���������� ��

&������������������ �� ������ ���� �� ������������������ ��� ������������������

��� �� �� $�� ����� ���� �������� ������ ������ ����� $��� �������� �����

�������� ��A $���� ������� ������ �����������������deltaf!���������������� �������������� ���� ���1��� ������ ������������!������������������� ��

������ ���������� ������ ��� ���� $�������������� ���)����������������

������crf������ �����������deltaf��

���������� ������� ��� �� �������1������������&��������������� ����?��������$������

����� ������1���������vf��� ����������1������������������ ���� �� ������ ���� ��0��������$������� ���� �� ������ ���� ���1������ ���� ������ ���� �������������

��� ������������!����$������� ���� �� ������������������?������ ����$������� ���� �� ��

���� ���� ���&���������������vpfi����������������������� ������1������������������vpf��������������������������� ������������

��������1����������������������df�� �����!����������������������1��

����������������� ������� �������� �����������������$����������������� ��� �� �� �� ��

������ �� ����� ���� #�������47,°�� ������������ �!�����',°�� ������������� ������ !�� ���������������� �����2� ��3���?�������������������� �����2���3���?����

���������������������� ���!� ��������������� ���������������$������

��� ��������������� ��������������������������������� ��������������� ��

4'���!���������"�!��5�-����������6�,���",!"���"�!��%�������!"��'����-����$������ �,�7

� # ������� ����� #�� ��������� ���� ��

��� ������� ������� �� ������� ����� �

4'����$�",������"�!��� ��!"��%6�8����� ��6�������� ��6�,���",!"���"�2'!$'� �,��%�������!"7

1������� ���������������������1��

S �1��� ���������������������1���������9 �

+ �1��� .� $��������������1����������

4'���'!�,������"�!���-��",����9���6�,���",!"���"�!��%�������!"��'����-����$������ �,�7

>#���� >#���������������������� ��

���� �������������������

4'���� �!"!"�������"��,��"���$'�"���������7

����� ��������������$��1������ ������ �!����� ���

����� � ��������������� ���������������������1�������������������������axisf��������

&��� ��������������$���������� ��

.��� .������ �����������������$��� ����������df���������

Page 224: Getting Started with VNMR 6.1C

��� + ���' �5���+����%����

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

���� �� ������������ ����������phasing!��������������������� ������������������ ���������E

K phasing=20������� ��������� ����������$��������� ��� ����������

K phasing=70�������(,V� ���������� �����������

���$���� ��phasing�����$��������4,�����4,,��� ������������ ��������������1���������������� ������ �����������

������������� ����?��������$����������� ������1���1��������� ��������������������

� ��� ��� ����������� ���������1���� ������������������ ��� �!�� ���� ������ ���

� �������� ���� ������1���������� �/�������������������������� ���������������$����

$���������������������������������������������� ����������1�������������������

���� ���� $� ��� ������1����������� �� �����$�����������

+ ����������2��3����������� ����������1�����������������phfid='n'� �0��1��phfid=90!����2��3����������� ����������������1�������������

'����������'��#��0�

������������� ������$��������������$��1������ ������ ���+ ���� ��������������

�������� ������� ����?�������������������� ���������������1���& ���� ������ ���

� ������ ��� ���� �!��������������� ������� �!���������� �������������������������

�����A $�������� ���� ��� ��� ���� ���� ������������������������������������� ���

���� ������������� /����������� ���������� ���� ��� ���� ���

��������� ������� ����?�������������� ���������������1���& ���� ������ ���� ��

$�� ����������� �!���������������� ������� �!�������� �9 �����������$������

��� ��������������� ���� ���A $�������� ���� ���� $� ��� ������ �9 �����

��� ���?�������������� ������1������������������� ������1���������������� ���?������ �

��������� ���� �� ��������������$��������� �������� �������������������� ���

� ������ $��� ������ �9 �������� !�������������9� ���������$�������

'���������������%���

���&�������� ������$��������������$���������� �E

4� & ���� ������ ���� �� �����1���� �� �������!��� �����������$��������������

���!������������������� ������� ���

��� �9 �������� ���������������� ���� �������� �$��������� ����������

���������� ������ ���� ������������� �� ���1��������������������������

� � ������� � ����������������)� ������������������ ������������$�����������

'� A $����� ����� $� ��� ������ �9 �������� !����������������� �$������

��� ���������������� ���������� ��� ���?��������1�������������phfid��

���������� ����� $����� �9 �������� �� �������phfid���������� ������ �9 �������� �� ������phfid��&�������� ���� ������� ������ �9 �������� ���������������������� ��� ��� �����������������

6� � �#�������������$���������� �!������� �������� ��� ����������%����

���"������ ���#�$�%%������ � ����� �������������

Page 225: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

/!( ���1������#���0�������'������������������

�����66�������� �������������������$�������� �����������������������1��

�������������� ��������������������������$�����1�����������������dotflag!�axisf!�vpf!�vpfi!�crf!�����deltaf�������������� �������������������� ����$�����������������!������� �addpar('fid')����� $����� ���������������������������#������������� �fidpar������� �������������addpar('fid')���

���1����'��

���dfs�� ��������������� �� �� ��1�����������$:�,�,!����%���������������1����� ������ �9 �����������$��������� ������$� ����1������� ���� �� �����������1�����

� $����������������wc!�sc!�����vpf��>��������0�����1������ ���� �������$�

� ������ �1��������������&� ������� �����������&������

$������addpar('fid') ������������ ��1������������������#�����

dfs* ����������������1��

dfsa* ����������������1������ ���������

dfsan* ����������������1������ �������������� ���������

dfsh* ����������������1���� �9 ������

dfshn* ����������������1���� �9 ����������� ������������

dfsn* ����������������1������� ������������

dfww* ���������1���������������� �

fidpar ������������ ��1������������������#�����

pfww* &� ���1���������������� �

plfid* &� ���1��

* dfs<(<start><,finish><,step><,'all'|'imag'><,color>)>dfsa<(<start><,finish><,step><,'all'|'imag'><,color>)> dfsan<(<start><,finish><,step><,'all'|'imag'><,color>)> dfsh<(<start><,finish><,step><,'all'|'imag'><,color>)> dfshn<(<start><,finish><,step><,'all'|'imag'><,color>)>dfsn<(<start><,finish><,step><,'all'|'imag'><,color>)>dfww<(<start><,finish><,step><,'all'|'imag'><,color>)>pfww<(<start><,finish><,step><,'all'|'imag'>)>plfid<(<start><,finish><,step><,'all'|'imag'><,pen>)>

����������axisf�PB�B!B�B!B�B!B�BQ �#��������� ��1����������������� ��

crf�P����!������Q ��������/� �������� �� ���� �

deltaf�P����!������Q ������� ���� �������� �

dotflag�PB�B!B�BQ ���������1������ ������� ��

ho�P����!������Q = �9 ����� ����

lsfid�PB�B!�����Q +���� ��� ���#�� ������ ����/����������1�

phfid�PB�B!R65,�� �65,!������Q S / ����������� �����1�

sc�P,�� �����#!������Q %���� ������

sf�P,�� ���!������Q %���� ���1���������

vf�P4R5�� �4:Q @����������� ���1�

vo�P����!������Q @������ ����

vpf�P����!������Q �����$������� ���� �� ���1�

vpfi�P����!������Q �����$������� ���� �� ������������1�

wc��8�� �����#!������Q ;����� ������

wf�P,�� ���!������Q ;����� ���1���� �

Page 226: Getting Started with VNMR 6.1C

��7 + ���' �5�����' �)#���%����

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

� ������������1�������� ����������� vo�����ho��� ���2���/� /����3�������� �!�ho�����������������$)�� ���2� �� �/� /� �3�������� �!�vo����� ����$����������#�� �dfs�������� �� ����E

dfs<(<start><,finish><,step><,'all'|'imag'><,color>)>

� ������4�� �'����������!�������������1��������$�����������������������#�

�������������������A��������1����������������������������������������� ����������

����������1������� ��� ����step���������������������� �����1�����#���������������4���1��'imag'�������������������� ��������!� �����������������1�����������������������������������'all'!�� ��������������1�������� � ��'red'!�'green'!�'blue'!���.������������������������������������

���� �� ������ ���������$����� ��� ��dfs��������������������������dfsE

K dfsn������� �������������dfs�#����������������������� �������� ��������������������������� ���� �� ������������� ��������1���� ��������

K dfsa���������� �� �� ��1������ ���������������?�����������������vo�����ho�� ������������������� ������� ����������������� ���wc������������ �������������������������� ������� �� �������� ���� �� �����������1������ $������

�������wc!�sc!�����vpf��

K dfsan������� �������������dfsa�#����������������������� �������� ��������������������������� ���������� �� ��� �� ������������� ��������1���

K dfsh���������� �� �� ��1���� �9 �����������������vo�� �9 �������?�������ho!�sc!�����wc�� �������������� ������� ��������������������������� ���� �� �����������1������ $�������������wc!�sc!�����vpf��

K dfshn������� �������������dfsh�#����������������������� �������� ��������������������������� ���� �� ������������� ��������1���� ��������

���plfid�� �������� ��� �� �� ��1������������������������������ ����������������������������dfs����������� �������������dfs�#���!�������� ��������������1��!�plfid��� �������1��!������������ ��������� � !�plfid������������������������������('pen1'!�'pen2'!�'pen3'!������������ ��� �����������

#���0�������'��

���dfww�� ���������������2'!��2��'�,�9�;�<��������������������1��������������� ������������ �������� ��������������������������������1���� �����������

������������������!�dfww�����dfs������� ��������������������������������

���pfww�� �������� ��������������1���������� ������������ �������������dfww�#���������pfww��� ����1�������� ��� ��������color��������

/!) '��������� ��������������

����������������� ��!������������ ����$�������� ��������������� ����������

� �������������������� �������ds!��������������������$����������� �� ����������4����������ds��������������� ����� ds<(index)>� �� �������������������������� �� ��������� �������� �� �;����!����� ��������4�������& �������

A���������6-�������� ��������������������� ���������������������$�������

��������

Page 227: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

'���������"�� ���������������%���

M� ������� �ds!��������� ������������������������ ������5-��

������� �� �������������������1������$�4��%��������������A������������ �� �����

���� ������������������� ��� �� ��������� ������ ������ ����� ������ ����������E

� ������ 1������$�%��������������� �����������&�����

$������cz<(freq1,freq2,...)> ��������������� ����

ds<(index)>, ds<(options)> ����������������

inset ����������������������

����������cr�P����Q �������� �� ���� �

delta�P����!����=9Q ������� ���� ��0�������� �

intmod�PB ��B!�B����B!�B������BQ 1��������������� �

io�P,�� �',,!������Q 1������ ����

is�P4�� �4:Q 1����������

lp�PR65,,�� �I65,,!�������Q ����/ ������� ��������������������� �

lvl�P����Q S / ���������� ��� �

lvltlt�P����Q � �� ��������$���� ��lvl�����tlt���?�������

phasing�P4,�� �4,,!��� VQ � �� ���������� ���������������$��������

rp�PR65,�� �I65,!�������Q S / ������� ��������������������� �

tlt�P����Q ����/ ���������� ��� �

vp�PR',,�� �I',,!������Q @������� ���� �� ��������

vs�P4R5�� �4:Q @����������

���������� 1������$�%���������������ds�� �����

Page 228: Getting Started with VNMR 6.1C

��7 + ���' �5�����' �)#���%����

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

������� ��� �����1������$�4��%��������������A��������� ������ �� ��E

$������������$���������� ��������'�����

������ ����� �� �������� $�������� ���� ��������������������� ������� ���

�������$��!��������� ������� ������������� ������������� ���������������

� $���� ������ ���� ������������cr��������������� $���� ���������� �

&��������������� ������� ������������������� ������ �� ��������� ����� �������

��� ��%���0��������� �� ����������� ������� ��� �� ������������������ ��� ����

��������������������� �� �� $�� ����� ���� ������������delta������������������� $���� ��������� ������ ��������� ������ ������ ����� $��� ����

���� ������������� ��1��� ������ ������������!������ �� ���������� ������� ��

������� ������ ��� ���� $�������������� ������������!����������cr������������������������delta����� ����������

���������� ������� ��� �� �����������������������&��������������� �����������

$����������� �������������������vs��� �����?������ �������������������������������� ���� �� ������ ���� ��0��������$������� ���� �� ������ ���� ���1�����

��� ������������������������������������� ������� ����������!����������������

�������is�����������?������ �������������������������������� ���� �� ������ ���

4'���!���������"�!��5�-����������6�,���",!"���"�!��%�������!"��'����-����$������ �,�7

� # ������� ����� #�� ��������� ���� ��

��� ������� ������� �� ������� ����� �

4'����$�",������"�!������"������6�9�����"������6����������"������6�,���",!"���"�2'!$'�!"�������

,!����%� �,��%�������!"7

+ �1����� =���������������������

�����1����� ��������������������� ���

&���1����� ��������$�� ����� ��

4'���'!�,������"�!���-��",����9���6�,���",!"���"�!��%�������!"��'����-����$������ �,�7

>#���� >#�������������� ���������� ��� ��������������� �������

���� %������������������� �����������������������

4'���� �!"!"�������"��,��"���$'�"���������7

����� �������������$������������ ������ �!���������� ��

A�� 1����������������� �� �!����� ���� ������������������������������� ����

������������������������ �������mark1d.out������������#���������� ����������! /home/vnmr1/vnmrsys/exp2/mark1d.out)��1��������������� #�� �!����$����� ��� ������ �� ���� ��!�����������

��������� �������#���������������� �!��������� ����������������

������ �������������������������� ��������

&��� �������������$���������� �!���������� ��

�� � ���������������� ����� �9 �������� ���������� ������� ��� ���� ��������

��� �������� ���� ��� ���� ������������� ������� ����?��������

����!������������� ��

��� �������������$������������ �!����� ��

����� � ���� ������ �������������� ����������� ������������

L$�*��� ����������$�9 /���������/ ���������� ��� ��� �!����� ��

%��1�� %�����$���� ������������

.� %����������������

�&� # ������&� #�������������������������!,�7�<!+�!,��

.��� .����� �����������������$��� �������ds�

Page 229: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

� ��0��������$������� ���� �� ������ ���� ���1������ ���� ������ ���� ������

���������� ������������!����$������� ���� �� ����������������������?������ ����$������

� ���� �� ������ ���� ��������������������������io�������������������������� �vp������������������ ������������

'��������� ��������#��0��%���

������������� ������$�����������$������������ ������ ���+ ���� ���������

������������������ ������� ���������� ���?����������������0����� ��������������

��������& ���� ������ ���� ������ ��� ���� �������������������� ������� �����

��� ������������������������������0������A $�������� ���� ��� ��� ���

� ���� ������������������������������������� ������� �������2���3������� �������

�0������ ���������� ���� ��� ���� ���

��������� ������� ���������� ���?������������� ����������������������& ���� �����

� ���� �� $�� ����������� ��������������������� ������� ������ �9 ���������

��$��������� �������������������� ���� ���A $�������� ���� ���� $� ��� ��

���� �9 �������� ��������?���������� ����������������������������� ������������

���������������� �����?������ ���������� ���� �� ��������������$��������� �������

� �������������������� ���� ������ ������ �9 �������� !�������������9� ��

�������$�������

'���������������%���

���&�������� ������������������$���������� ��������������������� ���������

����������� ��������������������� $���

& ���� ������ ���� �� ������������� �� ��������� ���������������� �����

������!��� �����������$�����������������!������������������� ������� �����

� �9 �������� �������������������� ���� ����� �$��������� ��������������� ��

�������� ������ ���� ������������� �� ���������������������������������

�������� � !������� � ����������������!����� ������������������ ���������

�������$�����������+ ��� $�������� ����� $� ��� ������ �9 �������� !�����

������������ �$��������� �!��������������������� ���������� ���������?�������9 /

�� ��0����/��������������������rp��������������� ����� $����� �9 �������� ������������rp����������� ������ ���� �� ����������!����������������� ������ �9 �������� �����������rp�������������� ���/�� ������ ���� ����&����������� ���� ������� ������ �9 �������� ������������������������� �������

�� ������������������

�������������������� �� ������ �������� �����������������$����������������� ��� �

� �� �� ����������� �� ����� ���� #�������47,°�� ������������ �!�����',°�� ������������� �!���������� ������� ���������������� �����2� ��3���?����������������

���� �����2���3���?����

���������������� ���!� ��������������� ���������������$��������� �������

������������ ��������������������������������� ��������������� �����

� �� ������������ ����������phasing!��������������������� ������������������ �����������phasing=20����������� ����',V� ���������� ���������)�phasing=70�����������(,V� ���������� ��������������$���� ��phasing�����$��������4,�����4,,��� ������������ ����������������� �������������������� ��

��� �����������

+ ��� $����� ���� ��� ��� ����� �� �����������!�������������� �����

�������!� ���������$��������� �!������������������� ������� �������������0����/

�������������/� ��� ������� ������������������������ ���������������������

Page 230: Getting Started with VNMR 6.1C

��7 + ���' �5�����' �)#���%����

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

� �9 �������� ������������������������ ���� �!������� ����$��������� �������

����������� ���������� ������ ���� �������� ��������� ��� �� ���������/ ��

��0����/������������������lp������������������ ���������� ���� $� ��� ������ �9 �������� ������� �������� ������lp!������������� �������rp�� ������������������������ ������$� ����� ���������������$��������� ���������

����� �������������� ������������� �������������������������������� ������$���

��?��������� ��������rp�����lp�������������9 / ��� ��� �!������������ ������������2� ��3���?���!����������������� �������2����3

>������������ ���� ������ $�� ������ ������� �$��������� ���������� ���

���� �����������!�������������� ������������� ������ ���� ���������� �9 �����

����$��������� ��������������%���0��������/ �����������������������9 /

�������� �����?�������������������������������������� ������$� ����� ��

�������������$��������� ��������� ��������1��� �������� ������ ����9 / ��

������ ��� �!����&�������� �������������������������

���������� ������� ����?��������$����������� �������������1�������� �!����������

��������������� ��� ��� ����������� ����������������� �� �����!�� ���� �����

� ���� ��������$��� �� ���������������� ������!���������������������� ��������

��$�����$������������������������������������������ �����������������

�������������������� ���� $� ��� �������������� �� ������$�����������

� �#�������������$���������� �!������� �������� ��� ��������)������������� ��

���� � �� #������������������ ������� ������� � ����� �������������

'���������'�������������%���

����������� ������$��������������$������������ ���+ ���� ��������������

�������� ������� ��������������������������������� ���� ��� ���� ������

������ ������� ��� $����������������� ����� ���������� ���� ��� ���� ���

���������� ������� ����?������������!������������� $��

����������� ��� ����$�� �������������= �$!��������������������������������

2������3�� �!����� ��������������� ������������������ ����������� ��������

����������� ������� ���������!����� ������cz�����������)�� ������� ������� $����� ���������� ��

'���������2�������������3�����-����$��������%���

���L$�*�������� ������$�����������$�9 ���������� ���������� ��� ��� ������

9 � ��� ��� �����������������lvl������)��������� ��� ��� �����������������tlt��������1��� ����������������������������$�*�������� ���������$���!����������������� �������������������

& ���� ������ ���� �� �������������� �� �������!��� �����������$��������������

���!������������������� ������� ������ �9 �������� �������������������� ���

� ����� �$��������� ��������������� ���������� ������ ���� ���+ ��� $����

���� ���� ���� $� ��� ������ �9 �������� !����������������� �$��������� �!�

�������������������� ���������� ���������?�������9 / ���������� ��� ��������

lvl��������������� ����� $����� �9 �������� ������������lvl!����������������� ������ �9 �������� �����������lvl��&����������� ���� ������� ������ �9 �������� ������������������ ������� ��������� �������������������� ��� ��

$����

+ ��� $����� ���� ��� ��� ����� �� �����������!� ���������$��������� �!�

������������������ ������� ��������������� �9 �������� �����������������������

Page 231: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

� ���� �!��� ����$��������� ������������������ ���������� ������ ���� �!�

������������$��������� ����������������������������� ������� �����lvl���������������������� ��������� ��� �� ���������/ ���������� ��� ��������

tlt������������������ ������� ������� ���� $� ��� ������ �9 �������� ������� �������� ������tlt!������������� �������lvl�� ���������� ���������� ��� ��������������$��������� ������������� ������$� ����� �������������� �������������

� ������������� �������������������������������� ������$�����?��������� �

�������lvl�����tlt�������������9 / ��� ��� �!������������� ���� ������� ������ �9 �������� ������������������ ������� ��������� �������������������

� ��� ��$�����

>������������ ���� ������ $�� ����������� �$��������� ���������� ������� ��

���������!������$����������� �9 �������� �������������������������?�������

���������������?������� �������lvl�������������?�������� ������lvl�����tlt��������

����������������� ������� ���� �����?��������������� ��� ������������������

�����������������$���������������� ��������������������� � ���������������������

������������ �!���������� ������� ���������������� �����2� ��3���?����������������

���� �����2���3���?�������� $����������$���� ��������?��������������� ���� �� ����

������������lvltlt��������������������������!���������������$���� ��4�,!�� ������9� �������������� ���������������!�����lvltlt����������4�,��� ���$������ �� �!����lvltlt�� ��������,�,�����4�,��

���������� ������� ����?���������������������������is�� ����������� ������������io�!�#������������$�����������������������

� �#�������������$��������� ��� ��� �!������� �������� ��� ��������)����

��������� ������ � �� #������������������ ������� ������� � ����� �������������

���������'�������4����

4� & ���� ������� � $������������� �!����������������%��1������� ��� ��������E

Current integral is xx. New value?

'� >������$����� �������� ��������� ��������������� ��

�����������������������

4� & ���� ������� � ������������!����������������.������ ��� ��������E

New reference value (in ppm)?

'� >������$����� �������� ��������� ����������

'���������'����������

���inset�� ���������������������� ���������������������� ���� �����ds����������������$������� ���� �� �����inset����������������������� ��� �/0���� ����������� ������� �������������� ������ ���������������� ��������!��������

��������� ���������� �� ����� ���$����� ������������������1������!�����������

������������������������������������inset���������

Page 232: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ���' ������%��������$�* �

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

�����������inset!�� ������������������������������!�#�������!� �$��� ������������������������������� ������� ����������� �� ����������� ������������������������

��� �� ��������� ������ ������ ����� ������ ����������E

�������� ��������� ������ �� ��E

;����� �������������inset��������!����� ������� ��������� ������ �� ��E

K �������� ������� ��� ���� ��������� � ����� ����� ���1������������ �!����

�������� ����?����������������� ���� �� ��������������1������������ �!������������ ��

��?�����������������0�������������������

K �������� ������� ������������$����������� ������������ ��������� ������

���� ���� ������������� ���� ���� ���1������ ������ ����� ���� �������������

��� �����������!����� �9 ������ ���� �� ������������ �������������?�����

K ��������� ������� ��� ���� �������� ������ �����$�� ������������ ��1��������

���� �!������������� ����?�������������� ������������� ����������1�����������

� �!������������� ����?�������������� ���0���������������

/!* ������������������������

�����68����������������������� �����������������!����������65�������� �������

����������� ������������� ������ ���������

����� �������� ��� ��������� �����������68�������� ���������������� �����

����� ��� ���������������� �����������65��

�����������������

&�������������� ������ ���������������������� vs!�sp!�wp!�vp!�cutoff! th!�axis!�rfp!�����rfl.����s!�fr!�����r���� ����� ��� �����������������������������������E

K ���s���� ���$����� ��� ����������$����� ��������������������������������������������M��� �����������������$�!������������������4!���!�'!��������s�

4'���!���������"�!��5�-����������6�,���",!"���"�!��%�������!"���-����$������ �,�7

� # ������� ����� #�� ��������� ���� ��

��� ������� ������� �� ������� ����� �

����� ������� ��� ��� �������������E

����� 1������$�����?��������� ��������������������������� ���������

4'���'!�,������"�!���-��",����9���6�,���",!"���"�!��%�������!"��'����-����$������ �,�7

>#���� >#���������������������� ��

���� �������������������

4'���� �!"!"�������"��,��"���$'�"���������7

����� 1������$�����?����������������0��������������� ���0���������������

������������

�� � &� �����������!����������������!�����������������������

�� .����� ����ds��������� ��������������������

.��� .����� ����4����������A���

Page 233: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

� ������ %��������������� �����������&�����

�� �",�ai %������� �������������� �

center %������������������ ����� �����

crl �����������

dll* �������������������0�������������������

dpf* �������������0������ $�������

dres* A�������������������������� ���� �

dscale* ��������������� ��������� ��1�

dtext<(file,x,y)><:xn,yn,inc> �����������#������������������������ �

f %������������������ ������������

frset_number, fr(set_number) ���������� ��������������������

full %������������������ �����������

left %������������������ ���������� �����

nl<:height<,frequency>> & ���� ����� ������������

nm %����� ����9������������ �

noislm<(max_noise)> ��?����$������������ �������� ����$�

rset_number, r(set_number) .���������������������

right %������������������ ����������� �����

rl<(frequency)> %���������

sset_number, s(set_number) %�$�����������������������

setref* %���0������������� �� � �������

setoffset(nucleus,ppm):offset ��������� ������0������ ���$����������������

split %������������������� ���� �

thadj* ��?�������� ���� ��������� ��

tmsref:tms_found .������������ ��A%

vsadj<(height)> ��?����$����������

vsadj2<(height)>:factor ��?����$��������������� ��� ����

vsadjc<(height)> ��?����$����������� ����� �������

vsadjh<(height<,do_not_ignore)> ��?����$����������� ��� � �������

zoom(width) ��?������������� ���$�������

* dll<('pos'<,noise_mult>)><:number_lines,scale>dpf<(<'noll'><,'pos'><,noise_mult><,'leader'><,length>)>dres<(<freq<,fractional_height>>)>:linewidth,digital_resolutiondscale<(<axis><,vertical_start><,display_start><,color>)>setref<(nucleus)>:$rfl,$rfp,$reffrq,$refposthadj<(maximum_peaks<,noise_mult<,llarg1<,llarg2>>>)>

���� �����aig�PB��B!B��BQ ��� �������������� ��

axis�PB�B!B�B!B�BQ 4���#��������� ���������������� ��

cutoff�P����!������Q ������������ �������

cutoff�P����!������Q ������������ �������

dmg�PB��B!B�$B!B��B!�B��BQ �������������� �!�������������������� �

rfl�P����!����=9Q .��������� ���� �

rfp�P����!����=9Q .���������0����

th�P,�� �4:!������Q ���� ��

vp�PR',,�� �I',,!������Q @������� ���� �� ��������

vs�P4R5�� �4:Q @����������

wysiwyg�PB�B!B�BQ %���� ���������� �������������

Page 234: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ���' ������%��������$�* �

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

� ����������������s#!����#������������� ��4�� �:� ���������������������!�����!�������s3���$�����6��

K ���fr���� !��������fr#!����#������� ��4�� �:�����!�fr3�!��� ��������������� �������������������#!����������������������������� ��� ��$������

K ���r���� !��������r#!����#������� ��4�� �:�����!�r3�!�������� ��� �������������������#�#���������������!������� ��� ��������!�����������������!����������������

���$������� ���� ���������� ����������������������� ����� �� �� ����������������

���������vp�����������cutoff�������������������������� $������� ����������$������� ���� ���������������������������������� �#����! cutoff=50���������������������vp+50��������vp-50����

4������� �������5������

�� �$��������������� ������$������!�� ����9��������� ������������E

K ���nm�� ���������������"�� ��!#�,�,!����%� �,�������������������������� �����������������������������������vs����������

K ���ai�� ������������������������!"��"�!�%� �,��������������������������� �������� ���������� ����������������� ���� ����� �� �������������� �� ��

�������� ��� ����

���� ��������������#�����$<���������������������������� ����9�� ���� ���/

������������������ ������aig�������� ��������������� �����ai� �nm�� �������1��������0�����aig?��� ���������������������� ���������$�

���vsadj���� ���� �����������������$�������������?�������vs�������ai�� ��� ����������������������0.9*(wc2max–vp–sc2)������������������#����

� ������ %������&� ������� �����������&�����

$������aexppl<(expansion_factor)> ��� �������� �� ���������#����� �

pl* &� �������

plc<(pltmod)> &� ����� ��������

plh<(pltmod)> &� ��� � ��������

pll<(x,y,minimum_y)> &� ������������

plp<(pltmod)> &� ���� ��� ���������

plot ��� ������������ �������

plot1d &� ��������� �� ��������� �/������4�������

ppf* &� �������0������ $�������

pscale* &� ��������� ��������� ��1�

* pl<(<start,finish,step><,'int'><,'all'><,options>)>ppf<(<'noll'><,'pos'><,noise_mult><,'top'>)>,ppf<(<'noll'><,'pos'><,noise_mult><,'leader'><,length>)>pscale<(<'fid'><,axis><,vertical_start><,plot_start><,pen>)>

����������hzmm�P����Q %����������� �� ��� ��

pltmodG &� ������������ �

sp�P����!����=9Q %���� ���� �

wp�P����!����=9Q ;����� ���� �

* pltmod�PB ��B!B��#�B!B����B!B�������B!B��B!B$�����BQ

Page 235: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

vsadj<(height)>��1������height��������������� ���������������������!������!� ���������������������������������� �� �� ������������

������ ��vsadjh�����vsadjc������� ������������vsadj�#������������� �$��������A%�������������������� �����������$�� � �� ���� ��������� ����$������

�������?��������vsadjh���� ��������do_not_ignore _solvent��������������������vsadjh����� ���� ������������ �$������������ �#����� ��������A%�����

���vsadj2���� ���?��������$��������������� ��� ���� ����0����� �#����� ���� ������������#����vsadj2<(height)>:scaling_factor������������height���������������������vsadj��scaling_factor������������ � ��������� ������ ���� ���$���� ��vs�� ������� ��������������� �

���noislm���� ������������ ���������������������������������$�����������vs��1������ ��������������������� ��������!�vs����������� ���������� ��������������������� �/���/�0���� �����9)�������/� /����� ���������� ������ ������������

�� �������������$��������� ����������������������������������$����� ��� ��8V�

�� ���������������� ������������������������� ��������������������������������

� ���������������!�������� ����������� ������������������������� �����

�������������� ����������������� �������������������� !���������������������� ��

������������ ����� ���������������� ��noislm����� ��� ����������!�max_noise!������������ �noislm��max_noise���������#����� �/���/�0�����9!������!� ������ �����������������'���

+��+����

���nl�� ������� $�������������� �� ��������������������������������������0���������=9����������

���dll�� ��������������������0����������������������������� $������� ���������������������th���������� ������������������������� �� ��������������������������� ������������������ �������0�������� $�th������ ��������llfrq���������0�������������������������������axis���0���������� �����=9�������� ����?���������������rfl�����rfp������������noise_mult�� �dll������������������ �������������������$���� ��noise_mult����6����������$�������������� �����!�������$��������������������!�������$���� ��,�,������������

������������� �������������������� $�th���������� ������������������ $�th������ ��������llamp���������������������� ��������������������� ����$���)�������� �����������vs�

���thadj�� ��������?������������ ���th�� ��������������������#���

thadj<(maximum_peaks<,noise_mult<,llarg1<,llarg2>>>)>

��!����maximum_peaks��������������#���������� �������������� $�������� �����������������wc*4�!�noise_mult������� ����������������� ���������������������$����� �th�� �������9� ����� �/���/�0���� �����������������6�!�����llarg1�����llarg2������������ ����noise_mult���������� �!������$��!������ ����nll�� ����������������thadj��

���dpf�� ��������������������0�����!������������������������axis������!� ����������������!��������� ������ ����������������th��������� ������ ��� ���� �dpf���'noll'!�'pos'!���� noise_mult.����� ������dpf('noll')���������������0���������������������$� �������������������dpf('pos')����������� ����$������ �������������0������������������������������0��������ds�� ������� �����������������0����������noise_mult����������������� �����������������������$����������$��� ����dll�� �������� $��� �� �� �������� ���� ������$��������� ������� ��� ����'leader'!�'top'!�����length���������

Page 236: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ���' ������%��������$�* �

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

���dscale�� ������������������������������������ ��1�����������#���

dscale<(<axis><,vert_start><,display_start><,color>)>

���axis�����������������!�vertical_start�������$������� ���� �!�display_start�� �������������� ������� �!�����color�������� � � ����������

+����������

���dres�� ������������������� ���� �� �������!�������������������������������� ���� �� �����������!������������������������� ������ ���� ������������

������������������/��������� ���������� ���������/�0�����

��������

@+A.��0�������������������� ��������� ��������E

���rl�� �������������� ������������������� ������������� �� ���� ���1��� �������� �������������������� ��������� ���� ��������������!������������

nl�� ������� ������������ �������#����� ���� �� ������������1��� �������������$�!�rl������������������ �� ���� �������������0����E

reffrq = sfrq + (cr + rfl - sw/2)/1e6

�������������!�rfl�������� ������������ �������� �� ������������� �����������!����=9E

rfl = sw/2 - (sfrq - reffrq)*1e6

�������������rfp�������� �,!�����������$��������������������� ������ ���� �� ����������0�����������

��� �����!�rl���������� ���� �� ������������!����=9!���������������� �#����!����� ��������� � ���������� ������� � ����=��6��� �$������!�� ��� ����

� ���� �������� � ���������������������nl rl(7.24p)��rl���������������������� ������� �� ���� ����

absolute_cr = sfrq + (cr + rfl - rfp - sw/2)/1e6

���������������������reffrq���

rfl ������"$���!"��R�����������!����=9!� �������������� ����������

��� ���������������� �������������������������� ���� ������� ����

�����������1������������������ �����0�����������������������A%�!�

��������������������� �$�������������������� �������������������������!�

���� ���� ������������������� ��#���������������� ������

rfp ������"$�����!�!�"�R����������������������������������

�����0������9 �� ���� �� ����������!����=9��1��� ��������

����������������������� �����0������������!����������A%!�����rfp����,������������� ����������0������ ������������� �����

����������rfl�-�rfp�

sfrq =��$��� ��������+��"$%�R������� �����0����!����A=9!� ��������� ��

������������������������ ���� ����1�� ��� �������������$����

�����sfrq������!�� ���� ����������spcfrq�� ������

reffrq ������"$�����+��"$%�R�����0����!����A=9!� ������0������������!�

���!����9 �� ���� �� ������0���������!��",������$����������� ����

��������� �� ������������

refpos M��� ����� ��������� ���������������� ���������� �9 ��1����� �

�������������������������������� ��� �� ���refpos='n'��

Page 237: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

reffrq = (1/(1 + (argument_1/reffrq)/1e6))*absolute_cr

refpos�������� �,!�rfl�����rfp����������������� �� ��E

rfl = sw/2 + (absolute_cr - sfrq)*1e6

rfp = (absolute_cr - reffrq)*1e6

���crl�� �������������������������� $����������������������������1����� �����refpos='n'������� ��������������������� ���� �!�9 ��0������������������������� ������������

���tmsref�� ����������� �� �������A%������1��� ���!�tmsref�/���������������� �����A%����������������4�� ��������������� )����� ��� ���!�tmsref������,���������������������������������1��������� �� ���������������!�� ������� �������

����������� �������� ������A%������$��������������������������������!�

tmsref������$ �������� ����������������������������������� �������������������!����� ��������������������4,V� ����������%�/�=6���������L������������������,�5������ �

4=�

� �5������ �46���� ��������� ���A%������������ ������������

���setref���� ���?���������������� ���������� �$����0��������� ����>$������� ���������������������������������!�setref�������� ����� ������0������������������ ���� � ���0����� ��4,,�,,,,,,,�A=9���������������������

/vnmr/nuctables/nuctabref!�������� ��������� ���'8� ������ ���� �� ���������setref�������������#������� �� $����� ����������������)������� ��� ��� �#�����setref������$������������ ���������/vnmr/nuctables/nuctabref�

The setref���� �������������������������� ������������������ ���� �$���������������/vnmr/solvents���1��� ����� ��������� ���� ������������������� ����setref!�� ������������������������ �������������$� �������?������ ���������� ����0�����

��� ��� ������������������ ������������������������� ������������������ ��������

��?����!�� ����� �� ������ ���E

4� 1������������������������� �$���

'� ��?����z0�� �lkof�����acqi�� ���������� ����0�������� ��� �����

6� %������ ������� ���

-� 1�������� ��������������

�����������������!�setref�������������������� ����0����!����A=9!���

lock_frequency = lockfreq + lkof/1e6

� �� ��� ���������!����� ����0��������0����� �lockfreq!�#����� �M+1�"�����@N./%�������!������������������������� ��lockfreq��

setref�����������������������������0����!������ ������������������� �����'=�� �����������lock_shift�!����������#������� ���������/vnmr/solvents����������solvinfo�� �����E

h2_ref = lock_frequency/(1 + lock_shift/1e6)

������������0����� �������������0��������������,����������������������

��������M����������� � �������� ��������������� ������0������� ��������

�stdfrq_h2������� �����������������stdfrq_tn�!����reffrq������������ ��������������������E

reffrq = h2_ref*stdfrq_tn/stdfrq_h2

+ �!�rfl�������������������

rfl = sw/2 - (sfrq - reffrq)*1e6

Page 238: Getting Started with VNMR 6.1C

��� ���' ������%��������$�* �

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

rfp�������� �,��������� ������0�������������!�����refpos�������� �,�������������$���setref���������$����� ��rfl!�rfp!�reffrq!�����refpos�� ��������������� �

����������� �����setref���� ����� �������������������������� ������������������� ������ ���� ��������!���������������� ������ ������� �����������������

� �������������*���������� ������ �� ����������������������setref��� ����� ���������������� ����� ���� ����������tmsref�� �������������������������� ��� ������������� ���� ��

setref����������� ���������)�� �$��1������ ������� ���� ����setref�� ������������� ���� �������������0��������������� ����� ����������!�

� $����������� ������������ ���� �����������������������������������!���������

acqi������ ��������������������������� �������?������������������� ������������� �/� ������+ �!�� ��������0������������� ���� ������������������������������

�������������setref!�� $�������solvent�������������� ����� �$���������������������� ���� ��

���setoffset���� �����setref�� ���������� ������0������ �����������������

������ ��setref1�����setref2�������� ������4������'��������������� ���������!������$���������������2�0����/�$���3�������������������tn�� �� � ��������������!�dn�� ��4������ ������'�������!�����!������ ��������setref������������������������������� ������������� �� �������������������

��������������

���pl�� �������� ������������������������ �� ����������������$�������!� ��������������������� ������ ��������would������������������������������������� �����������pl('int')��� ������������� �����pl('pen2')��� ���������������������������'� ���������/����� ���

���pscale�� �������� ��������������������������������#���

pscale<(<axis><,vertical_start><,plot_start><,pen>)>

1���������p!�h!�k!���������������������� ��� ������������ �axis!�������������������� ����������$���� �����������axis����� ��� �����������vertical_start����������$������� ���� �����������������������������������8������ ����������

$���� �����������vp�������� ��� ��� ���������� plot_start����������������� ����������� ���� ������pen� ��� �������������������� �������

���ppf�� �������� ��������0�����!������������������������axis������!��� $��������!��������� ������ ����������������th�������ppf('noll')��� ��������0���������������������$� ��������������������ppf('pos')��� ���� ����$������ ����� ������������ �� ���������� ���noise_mult������������ ���� ������ ���������������dpf�� �����!���������� $�

���pll�� ������� �������� ��������������� ������ ��!��������� ������� ��������� ������������� ������������ ����������� ��������� ���������� �����!��������� �����

����� ����������������#����pll<(x,y,minimum_y)>�������������x�����y������-�������� ���� �� ������������� �������������!�����minimum_y���������������%����������� ���������� ����� ��

���plh�� �������� ������ � �������������� ���������pltmod�����intmodE

K pltmod='off'������ ��� ������

K pltmod='fixed'������sp�����wp��������

K pltmod='full' ��?�����sp�����wp�� ��� �����������������

Page 239: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

K pltmod='variable'���?�����sp�����wp�� ��� �� ��������� �� ��������

K intmod='off'���$��� ��������

K intmod='partial'���$�������� ���������� $������� ��

K intmod='full' ��$����������������� $���������������

%�������!�plc��� �������� �������������plp��� ������� ��� ��������������� ������������pltmod�����intmod!������������� $��� �� ������ �!���������� ����userplc����pltmod='user'�

D�$�������������$������� ��� ���������region�� ������ ���������� ��������ds�� ���!������� �aexppl<(expansion_factor)>��� ������ ���������������� ��������� �9 ����������0���������=9*�����������������������'�=9*���

%$���������� ��������� �!���������plot�����plot1d!����$������������������������9���� ��������� �!��������� ��������������� �� � ������� ��������� ��

�����������#�������� �������!������� ���� �",��",����� �����������"$��

�������+���

������ �������� ����������� ���������������������� ��!�����������sc!�wc!�sc2!�����wc2����� ���������������� �� ���� ���� �������������������������������!.��� ���� �� �������������full!�center!�left!�����right�� �������� �� ������� ������� �����sc!�wc!�sc2!�����wc2 � ����������������������� �������������� �� �� ���������������������f�� �������������� �������sp�����wp��������� ���������������������������zoom(width)���� ���?������������������������ �����������������!����=9!������������������� �±width/2����� ��$�������������split���� !�������� ���� ���������/�������� ������������������ �������� ���� ���������� ���� �� �����

������� �

�������������� ��������� �4���� ������������hzmm������!�������� ����������0� ����� ��wp���$�������wc�

���wysiwyg����������������� ������������������ ������������ ��������� �����������9��������� ���%������wysiwyg='n'������������������������wysiwyg='y' �������� ����������������������

/!6 '�������

��������� ������������ �������� ���� ������������������ ��������������������6(�������

���������� ��� ������������������������������������� ��

��������'�������� ����,�� ���

���� �� �������� ����� ������$�� ����� �� �������� �� ����� �������� �

������������� ���!������� � �������������������������������E

rt('/vnmr/fidlib/fid1d') wft full.

��)��� &*�

4� ������ ���������

���4��������������������������1���������� ���������������'!�6!�����-�

'� ������ ��� �� ���W��������W��������

Page 240: Getting Started with VNMR 6.1C

��� + ��� �*

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

6� � ��� ����������� ��� �� ���W����W��������

-� ������ ��� �� ���W��� �!"�W��������

8� ������ �������

���4���������������%� �����A���������

5� ������ ��!����� ���

����#������ ������������������ �������������������

�)�����) *#� ����� &*�

4� >���intmod='partial' region.�

������������������� ������������� ������ ����$�� ������������ �����

��������!��������������������� ����������� ������ ���������� ���

'� � ��� �����>���bc.�

�������/������������ ��� ������� ���� �� ���������������� �������������

6� >���isadj��

���������������������?������ ����� �������9�

-� >���dli�

����#������ ������������������ �������������������

� �����# 1������������������&� ������� �����������&�����

$������bc* 4���������� ��� �

cdc ������������ ��� �

cz<(freq1,freq2,...)> ��������������� ����

dc ���������������������� ��� �

dli ������������� ���������

dlni ������������� ��� ����9���������

dpir ��������������������������� ��������

dpirn ��������� ����9��������������������� ��������

isadj<(size<,neg_size>)> ��� ��������������������?������

nli ������������$����

pir &� ��������������������� ��������

pirn &� ��� ����9��������������������� ��������

region* ��$������������� ��� ��

z<(reset1,reset2,...)> ��������������� ���������� �� ���� �

* bc<(<1|'unbc',>nsubregion<,minpoints<,minregion>>>)>region<(tail_length,relative_num,threshold,num_points,tail_size:<:num_regions>

����������dcg�PB��B!�B���BQ ������ ��� ��� ��

ins�P����Q 1������� ����9��� �������

intmod�PB ��B!�B������B!�B����BQ 1��������������� �

liamp�P�����Q ���������� ������������� ����

lifrq�P�����!����=9Q �0������ ������������� ����

lvl�P����Q S / ���������� ��� �

tlt�P����Q ����/ ���������� ��� �

Page 241: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

��)����� &*�

4� >���cz��

���������������������������� ������������

'� >���intmod='partial'��

������������������� ������������� ������ ����$�� ������������ �����

���������

6� ������ ��$�%��W��������

-� �����������&������������������� �������� ��������/� ���� ��� ��������

��������������������� ������������ ����������������� �� ����������" ������

� ���� ������ ������ �������$������������������ ���� �� �����

8� �����������&������������������� ��������� ��������/� ���� ��� ��������

��������������������� �������������� �� �������

5� .���������-�����8�� ������ ��� ��������� ��������������������� �����

�������������������������������������1���� ����������?������ ����� ���

����� ��������������������!�������������� ��twice����������������������������������2������3��� �� ��9 ��������

+ �������� ��������� �add������� ��������������������� ������������������������� ����������������region�� ������

(� >���vp=12��

����������� $������ ���� �������� ������������������� ����������

7� ���������'������� ������� ���� $������������ �����������������������

�������?���������������$�����������

:� >���ins=x,����x�������$����� �������� ��������� �������� �������������

���$��������������� ���������� �����!�� ��������� ������������

4,� >���dpirn�

����#������ ������������������ ��������������������������� ����������������

� ����9��� ����$���� �����������ins�

-������$�������

��� ������� ����� ���� ����� ��� ����������������2� �3���������L��������!�

������� ��!�� ���� ����������!�'��$ ����������� ��!����!��������������������

� ��29 3������ �� ���� ���������������?���������1���������������� ���������

���� ��2� �!3�� ���� ����������� ������������ ��� �� ���� ���� ��� �����

��������������� ����� ������ ���������� ��� ����� $���E����������� �/�����

���dc�� ����������� ����������������� ��� �!�������������������������� ���������������������� ��������������������� �������� ��������� ��� ��������������

� ������������9 / ���������� ��� ��������lvl�����������/ ���������� ��� ��������tlt�����cdc�� ����������� ��������� ��� ������������ �����dc� �cdc�� ����������� ��������dcg������!�������������0�����dcg?��� ������������������ ��� ���������$��1������$! dcg='')����������$!�dcg='cdc'�

���bc�� ����������� ��4������'���������� ��� ������4���������� ��� ������������ ��� ���� ��������� ��� ��� ������������� ������������������ ����bc�������$�� ���������!��������!��� ���������������������������

Page 242: Getting Started with VNMR 6.1C

��� + ��� �*

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

intmod='partial' ����������������������� �� �������� ������ �9 ����$����� �������������������� �� �� ���������� �����bc�� ������

� �� ���� ���� ���� ������bc�� �����!���� ��������� �bc�������� ���� �",��",����� �����������"$���

'�����������������

���z�� ������� ����0��$����������� ��������������������� �9 �������� ��������������������������� ��z(reset1,reset2,���)���� ������������ ��������� ������������ ������ �����!�������� ������������ ���� �� �������� ��.���� ������ �

� ����$�� ���������� �������������� ������0���������������� �����������

���������fn���������������� ������cz�� $�����������������������cz(reset1,reset2,���)��������������������������

� �������� ���������!����liamp��������� ���������������������������������������� ������������lifrq��������� ������0������ ������������� ������� ������������$����� ��liamp!����display('liamp')���0���������� �����=9�������� ����?����������������������rfl�����rfp�

'������������

���region�� ��������$������������������� ��� ���� �����������������$����� �������������������� �� �� ���������� �����region�� �����)������� ���� �",��",����� �����������"$��� ��������

'�����������������������

�������������� ������ ���������������������������� �����$����� �����������������

������ ������������� �� ����������������is������������������$�����?�������������ds�� ���������� !������� isadj(height)���?���������������������� ������������������������������� ����height�������������������������� $���!�� �#����!�isadj(100)�

���� ������dli����������������� ���������$���������������������� ����������0����������� ��������� �������������������������axis��������� ��������� �����=9�������� �������� �rfl�����rfp������������������� ������������$����)�������� �������������������$��������������������������ins�����insref��������� ������������������!�ins�������� ��������� ���������������$���� ���� �#����!�������� ����������������������� ��!����� �� ������ ����

� �������������������$����� ��������� �E

4� %��ins���

'� %��insref�� ����� ��/����/�����/$����� ��������������

6� >���dli������������$���� ��������� �����������������6��������� ����������$���������� �������������

1������$�������������������������$��������������ds�� ����������setint���� �������� �������� ���?�����������$�������������setint��������$���� ��������������������������� �?����� ����������� ������dli�� �������������$�����+ ����9���������$������������ ����������1����������!�ins����������� ��������� ����������������$�������������$������������������� �����������������0����� �ins������ ����9��� ������������������������insref�� �2� ������3�����������������������ins�����insref�

Page 243: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

�� �� ����������� ���������� �dliE

K nli����0��$������ dli�#���������� ����������������� �����

K dlni�� ����9�����$������ ��dli������������������ ����9��� �������������ins��������������������������

���dpir�� ������������������������������$������� �������� �������������� ��!��������������������������� ����������� ����$�� ��������������� ��������

� ������dpirn��� ������� ����9���������$��������������� � �������� ��

���pir�� �������� ������������������$������� �����������!��������������������������� ����������� ����$�� ��������������� ��������� ����d pirn��� ������� ����9���������$��������������� � �������� ��

/!7 ������

@+A.�� �������� ����� ����������������� ������!����������$� ���������� �������

�������������$����������* �� ����������������� ��������������������

�� �������$����������������������@+A.���������������� ������ ��!����� ���

���������� ������� ����� ���$���>������ ����� �������!� ���������������� ��

���������� ���!���������������� ����� ��������$���� ����������������67�������

� ��������������������� ������������� ������

��������3�����

&� ��������������������$� ��������� �� �������2�����3�>������ ��� ������� ��

2���3� ������ ������������� ����$����� ������� ���������� ���!������������S���

� �����( &� ������� �����������&�����

$������ap<(template)> &���� �������������

bpa:$sc2_minimum &� ��� #��������

hpa &� ��������� ������������������������

killplot %� ���� ��? ������� $�� ���� ��0��

page<(num_pages<,'clear'|file>)> %�������� �������������� ������

pap<(<template,>x,<,y><size>)> &� �� ���2���3�������

pltext* &� ���#�����

ppa<(x<,y>)> &� ����������������2>������3

setpen<(maxpen,max_num_pen)> %����#���������� ��=&����

setplotdev<:plotter_type> .����������������� ����������� ��

showplotq ���������� ��? �������� ��0��

showplotter ����������������������� �������������

vnmrplot <file> &� ��������M+1N�

* pltext<(<file><,x<,y<,width>>>)> <:$x_next,$y_next,$y_increment>

����������ap�P�����Q 2���3����������������� �� �

maxpen�P4�� ������ �����Q A�#���������� ������� ���

plotter�P�����Q &� ����$��

wcmax�P����!������Q A�#����������� ������

wc2max�P����!������Q A�#����������� ������������ �������� �

x0�P����!������Q N/9 �� ���� �� ��=&��� ��� �& ���������$��

y0�P����!������Q "/9 �� ���� �� ��=&��� ��� �& ���������$��

Page 244: Getting Started with VNMR 6.1C

��� $�* �

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

�� ��!� ��2���3���������������������$������� ��������� �����A�������� ������!�

��������������������������������� �������!������ ���� �������

���������������������� �� ������������ ���� ��������1��������� �� ���������� ���

�� ���� ����������������� �������������������������������� ������� ���

��� ���� �!���������������� ���������������������� ��� ����������������� ��

���������������������������!������� �� �� ��� ���� ��������������������page�� ������ page��� ������������������������������� ������� ������� ���0��!��������������� ������ ������� ������ �������page���� �0�������������� ���� ���� ����0����������������� �����������������

���M+1N�� ������vnmrplot�������������������� �����@+A.�������� ��� �������� ��������@+A.�� �����������showplotq���� �������������������� ��? ����������� ��0���� ��������$��� ����

� ��� ������ ������ ��������� ������������ ����$�� ������page�!�������� ������page('clear')�����killplot���� ��� �������������� ��? ����������� ��0���� ��������$��� ��!������ $�����? ���� ������� ��0����M�����������#�������

killplot����root!� �����������C���� ���? ����������� ������� ��0���

&� �������������� �������������� ��� ����� ���������������������������������� ����

page�� �������1����������!�&�L!�=&/DL!�����& ��%������������������������ ���� � ��� ����� � ���� ������ �������

��������$��������

���@+A.�� ��������� �����$����� ����������� ����$����������������

��������������&���� �������������������������������� ����� ������ ���!����

=&DL������������������ ��=����/&��������������� ������������������!����

=����/&����������� �� �& ��%����������������� �� ������������������� �

���������������������� ����������� ���E

K plotter�� ���������� ��� ������������ ����

K wcmax���������#������ �9 ����������!������!� ������� ������

K wc2max���������#�����$��������9!������!� ������� ������

K maxpen���������#���������� �������� � ����$������� ���� ����;������������� ���=����/&�������� ��!����setpen���� ���� ���������� ��������$�������������#���������� ������

����������plotter! wcmax!�wc2max�����maxpen����� ����������$��������� ������#��������exp1��� ����exp9999���������� ������wcmax!�wc2max�����maxpen�������������������� ���� �������� ��� �������$����������������������������������������#������� ���$����!������������ �!����� ����#��������

� �� �����=����/&����������� ���������� ��E

��������4%�� ������=!#� ��,��

����A��� ����> DraftMaster_A, etc.

����& �!�� DraftPro_C, DraftPro_D

=&�(-(8� � HP7475A

=&�(88,� �!�� HP7550A8, HP7550A

Page 245: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

���� �� �����=����/&����������& �����������������!����������������$����������

�� ���!������� ��)��������������������.������������������� ������ �����������

� �E

�������� �������� ��������#�����$������ ��� �������������������� �� ����E

��!"����4%�� ������=!#� ;���1!"$' ��,��

L��T�� 44�× 7!��6!��

48,!�6,,!�5,, LaserJet_150, LaserJet_300, LJ_B_300R, LJ_A_300R, LaserJet_600, LaserJet_600R

X���T�� 4-��44 :5!�4:' QuietJet_96, QuietJet_192

�����T� 7��44 :5!�4:' ThinkJet_96, ThinkJet_192

���T� 7��44 6,, DeskJet_300

& ������� 7��44 PS_A

& ������� 44�× 7 PS_AR

������� ��"�!�����!�"������ �-! � ��������������

��,� wcmax wc2max maxpen wcmax wc2max maxpen

HP7475A -,, '4, 5 -,, '4, 5

HP7550A8 '8, 488 7 '8, 488 7

HP7550A -,, '4, 7 -,, '4, 7

DeskJet_300 ',, 4-, 4 ',, 4-, 4

DeskJet_300R '-, 47, 4 '-, 47, 4

DraftPro_C 8', 68, 7 8', 68, 7

DraftPro_D 7,, -7, 7 7,, -7, 7

DraftMaster_A '', 4-, 7 '', 4-, 7

DraftMaster_B 6(, ''8 7 6(, ''8 7

DraftMaster_C 8', 68, 7 8', 68, 7

DraftMaster_D 7,, -7, 7 7,, -7, 7

DraftMaster_E 4,,, (7, 7 4,,, (7, 7

ThinkJet_192 ',, 448 4 ',, '-, 4

ThinkJet_96 ',, 448 4 ',, '-, 4

QuietJet_192 66, '6, 4 66, '-, 4

QuietJet_96 66, '6, 4 66, '-, 4

LaserJet_150 ',, 4,8 4 ',, 48, 4

LaserJet_150R ',, 4,8 4 '8, 47, 4

LaserJet_300* ',, 4,8 4 ',, '-, 4

LaserJet_300R* ',, 4,8 4 '8, 47, 4

LJ_B_300R -,, '4, 4 -,, '4, 4

LJ_A3_300R 67, '68 4 67, '68 4

LaserJet_600 ',, 4,8 4 ',, 4-, 4

LaserJet_600R ',, 4,8 4 '8, 47, 4

PS4079_HPGL -,, ',8 4 -,, ',8 4

PS_A 47, 4-, 4 47, 4-, 4

PS_AR '8, 488 4 '8, 488 4

Page 246: Getting Started with VNMR 6.1C

��� $�* �

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

(������������L��T��&���������������/� ���� ��� ����� ���� � LaserJet_300������ �������� � wcmax*wc2max<=200*105��1��wc2max������������� $�4,8!�wcmax������ ����������� ������������������� ��� ��� ��������������'/A������ ��#����� ������������������������L��T��&����

�������������������� ����

&���� ���� �����������#��� ���� ���� �������������������������T�!�L��T�!�

����!�������/� ���� �������������/� ���� ��� ������ $���E

K �������/� ���� ��� �������� ���� �������������������������!����!�

L��T�Y6,,���� ����������� �����/0�������4��+A.�������������������������

K ��������/� ���� ��� ������!�LaserJet_150���� ���������������� �'��� �� ��������

��������0����� ��� ����� ������������ ������� ���������� ��������������

��9� ���������$������$�� ���������������� �������������������!��������0����

� �� �������������������� �������9� �������������wcmax�����wc2max������ ������ ���� ����������/� ���� ��� ��������������� ���� ��������� ����������

�����/� ���� ��� �����������T���������L��T�����7�8��44���������

����������������

� �����A����A��!���������A ����� �!�� �� ������� �����!�����%� �� ������

�$���!���������$ ������showplotter���� �� ���������������� �������������� ��� �������� �����%����&� �������������� �������$�� ����� �����

�������$��!��������������� ������� ��!���������plotter='HP7550A'������������������setplotdev���� �� �� ���������������� �������� �������������� �������� �!�wcmax!�wc2max�����maxpen������� ����$���������������������� $���������� ������������ ������!��������� �����������$����!����0������������

�������������� �������� �����$���� ��!������������������������ �����������

�� ���������������

+$������������ ���� �������� ����������������� �� ���������� ���������!�

����������� ������� �� ������������ �� ���������� ����1���$����� ������

� ������� ���������!�������� ������� ������������ ���������� �����������!�$��

���������������������������������0���� ����������

����� ���� �������� ������� ������� ����$�������� ������������ !��������

������$����� ����� ���������� �!���������� � ������������� ����������� � �����

������������������� ���� ��������� ��#���� ��� ����������1������ ���

� �������� ��� ��������������������������� �� �����!����������#��������

����� ���!��������� ������$�������������������������#���� �� ������������ ����������

�������������������� ����� �� �����2�� ���3��������

$���������

���color�� ������� ���� ��� ����������� � �� �����@+A.������������������ � ������� ������� ������������� ����

� ���� ���� ���� ���������������� � �L��T������!���������5!�2&��������&� ���

%���!3�������� ���",�=����!��=���2�����"�������!�"��������

Page 247: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

� �� �� &��!*�*��$�*��#

� ���������� ���!����color� �����@+A.�� �����������

��� � ������ ������ �!��� �����������58!� �����

�������������� ������ �D����� �4��������� � ������ ��� ���������������� ��

������������ �������� � ���� � ������ ������ ��!������� ��������� ���������� �� ��

���@+A.�� � �%���� ������ ��� ������������'��&���!�'� ��� ����@���!�����

1����� � ������ ������ ��E

K ���D�������� ���������� ����� ������������������������������� �������������

���� ��� �������� ���������� � �E������ ���!�������!�������!����!���������!�

����!������!���� !��������� ����� ��������� ���������� ��������� � ��������

��������� ��������� ����������������� ���

K ������� ���� ����'��&�������� ��� �����������!��� �����������55!���� ��� ��

� ����� � ��� ����� �� ��� �������������

K ������� ���������'����� ����@�������� ��� �����������!��� �����������5(!�

��� ��� ��� ��������� � ��� ����� �� ��� ��������������

K ���1�������� ��� �����������!��� �����������57!���� ���� ��� �������� � ��� �

���������������� ��������� � ����

�� ��!*�*�%

" ������������ � ��� ���������� � ������� #������������ ��������� ��� ����� � �

�������� �$��� � � ����������!���������$����������������� #��� �������

����� ����� � � ����������������� ��� ����!�� �#����!�� ����� �� ���������E

4� ������ ���������� �������� ��

���������� � � �%���� ��;��� ���color�& ����

Page 248: Getting Started with VNMR 6.1C

��� $�* �

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

���������� '��&����� � �%���� ��;��� ���color�& ����

��������#� '����� ����@����%���� ��;��� �

Page 249: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

'� ������ ������������ ��������� � �������

������� ��������� ����������$������������������ ������������ #��������� ����

���� ������������� ����������� � �����!������� ����$�������������������!�

���46��

� ����� � ��� ��������������������� ������������!����������4�����'�

��5����!*�*������

;���� ���������������������� � �����������!�� ��������$������������������ �� ��E

4� >���������������� � �%���� ������+��������������� �� ������/������ ��

������ � �%���� ������ ������� �� �������� #��������������������������

����

'� ������ �����%�$����� ������� � ����������$����������������������������

@+A.�����������

8*������!*�*������

� ���$���� � ����E

4� ������ ������ � ����������������� ������������ #�������� �� �� ��������� ���

���� � ��������������� ������������ ������ � �%���� ������+��������

'� ������ �����L ������� ��

!&���*�� ��#����!*�*������

� ����������� � ����������E

��������(� 1����� � �%���� ��;��� �

Page 250: Getting Started with VNMR 6.1C

��� $�* �

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

4� L ����������

'� >������� � ������������

6� %�$��������

� �������������� ����� � ����E

4� L ����������

'� %�$����������������������

6� ������������������� �������

�#*5����!*�*������

� �� $���� � ������ ���������E

4� ������ �������������

'� ������ ������������� ������������������� $��� ������ �� �������� #�

6� ;���� ����� ����!��� �� O�� �����������!� �������� �����������

�%%���!*�*�%� *���$�* ��

� ��������� � ��� ����� ��E

4� ������ �����&� ������ ��

'� �� ��������� ���� ��������� ����$��

M������$� ������������ ������ ���$!�� ��!������!����!������ $������

� ����� ������ ������� ������E

4� >#������� � �%���� ������ ��

'� >���setcolor� ����� ����������

!�*%�� &��!*�*������' �*�6��*.

;���� ����$������������������� ���!������� ��>#���� ��� ��������� ��

!*�*��"�-���8*����

������ �loadcolors<(color_file)>�� �������� � ������� ���������������� �������� �����loadcolors����������������colors�� ���������������������� ��setcolor�� �������� ��� ���!����bootup���� �������loadcolors�� ������������������� �������� ���� � ��

�����������������+���������8������

������� ��� �������������� �����$�������� ��� �����������������#������E

K ppa<(x<,y>)>����������� ������ ������������������2>������/�������3�� ���!�����������#������� �� �������������1�����x�����y�� �����������$������������!������ ��������� ���� ���������������� �������� �� �����#�����

�� ����!������!�� ������ ������ ������� ��� ������������� ���� ����������������

K bpa��� ������ #�� ����������������������������������������������� ���2������/����3������������ #���� ������� ����� �����������bpa��������������ppa!���������������������� ����� ���ppa�����bpa����$�� ���������$������

Page 251: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

���������0�������� �� ���#!��������������������������� ��������!�

� ��� ����� �� ������

K pap<(<template,>x,y<,character_size>)>���� ��� �����������������������2��� ���3�� ���!��������� ��������� /� ���/����������������$�����

��������������������ap�������� �� ����������� ��pap��M������ ������paramedit('ap')�� �� ��������������$���� ��ap��%����� ������������� !"�� �"��� � ���� ���� �� �����template����������� x�����y���������������������ppa��� $��� �pap� ���!������������9����������������������������<�������������,�(�

K ap<(template)>������� �����������������������������������ap�������� �� ����������� �����ap�� �������M��paramedit('ap')�� �� ��������������$���� ��ap��%������������ ������������� !"� � ���� ���� �� �����template��������

K hpa�2������������������3� ������ �� �� ����������������������$�������� �=����/&������(-(8������(88,���� ������� x0�����y0����������?�������#/9 ������/9 �� ���� ��������!������$��!� ��=����/&�������� ��������

& ���������$�����" ���������hpa�� ���?����x0�����y0�� ������������������������������� �������������������������������� ���� ��

K pltext<(<file><,x<,y<,width>>>)> <:$xn,$yn,$y_inc> �� �������#��� ������ �������� ������� �������������������������#�������#������ x���� y������� ������!������!� �������������� ���#���width���������#������ ������#�������!�������������pltext�������� ������� ���������#��������� ������������������

/! �����������

&� ����������� ���� ��� ����������������� ���� �� �����������1��� $�����������!�

�������� ��!��������#����� ��������$�� ���������������� ��� ���� ����������!�

������!��#�!����� ����� �� ������ ��������

&� ����������$��� ������ �� ����������������E

K " �������������$���� �� ������ �������������$������/���������� ��� �����

�������� �����$����� ������������� ���

K &� ����� ������������������������$��� ����

K " �����������������������#�����$�� ���� ����������������!�� #�!������ ���

K &� ���������#� ���� ��������� ���� ��������� � ��� ����� �� �������

��������� ���

����������������

&� �������������T�$�/�������������� ��" ���������$�% ���� '�5� �����������������

��� ����&� ������������T�$��A�.������>�$� ������T.>��� �% �����A�� ��%���

A�� �������� $��������$� ��������������� ���������T�$����������� ����&� ��

������0������������T.>�4�4�5��" ������� ��� ������������$�� �� ��T.>�� �

% �����A�� �����%���A�� �������;�������������E**��������� �*� ����*?*

���#������

�����������������

%�������&� ��������� �������������jdesign�������@+A.����������� ��

Page 252: Getting Started with VNMR 6.1C

��4 $�* ���%���

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

���&� ������������ �!��� �����������5:!� ����

!)% *#�9�� &��$�* ���%����6��*.

" �����������������������9�������������

�����&� ������������ ������ �������

� �� ������ ���E

4� ������ ��)��&����'�����������������!�

����"���*+�� � ������; ������

&������������ �����������(,�

'� � ���������������� �!� �� ������!�

���&� ������������ �!������� ������

� �� ���������� ��� � ���������/

� ��������

%������6:�� ���������� �� ������

� �� ��

�����(4�������#����� ��������� ��

���� ���$�������� ��� �������

���� ���������

6� ����� ����$��������� ��� �������!��������++�,�� �#��������������

-� ������������� �#���������� ��

$�����9��������

" �����������������������������#��� ����� ������������������9����������������������

���� �����������������-,��� �������������� �!���������� ���� ����������� ������� ��

�������������� �������� ������

���������� &� ��������;��� �

��������

������ ��������

�� �����

�������#�� ;��� ��

&�����&���

Page 253: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

0%��"�#��� �%

" ����������� �� ����������������� ����$�������������!�� ����� �� �����

� ����� ���$�� �������������������E�

4� ����������/��-+� ����� � ������&� �������������� ��

'� >�����������������-+� ���������1��� ��������������� �������������������!�

���������� #��#��� �*����.�����-+� ��� ����& ���������� ������������������

� ������ ; ������&����� �� ��

��"���� 9�"$�!�"

� '/������ ��������������� ����� � � ��������� ��

������������ ����������� � � ������ ���� ����������� ������

0��.���.������� ;���� ��� ���/������ ����� �?��!������ � ��������� ��������������

����������������������� ��� ��� �� ����������������� � �

1��������� ����������� � � ���������

)������ ��� ���� ��� ��� ������������������� �� � ��� ���

������ %� �������������������&&���� ��� ���

1���� %� �������������������&&������������� ������

"� + �������������������� ������;������������������!��������� ��

��� �?����������� ������� ������ ����������������� ��������

���$�� ������ �� $���� �?��� �������������9� �������

��������&&�%�����������9���������

"� +�"+ '���� � �� �������� ���� ������� ���������� ���������� �?����������

%���������������������!��������!� �� �����

�������#�� ;��� ����������������;��� ���� ���������D��

Page 254: Getting Started with VNMR 6.1C

��4 $�* ���%���

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

������!�����#������������ �������&� �������!������������ ���������� ��������

����������

6� ������" 2��� ��� ��������������$vnmruser/templates/plot����� ��

1��� ������ ���$��������������������������������������#�������������!���

�������� ��������� ��������������������� $�������������1��� ��� �� �������

������������!�������� �'����

-� X�������&� �������������� �������������� ��������

��!"��=�.�,�4� ������

����� ����$�������������!�� �������� ����������������������������������������

���jplot�� �������������������������� �#����!�������jplot('t1')����������� �����������4����������� ����������� ����

1��� �� ����&� ����������������jdesign���� !����� ���������������������� �� ������������������������������ ��� ������$� �������&� �����������������

� ����� �� ������ ����� �� ���������������E

4� ������ ���������������������!�������-+� ����� � ������&� �������������� ��

� ������ &� ��������� ��

3����4� 5��� �����������

��% �������� #�

����5� ��������� �)����������� ������������ �������

������� ��%��.��� ��������� ��

��������� �)����������� ������������ �������

������� ��>+������������� ��

!��-�)��&����'�� %������� � �������9� ������������ ������ ��������

�?��!������������������ ���/��������� ������� ���

������� �� ������� ����!�������'85��" ��������� �

��������� �������������� ��������/)��&����'���

��%��!�+�� ��� ���� ��� ������#����� �� ���������%$��� ��� ���

��� ��� ��� �� �� �������9������������� ������#���

� ���������� �!���2��������#�!3�����'8(�

6� ���� ����33����� $������ �?�����" ��������� �

� $������� �?����������������������/4����������

��� ��������� ������'85

������� ��� $�� ���������� �?����

)���� &�����������

Page 255: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

'� =��������������������������������� M�L>/�L1�O1+D� ����������������������

��������� �� ��������� �� �����������������������������-+� ���������

1� � ��������������� �������������������!������� ����������*����.�����-+� ���

����& ����

6� � ������������������� ����&� ������������ �!������� ��7+���

-� ������������� �#���������� ��

�� �.!"��4� ������

� �� $����������� ����������������&� �������������� �!������� ��4�������

��������������� ��������� ������������������������������������� �'������� ��� �

� �������� ���������������

+#�*� ����$�*

� ���� ������ ��� �����@+A.������������� �� �� ����&� ��������� �����!�� ��

������������������ ���.�� ������������ ����������������� ���������� ��9���

�� ����������� ������ �������� �� ������ ���E

4� ������ �����������������������!�����$�5�� ��������� �� ������ �������

'� A $������� ���� ����� ������������� ��� ������ ��/�����+#�!�� $�

���� ��/����� ������� #������ ���� �� ����� �� ������� ��� �������� �

����

6� &�������� ���� ����������� ������� �������������� ��/����� ������� #�����

�� ����� �� ���������� �!����������������� ������� �������������

� �������������� ���

-� 1������ ������ �������������!����������������� ������� ����������!�����������

������/6����� � ������.�� ��>��� ����� ���� �����������('��.�� ��>��� �

������#����� ����������� ���������� �������� ������������� ����� ��

8� >�����@+A.��� ��� �������pl!�pscale!�ppa!�pltext���������#�����������

&� ��� ����������� ��������/$vnmruser/templates/plot/menu����� *$vnmrsystem/user_templates/plot/menu������" ����������� ��� ������������ ����� ������ ��������1�����menu����!����� ����������������������� �����E

K ����������������������� ������ ������������������������� ���������� ��

�������#� .�� ��>��� �;��� �

�!#%��&�%��!�

Page 256: Getting Started with VNMR 6.1C

��4 $�* ���%���

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

K ����� �������������� ������������

1�������(6!���������pl�������������� ����������pl pscale����������PAP�������������pap�� ������

5� ������)��2��5/"���'����� ���� ������� ����� ������ ���������)��2��5/����� �

��� ���� ������ ����������� ����

" ��������� ���� ������ ����� ����� ������ �������

� �� ������ ���E�

4� �������� ��

'� ������ ��������/6����� � ������.�� ��

>��� �

6� &������������ ������� ��� � �������� ��

�������� ���� �����������(-�

-� �� ��������� ��� ���� ����� ����.�� ��>��� �

/�� ����$�*

� ��������� �!�� ����� �� ������ ���E

4� %�������� ��

'� ������������/6����� � ������.�� ��>��� ����� ��

6� >������ ���������������pl� �pscale���������#������������M��������� �����������������-4�� ������#��

plpl pscalePAPpap�Z

Z

Z

Z

Z

"menu" 6 lines, 23 characters

�������#�� menu����

'�$!�

"�((�)

�������#�� &� ��A���;��� �

� ������ .�� ��>��� ����� ��

5����" 9�"$�!�"

������� ���������� ��������������� ����� ���1��� �� �������������

���������������� ���!�� �������� ����� ����� ����������������

��������������� ��

4����� .� $���#�������� ��� ������ ���������� ���+,��������#�����

� ���� �����������)�� �� �����4������� ���������������#��

4������ �� ����������#��� ���������������

��+, �����������#���

) ��� 1������ �����#������������������

Page 257: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

-� >#������.�� ��>��� �������������������

���� ���� ��*�

� ��������� ��� ������ �����!���������������� �!�����������������/4�������

������������/4����������� �� $������� ���

�* �� .�� ���� $�������4������������� ���� �������������������� ������ ��

� ����� ������

�% *��������� ��� ��*�

� ��� ����!"������ �������� ������ �����!�������������/*���������.�� ���

� $�������4�������������� ������ �������*��������

!������ &��6*�:%��'��

� ���� �"�"��%�� $������� ���� ������ �����!�������4�����������.���!����� ��

� $������� ��!�� ������ ���� ����������*��������

!)% *#�9��,-;�' %����� ��*

" �����������������9������ � � �� �?����������� ����������1���&��������� �!�

�� �����������(8�������� ��������/)��&����'���� � ������������ ���" ��������� � ���

������� �������������� �����1���&������ �� !�������� ������'86��

�'�"�!"��<!"��>!,�'

��������������� ������������ �������� �� ������ ���E

4� =���������������� ��� ������ ���/��������� �����

'� >��������������������3����8���.������

6� �������++�,�� ��������������

-� ������������������� ������� ��������������

�������#�� 1���&�����;��� �

"�����&�&*�&�(!�

�����������

�����!!)�!

Page 258: Getting Started with VNMR 6.1C

��4 $�* ���%���

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

�'�"�!"��9�"��

&� ���������������� ����������E�+��+!��,!�Monospaced!�����%����� ����������&����!�����!� �����!$��� ����������������!�����!�������9� ����� ��!�� ����� �� �����

� ���E

4� =�������������#�� ��� ��

'� ������ �����1���&������ �� � � ������1���&��������� ��

6� �� ����������!�����!������������9�����������������

-� �������++�,�� �����������#��

�'�"�!"��<!"�������

" ���������������� � � ������������ �������� �� ������ ���E

4� =���������������� ��� ��

'� 1�����1���&��������� �!������� ������ � ����� �� � � �����

� �/��������� ����������� ��� � ��

6� A $����������������������� ������� ���������� � ��" ��������� ���������

� � ������������� ��������� ������� ������������!�1����!���������������)����

$����������������9�1�:��������� �������������������� ��� $�������

-� ;���� ��������������������� � !��������++�,�

8� &���������� �������������� ���������������� ���� ������� � �������

,,!"��4�-��

� ������#����� �� �������!�� ����� �� ������ ���E

4� ������ ������#��������� �� � � �������#������������ ��

'� �����#�������������������� �� ��������� ��

" ���������� ��9�� ���#�������������� ���������� ��� ���������������� ���

��9���������������������

6� ������ ��)����������������� ���� ����� �����!����������� ���� ������������

�#��

� �� ����#���������������� ������ ����������������������������� ��������!�� ����

� �� ������ ���E

4� =�������������#��

'� �������#��1��������� ���� �����������(5�����������������#��������

� � �

6� %�����������& -��,������������,��!�����������������;��

-� ������)���� ����������#��������� ������

�'�"�!"��9�"��������

� ����������� � � ��� ���!��������� ������$�����2���������L���� � �3

��5�������������������������������

;���� ���������� �!������������������� ������� ����������wcmax�����wc2max������?�������������� �jplotscale���������������������io!�is!�vs!�wc!�����

Page 259: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

wc2�� ������ ������������� ������ ����� ������� ������������?�������� ������ �wcmax�����wcmax2��1��� �������� ���������?�����������!�������� �� ������ �����������!�������������� ������������ ����������#�������n��� ������ �!�����������������?������������� ������ �E

jplotunscale jexpn jplotscale

1��� ��� �� �������� ���������?�����������!�������� �� ������ �����E

jplotunscale jexpn

jplotunscale��������� �������� ����� �������������� ����������#������� ������ ��

%����3,5��������$�����3,5���� 9�

" ������� $���� �?������� ���/��������� ��������������������� ����� ������

� �������� �� $����� �!������������������������ �� � ������� ���" ������

��� ����� ������� �� $� �?����

" ������������ ���������� ������ ���/��������� ����!��������������� � ����� ��

���� !����������������

$��������� ������������������������#��0

&� ��������������$��������� � ������ ��!�3 ���' +�� �)���� ����������������

������� ������ ����" �������������������� �����&� ������������ ��������7������

����

$��������� 9���������������������#��0

1����� �����������9� �����&� ������������ �������������� �������9�����������

���� ���&,�����

�������#�� �#��1�����;��� �

Page 260: Getting Started with VNMR 6.1C

��4 $�* ���%���

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

����:��������

����� ����������������������� ��

������ ����$�����!�� ����

� �� ������ ����� ��� �� ��

���E

4� ������ �������������A����

A��!�����" 2��4 � �� �

������&� ��%�$����� ��

�� �����������((��

'� %� ���� ����������� ��

���� ��������� ����

���� ���" � ������� ����

�������� �� ������������4���'���,������

6� %������4 � �&��- ��� �� ���������������4 � ������������������-'����������

� �������������$�������

-� L����� �������������������������������������

-��!�%��.����% /��!����%

�������##� &� ��%�$�;��� �

� ����� � ������$����������&� �������

9�� �� ;��$�!��!�"

�@% �@%�N���������

�A& A�� � ���;��� ������������������

>&% �� ��>�����������& ��%��������

��N D ���6���N

�1�% ��#����1��������� ��%����

D1� � ����$�D�������1��������� �����$�� ��7:��

D1�7( � ����$�D�������1��������� �����$�� ��7(��

T&>D � ������� ����� ��T ����&� � �������>#����D ��

A1�� A���������������� ���

&�� &� � ���

&�N S% ���1�A�&��&������������

&�� & ������ ������� ���

&1�� �����A����� ���X�������*&1������

&DA & ������������

&+D & �����+�� ��D������

&% �� ��& ��%��������

&%' �� ��L$��11�& ��%��������

%D1 1�#�.D����������

%M+ %���.������

�D� ��$��� ���������������

�1�� ������1��������� ���

@1�� O� ��@������9��� ����������

N�A N44�����������

N&A N44���#�������

N;� N�;��� ��%��������� ���������������

Page 261: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

8� ������������� �#���������� ���

�����:��������

� ������� ���� �!������� ����������� ���

;8��������������

� �#������� ���!������� ������/<�����1��� ����$������������������� ������� ��#���

&� �������!�� ���������������� ���������������������� ����������#�����������

� ��������� ����

/!/ ����

�����-6�����������/��� ������� �������������������

&�������� ���������@+A.���������������������printon�� ����������� ������������� �������������������#������ �������$�����!��������printoff�� ��������������!������ �������������� ������������������ �� ����E

K &��������������� ��dg!�dg1!�da!����

K L������������� ��dll��

K 1���������������� ��dli�

K %������ �������� ������������������config('display').

K �#����������������text�� �����

K .������ ����������� ���� ��h2cal!�adept!�t1!�t2!����

K ���� ������ ���� �������� ��� ���� ���� ���������� �����#������ ��

����� �����������$���������� �������������@+A.�������� ��tmp�����@+A.�������printer����������������� ���������� ����������������� ������������!���������A ����� ��� �����A����A��!�� �� ������� �����!�����%� ��

�������$���!���������$ ������showplotter���� �� ������������������������������ ��� �������� �����%����&��������������� �������$�� ����� ������ �� �

��� ���� �!���� �2&� �����!3�����'-'�

;������printoff�� ��������������!�@+A.�#�������M+1N�������������vnmrprint����������������� �������� �����������������������M+1N���������

� ������ &���/��� ������� �����������&�����

$������killprint %� �������? ������� $�� �������0��

printoff<('clear'|file)> %� ����������#��� ������[����������� ���� �

printon ������#�� ������� �����

ptext(file) &���� ������#�����

showplotter ����������������������� �������������

showprintq �������������? �����������0��

vnmrprint* &�����#��������M+1N�

* vnmrprint printfile <printcap> <printer_type <clear|file>>

���������printer�P�����Q &�����$��

Page 262: Getting Started with VNMR 6.1C

���� 0%���!* �*���-���8������.�

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

�������������������������������������������� �������� �������� ��������!��������

������������ �� ������� ���printcap�����!������������ ��������� �� ������� ���devicetable��������+ �������devicetable���� ���� ���������� �������������& ��%�������������1������!����������vnmrprint���� ����������� �������� ��9����

������ �ptext(file)������� �������#��������$����������������� �#����!����� ������ptext('/vnmr/psglib/dept.c')�����������#������dept.c��

&����? ���� ���������������$���������@+A.�����������������0�������

showprintq���� �����������������������? ��������������0�������killprint���� �������� ���������? ������� $����� ����������0����M�����������#�������

�������� ����root��������!� �����������C�������? ����������� ����������0���

/!"< �����$�������,���+�����0�

���pen!�move!�����draw�� �������� $�������������������/������������������� ��������� ����������������� � ������ ������� �������������!���� �������$���������

�� ����'plotter')���������$����������������� �����������������'graphics')�������� ������� ����������� ����������������������������� �����0����pen!�move!�����draw�� ���������������������$���������������� ���������������������� ����������������� �� ��E

K pen(<'graphics'\'plotter',><'xor'\'normal',>pen|color) ������������� ����� ����'pen1'!�'pen2'!������ ��������$�� � �� �����������������'red'!�'green'!�'blue'!�'cyan'!�'magenta'!�'yellow'!�'black'!� �'white'�!�� �#����!�pen('graphics','red')������������ ���'xor'� �'normal'��� ���������������� �� ���������������������1�����'xor'�� �!���������������������������� �� �� �� ����� ��������������� �� ����������$� �������������!����� �� ��� ������������1���� 'normal'�� �!����� �� ��� ���������������������� �����'normal'��

K move(<'graphics'\'plotter'>,x,y)����������� ����� ���� �������� �������-�����%! ��������move(10,20)��������� ������� ����� ��������� ��������������������

K draw(<'graphics'\'plotter',><'xor'\'normal',>x,y)������������������������������������pen�� �������� ����������� ���� ������������move�� �������� ������� ����� ���� �������� �������x�����y�

���pen!�move!�����draw�� ��������� ���� ���� ����������0����� ��� ��������1�����������0���!������ ������������������ ����������������� ��������th��$��

4� pen('graphics','yellow')%������������������� ��������� ������������$�� �

'� move(wcmax–sc–wc,vp+th)A $�� �������� ����������#������������ ����$������

6� draw(wcmax–sc,vp+th)����������� ������������ ������������������������ ����$������

1������� ����0���!��� ���� ��������� ������� ������������6�

4� pen('plotter','pen3')%��������� ����������6

'� move(wcmax–sc–wc*(cr–sp)/wp,–20)A $�� ������� �� ���� ���� ���#��������� �� �� ������������ ����

Page 263: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ����� ��%����3�$�* �3����$�� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

6� draw(wcmax–sc–wc*(cr–sp)/wp,wc2max)A $�� ���� �� ���� ���� ���#������ ����� �� ������������ ����

-� move(wcmax–sc–wc*(cr–delta–sp)/wp,–20)A $�� ������� ���� ���� ���#��������� �� �� ������������ ����

8� draw(wcmax–sc–wc*(cr–delta–sp)/wp,wc2max)A $�� ������� ���� ���� ���#��������� �� ������������ ����

� �������� #� ������ ��� ����������!����

box(<'plotter'|'graphics',>x1mm,x2mm,y1mm,y2mm<,'nolimit'>)<:r1,r2>

��������$������ ������������x1mm�!����������x2mm�!�� �� ������y1mm�!������ ������y2mm�������������������������!�box(20,100,40,150)������ ���� �� �������������$������� ������������� ��� ����� ����������������������� ������������

����������1�������������=9� ����!�� ������������hztomm�� ������� �� �$��� ��� ����������������� � 'nolimit'���� ������� #�� �#���� ������������������������������������sc!�wc!�sc2!�����wc2�

�����--�������9������ �������� ���������������������

� ������ M�/� �� ������L����������� ������

$������box* ������� #� ������ ��� ����������������

draw* ��������� �������� ���� ��� ��� ���� ���� �

hztomm(x_position)<:xmm> � �$��� ���� ��� ��=9� ������ ��� ��������

move(<'graphics'|'plotter'>,x,y) A $�� ������� ����� ���� ��� �����������

pen* %��������� �� � �� �������

* box(<'plotter'|'graphics',>x1mm,x2mm,y1mm,y2mm<,'nolimit'>)<:r1,r2>draw(<'graphics'|'plotter',><'xor'|'normal',>x,y)pen(<'graphics'|'plotter',><'xor'|'normal',>pen|color)

Page 264: Getting Started with VNMR 6.1C

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

!&�� ������ ����.��������.����%��������

%��� ����������������E

K 4,�4�2; �������������� �����������!3����������

K 4,�'�2%� ��������!3�����'58�

K 4,�6�2.��$��������!3�����'5(�

K 4,�-�2��������������M�����>������������+>�!3�����'5:�

K 4,�8�2� �$���������������%�����!3�����'(-�

K 4,�5�2A����������� ���� ��!3�����'(5�

K 4,�(�2� ������������!3�����'7,�

������4���$���� $$��� ��M+1N�����@+A.������������������� $��� ��� �� ��

������� ��������������� ��<� ��� ��� !���$!������ $�����E

1��� ������!�� ������� �$������������������������ �� ���� ����� ������ ���������� ��

�������$�������������������������������������������������� �����������

���� ��������A����A��� �������������files�� �������������-!�2M��������@+A.�A���%����!3�� $������� ������������ �� ����������

"<!" #��1��0��������������������

�������� ���� ������������ ����������������$����������$��������!�� ����������!�

����������������������!�����#������������ ������ ������ ������������������

���� ��� $������ ����$�������� ����� ���� ���������-8������������ ���

����������������

�������������������������#������ ����,�������,!��$���%!���� ����������$����"��

2��:!"��,!��$���%����������������� ����������������������� ����������������� �����

������ ��������� �!�������� ������pwd�

�������������� �������������������������� ��� ������cd<(directory)>!����directory����������� ������������������� �)�� �#����!�������cd('/export/home/steve/vnmrsys')����������������� ��������� ��� �������� ��/export/home/steve/vnmrsys��>������cd��� ��������������� ��������� ��� ������C��� ������ ��������������� ��2~3!��� ������� �2���� ������ �� �3����M+1N!�� ��� ��� �������@+A.�� ���������

����������������� ��� ��������������������������� �!���������������������������

� �#����!������������������ ��������� �/vnmr/fidlib!�������������andro1.fid�����/vnmr/fidlib/andro1.fid���0��$�����

Page 265: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ������ � *��3� � ���5�3�����*5���� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

���defaultdir�������� ����������� ���������������� ��� ����files������������������-!�2M��������@+A.�A���%����!3�����������������

$���������%�����������������

��������� ����������������mkdir(directory)�� �������1�������� ������ �� ������!����rmdir(directory)�� ������� $�� �� �� ���������� ������!�������� ��� ��� ��� ����������������mv(old_name,new_name)�� ����������������� �!��������copy(old_name,new_name)�� �������������� ��� ��������� ���������������������������������������� ������������ �������

���� �������������� ������������������������� ����������

���� �������lf!�ls!�����dir����������������������� ��������� �� ������#�� ���������� ���1�������� ��������������������������� �lf� �ls!��������������������� ����������������� �������������� ���dir���������������������������� ���������������� ��� ������������������M+1N�ls�� �������

$���������%������������

�������������������������������� �������$���������������$��������!��1��!� �

��������1������������ �� ������!��� delete(file1<,file2,���>)�� ������� $��������� �������������������rm(file1<,file2,���>)�� ��������� �� $�����!�����delete�������������������������rm������� ����������� �����M+1N�� ������ �������������������������$������������� �������������� ���

������!�$��� �#����������

���rename(old_name,new_name)�� �������������������� ������������� $����������������� ������������������!�rename�������� �������� �� $�������� �� ������ ��� ��� �������mv(old_name,new_name)�� ������� ����������������rename�� ������

� ������ ���� ����������=��������� �����������&�����

$������cat(file1<,file2,...>) �������� �� �� ��#�����������#������ �

cd<(directory)> ������� ��������� �

copy(<'–r',>from_file,to_file) � ��������

cp(<'–r',>from_file,to_file) � ��������

delete(file1<,file2,...>) ���������!����������� �!� ��1������ �

dir<(string)> L���������������� �

lf<(directory)> L���������������� �

ls<(directory)> L���������������� �

mkdir(directory) ����������� �

mv(from_file,to_file) A $����* ����������

pwd<:directory> �������������� ��������� �

rename(from_file,to_file) A $����* ����������

rm(file1<,file2,...>) �������

rmdir(directory) .� $����� �

����������curexp�P�����Q �����#���������� �

defaultdir�P�����Q ����������� ��� ������������������

Page 266: Getting Started with VNMR 6.1C

���� � *����� �

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

� �������� ��� �������!�������@+A.�� ������copy(old_name,new_name)������������� ���������� �������� �� �����������������������������������������

�� �����������1����������������� ��������� ������������� �������� �� ���� ���

����������!��������������!�� $����� ��� ������� ������� ������

cp(old_name,new_name)�� ����������������@+A.�copy�� ������

� ������������� ������ �� �� �� ��#������!����cat(file1<,file2...>)�����cat�� ����������������#�� ���������!������� ����$���������������!��������#������ ���1������#������ ������������� ������ ������� ��!�cat������������������ ����������������������� ������� ��� ����� ��� �� ������������� �������� ��#���

���curexp������������������������������#����������������$�� ���� ��������curexp�� ���������������M+1N������� ���������������$�#�������� �#����!�cat(curexp+'/fp.out')�������������� ������ �����fp.out����������������#���������� ��

"<!& ����������

���#��������$� ����!�+A.������ �����@+A.�����������������0������������ ���

�������������� ����������-���! �"��������������������������������exp#!����#������������� ��4�� �:!�����!�exp1� �exp6������������������#������������������������� ������ ����������� ����������������#����������� �����!�� �$!�������

��������������� ���������������� ���� ����������������������������������

� ������� ������������!�� ��������������!� �$��$�������������!���������>����!�� �

� ��� �������������������-5�������� ���� ��� ���������

;8�����������

���#��������������exp1�� ������� �� �� �� ��1��!� �� �� ������!�$�� ������������������������2��$����������!3����#�����!������������ �� ���������������

����1������������������������ �����������!�������"����������� ���$������

������������������ ��������� �������� �� � ��������� ��������

1������!����� ������� ��� ������ ����������@+A.���������������� ���$���������

������������������������������� �������� ���� �� �����������1����������!��������� ��

���� ����� ��������������� ���������� ��� ����������������� ��!�������!�

�������!��������!���������$��������������!������� �����������������������!����

�������� � ������� ���������� ���� ����� �����������

� ������ �����%� ���� �����������&�����

�� �",�svf<(file<,'nolog'><,'arch'>)> %�$��1�����������#�����

svp(file) %�$��������� �������#�����

svs(file)<:status> %�$������� ����������

writefid(file<,element_number>) ;����������#���������������1������

���������shimspath�P�����Q &����� ���C����������� �

Page 267: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ������ � *��3� � ���5�3�����*5���� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

��������

���������$�����������svf<(file)>���� ��1���������������� ������������������!�svf������� � ��� ��������1�������$�!�� �����������!������������������������������ ��������� ������1���

���svf���� ������������ ���������������# .fid������� ����������� �� ������ ������!���������������������� �E�

K ����fid�� �����������������������1���

K ����procpar�� �����������������

K ����log�� ������������0������ ��� ��

K ����text�� �������� ����� ���� ���

� ������#��������� ������������������1���!����svf���� ���$�������1�����������������)�������� ��������� ������� ���� ������$�������1��� ���������� �����$��

svf���� ���$����������������.def����0����������<�;��

1��� ��������$������� ���� ����� ����text��������������text�� �����!������������������� ������ ������������� ������������������������#������������#������

����� ������������������������

���� ������writefid(file<,element_number>)���������#������������������ ������������1������������������� �element_number����4������ ������������� �$��������������������������$����� �����N������������!���������� ���

������$����� �����"�������������������

���autoname�� ��������������������� ����� ���� ������#������������ �����$����� ��@+A.���������1���������������������������������� ���autoname��������������� ���� ��������� ���� ����������������)���������������������������

������ �������������������������� ���� ��

��������������

&������� ����������#����������$����������� �svp<(file)>��������������� .par������#��������!�������� ����������������������#���1��svp������������ ������������!�� ����� ������ ������������M��������svf���� !�svp������������������������������������ ����� ���� ��������svp!�������������0������ ���������

���� ���$��� �����

���������� �����������#����S,�����$����������� ������svs(file)��1��������� �����������������������������������$�����!�svs�� ���� ���shims�������� ��������� �� ����� �E

4� 1�����shims�������� ��#��������� ��@+A.�������� �!�svs��� �������� ��������������

'� 1�����shims�������� ��� ��� ��#���!�svs�� ���� ����� ���������������shimspath��1��shimspath��������!�������#������ �� ������������� �������� ���1����������� ��#����!�svs���$���������������������������������������

6� 1������'�� ��� ��� �!�svs��� �����������������/vnmr/shims����� ���� $����� ����$����������� ����

Page 268: Getting Started with VNMR 6.1C

���< � ���5���� �

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

1��������� ����������������������������������� ��������!�������������$����������

"<!( ������������

�������!�� ������ �������� �������������-(�������� ���� ��������$�������

��� ���� �������������� ����������$������ ���� ���$������������@+A.�

������.����.�����������������������

������ �rt<(file)>���$���1����� ���������1������file.fid���� ���������#����������!�rt('/vnmr/fidlib/fid1d')���1��file.fid�� ��� ��#���������������������file.par�� ��#���!�rt���$������������ ����� ��file.par��1��rt������������ ������������!���������� ������������1����������!��������������������$������ ���������0� ����

.��$������������������� ���������#������������������������#���������

$�������.�������������������1������������$��������������������� ��!��������

������������� �������������� ���������� ����!�����$� ������ �����!�������� ��

�������� �����!�/���!� � ������� �����������!�#�������������

������ �rtp<(file)>���$�������������� ���������������file.par!�������������#������1��� �!��������file.fid��-!���!�rtp���$������������ ����� ������1������file.fid��1��� �� ���������� ���$�������������� ���������� �������svf� �svp6�������� ������rtv<(file,par1<,par2,...>)>��������������������� �� �� ������������������������1��rtp� �rtv����������� ������������!�� ����� ������ ������������1����������!��������������������$��

���� ���������0� ���

� ���$�������������!����� ������rts(file)�� ��������#����������� �����������������$��������svs�� ����������� ������������������ ������������������ ����������#�������1���������������������������������������$�����!�rts�� ���� ���shims�������� ��������� �� ����� �E

4� 1��shims�#��������� ��@+A.�������� �!�rts�� ����������������

� �����# �����.��$���� �����������&�����

$������compressfid(<indir,>outdir) � ������ ���/����� ��@+A.��1������

compressfid* � ������ ���/����� ��@+A.��1��������M+1N�

makefid* A������1��������������������#�������

parfix M��������������

rt<(file<,'nolog'>)> .��$��1��

rtp<(file)> .��$�������

rts(file)<:status> .��$������� ����������

rtv* .��$�����$������������

updatepars M���������������������$����������� �

* compressfid –i indir –o outdir –fcompressfid –e exp_number –o outdir –fmakefid(file<,element_number><,format>)rtv<(file,par1<,par2,...>)><:variables>

���������parversion�P���$���Q @�� �� ����������

Page 269: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ������ � *��3� � ���5�3�����*5���� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

'� 1�����shims�������� ��� ��� ��#���!�rts�� ���� ����� ���������������shimspath��1������������!�shimspath����#������ �� ������������� �������� ���1����������� ��#����!�rts�� ���������������������� ��������0���������

6� 1������'�� ��� ��� �!�rts������ �� ��������������/vnmr/shims��

1��������� ����������������������������������� ��������!������������ �������������

������������������������������� ������������� ������� ��rts��

� ���$�%����������������� ���������#�����!�������rtcmx<(file)>�� ������

����$�;�����%���������������������

�����>�����A���������������� ���$������ ��������!��1��!� ������������� �

����������� �!����listenon���� �������!� ��������$���!�#������1��������$�������������� �� �� ���� �!�� �������������listenon����� ��� ����login���� ��� ����� �� ����������� ���$�������������>E

4� %���������>�����A������ �������>�� ����

'� D �� ������������� ������� ���/�������������������!��1�!� ����������

����� ����$����������������1�����!�������� ������������������ .def��������������0���������GLIDE������$����� �GLIDE��

$�������� ��������������� ���

���updatepars���� �� ������$�������������;����������� ��@+A.�$�� ��-�'!��������������!����������!�� �������!�����������9�������������

����������� ������������@+A.�-�6�����@+A.�8�6��updatepars������������� ��� ������������1������!������ �������procpar������� �����1������ �����������������#������������ � ������ ��������������� ����������

����������������updatepars� $�����������������������#����������� ��� ������������������ ����������������������������parfix���� ��;�����������������������������updatepars� �parfix!����������parversion�������� �8�6�� ������������$�� ������updatepars���� �������������#������� �� ��������������������� !������$�#����������� ���� ��������

updatepars��� ����� ��� ��������$���������������

�����#������'������

���makefid(file<,element_number><,format>)�� ����������� ����� ����� �������������� ����#�������������������1�������� ���������� �����!�

� ���������$�������� ����������������������������������������������������� ������

������$����!��� ����������������$���������������� ����N�� �����������)����

�� ���$���� ��������������������� ����"�� �������������������

��� ����� �������������������������� �E�element_number������������ ���������� ��1����������������������������� ��1��!�����format������������������������� �� ��������������1��������������������'32-bit'�� �� ���/����� ����������� �������makefid!�������������� �� ������������ ���� �",��",����� �����������"$��� �������������

Page 270: Getting Started with VNMR 6.1C

���7 "��%=������� ��0%��/ &��� ������#�/"

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

"<!) �������������������;������������=;�

�� ������ ���������������������� ���������������� �� ��� ���� ��� ��� ������

$����>�������� ���>���������������� �����������!���������� ��� �����

��$������� ���!� ��������$����� ��������!�����������@+A.��������

� ��������!� ������!���������!�M+1�"����!��� ��������!�M+1�"!�����@N./%�!�

@N./�������������D����!�@N./-,,,!�����NL�!�����@�N�� �������

>������� �������������� ������!������ � ����� ����� ��������������

� ������ �2� � � �3������ ������� ��������������!�>�����������������������

�����@+A.�������������>�������������� ��� ���� ��@N./�������������� �����

� ��������!�@+A.�����������������M+1N�� ��������������1�����& � � ���1&��

��������������������������� ��@+A.������������� ��!� ��������@+A.�

���������� ���� ���������� �����1&��

@+A.�� ���������������� ������>������ � � ����������+>� ��L�� �� ��1�� ���� ��A��������+�� �!���@�������������������� � � �����0����� �

#������������ ���� �������@N./�����������!� �������� ����������+>��� � � �����

���� ����������+>��� � � �������� ��$�������� �@�N�����1�A�.%*5,,,�� �����!�

�������������� ������������� ��@N./�������������

�����-7�������� ���������� ���������������������� $�>������������+>��

�������������������;������

M+1N�� �������ftp������������� ���������rcp��� ��� ���� ��������� ������� ��������$�������� ������� �������� �� ��@+A.�������� ��� ���������

>����������� ���������� ������ ���������@+A.!����� ��������� �����������

�������������������������

%����� ����1�������������@+A.��������������� ��������� ��!����rcp�� �������� ���������� ��������!���������������������������� ��!�� ��?��������$������

���������������� ��rcp�������������� ������ �������������M+1N�cp�� ���!�#������������� �������������������������������� ������� ���������� ��� ��/

������ �� ��������� � ������� �� ������� �#�������� ����������E

K .� ��� ��� ������������� ���–r� ��� ������������������ �������noesy.fid������������������������ .fid��� ���� ��� ����@�.1�+5,,����� ������������E�rcp –r noesy.fid VARIAN600:/usr2/slp/noesy.fid

� �����( >������������+>�������������� ������

$������dnode L����$��������+>��� ����@+A.!M+1N�

eaddr ��������>������������@+A.!M+1N�

elist(remote_mode,remote_dir) L�������� �� ��� ���������@+A.�

elist remote_mode remote_dir L�������� �� ��� ���������M+1N�

eread* ����������� ����� ��� ����@+A.�

eread* ����������� ����� ��� ����M+1N�

ewrite* ����������� ���� ���������� ���@+A.�

ewrite* ����������� ���� ���������� ���M+1N�

* eread(local_file,remote_node,remote_file) (VNMR)eread local_file remote_node remote file (UNIX)ewrite(local_file,remote_node,remote_file) (VNMR)ewrite local_file remote_node remote_file (UNIX)

Page 271: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ������ � *��3� � ���5�3�����*5���� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

K .� ��� ��� ����newfid.fid�������� ������ �� ��vnmr1� ������ ��� ����@�.1�+8,,�!���� ����� ������ �� ��vnmr1�����������������$�������������E�rcp –r VARIAN500:~vnmr1/newfid.fid ~vnmr1

�������� ������� ���� ��� ������� �����������������/etc/hosts� �������+1%����������ypcat hosts������M+1N��������������������������������������������� ������� ��������� ��� ��������� ������� ������������� �����

� �����$���!����rsh�� ����������$�����������!�rsh VARIAN500 ls)�

���������������������=;�

�������������� �������+>��� ������ ������� ������ �������eread6�ewrite6�elist6�dnode!�����eaddr������� ����������$�������� �����@+A.�� ���� �� �����M+1N�������1��@+A.!����������������������!�� ���������������������������

����� ������������0� ��!����� ����������$�������������������� ��� �����M+1N�

����!���������������������������������>#������ ��� �������$���� ���

�� ��� ���������� �!�@N./������D����!�@N./-,,,!� �NL�������������������

���� �������� ����"�,���+ �������������������������!������������ �$���������

���� $��������2� �$���������������%�����!3�����'(-�

"*���%����� �#* ���*��%��5����-��

���dnode�� �������������������� ��� ����$�������� ����+>���dnode������������ �������������������������� ������@+A.� ����M+1N������

"*�"��%=������������*#��� �#* ���*��

���eread�� ����������������� ������ ����������� �������������� ��� ��� ����� ������������ �����������#�������� �� ����E

�����������������0������������� ������ ��� ������ �"�,����$�������� �

������+>��� � � ��������������/vnmr/nodes���������dnode�� ���������������������� ���$�������� ��!������������������� ��� ��

� �#����!�� ����������� ������ ���������dsk1.osv700!������������������� ��� ��������v400!�� ����� ������������ ������������osv700!���E

"*�"��%=����������"*��� �#* ���*��

���ewrite�� ����������������� ������ ����� ��������� ����M+1N�������� ����� ���������� ��������� ��������������� ��� �����������#�������� �� ����E

������������������������������ ����eread�� ������

� ��M+1NE eread local_file remote_node remote_file

� ��@+A.E eread(local_file,remote_node,remote_file)

� ��M+1NE eread osv700 v400 dsk1.osv700

� ��@+A. eread('osv700','v400','dsk1.osv700')

� ��M+1NE ewrite local_file remote_node remote_file

� ��@+A.E ewrite(local_file,remote_node,remote_file)

Page 272: Getting Started with VNMR 6.1C

���7 "��%=������� ��0%��/ &��� ������#�/"

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

"*�8�% � &��!* � %�*=�������' *���*��� �#* ���*��

���elist�� ������������������������� ������ ������ �������� �� ����� ��@N./��������������������#�������� �� ����E

���remote_dir����������� ��������� �� ������ ���������

� �#����!�������� ��M+1N

elist gemini fidlib

or entering from VNMR

elist('gemini','fidlib')

� $������������������� ����� �� ����E

���� �������������������� ������������������ ������ ��

"*���%�����8*'����*��������%%

���eaddr�� ������������ ��� ��� ����� ��������� ����������������� �������������������������� ������@+A.� ����M+1N������

���� ���8��

;��$����+>���������� �������������� ����@N./������D����!�@N./-,,,!� �

@N.��������� ���M+1N/�����@+A.�� ��������!� ������!���������!�

M+1�"����!��� ��������!�M+1�"!� �@N./%�������!��������#������������ ����M+1N�

��������������@+A.����������������� ���� ����� �����@+A.��������� �������

���� ��@N./������������M+1N�����������

%�������!��������+>���������� �������������� ����@+A.�������� ���@N./�����

�����!����@+A.������������������#�� ����������������� ��@N./����������������

�������1�����M+1N���������� �������� ������#� ���������� ��!�������+>��� �����

�������������������@N./���������������

������+>��� � � ������������@N./��������� ��!�� ��������!��������������������

@N./������ �������DIR�����DLIST���������� �����DR!�PR!�����DA!������$��!�� ������������������������@+A.������#�� ������������ �� ����E

K ���� ���������$��� �]]]������#������ ���

K & �����������$��� .prg������#�

K ������������$��� .dat������#�

��������#�� ������� ������������� ��������� ���������� �����������@N./�����

���� ������ !����FIDLIB���������!�65�����!������ ���fiblib.36 ���@+A.���� �� ����������������������!���� ������prg� �dat��������)�����!�MNPPGM��� ���mnppgm.prg�����VCOEFS��� ���vcoefs.dat)�

� ��M+1NE elist remote_node remote_dir

� ��@+A.E elist(remote_node,remote_dir)

APT DR 5 45

HETCOR DR 5 141

C13 DR 5 45

DEPT DR 5 144

H1 DR 5 23

COSY DR 5 141

Page 273: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ������ � *��3� � ���5�3�����*5���� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

����������������� ���� ��������1'�������� ������������������ �����������������

�������� �@+A.�����#���� ����!� ��� ��!���@N./��������� ��

'����������������������������=���

������+>��� ���������� ���������������� ����� ��� �� ����@N./������������

;���� ��������ewrite�� ������� �������������� ���M+1N������!�������� ��������� �����M+1N��������������$��������#��������������������� ��@N./������������

���������������

;���� ��������eread�� ������� �������������� ����M+1N������!�������+>��� ����� �����M+1N�������������� ������������������������� �������eread�� �������1������������ ���!����+>�� �����M+1N���������������������� �� ��� ����@N./

������������1��� ��������� ���!����+>����������������������$���� �������������������

�����#�������1��#������ ��������������� ���!��������������� �� ��� ����@N./�����

�������1������������� �!�������� ������ ������ ����@N./������������������� �����

�����#� ��������� ������ ���������1������ ����������� ������#� ���������#����

������ ��!��������������������� ������������

+ ����/����������������������������������� �� ������������ �����M+1N�

�������1�����������!������������������������ ��������������������� ��� ��#���� �

���� ����� �����������+>��� ������ �$����������/���������� �� ���������

���������������������� ��M+1N�

����������� �����M+1N�� �������������������$���������������+>���$���������

��������� �����$������� ��� �� ��������0����������������!����������������

����������� ����������������� �����������.�������#���������������� �0����� �

������������ �!����������$���� $���!������������������ ���� ���� �#����E

1��/export/home/vnmr1�� ��� ����$�#���� ����������� ����� �����!������������/export/home/vnmr1/vxr/example����� ������������ �����+>�!�$�������������� ���� ��� ����� ��� ������������� !�� ����������� $������ ����!�

$������������� ���� ��� ������� �����

��������������������� ����������� ���������!����!�����#����������� ���������

���� ���.�������#�������������0����� ��������� ���� $���������������

�)�� �#����E

9!������������, ��+�!��,��$$���

/export/home/vnmr1/vxr/example rwxr–xr––

����"��,!��$���!�� ��+�!��,��$$���

/export/home/vnmr1/vxr rwxr–xr–x

/export/home/vnmr1 rwxr–xr–x

/export/home rwxr–xr–x

/export rwxr–xr–x

/ rwxr–xr–x

9!���������2�!���" ��+�!��,��$$���

/export/home/vnmr1/limnet/newfid.5 +*���� ��������

����"��,!��$���!�� ��+�!��,��$$���

/export/home/vnmr1/limnet rwxrwxrwx

/export/home/vnmr1 rwxr–xr–x

Page 274: Getting Started with VNMR 6.1C

���7 "��%=������� ��0%��/ &��� ������#�/"

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

��� ���������� ����������������� ��� ����+>���������� ������������ ����

� ����������������� ������������� ���

;�����%���������������=;�

���dnode�����eaddr�� ��������� �����$�� ������� ��1�� �� ����!�� ������������������������� �������������+>��� ���������� ������� ������������ ������

���eread�����ewrite�� ����������������� ���$����� ���� ����% �� ����� �������������������������������� ����������������� ����������#������� �� ������

�������������� ���������� �E

� �=���+�����-$6�����2�'��&���

������+>���$������$��������� ������������������������� �

6�����'����'��������+����'���'/��>��������'����'�������&����

������+>���$����� �� ��������� �����

��������� ���������������.����� -�

�������/etc/hosts ���� ������� �� ��� ��� ��������������� ������ ����� ���

��.��?.�������& �����>������'.�&�����������'���,

�������/etc/ethers����� ��������$�� ��'�,� �����+>�� ��������������������� �����������eaddr�� ����������������+>���$��

!�'����'����-�����&� ���-����

M��#������������������ �eread�����ewrite!������������� $�

$��5��/���-����

���� ����������� ������ ������������� ������ ��� ��������������� ����������

0���!������������ ���$����� ������������� ����������� ��� ��� ��� ����$�

���+>����������!�������� ������ ��� � �������������!�������>������������ ����

� ��� ������ ��!�������>���������������� �������������� �� �������

� ����!� ��������� ����� ������ �������������� ������� ������� ��

1������� ����������������� ������� ��������������������� ����@N.!�D����!� �

NL�� ��!��������������������������������� ������ ��� ��� ����$���� �����

������ ������ ����� ���

)����'���'/���'����'�������>�$��5��/����� '. ���

)����'���'/���'����'�������>������'�������&����

>���� �� ������������������������������� ����� ������� ��� ������� ����>�����

�������1�������������� �!�������������������� �������������������+>���$!�

� ��������� ����� ��� ������� �!������������������$�

������������������� ������� ��������+>���$��������������� �� ���������E

4� >������M+1N�� ������ps-e� ��% ������ ���������� ����1�� ��������+>���$��������� ������ �������limnetd�

'� >������M+1N�� ������kill –a PID!����PID�������� ����1�� ��������+>���$�� ����root�����#���������kill�� �������

/export/home rwxr–xr–x

/export rwxr–xr–x

/ rwxr–xr–x

Page 275: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ������ � *��3� � ���5�3�����*5���� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

��-����.�������,

���� ��� ��������������$ �$������� ������+>������������@N./-,,,�������

��� ��� ���� ������������������������� ���������������������������

��-�������������&����

���remote_node��������� ����� ����� ������������ ������

"<!* $������������-��0��� ������

������������� ��@N./�������������D����!�@N./-,,,!� �NL�� ������������

�������� ����������������� �$���� ���������� ����� �@+A.����������� ��� �

��������

K � ������#������!����unix_vxr�����vxr_unix � �������� �$���������������@+A.�����@N./�������������

K � �@N./��������������������!����convert�� ��������������������������������� �@+A.�����decomp����������������������������� ���������������@+A.�������� ���

K � ��������������!����convertbru�����sread�� �������� �$������������������������� �$����������� �@+A.��

�����-:�������9������ ������������ ������� �$�� ��

$���������8������

�#���������$����������� ������������ �����$���� �����M+1N/������������

���������� � ��@N./�������������� ������� $�����#������!���������������0����!�

� �� ��������� ��� ��!����� �� ������ �����������������������������������

�� ����� ����� �$�� ��

��������#�� �M+1N��#��� �@N./������#�E

��������#�� �@N./������#��� �M+1N��#�E

� ��@+A.E unix_vxr(UNIX_file,VXR_file)�

� ��M+1NE unix_vxr UNIX_file VXR_file

� ��@+A.E vxr_unix(VXR_file<,UNIX_file>)�

� ��M+1NE vxr_unix VXR_file UNIX_file

� ������ ������ �$�� ��� ������

$������convert(VXR_file) � �$����������� ��@N./����������

convertbru(file<,options>) � �$������������@+A.�

convertbru file <options> � �$������������M+1N�

cpos_cvt VXR_file � �$����������� ��@N./������������M+1N�

decomp<(VXR_file)> �� �� ����@N./��������� �

sread(file<,template>) .���� �$��������������� �@+A.

unix_vxr(UNIX_file,VXR_file) � �$��M+1N��#�������� �@N./������@+A.�

unix_vxr UNIX_file VXR_file � �$��M+1N��#�������� �@N./������M+1N�

vxr_unix(VXR_file<,UNIX_file>) � �$��@N./������#�������� �M+1N��@+A.�

vxr_unix VXR_file UNIX_file � �$��@N./������#�������� �M+1N��M+1N�

Page 276: Getting Started with VNMR 6.1C

���� !*5�� ���� ���� .�����% �#%

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

1������������������#!�VXR_file����� ��������������UNIX_file��

� �� �����vxr_unix� �������� �����������#������ �������� ����@N./����/���������������@+A.�� ������vxr_unix �������� ����UNIX_file!����������������� �������������� �����#������ ��

$����������������

������������� ���$����������� ���� �����M+1N/���������������������� � �����

@N./������������������������������� ����@N./�������������� ���$�� ���

� �$���� ����� �����������M+1N/�������������

� ��@+A.!����� ������convert(VXR_file)�� ������������� ���������VXR_file���� ���������#����������� �$������� �������� ��������convert�� ������������������������ ��rt�����@N./�������������� ��������

���������M+1N�� �����!�cpos_cvt VXR_file!���� �� �$��������������������������� �$����������� ���������� �� ����������� ��������� �!���������� �������

���� �������������

������������+,����

���� ������decomp<(VXR_file)>��������@N.������!����� ����� ����@N./����������!�����#����������������� ���������M+1N������������������� �������

� ���������������� � $����+>����������� ��-6'������������ ����decomp��������M+1N�������� �������������� ��������� ���������������� ���������@N.�

���������M+1N������������� �����M+1N�������� �������$��� �����@N.�������

������������ ����� �������@N.������������$����#���� ��������� � .NNN!����NNN������������ ������������� �������@N.�����������+>����� �����������������������#���� ���

+ �������������������� ����� ����@N./����������!������������ ������������� �������

���� �� ��������������������� �� ������������ ������� �������� $�>�����

��� �������� �����!����� ������decomp������� ��� ��

����,�� ����;8������0�����=;�

���@+A.�� ������convert����������1������� ����@N./������D����!�@N.!� �NL����������� ���� ������������������@+A.�� ��������� ������$������������!�

� �$����������� ��@+A.�� ������� �@N./������ ���!�� ��� ��#��������#�����

�� ���� ������������� �� ����%������������������+>����������� ��@N./�����

�����!���D����������2������3

4� ���� �� ������ ����������������������� ������ ��E

> eread h1 gemini fidlib.h123> ls h1*h1.5> vnmr

'� @+A.��������1��@+A.!���E�convert('h1.5')

���convert�� ������� ����������� ������� �����@N./������ ������SVF����� ������ ��2233�� �����eread�� ����������������������fidlib.h1����'6��� ���������9����������#�2.53��������������������h1������@N./��������� �������8�����!���������������� ���$���1��� ��@N./������������

6� � ���$������������@+A.�� ���!���E�svf('h1')

Page 277: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ������ � *��3� � ���5�3�����*5���� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

-� @������� ���� �������������������������ls('h1/*')

@+A.�������������� ������ ��������� ��h1.fid!������������svf���� Efid procpar text

���decomp�� ���������������������� ����� $�� ����@N./������������1���������������� �� �����M+1N������!�������������� �����@N./����������!�����

�������� ������������������@N./������������ ���������������������������� ������

�#��#������������������� $���������convert�� ������

4� ���� �� ������ ������������!����������� ������ ��E

> eread fidlib gemini fidlib64 128 192 256 320 384 448 512 540> ls fidlib*fidlib.36> decomp fidlib.36Loading fidlib/apt.5, 45 blocksLoading fidlib/c13.5, 45 blocksLoading fidlib/cosy.5, 141 blocksLoading fidlib/dept.5, 144 blocksLoading fidlib/h1.5, 23 blocksLoading fidlib/hetcor.5, 141 blocks> ls fidlibapt.5 c13.5 cosy.5 dept.5 h1.5 hetcor.5>

'� ��������� ���!����� �����@N./������1���apt.5,�c13.5!�cosy.5!�dept.5!�����h1.5�������� �$������ �@+A.�� �������������@+A.�convert�� ����������!�convert('fidlib/c13.5')���+ ������������������� ��fidlib������������������� �����convert�� ������

1��� ���� ���� �!����decomp�� �������� ���������������������@N./������1������!���������h1.5��1��� �� ���� ��������������������� ���#��������������������� ���!����decomp�� ����� ������������������

$�������-��1�������

���� ������convertbru(file<,options>)�� �$���6'/���������AN����������'-/�����6'/���������A��������� ���6'/����� ����� �������������@����’��sread�� ��������file��������� �convertbru����������� �������������������� ��M+1N!���������#����convertbru file options��.��� ����� ���� �",��",����� �����������"$��� ����������� ���� �� ��convertbru!�������������� ��� ����$�����������#������

����� �$�������������������� �������� ���!����� �$�������������������� �

@+A.����������� ������sread(file.cv'<,template>)!����file����������� ���������� ������������� �$������������template����������������� ����������������������� �� ������� �par�� ������������<� �#����!�sread('brudata.cv','/vnmr/parlib/bruker')��������� ���������� ���������������������������� ��� ���)��������������bruker.par��1��� �����������������������������bruker.par����� ����� ������������� �������parlib����� �!�sread��� �������������� ����� �������

"<!6 %�����������3�������

�����8,�������M+1N�����@+A.�� ���������� ����������������������� ���� ����

Page 278: Getting Started with VNMR 6.1C

���� ��� �'�"����,���� �*%

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

����������������0��� � �������������������� ��������������$������������������

��������������2����A���!3�����7(���������������� ���� �������$����

���� ��E������������� �����!�������������� ����!������������������������ ���

����� ������ ������ �������M+1N�� ������tar����������$���.������������������ ��� ��@+A.!���tar������������� ���� ������������������� �����1��� ����$�������������� �������� ��������!�������� ��� ��� �������@+A.�����������

� �����%������ ��������������� ���������tar�

������� ����������$�������� �������� �������������� ����������������%����

� �������� �� �����M+1N�tar!�mt6�����dd�� �������� �� ��� ������������� �#����!� ���������������% ����!����� �� ������ ������������������abc�����xyz�� �����������������E�

mt –f /dev/rmt/0lbn rewmt –f /dev/rmt/0lbn fsf 1tar cvf /dev/rmt/0lbn abc xyzmt –f /dev/rmt/0lbn rew

1���������������� �� �����������������������%��� �1�A�.%*5,,,�� ����������������

� ���� ������� ���%���� ��D�������� ����!�������� �� ������������$����� �

��������������� �������������/dev/tapens��$�������������tarEtar xvf /dev/tapens

1�������������������� �� ��������������� ����%���� ��D�������� ������������� ���

� ��������� �� ���%��� �1�A�.%*5,,,�� ����!�������� �����������$�������

tar�� ���������� ���������� �������������)�������!�������� �����������Edd if=/dev/rmt/0lb conv=swab bs=20b | tar xvBfb - 20

�+ �����������������������2-3��������2203���������� ������ �������������

�������� >������������������0�����������������!������������������������

���,����������,�����������������������!

�����������������?��.�4@��)<<<.����@+� ������

���� ����� tape(<type,>keyword<,file>)�������������� ������ ����@N./�������������� ����D����!�@N./-,,,!� �NL�������!�� ���� ����M+1N/����������!�

����� �� ������� ����@N./������������ ������������� ���type����������� ������� ������������������������4*-���������!�keyword�������'help'�������������� ��� ���!�'cat'��������������� �� ������� ������!�'read'�����������$�����filename!���#����� ��� �������������������������!�'rewind'����������!�4*'��������� ����!� �'quit'���������������$!�4*'��������� �����

� ������ A����������� ���� ���� ������

$������dd <option=value>... � �$������� ����������M+1N�

mt <–f tape> command... <count> A������������ �� ���M+1N�

readbrutape file <num_skipped> .������������������ ��:/����������M+1N�

tape(<type,>option<,file1,...>) .��������� ��@N./������������@+A.�

tape <type> <option> <file1> .��������� ��@N./������������M+1N��

tar <options> ������������$�!����� �#�����������M+1N�

Page 279: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ������ � *��3� � ���5�3�����*5���� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

1��� ����������@��1� �����1�A�.%*5,,,�� ����� �@��%D1� ����%���� ��D�������

� ����!������� ��@N./������������������������������M+1N�dd�� �������� ����1�A�.%*5,,,!����� �� ������ ������������ ����E

dd if=/dev/rmt1 fskip=1 of=xyz.288

���xyz����������� ��������� ��� �������� ���������'77������������ ��������������� ����������D����� �@N.����� ���'77�� ����� �� ���� �����������������

����$���������� ������� ��������rmt1!���������rmt0�

� �%���� ��D�������������!����� �� ������ ������������ ����E

mt rewindmt fsf 1dd if=/dev/nrtape of=xyz.288 ibs=512000 conv=swabmt rewind

1������� ������!�xyz����������� ��������� ��� �������� ���������'77������������ ��������������� ����������D����� �@N.����� ���'77�� ����� �� ���

� ����������������

� ����������!�������� ��������������xyz.288 ��������#������������#������ �� ����������������!�decomp xyz.288)�

���decomp�� �������������������� ��xyz!������������$������������ ���������������� �������������� �@+A.����������convert�� ������

������-��1������������������/�����1�����

���M+1N������������readbrutape����� ������� ��������������� ���M+1N��������������#��������readbrutape file <number_skipped>!����file����������� ��������������� �M+1N��� ������������ �!��� �bru�#���� ����������� ���������������� ��� �����������number_skipped������������ ������������������������������������!������������������ ������������� ��������������������������

��������������������������������������1��number_skipped ������� �,!�������� �������������������������� �����#������� ���������������

�����������readbrutape�� ���������������!������������ �$������������convertbru�����sread�� �������� ���������@+A.�

����������������=��0��1

������������������������������������ � �� �� �����!�� $��������������

�������������� ������ ������������ ��� ��� ������������ ���������������� ���",�

=����!��=���2�����"�������!�"���������������������� ��� ��� ���� $������� ��

���������� �� �����M+1N�� ������E

K � ��������������� �� ����� ������ ����� ��� ����������2���5,,3E

rsh -n lal600 dd if=/dev/rmt/0lb bs=20b | tar tvfbB - 20

K � �������������� ������ �����E

rsh -n lal600 dd if=/dev/rmt/r0lb bs=20b | tar xvfbB - 20

K � ���������������file1!�file2! ������ ������ �����Ersh -n lal600 dd if=/dev/rmt/r0lb bs=20b | tar xvfbB - 20 file1 file2 ...

K � ����������������file1!�file2! ������ ����� �����E�tar cvfb - 20 file1 file2 ... | rsh lal600 dd of=/dev/rmt/0lb obs=20b

Page 280: Getting Started with VNMR 6.1C

���� ��� �'�"����,���� �*%

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

M�� �������!������������� ����������� �� ����������� ���#�� �����������

�������� �� ����1��� ������ �� ������������!�� ���� ������������$��������������

� ���� ������������������������������� ���� �� ���� ���� �!���� �� �������� ��

�����M+1N�tar�� ������

%�������������$�����%���������������������1

���4�--/A������ �����������$�� ���� ��� ���%&�.������ ��� ������� $������

� �$���������� �� ����� ��� ������������� �� �� $�����!�������������#������!������

���%��!�&�����!�A����� �������� ���

���%���� ������fdformat�� �������4�--/A������ ���������������� ������� �������������/dev/rfd0!���2��3��$��������� ����� ���������������������������������� ���������tar� �bar�� ���������������� ����������� � ��/������������������������� $������� �$���������� ���������������� ��� � ���

1��� ����������� �����������������$������ �������������fdformat�-d!���� %����������������������� ������� ����������" ��������������� ������ ���� �������������

� �������������!����.!,�,�"�������� ��������""!"��

1��volmgt����� ��������!�� ������� ��������������� ������������root!�����������mount -F pcfs /dev/diskette0 /pcfs��

+ ��� ������� ��������� ����/pcfs����� ���� ��#������!�� ��� �������unix2dos Suntextfile DOStextfile!��������� ��������������#��� �$�� ������������ ���!������ ��������� ����� umount�/pcfs�� �� ���������� ������eject floppy�� �� $���������� �������$!�� ��������������������� ���&�������������������������������#������������ ����������������� ���������������� ����$�� ���root�� ��������� �������

�A��� �����������������������(�8��� �������������� ����A����� ��!���� �� �����

��������A��/� /&��� �����$����� ������;����� ��� ������� ����!�� ������� �����

��������� ������ ��� ������ ��������� �������������������#���������������������������

������������� �� �������������

A��� %�(�8������������������&���� ������������� ��������� ����� �����

" ��������� ��������� ��������������M+1N����������E

4� ����������fdformat�� �� ��������� ���!���Enewfs /dev/rfd0c

�������$��!�� �������$ ������������4,������2������3������������������ ��

���� �������� $����������������E

newfs -m 0 /dev/rfd0c

'� ���������� ������� �������� ������������E�

mkdir /floppymount /dev/fd0c /floppy

+ ��/floppy����?������� �������������������� ������������������ ��

6� ;���� ������������ ���!���E

umount /floppy

-� � ���������� �������������������� ����!������������ ������$�������E

mount /dev/fd0c /floppy

������� ����� �� ���� ���������������������

%������������ ����������� ��� ����� ����������������� ����root����������$������ �� ����� ������� $��1���������� �!�root������ ������� ������ �� ���������E

Page 281: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ������ � *��3� � ���5�3�����*5���� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

4� 1��������% ����!�����������������mountfloppy���������E#! /bin/csh -bmount –F pcfs /dev/fd0c /floppy

1��� ��������% ����!��������������mountfloppy��������������� �E#! /bin/csh -bmount /dev/fd0c /floppy

'� ������ �������������ejectfloppy���������E#! /bin/csh -bumount /floppyeject

6� .�����chmod 4755� ������� ���������������������������/floppy ���� �������(((��������������

������� ������mountfloppy�����ejectfloppy��������� �����mount�����eject�� �������� ���� ���������� ������� ������������

"<!7 $�������������

������� �������� ����� ��� ��������$�������� ������������� ���������������

���� ����$��������� ������������ ������� �������������� ��������������������

M+1N�compress������������������/��� ��� �������������� ������������!��������������-,�� �8,����������compressfid�� ������������ ��������9��� ����������������� �� ������ ���/����� ��@+A.��1�������� ������������ ��

$������������������������'�����������

1��� �����compress��������������������!�compress mydata.fid��� ��M+1N!����compress�� ������������������ ������������������ ������������������������������������� .Z������#�����!�mydata.fid.Z���

" ������� ��� ������ �������� �!�� �� ����������� �� �������� �������� ���������1��

����������������������� ���� ���������������� ����������� ����� �������������� �

��$������ �������1�E

"svcf - save compressed fid"

svf($1)

shell('compress'+$1+'.fid/fid &')

����� ������ ���$������ �������1�E

"rtcf - retrieve compressed fid"

shell('uncompress'+$1+'.fid/fid')

rt($1)

������compress�� ��� ��� �� ������ ��!����������������������� ����������� � ���� ��!�������������� �� �����$�� ���������������� �����������������������������

���������������� �� ���������� �������tar�� ������� ������ ��� ������������ ������������!�tar cvf mydata.fid.tar mydata.fid)

�������������������mydata.fid.tar���������?������������������ �����������������������compress mydata.fid.tar���������mydata.fid.tar.Z���������

� �$������ ���!���� ��������������������E

uncompress mydata.fid.tar

tar xvf mydata.fid.tar.

�����#������������ ������ ������������������������������ ������� ���

Page 282: Getting Started with VNMR 6.1C

���� !*#���%%���� �

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

&� ����������� ���� ���������/vnmr����� �!�� �#����!������������������ ��8�-�A�!�� ������ �44�:�A��� ����� ��������� �!���88������� ����� ��������

������#����������� ������ ��� ��������������������

$��������������������������'������

� ��������������������������%&���1�������������� �� �������� ����E

K �%&������ ���������������������������������������������� ������� ���� ��

$��������������������� ����������$�������������0��$������1�����0����

���� ����%&�

K 1������%&�� ������1�������� ������� ����� ����

���������M+1N�� ����� �� �����������1����������compress� �gzip������������ ��� $�����������9 ������� ������� ������1��� ��������������������!����

������������ ������������compress� �gzip�� ���������������������gzip�������������� ������ �����$�������� ���������������������������������� ���� ������

� ���������������������� ���������������������������������� ������� ����� ����

� ���������������$�������������1������ ����������������9� �������������������������

����������������� ����� ��� ����

1��compress�����gzip�� ���� �� ��� �!���� ����� ����� �� ��� ��������@+A.�� ������compressfid!�������� ���������������� ������������ ���dp='n'��� ������������$������ ��compressfid�� ������ �compress�����gzip������������ ���������������� ����� ���������������compressfid�� ����� �!�$���� ���������� ���� ��� ���������������������� ��������

$������������,����������4=%���'������

���� ������compressfid�� ������� ���/����� ��@+A.��1�������� ������������ ����������������������dp����procpar��������������������? ������ ����� ���8,������������0��������������� ��� ���������������������������������

� ���� �� ������� ��������compressfid������������ ��������� �����������@+A.� ��������������M+1N��$���� �������!���� ����������� �� ��

compressfid�������� ���� �",��",����� �����������"$��

Page 283: Getting Started with VNMR 6.1C

!&�� ������ � *��3� � ���5�3�����*5���� �

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

Page 284: Getting Started with VNMR 6.1C

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

��� ��

���������������� � ��������+A.�������� �� �������� �� ������

��0������ ��� ����

��$ ���� �/� /��������� �$���������9��������� ���������

� ������ ��

�������������� ���� ����/������������������������������������������

� ������� �������� �������!��������������������� � ���� �

��������������������������������� ����������� ������

� ������ ����� �� ���������� �������

����� %�� �������������������� ���������������������

������������

-���������0���� ��� ����� ������$�������� ��@��������������

��������� ����������� ��� �������������9�4�!����/

� ���������!�� $���������������������!��0����!�����

���������� �������������������������������� �����

-��10��������� ���� ����/����������������������������������� ���

������������ �������������������

$�; � �� ������ ��>�$� ��������M+1N����� �����

�$� �����

������������ �$���� $����� �� ���� ��������������������

�����������0��� ��� ����� ������$�������� ��@������ ���������

��0������ ���������������� ������ ������������ ��

��������� ��� �������������������������������� �

��� ��

�����������

���������A� �B

����������� ��@+A.�� ������ � $�������������!�

���������������������� �����1�!���������� �����������

������������� ���%&��������� �������� ����$���� ���

���������!���� $����������������!��������

�����������!�������������������

��0������ .��������������� �������� ������������1��� ����

��������������0����� �����������������������

�� ������������������ ��������������� �������

������� �������������������������������������� �������

�8������ 1��@+A.!������� �����������������������������

�� ��

�'� ��������� ��������%������ ��$��� �����

#������

Page 285: Getting Started with VNMR 6.1C

��*%%���

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

��������������� � �$������/� ������������1������ ��0������ �����

���������

��;������0��� ������.����� �� ��>������������� ��� ����� �����

��������$�������� ��@���������������9����������� �

��$�������������������� ���������������� �������

+A.������������.>��#��������� �/� �����$����

��� ���� ��� �������� ��1+��>XM��>�#�������

����������������� ���� ��@�����+A.����� ���������

���� ��@+A.����������

������������� %���� ������ �������� �� ���������� ���������

'���A���������

������������5������B

;��� ��������������$����� ������ ���$������������

������������� $������� �9 ������������������� ���

������������ M������ ���� ��� �����2���3� ������1��� �#����

����1�����������$������� ���� ���� $�����

� �����������1��� ������� ��������� ���� ���������

������� ��� �������� �� ����������� ���!�����1�����

����� �������� �������������������

���1 �������������� ��������� �� ��/����������������

���� ��������������������

����� %������ ����������������������������� ��� ������!�

��� �!������������������ �������� ��

%�?'$�+ A�D�����1��������� �� ���������������L��������

A�� ������������������ �@+A.

������� ���� ��@�����+A.����� ���������

���������� ���������������������0������ ��� ������������

@#; ���A�

=%���������

����������

%��������!����������vnmr1!��� ������� ������������������ ��� ������������� ����������� ��@+A.�������

���� ���vnmr1������� ����������� ��@+A.!������������ ��� ����+A.�#������!�� ��������!����

=%��������������� A��������� ��+A.����� ��!�� ������� ��� �� ��

��������

3��#��0� M+1N����� ������$� �����

���������� ��0���������������������������������������������

����� �������� ����!����� ������ ���0������ ������ ���

���������������� ���������%&��� $��������������������

����������������� ������%&��

���������������� ��� �����������������������&�D��� ������ �����/

� ���� ����0�����#�������

Page 286: Getting Started with VNMR 6.1C

��*%%���

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

�������������������� %���������� ���������������� ���������������������� ��

������������������ ����$�����������������!�

� ����$�!���0������ �!����� ������ ���� ���� �������

����$���������

���� � �/�$������ �� ����M+1N��������������� !�� ����

���� �����M+1N����������������� �

���� %�� ��� �������������������������������������������

����� ������������������

����� %���A�� ������� ��������$� ������1�������

%�� %�

�$�� D��������������0������ ���������$� ������ �

�������������0�����

�3 %���A�� ������� ��������������&��� �����% �����

�='�:������� ���� ��@�����+A.����� ���������

����������������� ���� ��@�����+A.����� ��������

�='�:���������� ���� ��@�����+A.����� ���������

�='�:�������������� ��������!�M+1�"����!�����M+1�"����� ���

�������

������,���� M�/� �������������������������userlib����� ��

4=%� +��� ��@����C��+A.���������� ��� ������������

���" L �������� �����+A.����������������� �

4��' @�� �� ��@+A.�� �1�A�� ������ ���

4�� ?' @�� �� ��@+A.�� �%D1�� ������ ���

4@�� � ���� ��@�����+A.����� ���������

4@��������������� D����!�@N./-,,,!�����NL����� ����������

0��1����� @+A.������������������ �������� ����� ���

�����

Page 287: Getting Started with VNMR 6.1C

��*%%���

��� �� ��� �� ������� ����! ������������� �����

Page 288: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

�� !"

#�$%��/]I����� �!�-'B���B��������0� ���� ��������� ���� �!�:8I�� ����0����� �!�4:8��������!�'(7��������!�'55���������!�'5(!�'5:�� �������!�-7�������� �DL1�>�#������!�88��������!�'55!�'5(*������������ ������� �!�6-/W�@����� �!�('!�(-/W&=����� �!�('!�(-^��0���� �������� ���� �!�:5_�������������� ���� �!�:-!�478

��$!�&'�4������������������!�((4���������������%� ��������!�(74�������A��������� �����!�((4�������& ����������!�(44����������%�9�%���� �����!�(74��#�����!����� ��9���!�884��&� ���������!�(74��& �������&�����%�������!�('4��&����%0����%�������!�574��&����%0����%����%� ��������!�5:',/����������9!�',6'������ �!�5:'������������������!�(:'���������������%� ��������!�7,'�������A��������� �����!�(:'�������& ����������!�(6'����������%�9�%���� �����!�(:'��1��� ����& ����������!�(-'��L���L�������� �!�7''��&���&���������� ���������!�(8'��&���&�������>�������!�(5'��&���&��������������!�(5'��&� ���������!�7,'��& �������&�����%�������!�(-5,/�������������� !�4745/�������������� !�474:,/�������������!�44-!�4(5

��'������ �!�76�'�'������ �!�7-�'������� �!�7-�'�������� �!�7-�6������ �!�7-�6�'����� �!�7-�6�'������ �!�7-�6������� �!�7-���� �����!�4:4!�4:8������� �!�76�������� �!�76��������� �!�7-����>����� �!�7-�� ����0����� �!�58!�4:4�� ����0������ �!�4:4

�� ��#���������� ���!�58��� ������� �� ���� �!�'68��� ����� ���� �!�'54��� �����������!�6(��� ���/���������� �!�'',!�'66��� ���/$����'��#������!�'4,��� ���/$����� �!�('!�(-!�(:!�7,!�'46��� ��� ��������!�'4'��� ������ �!�57��0�������� �!�6-��0�������� �!�4:5��0������ �!�58��0��� �����!�-,!�4-7!�488!�4:8��0��B��B��� �����!�48(!�45,��0� ��� �������M+1N�!�4:5��0������ �������M+1N�!�4:8!�4:5��0�������� !�-,��0������������!�4:(��0������� �!�55!�5(!�4-7!�4-:!�475��0������!�(,��0����������!�4(4��0������ �!�475R4:(

�� ����!�4:4����$����� �!�4:5��� ����!�:7��� ������� ����������� �!�46-� ��!�4:(���������� �������� ��!�4-7� ��� �!�4:( !�4:' �� �!�4:(��� ���� �!�4:5����������!�475� �!�'55�����������!�4:5� ����!�'-0�����!�6,!�47:� ��� �� �!�4:8���������� �����!�4:,�� �����!�4:,�� ���������!�4:4���!�4-4����������!�4((����� ��� �!�'48���� ��!�-:

��0������ ��� ����������� �!�6-��0������ ��� ����!�'-!�4:'��0������ ��� �� ���� ��!�'-��0������ ��� �����!�6(��0������ ��%���������� �!�'7!�-,!�-4!�--!�-:��0������ ������ �!�'7!�64!�-,!�-4!�-'!�--!�-:!�

4-7!�4-:!�48,�� �������� �!�6-������$���0������ �!�66�����������������!�488���� $�� �!�',6�������� �!�76����%���������� �!�7'�������������� ����*��������#�����!�7'���*%������� �!�74!�75���*%����������!�7'������ �����!�76������$����������� ������!�('!�',:!�'44��������� !�444!�'45!�''-

Page 289: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

��� �� ��� �� ������� ����! ������������������

������ ��� ����>������ �!�'(4��?�1%����� �!�((��?�@%����� �!�((��?�;������������ �!�(4!�(6!�(-��?�;&����� �!�((��?�������� �!�(8��?����������������!�'-4��?���������������!�((��?����$����������!�((��?���������� ���� �!�((��$����� ������������!�':�#������� !�'67���� �����!�'',!�'66���������!�'66����������!�4(8!�4(5!�',-��� ����!���� ����!�'46����� �� ������� �!�7,����&��������� �!�(7!�7,���9����� �!�4-5�� ��������!�466!�46-!�488�A�����������!�'(5�AN�����������!�'(5���� ������/�������������!�4::���� �/� /��������� �$�������!�'-!�4:7�����9����� �!�55!�7,�����9����!�74��������������`� �W��� ���� �!�'4���� �����!�'8,������� ����!�'46����� �����!�'46���,���� ����!�'46���,�� �����!�'46������ �����!�'46��������������!�474���/������������ �!�-8�������#��� ������#�������#�����!�478��������� ���A �����!�(,���� �������!�(,�&������ �!�57������� !�6'��������� �� ������!�:6�������#!�:8������� !�:8������������!�477�����#������������ �!�477�����#������!�'55�����������!�:8��������������!�64!�6'����������� �!�78���������� !�78������ � ����� ����� �!�4(7��������!�4-4!�4(8��#��� �����!�478��������& � �����!�57���>+��������� ��!�445���>+��� ��!�448������� �� �������� ��!�4(:!�47,���� �����!�46:!�475!�47:!�4:,���� �����!�4(8��� ������������ �!�78��� ����� �!�(8��� ����� �!�4-4!�45'��� �������� !�4:,��� ����

��0������ �!�:7�������0������ �!�:7�� �����!�::� ������!�::

��� ������� ��/��9�� ������!�4:'�������������� �!�((�������!�'46����� �� �������� ��!�((��������!�65!�464!�4-,!�4-6!�4-8!�4-5!�45'!�

456��� ���������� �!�(4!�475��� ������� %"�������������!�7'��� �������>&��������������!�74��� ����������!�4:-��� ������� ��

����� �����9��� �!�468 �����9������� � ��!�46-��������� � ��!�466

��� ����������������� �����!�'46��� ��������������������A������������ �!�4:��� ��������� �!�((�M� %=1A����!�456��� �������� �!�48:��� ����!������ ����������������� ��������� !�::�@����� �!�7,�$�� �����!�'46�@%������ ���!�'8:�������� �!�('!�'44���������!�',:�N����� �!�7-�N'����� �!�7-�N'"����� �!�7-�N6����� �!�7-�#�!�� ���� ����!�'8,�#��������!�'',!�'6-!�'6(!�'-4�#���������!�'',!�'''�N"����� �!�7-�N"S����� �!�7-

(��������������� �!�4-4����� ������� ����!�4-,!�4-5����� ����� �� ���� �!�6,��������������� �!�(5����������������� �!�4-4�������������!�',4!�',5���������� ��������������!�',4!�',5���� �������M+1N�!�'(:�������� ��� �!�((!�'6,!�'-,��������������!�4(5��������� ����!�','������ �����������!�66������� �!�((���� �����!�'-,��������!�4,8�����������0������ �!�(,��9������ �!�57�������� �����0��!�48(���������!�4(8�������� �!�6-�1+ A����� �!�5:

Page 290: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

��� ���������������� �!�5:���������������!�4(5�� ��/��9��� ��!�4:'�A&������ ���!�'8:� ��!��� ���������������!�'8'� ������� �!�(8� #����� �!�(4!�(6!�(-!�(8!�(5!�76!�'''!�''(!�'64� #�� �����!�'5'������� !�'-:�������������!�','� ������������������ �!�'6� �������� �!�('���������� ������!�'48��������!���� �������!�'46�������!�'(7��������!�485!�487!�4:'�������� !�4'8!�4'5���� ��� ������!�8:����������� �!�7:���%�9����� �!�7:

��46����� �!�57�46���������!�4-5�46!�����6����� �!�5(��������� �����!�477��������

� �� ���� �!�7,���������������!�78

��������� !�',-�������� �

��� ����!�:7���������� �!�(8�������������� �!�58������� ��� �!�'-,�����������������$�� �����!�58����������������� ����!�'-4��� ��� �����$����!�66��� ����������� �!�'67��� �/��� ��� �����$����'�!�(,����� �����!�'58����� ��������!�4(���� �������M+1N�!�6(���� �������@+A.�!�'56����� �����!�'-,����6����� �$��!�5(����6����� �!�57��>����!�84��/. A���$!�'-���������!�477�������� �!�(7!�(:�������� �� ��� ��!�-'����� �����!�'67���� ��������*���!�(7!�(:��������� !�4(6�������#������!�4:,�=�+�������!�448!�445�����

���� �!�6(!�'56������!�'5-

��������!�''���������� �!�77��������� !�4,5

������������ �!�'8�������!��!�'-�����������!�'',������������������!�(:������/�����������!�'-:���

���*��������#�����!�7'�#������ �������#�����!�475���������������!�('!�(-

�������� �!�(5!�7'������������ ������� �!�-'�� ���� ���!�8,�L %>����� �����0��!�48,!�484!�456�� ����� ��!�84�� ����������� �!�84�� �����&� �������!�'5,� ��������� �� ��!�45-� ���������������!�46(� ���������� ����������������!�4:7!�',4� ���������� ������� ������� �!�',8� � �� �����!�'-8� � �� ������������!�'54� � �A������� �!�(-!�(:� � ��������!�'-8!�'-5� � �%���� ������ �!�'-5� ������� ��#������

���� ��9���!�85� ������������� �����!�8(

� ��������� �!�(5� ����������������!�:(� ������� �!�:6� ������

�������!�:6!�:-�����!�:6���!�:-��������!�6-�������$!�:-�������������������!�:-����!�:6�0�������#���� �!�:-����!�:6

� ��������� �!�(5� ���������$������������!�46:� �������0����������!�65� ��������������!�4(5� ���#������� ���!�'48� ������ �������M+1N�!�'7,� ������ ���/����� ���1������!�'74� ������1������!�'7,!�'74� ��������� �����!�'74� ����������!�'57� ����

��0������ �!�'-� ��!�'6!�'8= ��/��0������ ��L���!�'-

� �������� !�:4!�474� �������� �����!�:4� �������� �����������!�65� ���������� �!�:4� ��������������!�:4� ��������� �����0��!�484� ++>��>�������!�-:� �������!�65� �� �!�'6

Page 291: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

��� �� ��� �� ������� ����! ������������������

� +% L>���������� �!�-7� ����������������� �!�4-6� +�������!�-8� +�>+�%����!�67� ����� �����$���;��� ������ �!�4(:� �� ������ �!�(:� �� ���� �!�-8!�7,� �� ��������!�47-� �� �/������ ������� �!�:4� �� �/������ ������� �!�:(� �� �/������ ������� �!�:(� �� �/������ ������� �!�:(� �� �/M����� ������� �!�:(� �$��� ����������������!�'4� �$�

��������!�'(5����������������!�'(-���������1���������� ����������1�!�'4(@N./������1������� �@+A.!�'(8

� �$��� �����!�'(8� �$����� �����!�'48!�'(5!�'(7� ������� �!�:4� ���� �����!�'5-!�'58� �����

���� ��!�'5-����!�:4!�'58

� �����$�����������!�'57� ��������� �!�'4'� %"���������!�7'� %"����� �!�5:!�74� %"�� ���� �����!�7,� ������ !�6'� %"������� ���/0�����������!�(,� %"&%����� �!�5:� ����������������+ >!�4(7���� �����!�'58!�'5:�� �Y�$��� �����!�'(8�������!�4('!�4(6!�''(���

���� �!�'5-����������� ��������!�'45������� �!�77���#�����!�55

����+������ �!�55!�77��������������� �!�4:��������!�'''���� ��� ���������!�4-'���� ��$������ ���� ����!�4-4���� �����!�'65� ��/� ���9��� ��������0���!�5:��������!�-:��������!�:5!�4(5!�4:,��#��� �����!�475�������� !�4'8!�4'(��#�������!�'58��������� �!�7(!�77�����#����������!�-8���������!�-8������ ��������� �!�'56�����������$�#�����!�'58��� !�-4��� ����� �!�(4!�(6!�(-!�(8!�(5!�76!�'''!�''(!�

'64��� �� $���!�'''

��� �� ���� �!�4('��� �!�'(!�8:���� ��9����#������!�88���� ��9����������������!�5-��� ��������!�'66��� ���������!�',6�9�� �����!�'':!�'-4

��������#!�:8�4������!�4(8!�4(5�'������!�4(8�' ����� �!�57�'&ML����� �!�5:��������������� ��!�74��������� �!�7(������ ����� �!�'7,��������� �!�6(����������� ���!�'(8������ ���������� ��!�'48���������

�����>!�87������@+A.�����!�87

���������� ��������0������ �!�4-7������� ��������� ���� �!�6(������� ���� �#������!�64���� ����0������ �!�477���������!�477������� �!�((���� �����!�'-,����$�!�'44����4������ �!�7,����'������ �!�(:���������!�'-,���$������!�'44���� �����!�'((���� �������M+1N�!�'(7��������#� ������������� �!�',:������� �!�4:7�� ���� �����!�'(8!�'(5�� �$ ���� �!�'4,�� �$ ���� ������ �!�74�� �$ ���� �����!�78�� �$ ���� ����������� ���!�78�� ���������������� ���+ >!�4(7�� ���

���� �� �����$����!�4(6�������� �!�474� �������� �!�4'5�����������!�47'����� ���$�!�474�0����!�:8����/� ������� �!�474� � ������� �� �!�4(:� �!�4(7� ������ �!�47'� ������ ��� �!�47' ����!�4(6� �!�474� ���$�!�474� �������!�47'�0���!�47'������!�4(7

Page 292: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

���/������!�4(:��$� ������ !�47'

��Y �����������!�',6����������� �!�77����������� �!�'56�������$���� �������!�:5��������������!�77!�'5-������� �!�4(8���

#���������!�55������������� ��!�7(

�������� �!�55!�7(����� �����!�'5-������!�:(����������!�4(6!�''(�����������!�'''�>&����������!�74�>&������ �!�57!�74�>&��������0���!�57���� ������!�7'������������ !�4,'�������� ������ �!�44-�������� ���� �$��!�464�������� �$���!�4,4��������� ����������!�474��������0����!�4('����������������������!�45:��������!�'-�$����������!�65�$�����������������$!�:4�$����������!�'54���� �����!�(4!�'4:!�'',!�'''������ �����!�''4��0������!�486!�4(4��0'������!�4(4��06������!�4(4��0-������!�4(4������ �����!�''8������� �����!�''8������ �����!�''8������� �����!�''8������ �����!�''8������ �����!�''8���� �����!�-(!�44'��������!�44'!�4((���� ���!�--!�-(!�-7��4���� !�44'��4������!�44'��'���� !�44'��'������!�44'������ �����!�44'!�'45������� !�44'!�4'7!�46(���������!�44'���������!�474����� �����������!�-7������������� !�46:������� ��� ����!�66����������� !�',5����������0������ ��� �� ���� ��!�'-������������!�4:7���������������!�'45������������������������!�'-'��������0������������ �!�',5��������� ���� �!�4-4!�'68

���������������� ���������%&�!�4:(������9��� �� �!�4:7������ �� �����#�����!�477���� �����!�'5-���� ��!�6-

�����!�77����������� �!�'5-���!�7(���������#� ��>����!�'(4����� ���!�'5-� $!�'5-���!�'5-��9� ������!�7:� ������!�7:������ $�>����!�'5:��!�65� ����!�6(

���� ������ �!�7:���� �����!�77���� ��%� ��������!�77������ ��������!�'4'�������

4�����������������!�(('��� �� ���������!�(:'������ �������� �� �����!�(-��������!�488�����������$���!�:5� #�������!�'5'�������������������������!�7,>������ ����$������!�'(,>������ ��� ��!�'(,#������� �����!�4:5#��������������!�76�1�!�488!�'4:�1���������0���!�485�1���� �9 ������!�''8����� �����!�'58����!�-5!�:,����������� ������� ����!�75�����������!�'67�������������!�(:��������!�485����� ��������!�'6,����������������!�(7����������� ����!�'-4�������!�'67�����$� �����9��� ��������!�78��������������!�78������ ��#����������!�55�����������!�'54����������� ��������!�'45�������� �������������������� �!�7-� ����>������ �!�'(4� ��!�'',������������������������!�'-' �� ��� ���� �!�'4: �������$���!�:4������� ���!�44'������$���!�:5�����0�����!�'6-�� ��? ������0��!�'-6������0�������������!�4((������0����!�4(5���� ����������������!�7(

Page 293: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

��� �� ��� �� ������� ����! ������������������

� ������ �� ��>����!�'(4���������������� ��1�!�'68�� ������ !�'''������������������!�46(���������������!�78�����!�'64������� �9 ������!�(7������������0�������������������!�(7������!�45,!�'46!�'4:������������� ��������!�76�������1�!�485���������������!�78�#��������������#�����!�475����� �#�����!�(,$����������!�'',�����������1��!�''8

������������ �!�55!�(8!�74!�:,������������ �!�78��������� �����!�'-4���������1������ �!�(4��������� ��� !�--����������������!�'64�����������!�'(��$������������� ��� ������������!�'-4������� !�78����� �����!�'-4����� �����!�'6-������ �����!�'-'���������!�474��������!�4(7!�47'!�476��'������!�4(:��6������!�4(:��-������!�4(:���������!�47'!�476���'������!�47'���'��?���� !�47'���6������!�47'���6��?���� !�47'���-������!�47'���-��?���� !�47'�����?���� !�47'���������!�('!�(-!�(:!�7,����������!�48(���������!�4(:!�47'!�476���'������!�474!�47'���6������!�474!�47'���-������!�474!�47'�A% ����� �!�57��������!�4(6��'������!�4(6��6������!�4(6�� ��� �����!�'(,!�'(6� �������!�486!�4(6� �'������!�4(6� �6������!�4(6� ��� ��!�4:(� %����������!�'(:� ���/����������������!�478� ���/����� ��@+A.��1������!�'74� ���/0�������������� %"!�(,� ������� �!�488� ��/� ����!�:(� ������������!�',8� ���������������!�4:7

� ��������������� !�',8��� �����!�7(��������!�',-!�'74��/���������� �!�7(��/#������ �!�75!�7(����� �����!�'6-����� �����!�'-'������ �����!�'-'��/��������� �!�75��/0�������� �!�75!�7(����� �����!�4((���������!�474!�47'!�476���'������!�474���6������!�474���-������!�474����������!�474����'������!�474����6������!�474����������!�47'����'������!�47'����6������!�47'�X� %"����� �!�(,����A������ ��!�'-6����& ��� ��!�'-6����� #!�'5'����� �����!�'54�������!�'54���� �����!�'68��������!�47'��'������!�47'��6������!�47'��-������!�47'������ ���'���������!�(:������ ���������!�((������� �!�'64���� �����!�(6!�'4-!�'4:!�'',!�''8!�'6,!�'-4���������� �!�(4!�(6!�'''!�''(������� �����!�'68��� �������!�',8��0������!�47'��0'������!�47'��06������!�47'����������!�',5��������� !�4-,�����0������!�',5�%&������������������ �������!�4:(

� ���������%&��1������!�'74���������!�',,��������� �!�(7��������� �!�(7�������� !�4'8��������!�4(6

����� !�4,->�������������� �!�4-4����� �����!�'(4!�'(6>�������� �!�(8!�7'!�:4������� !�478�����#������!�:4!�478��������� ���� ������!�47'>?������� �!�88?������� �����0��!�48,

Page 294: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

>?������� ���DL1�>�!�4,-?���� �������M+1N�!�'(:?�������������!�4,-!�48,������ �����!�'(4>������/��������������� ���!�(7!�'-:����������������� �!�-(���� ���!�88������� ������!�:-������@+A.!�6:��������������!�:5�������������$����!�:5>&%������ ���!�'8:���� �����!�'(,!�'('!�'(6����� �����!�4(5� ��� �����!�-8!�4:(� ���������!�-8!�4:( �� ��!�4:( ����������� �� �!�468 ���������������!�-8 �������� �����+>�!�'(6>������ ��������� �!�'->�������� �!�'5:�������!�'(6����� �����!�'(,!�'('!�'(6#������������������� �!�4-4#���� �����!�-4>#���@+A.����� �!�-5!�:4#������@+A.!�-,!�84!�:4>#��]����� �!�55#�]��������!�'58#�4��� ����#�:�#������!�64!�55#�8�#�����!�7'#�����$�� �����!�4:(>#��������� �!�(4!�(6!�(-!�(8!�(5!�76!�'''!�''(!�

'64#�����

�� �!�58����$!�47:� �������1��!�477������ �!�477����!�55� ���� �!�4:8� ��������!�4:8� ���!�4:5� �����!�4:5����!�-8�� ����0������ �!�4:,�#������!�478

>#���������� �!�8-#���������!�4((#������

���������DL1�>!�88���� ��9����������DL1�>!�88������ ����� �!�'58������� ��!�64�����!�64!�'58��������#����������!�64����!�'58��� ����� �� ��� ����������!�'57������1�!�64�������!�6'����!�64������ �#�����!�'58������!�4,(

������ ���!�466��������������!�8-

#������ �����!�64!�6'#���������0������ ��� �����������!�',6#�� ��� �����!�4:8#� ������������������ �!�74>#� ����������� �!�74#� �����������/�0������������!�74#� ���������������!�('!�',:!�'44#� ������ �!�6-!�65#������ �����!�4((#����������� ��@N.������!�'(8#����������������$����!�46:

)��� �����!�'67�4�A ������ �!�7,�4������ ������ �!�(-�4:����� �!�57�4R�:����!�-6�'�A ������ �!�7,��N������ ���!�'8:��������!�4(8��� ����� �������M+1N�!�'(:�1�

�������!�488!�'4:!�''-��������������!�'',����!�6(�����!�6-����� ���� �!�''4�� �����!�''-�����������!�6(��������� ����!�4-6����� ���� �!�'',�� ��!�64!�6(��������!�'''$��������������� ���� �!�'',$�������������?������!�'''$������������������1�!�''4���� ������ �!�'''!�''6

�1������ �����0��!�48,!�488!�485�1����������A��!�'''�������!�6(!�'55�1�� ������� ����/�����%&!�',-����������� �!�6-��������� !�''-�1��

��0������ ������� ��� �!�'48� ���������#�����!�477� �� ������������!�''8� ���������1�����������!�'7,� ������1�����!�'57� �$�����������1����� ��������1�!�'4(����$�!�'44���� �� ��� �������!�'48#��������� �!�'48!�'7-��������!�'44������������!�'4-� ����$�!�4:(����� ���� �!�'4-��$��1�������1�����!�'5(��$���!�'55�� ������������������� ���1�!�4(5

Page 295: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

��� �� ��� �� ������� ����! ������������������

��������������� �!�',:�����1��������#�����!�'55

������ � ������0������!�4-,����� ����!�46(����� ������ �� �!�4('���������������������!�44,�������� �!�-5!�55!�(8����� ����

&� �������!�'8:� ������������!�'8:& ��%����!�'8:

����1�� ����� �!�7(���������!�44,����

� �������!�'7,���� �!�'5-���!�7(!�'5-��������� �����!�'58>�����������������#�!�'(4#������!�55����� ���!�'58 $$��� ��������!�68���!�'5-����������������!�'('����������������� ���!�'(:������ $�>����!�'5:

������ �����!�:,���������

���!�:,%� ��������!�:,

�����1�� ���� �����!�7:�����A�������!�7(�����%� ��������!�:,����������!�6-������������!�7:�������� ��!�4:7������ �/��������!�'48����������� ����!�4:7�������������!�',4!�',5������������ �!�',4!�',5������ ���� ������� �!�7'����������� !�474����� ��� �� �!�4(:����������������!�46(��������������� �����1.�����!�',4!�',5��������� �����0��!�48(����/ ���������� ��� �!�'6,!�'-,����������� ������� ����!�75�������� �!�78���������������!�78��������� ������� ����!�75�1�%������ ���!�'8:��$/����������!�7-��#������ �!�4,:!�44,�����������!�:5��������������������!�47��������� �!�-(!�58������ �����!�-(��������!�4(5�� �����������$!�'(:��������!�'44!�'-4�+�%��������� �!�('!�(-� ������� ��!�7,� ���� ���#������!�'(-

� �������!�('!�(-!�:8� �������� ���� �!�',:!�'44

� ���#!�'48������ ������!�'48���� ���!�-8����� ��� ����!�'44 ����������!�'4'��!�'48�����!�(4

� �/����������!�7-� �������������������!�44,����� !�'66�.>��� �����������!�66��������� ��������%��1���/� ���������!�:-�0�����������!�'68�0����������� �������������!�'48�0����/�����������������!�',-�0����/ ������������!�',5�0����/�������0������������ �!�',5��0������!�',(���� �����!�',:!�'44!�'48��������!�-8����� �����!�'5:������������������ �!�7'��������� �!�(4!�(6!�(-!�(5!�76!�'''!�''(!�'64������ �����!�'67������������� ���� ������!�'67�����1���������� �!�(6����� �����9��� �� ��� ��!�468�����%������� �!�(7!�(:��������*���!�(7!�(:�������� ������� ��!�(6���������� ������ �!�(6������������������� �!�(:��������� ��������� ����!�4-,������ ��������� ��!�'4:������ �����!�-6������ ������� ������������ ��!�8:��99��� ���!�'46

���� �����!�46:!�475!�47:!�4:'������ ����/�����%&!�',6����������!�488!�4:-D�.&��� ������!�47'D���������� ��9��� �!�'4,D�����������������!�'4,������������ !�'4,D������������� ������!�('!�',:!�'44D������������� ������������!�('!�'44D>A1+1�',,,

�� �������$����!�476� ��������!�4'8

D�����������!�'5:������� ��������� �!�'67���#��� �����!�475������� �!�('!�'44������ !�488!�485!�48(!�45,��������!�',:!�'4,�������� �!�('!�'44���������!�',:D1������� ���!�'8:

Page 296: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

D1�7(������ ���!�'8:DL1�>

���� �!�-:!�86!�8-!�58� �����!�-:!�86���� �!�6-����!�6- ������������ ����!�86���������!�'7!�-:

�� �������!�6(D ����� �!�(,!�475D ����� ���DL1�>�!�88� �� �����!�6'!�448!�46:!�4(4!�475!�47:!�4:4!�

4:8� �B��0�B��� �����!�48(D !�&� ����;������� �!�(4!�4:'D !�;������� �!�(,!�475� Y���� !�475���������� ��������!�45:�������������!�'-�������� ���������!�4-'������������!�478���������� ��������!�445���������������������������������!�'54������������ �!�--!�-5

� $�����#������ �!�58����!�58

������������!�(:!�7,D������� �����0��!�485��������!�485D��� ������� ����0��!�485���!�������9���������������9���!�'8'���!��� ���������������!�'8'�9���� �������M+1N�!�'74

*=4����� �!�57�4���������!�4-5=4!����6����� �!�5(='����� �!�57������ �����!�4:4�����������$!�'6=��������� �!�:4���������������� �� ��!�'48������� �������� �!�:4��������������� � ��!�46-������S4���� ����!�4-,=���������� �!�((=��� #����� �!�(5=��L������� �!�((=��&������ �!�(5=�+������� �!�(5�������������!�4-,!�4-5�����������������!�4-5�����������������!�4-5���/#�����������!�47-������� ������������ ��!�47������������ ���������� �!�',=������� �������������!�8:!�58�������� �!�6-!�(,������������� ��9��� �!�5-=������!�8:!�58=>�'�T����� �!�(,=>�� .����� �!�5:

�� ������� ���� �!�5:�� �������� ������!�476�� ������T/� �$��'�!�(,=����/&�������� ���!�(7!�'-6=����/&�����������!�'--=����/&����������� �!�'-6�#��������� ���� ������� ��!�4-6�����������!�4('����/� ���������������� ��!�',����/� ���� ���� ���� �!�'-8����/��������� �� �!�'-� ������!�''8= A'�T����� �!�(,= ������ �!�77� ������ �!�6-!�65!�6(!�77� � ������!�4(:!�47'� � '������!�474� � 6������!�474� � -������!�474� � ��������?�������!�465R4-,� � ������0������!�4-,� � ������� ���� �!�5:� � �������� ������!�47'!�476� � �������� �������� �� �!�4(:� � ������T/� �$��'�!�(,� � ������ ���� �!�4(6� � �� ���� ���!�4:-� � �� ���������!�4(7� �9 ������#�������� �!�7,� ���� ����!�'8!�4:'= ��/��0������ ��L�����=�L�!�'-� �������!�'(,!�'(6� ������� !�4(5!�',-=&�(-(8���� ��!�'-6=&�(88,���� ��!�'-6=&�&��������� �!�(7����� �����!�'8,=&DL����������������!�'-6=� ?����#������ �!�(8=� ?����������� �!�(8��������!�4:-���������!�4:-�������� !�4'8!�4'(=9�� ��� ��������!�'5'�9��������!�'67�9� ���� �����!�'5'

�1'�����!�'('1�A�.%*5,,,�� ����!�'(71�A�� ������ ��!�'8�� ��� ��� ������� �!�'7!�84�������������!�45,������� �����!�'4(1�������� �!�(:!�7,1������������ �!�(4!�'''���������������!�'4'!�'''1����������� �!�(,��������� ��������!�445��������!�4':!�468���$�$ ��������������!�'461+��>XM��>�������0���!�(,1+��X������ �!�(,

Page 297: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

��� �� ��� �� ������� ����! ������������������

��������1�*���� �������#!�('!�'44�����������0������ �!�4(51+>&������ �!�571+>&��������0���!�571�� ����� �!�(5����������0������ �!�475�������%&!�4:7!�',,!�',5���������� �!�--!�-8���������!�'-,!�'-4��������� �����0��!�48,1�������� ���DL1�>�!�88!�4,8���������������!�4,8������ �����!�'6,�����������!�'-4�����������������������!�475������������!�:-����������������� �!�'-'����������������!�(7������� ����!�'',!�'6,�������� ���� ������������� �������!�'',����������� �!�''(!�'':����������� ����!�((!�'-4�����������!�'6,��������������?������!�((�������$�����������!�'-41����������� �!�(7�������$

��?����4��������!�((��?����'��� �� ���������!�(:��?�����������������!�(:��?�����������������������������!�7,��� ����!�4-,��� ������ �!�4-8� ������!�:-������������� ��!�4--�1������������ �!�''4�1������ ������ �!�'''!�''6������ ���!�'56����������� ��!�''(!�'':� ����������!�484��������?������!�45,��������� �!�'''!�''6!�''7� ��������!�445�������������!�''8����������� ������ �!�''(!�''7��������������!�'4-��������!�'449 ���������� ���������� ��� ��� �!�

'':1������$�4��%��������������A��!�''5!�''(1������$�4��%�����������������!�(61������$�'��� � �A�����������A�������!�(-1������$�'����������& ?��� �����!�(81������$�'��&���&�������A�������!�(8�������$���0������ ������ �!�4-7R4561������$����*%����������!�761������$����� �!�((�������$���������� ����!�'4:1������$�A ������ �!�7'�������$�� ��������������!�5,1������$�;�����������!�(4!�('�������� ��!�474�����$�����1��!�'4(���� ��������!�4':

���� ������ ������ �� ��!�4:-1�����& � � ���1&�!�'5:���� �������!�(7!�'6(!�'-4��$�������������!�'46� ������!�'',!�''7!�'6,� ����������!�4461&��1�����& � � ��!�'5:1&����������$���������?�������!�45,1&������ �!�45,�������������!�45,!�454��������!�''(!�'6,!�'-4����?���� !�'-4��������� �!�78�����$� �����9��� �!�78

+?��������� !�'86?#��� �����!�6'!�4:5? ������#�����!�6'? ���#�����!�55T&>D������ ���!�'8:?�� ��� �����!�'86?�� ��������� !�'8(T/� �$��'�!�(,!�7,

,�������#!�:8O����� �!�'44��������� �!�6-������ ���!�6-������ �����!�6-��� ��!�'(!�-'��� ������� ����� �!�66������ �������M+1N�!�4:5!�'(6������ ����� !�'-6

�L�������������� �!�4-4L4�� �L4,����!�-6L(������� ����!�84L�������� �!�(5L�� �� ��1�� ���� ��A��������+�� �!�'5:���������$��!��� ��� �������� �!�'87L������� �!�('!�(-L�.D>����� �����0��!�48,����� �����!�-(���������������� �!�-5��������� �������9 ��������!�('!�(-L��T��&��������!�'--������� �!�('!�'44��������!�',:!�'4,L������� �!�(7!�(:�������� �� ��� ��!�-'!�8:����� �����!�'67��������� ��������*���!�(7!�(:��������!�'4'���/� ����!�:(���/������������1�!�'4-������ ��:,/�������!�4(5���� �����!�4,7!�'5-

Page 298: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

������ �/�0������������ ��!�'45�����������!�'-4�������� �!�6-������� ��� ����!�6-L��������� �!�55���0������!�'-4���+>��� � � �!�'5:���+>���$������ ��!�'(6�������� ���!�'(6����� ������!�',:����� �������������!�('����� ���������������!�('!�'44������������ ����������������!�78�������������� ��� �� �!�4(7������������� ��� �!�'-,������ ����� �!�47'����������� �

��� ����!�'45������ ���������� �!�'48

�����������������!�'-�����#/�#�������!�75������/�#�������!�75���/�����������������!�'54L�������� �!�(7��0����� ����������!�4,'��������� �!�7-���������!�'5-����� ����� !�4,:!�46:!�'57�� �������!�486������� �!�78�����������!�'6-���0������!�'6-� ��

������������ ������#�����!�7(���������������!�:,�����!�:,������������� ���������� �!�7:@����������� ������#�����!�7(

L ������� �!�7(!�:,� ��������!�46(!�467!�488L ���&��������� �!�:,L ���%��������� �!�:,� �������!�4,5� ���� ������� !�4(:� ��!�46,R465

����� ��� �$��!�464�0����!�'-!�4('����!�46'� �����������!�4('� �!�4:8������!�464!�466!�48'� �!�46'� ����������� �����9��� �!�46-� ��������������!�4-,������� �!�4-,��������� ����!�4-6� �$���!�444������!�48'����� �������� �� �!�465

L �O����� �����0��!�48,!�484� ���� �����!�468L �O��������!�484!�486� ����0����!�'65� ����0�������0������ ������ �!�468

� ����0����!���!�486� ����$���������!�-6� ����$������ ��!�468L �O����!�484� �����$�����!�48(� ��Y+����������!�4:8� ��Y+��� ��������!�4:8� ����0��������!�465� ����#�����!�4:5� ���0������!�486!�4(4!�4('!�'65� ������������!�464!�484!�48'!�488� ������������!�48'!�488� ��� �������!�464!�484!�48'!�488� ����������!�465� �����!�6(!�4:5!�'55� ���������#/�#�������!�75� ����������/�#�������!�75� ����� �������M+1N�!�-,� �������� �!�77� ������� !�4,:!�'57� ����� ���!�-,� � ���� �������M+1N�!�-4� ��������������� �!�4-4!�456L ��9������������!�'4,� ��������!�4('� �/�0������������ �!�'45��������!�',-!�'4'!�'46!�'':���� �������@+A.�!�'5-�����������!�48(!�'44!�'4-!�''4���0������!�'48!�'4(�$�������!�'':!�'-,L$�*�������� �!�(6!�''(!�'':

�A�������������� �!�4-4A����� ���� ����!�'(:����������� �!�6-!�(,!�:7��� �

��� ���� �!�:7�����!�6'!�:6��� ���#���� �!�66�������!�6'���������� �!�6-����!�6'

A�D1��L�11��������!�6'A�D1��L�11���� ������!�6-�����!�'6!�'8������0�����������!�47������������������ �!�4:������������ ���� �!�'(5����������������!�'6������������������ �!�'((������9��� ��� $��� �0��������!�4(5A����A��!�-5A�������!�-5!�5,!�58A����A������� �!�-5!�58������ ��� !�'-�������� �����!�'57����������� �!�45'����������� �!�6-!�67������������� ����������!�46:�������� �����!�486�������������?��� ����������� �!�4,-

Page 299: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

��� �� ��� �� ������� ����! ������������������

A������%�������!�48(����������������� �!�45'A������� �!�(5!�''(���4�� ������!�78!�''(A���������� �!�((!�(:A���L �����!�4:5������������#���� ��!�:8��#������������������������!�4:4��#��������!�'-6!�'--!�'-8������������������� �!�4-4!�456�����/� ���� ���� ���� �!�'-8�� �� $�� ��� ����/�����%&!�',6�������� ��!�-5����� �����!�5,���������!�--!�8:

���� ��9��� �!�5-��������!�6-�������$�� ��������!�5, �����!�54!�5'!�56

����������� �!�6-!�(,����������!�6-����� �?����������!�4(��� �������!�4-,!�4-8!�4-5!�4:8A1�������� ���!�'8:�������� �!�76A����������� �!�7'��������� !�4(6������ �����!�'5-AL>@/45��� ������!�47'��� ����������� ���!�(7!�'8,A ������!�48(� �������������������!�47A �4������ �!�5:A ����� �!�5,!�55!�:,� ����� �������M+1N�!�'(:� ���� �!�8:� ������� �������!�'4:� ������� ��!�-'� ����$��!�'(!�-4� $�� �����!�'54� $�#������� ����� ��0��!�47:� $�� ��#��� ���������!�:(� $�������� !�',8� $ ������� !�',4� $������ !�4(6� $� ����� !�4('���� �����!�'((�����/�1��#������!�64�������������� ������� ���� ��!�6,����������������!�6'������������!�6,�$�� �����!�'5-�#� ���������!�4:4

�+48����� �!�57���� ������� !�6'��������!�'6-������� ��!�'8��� ����� ��!�'(6��� ����� �������!�'(7������!�8:������ �������M+1N�!�'(:

��������� !�4--�#���������� �!�('!�'44��� ���� ������������ ��!�47��� ��������� ���������� �!�',���� �����!�'6-!�'68����� �����!�'-'���� �����!�'',!�'66+A.����� ��������������!�'6+A.����������������� !�65+A.�������� �� �!�'-+ �1�������� �!�(4!�'''+ �1���������� �!�(6!�''(+ �;������ �!�('!�(-� ������!�'(,+ >�'��� ���� �!�5:+ >%"����� �!�5:� ���� �����!�4:(� ����$�� �����1�!�4:(� ��������!�'6-� �������� �!�4:7� �������� !�'6-� �/������������� ��� �!�'-,� �/����������� ���� �!�4-,� �/����������!�45-+ �������� �!�('!�(-� ������9������ �!�('!�(-+ ����9����� �!�7,� ����9�$����������!�7,� ����9����������� �!�'',!�'66� ���� ����� �$��� ��!�'4��������!�4(8!�'44��������!�4(8!�4(5����������� �!�444�������� ��������!�6-+������%���� �����!�57!�444������������������������!�65�����������!�4(4+�����!�% �$������� �!�5(������������� �!�6-�����������!�'65����� ����������!�4(8!�4(5�������������!�:-������������!�:-������������������������!�'-'������������!�44,

� �?��������!�������!�'86 ��$����� �!�78 ��$���$�����!�48( ������������ �!�84 ��;��� ������� ������$� ����!�'8!�66 �����9������� � ��!�46- ��������2>���3������������!�4(5 �������� ���������!�464 ������� �$���!�446 ����������� �!�76 �� � ���������� ����!�'48 �� �������!�',4 ���������!�',4 �����������!�',6 ����0������!�',4!�',5 ������� ��!�'-

Page 300: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

�������$���!�:4 $����������!�',,!�',6 $����������� ���!�',6 $�������������!�4:7 $������������� !�',,!�',4

��������#!�:8�4�� �����!�4(5�4������!�4(8!�4(5&64����� �!�57���� �����!�'46�������������!�4(���������!�4(8&������� �!�(7!�7,����� �����!�'-6����� ���� ��� �����!�'-'��������!�45,������ �������!�48(������� !�'8,��������� �����!�44'!�'8,����������� !�'8,���������!�4,(

� �����$�����!�'57��������� ��!�44,������������!�4,7��$��!�4,:�����������������!�44,�� ��!�65

��������0������ �!�6(��?������������� ������ �!�'8(����!�:8�������� ��� �!�'6,������/����!�'-:� �� ��� �#������!�6(����� ������#�����!�444�������$����!�:5�����!�:6��������� ���!�44'������$������������!�'4:���!�:8������������ �!�:5�0����/����!�4(4��������� ����!�4-5������������ �!�:5�������$���������?������!�45,����� ������!�('����������� �!�'45����!�:- ����9��� �!�4,(�������!�'4'�� ������� ��$����!�'-:&����������D�������&�D��� ���!�478� ���� ����������!�('��$�� �����������!�'5(�������������!�44,����� �!�('!�(6������������!�46(����� ��!�:8����!�:-������ ���������������������!�44,$�����������!�:5

$��������!�:5��������!�('

������!�� ���� ����!�'8,&��������� �!�(7!�7,!�78����$����� !�44'�������� !�',8&�������� �!�77����� �������� �!�77�������!�:-����#���� !�'57���������� �!�65!�4,7�������� !�'45�� ����� !�',,&���1���������� �!�''(��$�� �������!�'57����� ��� ���!�-,����� ������� �!�-,�������������!�6(��������� ������#�����!�'58&������� �!�'(:&�������� ���!�'8:&�N������ ���!�'8:&������� �!�(-!�(8�����0�����!�'6-������ �������� �!�((&�������� �!�(7���/� /����� ��!�'6-������������� ���!�'-5���� �����!�'54�������!�'54����� ���!�'-6&� ���&�D�� ����!�'-&� �����A��� ���!�84&���������!�-5!�5,!�58��� �������!�478������ �����!�''8&DA

����� ���!�'8:&=����� �!�(:���� �����!�'46&=�� �!�7,&�������� �!�(4!�(6!�'4-!�'''!�''6!�''(!�''7������ �����!�'46&�����'����� �!�(6�����������!�'46����� ���� �!�'44!�'4-!�''4����/������ �!�'46����/������$�� %"!�5:����/������$�� �!�('!�(-!�(:!�7,!�'46�������

�������$!�''6� �!�'''!�''7�����!�'4'

�������������!�''6!�''7�����������!�48(!�45,!�'44!�'4-!�''4!�''6�� ��� ������������ �!�'67��6����0���� !�'4,��-����0���� !�'4,&1�������� ���!�'8:���� �����!�'-'����� �����!�'-'���� �����!�'6(������� �����!�''8������� !�'6(

Page 301: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

��� �� ��� �� ������� ����! ������������������

����� �����!�'6(�� �

�#����� ��������!�(7� ��������������!�'6(������������������ �!�'6(���� ��9�����!�'84������������.�� ��>��� !�'88#� ���������������������!�74�1��!�''8�������������� ���������������!�(7!�7,��� ������ ��@+A.������������� �!�'8-������������������!�(7�������!�'67������!�7,!�'',!�'8,������� ��=&��� ��!�(7�����0�����!�'6(������0�������� $�����!�(7�� ��� ���������!�'67� � ��������!�'6(������0���!�4(5������0�������������!�4((���������������!�'6(���������������!�75������!�(7����!�'',�#�����!�'8,�����!�'',

&� ������ �!�(-!�(8!�((!�(7!�(:!�74!�7'!�75!�7(!�'64&� ��� ���� ������� �!�7'&� �������

����� ����!�'8:&� ��������� ���!�'8,R'5,�� ����� !�'67�� ���������!�'8-�� �� �����!�� ���� ����!�'8,�� ��������!���?������������� ���!�'8(�� �!���� �������� ����� �!�'88�� �4����� !�'67�� ��

��������� �� ����!�65�� ���!�'-8� �!�'-6� � ��������!�'-5� �������� �!�'-6!�'-8� �$��=9� ����!�'5'����� #!�'5'����������!�'54����� ���� ���!�65����� �����!�'-6�������!�'54�� ����$���!�:40��!�'-6� ���� �!�'-8����� �!�'-8��9� ���� ����!�'-6���!�'-8

�� ��������!�'-6�� �����

��� ����!�::�������!�'',�� ������� ������!�'-'

������� !�'67���#��� �����!�'8,���� �������!�'6(

&+D������ ���!�'8:� ������ �� �������� �!�'44� �/������!�484� �����$��!��� ��� �������� �!�'87& ��� �������� �!�7,� ���� ���� ���������������!�'67� ����0������ ���%&!�4:7!�',8& ���������$���!�'8,& ��%����� �����!�'-6& �����������������!�'--� ��� �!�'46������� !�'-:����� �����!�'6(������������������� �!�4(4����� ��� ��������!�'5'���������!�:8����� �����!�4((���0������ ������!�4(8���������������� �!�'48�������������!�4,4���������������!�'8,�$� ���� ���������!�:(������� ��!�4:8����

����������!�'8,#� �����������/�0������������!�74�������������!�7,������!�(7!�7,!�'-:�#�����!�'54� ��������� �!�6(

&�������� �!�74�����������!�'54����

��������� �� ����!�65�$���!�:4����� ���� ���!�65

�������!�'5,� � ��������!�'-8

���� ���� �����!�'5,���� ��� �����!�'5,&��� ������� �!�7'� �!�'6!�'8

����� �!�446� ���� �!�475� $��!�44'������!�'48���������������!�44-������!�'8!�446R445

� ��������� �!�446� �����������!�446� �Y� ���� �������!�477� �������!�'48& �������� �!�55!�74� ��������!�(4!�::� ����1�!�'(6� ��������!�4:5� ������������ ��!�64� �������� �!�'57� �������!�6(!�'55� ���������� ������!�47'& ?����� �!�(-� ������������������!�4(� � ������������ ��������!�45:� � ����������� �!�'6(

Page 302: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

���� �������M+1N�!�'(6&%������ ���!�'8:&%'������ ���!�'8:������� �����!�'6(&��� ����� �!�(-���� /�� ���������!�(-���� /0�����������!�'48�������� �!�65����������� �!�65������������!�-8��#��� �����!�'54�������� ���!�'(6���������� ���������!�4(5&����%0����� �� ���� ��!�'-������0�������������� �!�'-������0�������!�4(6������0����

����������������!�4(5!�4((�����!�65�� �����!�4(50����������� ��� !�-8%'&ML!�4(6����������������� !�6'� �$���������� �!�'45

����������������� ��!�65�������������!�4(8����������� ������!�4(5&����������D�������&�D��#������!�'-&����������D�������&�D��� ���!�478����#��� �����!�475���� �����!�4(5��������!�4(8!�4(5��:,������!�4(5����� �������M+1N�!�6(!�'56���� �����!�'46

-0����� �����!�4450������������ �!�'48

�0�����������!�',5XM�L1�"����!�4560���/��$����������!�44-0���� �������^��� ���� �!�:50���� ���� ��!�6,0������#������!�47:0���������� �!�('!�(-X���T��&��������!�'--0��������&� �������!�'5,

����� !�'66��� �����!�4:,��� /�0���������� �������� ��!�',���������� ��!�64���� �����!�'5:.����������� �!�7:.������� �!�(5.����#������ �!�(5�������������� !�46(������������������!�'(7������ �����!�466.>��A>����!�67

���������� !�457���������!�'4'��/�����%&!�4:7!�',4�������

� ��������������!�:(��������������!�'66

��$�����!�4:-��$�������!�4(:��$������������!�4(5��$� $� ��!�4:-.������������ �!�7'.�������� �!�(-������9� �������������� �!�-(.�������� �!�(:!�7,�����0����!�'68�������� ��������� ��!�7,�������!�'68����� ���� �!�'68��0������!�'68!�'65������� �!�'8�� �������!�'68.�� ������ �!�((�� ��� �����!�'67!�'-4.���� ��4����!�75.���� ��'����!�75���� ����������!�75���� ���������!�75.������� �!�74����$�����!�67����$��$��������!�4:� ����0������ �!�4:8� ������� ��!�'5:� ��� �������!�'(-� ��� ������!�'5:� ���������$���������!�4:8� ��� �!�'(,� ���������� ���!�'(!�-6� �����!�'(7� $����0����������������!�4:� $���

���� ��!�'5-����!�'5-�� ���������� ����$!�'(:� ��!�4:8

.�������� �!�:4����� �����!�'5-������

���� ��!�'5-����!�:4

.� �������� �!�(-!�((!�(:

.������� �!�(8����������� �9 !�'-4.�������� �!�(6�������� �!�''(!�'':.��9����� �!�-(!�58� ���� ����������!�('!�'44� ���� ����������������� �!�',:!�'4,� �$�� �����!�'4,.� �$����� �!�('.���������� �!�78���������0������ �!�4:,��$���

� �������1��!�'7,�1��������������!�'5(

Page 303: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

��� �� ��� �� ������� ����! ������������������

�������� �����������!�'5(�$� ��������$����!�467������������!�'5(

.�������� �!�5:

.������!�''!�-5!�:(���������!�'-�����������!�4('�������������!�4('��������!�'68��������!�'68.��������� �!�(7!�(:��������� �� ��� ��!�-'������ �����!�'67���������� ��������*���!�(7!�(:������ ������� �!�:4���������!�'4'����/� ����!�:(��� �����!�'68��� �����!�'5-����� �����!�'5-. >%"����� �!�5: �4������!�4(5 �'������!�4(8!�4(5!�',- �/������������� ��������!�465 �/���������������?������!�45: ������ �!�6-!�6( ����!�65 �/���/�0���� ��!�'6-. �������� �!�7, ���������������!�7, �����������+ >�'��� ���� �!�5:�������!�'4'!�'46!�''7���� �����!�'(,��� �����!�'5(!�'(8���� �����!�4,:!�'5(���� �����!�46:!�'5(�$�� �����!�'5(

#����� !�'64%'&ML����� �!�5:�'������� !�4(6%'&ML�������0���!�4(6���� �����!�4:,������������ ��!�4(!�4:�����

?��� �!�4,6!�48,�����!�4,'!�4-5����� �!�'8!�4,6!�4,8!�48,� ���� �!�4,'������ �!�4,4��������!�4'7!�4':!�45'����!�4,6

��������������������������!�4,5������� ���� �!�4,'

��������� !�4,5%�A&L>����!�48,!�484�����������!�4(6��������� ���������!�4-,������� �� ������ ���������!�45-��$����� �!�76%�$��1������ �!�:,

%�$�&��������� �!�:,%�$�%��������� �!�:,��$���

� �������1�!�'7,����������������!�'64#����������!�'58�1������!�:,�������� �������#�����!�:,������������!�:,!�'55

������� �!�('!�'44��������!�',:�������� �!�('!�'44���������!�',:��������!�'',!�''-!�'67���������� �!�'64��'������!�'67%�������� �!�(7����������� ���������� �!�'67������������$���!�'-4��������� ������!�4:4����������� ���� ���������!�:-�� �����!�-(�� ���������� �!�--!�-8%�%1�����/��������!�'-������ !�4(6��'���� !�4(6��'����� !�4(6��6���� !�4(6��6����� !�4(6������� !�4(6������������� �����!�4(6�� ������ !�-'!�'''�� ���� �������� ���� �!�(-%� �����A�������!�5,!�:4�� ��/�$������!�58%�������� �!�76%����&��������� �!�(4!�(6%����&� ������� �!�:4%����&�������� �!�:4!�'5,�0����#���������!�4((�0���������!�4(6�0�������� �!�65�0���!�(,%0�������� �!�5(�0�������#���� �� ��� ������!�:-�0������������������!�'48������ ��������� ��!�6-������ �� ���� ��� �9 !�(:%������������� �!�77%������ ������ �!�7(����������!�(7!�(:%��1������� �!�(5���������!�57%��&��������� �!�76���� �$��!�57�������������� !�46(���0�� �����!�4(4������ �����!�4'8!�466��������� !�'-4�� �������� !�'6(�������� !�'-6���� ��$���� !�'-8������� !�'65!�'6(���4���� !�'6(

Page 304: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

���'���� !�'6(�����������$���!�'-4�������� !�4(6%�������� ���DL1�>�!�88!�55�������� !�57!�444%�������!�5(��������!�'',���������� �!�(4!�'''��0������!�'-!�486!�4(4!�'68%D1������ ���!�'8:%���������� �!�((%��� #����� �!�(5%��L������� �!�((%��&������ �!�(5�����������!�4((������������ �!�65�������� �����#�����!�4:5������ �����!�4:8!�4:5��������M+1N!�:4%����� ��� ���!�8,��������� ��!�-7�������?���!�45,��������� �����0��� ����!�48,!�45,������ ���������!�4-6������ ����������!�467!�'55������ ���!�465������ ������� ��!�456������ �����!�46:!�4-,!�4-8!�4-5!�47:��������� �!�:,������������� ������� ��!�4-'��������!�45'�������� �!�4-4�������� �������!�65��������������?������!�48(��������!�467������������!�'5(����������������!�65�����������!�'-�����$����!�46(%=1A����� �!�47:������� ������� �!�65!�4-,!�4-4!�4-5������� ������!�4-,��������

��0������ �����!�4-4����� ������� ����!�4-5���� �!�4-,!�4-4!�456� ��������������!�4-,��� ��!�4-,!�4-4 ���1�!�454 ��������!�454 ������ ��!�4560������!�4-, ����������!�4-(���������� �!�45'��/�������������� ��!�4-6

������� �� ��!�48(���������� �!�65!�46:!�'55������������!�466!�46(!�4-'���������������!�46:!�'55!�'57%�+������� �!�(5%� ���������� �!�78%� �� �������$�������� �!�:4!�'5,%� ��&��������� �!�76%� ��%��������� �!�:,

%� ���������� �!�(,�� ��� �0���� !�'-6�� ��� ������ !�'-8%���� ��D��������%D1��� ������ �!�'8!�'(7��������� � ��!�466!�484������� �����!�486%����������� �!�76%������� ������ �!�74�������� ���������� �����!�4:8�������� ����������������!�'48��������� �!�'4'%���������� �!�(-�������� ������!�('!�',:!�'44�������������� ������!�('!�',:!�'44���������������!�(-%��������� �����0��!�485������0� ���B��� ���� �!�:8�����/�����#������!�44-��#/����������!�7-%�9����� �!�((!�(:��9� ������ ������!�7:%�9������ �!�7:������ �� �!�48'���������!�78%A�LL����� �����0��!�48,������� �����!�-(������������������ �!�-5������������!�� �� �����!�'8'� �����������!�6-� �������������� � ��!�466% ������ ���������$� ����!�66� ���������/� ���������������� �!�',� ���/������� �������0���!�5:% �$������� �!�8-� �$��������!�'6(� �$�������������� �!�'45� �$����������� ��#������!�4(7� �$�������� �!�4,4% �$���%���� ��A��!�444% �$���%���� �����!�57% �$���%������� �!�'4-� �$����������� ���������!�'45� �$���������� ��������0����!�'45� �$���$ ����!�4,'� �$�������� �!�444� �$�������!�'65� �$��������� �!�444� �$��� �� �����!�'65� ������ ������!�7:� ���� ������!�65� $����0����!�'65��������!�'',!�'67���������� �!�(6!�76!�''(!�''7!�'64����0�� �����!�'68�������������!�'4'�����!�� ���� ����!�'8,������

�������!�45,!�'46!�'4:!�'64��������!�'44���������� �� �!�''(�����0�������������������!�(7�����������!�((�� �����!�'64������!�'68

Page 305: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

��� �� ��� �� ������� ����! ������������������

���������0����!�''7$���������������������� ���� �!�'',�����!�4(8��������?������!�''7���� ����9!�4(6���� ������ �!�''(!�''7

���� ����0��������!�'68���� ��������������!�'6%���������� �����0��!�485������ �����!�4'7��������!�484!�45'����������!�4'7!�48'����������?������!�4'7!�4':������������� ���������������!�76%����%������� �������������� �����!�76%����%������� ��L����������������!�78%����%������� ��A�������!�76%����%������� ��%� ���������� �����!�7-%����%������� ��%� ��������!�7-%����%������� �������������� �����!�7-������������� ��!�468�����������!�48'%����%��������� �!�76������� �����!�4'7!�46,������� �� �!�4'7!�4-6%������ �� ������ �!�4'7!�46,��������������� �!�4':�����/������������ ��� �!�'6:��������� !�'67�0� ������� !�'4,�0���������� !�'4,�0����������������� �!�',:�0����#/�#�������!�75�0�����/�#�������!�75����� �����!�'(5!�'(7��������!�4(8!�4(5���� ����� �!�5:������������!�'45�����0������!�'45!�'4(�������������!�'45�� �������!�'45%������&� ������ �!�7,��������'/�����#�����!�5:%����������� �!�(,����������� ��#�����!�5(��������� ���� ������!�4-6���������� ����������0���!�5:�����������������!�44,������������������� ���������!�65��������� � ��#�����!�5(���������� /������0���!�4(6!�4(7%��.%�� �����������!�66��������� �����0��!�456����� ������!�'',����� ���1�!�'',����� ���� �!�'',������������ ��� ���������!�4-4��������&� �������!�'8,�������� ����!�4(7����������!�-8����������� �!�--���������� �!�65!�4,(!�4,7!�444!�4-5���������� !�4--�����/����������!�4(5

�����/�������������!�4(8%� &����� �����0��!�456�� �����

��0������ �!�4:,? �������� ��0��!�'-6���+>���$!�'(6

���������������� �!�7:�������������!�:-������������!�:-������ �������M+1N�!�:(���� �������@+A.�!�448!�46(!�46:�������� �!�76%����������� �!�7'���������������� �����*��������#�����!�7'��� �����!�4:5%��������� �����0��!�485%���� �����!�'6!�'8%M+������ ���!�'8:���� ��������������!�'8�$��� �����!�46:!�'55�$��� �����!�46:!�'55�$��� �����!�46:!�'55��������!�4(6!�4(8!�',,!�',8����/���/����+A.�� ��������!�445����������� ������� �!�474������9��� �����'������0���!�7,������9��� �����T/� �$��'�������!�7,����� ��9����� ������������#������

�������� �!�47:����� � ����� ����� �!�4(:����������������!�(,������������!�-8������0������� �&� �������!�'8,���������������������!�(,

���������������� �!�4-4�4�������������� �!�7444��������!�7444� ���������� ���� �$��!�464�4�& ������ �!�7444�$���!�74�'�������������� �!�744'��������!�74�'�& ������ �!�744��$���!�74��������$!�'((����� �����!�'((���� ���� ��� ������� �!�'(7���������!�7:���� �������M+1N�!�'((!�'(:!�'7,�������� �!�-7����$�� �� ��������� �!�-(����� �����!�47-���������!�64!�47-�������� �� ������ �!�47-���������� ���� ���!�47-������!�� ��������&� �������!�'86���������0������ �!�4:8��������� �!�4,7�#��� �����!�6'!�:-!�478!�475!�'55�#������!�6(!�'55

��� !�478

Page 306: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

� ���!�'(-�� �����!�'8,�������!�'54

�#������ �!�'5,��� $� �� ����!�58

�#�$��� �����!�478�D������� ���!�'8:������� �!�(6!�''(��������!�(7����?���� !�'6-�����T������!�'--��������������������!�44,��/����������!�76����������������!�4('�1�������� ���!�'8:������������������� �!�4-4!�456������� !�4((����� �������#�����!�4((���/� ���������!�'48���/������� ������!�4(:���������!�47-���/������ ���� �!�47'���������!�'':!�'-,�� $���� !�'4-�A%����!�'65�A%�������!�44,�������� !�'65!�'6(��������!�57!�4(4!�4(6� �%"����� �!�(,� �������!�486!�4(4!�4('!�4(6� ����� ���� ��'�!�(,���������!�4(7����������!�4(:!�47'����������!�4(:!�47'�������� �!�(-��������!�48(����� ������ �!�(4����� ���'����� �!�(6����� ������������ ��!�64���������� �����!�-:��������

�������� �!�4(:����� ��� �� �!�4(: ����!�4('� �!�4(7

���������������������!�57�����#������!�4,5������������������!�6-��� ����������9��� �!�7,����� �����!�448�M+>�1+�>.���>�����!�'8!�448��� ������ !�4'8!�4'5!�4'(�������������� �!�'8���������!�'8������� ��!�'8����������� �������!�'8�� /����������!�76

�M���K��������������11!�'-M���K���%����!�458R45:

�� �����������!�45(�������� #!�458

� ��� ��!�457� �� �!�45:��������!�45(

�� ����� �������M+1N�!�'(:��� ������ �������M+1N�!�'7,������ �����!�:8M+1�"��������� ��

�� ����� ��!�4(7������ ����� �!�47'� ����0����!�4('� ��������!�448

M+1N� �$������� ��@N./����!�'(-����������!�'('���������!�6-�� �����������������������!�'(:����������������!�'5,����!�:4���������������� !�65

M+1N����� �!�:4���#Y$#�� �����!�'(-���#'� ��� �������M+1N�!�'(:��� ���� �����!�4:8��� ����#������!�466M��������� �!�(5������� �!�488��/� ����!�:(������ ���������������������!�44,������������ !�'57��������������!�47�������������� �!�78M��L���L�������� �!�78���������� �!�78M��A������� �!�78������� ��!�65���� ��������!�67��������!�67����������������!�6:��/� ������������!�65����#������ !�44,��� ���� !�475���������� �!�65!�67��������� !�'67��/�������������� ��!�4-6��/��������������������� ��!�'4,������� �!�6-

�$��������������@�������� �!�47-$�������������������!�-6@�����+A.�� ������ ���!�'8@�N�� ����!�'5:$�� �� ����������!�'57$����������!�-'$�������������?������!�(($����������� ���������!�'',$��������������� ��!�'66$�����������������������!�45,$�������!�'44!�'',!�'''@������� �!�((@1�������� ���!�'8:@+A.

�����������!�'(

Page 307: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

��� �� ��� �� ������� ����! ������������������

�����!�6:#�����!�-,!�84���������!�8:� ����!�'8���������� �!�77������!�'5:������� �!�77

$������� �!�6-!�65@+A.� ���������#��������!�6-!�8,@+A.���������� �!�-7$��4����� �!�65$��4���!�65$����� �$�����!�478@��1!�'8!�'(7$���� ��� �����!�'-6$�������� �����!�'5,!�'54@��%D1!�'8!�'(7$���������� �!�65!�6($���#��$�������M+1N�!�-7@��N!�'8$ ������!�''8$ ������ ���!�'(:@ �������� �!�(8$�������!�'',!�''7!�'66$��������!�'',!�'''!�''-$���������!�'''@� ?����#������ �!�(8@� ?����������� �!�(8$�������!�'44!�'',!�''($���?���� !�'66$���?'�� �����!�'6-$���?����� !�'6-$���?����� !�'6-@��#������������!�47@��������!�48'$��������!�47-$����������!�48'!�4:6@N.�����������#����� �!�'(8$#Y���#�� �����!�'(-@N./-,,,�������!�'5:@N./%�������!�'5:@N./�����������!�'5:@N./��������!�'((

.�������+A.!�87;������+A.�M�����DL1�>�������!�87;�L�S/45��� ������!�47'!�476�������������!�4(����������� �!�5:!�4-(��$� ������ ������ �!�'-��$� ������ �� ���������� ������!�47'����� �����!�4:'���������!�(4!�4:'!�4:(��������!�'',!�''-!�'67��'������!�'67��'��#������!�'-6!�'--!�'-8����#������!�'-6!�'--!�'-8����������� �������� �!�(4!�',:�����!�� �������� �!�����������1�!�74;����!������ ������ �!�(4��������������� �!�',:R'44

��/�����!�'4,

���������������!�('��� �����!�4:4�������!�4:4!�4:'!�4:(�#��� �����!�4:'�#�������!�(4!�4:4!�4:'!�4:(��������!�'',����� �����!�4:'!�',:!�'44!�'48�����������1��!�''8������ ������!�'',������ ���1�!�'',������ ���� �!�((!�'',;����������!�4,'���� ���� ��������� �����!�84���� ��� �������������!�'(!�--����� �����!�4:'���������!�(4!�4:'!�4:(� ��������� �!�6(!�67; ���������� �!�55; ������A��!�8,� ���������� �����!�'7��������!�'',!�'67;������� �!�7:;���&����%0�������� �!�:4;����#������ �!�(5�������� �����!�'55�����������!�4-,!�4-8!�488!�4:8�����������!�'4,����� �����!�('!�'44�������������!�'',!�'67

�N�����"�������������������!�46(N�;��� ��%����!�'8#,������!�'8,#4����� �����0��!�48(#4������!�46(N4������������!�46(N�A������ ���!�'8:NL�������!�'5:#/��������� �!�75#/� ������ �!�75N&A������ ���!�'8:N& L�.����� �!�5:#/�0������� �!�75N;������� ���!�'8:N"6'��� ������!�47'

��,������!�'8,�/��������� �!�75�/� ������ �!�75������� �������M+1N�!�'(,�/�0������� �!�75

/S��#���������������!�4659�� �����!�'-4S,������ ������ ��!�46(S,������� ���� �!�4669,������!�46(!�48'!�4('

Page 308: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

������������� ����� �� ��� �� ������� ����! ���

S4�����S'���?������!�45-94������!�46(S4������������!�46(S4���������������!�4-(94�������!�46(9'������!�46(S'������������!�46(9'�������!�46(S6�����S-���?������!�45-9 ���������� ���������� ��� ��� �!�'':9 ��������!�('!�(-S �1�������� �!�(4!�'''9 �� ���� �����!�4859 /�������!�'4'9 /�0������������ �!�'459 / ���������� ��� �!�'':!�'-,9 / ���1����������� ������!�'4-S����� ��!�'-'9����9 /�0������������ ��!�'459 ����� !�'67

Page 309: Getting Started with VNMR 6.1C

�� !"

��� �� ��� �� ������� ����! ������������������