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Pontificia Universidad Católica de Chile

Facultad de Ciencias Biológicas

Genética y Evolución

2016

BIO226E

Guía de ayudantía 8: Filogenia Molecular- Evolución

del Hombre

Ejercicio 1

A partir de las secuencias siguientes, construya un árbol filogenético siguiendo los

criterios de

A.  la fenética

B.  la cladística, considerando a la secuencia 6 como grupo externo

1 > A T T C C T G A A T G T C G A T A T G G C A G A A T A

2 > A T T C C T G A A T G T C G A T A T G G C A G A T T A

3 > A T A C C T G A A T G T C C A T A T G G C T G A T T A

4 > A T T C C T G A A T G T C C A T A T G G C T G A T T A

5 > A T T C G T G A A T G T C C A T A T G G C T G A T T A

6 > A T T C G T G A A A G T C C A A A T G G C T G A T T A

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Ejercicio 2

La papa-oca es una planta de origen precolombino que se cultiva en los Andes.

Pertenece a la especie Oxalis tuberosa. Para investigar su relación evolutiva con otras

especies de papa, se cuantificó la similitud genética usando marcadores AFLP con los

cuales se generó el árbol fenético (o “dendrograma”) siguiente:

A. Observando el dendrograma y comparando las distintas especies ¿podría decir si la

variedad cultivada (O. tuberosa “market”) es el resultado de una selección intensiva

asociada a un mejoramiento agronómico moderno y global, o más bien de un proceso de

selección artesanal? Considerar la principal diferencia entre ambos procesos en términos

de producción de “variedades domesticadas”. 

B.  ¿Son realmente las cepas 1047 y 1056 ejemplares de la especie O. tuberosa? Qué

argumentos tiene a favor y en contra de la separación en 2 especies?

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Ejercicio 3

Existe un amplio consenso de que la colonización de América ha sido por migración de

asiáticos a través del estrecho de Beringia. Sin embargo, evidencia arqueológica (puntas

de flechas en particular) sugiere que europeos estuvieron presentes en el noreste de

América hace 14000 años atrás. Brown et al. publicaron un estudio de diversidad del

haplogrupo X del genoma mitocondrial, en el que aparece la figura siguiente. Los alelos

CE son de europeos caucásicos; los NA son de nativos americanos; los AS son

asiáticos. Las líneas más gruesas representan los pasos mutacionales más probables. Los

números sobre las líneas indican el sitio polimórfico. El asterisco representa el alelo

ancestral más probable.

¿En qué esta figura apoya o refuta la hipótesis de una colonización de America, al

menos en parte, desde Europa? Ordenar sus argumentos antes de concluir.

¿Cuál es la limitación de esta aproximación para reconstruir la historia evolutiva? Qué

alternativa sugiere?

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Ejercicio 4

El gen COX8H codifica para una subunidad de la proteína Cytocromo Oxidasa de tipo

“heart”, la que se expresa en edades y tejidos específicos en los mamíferos placentados.

Sin embargo, esta proteína no existe en los simios catarinios ya que COX8H es un

 pseudogen en este grupo.

En base a la filogenia, en la que aparecen valores de Ka/Ks, cuando ocurrió la pérdida

de la proteína?

Fue el resultado de cambios neutrales o de una selección divergente?

Goldberg et al 2003 - PNAS