1. Anchored contigs2. Proportion of genome to be covered by an anchored contigs

Homework: Ewens, W. and Grant, G. (2005).Statistical Methods in Bioinformatics:Ch. 5, Sec. 1

*T~-~ -1r~--~,,--~-¥l<'<l~=~~~"~ n

~~~ l ~Ll~ ~ __u _Q-~~- --~.

- ~~,~eJ:~:(M'<.~ ±W-- {L,OY\A.c..l~ is o..~~______ __ __ _ _ __

-- -=:::-- ~--_._-- ~_ .._. _.~ .. ..........-- .....-

••••••• v . ---- ~ ~ , --:.-.t. 7\.~--*------.(------- ~ .------r -.--~J(---\ --- T -)C:

" < __ \. " i' j --"* f - ; ~{;n----- ~~'i-

Co ~~-----4~ ~'-(-1 U-------_.- --- .. _- - ----

---b Qx\c.kU< La~t-~-----------------f{----a--~------------------------ -------- --

iD ~~~~s.. --~ . .- _

~----------------------:rk-_-(ID:~~~i/---&i-"--~----~~+ ~_ s------ -- -------- -------ic;.- -Y\,..O-{- ~u~e.-4 __~_ --~----~~ CD~h'cr~~

__ M.±:_~(.('e.¢ ~~_~ •.~=~~Q{.L~:e . I O--~ ~.L -------~-~~-- ----- -

~ u" , !.5"-"--~ ..~-_______ ------~~~-----~-J---~-, ~s_---------------- -------------------------------------------------------~-----~--_ ..~- ---

I _~_-_-_.- ... • . __ ----.---L.~----~~_.-._- ---------- ---<Y\\A.c.JL---f\t-~. --~---.-------~--~ ~ :--.--- -------------------------------.---- ----L-------------------- --- -- --- - -

~----==- - ~L= I n 'ft-O~ =RI~~J)·1PLft?!;))··~--=.~:--~=:=-------------:=~=~~-~~;.e~-~:.,·-~--- ~-e- (Q~-' ) :

t1?~~ Hi -~l~-:~~I:~.•frL------- ~-_G:1J~-:-~-)~;.- ~~ .;Z- .-~

'MoL

-------...---- ~ --~-)(-ii)- ------ .~__ _~~ CDV4i~---n-----------______ w~+h ",0 a\A_~---.fCM..----~ _~~-+~~--_._-_ ..- ...._.\-------_. -- -. .._- -' .._-_._--- ~...•- _._ ..---. __._._-_ .. __._------._+...,-- -- -- - _.,- -._-_._--_. __ . --- ._-----_.-_."

,- - -- ----- ..-- -~:'k- -- --2,.t--- .~ -:..cc.:..1)----~-("t{-~)----·-------e------ ------------- ftrJ--------·- 'r-@;,------+- ---e-------.---------.--".- ----. -- --------LA.~-~j---- - ------. --~ - -O--~- ---.----- - ..

-'f-

\",,~..L\ F~~.M-<-~2 \ ~Wl k--~~·,~=~_=~~~~:n=:-~--:=-"~,._~-~~=-...~....•.•.····io. ~ ~f+\- . . .... Pf)c;'

-.------ .-----.-. ---- --.- ---._-. t-- 3= t- - - I -. -- -. - - ------.- - ._ - ----.."-'---..-- _-- --

\' ~.. xl _-.:. .~_ ... ~ ~ -~~-~X-tL) ...::....'X_3 ..: f :'------'1.. - _~L_:::. ')<-{~)~1-

• • . ._---_._---_._-_.- --- _. ---

&+-t .••.t c1" ,,'T'1--~·~~ ..'l?:. .. ---.- . - - - .u_

-=.::=~:..=.. ·~:=~~~~==~~~f~~·•.~-~·· •..··•.....•••.

._.~~~l =:: X+Y =: x + L.- \J.L, U ~$_.._~

,_ •••• _ n. __ ._ •• __ • ~. ~.~ ~_ ~~:f_~_O ~_ '. . _._ ___.. ._

,.._._.._..- ..- ._.2.= X.!": Wt ..b ..I· .. .. ..c __ .___ __ no· -. V -= X:.-_... . ..

-b-

__ .__ . "._ \(-'2..--------_._._-_ ..._--_. _._------ -----_._--_._---_._--_._----_._- -------- -

~----------.--- ---------~.-~_C ~::"..D_(._i? -:-_L \ --t----q--I- ) __ . I L:J ) <? I -. __ / _"__ +_- A. l.- - ~ t= .-c---£.--\.- .-------------:---_.- - --- -- -..... - --_ .._.-._- ------_ .. -_ .._- .. -\-._~. -_. . - -- - - -_ .... __ . _. -_._----- _._-- . -- -------_.1 l,....-!.- ---.. •. -- -- - .---- -- ." .._- ., - .. . -- ----_ .• - • - _.

>------ -.--- --F:' - -- -C,-" - ·J.r--)-- . .-~~-- - -.--_ ..--- - -----_______________C~~ __. ~ _)__. ~ \.._f __~-e...... ' "'- . . . . .... .

.-. ~--~-:--~T·-;'~:~...~~.;-~~)-:==·~r(1L::~~--OO-=-:--~[~~)~~~;~.__-~=M,-~ - "' ..~'f-Z: .. ~QJ.~:=_{~~~~~~l}~~/'- ~

---------- -.-.----- --- - - - -. - -- --- -- - L... - - ---- - --- --.----~-tf-c-------- -------- --- -- ----"2r------------------- -------~-€.---------l~----.-------- --- ~----------------.--~-------------e----- -. -__ ...____ --=:::..~_ [1 I~.., ~ ~ ~_{!_. ~ - \.. 1\'"-'_ ._ -:2 __ -.-.

.•..•. ~-4;; 'e-J ". t "t.. =:J------~Jii:-t:..------ .----- -.-----.----.~. ··-Q'--LL::"::=----~------~---.--------- .--"-~ ~~ ~__~_~ ~___ L _.---.lS:::li>':>.. _ l'-::: 2.) ~.__ ~____ . . ._.. _ __

---- ----- ---------. -----·------t ------------------------.-- .<t:-;-ZL!:- -- 2' .,,-.---------L. l-

=: -e _L-:..~ . e.. Ji-- --._-- --~- -------;:7"- ---.--------- .. -.•---~- .... -..- - -

.-.-.-.----.-----.----.------------. ---A-t-----·-----·---··---·---··--n-o",>J-·---·-----·--- lL~ ...- -- -~ "'"~(L.. -a., {?'~ -

- :::e .~f~-e:-- ·e · e-...L-J.r:~ ...-

-1-

2L '=~-~~:~~_:::~~~~~~~~~~c~~jIt~~~)_~i~------.._--------- ---_. __._--~-_. __ ..-----------_._. __ ._.,_ .. _ .._. -~ ...__ .. _--_._._.- _.- - ._-_ .._-~

L

i..._ _ .._"",_,,__ _ __ __ _..... .

"~-- -tl~17 sJ..•fo~""'~_~=\-.... --- ...----...-, .....-...;:,:i:(, .. , ..- ... -".---~-e. ,.

:e. j ._,Cl.€- . .~4- (~)...

~