igem 2011 infosessie
DESCRIPTION
iGEM 2011 infosessie. wat is iGEM?. i nternationale G enetically E ngineered M achines competitie sinds 2005 georganiseerd door Massachusetts Institute of Technology ( www.mit.edu ) wedstrijd synthetische biologie voor multidisciplinaire studententeams - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
iGEM 2011infosessie
wat is iGEM?
• internationale Genetically Engineered Machines competitie
• sinds 2005 georganiseerd door Massachusetts Institute of Technology (www.mit.edu)
• wedstrijd synthetische biologie voor multidisciplinaire studententeams– teams maken een “nieuwe genetische machine” tijdens de zomervakantie, zowel
met computersimulaties als in het labo
– alle teams stellen hun project voor op de jamboree (1 – 2 okt) in de Vrije Universiteit van Amsterdam
– Winnaars mogen naar het wereldkampioenschap in het MIT te Boston (5 – 7 nov)!
• Deelnames K.U.Leuven:
2008 2009
wat is synthetische biologie?
• combineert biologie en ingenieursprincipes om nieuwe biologische functies en systemen te ontwerpen en te bouwen die niet aanwezig zijn in de natuur
• die nieuwe functies zijn vaak nuttig voor mens, dier of milieu
→ groot potentieel!Drew Endy Nature 2005
toepassingen
cellen worden geprogrammeerd als robots voor allerlei toepassingen in geneeskunde, materialen, milieu, energie, …
biosensors, bioremediatie, bv. detectie landmijnen
biobrandstoffen
spider silkproductie anti-malaria geneesmiddel
biotherapeutica
tumor
bacteriële fotografie
cellen programmeren
recombinante DNA technologie
ad hoc & bijna nooit voorspelbaar
synthetische biologiegestandaardiseerde onderdelen & voorspelbaar resultaat
ontwerp modelleer bouw
cellen worden geprogrammeerd als robots voor allerlei toepassingen in geneeskunde, materialen, milieu, energie, …
iGEM & BioBricks
• voor iGEM maken we een nieuwe genetische machine mbv BioBricks
• BioBricks zijn gestandaardiseerde ‘off the shelf’ bouwblokken waarmee ontwerpers van genetische netwerken aan de slag kunnen
• BioBricks uit vorige iGEM’s zijn geregistreerd in de Registry of Standard Biological Parts (partsregistry.org)
• Registry groeit bij elke editie van iGEM!
Breithaupt (2006) EMBO reportspartsregistry.org
iGEM & BioBricks
• voor iGEM maken we een nieuwe genetische machine mbv BioBricks
• BioBricks zijn gestandaardiseerde ‘off the shelf’ bouwblokken waarmee ontwerpers van genetische netwerken aan de slag kunnen
Breithaupt (2006) EMBO reportspartsregistry.org
gene
promoter
Ribosome binding
site
terminator
iGEM & BioBricks
• voor iGEM maken we een nieuwe genetische machine mbv BioBricks
• BioBricks zijn gestandaardiseerde ‘off the shelf’ bouwblokken waarmee ontwerpers van genetische netwerken aan de slag kunnen
Breithaupt (2006) EMBO reportspartsregistry.org
In silico:Ontwerp & Modellering
In vivo:Bouw organisme
project K.U.Leuven 2008: Dr. Coli
Geheugen
Ziektesignaal
Filter
Reset
(Inver)Timer
Celdood
Geneesmiddel
project K.U.Leuven 2009: Essencia coli – The fragrance
factory
Licht receptor
Vanille productie“Sleutel/slot” regulator
Vanille receptor
blog - website - wiki
wedstrijdwiki:2008.igem.org/Team:KULeuven
website:www.kuleuven.be/bioscenter/igem
blog tijdens jamboree: igemkuleuven.wordpress.com
knipsels
De Standaard – Wetenschapsbijlage 6 nov 2008
EOS magazine – dec 2008
Mens en Molecule10 dec 2009
De Standaard12 nov 2009
De Morgen5 nov 2008
de iGEM jamboree!
wie zoeken we?
• interdisciplinaire teamspelers• sterke motivatie• creatieve geesten• oog voor gewaagde én realiseerbare ideeën
• met veel zin voor labowerk en/of modellen bouwen• maar ook grafische talenten, website/wiki makers, PR wonders,
wetenschapcommunicators, team managers, ethici, podiumbeesten…
wat verwachten we?
• 2e semester na paasvakantie (mei – juni): introductie & project brainstorm
• zomervakantie: 8 weken aanwezig van de 11 weken tussen 4 juli en 16 september
• Tweede helft september: presentatie voorbereiden en poster maken voor jamboree @ VU Amsterdam
Tweede helft oktober: presentatie voorbereiden en poster maken voor jamboree @ MIT, Boston
wat krijg je?
• een onvergetelijke belevenis en heel wat ervaring • een wetenschappelijke en technische uitdaging• een blik van binnenuit op een nieuwe wetenschappelijke
community
• Europese jamboree @ VU Amsterdam, 1 – 2 oktober 2011• Bij plaatsing: Wereldkampioenschap @ MIT, Boston, 5 – 7
november 2011 ?!!!
(reis, verblijf en jamboree)
iGEM team 2011
• 14 studenten:– Ingenieurswetenschappen (3)– bio-ingenieurswetenschappen (3)– wetenschappen (3)– biomedische wetenschappen (3)– Media Arts Design faculty (2)
• begeleiding door doctoraatsstudenten, postdocs en proffen van BioSCENTer = BioScience, BioEngineering & BioTechnology, dat alle onderzoekers in de bio-wetenschappen en bio-informatica van de groep Wetenschap & Technologie groepeert
selectie: motivatiebrief
• waarom wil jij in het iGEM team?• waarom ben jij de meest geschikte persoon voor iGEM?• kan je samenwerken met studenten met totaal verschillende studie-
achtergronden? • wat is jouw visie op synthetische biologie?• welke nieuwe genetische machine zou je maken en waarom?• hoe zou je firma’s overtuigen om het iGEM avontuur te sponsoren?• kan je je 8 van de 11 weken zomervakantie (4/7 tot 16/9) vrijmaken, en
kan je van 1 tot 2 oktober mee naar Amsterdam, en hopelijk van 5 tot 7 november naar Boston?
stuur je CV* & motivatiebrief (max 1 blz, in Engels!) naar [email protected] vóór donderdag 12 mei (17h00) *vermeld studierichting en –jaar (& gsm nummer)
info
• Main page iGEM: http://ung.igem.org– “What is iGEM”– iGEM 2011: http://2011.igem.org– Registry of Standard Biological Parts: http://partsregistry.org– Voorgaande iGEM competities!
• team abstracts: snel overzicht van de verschillende projecten !• Results: presentatie (met video) en posters van de verschillende groepen
– K.U.Leuven teams:• 2008: http://2008.igem.org/Team:KULeuven• 2009: http://2009.igem.org/Team:KULeuven
• www.kuleuven.be/bioscenter/igem• Google/Wikipedia !