keragaman mikroorganisme 2 - · pdf filedalam taksonomi, picrophilus adalah genus archaean...
TRANSCRIPT
Keragaman mikroorganisme 2
( prokaryotz/archaea &eukaryote )
Kelompok e
Natronobacterium
klasifikasi ilmiah:
Domain: Archaea
Raya: euryarchaeota
Filum: euryarchaeota
Kelas: Halobacteria
Order: Halobacteriales
Keluarga: Halobacteriaceae
Genus: Natronobacterium
Tindall et al.
Dalam taksonomi, Natronobacterium adalah genus dari Halobacteriaceae.
Seorang anggota dari domain Archaea, itu adalah baik halophile ekstrim dan
alkalifili, berkembang pada konsentrasi garam optimum dari 20% dan pH optimum
dari 10.
klasifikasi ilmiah:
Domain: Archaea
Raya: euryarchaeota
Filum: euryarchaeota
Kelas: Methanobacteria
Order: Methanobacteriales
Keluarga: Methanobacteriaceae
Genus: Methanobacterium
nama binomial: Methanobacterium
Kluyver dan van Niel 1936
Para ilmuwan telah diurutkan Methanopyrus kandleri, organisme berbentuk batang yang menghasilkan metana dan tumbuh optimal pada suhu dekat dan di atas titik didih air. mikroba diisolasi dari dasar laut di dasar cerobong 'perokok hitam' di Teluk California. Ini adalah anggota dari keluarga archaea, cabang kuno hidup yang berbeda dari tanaman, hewan, dan bakteri. Methanopyrus kandleri. Courtesy K.O. Stetter, R. Huber & R. Rachel, Univ. Regensburg, Jerman. Methanopyrus kandleri memiliki relatif sedikit gen ditransfer dari organisme lain dibandingkan dengan archaea lainnya. Hal ini mungkin karena lingkungan ekstrim M. kandleri, yang akan membatasi kemampuannya untuk bertukar gen dengan organisme lain. Urutan termasuk 1,7 juta pasangan basa dan sekitar 1.690 gen. Para peneliti membandingkan urutan dengan yang metanogen sequencing lainnya untuk mengidentifikasi satu set yang berbeda dari gen karakteristik metanogen archaea. Organisme lain yang Methanococcus jannaschii dan Methanothermobacter thermoautotrophicum.
Methanosarcina
Methanosarcina barkeri Fusaro
klasifikasi ilmiah:
Domain: Archaea
Raya: euryarchaeota
Filum: euryarchaeota
Kelas: Methanomicrobia
Order: Methanosarcinales
Keluarga: Methanosarcinaceae
Genus: Methanosarcina
nama binomial: Methanosarcina
Kluyver dan van Niel 1936
Methanosarcina adalah genus archaea euryarchaeote yang menghasilkan metana. Organisme bersel tunggal yang dikenal sebagai
metanogen anaerob yang menghasilkan metana menggunakan semua
tiga jalur metabolisme untuk methanogenesis. Mereka tinggal di
lingkungan yang beragam di mana mereka dapat tetap aman dari efek
oksigen, baik di permukaan bumi, di tanah, di ventilasi laut dalam, dan
dalam saluran pencernaan hewan. Methanosarcina tumbuh di koloni.
The pyrrolysine asam amino pertama kali ditemukan pada spesies
Methanosarcina, M. barkeri. versi primitif dari hemoglobin telah
ditemukan di M. acetivorans, menunjukkan mikroba atau nenek moyang
itu mungkin telah memainkan peran penting dalam evolusi kehidupan di
Bumi. Spesies Methanosarcina juga dicatat untuk genom yang luar biasa
besar. M. acetivorans memiliki genom terbesar yang diketahui dari archaeon apapun.
Picrophilus
klasifikasi ilmiah:
Domain: Archaea
Raya: euryarchaeota
Filum: euryarchaeota
Kelas: Thermoplasmata
Order: Thermoplasmatales
Keluarga: Picrophilaceae
Genus: Picrophilus
nama binomial: Picrophilus
Schleper et al. 1996
Dalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae.
Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota. mikroba ini adalah organisme
yang paling acidophilic saat ini dikenal, dengan kemampuan untuk tumbuh pada pH -0,06. Mereka
pertama kali diisolasi dari sampel yang diambil dari mata air panas asam dan tanah panas kering di
Hokkaido (Jepang). Mereka asidofili wajib dan tidak mampu mempertahankan integritas membran
mereka pada nilai pH lebih tinggi dari. Sementara filogenetis terkait dengan organisme lain dalam
Thermoplasmata, tidak seperti Thermoplasma dan Ferroplasma, Picrophilus berisi dinding sel S-
layer.
Dalam taksonomi, yang Thermoplasmatales merupakan urutan Thermoplasmata. Semua yang
asidofili, tumbuh optimal pada pH di bawah 2. Picrophilus saat ini acidophilic kebanyakan dari
semua organisme diketahui tumbuh pada pH minimum 0,06. Banyak organisme ini tidak
mengandung dinding sel, meskipun hal ini tidak benar dalam kasus Picrophilus. Sebagian besar
anggota Thermotoplasmata yang termofilik.
Thermococcus kodakarensis
klasifikasi ilmiah:
Domain: Archaea
Raya: euryarchaeota
Filum: euryarchaeota
Kelas: Thermococci
Order: Thermococcales
Keluarga: Thermococcaceae
Genus: Thermococcus
Spesies: T. kodakarensis
nama binomial: Thermococcus kodakarensis
Atomi et al, 2004
Thermococcus kodakarensis adalah spesies archaea termofilik. Jenis galur T. kodakarensis KOD1 adalah salah satu anggota dipelajari terbaik dari genus.
Thermococcus kodakarensis adalah spesies archaea termofilik. Jenis galur T. kodakarensis KOD1 adalah salah satu anggota dipelajari terbaik dari genus.
T. kodakarensis diisolasi dari solfatara di dekat pantai Kodakara Island, Kagoshima, Jepang. Isolat awalnya bernama Pyrococcus kodakarensis KOD1, tapi direklasifikasi sebagai spesies Thermococcus, berdasarkan 16S rRNA urutan. Penelitian awal dengan T. kodakarensis diarahkan sebagian besar pada enzim termostabil, tetapi relatif mudah atas penanganan dan manipulasi genetik difasilitasi oleh kompetensi alami telah membuatnya menjadi sistem yang menarik untuk studi dari beberapa proses biologis.
sel T. kodakarensis tidak teratur cocci 1-2 m dengan diameter, sering terjadi di pasang, dan sangat motil dengan cara flagella lophotrichous. Dinding sel terdiri dari lapisan di-eter dan lipid tetra-eter, dan mantel glikoprotein luar. T. kodakarensis adalah anaerob obligat, dan heterotrof, tumbuh cepat pada berbagai substrat organik di hadapan elemen sulfur, menghasilkan gas hidrogen sulfida. Waktu generasi diperkirakan 40 menit dalam kondisi optimum. Persyaratan untuk elemen sulfur adalah lega ketika piruvat atau pati digunakan untuk pertumbuhan. Dengan tidak adanya sulfur, hidrogen diproduksi bukan hidrogen sulfida. Pertumbuhan ini dimungkinkan pada suhu berkisar 60-100 ° C, dengan optimum pada 85 ° C. Seperti organisme laut lainnya, konsentrasi garam yang tinggi diperlukan untuk pertumbuhan optimal, dan lisis sel dapat terjadi dalam solusi encer.
Methanopyrus
klasifikasi ilmiah:
Domain: Archaea
Raya: euryarchaeota
Filum: euryarchaeota
Kelas: Methanopyri
Order: Methanopyrales
Keluarga: Methanopyraceae
Genus: Methanopyrus
nama binomial: Methanopyrus
Kurr et al. 1992
Dalam taksonomi, Methanopyrus adalah genus dari Methanopyraceae.
Methanopyrus adalah genus metanogen, dengan spesies dijelaskan tunggal, M.
kandleri. Ini adalah hyperthermophile, ditemukan di dinding perokok hitam dari
Teluk California pada kedalaman 2.000 m, pada suhu 84-110 ° C. Strain 116
ditemukan dalam cairan perokok hitam bidang hidrotermal Kairei; itu dapat
bertahan hidup dan bereproduksi pada 122 ° C. Ia tinggal di lingkungan yang
kaya hidrogen-karbon dioksida, dan seperti metanogen lain mengurangi
terakhir untuk metana. Hal ini ditempatkan di antara euryarchaeota, di kelas
sendiri..
Kelompok E:
Sisca nirmala sari/ 160401087
sandita mahdani/160301088
debi Chandra siagian/160301089
elisa Christy panjaitan/160301090
aulia risky rahmadani/160301091
sri noviani/160301092
annur alhayu/160301093