kerangka modul pembelajaran mata kuliah: struktur dan fungsi biomolekul · 2020. 3. 28. · polimer...

i

KERANGKA MODUL PEMBELAJARAN

MATA KULIAH: STRUKTUR DAN FUNGSI

BIOMOLEKUL

Nama : Dr. Julius Pontoh, MSc

Lidya Momuat, SSi. Msi.

Vanda Kamu, SSi. MSi.

Institusi : Universitas Sam Ratulangi Manado

Fakultas : MIPA

Program Studi : Kimia

ii

2015

LEMBAR PENGESAHAN

Judul Modul Ajar : Struktur dan Fungsi Biomolekul

Nama Dosen Penyusun : Dr. Julius Pontoh, MSc.

Lidya Momuat, SSi., MSi.

Vanda Kamu, SSi., MSi.

Mengetahui dan Menyetujui: Manado, 24 Juli 2015

Dekan Penyusun,

(Prof. Dr. Benny Pinontoan, M.Sc) (Dr. Julius Pontoh, M.Sc)

NIP. 196606041995121001 NIP. 195102131976031001

Menyetujui, Mengesahkan,

Direktur Eksekutif PIU, Ketua LP3,

Prof. Dr. Ir. Dody M.J. Sumajouw, M.Eng, Ph.D, Prof. Dr. Ir. Odi R. Pinontoan, MS

NIP. 195812171988031002 NIP. 19581007198621002

3

RANCANGAN PEMBELAJARAN

Mata Kuliah : Struktur dan Fungsi

Biomolekul

Semester : 4 (Empat); Kode : KIM-241; sks : 3 (2-1)

Program Studi : Kimia Dosen : Dr. Ir. Julius Pontoh, M.Sc; Lidya Momuat, SSi., M.Si;

CAPAIAN PEMBELAJARAN:

a. Menguasai konsep teoretis struktur, sifat, dan perubahannya baik pada energi maupun kinetiknya, identifikasi, pemisahan, karakterisasi,

transformasi, sintesis bahan kimia mikromolekul dan terapannya

b. Menguasai prinsip dasar piranti lunak untuk analisis dan sintesis pada bidang kimia yang umum atau yang lebih spesifik (organik,

biokimia, analitik,kimia fisik, atau an-organik)

Matriks Pembelajaran :

Ming

Kemampuan

akhir yang

diharapkan

Bahan Kajian/Materi

Pembelajaran

Bentuk

Pembelajaran

Waktu

Belajar

(Menit)

Deskripsi Tugas Luaran Kriteria

Penilaian

(Indikator)

Bobot

Nilai

(%)

Referensi

1 2 3 4 5 6 7 8

1 Penjelasan Umum

Pelaksanaan

Perkuliahan

Diskusi 100 Kesepakatan

Dosen dengan

Mahasiswa

2 Menjelaskan

konsep dasar

biokimia sebagai

lanjutan dari Kimia

Organik dalam

Sistim Kehidupan

dalam Sel

Konsep Dasar

Biokimia

Diskusi kelompok 100 - Mahasiswa

mendiskusikan

permasalahan yang

sudah disusun dosen

dalam kelompok kecil

- Diskusi kelas

- Mahasiswa mengikuti

tes formatif

Gambar empat

jenis sel

(Prokaryotik,

Karyotik,

Hewan dan

Tumbuhan)

Hasil tes

formatif

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

- Hasil tes

formatif

perorangan

6,7 2, 3

4

(perorangan)

3 Memahami struktur

molekul air

Struktur molekul air

dan fungsinya dalam

biokimia sebagai

pelarut dan buffer

Pembuatan larutan

bufer

Diskusi kelompok

Praktikum dalam

laboratorium

T:100

P:160

- Mahasiswa

mendiskusikan

permasalahan yang

sudah disusun dosen


- Diskusi kelas

- Mahasiswa secara

perorangan menyusun

ringkasan hasil kajian

struktur molekul air

dan buffer

- Mahasiswa membuat

larutan buffer sesuai

dengan perhitungan

masing masing pH

Ringkasan hasil

kajian struktur

molekul air dan

fungsinya dalam

sel

Laporan

praktikum

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

- Kelengkapan

laporan hasil

praktikum

6,7 3

4 Mampu

menggambarkan

struktur karbohidrat

sederhana dan

klasifikasinya serta

turunan turunannya

Monosakarida Diskusi kelompok 100 - Mahasiswa

mendiskusikan

permasalahan yang

sudah disusun dosen


- Diskusi kelas

- Mahasiswa secara

perorangan

menggambarkan

struktur karbohidrat

Gambar struktur

jenis jenis

monosakarida

dan turunannya

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

- Kualitas

gambar

struktur

monosakarida

dan

turunannya

6,7 1, 2, 3, 5

5 Mampu

mengidentifikasi

dan

menggambarkan

beberapa senyawa

oligosakarida serta

menyebutkan

fungsi

oligosakarida

Oligosakarida Diskusi kelompok 100 - Mahasiswa

mendiskusikan

permasalahan yang

sudah disusun dosen


- Diskusi kelas

- Mahasiswa secara

perorangan

menggambarkan

struktur beberapa

senyawa oligosakarida

Gambar

beberapa

senyawa

oligosakarida

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

- Kualitas

gambar dan

ringkasan

fungsi

oligosakarida

6,7 1, 2, 3, 5

5

6 Mampu

menjelaskan

struktur dan fungsi

polisakarida

Polisakarida Diskusi kelompok 100 - Mahasiswa

mendiskusikan

permasalahan yang

sudah disusun dosen


- Diskusi kelas

- Mahasiswa

mempresentasikan

suatu topik secara

kelompok

- Mahasiswa menyusun

makalah

Makalah

kelompok

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

- Kemampuan

presentasi dan

diskusi dalam

kelompok

- Kualitas

makalah

kelompok

6,7 2, 3, 5

7 Mampu

menggambarkan

struktur dasar asam

amino dan ke20

jenis asam amino

Asam Amino Diskusi kelompok 100 - Mahasiswa

mendiskusikan

permasalahan yang

sudah disusun dosen


- Diskusi kelas

- Mahasiswa

mempresentasikan

pengelompokan asam

amino menurut

polaritasnya masing

masing.

Makalah

kelompok

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

- Kemampuan

presentasi dan

diskusi dalam

kelompok

- Kualitas

makalah

kelompok

6,7 1, 2, 3, 7

8 Memahami ikatan

kimia peptida dan

polimer polipeptida.

Struktur primer,

sekunder, tertier dan

kuartener

polipeptida/protein,

motif, bentuk dan

ukran protein

Praktikum analisa

[rotein menurut

kelarutannya

Diskusi kelompok

Praktikum

pemisasahan

protein menurut

kelarutannya

T: 100

P: 160

- Mahasiswa

mendiskusikan

permasalahan yang

sudah disusun dosen


- Diskusi kelas

- Mahasiswa

mempresentasikan

pengelompokan asam

amino menurut

polaritasnya masing

masing.

- Mahasiswa melakukan

Makalah

kelompok

Laporan

praktikum

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

- Kemampuan

presentasi dan

diskusi dalam

kelompok

- Kualitas

makalah

kelompok

- Kelengkapan

laporan

praktikum

6,7 2, 3, 7

6

pemisahan protein

sesuai kelarutannya

9 Memahami fungsi

protein sebagai

enzim

Pengertian enzim,

nomenklatur dan

mekanisme kerja

Praktikum aktivitas

enzim

Diskusi kelompok

Praktikum Lab

T: 100

P 160

- Mahasiswa

mendiskusikan

permasalahan yang

sudah disusun dosen


- Diskusi kelas

- Mahasiswa

mempresentasikan

pengelompokan asam

amino menurut

polaritasnya masing

masing.

- Mahasiswa membuat

reaksi biokimia kerja

enzim dalam

menghidrolisa lipida

dan karbohidrat

Makalah

kelompok

Laporan

praktikum

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

- Kemampuan

presentasi dan

diskusi dalam

kelompok

- Kualitas

makalah

kelompok

- Kelengkapan

laporan

praktikum

6,7 5, 6, 8

10 Memahami krontrol

dan kinetika enzim

Pengertian kofaktor,

alloenzim dan kinetika


mendiskusikan

permasalahan yang

sudah disusun dosen


- Diskusi kelas

- Mahasiswa

mempresentasikan

pengelompokan asam

amino menurut

polaritasnya masing

masing.

Makalah

kelompok

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

- Kemampuan

presentasi dan

diskusi dalam

kelompok

- Kualitas

makalah

kelompok

6,7 2, 3

11 Memahami fungsi

protein sebagai

penggerak motorik

dalam sel

Mekanisme kerja otot

pada tingkat molekuler

dan kerja flagela dalam

sel bakteri


mendiskusikan

permasalahan yang

sudah disusun dosen


- Diskusi kelas

Makalah

kelompok

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

- Kemampuan

presentasi dan

diskusi dalam

6,7 3

7

- Mahasiswa

mempresentasikan

pengelompokan asam

amino menurut

polaritasnya masing

masing.

kelompok

- Kualitas

makalah

kelompok

12 Memahami fungsi

protein sebagai

antibodi dan saluran

signal

Struktur dasar antibodi

dan mekanisme kerja;

contoh protein sebagai

saluran signal; dan

peran protein dalam

transpor melalui

membran sel

Praktikum analisa

protein dengan

elektroforesis

Diskusi kelompok

Praktikum Analisa

Protein dengan

Elektroforesis

T: 100

P:160

- Mahasiswa

mendiskusikan

permasalahan yang

sudah disusun dosen


- Diskusi kelas

- Mahasiswa

mempresentasikan

pengelompokan asam

amino menurut

polaritasnya masing

masing.

- Mahasiswa melakukan

kjegiatan praktikum

elektroforeis sesuai

penuntun

Makalah

kelompok

Lapotan

praktikum

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

- Kemampuan

presentasi dan

diskusi dalam

kelompok

- Kualitas

makalah

kelompok

- Kelengkapan

laporan

praktikum

6,7 2, 3

13 Memahami struktur

dan sifat sifat

molekul lipida

Pengertian lipida;

pengelompokan dan

struktur molekul lipida


mendiskusikan

permasalahan yang

sudah disusun dosen


- Diskusi kelas

- Mahasiswa

mempresentasikan

pengelompokan asam

amino menurut

polaritasnya masing

masing.

Makalah

kelompok

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

- Kemampuan

presentasi dan

diskusi dalam

kelompok

- Kualitas

makalah

kelompok

6,7 3


lipida kompleks dan

membran


mendiskusikan

permasalahan yang

Makalah

kelompok

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

6,7 3

8

sudah disusun dosen


- Diskusi kelas

- Mahasiswa

mempresentasikan

pengelompokan asam

amino menurut

polaritasnya masing

masing.

- Kemampuan

presentasi dan

diskusi dalam

kelompok

- Kualitas

makalah

kelompok


nukleotida

Struktur Nukluosida

dan nukleotida; basa

basa penyusun

nukleotida


mendiskusikan

permasalahan yang

sudah disusun dosen


- Diskusi kelas

- Mahasiswa

mempresentasikan

pengelompokan asam

amino menurut

polaritasnya masing

masing.

Makalah

kelompok

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

- Kemampuan

presentasi dan

diskusi dalam

kelompok

- Kualitas

makalah

kelompok

6,7 2, 3

16 Memahami fungsi

nukleotida

Fungsi nukleotida

sebagai transfer energi,

pembawa molekul dan

penyimpan informasi

genetika


mendiskusikan

permasalahan yang

sudah disusun dosen


- Diskusi kelas

- Mahasiswa

mempresentasikan

pengelompokan asam

amino menurut

polaritasnya masing

masing.

Makalah

kelompok

- Keaktifan

dalam diskusi

kelompok

- Kemampuan

presentasi dan

diskusi dalam

kelompok

- Kualitas

makalah

kelompok

6,7 2, 3, 4

Daftar Referensi:

1. Yohanis Ngili. 2009. Biokimia Struktur dan Fungsi Biomolekul. Graha Ilmu. Yakyakarta.

9

2. Campbell, M.K. dan S. O. 2006. Biochemistry. International Student Edition. Fifth Edition Thomson.

3. Voet, D., J.G. Voet dan C.W. Pratt. 1999. Fundamentals of Biochemistry. John Wiley & Sons, Inc. New York.

4. Alberts, B., D. Bray, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Robert dan P. Walter. 1998 Essential Cell Biology. Garland Publishing, Inc.

5. Pontoh, J. Struktur dan Fungsi Karbohidrat, Program Studi Kimia, FMIPA, Unsrat Manado

6. Pontoh, J. Struktur dan Fungsi Lipida, Program Studi Kimia, FMIPA, Unsrat Manado

7. Pontoh, J. Struktur dan Fungsi Protein, Program Studi Kimia, FMIPA, Unsrat Manado

8. Pontoh, J. Biokimia Lanjut, Program Studi Kimia, FMIPA, Unsrat Manado

RANCANGAN TUGAS

Nama Mata Kuliah : Struktur dan Fungsi

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Program Studi : Kimia Pertemuan ke : 2

Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Menjelaskan konsep dasar biokimia dan hubungannya dengan berbagai ilmu lain

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Biokimia

2. Batasan yang harus dikerjakan:

a. Sel sebagai suatu sistim kehidupan

b. Jenis jenis sel dan perbedaan dalam strukturnya

c. Sistim kehidupan menyangkut perubahan molekul/senyawa secara kimia

3. Metode/Cara Pengerjaan (acuan cara pengerjaan):

- Mahasiswa mendiskusikan permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil

- Permasalahan yang didiskusikan:

10

1) Jelaskan pengertian pengertian sel sebagai suatu kehidupan yang independen atau bagian dari jaringan dan organ

2) Gambarkan bagaian bagian dari sel

3) Mengapa sel diciptakan terdiri dari bagian bagian (organela)

4) Materi apa yang menyusun sel

- Hasil diskusi kelompok didiskusikan di kelas

- Mahasiswa mengikuti tes formatif

4. Deskripsi Luaran tugas yang dihasilkan:

Hasil tes formatif (perorangan) yang dilaksanakan selama 10 menit terakhir pada tahap ini.

C. KRITERIA PENILAIAN (6,7%):

- Keaktifan dalam diskusi kelompok

- Hasil tes formatif perorangan

RUBRIK PENILAIAN

KRITERIA 1:Keaktifan dalam diskusi (20%)

DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

Keaktifan mencari

literatur Sangat aktif Aktif Cukup aktif Kurang aktif Tidak aktif

Keaktifan

berdiskusi Sangat aktif Aktif Cukup aktif Kurang aktif Tidak aktif

TOTAL

KRITERIA 2: Hasil tes formatif perorangan (80%)

DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah standard (<40)

SKOR

Skor

11

RANCANGAN TUGAS


Biomolekul

Sks : 3 (2-1)


Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Memahami struktur molekul air dan fungsinya dalam biokimia

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Air


a. Struktur kimia molekul air


- Mahasiswa mendiskusikan permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil. Permasalahan yang dibahas

meliputi:

1) Gambarkan struktur molekul air

2) Jelaskan sifat sifat molekul air dalam hubungan dengan distribusi elektron

3) Mengapa molekul molekul air dapat mengumpul dalam bentuk cairan

4) Jelaskan ikatan kimia yang menghubungan molekul molekul air

5) Jelaskan mengapa air dapat melarutkan berbagai senyawa kimia

6) Jelaskan pengertian buffer

7) Apa peran buffer dalam sistim sel

8) Bagaimana perhitungan bahan untuk pembuatan buffer


- Mahasiswa membuat ringkasan tentang peran air dalam sel

- Mahasiswa secara perorangan menyusun ringkasan perhitungan pembuatan buffer.

- Praktikum Pembuatan Bufer


Ringkasan hasil kajian peranan air dalam sel dan pembuatan buffer

12

Lapoan praktikum pembuatan bufer




- Kualitas ringkasan hasil kajian perorangan dan laporan praktikum

- Test formatif

RUBRIK PENILAIAN


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

Keaktifan mencari


Keaktifan


TOTAL

KRITERIA 2: Kualitas ringkasan hasil kajian perorangan 50%)

DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Kelengkapan

gambar/diagram Sangat lengkap

(mampu

mengembangkan

konsep secara

optimal)

Lengkap (melebihi konsep

minimal pada

modul)

Cukup lengkap (sesuai konsep

minimal pada

modul)

Kurang lengkap (dibawah konsep

minimal pada

modul)

Tidak lengkap (konsep tidak

sesuai)

13

Ketepatan gambar

/ diagram Sangat tepat

(sesuai dengan

logika ilmiah)

Tepat

Cukup tepat Kurang tepat Tidak tepat

Ide baru dan

kreativitas Sangat baik

(memunculkan

beberapa ide baru)

Baik (memunculkan ide

baru)

Cukup baik (ide seperti pada

modul)

Kurang baik (ide di bawah

tuntutan modul)

Tidak baik (miskin ide)

Total


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Skor

14

RANCANGAN TUGAS


Biomolekul

Sks : 3 (2-1)


Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Memahami struktur molekul karbohidrat sederhana dan turunannya

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Karbohidrat


b. Struktur kimia molekul karbohidrat



meliputi:

1) Gambarkan struktur molekul glukosa

2) Menunjukan gugus fungsi utama (kimia organik) dalam molekul glukosa

3) Jelaskan kemungkinan reaksi reaksi kimia dari gugus tersebut

4) Jelaskan bentuk bentuk struktur molekul glukosa

5) Jelaskan stereoisomer dari glukosa

6) Jelaskan berbagai jenis karbohidrat menurut jumlah aton C dan stereoisomer

7) Jelaskan senyawa senyawa turunan monosakarida


- Mahasiswa membuat ringkasan struktur beberapa monosakarida yang penting

- Mahasiswa menggambarkan struktur monosakarida yang penting


Ringkasan hasil kajian struktur monosakarida

15




- Kualitas ringkasan hasil kajian perorangan

- Test formatif

RUBRIK PENILAIAN


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

Keaktifan mencari


Keaktifan


TOTAL


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Kelengkapan


(mampu

mengembangkan

konsep secara

optimal)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


sesuai)

16

Ketepatan gambar


(sesuai dengan

logika ilmiah)

Tepat


Ide baru dan


(memunculkan

beberapa ide baru)


baru)


modul)


tuntutan modul)


Total


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Skor

17

RANCANGAN TUGAS


Biomolekul

Sks : 3 (2-1)


Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Memahami struktur molekul oligosakarida

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Oligosakarida


c. Struktur kimia molekul oligosakarida



meliputi:

1) Jelaskan pengertian “oligo”

2) Jelaskan beberapa jenis oligosakarida yang penting

3) Jelaskan struktur molekul oligosakarida

4) Jelaskan mengapa sukrosa dinamakan gula nonpereduksi dan laktosa sebagai gula pereduksi

5) Jelaskan beberapa kompleks oligosakarida (glikoprotein dan glikolipid)

6) Jelaskan tentang struktur dan fungsi glykokonyugat

7) Jelaskan tentang lektin

8) Jelaskan tentang pebedaan golongan darah ABO dan antigennya

9) Jelaskan beberapa contoh mekanisme interaksi oligosakarida dalam pengenalan sel dan molekul


- Mahasiswa secara perorangan membuat ringkasan tentang struktur molekul dan fungsi oligosakarida

18


Ringkasan hasil kajian tentang oligosakarida dalam sel





- Test formatif

RUBRIK PENILAIAN


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

Keaktifan mencari


Keaktifan


TOTAL


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Kelengkapan


(mampu

mengembangkan

konsep secara


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


sesuai)

19

optimal) Ketepatan gambar


(sesuai dengan

logika ilmiah)

Tepat


Ide baru dan


(memunculkan

beberapa ide baru)


baru)


modul)


tuntutan modul)


Total


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Skor

20

RANCANGAN TUGAS


Biomolekul

Sks : 3 (2-1)


Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Memahami struktur molekul polisakarida dan fungsinya dalam biokimia

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Polisakarida


a. Struktur kimia molekul beberapa polisakarida



meliputi:

1) Jelaskan monosakarida yang menyusun amilosa, amilopektin, selulosa, kitin dan glikosaminoglikan.

2) Jelaskan apa yang dinamakan homopolimer dan heteropolimer

3) Gambarkan struktur molekul amilosa, amilopektin, dan selulosa.

4) Sebutkan polisakarida sebagai penguat struktur sel dan sebagai simpanan makanan

5) Jelaskan tentang peptidoglikan


- Mahasiswa membuat ringkasan tentang peran air dalam sel

- Mahasiswa secara perorangan menyusun ringkasan polisakarida dalam sel.


Ringkasan hasil kajian tentang polisakarida dalam sel


21




- Test formatif

RUBRIK PENILAIAN


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

Keaktifan mencari


Keaktifan


TOTAL


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Kelengkapan


(mampu

mengembangkan


minimal pada


minimal pada


minimal pada


sesuai)

22

konsep secara

optimal) modul) modul) modul)

Ketepatan gambar


(sesuai dengan

logika ilmiah)

Tepat


Ide baru dan


(memunculkan

beberapa ide baru)


baru)


modul)


tuntutan modul)


Total


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Skor

23

RANCANGAN TUGAS


Biomolekul

Sks : 3 (2-1)


Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Memahami struktur molekul asam amino

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Asam Amino


b. Struktur kimia molekul beberapa asam amino



meliputi:

1) Jelaskan struktur umum dari asam amino dan tunjukan gugus fungsi utama (3)

2) Gambarkan setiap molekul asam amino yang biasanya menyusun protein (20)

3) Jelaskan pengelompokan asam asam asam amino

4) Sebutkan sifat sifat kelarutan kelompok kelompok asam amino tersebut.

5) Sebutkan dua asam amino selain diatas yang terdapat dalam sel dan fungsinya (Dopamin dan Histamin)


Ringkasan hasil kajian asam amino


24




- Test formatif

RUBRIK PENILAIAN


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

Keaktifan mencari


Keaktifan


TOTAL


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Kelengkapan


(mampu

mengembangkan

konsep secara

optimal)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


sesuai)

Ketepatan gambar


(sesuai dengan

logika ilmiah)

Tepat


Ide baru dan Sangat baik Baik Cukup baik Kurang baik Tidak baik

25

kreativitas (memunculkan

beberapa ide baru) (memunculkan ide

baru) (ide seperti pada

modul) (ide di bawah

tuntutan modul) (miskin ide)

Total


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Skor

RANCANGAN TUGAS


Biomolekul

Sks : 3 (2-1)


Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Memahami struktur molekul polipeptida dan fungsinya dalam biokimia

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Polipeptida


a. Struktur primer molekul polipeptida

b. Struktur sekunder molekul polipeptida

c. Struktur tertier molekul polipeptida

26

d. Struktur kuartener molekul polipeptida



meliputi:

1) Gambarkan ikatan peptida

2) Tunjukan satu contoh senyawa polipeptida dan urut urutan asam aminonya

3) Jelaskan beberapa cara penulisan urut urutan asam amino dalam suatu polipeptida.

4) Jelaskan apa yang dinamakan struktur primer, sekunder, tertier dan kuartener.

5) Jelaskan apa yang dinamakan struktur heliks, beta sheet dan beta turn.

6) Jelaskan apa yang dinamakan motif

7) Tujukan beberapa bentuk protein dan ukurannya.

8) Jelaskan tentang pelipatan protein (folding) dan ikatan kimia yang menstabilkannya


- Mahasiswa membuat ringkasan tentang struktur protein

- Mahasiswa secara perorangan mengumpulkan gambar tentang beberapa struktur protein

- Praktikum kelarutan dan isolasi protein


Ringkasan hasil kajian struktur protein dan laporan praktikum kelarutan protein





- Test formatif

27

RUBRIK PENILAIAN


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

Keaktifan mencari


Keaktifan


TOTAL


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Kelengkapan


(mampu

mengembangkan

konsep secara

optimal)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


sesuai)

Ketepatan gambar


(sesuai dengan

logika ilmiah)

Tepat


Ide baru dan


(memunculkan

beberapa ide baru)


baru)


modul)


tuntutan modul)


Total

28


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Skor

RANCANGAN TUGAS


Biomolekul

Sks : 3 (2-1)


Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Memahami fingsi protein sebagai enzim

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Pengertian enzim dan mekanisme kerjanya


a. Pengertian enzim

b. Klasifikasi enzim

c. Mekanisme kerja enzim



meliputi:

29

1) Jelaskan apa fungsi utama protein. Mengapa fungsi ini sangat penting dalam biokimia

2) Jelaskan mengapa enzim perlu dikelompokan dan bagaimana pengelompokan enzim

3) Jelaskan berbagai mekanisme kerja enzim


- Mahasiswa membuat ringkasan tentang peran enzim dalam sel

- Mahasiswa secara perorangan menyusun ringkasan tentang enzim.

- Mahasiswa melakukan praktikum aktivitas enzim sesuai buku pedoman praktikum


Ringkasan hasil kajian peranan enzim dan mekanismenya dalam sel

Laporan praktikum aktivittas enzim





- Test formatif

RUBRIK PENILAIAN


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

Keaktifan mencari


Keaktifan


TOTAL

30

KRITERIA 2: Kualitas ringkasan hasil kajian perorangan dan laporan praktikumS 50%)

DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Kelengkapan


(mampu

mengembangkan

konsep secara

optimal)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


sesuai)

Ketepatan gambar


(sesuai dengan

logika ilmiah)

Tepat


Ide baru dan


(memunculkan

beberapa ide baru)


baru)


modul)


tuntutan modul)


Total


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Skor

31

RANCANGAN TUGAS


Biomolekul

Sks : 3 (2-1)


Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Memahami kontrol dan kinetika enzim

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Kinetika Enzim


a. Kinetika enzim

b. Mekanisme pengontrolan aktifitas enzim



meliputi:

1) Apa yang dinamakan kinetika enzim dan apa tujuannya

2) Bagaimana menentukan mekanisme proses penghambatan (inhibisi) enzim

3) Jelaskan berbagai mekanisme pengontrol aktivitas enzim


- Mahasiswa membuat ringkasan tentang kinetika enzim dan pengontrolan aktivitas enzim

- Mahasiswa secara perorangan menyusun ringkasan kinetika enzim dan pengontrolan aktivitas enzim.


Ringkasan hasil kajian kontrol dan kinetika enzim





- Test formatif

32

RUBRIK PENILAIAN


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

Keaktifan mencari


Keaktifan


TOTAL


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Kelengkapan


(mampu

mengembangkan

konsep secara

optimal)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


sesuai)

Ketepatan gambar


(sesuai dengan

logika ilmiah)

Tepat


Ide baru dan


(memunculkan

beberapa ide baru)


baru)


modul)


tuntutan modul)


Total

33


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Skor

RANCANGAN TUGAS


Biomolekul

Sks : 3 (2-1)


Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Memahami fungsi protein sebagai penggerak dalam sel

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Mekanisme kerja prorein dalam otot dan transport mioglobin dan hemoglobin


a. Struktur kimia molekul prtotein yang berada dalam otot dan flagela

b. Mekanisme kerja gerak otot pada tingkat molekular

c. Struktur molekul miglobin dan hemoglobin

d. Mekanisme transport oksigen dari protein

34



meliputi:

1) Jelaskan struktur protein (miosin dan aktin) dalam jaringan otot

2) Jelaskan mekanisme gerakan dalam otot secara molekuler

3) Gambarkan molekul mioglobin dengan gugus heme dan interaksinya dengan protein

4) Jelaskan fungsi mioglobulin

5) Gambarkan molekul dari hemoglobin

6) Jelaskan fngsi hemoglobin


- Mahasiswa membuat ringkasan protein sebagai penggerak dan pembawa oksigen


Ringkasan hasil kajian peran protein sebagai penggerak dan pembawa oksigen





- Test formatif

RUBRIK PENILAIAN


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

Keaktifan mencari


Keaktifan Sangat aktif Aktif Cukup aktif Kurang aktif Tidak aktif

35

berdiskusi TOTAL


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Kelengkapan


(mampu

mengembangkan

konsep secara

optimal)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


sesuai)

Ketepatan gambar


(sesuai dengan

logika ilmiah)

Tepat


Ide baru dan


(memunculkan

beberapa ide baru)


baru)


modul)


tuntutan modul)


Total


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Skor

36

RANCANGAN TUGAS


Biomolekul

Sks : 3 (2-1)


Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Memahami fungsi protein sebagai antibodi, saluran signal molekul dan transport senyawa melalui membran

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Fungsi protein sebagai antibodi, saluran signal dan transport senyawa melalui membran


a. Struktur kimia molekul antibodi

b. Struktur kimia molekul saluran signal

c. Struktur kimia molekul transport melalui membran



meliputi:

1) Jelaskan struktur molekul antibodi dan mekanisme kerjanya.

2) Sebutkan dan gambarkan dua protein yang berfungsi sebagai penuerus signal (signal transduction)

3) Sebutkan dan gambarkan dua protein yang berfungsi sebagai pengantar molekul melewati membran


- Mahasiswa membuat ringkasan tentang fungsi fungsi protein sebagai antibodi

- Praktikum analisa protein dengan gel elektroforesis sesuai dengan pedoman praktikum


Ringkasan hasil kajian antibodi

Laporan praktikum


37




- Test formatif

RUBRIK PENILAIAN


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

Keaktifan mencari


Keaktifan


TOTAL

KRITERIA 2: Kualitas ringkasan hasil kajian perorangan dan laporan praktikum 50%)

DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Kelengkapan


(mampu

mengembangkan

konsep secara

optimal)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


sesuai)

Ketepatan gambar


(sesuai dengan

Tepat Cukup tepat Kurang tepat Tidak tepat

38

logika ilmiah) Ide baru dan


(memunculkan

beberapa ide baru)


baru)


modul)


tuntutan modul)


Total


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Skor

RANCANGAN TUGAS


Biomolekul

Sks : 3 (2-1)


Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Memahami struktur molekul lipida dan fungsinya dalam biokimia

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Lipida


a. Klasifikasi lipida

b. Struktur kimia molekul molekul lipida

39



meliputi:

1) Jelaskan pengelompokan senyawa senyawa lipida

2) Gambarkan struktur molekul asam lemak

3) Jelaskan pengelompokan asam lemak

4) Gambarkan struktur molekul triasil gliserol

5) Gambarkan struktur molekul umum gliserofosfolipida

6) Jelaskan sifat sifat dan fungsi gliserofosfolipida

7) Jelaskan struktur molekul dan fungsi spingolipida

8) Jelaskan struktur umum steroid

9) Sebutkan beberapa jenis steroid yang penting


- Mahasiswa membuat ringkasan tentang senyawa lipida


Ringkasan hasil kajian senyawa lipida





- Test formatif

RUBRIK PENILAIAN


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

40

Keaktifan mencari


Keaktifan


TOTAL


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Kelengkapan


(mampu

mengembangkan

konsep secara

optimal)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


sesuai)

Ketepatan gambar


(sesuai dengan

logika ilmiah)

Tepat


Ide baru dan


(memunculkan

beberapa ide baru)


baru)


modul)


tuntutan modul)


Total


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Skor

41

RANCANGAN TUGAS


Biomolekul

Sks : 3 (2-1)


Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Memahami struktur membran dalam sel

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Polisakarida


a. Struktur membran dalam sel

b. Fungsi membran dalam biokimia



meliputi:

1) Jelaskan proses pembentukan membran dalam sel dan pergeseran molekul fosfolipida dalam membran

2) Jelaskan manfaat kompartemen dalam sel

3) Jelaskan struktur membran dan hubungannya dengan berbagai senyawa protein kompleks

4) Jelaskan mekanisme gerak molekul protein dalam membran

5) Jelaskan trnsport glukosa melalui membran


- Mahasiswa membuat ringkasan tentang membran dan mekanisme fungsi fungsi membran dalam sel


Ringkasan hasil kajian struktu membran, fungsi membran dan mekanisme transport melalui membran


42




- Test formatif

RUBRIK PENILAIAN


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

Keaktifan mencari


Keaktifan


TOTAL


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Kelengkapan


(mampu

mengembangkan

konsep secara

optimal)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


sesuai)

Ketepatan gambar


(sesuai dengan


43



(memunculkan

beberapa ide baru)


baru)


modul)


tuntutan modul)


Total


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Skor

44

FORMAT RANCANGAN TUGAS


Biomolekul

Sks : 3 (2-1)


Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Memahami struktur molekul nukleotida dan fungsinya dalam sel

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul nukleotida


a. Struktur kimia molekul nukleotida



meliputi:

1) Jelaskan struktur umum nukleotida, gugus fungsi apa yang terlibat dalam penyusunannya

2) Jelaskan pengelompokan basa dan gambarkan basa basa yang biasanya menyusun nukleotida

3) Gambarkan struktur molekul nukleosida

4) Sebutkan sifat sifat molekul nukleotida

5) Sebutkan empat fungsi utama nukleotida


- Mahasiswa membuat ringkasan tentang struktur nukleotida


Ringkasan hasil kajian struktur dan fungsi molekul nukleotida dalam sel


45




- Test formatif

RUBRIK PENILAIAN


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

Keaktifan mencari


Keaktifan


TOTAL


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Kelengkapan


(mampu

mengembangkan

konsep secara

optimal)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


sesuai)

Ketepatan gambar


(sesuai dengan


46



(memunculkan

beberapa ide baru)


baru)


modul)


tuntutan modul)


Total


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Skor

FORMAT RANCANGAN TUGAS


Biomolekul

Sks : 3 (2-1)


Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Memahami struktur molekul DNA dan RNA

B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul DNA dan RNA


b. Struktur kimia molekul DNA dan RNA

47



meliputi:

1) Jelaskan perbedaan struktur DNA dan RNA

2) Jelaskan ikatan kimia antara basa basa dalam DNA dan RNA

3) Jelaskan struktur molekul DNA, doobel heliks, kromosom dan gen

4) Jelaskan fungsi DNA

5) Sebutkan jenis jenis dan fungsi RNA

6) Jelaskan proses penentuan urut-urutan basa dalam molekul DNA


- Mahasiswa membuat ringkasan tentang struktur nukleotida


Ringkasan hasil kajian struktur dan fungsi molekul DNA dan RNA





- Test formatif

RUBRIK PENILAIAN


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)

Di bawah

standard (<40)

SKOR

Keaktifan mencari


Keaktifan Sangat aktif Aktif Cukup aktif Kurang aktif Tidak aktif

48

berdiskusi TOTAL


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Kelengkapan


(mampu

mengembangkan

konsep secara

optimal)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


minimal pada

modul)


sesuai)

Ketepatan gambar


(sesuai dengan

logika ilmiah)

Tepat


Ide baru dan


(memunculkan

beberapa ide baru)


baru)


modul)


tuntutan modul)


Total


DIMENSI Sangat

Memuaskan (≥80)

Memuaskan (65-79)

Batas (55-64)

Kurang

Memuaskan (40-54)


SKOR

Skor

49

GARIS BESAR MATERI PEMBELAJARAN

No. Pertemuan Materi Pembelajaran Garis Besar Materi Pembelajaran

1. 1 Penjelasan Umum

Pelaksanaan Perkuliahan

Pertemuan membahas capaian pembelajaran, metode dan strategi dalam pembelajaran,

evaluasi, serta tugas-tugas yang akan dicapai selama pembelajaran

2. 2 Konsep Dasar Biokimia Pertemuan ini akan membahas konsep dasar Biologi Konservasi yang terdiri dari:

- Jenis jenis sel

- Struktur sel

- Bahan biomolekul dalam sel

3. 3 Struktur molekul air dan

fungsinya dalam sel

Pertemuan ini akan membahas:

- Struktur molekul air

- Peran air sebagai pelarut dalam sel

- Peran bufer dalam reaksi biokimia

4. 4 Struktur molekul

monosakarida


- Sruktur molekul glukosa

- Gugus fungsi utama dalam glukosa

- Klasifikasifikasi monosakarida

- Struktur senyawa senyawa turunan monosakarida

- Fungsi monosakarida dalam sel


oligosakarida


- Jenis jenis oligosakarida

- Kompleks oligosakarida dang fungsi biologinya


polisakarida


- Struktur beberapa polisakarida

- Fungsi polisakarida dalam sel

- Polisakarida kompleks

7. 7 Struktur molekul asam

amino


- Struktur molekul asam amino

50

- Pengelompokan dan sifat sifat asam amino

- Fungsi asam asam asam mino dalam sel

8. 8 Struktur molekul protein Pertemuan ini akan membahas:

- Ikatan peptida dan struktur molekul protein

- Struktur primer protein

- Struktur sekunder protein

- Struktur tertier protein

- Proses pelipatan molekul protein

9 9 Enzim Pertemuan ini akan membahas:

- Fungsi protein sebagai enzim

- Klasifikasi enzim

- Mekanisme kerja enzim

10 10 Kontrol kerja enzim Pertemuan ini akan membahas:

- Kinetika enzim

- Proses penentuan kontrol enzim

- Mekanisme kontrol enzim

11 11

Fungsi protein sebagai

penggerak


- Fungsi protein sebagai penggerak

- Mekanisme kerja gerak otot

- Struktur molekul mioglobin dan hemoglobin

- Mekanisme transport oksigen oleh protein

12 12 Fungsi protein sebagai

antibodi, saluran signal dan

transport melalui membran

sel


- Struktur molekul antibodi dan mekanisme kerjanya

- Protein sebagai media penerus signal

- Fungsi protein sebagai pengantar molekul dalam membran

13 13 Struktur dan fungsi lipida Pertemuan ini akan membahas:

- Pengelompokan senyawa senyawa lipida

- Struktur molekul asam lemak

- Struktur molekul triasil gliserol

- Struktur molekul gliserofosfolipida dan fungsinya

- Struktur molekul steroid dan fungsinya

51

14 14 Struktur dan fungsi

membran


- Struktur membran dalam sel

- Hubungan membran dan protein dalam sel

- Mekanisme transport glokosa melewati membran

15 15 Struktur dan fungsi

nukleotida


- Struktur molekul nukleotida dan beberapa jenis nukleotida

- Sifat sifat nukleotida

- Fungsi beberapa senyawa nukleotida

16 16 Struktur dan fungsi DNA

dan RNA


- Struktur molekul DNA dan RNA

- Pembentukan double helix pada DNA

- Struktur kromosom dan gen

- Klasifikasi RNA

- Penentuan urut urutan basa pada polinukleotida

kerangka modul pembelajaran mata kuliah: struktur dan fungsi biomolekul · 2020. 3. 28. · polimer...

Documents