konzbiomaster3.pdf

11
3. METAPOPULACIONA GENETIKA I EVOLUCIJA U evolucionoj biologiji, termin metapopulacija podrazumeva skupove dema ili lokalnih populacija (sinonim) ograničene veličine unutar kojih je prisutno ukrštanje po principu slučajnosti, a između kojih postoji ograničen protok gena (Tucić, 2003), tj skup lokalnih populacija koji je genetički strukturiran. Podrazumeva se da je verovatnoća izumiranja tih lokalnih populacija realna i relativno česta, te da one bivaju obnovljene od strane imigranata iz ostalih lokalnih populacija u okviru metapopulacije. Veoma je važno istaći da, usled dinamike izumiranja i obnavljanja lokalnih populacija, stepen međupopu- lacione genetičke diferencijacije, tj nivo genetičke strukturiranosti metapopulacije, nije veliki, bez obzira na ograničen protok gena između lokalnih populacija (Pešić i sar., 2009). Činjenica je da genetička kompozicija metapopulacije i njenih elemenata direktno utiče na populacionu dinamiku i ekologiju, odnosno na verovatnoću izumiranja pojedinih lokalnih populacija i promene stope migracije (Hanski, 1999). 3.1. Genetička osnova i migracije Migracije u ovom kontekstu označavaju kretanje jedinki iz jedne u drugu lokalnu populaciju u okviru metapopulacionog sistema. Intenzitet stope migracije zavisi od spoljašnjih faktora, abiotičkih (povoljni/nepovoljni vremenski uslovi za migriranje) i biotičkih (prisustvo/odsustvo i/ili intenzitet predatorskog pritiska), ali i varijabilnosti gena koji determinišu sklonost ka migriranju tj napuštanju matične lokalne populacije. Poznato je da je varijabilnost za sklonost ili sposobnost migriranja kod mnogih taksona, makar delimično,određena naslednom osnovom (Wilson, 1995; Roff, 1996). Skup migranata tako predstavlja neslučajan genetički uzorak u okviru metapopulacije, pa migracija, putem protoka gena, može promeniti učestalosti alela u lokalnim populacijama. Sam process migriranja, kada traje duži vremenski period, izaziva promenu stope migracije u populaciji. Ako je, na primer, emigracija mnogo intenzivnija od imigracije (čest slučaj u izolovanim lokalnim populacijama), većina jedinki sa migratornim naslednim predispozicijama napušta matičnu populaciju i vremenom preovlađuju jedinke sa ne- migratornim naslednim predispozicijama-stopa migracije će evoluirati u pravcu svog

Upload: dreamsdiefirst

Post on 15-Nov-2015

227 views

Category:

Documents


1 download

TRANSCRIPT

  • 3. METAPOPULACIONA GENETIKA I EVOLUCIJA

    U evolucionoj biologiji, termin metapopulacija podrazumeva skupove dema ili

    lokalnih populacija (sinonim) ograniene veliine unutar kojih je prisutno ukrtanje po

    principu sluajnosti, a izmeu kojih postoji ogranien protok gena (Tuci, 2003), tj skup

    lokalnih populacija koji je genetiki strukturiran. Podrazumeva se da je verovatnoa

    izumiranja tih lokalnih populacija realna i relativno esta, te da one bivaju obnovljene od

    strane imigranata iz ostalih lokalnih populacija u okviru metapopulacije. Veoma je vano

    istai da, usled dinamike izumiranja i obnavljanja lokalnih populacija, stepen meupopu-

    lacione genetike diferencijacije, tj nivo genetike strukturiranosti metapopulacije, nije

    veliki, bez obzira na ogranien protok gena izmeu lokalnih populacija (Pei i sar.,

    2009). injenica je da genetika kompozicija metapopulacije i njenih elemenata direktno

    utie na populacionu dinamiku i ekologiju, odnosno na verovatnou izumiranja pojedinih

    lokalnih populacija i promene stope migracije (Hanski, 1999).

    3.1. Genetika osnova i migracije

    Migracije u ovom kontekstu oznaavaju kretanje jedinki iz jedne u drugu lokalnu

    populaciju u okviru metapopulacionog sistema. Intenzitet stope migracije zavisi od

    spoljanjih faktora, abiotikih (povoljni/nepovoljni vremenski uslovi za migriranje) i

    biotikih (prisustvo/odsustvo i/ili intenzitet predatorskog pritiska), ali i varijabilnosti gena

    koji determiniu sklonost ka migriranju tj naputanju matine lokalne populacije. Poznato

    je da je varijabilnost za sklonost ili sposobnost migriranja kod mnogih taksona, makar

    delimino,odreena naslednom osnovom (Wilson, 1995; Roff, 1996). Skup migranata

    tako predstavlja nesluajan genetiki uzorak u okviru metapopulacije, pa migracija,

    putem protoka gena, moe promeniti uestalosti alela u lokalnim populacijama. Sam

    process migriranja, kada traje dui vremenski period, izaziva promenu stope migracije u

    populaciji. Ako je, na primer, emigracija mnogo intenzivnija od imigracije (est sluaj u

    izolovanim lokalnim populacijama), veina jedinki sa migratornim naslednim

    predispozicijama naputa matinu populaciju i vremenom preovlauju jedinke sa ne-

    migratornim naslednim predispozicijama-stopa migracije e evoluirati u pravcu svog

  • smanjenja. Ako je imigracija intenzivnija od emigracije, to se moe deavati u malim

    lokalnim populacijama koje se nalaze blizu velikih, vremenom e se proporcija jedinki sa

    migratornim naslednim predispozicijama poveati u malim populacijama (Hanski, 1999).

    U kontekstu uticaja stope migracije na dinamiku metapopulacije, vano je saznati

    u kom obimu potencijalne evolutivne promene u stepenu pokretljivosti ili migratornosti

    menjaju povezanost lokalnih populacija u sistemu. Na primer, ako izolovane populacije

    imaju izuzetno nisku stopu migracije, one efektivno postaju izolovanije. Ako se stopa

    migracije dodatno povea u sistemu ve dobro povezanih lokalnih populacija, one e

    postati bolje povezane.

    Da bi pozitivna stopa migracije evoluirala u hipotetikoj metapopulaciji gde nema

    izumiranja i promene veliine lokalnih populacija, ali sama migracija ima cenu i/ili

    postoje konstantne razlike u kvalitetu fragmenata stanita i tako i u veliinama lokalnih

    populacija, mora postojati neki mehanizam koji poveava adaptivnu vrednost migranata

    na primer, vremensko variranje veliina populacija i adaptivnih vrednosti jedinki.

    Verovatnoa da e migrant naseliti prazan fragment stanita i verovatnoa da e naseliti

    malu populaciju koja ima predispozicije da u bliskoj budunosti postane velika, u znatnoj

    meri odreuju njegovu oekivanu adaptivnu vrednost (Hanski, 1999).

    Za oekivati je da selekcija u metapopulaciji paralelno deluje na dva nivoa na

    osobine ivotne istorije, odnosno komponente adaptivne vrednosti, od kojih je jedna i

    stopa migracije: a. selekcija unutar lokalnih populacija; b. selekcija lokalnih populacija.

    Uestalost alela koji favorizuju migratornost vremenom e se smanjiti na lokalnom

    nivou, ali ako posmatramo metapopulacioni nivo, ukupna stopa migracije (na nivou

    metapopulacije) e se poveati. Problem fragmentacije stanita jeste u tome to ona

    poveava cenu migracije (rizik od uginua tokom migracije), i na taj nain i relativnu

    jainu unutarpopulacione selekcije protiv migratornih alela. Meutim, smanjena veliina

    populacija poveava intenzitet njihovog izumiranja, to e poveati variranje adaptivne

    vrednosti u buduem vremenu, a to e doprineti selekciji za odravanje ili poveanje

    uestalosti migratornih alela na metapopulacionom nivou.

  • 3.2. Genetika osnova i izumiranje lokalnih populacija

    Uticaj evolucionih faktora na metapopulacionu dinamiku jo uvek je nedovoljno

    istraen. Poznato je da je negativan efekat inbridinga karakteristian za male izolovane

    elemente metapopulacije i da doprinosi njihovom izumiranju, pre svega putem smanjenja

    genetike varijabilnosti za osobine ivotne istorije. Na primer, nakon samo jedne

    generacije ukrtanja u drugom stepenu srodstva (braa i sestre) u lokalnoj populaciji

    leptira Melitaea cinxia, stopa izleganja jaja smanjila se za 30% (Saccheri i sar., 1998).

    Hanski (1999) smatra da, ponekad, ak i snana selekcija protiv tetnih recesivnih alela

    ne moe dovesti do takozvanog genetikog proiavanja ako su u pitanju veoma male

    lokalne populacije, verovatno zbog velike verovatnoe fiksiranja alela sa ne tako jakim

    tetnim efektima i zbog protoka gena izmeu lokalnih populacija.

    U udbenicima evolucione biologije esto se pominje da su male populacije pod

    veim rizikom od izumiranja jer u njima genetiki drift ima predominantnu ulogu, tj

    deluje jae od prirodne selekcije, pa te sluajne promene uestalosti alela mogu poveati

    stopu inbridinga u populaciji kroz gubitak alelske raznovrsnosti, naroito ako su aleli u

    populaciji zastupljeni sa malom uestalou. Predstaviemo ovaj mehanizam detaljnije,

    pomou termina varijansna efektivna veliina populacije (eng. variance-effective

    population size). Ovu efektivnu veliinu populacije matematiki je definisao Holdejn

    (Haldane, 1939) kao

    Ne(v) = 4N/(Vk+2),

    gde je N veliina populacije dobijena cenzusom, a Vk varijansa broja gameta koje

    proizvede roditeljska generacija.

    Krou i Kimura (Crow i Kimura, 1970) predstavili su varijansnu efektivnu veliinu

    populacije jednainom:

    Ne(v) = (Nk-k)/(1 +Vk/k),

    gde je N veliina roditeljske populacije, k je srednja vrednost broja potomaka

    proizvedenih po jedinki, a Vk populaciona varijansa broja potomaka proizvedenih po

    jedinki.

  • Kada je reproduktivni uspeh jedinki sluajan i veliina populacije ne varira, Vk = k =2 i

    Ne(v) = N. Meutim, u realnim populacijama, Ne(v) < N, zbog variranja odnosa polova u

    populaciji kao i variranja reproduktivnog uspeha izmeu jedinki istog pola.

    Dakle, na varijansnu efektivnu veliinu populacije utie sama veliina populacije i

    reproduktivni uspeh jedinki, tako da je ona pouzdan parametar za utvrivanje efekta

    uskog grla (jaina uticaja genetikog drifta zavisi direktno od broja potomaka koji

    formiraju populaciju nakon uskog grla).

    Kada posmatramo jednu metapopulaciju i njenu efektivnu veliinu kao merilo

    evolutivnog potencijala, ona moe biti ugroena bilo smanjenjem veliine metapopulacije

    kroz izumiranje njenih pojedinanih elemenata i/ili poveanjem varijanse broja potomaka

    izmeu porodica. Treba pomenuti i uticaj obrta populacije, to se u ovom sluaju odnosi

    na brzinu i intenzitet izumiranja pojedinanih elemenata metapopulacionog sistema, a taj

    uticaj je utoliko vei ukoliko su lokalne populacije koje iezavaju vee, jer e se desiti

    redukcija ukupne genetike varijabilnosti metapopulacije u procesu metapopulacione

    dinamike, lokalne populacije e biti obnovljene od strane imigranata, ali e te osnivake

    propagule na poetku biti male, te e i njihove lokalne efektivne veliine biti male, a ako

    sve jedinke dolaze iz iste populacije, vea je verovatnoa da e smanjenje genetike

    varijabilnosti populacije biti vee nego kada bi propagula bila sastavljena od jedinki iz

    razliitih lokalnih populacija.

    Ako je protok gena (izraen kroz m) mnogo manji od 1, proces

    izumiranja/obnavljanja rezultirae poveanjem meupopulacione genetike

    diferencijacije na nivou metapopulacije pod sledeim uslovom (Whitlock i McCauley,

    1990):

    k

  • obrtom populacija, stopa protoka gena ima visoke vrednosti, tako da su vrednosti FST koeficijenta veoma male i nema genetike strukturiranosti (Slatkin, 1985). Poveanje

    genetike strukturiranosti usled procesa iezavanja i obnavljanja lokalnih populacija

    karakteristino je, pre svega, za biljke, jer se kod njih ee deava da je k

  • vremenu i prostoru, dovodi do bolje adaptiranosti ili iezavanja pojedinih lokalnih

    populacija. Rajtov populacioni model u mnogome podsea na metapopulacioni jer

    opisuje skup lokalnih populacija koje, zbog svoje ograniene veliine i predominantnog

    delovanja genetikog drifta, mogu brzo ieznuti. Njihove genetike strukture tj tipovi i

    uestalosti alela uglavnom se menjaju putem genetikog drifta (faza 1.), ali dobitna

    kombinacija tj koadaptirane genske kombinacije sa najviom adaptivnom vrednou,

    kada preovladaju u demama usled delovanja prirodne selekcije (faza 2.) poinju da se ire

    migracijom odnosno protokom gena tako da preplavljuju ostale deme. Tako itav

    sistem polako napreduje ka adaptivnom vrhu, tj stanju u kome biva dostignuta

    maksimalna adaptivna vrednost (faza 3.) (detaljno u Tuci, 2003). Ono to je zanimljivo

    i kontroverzno u ovoj teoriji je faza 3., jer Rajt navodi (i matematiki objanjava) da

    razliite genske kombinacije mogu imati istu adaptivnu vrednost te, stoga, u razliitim

    demama mogu preovlaivati razliiti genotipovi, odnosno u jednom sklopu sredinskih

    varijabli nekoliko razliitih genotipova mogu imati maksimalnu adaptivnu vrednost.

    Kako i da li oni realno mogu da izvedu meusobno takmienje i zaposedanje tue

    teritorije, zavisi od stope migracije, prosene adpativne vrednosti populacije u

    adaptivnoj dolini (detaljno u: Tuci, 2003) i uticaju koji protok gena vri na genetiku

    strukturu date populacije. Snaan protok gena spreie pomeranje vrha tj ve samo

    jedan migrant po generaciji spreie retke genotipove koji su formirali adaptivni vrh u

    pojedinim lokalnim populacijama da se ire dalje putem migracije jer e protokom gena

    njih okupirati najuspeniji genotipovi iz populacija koje su na neto niem adaptivnom

    vrhu, ali su brojnije. Takoe, u realnim metapopulacijama protok gena nije homogen

    izmeu nekih fragmenata je intenzivniji u odnosu na druge, a sve se to opet menja u

    vremenu.Takozvana pomeranja areala (eng. range shifts), od kojih su najpoznatija

    ona iz perioda pleistocenskih glacijacija, predstavljaju ilustraciju faze tri procesa pomine

    ravnotee.

    Primena Rajtovog modela pomine ravnotee ogleda se u interpretaciji intenziteta

    autbredne depresije (eng. outbreed depression) izmeu lokalnih populacija koje se

    nalaze u razliitim delovima areala vrste. Ovaj fenomen utvren je kod nekih vrsta

    (Simberloff, 1988; Hanski, 1999) kao pad adaptivne vrednosti, najee u F2 generaciji

    potomaka nastalih ukrtanjem jedinki iz udaljenih populacija. Objanjenje je da su, zbog

  • razliitih sredinskih uslova, koadaptirane genske kombinacije sa najveom adaptivnom

    vrednou u tim populacijama razliite, tj nivo meupopulacione genetike

    diferencijacije je visok, tako da nove genetike kombinacije u poetku imaju manju

    adaptivnu vrednost.

    3.4. Rajtov ostrvski model populacione strukture kao primer dinamike efektivne

    veliine populacije na metapopulacionom nivou

    Metapopulacija je samo jedan od naina organizacije tj komunikacije lokalnih

    populacija u nekom prostoru i ovim modelom moe biti obuhvaen ukupan areal vrste ili

    samo jedan njegov deo. U evolucionoj biologiji, nivo genetike komunikacije izmeu

    lokalnih populacija nazivamo populacionom strukturom. Prilikom opisivanja populacione

    strukture od presudnog znaaja za stepen strukturiranosti jeste protok gena, od ijeg

    intenziteta (izraava se brojem migranata po generaciji) zavisi da li e populaciona

    struktura biti vie ili manje izraena. Ako su sve lokalne populacije meusobno povezane

    intenzivnim protokom gena koji izjednaava lokalne uestalosti alela, onda za taj

    analizirani skup populacija ne moemo rei da je strukturiran. Ako je protok gena

    izuzetno mali i to se odraava kroz veliku meupopulacionu genetiku diferencijaciju,

    skup je veoma strukturiran. U odnosu na intenzitet stope protoka gena koncipirani su i

    osnovni teoretski modeli populacione strukture (vidi u: Tuci, 2003). Jedan od njih,

    ostrvski model (Wright, 1931, 1932), podrazumeva skup lokalnih populacija izmeu

    kojih postoji protok gena toliko malog intenziteta da meusobna razdaljina izmeu

    populacija nema znaajnog uticaja na njega. Meutim, Rajt ne precizira da su te lokalne

    populacije podlone estom izumiranju i potonjoj rekolonizaciji, navodi kao jedan od

    sigurnih pokazatelja ostrvskog modela populacione strukture stopu protoka gena (Nm)

    manju od 1 i, zbog toga, stepen meupopulacione genetike diferencijacije (FST) vei od

    0.20, odnosno nezavisno delovanje evolucionih faktora u svakoj lokalnoj populaciji.

    Dinamika izumiranja i obnavljanja lokalnih populacija trebalo bi da smanjuje

    ukupnu genetiku varijabilnost metapopulacije, jer svaka rekolonizacija podrazumeva

    formiranje propagule koja je, najverovatnije, manje veliine od prethodno izumrle

    populacije, i, shodno tome, sa smanjenim nivoom genetike varijabilnosti. Meutim, u

    metapopulacijama pojavljuje se kombinovani efekat protoka gena i

  • izumiranja/obnavljanja lokalnih populacija na stepen meupopulacione genetike

    diferencijacije.

    Rajt (Wright, 1943) je definisao efektivnu veliinu metapopulacije koja se sastoji

    od idealnih n subpopulacija u kojima je Ne = N, kao

    NeT NT/(1- FST),

    gde je NT = nN, tj ukupan broj jedinki u metapopulaciji. Ova jednaina ukazuje da, kada

    je FST > 0, i, naravno, kada nema izumiranja i rekolonizacije lokalnih populacija nego je

    njihova veliina i broj konstantan i svaka od njih podjednako doprinosi ukupnom pulu

    migranata, onda je NeT > NT , to ilustruje kompleksne naine na koje mnogi faktori mogu

    uticati na odnos izmeu efektivne veliine lokalnih populacija i metapopulacije u celini

    (pod datim uslovima, fragmentacija doprinosi efektivnom poveanju metapopulacije, jer

    vremenom u razliitim subpopulacijama bivaju fiksirani razliiti aleli i genetika

    varijabilnost lokalnih populacija opada, ali ona biva ouvana na nivou metapopulacije). U

    ravnotenom stanju, kada je FST 1/(1 + 4Nem), onda je

    NeT/NT 1 + 1/4Nem .

    Kada se NT ne menja, efektivna veliina metapopulacije raste sa svakim narednim

    smanjenjem stope migracije unutar metapopulacije, jer sve vie i vie geneike

    varijabilnosti biva zamrznuto u izolovanim lokalnim populacijama.

    Da li je ovakav scenario mogu? U uslovima gde su pogodni fragmenti stanita izrazito

    izolovani, njihov kapacitet sredine podjednak, i ako lokalna regulacija populacije odrava

    veliinu populacije stabilnom, fragmentacija moe ograniiti varijansu reproduktivnog

    uspeha i tako voditi ka veoj NeT . Isti efekat mogu imati specifini dizajn rezervata

    prirode i programi uzgajanja u zatoenitvu, putem izjednaavanja eproduktivnog uspeha

    u subpopulacijama. Naravno, mnogo je realnija situacija gde fragmentacija smanjuje

    efektivnu veliinu metapopulacije (Waples, 2002).

  • Ako subpopulacije variraju u svojim stopama migracije, broju migranata i produktivnosti

    (parametar P predstavlja varijansu produktivnosti subpopulacija) po Vitloku i Bartonu

    (Whitlock i Barton, 1997)

    NeT NT/((1+P)(1- FST) + NPFSTn/(n-1)) .

    Ako je P=0, onda NeT NT/(1- FST). Ako je FST =0, onda NeT NT/(1+P). Ova

    poslednja jednaina je zanimljiva jer ilustruje da fragmentacija metapopulacije, ak iako

    nema genetike diferencijacije, utie na smanjenje efektivne veliine populacije zbog

    postojanja varijanse produktivnosti subpopulacija (P>0).

    Nani (Nunney, 1999) je koncipirao slian model, ali sa tzv. interdemnim

    genetikim driftom (variranje produktivnosti subpopulacija i tako i doprinosa skupu

    migranata) generisanim nakupljanjem sluajnih razlika u reproduktivnom uspehu izmeu

    jedinki i pretpostavljenim inbridingom unutar subpopulacija, izraenim preko FIS

    koeficijenta:

    NeT NT/((1+ FIS)(1+ FST) - 2 FIS FST).

    Ako je ukrtanje unutar subpopulacija po principu sluajnosti, tj FIS =0, onda je

    NeT NT/(1+ FST),

    to je upravo suprotno Rajtovom modelu, gde je NeT NT/(1- FST).

    Proces izumiranja/rekolonizacije moe drastino da umanji efektivnu

    veliinu metapopulacije, naroito ako je broj naseljenih fragmenata stanita tako mali da

    je metapopulacija u opasnosti od izumiranja. Ako je varijansa produktivnosti

    metapopulacije rezultat izumiranja i rekolonizacije subpopulacija, odnos izmeu

    efektivne veliine metapopulacije i koeficijenta meupopulacione genetike

    diferencijacije bie

    NeT n/4(m+e)FST.

  • U ovakvom modelu, efektivna veliina metapopulacije bie proporcionalna broju

    subpopulacija (n), a ne veliini subpopulacije (N) ili ukupnoj veliini metapopulacije

    (NT).