konzbiomaster3.pdf
TRANSCRIPT
-
3. METAPOPULACIONA GENETIKA I EVOLUCIJA
U evolucionoj biologiji, termin metapopulacija podrazumeva skupove dema ili
lokalnih populacija (sinonim) ograniene veliine unutar kojih je prisutno ukrtanje po
principu sluajnosti, a izmeu kojih postoji ogranien protok gena (Tuci, 2003), tj skup
lokalnih populacija koji je genetiki strukturiran. Podrazumeva se da je verovatnoa
izumiranja tih lokalnih populacija realna i relativno esta, te da one bivaju obnovljene od
strane imigranata iz ostalih lokalnih populacija u okviru metapopulacije. Veoma je vano
istai da, usled dinamike izumiranja i obnavljanja lokalnih populacija, stepen meupopu-
lacione genetike diferencijacije, tj nivo genetike strukturiranosti metapopulacije, nije
veliki, bez obzira na ogranien protok gena izmeu lokalnih populacija (Pei i sar.,
2009). injenica je da genetika kompozicija metapopulacije i njenih elemenata direktno
utie na populacionu dinamiku i ekologiju, odnosno na verovatnou izumiranja pojedinih
lokalnih populacija i promene stope migracije (Hanski, 1999).
3.1. Genetika osnova i migracije
Migracije u ovom kontekstu oznaavaju kretanje jedinki iz jedne u drugu lokalnu
populaciju u okviru metapopulacionog sistema. Intenzitet stope migracije zavisi od
spoljanjih faktora, abiotikih (povoljni/nepovoljni vremenski uslovi za migriranje) i
biotikih (prisustvo/odsustvo i/ili intenzitet predatorskog pritiska), ali i varijabilnosti gena
koji determiniu sklonost ka migriranju tj naputanju matine lokalne populacije. Poznato
je da je varijabilnost za sklonost ili sposobnost migriranja kod mnogih taksona, makar
delimino,odreena naslednom osnovom (Wilson, 1995; Roff, 1996). Skup migranata
tako predstavlja nesluajan genetiki uzorak u okviru metapopulacije, pa migracija,
putem protoka gena, moe promeniti uestalosti alela u lokalnim populacijama. Sam
process migriranja, kada traje dui vremenski period, izaziva promenu stope migracije u
populaciji. Ako je, na primer, emigracija mnogo intenzivnija od imigracije (est sluaj u
izolovanim lokalnim populacijama), veina jedinki sa migratornim naslednim
predispozicijama naputa matinu populaciju i vremenom preovlauju jedinke sa ne-
migratornim naslednim predispozicijama-stopa migracije e evoluirati u pravcu svog
-
smanjenja. Ako je imigracija intenzivnija od emigracije, to se moe deavati u malim
lokalnim populacijama koje se nalaze blizu velikih, vremenom e se proporcija jedinki sa
migratornim naslednim predispozicijama poveati u malim populacijama (Hanski, 1999).
U kontekstu uticaja stope migracije na dinamiku metapopulacije, vano je saznati
u kom obimu potencijalne evolutivne promene u stepenu pokretljivosti ili migratornosti
menjaju povezanost lokalnih populacija u sistemu. Na primer, ako izolovane populacije
imaju izuzetno nisku stopu migracije, one efektivno postaju izolovanije. Ako se stopa
migracije dodatno povea u sistemu ve dobro povezanih lokalnih populacija, one e
postati bolje povezane.
Da bi pozitivna stopa migracije evoluirala u hipotetikoj metapopulaciji gde nema
izumiranja i promene veliine lokalnih populacija, ali sama migracija ima cenu i/ili
postoje konstantne razlike u kvalitetu fragmenata stanita i tako i u veliinama lokalnih
populacija, mora postojati neki mehanizam koji poveava adaptivnu vrednost migranata
na primer, vremensko variranje veliina populacija i adaptivnih vrednosti jedinki.
Verovatnoa da e migrant naseliti prazan fragment stanita i verovatnoa da e naseliti
malu populaciju koja ima predispozicije da u bliskoj budunosti postane velika, u znatnoj
meri odreuju njegovu oekivanu adaptivnu vrednost (Hanski, 1999).
Za oekivati je da selekcija u metapopulaciji paralelno deluje na dva nivoa na
osobine ivotne istorije, odnosno komponente adaptivne vrednosti, od kojih je jedna i
stopa migracije: a. selekcija unutar lokalnih populacija; b. selekcija lokalnih populacija.
Uestalost alela koji favorizuju migratornost vremenom e se smanjiti na lokalnom
nivou, ali ako posmatramo metapopulacioni nivo, ukupna stopa migracije (na nivou
metapopulacije) e se poveati. Problem fragmentacije stanita jeste u tome to ona
poveava cenu migracije (rizik od uginua tokom migracije), i na taj nain i relativnu
jainu unutarpopulacione selekcije protiv migratornih alela. Meutim, smanjena veliina
populacija poveava intenzitet njihovog izumiranja, to e poveati variranje adaptivne
vrednosti u buduem vremenu, a to e doprineti selekciji za odravanje ili poveanje
uestalosti migratornih alela na metapopulacionom nivou.
-
3.2. Genetika osnova i izumiranje lokalnih populacija
Uticaj evolucionih faktora na metapopulacionu dinamiku jo uvek je nedovoljno
istraen. Poznato je da je negativan efekat inbridinga karakteristian za male izolovane
elemente metapopulacije i da doprinosi njihovom izumiranju, pre svega putem smanjenja
genetike varijabilnosti za osobine ivotne istorije. Na primer, nakon samo jedne
generacije ukrtanja u drugom stepenu srodstva (braa i sestre) u lokalnoj populaciji
leptira Melitaea cinxia, stopa izleganja jaja smanjila se za 30% (Saccheri i sar., 1998).
Hanski (1999) smatra da, ponekad, ak i snana selekcija protiv tetnih recesivnih alela
ne moe dovesti do takozvanog genetikog proiavanja ako su u pitanju veoma male
lokalne populacije, verovatno zbog velike verovatnoe fiksiranja alela sa ne tako jakim
tetnim efektima i zbog protoka gena izmeu lokalnih populacija.
U udbenicima evolucione biologije esto se pominje da su male populacije pod
veim rizikom od izumiranja jer u njima genetiki drift ima predominantnu ulogu, tj
deluje jae od prirodne selekcije, pa te sluajne promene uestalosti alela mogu poveati
stopu inbridinga u populaciji kroz gubitak alelske raznovrsnosti, naroito ako su aleli u
populaciji zastupljeni sa malom uestalou. Predstaviemo ovaj mehanizam detaljnije,
pomou termina varijansna efektivna veliina populacije (eng. variance-effective
population size). Ovu efektivnu veliinu populacije matematiki je definisao Holdejn
(Haldane, 1939) kao
Ne(v) = 4N/(Vk+2),
gde je N veliina populacije dobijena cenzusom, a Vk varijansa broja gameta koje
proizvede roditeljska generacija.
Krou i Kimura (Crow i Kimura, 1970) predstavili su varijansnu efektivnu veliinu
populacije jednainom:
Ne(v) = (Nk-k)/(1 +Vk/k),
gde je N veliina roditeljske populacije, k je srednja vrednost broja potomaka
proizvedenih po jedinki, a Vk populaciona varijansa broja potomaka proizvedenih po
jedinki.
-
Kada je reproduktivni uspeh jedinki sluajan i veliina populacije ne varira, Vk = k =2 i
Ne(v) = N. Meutim, u realnim populacijama, Ne(v) < N, zbog variranja odnosa polova u
populaciji kao i variranja reproduktivnog uspeha izmeu jedinki istog pola.
Dakle, na varijansnu efektivnu veliinu populacije utie sama veliina populacije i
reproduktivni uspeh jedinki, tako da je ona pouzdan parametar za utvrivanje efekta
uskog grla (jaina uticaja genetikog drifta zavisi direktno od broja potomaka koji
formiraju populaciju nakon uskog grla).
Kada posmatramo jednu metapopulaciju i njenu efektivnu veliinu kao merilo
evolutivnog potencijala, ona moe biti ugroena bilo smanjenjem veliine metapopulacije
kroz izumiranje njenih pojedinanih elemenata i/ili poveanjem varijanse broja potomaka
izmeu porodica. Treba pomenuti i uticaj obrta populacije, to se u ovom sluaju odnosi
na brzinu i intenzitet izumiranja pojedinanih elemenata metapopulacionog sistema, a taj
uticaj je utoliko vei ukoliko su lokalne populacije koje iezavaju vee, jer e se desiti
redukcija ukupne genetike varijabilnosti metapopulacije u procesu metapopulacione
dinamike, lokalne populacije e biti obnovljene od strane imigranata, ali e te osnivake
propagule na poetku biti male, te e i njihove lokalne efektivne veliine biti male, a ako
sve jedinke dolaze iz iste populacije, vea je verovatnoa da e smanjenje genetike
varijabilnosti populacije biti vee nego kada bi propagula bila sastavljena od jedinki iz
razliitih lokalnih populacija.
Ako je protok gena (izraen kroz m) mnogo manji od 1, proces
izumiranja/obnavljanja rezultirae poveanjem meupopulacione genetike
diferencijacije na nivou metapopulacije pod sledeim uslovom (Whitlock i McCauley,
1990):
k
-
obrtom populacija, stopa protoka gena ima visoke vrednosti, tako da su vrednosti FST koeficijenta veoma male i nema genetike strukturiranosti (Slatkin, 1985). Poveanje
genetike strukturiranosti usled procesa iezavanja i obnavljanja lokalnih populacija
karakteristino je, pre svega, za biljke, jer se kod njih ee deava da je k
-
vremenu i prostoru, dovodi do bolje adaptiranosti ili iezavanja pojedinih lokalnih
populacija. Rajtov populacioni model u mnogome podsea na metapopulacioni jer
opisuje skup lokalnih populacija koje, zbog svoje ograniene veliine i predominantnog
delovanja genetikog drifta, mogu brzo ieznuti. Njihove genetike strukture tj tipovi i
uestalosti alela uglavnom se menjaju putem genetikog drifta (faza 1.), ali dobitna
kombinacija tj koadaptirane genske kombinacije sa najviom adaptivnom vrednou,
kada preovladaju u demama usled delovanja prirodne selekcije (faza 2.) poinju da se ire
migracijom odnosno protokom gena tako da preplavljuju ostale deme. Tako itav
sistem polako napreduje ka adaptivnom vrhu, tj stanju u kome biva dostignuta
maksimalna adaptivna vrednost (faza 3.) (detaljno u Tuci, 2003). Ono to je zanimljivo
i kontroverzno u ovoj teoriji je faza 3., jer Rajt navodi (i matematiki objanjava) da
razliite genske kombinacije mogu imati istu adaptivnu vrednost te, stoga, u razliitim
demama mogu preovlaivati razliiti genotipovi, odnosno u jednom sklopu sredinskih
varijabli nekoliko razliitih genotipova mogu imati maksimalnu adaptivnu vrednost.
Kako i da li oni realno mogu da izvedu meusobno takmienje i zaposedanje tue
teritorije, zavisi od stope migracije, prosene adpativne vrednosti populacije u
adaptivnoj dolini (detaljno u: Tuci, 2003) i uticaju koji protok gena vri na genetiku
strukturu date populacije. Snaan protok gena spreie pomeranje vrha tj ve samo
jedan migrant po generaciji spreie retke genotipove koji su formirali adaptivni vrh u
pojedinim lokalnim populacijama da se ire dalje putem migracije jer e protokom gena
njih okupirati najuspeniji genotipovi iz populacija koje su na neto niem adaptivnom
vrhu, ali su brojnije. Takoe, u realnim metapopulacijama protok gena nije homogen
izmeu nekih fragmenata je intenzivniji u odnosu na druge, a sve se to opet menja u
vremenu.Takozvana pomeranja areala (eng. range shifts), od kojih su najpoznatija
ona iz perioda pleistocenskih glacijacija, predstavljaju ilustraciju faze tri procesa pomine
ravnotee.
Primena Rajtovog modela pomine ravnotee ogleda se u interpretaciji intenziteta
autbredne depresije (eng. outbreed depression) izmeu lokalnih populacija koje se
nalaze u razliitim delovima areala vrste. Ovaj fenomen utvren je kod nekih vrsta
(Simberloff, 1988; Hanski, 1999) kao pad adaptivne vrednosti, najee u F2 generaciji
potomaka nastalih ukrtanjem jedinki iz udaljenih populacija. Objanjenje je da su, zbog
-
razliitih sredinskih uslova, koadaptirane genske kombinacije sa najveom adaptivnom
vrednou u tim populacijama razliite, tj nivo meupopulacione genetike
diferencijacije je visok, tako da nove genetike kombinacije u poetku imaju manju
adaptivnu vrednost.
3.4. Rajtov ostrvski model populacione strukture kao primer dinamike efektivne
veliine populacije na metapopulacionom nivou
Metapopulacija je samo jedan od naina organizacije tj komunikacije lokalnih
populacija u nekom prostoru i ovim modelom moe biti obuhvaen ukupan areal vrste ili
samo jedan njegov deo. U evolucionoj biologiji, nivo genetike komunikacije izmeu
lokalnih populacija nazivamo populacionom strukturom. Prilikom opisivanja populacione
strukture od presudnog znaaja za stepen strukturiranosti jeste protok gena, od ijeg
intenziteta (izraava se brojem migranata po generaciji) zavisi da li e populaciona
struktura biti vie ili manje izraena. Ako su sve lokalne populacije meusobno povezane
intenzivnim protokom gena koji izjednaava lokalne uestalosti alela, onda za taj
analizirani skup populacija ne moemo rei da je strukturiran. Ako je protok gena
izuzetno mali i to se odraava kroz veliku meupopulacionu genetiku diferencijaciju,
skup je veoma strukturiran. U odnosu na intenzitet stope protoka gena koncipirani su i
osnovni teoretski modeli populacione strukture (vidi u: Tuci, 2003). Jedan od njih,
ostrvski model (Wright, 1931, 1932), podrazumeva skup lokalnih populacija izmeu
kojih postoji protok gena toliko malog intenziteta da meusobna razdaljina izmeu
populacija nema znaajnog uticaja na njega. Meutim, Rajt ne precizira da su te lokalne
populacije podlone estom izumiranju i potonjoj rekolonizaciji, navodi kao jedan od
sigurnih pokazatelja ostrvskog modela populacione strukture stopu protoka gena (Nm)
manju od 1 i, zbog toga, stepen meupopulacione genetike diferencijacije (FST) vei od
0.20, odnosno nezavisno delovanje evolucionih faktora u svakoj lokalnoj populaciji.
Dinamika izumiranja i obnavljanja lokalnih populacija trebalo bi da smanjuje
ukupnu genetiku varijabilnost metapopulacije, jer svaka rekolonizacija podrazumeva
formiranje propagule koja je, najverovatnije, manje veliine od prethodno izumrle
populacije, i, shodno tome, sa smanjenim nivoom genetike varijabilnosti. Meutim, u
metapopulacijama pojavljuje se kombinovani efekat protoka gena i
-
izumiranja/obnavljanja lokalnih populacija na stepen meupopulacione genetike
diferencijacije.
Rajt (Wright, 1943) je definisao efektivnu veliinu metapopulacije koja se sastoji
od idealnih n subpopulacija u kojima je Ne = N, kao
NeT NT/(1- FST),
gde je NT = nN, tj ukupan broj jedinki u metapopulaciji. Ova jednaina ukazuje da, kada
je FST > 0, i, naravno, kada nema izumiranja i rekolonizacije lokalnih populacija nego je
njihova veliina i broj konstantan i svaka od njih podjednako doprinosi ukupnom pulu
migranata, onda je NeT > NT , to ilustruje kompleksne naine na koje mnogi faktori mogu
uticati na odnos izmeu efektivne veliine lokalnih populacija i metapopulacije u celini
(pod datim uslovima, fragmentacija doprinosi efektivnom poveanju metapopulacije, jer
vremenom u razliitim subpopulacijama bivaju fiksirani razliiti aleli i genetika
varijabilnost lokalnih populacija opada, ali ona biva ouvana na nivou metapopulacije). U
ravnotenom stanju, kada je FST 1/(1 + 4Nem), onda je
NeT/NT 1 + 1/4Nem .
Kada se NT ne menja, efektivna veliina metapopulacije raste sa svakim narednim
smanjenjem stope migracije unutar metapopulacije, jer sve vie i vie geneike
varijabilnosti biva zamrznuto u izolovanim lokalnim populacijama.
Da li je ovakav scenario mogu? U uslovima gde su pogodni fragmenti stanita izrazito
izolovani, njihov kapacitet sredine podjednak, i ako lokalna regulacija populacije odrava
veliinu populacije stabilnom, fragmentacija moe ograniiti varijansu reproduktivnog
uspeha i tako voditi ka veoj NeT . Isti efekat mogu imati specifini dizajn rezervata
prirode i programi uzgajanja u zatoenitvu, putem izjednaavanja eproduktivnog uspeha
u subpopulacijama. Naravno, mnogo je realnija situacija gde fragmentacija smanjuje
efektivnu veliinu metapopulacije (Waples, 2002).
-
Ako subpopulacije variraju u svojim stopama migracije, broju migranata i produktivnosti
(parametar P predstavlja varijansu produktivnosti subpopulacija) po Vitloku i Bartonu
(Whitlock i Barton, 1997)
NeT NT/((1+P)(1- FST) + NPFSTn/(n-1)) .
Ako je P=0, onda NeT NT/(1- FST). Ako je FST =0, onda NeT NT/(1+P). Ova
poslednja jednaina je zanimljiva jer ilustruje da fragmentacija metapopulacije, ak iako
nema genetike diferencijacije, utie na smanjenje efektivne veliine populacije zbog
postojanja varijanse produktivnosti subpopulacija (P>0).
Nani (Nunney, 1999) je koncipirao slian model, ali sa tzv. interdemnim
genetikim driftom (variranje produktivnosti subpopulacija i tako i doprinosa skupu
migranata) generisanim nakupljanjem sluajnih razlika u reproduktivnom uspehu izmeu
jedinki i pretpostavljenim inbridingom unutar subpopulacija, izraenim preko FIS
koeficijenta:
NeT NT/((1+ FIS)(1+ FST) - 2 FIS FST).
Ako je ukrtanje unutar subpopulacija po principu sluajnosti, tj FIS =0, onda je
NeT NT/(1+ FST),
to je upravo suprotno Rajtovom modelu, gde je NeT NT/(1- FST).
Proces izumiranja/rekolonizacije moe drastino da umanji efektivnu
veliinu metapopulacije, naroito ako je broj naseljenih fragmenata stanita tako mali da
je metapopulacija u opasnosti od izumiranja. Ako je varijansa produktivnosti
metapopulacije rezultat izumiranja i rekolonizacije subpopulacija, odnos izmeu
efektivne veliine metapopulacije i koeficijenta meupopulacione genetike
diferencijacije bie
NeT n/4(m+e)FST.
-
U ovakvom modelu, efektivna veliina metapopulacije bie proporcionalna broju
subpopulacija (n), a ne veliini subpopulacije (N) ili ukupnoj veliini metapopulacije
(NT).