laboratoire dÉcologie microbienne de la rhizosphère « et denvironnements extrêmes » (lemir « e...
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Laboratoire d’Écologie Microbienne de la Rhizosphère Laboratoire d’Écologie Microbienne de la Rhizosphère
« et d’Environnements extrêmes »« et d’Environnements extrêmes »(LEMiR « E »)(LEMiR « E »)
Personnel permanent
Chercheurs
ACHOUAK Wafa
BALESDENT Jérôme
BERGE Odile
CHAPON Virginie
HEULIN Thierry
SANTAELLA Catherine
ITA
BARAKAT Mohamed (IR)
BRUTESCO Catherine (TS)
BRANDELET Géraldine (T)
CONROD Sandrine (T)
DE LUCA Gille (IR)
MAROL Christine (I)
ROBERT Sylvie (IE)
Thésards
DERRIEN Delphine
GOMMAUX Maxime
HAICHAR Feth-El-Zahar
PROFIZI Camille
Post-Docs
CHANAL Angélique
DE GROOT Arjan
NERCESSIAN Olivier
SANCHEZ Lisa
DEAMARCON Estelle
Programme toxicologie nucléaire-EProgramme toxicologie nucléaire-E
TRANSPLAMTRANSPLAM(Cd, Zn)(Cd, Zn)
TOXICOGENOMICSTOXICOGENOMICS(Cd, U)(Cd, U)
RÉSISTANCE DES RÉSISTANCE DES BACTÉRIESBACTÉRIES
(Se, U)(Se, U)
Pseudommonas brassicacearumPseudommonas brassicacearum
Stenotrophomonas maltophiliaStenotrophomonas maltophilia
Ligation of DNA fragments in pGEMT
Electrotransformation
White/bleue screen
pGemT
E. coli DH5,
Plates LA-amp
Microplates growth and conservation
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 A
BC
DE
FG
H
A Digestion by S1 nuclease PCR cycle using Taq polymerase
AA
AA
A
DNA extraction (strain NFM421)
Ultrasound DNA fragmentation
0.5- 2 kb
2 Kb
Sub-WP2.1: Construction of small fragment genomic librarie and genomic microarrays of Pseudomonas brassicacearum NFM
421
12 000 clones
7 107 clones
Analysis and identification of modulated genes
R > 2 or < 0.5 Statistic Analysis of data
Fragment sequencing
Sequence homology
Banque de séquences
ATGCTCCATTCGGAATCGATTTACTCGCTATA
Gene identificationMetabolic pathway
+-
II
Ammoniamonoxygenase
amoA
NH3
METABOLISME DE L’AZOTE
hydroxylamine
H2O
NO2-
(nitrite)
4H,H +
H+
ATP
Nitrate reductase
nosF copper processing,
ATP/GTP binding protein
Denitrification
H+
Drug
AcrA like protein
Resistance-Nodulation-Division efflux system (RND)
OprB like protein
Glucosecarbohydrates
Carbohydrate-selective porin H+
Drug
OprM like protein
Membrane efflux Protein (OEP)
Na+/H+ antiporter
Na+
Major FacilitatorSuperfamily (MFS)
ara
H+
Putative arabinose-proton
symporter
Small solutes
H+, Pi
Putative MFS
H+, Pi
ATP
Ferrichrome or CopperABC transporter
Putative Transmenbrane oxidoreductase
PbD sequestration protein
ATP
T
AB
C
Pb(II)D
Pb(II)
Pb(II)
ATP
ABC transporteur
NAD
NADP
ADP
ATP NAD kinase
NADPphosphatase
P
H2O
NADPH
NADH
Pyridine nt transhydrogenase
PntA
H+
H+
Metabolisme des nicotinate et nicotinamide
HJKMN
BCDI
3FeS
EFG
5FeS
NADHNAD+
Q
QH2
FMN
H+2H+
METABOLISME ENERGETIQUE
NuoG et NuoLNADH dehydrogenase
ATP synthase F1, γ su atpG
ATP
H+
OmpA like protein
Porine
OprE like protein
OprL Peptidoglycan- associated lipoprotein
Macromolecules
OM integrity Growth in low osmolarity
FliCflagellinlikeprotein
FlgC flagellar- basal body rod
protein
Surface adhesion protein
Mobilitt
é et adh
ésion - L lys tRNA -D lysine
Diaminopimelate epimerasedapF
Diaminopimelate decarboxylaselysA
-L lysine
BIOSYNTHESE DE LA
LYSINE
-L aspartate 2.3-dihydrodipicolinate -N acetyl- -2-L amino-6-oxopimelate
-N succinyl-2-amino6-oxopimelate
-N succinyl- -2 .6-L diaminopimelate
2.6-diaminopimelate
Meso-2 .6-diaminopimelate
Biosynthè sepepidoglycan
Cholest-4- -3-en one
CholesterolO2
H2O2
Cholesteroloxidase
Mé tabolisme des lipides
-3-UDP acylN-acetylglucosamine
DeacetylaselpxC
-3- -(3 )-UDP O hydroxite teradecanoyl) -Dglucosamine
- - -UDP N D acetylglucosamine
-3- -(3 -UDP O OH teradecanoyl) -Nacetylglucosamine
-3- -(3 -UDP O OH teradecanoyl) -DglucosamineLpxD
Lipide Adissacharide
BIOSYNTHESE DES LIPOPOLYSACCHARIDES
sedoheptulose
- -ADP L glycero- -Dmanno-heptose-ADP heptose--LPS
heptosyltransferaseIIwaaF
…(KDO2)(Hep1)- Lipide A
-3-CMP deoxy--D mannotulonate
…(KDO2)… lipide AKdtA
…(KDO2)(hep1) … lipide A
…(KDO2)(hep1) )(gal1-6) … lipide A
WaaG
WaaY
WaaP
WaaQ
WaaB
WaaA
LpxL
WaaC
Mé tabolisme des sucres aminés
Lipopolysaccharidemature
WbpD: -UDP2 3 3 3 -Man NAc NAC NAc N
acetyltransferase
WbpG:aminotransferase
Biosynthè se du LPS(hétéropolymè re de di à
pentasaccharides= - B Band )LPS
Organic solvanttolerance protein OstA/ Imp
Biosynthè se de l’enveloppe et division cellulaire
mraZ familly proteinOstA
Quinoprotein ethanol DH
Acetaldéhyde
AcetaldehydeDHAcetate
+NADH H +
ethanol
2H ++2e
Acetyl CoAtransferase
3- oxoacyl-( ) ACP
synthaseIII
HexadecanoateBiosynthè se
des acides gras
Acetyl-( )ACP
Aceto-acetyl-( )ACP
Malonyl-CoA
Malonyl-( )ACP
Acetyl CoA
-P dol -Man GDP
Manβ- -P dol
-N glycan
Mé tabolismes du fructose et du mannose
Dolichol- -P mannosyl transferase
1dpm
-L tyrosine
Hydroxyphenylpyruvatedioxygenase
4-hydroxyphenyLpyruvate
homogentisate
maleylacetoacetate
fumarylacetoacetate
acetoacetatefumarate
Tyr aminotransferase
DEGRADATION DE LA TYROSINE
Phenol
Dé gradation des acides grasà chainecourteDé gradation de la lysine
Fermentation
Cycle duglyoxylate
2- aminomuconic6-semialdehyde
4- hydroxy2- oxovaleric acid
2- aminomuconicacid semialdehyde DH AmnC
2-amino-phenol
2- aminomuconic acid
4- oxalo crotonic acid
2- oxopent4- enoic acid
Pyruvic acidAcetaldehyde
AcetylCoA
AmnBA
AmnD
AmnE
AmnF
AmnG
AmnH
DEGRADATION DES COMPOSES PHENOL
Mé tabolisme dupropanoate
Dé gradation de la lysine
Mé tabolisme des acides gras
Mé tabolisme du tryptophane
TCA
Succinyl CoA
sucD
Isocitrate
oxalosuccinate
cétoglutarate
succinate
Acide fumarique
Acide malique
aconitase
Isocitrate
dehydrogenase
Isocitrate dehydrogenase
Cetoglutarate
dehydrogenase Succinyl CoA
synthetase
Succinatedehydrogenase
fumarase
Malate quinoneoxidoreductase
mqo
2H
CO2
CoASH
CO2, 2H
+ GDP PiGTPCoASH
2H
H2O
2H
Mé tabolisme dubutanoate
Mé tabolisme de l’ alanine et del’aspartate
Mé 5tabolisme des acides dibasiques en C
Biosynthè se et dé gradation des composé s cétones
CoASH
citrate
Oxaloacetate Citratesynthase
Mé tabolisme des nucléotides
Interconversionsdes pentoses etglucuronates
Mé tabolisme eté pargne des sucres
-6-Glucose P
-1-Glucose P
Glyceraladhehyde-3-P
Glycerate-2-P
Pyruvate
PEP
Acetyl CoA-L lactate
Cycle des pentoses phosphate -6Fructose P
MltK, ATP bindingsu
MltZFructokinase
ATP
E F GK
MannitolGlucitol
Fructose
,Transport du mannitol arabitol and glucitolmtl
DÉ GRADATION DU BENZOATE
3-hydroxypimeloyl-coA
Benzoyl-CoA
2-cétocyclohexane1-carboxyl-coA
6- -2-oxo hydroxycyclohexane
1-carboxyl-coAAcyl- CoA
thioesté rase II
Pimeloyl-coA
Mé tabolisme de la phénylalanine
Dé gradation del’é thyl benzène
Ré sistance au nickel (opé ronnreAB)
NreA protein
Ré gulateur transcriptionnel GntR
Opé ron glutamate
Utilisation de l’histidine
Ré pression de la dé gradation des acides gras
Short chain DH Hypothetical /serin thré onine kinase
-N acetyl transferase Probable sensor histidine kinase Molybdopterine oxidoreductase
(COLD SHOCK PROTEINSDnaK, CspA)
TRANSCRIPTION ET TRADUCTION
( -3)Facteurs initiation de la traduction IFProteines ribosomales ( 1 , 11)L S
-Histone like protein(HupN) DNA methyltransferase
DNA primaseTransposase
QQQQQQQQQ™ QQ QQ QQQQQQQQQQQQQQQQ QQQQ QQQQQQ QQQQ QQQQQQQQQQ
QQQQQ QQQQQ.
30% de proté ines inconnues
Biosynthè se de l’histidine
1 -Dmyo-inositol-1P
1 -Dmyo-inositol-1 .3 .4 .5P
1-phosphatidyl-1 -D myo-inositol-4 .5biP
Phosphatidyl-1 -D myo-inositol
1-Phosphatidyl-1 -Dmyo-inositol-4 .5biP
Phosphatidyl inositol4- -5-P kinase
( 5 )PiP K
Inositol 1.2 .4 .5 .6 P
METABOLISME DU PHOSPHATE INOSITOL
Substrat ox Substrat red
NADP++NADPH H+TrxR
Proteine-S 2Proteine-( )SH 2
TrxR -( )SH 2TrxR -S 2
ThioredoxinetrxA
Biosynthè se des nt purines et pyrimidines
Voie d’ assimilation du sulfate
Voie desthioredoxines
Mé tabolisme duglyoxylate
OSMOREGULATION
Phosphatidylcholine
Phosphorylcholine
choline
Betain aldehyde
GlycineBetain
Dimethylglycine
MethylglycineSARCOSINE
glycine
-L serine
tRNA gly
Sarcosine oxidasesoxA
Mé tabolisme dessphingoglycolipides
Mé tabolisme du méthane
Mé tabolisme du soufre
. P C
Phosphorylcho . .P
Cho. , DH betA
Betain aldehydeDHbetB
B HMT
DMGO
SHMT
Mé tabolisme des purines
Biosynthè se LPS
-L proline -D proline
Prolineracemase
Ornithinecyclodeaminase
5-aminopentanoate
Dihydrolipoamide
dihydrolipoate-Dproline reductase
-L ornithine
DEGRADATION DE L’ORNITHINE
BIOSYNTHESE DES POLYAMINES
agmatine
aguB
-L arginine
ornithine
glutamate
speA
-N acetylPutrescine
CO2
Putrescine
-N carbamoyl putrescine
NH 4
Decarboxylated-S adenosylmethionine
dSAM
-S adenosylmethionineSAM
spermidine
aguA
AgmatinasespeB
speE
speD
CO2 + NH4 +
Spermidine-N acetyl transferase
speG
Urée
speC
acetate
PRPP
BIOSYNTHESE DES PURINES
ARN
ADN
ARN
ADN
GDP GTPATP
dGTPdATP
IMP XMP GMPAMPADP
adenosine inosine xanthosineguanosine
adenine hypoxanthine xanthine guanine
-5Ribose P
Ribosylamine-5P
-L glutamine
1-(5’ )phosphoribosyl-N formylglycinamide
FGAM
1-(5’ )phosphoribosyl5- aminoimidazole( )AIR
5 ’phosphoribosyl4-carboxy-5- aminoimidazole( )CAIR
AICAR
Phosphoribosyl Aminoimidazole mutasepurE
Phosphoribosyl aminoimidazole
carboxylasepurK
N5 -CAIR
purE
ATPHCO3
-
ADP
Experiments in triplicates
Dye swap
+-
II
Biosynthèse LPS
L-proline D-proline
Proline racemase
Ornithine cyclodeaminase
5-aminopentanoate
Dihydrolipoamide
dihydrolipoateD-proline reductase
L-ornithine
DEGRADATION DE L’ORNITHINE
BIOSYNTHESE DES POLYAMINES
agmatine
aguB
L-arginine
ornithine
glutamate
speA
N-acetyl Putrescine
CO2
Putrescine
N-carbamoylputrescine
NH4
Decarboxylated S-adenosylmethionine
dSAM
S-adenosylmethionineSAM
spermidine
aguA
Agmatinase speB
speE
speD
CO2 + NH4+
Spermidine N-acetyl transferase
speG
Urée
speC
acetate
H+
ATP
Nitrate reductase
nosF copper processing,
ATP/GTP binding protein
Denitrification
H+
Drug
AcrA like protein
Resistance-Nodulation-Division efflux system (RND)
OprB like protein
Glucosecarbohydrates
Carbohydrate-selective porin H+
Drug
OprM like protein
Membrane efflux Protein (OEP)
Na+/H+ antiporter
Na+
Major Facilitator Superfamily (MFS)
ara
H+
Putative arabinose-proton
symporter
Small solutes
H+, Pi
Putative MFS
H+, Pi
ATP
Ferrichrome or CopperABC transporter
Putative Transmenbrane oxidoreductase
PbD sequestration protein
ATP
T
AB
C
Pb(II)D
Pb(II)
Pb(II)
ATPABC transporteur
NAD
NADP
ADP
ATP NAD kinase
NADPphosphatase
P
H2O
NADPH
NADH
Pyridine nt transhydrogenase
PntA
H+
H+
Metabolisme des nicotinate et nicotinamide
HJKMN
BCDI
3FeS
EFG
5FeS
NADHNAD+
Q
QH2
FMN
H+2H+
METABOLISME ENERGETIQUE
NuoG et NuoLNADH dehydrogenase
ATP synthase F1, γ su atpG
ATP
H+
OmpA like protein
Porine
OprElike protein
OprL Peptidoglycan-associated lipoprotein
Macromolecules
OM integrity Growth in low osmolarity
FliC flagellin like protein
FlgC flagellar basal-body rod protein
Surfaceadhesion protein
Mob
ilitt
é et
adh
ésio
n
Métabolisme du glyoxylate
OSMOREGULATION
Phosphatidyl choline
Phosphoryl choline
choline
Betain aldehyde
Glycine Betain
Dimethylglycine
MethylglycineSARCOSINE
glycine
L-serine
tRNA gly
Sarcosine oxidase soxA
Métabolisme des sphingoglycolipides
Métabolisme du méthane
Métabolisme du soufre
P. C
Phosphorylcho. P.
Cho. DH, betA
Betain aldehyde DH betB
B HMT
DMGO
SHMT
Métabolisme des purines
2-aminomuconic 6-semialdehyde
4-hydroxy 2-oxovaleric acid
2-aminomuconicacid semialdehyde DH AmnC
2-amino-phenol
2-aminomuconic acid
4-oxalo crotonic acid
2-oxopent 4-enoic acid
Pyruvic acidAcetaldehyde
AcetylCoA
AmnBA
AmnD
AmnE
AmnF
AmnG
AmnH
DEGRADATION DESCOMPOSES PHENOL
P-dol Man-GDP
Manβ-P-dol
N-glycan
Métabolismes du fructose et du mannose
Dolichol-P-mannosyl transferase
dpm1
Quinoprotein ethanol DH
Acetaldéhyde
Acetaldehyde DHAcetate
NADH+H+
ethanol
2H++2e
Acetyl CoA transferase
3-oxoacyl-(ACP)
synthase III
HexadecanoateBiosynthèse
des acides gras
Acetyl-(ACP)
Aceto-acetyl-(ACP)
Malonyl-CoA
Malonyl-(ACP)
Acetyl CoA
1D-myo-inositol-1P
1D-myo-inositol-1.3.4.5P
1-phosphatidyl-1D-myo-inositol-4.5biP
Phosphatidyl-1D-myo-inositol
1-Phosphatidyl-1D-myo-inositol-4.5biP
Phosphatidyl inositol4-P-5-kinase
(PiP5K)
Inositol 1.2.4.5.6P
METABOLISME DU PHOSPHATE INOSITOL
Métabolisme du propanoate
Dégradation de la lysine
Métabolisme des acides gras
Métabolisme du tryptophane
TCA
Succinyl CoA
sucD
Isocitrate
oxalosuccinate
cétoglutarate
succinate
Acide fumarique
Acide malique
aconitase
Isocitrate dehydrogenase
Isocitrate dehydrogenase
Cetoglutarate dehydrogenaseSuccinyl CoA
synthetase
Succinate dehydrogenase
fumarase
Malate quinone oxidoreductase
mqo
2H
CO2
CoASH
CO2, 2H
GDP + PiGTPCoASH
2H
H2O
2H
Métabolisme du butanoate
Métabolisme de l’alanine et de l’aspartate
Métabolisme des acides dibasiques en C5
Biosynthèse et dégradation des composés cétones
CoASH
citrate
Oxaloacetate Citrate synthase
Métabolisme des nucléotides
Interconversions des pentoses et glucuronates
Métabolisme et épargne des sucres
Glucose-6-P
Glucose-1-P
Glyceraladhehyde-3-P
Glycerate-2-P
Pyruvate
PEP
Acetyl CoAL-lactate
Cycle des pentoses phosphate Fructose-6P
MltK, ATP binding su
MltZFructokinase
ATP
E
F G
K
MannitolGlucitol
Fructose
Transport du mannitol, arabitol and glucitol mtl
DÉGRADATION DU BENZOATE
3-hydroxypimeloyl-coA
Benzoyl-CoA
2-cétocyclohexane1-carboxyl-coA
6-oxo-2-hydroxycyclohexane
1-carboxyl-coAAcyl-CoA
thioestérase II
Pimeloyl-coA
Métabolisme de la phénylalanine
Dégradation de l’éthyl benzène
Substrat ox Substrat red
NADP+NADPH+H+TrxR
Proteine-S2Proteine-(SH)2
TrxR-(SH)2TrxR-S2
Thioredoxine
trxA
Biosynthèse des nt purines et pyrimidines
Voie d’assimilation du sulfate
Voie des thioredoxines
PRPP
BIOSYNTHESE DES PURINES
ARN
ADN
ARN
ADN
GDP GTPATP
dGTPdATP
IMP XMP GMPAMPADP
adenosine inosine xanthosine guanosine
adenine hypoxanthine xanthine guanine
Ribose-5P
Ribosylamine-5P
L-glutamine
1-(5’phosphoribosyl)N-formylglycinamide
FGAM
1-(5’phosphoribosyl)5-aminoimidazole (AIR)
5’phosphoribosyl4-carboxy-5-aminoimidazole (CAIR)
AICAR
Phosphoribosyl Aminoimidazole mutase purE
Phosphoribosyl aminoimidazole
carboxylasepurK
N5-CAIR
purE
ATPHCO3
-
ADP
L-lys tRNA
L-tyrosine
Hydroxyphenylpyruvate dioxygenase
4-hydroxyphenyLpyruvate
homogentisate
maleylacetoacetate
fumarylacetoacetate
acetoacetate fumarate
Tyr amino transferase
DEGRADATION DE LA TYROSINE
Phenol
Dégradation des acides gras à chaine courteDégradation de la lysine
Fermentation
Cycle du glyoxylate
D-lysine
Diaminopimelate epimerase dapF
Diaminopimelate decarboxylase lysA
L-lysine
BIOSYNTHESE DE LA LYSINE
L-aspartate 2.3-dihydrodipicolinate N-acetyl-L-2-amino-6-oxopimelate
N-succinyl-2-amino6-oxopimelate N-succinyl-L-2.6-diamino
pimelate
2.6-diaminopimelate
Meso-2.6-diaminopimelate
Biosynthèse pepidoglycan
Cholest-4-en-3-one
CholesterolO2
H2O2
Cholesterol oxidase
Métabolisme des lipides
UDP-3-acylN-acetylglucosamine Deacetylase lpxC
UDP-3-O-(3hydroxite)-teradecanoyl) D-glucosamine
UDP-N-D-acetylglucosamine
UDP-3-O-(3OH-teradecanoyl)N-acetylglucosamine
UDP-3-O-(3OH-teradecanoyl) D-glucosamine
LpxD
Lipide A dissacharide
BIOSYNTHESE DES LIPOPOLYSACCHARIDES
sedoheptulose
ADP-L-glycero-D-manno-heptose
ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II
waaF
…(KDO2)(Hep1)-Lipide A
CMP-3-deoxy-D-mannotulonate
…(KDO2)…lipide AKdtA
…(KDO2)(hep1) …lipide A
…(KDO2)(hep1) )(gal1-6) …lipide A
WaaGWaaYWaaPWaaQWaaB
WaaALpxLWaaC
Métabolisme des sucres aminés
Lipopolysaccharide mature
WbpD: UDP-Man2NAc3NAC3NAc3N-acetyltransferase
WbpG: aminotransferase
Biosynthèse du LPS (hétéropolymère de di à
pentasaccharides = B- Band LPS)
Organic solvant tolerance protein
OstA/Imp
Biosynthèse de l’enveloppe et division cellulaire
mraZ familly protein
OstA
Ammonia monoxygenase
amoA
NH3
METABOLISME DE L’AZOTE
hydroxylamine
H2O
NO2-
(nitrite)
4H,H+
Résistance au nickel (opéron nreAB)
NreA protein
Régulateur transcriptionnel GntR
Opéron glutamate
Utilisation de l’histidine
Répression de la dégradation des acides gras
Short chain DH Hypothetical serin/thréonine kinase
N-acetyl transferase Probable sensor histidine kinaseMolybdopterine oxidoreductase
COLD SHOCK PROTEINS (DnaK, CspA)
TRANSCRIPTION ET TRADUCTION
Facteurs initiation de la traduction (IF-3)Proteines ribosomales (L1, S11)
Histone-like protein (HupN)DNA methyltransferase
DNA primaseTransposase
Polyamines Polyamines metabolismmetabolism
OsmoregulationOsmoregulation
Purines Purines biosynthesisbiosynthesis
TransportersTransporters
Unknown putative Unknown putative regulatorsregulators
LPS biosynthesis & LPS biosynthesis & motilitymotility
Peptidoglycan Peptidoglycan biosynthesisbiosynthesis
Lipids metabolismLipids metabolism
Oxidative Oxidative phosphorylationphosphorylation
Citric acid cycleCitric acid cycle
Stenotrophomonas maltophilia
Sélénites 10 mM
Tellurites 200 µg/ml
CdCl2 500 µM EDXESEM/MET
363 mmol/g cellules363 mmol/g cellules
≈ ≈ 4% de la biomasse cellulaire4% de la biomasse cellulaire
1 mM
ZnSO4
Apparition d ’un composé thiolé soluble de façon proportionnelle, et spécifique au Zn et au Cd (en cours de caractérisation)
cystéine, spécifique au cadmium
50 M
500 M
0
CdCl2
cys
Dosages en HPLC
Cd Co, Zn, Ni, Ag, Pb, Hg,
sélénites
Composés thiolés solubles cellulaires
SC777 TSA/10 Cd 500 µM
SC777 TSA/10
Métabolome des composés soufrés
0 1 2 3 4 5 6
Fonction de distribution radiale
R(Å)
CdS
CdCO
3
Cd-acétate
Cd-(OH)
2
TSA
LUM-
LUM+
paire atomique
Cd-O
paire atomique
Cd--Cd
paire atomique
Cd-S
Culture sur milieu solide + 500 Culture sur milieu solide + 500 M de CdClM de CdCl22
CdSCdS
Spéciation du cadmium
Sur milieu solide, la 1ère sphère de coordination du Cd est composée de 4 atomes de S à une distance de 2.53 Å qui correspond au CdSCdS
Sur milieu liquide 20% du Cd est sous forme de CdS et le reste sous forme
de Cd-O octaédrique
Formation de colonies jaunes en présence de Cd
TSA + 500 M de CdCl2TSA
Culture sur milieu liquide + 500 Culture sur milieu liquide + 500 M de CdClM de CdCl22
Culture sur milieu liquide + 500 Culture sur milieu liquide + 500 M de CdClM de CdCl22
Lumière continueLumière continue
Personnes impliquéesPersonnes impliquées
Jérome Rose (CNRS, CEREGE) : Spéciation du cadmium, analyses EXAFS, XANES
Christophe Junot (CEA, Sacay) : Caractérisation du composé thiolé par MS
Patrick Carrier (LEP, CEA) : Dosage du cadmium et autres par ICP optique
Stéphane Cuiné (LEP, CEA) : Analyse des composés thiolés solubles
Xavier Gidrol; Pascal Soularue (SGF, CEA Evry) : Production des puces à ADN
Laboratoire d’Écologie Microbienne de la Rhizosphère, DEVM
Delphine Pagès
Sandrine Conrod
Lisa Sanchez
Wafa Achouak