laboratorio agrobiotecnología centro de investigación
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Laboratorio AgrobiotecnologiacuteaCentro de Investigacioacuten Agropecuaria Divisa
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Axel Villalobos Calixto Guerra Beroy Rita Gonzaacutelez Herrera Joseacute Hernaacuten Campos
Sandra Sopalda Prince Yanelkys Barrera Gonzaacutelez Ricardo Hernaacutendez Rojas Arnulfo Gutieacuterrez Gutieacuterrez
Cafeacute cientiacuteficoAplicaciones de la biotecnologiacutea en la agricultura 24 de mayo 2018
Centro de Investigacioacuten Agropecuaria DivisaLaboratorio Agrobiotecnologiacutea
1987
Conservacioacuten de germoplasma
Micropropagacioacuten
Investigacioacuten
Conservacioacuten de germoplasma
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas (1989)
Colecciones
bull Camote (Ipomoea batatas) 17
bull Plaacutetano (Musa AAB) 8
bull Ntildeame (Dioscorea alata D trifida) 27
bull Papa (Solanum tuberosum) 97
bull Yuca (Manihot esculenta) 46
Zanya Aguilar Reyes Calixto Guerra Beroy Joseacute Hernaacuten Campos Ricardo Hernaacutendez Rojas Yanelkys Barrera Gonzaacutelez Arnulfo Gutieacuterrez Gutieacuterrez
Coacutedigo Nombre del cultivar
D1 Darieacuten
D2 JamaicaD3 Diamante 6322 D4 CocoD5 Criollo babosoD6 Cristal
D7 CabuyaD8 Mano de Tigre
D9 Blanco PeluacuteD10 LisoD11 EspinosoD12 GelatinaD13 Colorado Peludo
D14 Mulato ColoradoD15 Morado
Coacutedigo Nombre del cultivar
D16 PapaD17 NegroD18 Caballo O
D19 Paleta
D21 KabushaD22 Caballo R
D23 DulceD34 Dt ntildeampiacute blanco
D35 Dt ntildeampiacute morado
D38 AeacutereoD43 HBD44 SedaD46 Clon 94D50 CulebroD51 Monja
Coleccioacuten de Dioscorea sp
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
bull Rendimiento y adaptacioacuten Brasilentildea criolla
IDIAP Y1450-17 CG-1450-4
bull Materia seca (almidoacuten) IDIAP Y1505-17 MCol-1505
bull Uso agroindustrial (hojuelas) IDIAP Y523-174 CM-523-7
bull Betacarotenos Yema de huevo criolla
Coleccioacuten de yuca Variedades Origen
Introducidas del CIAT en 2009 liberadas en 2017
Camote biofortificado
alto contenido de betacarotenos
rendimiento superior a 30 T ha-1
bull IDIAP C03-17 CIP 1066031 piel rosada pulpa anaranjada
bull IDIAP C90-17 CIP 1060901 piel morada pulpa anaranjada
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
Micropropagacioacuten
Saneamiento(termoterapia +
meristemas )Micropropagacioacuten Aclimatacioacuten
Cultivo en casa de vegetacioacuten
Zanya Aguilar Reyes Calixto Guerra Beroy Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera Gonzaacutelez
Saneamiento Micropropagacioacuten AclimatacioacutenCultivo en casa de
vegetacioacuten
Meristemas plaacutentulas semilla
Micropropagacioacuten de papa
Micropropagacioacuten de ntildeame
Investigacioacutenbull Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
bull Caracterizacioacuten molecular
bull Identificacioacuten de genes (resistencia y otras caracteriacutesticas)
bull Identificacioacuten de microrganismos
bull Desarrollo de protocolos de micropropagacioacuten
bull Generacioacuten de liacuteneas doble haploides de arroz
1
2
3
4
Reactivosbull Oligonucleoacutetidos 1 microM bull Taq polimerasa 1ubull MgCl2 3 mMbull dNTPs 400 microMbull Buacutefer 1Xbull ADN 100 ng
95
607272
60
PCR y Secuenciacioacuten (NGS)
ldquoInnovacioacuten tecnoloacutegica para el desarrollo sostenible del agro y la soberaniacutea alimentariardquo
Cruces para resistencia a Xanthomonas oryzae
Progenitores
bull IDIAP 38
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I38 390 39 12
Xa3 x I38 230 23 12
Xa5 x I38 200 20 1
Progenitores
bull IDIAP 145-05
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I145 300 29 1 + 11
Xa3 x I145 200 17 9 + 4
Xa5 x I145 250 25 19
Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Viacutector Camargo Sandra Sopalda Prince
Xa3 ndash BDTG18
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 23 M
600600
Anaacutelisis del cruce Xa3 x IDIAP 38 iniciador BDTG18
Xa1 ndash BDTG10
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 M
800800
Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
bull Identificacioacuten de genes de quitinasas en cultivares de ntildeame
bull Identificacioacuten de genes de resistencia a begomovirus en tomate criollo
bull Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
1500
1000
500600
200
M 3 9 10 12 15 18 20 28
IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
bull gt I38-20CTATTTGGAACATCTCCCTCTCCATATTCGAAGTCATATCCAACAAGCTAAGTGGTACACTGCCTACAATGCATTCAGTAATCTTCCTAGTCTGCAGGAGGTATACATGTATTACAACCAGTTTCATGGTCGTATCCCGGCATCGATAGGTAATGCTTCCAACATCTCAATATTACCATTGGTTTAAACTCTTTTAGCGGTGTTGTTCCACCGGAGATTGGAAGGATGAGAAATCTTCAGAGACTAGAGCTTCCAGAAACTCTTTCGGAAGCTGAAGAAACAAATGATTGGAAATTCATGACGGCATTGACAAATTGCTCCAATCTTCAAGAAGTGGAACTGGGAGGTTGTAAATTTGGTGGAGTCCTCCCTGATTC
Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
member E complete cds99 U727241
PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
Piz-5 6 RM 527 233 221-240 11
Pi-b 2 RM 208 173172-188 7
Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
Pi-27(t) 1 RM 259 162 161-183 14
Pitp(t) 1 RM 246 116 102-121 13
Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
Score Expect Identities Gaps Strand
523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
Query 1 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACC 60 D3
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Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
Query 61 ACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGA 120
| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
Query 121 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAA-AGTTACTGAT 179
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Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
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Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
Query 240 AAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTT-AAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGC 298
|||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||||| ||||||
Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACCACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGATGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAAAGTTACTGATATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGTAAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTTAAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGCACCAATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC
CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Centro de Investigacioacuten Agropecuaria DivisaLaboratorio Agrobiotecnologiacutea
1987
Conservacioacuten de germoplasma
Micropropagacioacuten
Investigacioacuten
Conservacioacuten de germoplasma
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas (1989)
Colecciones
bull Camote (Ipomoea batatas) 17
bull Plaacutetano (Musa AAB) 8
bull Ntildeame (Dioscorea alata D trifida) 27
bull Papa (Solanum tuberosum) 97
bull Yuca (Manihot esculenta) 46
Zanya Aguilar Reyes Calixto Guerra Beroy Joseacute Hernaacuten Campos Ricardo Hernaacutendez Rojas Yanelkys Barrera Gonzaacutelez Arnulfo Gutieacuterrez Gutieacuterrez
Coacutedigo Nombre del cultivar
D1 Darieacuten
D2 JamaicaD3 Diamante 6322 D4 CocoD5 Criollo babosoD6 Cristal
D7 CabuyaD8 Mano de Tigre
D9 Blanco PeluacuteD10 LisoD11 EspinosoD12 GelatinaD13 Colorado Peludo
D14 Mulato ColoradoD15 Morado
Coacutedigo Nombre del cultivar
D16 PapaD17 NegroD18 Caballo O
D19 Paleta
D21 KabushaD22 Caballo R
D23 DulceD34 Dt ntildeampiacute blanco
D35 Dt ntildeampiacute morado
D38 AeacutereoD43 HBD44 SedaD46 Clon 94D50 CulebroD51 Monja
Coleccioacuten de Dioscorea sp
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
bull Rendimiento y adaptacioacuten Brasilentildea criolla
IDIAP Y1450-17 CG-1450-4
bull Materia seca (almidoacuten) IDIAP Y1505-17 MCol-1505
bull Uso agroindustrial (hojuelas) IDIAP Y523-174 CM-523-7
bull Betacarotenos Yema de huevo criolla
Coleccioacuten de yuca Variedades Origen
Introducidas del CIAT en 2009 liberadas en 2017
Camote biofortificado
alto contenido de betacarotenos
rendimiento superior a 30 T ha-1
bull IDIAP C03-17 CIP 1066031 piel rosada pulpa anaranjada
bull IDIAP C90-17 CIP 1060901 piel morada pulpa anaranjada
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
Micropropagacioacuten
Saneamiento(termoterapia +
meristemas )Micropropagacioacuten Aclimatacioacuten
Cultivo en casa de vegetacioacuten
Zanya Aguilar Reyes Calixto Guerra Beroy Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera Gonzaacutelez
Saneamiento Micropropagacioacuten AclimatacioacutenCultivo en casa de
vegetacioacuten
Meristemas plaacutentulas semilla
Micropropagacioacuten de papa
Micropropagacioacuten de ntildeame
Investigacioacutenbull Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
bull Caracterizacioacuten molecular
bull Identificacioacuten de genes (resistencia y otras caracteriacutesticas)
bull Identificacioacuten de microrganismos
bull Desarrollo de protocolos de micropropagacioacuten
bull Generacioacuten de liacuteneas doble haploides de arroz
1
2
3
4
Reactivosbull Oligonucleoacutetidos 1 microM bull Taq polimerasa 1ubull MgCl2 3 mMbull dNTPs 400 microMbull Buacutefer 1Xbull ADN 100 ng
95
607272
60
PCR y Secuenciacioacuten (NGS)
ldquoInnovacioacuten tecnoloacutegica para el desarrollo sostenible del agro y la soberaniacutea alimentariardquo
Cruces para resistencia a Xanthomonas oryzae
Progenitores
bull IDIAP 38
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I38 390 39 12
Xa3 x I38 230 23 12
Xa5 x I38 200 20 1
Progenitores
bull IDIAP 145-05
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I145 300 29 1 + 11
Xa3 x I145 200 17 9 + 4
Xa5 x I145 250 25 19
Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Viacutector Camargo Sandra Sopalda Prince
Xa3 ndash BDTG18
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 23 M
600600
Anaacutelisis del cruce Xa3 x IDIAP 38 iniciador BDTG18
Xa1 ndash BDTG10
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 M
800800
Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
bull Identificacioacuten de genes de quitinasas en cultivares de ntildeame
bull Identificacioacuten de genes de resistencia a begomovirus en tomate criollo
bull Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
1500
1000
500600
200
M 3 9 10 12 15 18 20 28
IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
bull gt I38-20CTATTTGGAACATCTCCCTCTCCATATTCGAAGTCATATCCAACAAGCTAAGTGGTACACTGCCTACAATGCATTCAGTAATCTTCCTAGTCTGCAGGAGGTATACATGTATTACAACCAGTTTCATGGTCGTATCCCGGCATCGATAGGTAATGCTTCCAACATCTCAATATTACCATTGGTTTAAACTCTTTTAGCGGTGTTGTTCCACCGGAGATTGGAAGGATGAGAAATCTTCAGAGACTAGAGCTTCCAGAAACTCTTTCGGAAGCTGAAGAAACAAATGATTGGAAATTCATGACGGCATTGACAAATTGCTCCAATCTTCAAGAAGTGGAACTGGGAGGTTGTAAATTTGGTGGAGTCCTCCCTGATTC
Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
member E complete cds99 U727241
PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
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Pitp(t) 1 RM 246 116 102-121 13
Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
Score Expect Identities Gaps Strand
523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
Query 1 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACC 60 D3
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Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
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Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACCACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGATGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAAAGTTACTGATATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGTAAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTTAAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGCACCAATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC
CultivarReferencia NCBI
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D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
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Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
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36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Conservacioacuten de germoplasma
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas (1989)
Colecciones
bull Camote (Ipomoea batatas) 17
bull Plaacutetano (Musa AAB) 8
bull Ntildeame (Dioscorea alata D trifida) 27
bull Papa (Solanum tuberosum) 97
bull Yuca (Manihot esculenta) 46
Zanya Aguilar Reyes Calixto Guerra Beroy Joseacute Hernaacuten Campos Ricardo Hernaacutendez Rojas Yanelkys Barrera Gonzaacutelez Arnulfo Gutieacuterrez Gutieacuterrez
Coacutedigo Nombre del cultivar
D1 Darieacuten
D2 JamaicaD3 Diamante 6322 D4 CocoD5 Criollo babosoD6 Cristal
D7 CabuyaD8 Mano de Tigre
D9 Blanco PeluacuteD10 LisoD11 EspinosoD12 GelatinaD13 Colorado Peludo
D14 Mulato ColoradoD15 Morado
Coacutedigo Nombre del cultivar
D16 PapaD17 NegroD18 Caballo O
D19 Paleta
D21 KabushaD22 Caballo R
D23 DulceD34 Dt ntildeampiacute blanco
D35 Dt ntildeampiacute morado
D38 AeacutereoD43 HBD44 SedaD46 Clon 94D50 CulebroD51 Monja
Coleccioacuten de Dioscorea sp
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
bull Rendimiento y adaptacioacuten Brasilentildea criolla
IDIAP Y1450-17 CG-1450-4
bull Materia seca (almidoacuten) IDIAP Y1505-17 MCol-1505
bull Uso agroindustrial (hojuelas) IDIAP Y523-174 CM-523-7
bull Betacarotenos Yema de huevo criolla
Coleccioacuten de yuca Variedades Origen
Introducidas del CIAT en 2009 liberadas en 2017
Camote biofortificado
alto contenido de betacarotenos
rendimiento superior a 30 T ha-1
bull IDIAP C03-17 CIP 1066031 piel rosada pulpa anaranjada
bull IDIAP C90-17 CIP 1060901 piel morada pulpa anaranjada
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
Micropropagacioacuten
Saneamiento(termoterapia +
meristemas )Micropropagacioacuten Aclimatacioacuten
Cultivo en casa de vegetacioacuten
Zanya Aguilar Reyes Calixto Guerra Beroy Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera Gonzaacutelez
Saneamiento Micropropagacioacuten AclimatacioacutenCultivo en casa de
vegetacioacuten
Meristemas plaacutentulas semilla
Micropropagacioacuten de papa
Micropropagacioacuten de ntildeame
Investigacioacutenbull Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
bull Caracterizacioacuten molecular
bull Identificacioacuten de genes (resistencia y otras caracteriacutesticas)
bull Identificacioacuten de microrganismos
bull Desarrollo de protocolos de micropropagacioacuten
bull Generacioacuten de liacuteneas doble haploides de arroz
1
2
3
4
Reactivosbull Oligonucleoacutetidos 1 microM bull Taq polimerasa 1ubull MgCl2 3 mMbull dNTPs 400 microMbull Buacutefer 1Xbull ADN 100 ng
95
607272
60
PCR y Secuenciacioacuten (NGS)
ldquoInnovacioacuten tecnoloacutegica para el desarrollo sostenible del agro y la soberaniacutea alimentariardquo
Cruces para resistencia a Xanthomonas oryzae
Progenitores
bull IDIAP 38
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I38 390 39 12
Xa3 x I38 230 23 12
Xa5 x I38 200 20 1
Progenitores
bull IDIAP 145-05
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I145 300 29 1 + 11
Xa3 x I145 200 17 9 + 4
Xa5 x I145 250 25 19
Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Viacutector Camargo Sandra Sopalda Prince
Xa3 ndash BDTG18
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 23 M
600600
Anaacutelisis del cruce Xa3 x IDIAP 38 iniciador BDTG18
Xa1 ndash BDTG10
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 M
800800
Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
bull Identificacioacuten de genes de quitinasas en cultivares de ntildeame
bull Identificacioacuten de genes de resistencia a begomovirus en tomate criollo
bull Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
1500
1000
500600
200
M 3 9 10 12 15 18 20 28
IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
bull gt I38-20CTATTTGGAACATCTCCCTCTCCATATTCGAAGTCATATCCAACAAGCTAAGTGGTACACTGCCTACAATGCATTCAGTAATCTTCCTAGTCTGCAGGAGGTATACATGTATTACAACCAGTTTCATGGTCGTATCCCGGCATCGATAGGTAATGCTTCCAACATCTCAATATTACCATTGGTTTAAACTCTTTTAGCGGTGTTGTTCCACCGGAGATTGGAAGGATGAGAAATCTTCAGAGACTAGAGCTTCCAGAAACTCTTTCGGAAGCTGAAGAAACAAATGATTGGAAATTCATGACGGCATTGACAAATTGCTCCAATCTTCAAGAAGTGGAACTGGGAGGTTGTAAATTTGGTGGAGTCCTCCCTGATTC
Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
member E complete cds99 U727241
PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
Piz-5 6 RM 527 233 221-240 11
Pi-b 2 RM 208 173172-188 7
Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
Pi-27(t) 1 RM 259 162 161-183 14
Pitp(t) 1 RM 246 116 102-121 13
Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
Score Expect Identities Gaps Strand
523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
Query 1 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACC 60 D3
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
Query 61 ACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGA 120
| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
Query 121 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAA-AGTTACTGAT 179
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||
Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
Query 240 AAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTT-AAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGC 298
|||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||||| ||||||
Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACCACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGATGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAAAGTTACTGATATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGTAAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTTAAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGCACCAATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC
CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas (1989)
Colecciones
bull Camote (Ipomoea batatas) 17
bull Plaacutetano (Musa AAB) 8
bull Ntildeame (Dioscorea alata D trifida) 27
bull Papa (Solanum tuberosum) 97
bull Yuca (Manihot esculenta) 46
Zanya Aguilar Reyes Calixto Guerra Beroy Joseacute Hernaacuten Campos Ricardo Hernaacutendez Rojas Yanelkys Barrera Gonzaacutelez Arnulfo Gutieacuterrez Gutieacuterrez
Coacutedigo Nombre del cultivar
D1 Darieacuten
D2 JamaicaD3 Diamante 6322 D4 CocoD5 Criollo babosoD6 Cristal
D7 CabuyaD8 Mano de Tigre
D9 Blanco PeluacuteD10 LisoD11 EspinosoD12 GelatinaD13 Colorado Peludo
D14 Mulato ColoradoD15 Morado
Coacutedigo Nombre del cultivar
D16 PapaD17 NegroD18 Caballo O
D19 Paleta
D21 KabushaD22 Caballo R
D23 DulceD34 Dt ntildeampiacute blanco
D35 Dt ntildeampiacute morado
D38 AeacutereoD43 HBD44 SedaD46 Clon 94D50 CulebroD51 Monja
Coleccioacuten de Dioscorea sp
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
bull Rendimiento y adaptacioacuten Brasilentildea criolla
IDIAP Y1450-17 CG-1450-4
bull Materia seca (almidoacuten) IDIAP Y1505-17 MCol-1505
bull Uso agroindustrial (hojuelas) IDIAP Y523-174 CM-523-7
bull Betacarotenos Yema de huevo criolla
Coleccioacuten de yuca Variedades Origen
Introducidas del CIAT en 2009 liberadas en 2017
Camote biofortificado
alto contenido de betacarotenos
rendimiento superior a 30 T ha-1
bull IDIAP C03-17 CIP 1066031 piel rosada pulpa anaranjada
bull IDIAP C90-17 CIP 1060901 piel morada pulpa anaranjada
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
Micropropagacioacuten
Saneamiento(termoterapia +
meristemas )Micropropagacioacuten Aclimatacioacuten
Cultivo en casa de vegetacioacuten
Zanya Aguilar Reyes Calixto Guerra Beroy Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera Gonzaacutelez
Saneamiento Micropropagacioacuten AclimatacioacutenCultivo en casa de
vegetacioacuten
Meristemas plaacutentulas semilla
Micropropagacioacuten de papa
Micropropagacioacuten de ntildeame
Investigacioacutenbull Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
bull Caracterizacioacuten molecular
bull Identificacioacuten de genes (resistencia y otras caracteriacutesticas)
bull Identificacioacuten de microrganismos
bull Desarrollo de protocolos de micropropagacioacuten
bull Generacioacuten de liacuteneas doble haploides de arroz
1
2
3
4
Reactivosbull Oligonucleoacutetidos 1 microM bull Taq polimerasa 1ubull MgCl2 3 mMbull dNTPs 400 microMbull Buacutefer 1Xbull ADN 100 ng
95
607272
60
PCR y Secuenciacioacuten (NGS)
ldquoInnovacioacuten tecnoloacutegica para el desarrollo sostenible del agro y la soberaniacutea alimentariardquo
Cruces para resistencia a Xanthomonas oryzae
Progenitores
bull IDIAP 38
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I38 390 39 12
Xa3 x I38 230 23 12
Xa5 x I38 200 20 1
Progenitores
bull IDIAP 145-05
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I145 300 29 1 + 11
Xa3 x I145 200 17 9 + 4
Xa5 x I145 250 25 19
Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Viacutector Camargo Sandra Sopalda Prince
Xa3 ndash BDTG18
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 23 M
600600
Anaacutelisis del cruce Xa3 x IDIAP 38 iniciador BDTG18
Xa1 ndash BDTG10
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 M
800800
Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
bull Identificacioacuten de genes de quitinasas en cultivares de ntildeame
bull Identificacioacuten de genes de resistencia a begomovirus en tomate criollo
bull Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
1500
1000
500600
200
M 3 9 10 12 15 18 20 28
IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
bull gt I38-20CTATTTGGAACATCTCCCTCTCCATATTCGAAGTCATATCCAACAAGCTAAGTGGTACACTGCCTACAATGCATTCAGTAATCTTCCTAGTCTGCAGGAGGTATACATGTATTACAACCAGTTTCATGGTCGTATCCCGGCATCGATAGGTAATGCTTCCAACATCTCAATATTACCATTGGTTTAAACTCTTTTAGCGGTGTTGTTCCACCGGAGATTGGAAGGATGAGAAATCTTCAGAGACTAGAGCTTCCAGAAACTCTTTCGGAAGCTGAAGAAACAAATGATTGGAAATTCATGACGGCATTGACAAATTGCTCCAATCTTCAAGAAGTGGAACTGGGAGGTTGTAAATTTGGTGGAGTCCTCCCTGATTC
Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
member E complete cds99 U727241
PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
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Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
Pi-27(t) 1 RM 259 162 161-183 14
Pitp(t) 1 RM 246 116 102-121 13
Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
Score Expect Identities Gaps Strand
523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
Query 1 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACC 60 D3
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Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
Query 61 ACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGA 120
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Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
Query 121 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAA-AGTTACTGAT 179
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Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||
Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
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|||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||||| ||||||
Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACCACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGATGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAAAGTTACTGATATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGTAAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTTAAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGCACCAATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC
CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Coacutedigo Nombre del cultivar
D1 Darieacuten
D2 JamaicaD3 Diamante 6322 D4 CocoD5 Criollo babosoD6 Cristal
D7 CabuyaD8 Mano de Tigre
D9 Blanco PeluacuteD10 LisoD11 EspinosoD12 GelatinaD13 Colorado Peludo
D14 Mulato ColoradoD15 Morado
Coacutedigo Nombre del cultivar
D16 PapaD17 NegroD18 Caballo O
D19 Paleta
D21 KabushaD22 Caballo R
D23 DulceD34 Dt ntildeampiacute blanco
D35 Dt ntildeampiacute morado
D38 AeacutereoD43 HBD44 SedaD46 Clon 94D50 CulebroD51 Monja
Coleccioacuten de Dioscorea sp
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
bull Rendimiento y adaptacioacuten Brasilentildea criolla
IDIAP Y1450-17 CG-1450-4
bull Materia seca (almidoacuten) IDIAP Y1505-17 MCol-1505
bull Uso agroindustrial (hojuelas) IDIAP Y523-174 CM-523-7
bull Betacarotenos Yema de huevo criolla
Coleccioacuten de yuca Variedades Origen
Introducidas del CIAT en 2009 liberadas en 2017
Camote biofortificado
alto contenido de betacarotenos
rendimiento superior a 30 T ha-1
bull IDIAP C03-17 CIP 1066031 piel rosada pulpa anaranjada
bull IDIAP C90-17 CIP 1060901 piel morada pulpa anaranjada
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
Micropropagacioacuten
Saneamiento(termoterapia +
meristemas )Micropropagacioacuten Aclimatacioacuten
Cultivo en casa de vegetacioacuten
Zanya Aguilar Reyes Calixto Guerra Beroy Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera Gonzaacutelez
Saneamiento Micropropagacioacuten AclimatacioacutenCultivo en casa de
vegetacioacuten
Meristemas plaacutentulas semilla
Micropropagacioacuten de papa
Micropropagacioacuten de ntildeame
Investigacioacutenbull Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
bull Caracterizacioacuten molecular
bull Identificacioacuten de genes (resistencia y otras caracteriacutesticas)
bull Identificacioacuten de microrganismos
bull Desarrollo de protocolos de micropropagacioacuten
bull Generacioacuten de liacuteneas doble haploides de arroz
1
2
3
4
Reactivosbull Oligonucleoacutetidos 1 microM bull Taq polimerasa 1ubull MgCl2 3 mMbull dNTPs 400 microMbull Buacutefer 1Xbull ADN 100 ng
95
607272
60
PCR y Secuenciacioacuten (NGS)
ldquoInnovacioacuten tecnoloacutegica para el desarrollo sostenible del agro y la soberaniacutea alimentariardquo
Cruces para resistencia a Xanthomonas oryzae
Progenitores
bull IDIAP 38
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I38 390 39 12
Xa3 x I38 230 23 12
Xa5 x I38 200 20 1
Progenitores
bull IDIAP 145-05
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I145 300 29 1 + 11
Xa3 x I145 200 17 9 + 4
Xa5 x I145 250 25 19
Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Viacutector Camargo Sandra Sopalda Prince
Xa3 ndash BDTG18
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 23 M
600600
Anaacutelisis del cruce Xa3 x IDIAP 38 iniciador BDTG18
Xa1 ndash BDTG10
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 M
800800
Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
bull Identificacioacuten de genes de quitinasas en cultivares de ntildeame
bull Identificacioacuten de genes de resistencia a begomovirus en tomate criollo
bull Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
1500
1000
500600
200
M 3 9 10 12 15 18 20 28
IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
bull gt I38-20CTATTTGGAACATCTCCCTCTCCATATTCGAAGTCATATCCAACAAGCTAAGTGGTACACTGCCTACAATGCATTCAGTAATCTTCCTAGTCTGCAGGAGGTATACATGTATTACAACCAGTTTCATGGTCGTATCCCGGCATCGATAGGTAATGCTTCCAACATCTCAATATTACCATTGGTTTAAACTCTTTTAGCGGTGTTGTTCCACCGGAGATTGGAAGGATGAGAAATCTTCAGAGACTAGAGCTTCCAGAAACTCTTTCGGAAGCTGAAGAAACAAATGATTGGAAATTCATGACGGCATTGACAAATTGCTCCAATCTTCAAGAAGTGGAACTGGGAGGTTGTAAATTTGGTGGAGTCCTCCCTGATTC
Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
member E complete cds99 U727241
PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
Piz-5 6 RM 527 233 221-240 11
Pi-b 2 RM 208 173172-188 7
Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
Pi-27(t) 1 RM 259 162 161-183 14
Pitp(t) 1 RM 246 116 102-121 13
Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
Score Expect Identities Gaps Strand
523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
Query 1 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACC 60 D3
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
Query 61 ACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGA 120
| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
Query 121 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAA-AGTTACTGAT 179
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||
Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
Query 240 AAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTT-AAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGC 298
|||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||||| ||||||
Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACCACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGATGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAAAGTTACTGATATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGTAAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTTAAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGCACCAATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC
CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
bull Rendimiento y adaptacioacuten Brasilentildea criolla
IDIAP Y1450-17 CG-1450-4
bull Materia seca (almidoacuten) IDIAP Y1505-17 MCol-1505
bull Uso agroindustrial (hojuelas) IDIAP Y523-174 CM-523-7
bull Betacarotenos Yema de huevo criolla
Coleccioacuten de yuca Variedades Origen
Introducidas del CIAT en 2009 liberadas en 2017
Camote biofortificado
alto contenido de betacarotenos
rendimiento superior a 30 T ha-1
bull IDIAP C03-17 CIP 1066031 piel rosada pulpa anaranjada
bull IDIAP C90-17 CIP 1060901 piel morada pulpa anaranjada
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
Micropropagacioacuten
Saneamiento(termoterapia +
meristemas )Micropropagacioacuten Aclimatacioacuten
Cultivo en casa de vegetacioacuten
Zanya Aguilar Reyes Calixto Guerra Beroy Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera Gonzaacutelez
Saneamiento Micropropagacioacuten AclimatacioacutenCultivo en casa de
vegetacioacuten
Meristemas plaacutentulas semilla
Micropropagacioacuten de papa
Micropropagacioacuten de ntildeame
Investigacioacutenbull Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
bull Caracterizacioacuten molecular
bull Identificacioacuten de genes (resistencia y otras caracteriacutesticas)
bull Identificacioacuten de microrganismos
bull Desarrollo de protocolos de micropropagacioacuten
bull Generacioacuten de liacuteneas doble haploides de arroz
1
2
3
4
Reactivosbull Oligonucleoacutetidos 1 microM bull Taq polimerasa 1ubull MgCl2 3 mMbull dNTPs 400 microMbull Buacutefer 1Xbull ADN 100 ng
95
607272
60
PCR y Secuenciacioacuten (NGS)
ldquoInnovacioacuten tecnoloacutegica para el desarrollo sostenible del agro y la soberaniacutea alimentariardquo
Cruces para resistencia a Xanthomonas oryzae
Progenitores
bull IDIAP 38
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I38 390 39 12
Xa3 x I38 230 23 12
Xa5 x I38 200 20 1
Progenitores
bull IDIAP 145-05
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I145 300 29 1 + 11
Xa3 x I145 200 17 9 + 4
Xa5 x I145 250 25 19
Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Viacutector Camargo Sandra Sopalda Prince
Xa3 ndash BDTG18
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 23 M
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Anaacutelisis del cruce Xa3 x IDIAP 38 iniciador BDTG18
Xa1 ndash BDTG10
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 M
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Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
bull Identificacioacuten de genes de quitinasas en cultivares de ntildeame
bull Identificacioacuten de genes de resistencia a begomovirus en tomate criollo
bull Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
1500
1000
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200
M 3 9 10 12 15 18 20 28
IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
bull gt I38-20CTATTTGGAACATCTCCCTCTCCATATTCGAAGTCATATCCAACAAGCTAAGTGGTACACTGCCTACAATGCATTCAGTAATCTTCCTAGTCTGCAGGAGGTATACATGTATTACAACCAGTTTCATGGTCGTATCCCGGCATCGATAGGTAATGCTTCCAACATCTCAATATTACCATTGGTTTAAACTCTTTTAGCGGTGTTGTTCCACCGGAGATTGGAAGGATGAGAAATCTTCAGAGACTAGAGCTTCCAGAAACTCTTTCGGAAGCTGAAGAAACAAATGATTGGAAATTCATGACGGCATTGACAAATTGCTCCAATCTTCAAGAAGTGGAACTGGGAGGTTGTAAATTTGGTGGAGTCCTCCCTGATTC
Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
member E complete cds99 U727241
PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
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Pi-b 2 RM 208 173172-188 7
Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
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Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
Score Expect Identities Gaps Strand
523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
Query 1 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACC 60 D3
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Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
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Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
Query 121 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAA-AGTTACTGAT 179
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Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
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Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
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Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
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||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACCACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGATGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAAAGTTACTGATATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGTAAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTTAAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGCACCAATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC
CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Camote biofortificado
alto contenido de betacarotenos
rendimiento superior a 30 T ha-1
bull IDIAP C03-17 CIP 1066031 piel rosada pulpa anaranjada
bull IDIAP C90-17 CIP 1060901 piel morada pulpa anaranjada
Banco de germoplasma in vitro de especies agaacutemicas
Micropropagacioacuten
Saneamiento(termoterapia +
meristemas )Micropropagacioacuten Aclimatacioacuten
Cultivo en casa de vegetacioacuten
Zanya Aguilar Reyes Calixto Guerra Beroy Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera Gonzaacutelez
Saneamiento Micropropagacioacuten AclimatacioacutenCultivo en casa de
vegetacioacuten
Meristemas plaacutentulas semilla
Micropropagacioacuten de papa
Micropropagacioacuten de ntildeame
Investigacioacutenbull Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
bull Caracterizacioacuten molecular
bull Identificacioacuten de genes (resistencia y otras caracteriacutesticas)
bull Identificacioacuten de microrganismos
bull Desarrollo de protocolos de micropropagacioacuten
bull Generacioacuten de liacuteneas doble haploides de arroz
1
2
3
4
Reactivosbull Oligonucleoacutetidos 1 microM bull Taq polimerasa 1ubull MgCl2 3 mMbull dNTPs 400 microMbull Buacutefer 1Xbull ADN 100 ng
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607272
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PCR y Secuenciacioacuten (NGS)
ldquoInnovacioacuten tecnoloacutegica para el desarrollo sostenible del agro y la soberaniacutea alimentariardquo
Cruces para resistencia a Xanthomonas oryzae
Progenitores
bull IDIAP 38
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Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I38 390 39 12
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Progenitores
bull IDIAP 145-05
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
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Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Viacutector Camargo Sandra Sopalda Prince
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Xa1 ndash BDTG10
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Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
bull Identificacioacuten de genes de quitinasas en cultivares de ntildeame
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1500
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IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
bull gt I38-20CTATTTGGAACATCTCCCTCTCCATATTCGAAGTCATATCCAACAAGCTAAGTGGTACACTGCCTACAATGCATTCAGTAATCTTCCTAGTCTGCAGGAGGTATACATGTATTACAACCAGTTTCATGGTCGTATCCCGGCATCGATAGGTAATGCTTCCAACATCTCAATATTACCATTGGTTTAAACTCTTTTAGCGGTGTTGTTCCACCGGAGATTGGAAGGATGAGAAATCTTCAGAGACTAGAGCTTCCAGAAACTCTTTCGGAAGCTGAAGAAACAAATGATTGGAAATTCATGACGGCATTGACAAATTGCTCCAATCTTCAAGAAGTGGAACTGGGAGGTTGTAAATTTGGTGGAGTCCTCCCTGATTC
Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
member E complete cds99 U727241
PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
Piz-5 6 RM 527 233 221-240 11
Pi-b 2 RM 208 173172-188 7
Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
Pi-27(t) 1 RM 259 162 161-183 14
Pitp(t) 1 RM 246 116 102-121 13
Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
Score Expect Identities Gaps Strand
523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
Query 1 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACC 60 D3
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
Query 61 ACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGA 120
| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
Query 121 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAA-AGTTACTGAT 179
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Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||
Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
Query 240 AAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTT-AAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGC 298
|||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||||| ||||||
Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACCACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGATGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAAAGTTACTGATATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGTAAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTTAAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGCACCAATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC
CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Micropropagacioacuten
Saneamiento(termoterapia +
meristemas )Micropropagacioacuten Aclimatacioacuten
Cultivo en casa de vegetacioacuten
Zanya Aguilar Reyes Calixto Guerra Beroy Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera Gonzaacutelez
Saneamiento Micropropagacioacuten AclimatacioacutenCultivo en casa de
vegetacioacuten
Meristemas plaacutentulas semilla
Micropropagacioacuten de papa
Micropropagacioacuten de ntildeame
Investigacioacutenbull Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
bull Caracterizacioacuten molecular
bull Identificacioacuten de genes (resistencia y otras caracteriacutesticas)
bull Identificacioacuten de microrganismos
bull Desarrollo de protocolos de micropropagacioacuten
bull Generacioacuten de liacuteneas doble haploides de arroz
1
2
3
4
Reactivosbull Oligonucleoacutetidos 1 microM bull Taq polimerasa 1ubull MgCl2 3 mMbull dNTPs 400 microMbull Buacutefer 1Xbull ADN 100 ng
95
607272
60
PCR y Secuenciacioacuten (NGS)
ldquoInnovacioacuten tecnoloacutegica para el desarrollo sostenible del agro y la soberaniacutea alimentariardquo
Cruces para resistencia a Xanthomonas oryzae
Progenitores
bull IDIAP 38
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I38 390 39 12
Xa3 x I38 230 23 12
Xa5 x I38 200 20 1
Progenitores
bull IDIAP 145-05
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I145 300 29 1 + 11
Xa3 x I145 200 17 9 + 4
Xa5 x I145 250 25 19
Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Viacutector Camargo Sandra Sopalda Prince
Xa3 ndash BDTG18
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 23 M
600600
Anaacutelisis del cruce Xa3 x IDIAP 38 iniciador BDTG18
Xa1 ndash BDTG10
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 M
800800
Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
bull Identificacioacuten de genes de quitinasas en cultivares de ntildeame
bull Identificacioacuten de genes de resistencia a begomovirus en tomate criollo
bull Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
1500
1000
500600
200
M 3 9 10 12 15 18 20 28
IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
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Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
member E complete cds99 U727241
PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
Piz-5 6 RM 527 233 221-240 11
Pi-b 2 RM 208 173172-188 7
Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
Pi-27(t) 1 RM 259 162 161-183 14
Pitp(t) 1 RM 246 116 102-121 13
Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
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523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
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Query 61 ACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGA 120
| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
Query 121 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAA-AGTTACTGAT 179
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||
Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
Query 240 AAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTT-AAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGC 298
|||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||||| ||||||
Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
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Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
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CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Saneamiento Micropropagacioacuten AclimatacioacutenCultivo en casa de
vegetacioacuten
Meristemas plaacutentulas semilla
Micropropagacioacuten de papa
Micropropagacioacuten de ntildeame
Investigacioacutenbull Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
bull Caracterizacioacuten molecular
bull Identificacioacuten de genes (resistencia y otras caracteriacutesticas)
bull Identificacioacuten de microrganismos
bull Desarrollo de protocolos de micropropagacioacuten
bull Generacioacuten de liacuteneas doble haploides de arroz
1
2
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Reactivosbull Oligonucleoacutetidos 1 microM bull Taq polimerasa 1ubull MgCl2 3 mMbull dNTPs 400 microMbull Buacutefer 1Xbull ADN 100 ng
95
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60
PCR y Secuenciacioacuten (NGS)
ldquoInnovacioacuten tecnoloacutegica para el desarrollo sostenible del agro y la soberaniacutea alimentariardquo
Cruces para resistencia a Xanthomonas oryzae
Progenitores
bull IDIAP 38
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I38 390 39 12
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Progenitores
bull IDIAP 145-05
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I145 300 29 1 + 11
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Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Viacutector Camargo Sandra Sopalda Prince
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Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
bull Identificacioacuten de genes de quitinasas en cultivares de ntildeame
bull Identificacioacuten de genes de resistencia a begomovirus en tomate criollo
bull Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
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500600
200
M 3 9 10 12 15 18 20 28
IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
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Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
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Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
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PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
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Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
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Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
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523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
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Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
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Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
Query 121 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAA-AGTTACTGAT 179
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Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
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Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
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Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACCACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGATGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAAAGTTACTGATATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGTAAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTTAAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGCACCAATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC
CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Micropropagacioacuten de ntildeame
Investigacioacutenbull Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
bull Caracterizacioacuten molecular
bull Identificacioacuten de genes (resistencia y otras caracteriacutesticas)
bull Identificacioacuten de microrganismos
bull Desarrollo de protocolos de micropropagacioacuten
bull Generacioacuten de liacuteneas doble haploides de arroz
1
2
3
4
Reactivosbull Oligonucleoacutetidos 1 microM bull Taq polimerasa 1ubull MgCl2 3 mMbull dNTPs 400 microMbull Buacutefer 1Xbull ADN 100 ng
95
607272
60
PCR y Secuenciacioacuten (NGS)
ldquoInnovacioacuten tecnoloacutegica para el desarrollo sostenible del agro y la soberaniacutea alimentariardquo
Cruces para resistencia a Xanthomonas oryzae
Progenitores
bull IDIAP 38
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I38 390 39 12
Xa3 x I38 230 23 12
Xa5 x I38 200 20 1
Progenitores
bull IDIAP 145-05
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I145 300 29 1 + 11
Xa3 x I145 200 17 9 + 4
Xa5 x I145 250 25 19
Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Viacutector Camargo Sandra Sopalda Prince
Xa3 ndash BDTG18
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 23 M
600600
Anaacutelisis del cruce Xa3 x IDIAP 38 iniciador BDTG18
Xa1 ndash BDTG10
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 M
800800
Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
bull Identificacioacuten de genes de quitinasas en cultivares de ntildeame
bull Identificacioacuten de genes de resistencia a begomovirus en tomate criollo
bull Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
1500
1000
500600
200
M 3 9 10 12 15 18 20 28
IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
bull gt I38-20CTATTTGGAACATCTCCCTCTCCATATTCGAAGTCATATCCAACAAGCTAAGTGGTACACTGCCTACAATGCATTCAGTAATCTTCCTAGTCTGCAGGAGGTATACATGTATTACAACCAGTTTCATGGTCGTATCCCGGCATCGATAGGTAATGCTTCCAACATCTCAATATTACCATTGGTTTAAACTCTTTTAGCGGTGTTGTTCCACCGGAGATTGGAAGGATGAGAAATCTTCAGAGACTAGAGCTTCCAGAAACTCTTTCGGAAGCTGAAGAAACAAATGATTGGAAATTCATGACGGCATTGACAAATTGCTCCAATCTTCAAGAAGTGGAACTGGGAGGTTGTAAATTTGGTGGAGTCCTCCCTGATTC
Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
member E complete cds99 U727241
PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
Piz-5 6 RM 527 233 221-240 11
Pi-b 2 RM 208 173172-188 7
Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
Pi-27(t) 1 RM 259 162 161-183 14
Pitp(t) 1 RM 246 116 102-121 13
Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
Score Expect Identities Gaps Strand
523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
Query 1 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACC 60 D3
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Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
Query 61 ACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGA 120
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Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
Query 121 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAA-AGTTACTGAT 179
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Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
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Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
Query 240 AAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTT-AAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGC 298
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Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
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Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACCACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGATGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAAAGTTACTGATATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGTAAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTTAAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGCACCAATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC
CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Investigacioacutenbull Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
bull Caracterizacioacuten molecular
bull Identificacioacuten de genes (resistencia y otras caracteriacutesticas)
bull Identificacioacuten de microrganismos
bull Desarrollo de protocolos de micropropagacioacuten
bull Generacioacuten de liacuteneas doble haploides de arroz
1
2
3
4
Reactivosbull Oligonucleoacutetidos 1 microM bull Taq polimerasa 1ubull MgCl2 3 mMbull dNTPs 400 microMbull Buacutefer 1Xbull ADN 100 ng
95
607272
60
PCR y Secuenciacioacuten (NGS)
ldquoInnovacioacuten tecnoloacutegica para el desarrollo sostenible del agro y la soberaniacutea alimentariardquo
Cruces para resistencia a Xanthomonas oryzae
Progenitores
bull IDIAP 38
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I38 390 39 12
Xa3 x I38 230 23 12
Xa5 x I38 200 20 1
Progenitores
bull IDIAP 145-05
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I145 300 29 1 + 11
Xa3 x I145 200 17 9 + 4
Xa5 x I145 250 25 19
Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Viacutector Camargo Sandra Sopalda Prince
Xa3 ndash BDTG18
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 23 M
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Anaacutelisis del cruce Xa3 x IDIAP 38 iniciador BDTG18
Xa1 ndash BDTG10
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 M
800800
Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
bull Identificacioacuten de genes de quitinasas en cultivares de ntildeame
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bull Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
1500
1000
500600
200
M 3 9 10 12 15 18 20 28
IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
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Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
member E complete cds99 U727241
PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
Piz-5 6 RM 527 233 221-240 11
Pi-b 2 RM 208 173172-188 7
Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
Pi-27(t) 1 RM 259 162 161-183 14
Pitp(t) 1 RM 246 116 102-121 13
Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
Score Expect Identities Gaps Strand
523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
Query 1 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACC 60 D3
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Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
Query 61 ACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGA 120
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Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
Query 121 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAA-AGTTACTGAT 179
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Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
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Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
Query 240 AAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTT-AAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGC 298
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Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
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Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACCACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGATGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAAAGTTACTGATATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGTAAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTTAAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGCACCAATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC
CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
1
2
3
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Reactivosbull Oligonucleoacutetidos 1 microM bull Taq polimerasa 1ubull MgCl2 3 mMbull dNTPs 400 microMbull Buacutefer 1Xbull ADN 100 ng
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607272
60
PCR y Secuenciacioacuten (NGS)
ldquoInnovacioacuten tecnoloacutegica para el desarrollo sostenible del agro y la soberaniacutea alimentariardquo
Cruces para resistencia a Xanthomonas oryzae
Progenitores
bull IDIAP 38
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Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I38 390 39 12
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Progenitores
bull IDIAP 145-05
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Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
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Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Viacutector Camargo Sandra Sopalda Prince
Xa3 ndash BDTG18
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Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
bull Identificacioacuten de genes de quitinasas en cultivares de ntildeame
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Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
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Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
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Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
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98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
Piz-5 6 RM 527 233 221-240 11
Pi-b 2 RM 208 173172-188 7
Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
Pi-27(t) 1 RM 259 162 161-183 14
Pitp(t) 1 RM 246 116 102-121 13
Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
Score Expect Identities Gaps Strand
523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
Query 1 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACC 60 D3
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
Query 61 ACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGA 120
| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
Query 121 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAA-AGTTACTGAT 179
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||
Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
Query 240 AAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTT-AAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGC 298
|||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||||| ||||||
Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACCACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGATGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAAAGTTACTGATATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGTAAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTTAAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGCACCAATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC
CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
ldquoInnovacioacuten tecnoloacutegica para el desarrollo sostenible del agro y la soberaniacutea alimentariardquo
Cruces para resistencia a Xanthomonas oryzae
Progenitores
bull IDIAP 38
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I38 390 39 12
Xa3 x I38 230 23 12
Xa5 x I38 200 20 1
Progenitores
bull IDIAP 145-05
bull Xa1 Xa3 Xa5
Cruce Nuacutemero de plantas
Muestra Seleccioacuten
Xa1 x I145 300 29 1 + 11
Xa3 x I145 200 17 9 + 4
Xa5 x I145 250 25 19
Seleccioacuten asistida por marcadores moleculares
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Viacutector Camargo Sandra Sopalda Prince
Xa3 ndash BDTG18
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 23 M
600600
Anaacutelisis del cruce Xa3 x IDIAP 38 iniciador BDTG18
Xa1 ndash BDTG10
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 M
800800
Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
bull Identificacioacuten de genes de quitinasas en cultivares de ntildeame
bull Identificacioacuten de genes de resistencia a begomovirus en tomate criollo
bull Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
1500
1000
500600
200
M 3 9 10 12 15 18 20 28
IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
bull gt I38-20CTATTTGGAACATCTCCCTCTCCATATTCGAAGTCATATCCAACAAGCTAAGTGGTACACTGCCTACAATGCATTCAGTAATCTTCCTAGTCTGCAGGAGGTATACATGTATTACAACCAGTTTCATGGTCGTATCCCGGCATCGATAGGTAATGCTTCCAACATCTCAATATTACCATTGGTTTAAACTCTTTTAGCGGTGTTGTTCCACCGGAGATTGGAAGGATGAGAAATCTTCAGAGACTAGAGCTTCCAGAAACTCTTTCGGAAGCTGAAGAAACAAATGATTGGAAATTCATGACGGCATTGACAAATTGCTCCAATCTTCAAGAAGTGGAACTGGGAGGTTGTAAATTTGGTGGAGTCCTCCCTGATTC
Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
member E complete cds99 U727241
PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
Piz-5 6 RM 527 233 221-240 11
Pi-b 2 RM 208 173172-188 7
Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
Pi-27(t) 1 RM 259 162 161-183 14
Pitp(t) 1 RM 246 116 102-121 13
Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
Score Expect Identities Gaps Strand
523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
Query 1 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACC 60 D3
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Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
Query 61 ACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGA 120
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Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
Query 121 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAA-AGTTACTGAT 179
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
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Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
Query 240 AAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTT-AAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGC 298
|||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||||| ||||||
Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACCACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGATGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAAAGTTACTGATATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGTAAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTTAAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGCACCAATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC
CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Xa3 ndash BDTG18
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 23 M
600600
Anaacutelisis del cruce Xa3 x IDIAP 38 iniciador BDTG18
Xa1 ndash BDTG10
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Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
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bull Identificacioacuten de genes de resistencia a begomovirus en tomate criollo
bull Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
1500
1000
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IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
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Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
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PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
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Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
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Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
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Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
Score Expect Identities Gaps Strand
523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
Query 1 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACC 60 D3
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Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
Query 61 ACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGA 120
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Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
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Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
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Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
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Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
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Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACCACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGATGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAAAGTTACTGATATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGTAAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTTAAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGCACCAATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC
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Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
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Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
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Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
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Xa1 ndash BDTG10
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 M
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Anaacutelisis del cruce Xa1 x IDIAP 38 iniciador BDTG10
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
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IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
bull gt I38-20CTATTTGGAACATCTCCCTCTCCATATTCGAAGTCATATCCAACAAGCTAAGTGGTACACTGCCTACAATGCATTCAGTAATCTTCCTAGTCTGCAGGAGGTATACATGTATTACAACCAGTTTCATGGTCGTATCCCGGCATCGATAGGTAATGCTTCCAACATCTCAATATTACCATTGGTTTAAACTCTTTTAGCGGTGTTGTTCCACCGGAGATTGGAAGGATGAGAAATCTTCAGAGACTAGAGCTTCCAGAAACTCTTTCGGAAGCTGAAGAAACAAATGATTGGAAATTCATGACGGCATTGACAAATTGCTCCAATCTTCAAGAAGTGGAACTGGGAGGTTGTAAATTTGGTGGAGTCCTCCCTGATTC
Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
member E complete cds99 U727241
PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
Piz-5 6 RM 527 233 221-240 11
Pi-b 2 RM 208 173172-188 7
Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
Pi-27(t) 1 RM 259 162 161-183 14
Pitp(t) 1 RM 246 116 102-121 13
Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
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523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
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Query 61 ACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGA 120
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Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
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Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
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CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Caracterizacioacuten molecular
bull Caracterizacioacuten molecular de variedades de arroz (mejoradas y criollas)bull Resistencia a Xoobull Resistencia a Magnaporthe grisaebull Resistencia a Burkholderia glumaebull Resistencia a Rizoctonia
bull Identificacioacuten de genes de quitinasas en cultivares de ntildeame
bull Identificacioacuten de genes de resistencia a begomovirus en tomate criollo
bull Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
1500
1000
500600
200
M 3 9 10 12 15 18 20 28
IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
bull gt I38-20CTATTTGGAACATCTCCCTCTCCATATTCGAAGTCATATCCAACAAGCTAAGTGGTACACTGCCTACAATGCATTCAGTAATCTTCCTAGTCTGCAGGAGGTATACATGTATTACAACCAGTTTCATGGTCGTATCCCGGCATCGATAGGTAATGCTTCCAACATCTCAATATTACCATTGGTTTAAACTCTTTTAGCGGTGTTGTTCCACCGGAGATTGGAAGGATGAGAAATCTTCAGAGACTAGAGCTTCCAGAAACTCTTTCGGAAGCTGAAGAAACAAATGATTGGAAATTCATGACGGCATTGACAAATTGCTCCAATCTTCAAGAAGTGGAACTGGGAGGTTGTAAATTTGGTGGAGTCCTCCCTGATTC
Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
member E complete cds99 U727241
PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
(LOC9271075) mRNA
98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
Piz-5 6 RM 527 233 221-240 11
Pi-b 2 RM 208 173172-188 7
Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
Pi-27(t) 1 RM 259 162 161-183 14
Pitp(t) 1 RM 246 116 102-121 13
Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
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Related Information
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Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
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Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
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Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
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CultivarReferencia NCBI
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D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
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Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
1500
1000
500600
200
M 3 9 10 12 15 18 20 28
IDIAP 38
Anaacutelisis de la variedad IDIAP 38 para resistencia a Xoo
bull gt I38-20CTATTTGGAACATCTCCCTCTCCATATTCGAAGTCATATCCAACAAGCTAAGTGGTACACTGCCTACAATGCATTCAGTAATCTTCCTAGTCTGCAGGAGGTATACATGTATTACAACCAGTTTCATGGTCGTATCCCGGCATCGATAGGTAATGCTTCCAACATCTCAATATTACCATTGGTTTAAACTCTTTTAGCGGTGTTGTTCCACCGGAGATTGGAAGGATGAGAAATCTTCAGAGACTAGAGCTTCCAGAAACTCTTTCGGAAGCTGAAGAAACAAATGATTGGAAATTCATGACGGCATTGACAAATTGCTCCAATCTTCAAGAAGTGGAACTGGGAGGTTGTAAATTTGGTGGAGTCCTCCCTGATTC
Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
secuencia del cromosoma 11 99 CP0181671
Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
member E complete cds99 U727241
PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
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98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
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Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
Piz-5 6 RM 527 233 221-240 11
Pi-b 2 RM 208 173172-188 7
Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
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Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
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400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
Alignment statistics for match 1
Score Expect Identities Gaps Strand
523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
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Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
Query 61 ACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGA 120
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Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
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Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
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Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
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Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
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Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACCACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGATGCCAAGCCGGTCCTTGTTGGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAAAGTTACTGATATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGTAAAGGCTTCTACACCCGGTCTGCCTTCCTTAAGCCATTTCCGCGTACCCTGAATTTGGCACCAATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC
CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Descripcioacuten Ident Accesioacuten NCBI
Oryza sativa grupo Indica cultivar Shuhui498
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Oryza sativa receptor kinase-like protein gene family
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PREDICTED Oryza sativa Japoacutenica probable LRR receptor-
like serinethreonine-protein kinase At3g47570
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98 XM_0157613521
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 1198 AP0149671
Oryza sativa grupo Japoacutenica cultivar Nipponbare
cromosoma 11 clone OSJNBa0038B2298 AC1369564
Oryza sativa grupo Indica cultivar RP Bio-226 cromosoma
1 93 CP0126091
Anaacutelisis de la secuencia de IDIAP 38
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
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Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
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Q10 Q11
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Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
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Related Information
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Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
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CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Gen Cr MarcadorTamantildeo (pb) Variedades
con bandas esperado observado
Pi-9 6 RM 541 158 159-162 9
Pi-1 11 RM 224 157 139-191 15
Piz-5 6 RM 527 233 221-240 11
Pi-b 2 RM 208 173172-188 7
Pi-ta 12 RM 247 131 139-181 8
Pi33 8 RM 72 166 0
Pi-27(t) 1 RM 259 162 161-183 14
Pitp(t) 1 RM 246 116 102-121 13
Pi-kh 11 RM 206 147 138-175 4
Pb1 11 S273 133 135-142 15
Pi21 4 Pi21b 972 977 -997 3
Caracterizacioacuten de variedades de arroz (marcadores para resistencia a Magnaporthe grisae)
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
M D3 D6 D9 D11 D15 D13 D14 D19 M D14 D11 D48
Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
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Related Information
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Query 61 ACCTACTGCTGCAGCCAGTATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTACTGTGGACCTGGA 120
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Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
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Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
Query 180 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCGCAAGCCGCTGACAACTGTCCTGGT 239
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Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
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Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
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Sbjct 691 ACCAAATGCACCGACGAAGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 750
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CultivarReferencia NCBI
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D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
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Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Identificacioacuten de un gen de quitinasa en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
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Carmen Bieberach Forero Zanya Aguilar Reyes Rita Gonzaacutelez Herrera
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400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
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Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
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Related Information
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Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
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Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
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Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
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Sbjct 631 AAAGGCTTCTACACCCTGTCTGCCTTCTTAGAAGCCGTTTCGGCTTACCCTGGCTTTGGC 690
Query 299 ACC-AATGCACCGACGATGACAGAAAGAGAGAGATTGCAGCTTACTTCGCCCATGTCACC 357
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CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2 M D3 D6 D8 D9 D11 D13 D14 D15 D19 D48-2
400400
Q10 Q11
Imagen UVP02059 del 24 de marzo de2017Marcador K180 Amresco (100-3000 pb)
Identificacioacuten de un gen de quitinasas en cultivares de ntildeame (Dioscorea sp)
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
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Related Information
Range 1 391 to 750
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Score Expect Identities Gaps Strand
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Query 1 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGTTGTGGCACAAAACTGCAAGTGCGACACCACC 60 D3
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Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
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Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
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Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
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Sbjct 571 ATTGTAACACAGGACTTTTGGGACGGAATTGCATCACAAGCCGCTGCCAACTGTTCCGGT 630
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CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
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D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
D3 alineamiento
Dioscorea oppositifolia gene for chitinase complete cds
Sequence ID AB1027141Length 1631Number of Matches 1
Related Information
Range 1 391 to 750
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Score Expect Identities Gaps Strand
523 bits(283) 1e-144 335360(93) 3360(0) PlusPlus
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Sbjct 391 GTTCTCTCCGGTCTCTTCTCCAGCTCTGCCGTGGCACAAAACTGCCAGTGCGACACCACC 450 AB1027141
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Sbjct 451 ATCTACTGCTGCAGCCAGCATGGCTACTGCGGCAACAGCTACGACTATTGTGGACCGGGA 510
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Sbjct 511 TGCCAAGCCGGTCCTTGTTTGGTTCCTTGCGAAGGAAACGGCACCTTAACAGTTAGTGAT 570
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CultivarReferencia NCBI
AB1027141 ()D3 Diamante 6322 93
D6 Cristal 90D9 Blanco Peluacute 91
D13 Colorado Peludo 87
D14 Mulato Colorado 92
D19 Paleta 90
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Desarrollo de protocolo de micropropagacioacuten de pifaacute
(Bactris gasipaes )
C Bieberach Forero Joseacute Hernaacuten Campos Yanelkys Barrera
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Identificacioacuten de microorganismos (patoacutegenos de plantas)
Teacutecnicas PCR y secuenciacioacutenbull Colletotrichum en ntildeame
bull Burkholderia de arroz
bull Colletotrichum acutata en cafeto
Carmen Bieberach Forero Felipe Gonzaacutelez Ochoa Rito Herrera Vega
Rita Gonzaacutelez Herrera Axel Villalobos Corteacutes
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Identificacioacuten de genes en hiacutebridos nacionales de maiacutez dulce (su1 se1 sh2)
M 1 3 4 5 6 8 10 11 13 14 15 16 17 18 19 20 M
1000
36 hiacutebridos analizados12 tienen el gen su18 tienen el gen sh2Proyecto Conservacioacuten de germoplasma
Carmen Bieberach Forero Sandra Sopalda Prince Omar Alfaro
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Contribucioacuten de la biotecnologiacutea al desarrollo agropecuario
Informacioacuten sobre las caracteriacutesticas de variedades
Conservacioacuten de la variabilidad geneacutetica de los cultivos para ofrecer a la agricultura nacional genotipos con caracteriacutesticas para diversos usos
Multiplicacioacuten masiva de plantas de alta calidad fitosanitaria para la produccioacuten de semilla vegetativa
Apoyo a los proyectos de mejoramiento geneacutetico
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Yanelkys Barrera Calixto Guerra Sandra Sopalda J Hernan Campos Zanya Aguilar
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach
Rita Gonzaacutelez ZanyaAguilar Axel Villalobos LissyAvila Carmen Bieberach