legame cometitivo al dna mascheramento della superficie di attivazione interazione con fattori...
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Legame cometitivo al DNA
Mascheramento della superficie di attivazione
Interazione con Fattori generali della trascrizione
Reclutamento di complessi di rimodellamento della cromatina repressivi
Reclutamento di istone deacetilasi
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HELICASE/ATPase domain
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BROMO domainbinds acetylated lysines on histone tails
HSA domain protein interactions
actin/ARP transcription factors
ATPase domain
ROLE of SNF2/BRM domains
SNF2 ATPase activitychange nucleosome positionincreased regulatory protein access!change nucleosome conformationeject histone octamer
displace H2A/H2B dimer
Roles of SWI2/SNF2Role in activation or repression of genesInducible gene expression:transcription initiationtranscription elongation
SplicingRepair
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Roles of ISWInucleosome array formationchromatin assembly, replication
heterochromatin formationtranscriptional regulation some PolII, PolI
SANT/HAND domain contacts histone tails
Slide domain linker DNA contact, ’measures’ distanceequal spacing of nucleosomes
ATPase domain
ROLE of ISWI domains
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CHD ATPasesCHD1: role in chromatin assembly; open chromatinin pluripotent cellsNuRD complex also contains Me-DNA binding protein (MBD2)complex connects deacetylation, chromatin remodeling and DNA methylation; repressive function
CHROMO and PHD domainsbind methylated lysines on histone tailsmodulate activity of remodelers
ATPase domain
ROLE of CHD ATPase domains
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INO80chromatin assemblyDNA repairinteracts with phosphorylated H2A.X (gammaH2A.X)transcription
SWR1H2A exchange with H2A.ZBoundary to heterochromatin spreadingtranscriptionally poised promoters (together with H3.3)
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WINAC-WICHWSTF Williams syndrome transcription factor
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helix–turn–helix motif (HTH)
tight chromatin binding
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stepwise assembly model for transcription initiation.