Participants

• David Klatte (Leader)• Jasmin Saric• Robin Munro• Simon Mercer• Steve Pettifer• Todd Vision• Nick Lakin

PRINCIPLES FOR LOW HANGING FRUIT

• Pistoia should pick and support some standards• Should do things that are already in‐flight, e.g. a standard that 

is already in use by a Pharma• Adopt standards that have a clear business case – “easy to 

convince my boss’ boss that it would have value this year!”• Pistoia shouldn’t be involved in systems implementations but 

only in the language definition (format)• Value would be in an open (non‐proprietary) language / 

standard

OpportunitiesWhere From? Value Delivered Actions / Deliverables

Canonical model for large molecules(#1)

PFE initiative which will be published as open standard

•Opportunity for exchange of data with CROs  • Previous examples of small molecules standards which have become a hodgepotch. Pistoia could take a role validating to the standards.• Mechanism for down stream data exchange on a molecule

•Develop a BC for this and circulate to pharma’s• Identify stakeholders and form a cross‐pharma• Agree on the standard• Build validation tool and enable

BEL framework –product(#3)

Collaboration between PFE and Selventa

• Open Language for expressing biological relationship + system for holding triples• Pick a standard to be supported by Pistoia

• Develop a BC for this and circulate to pharma’s• Identify stakeholders and form a cross‐pharmacommunity • Agree on the standard• Build validation tool and enable

Gene Taxonomy –establish a service which delivers this

Pistoia driven initiative with EMBL

•Obtain dictionaries and taxonomies for the genes – no need to license them individually• Able to have collaborative working across Pharma’s• End user has improved interpretability• Genes are an easy start to this and this can be extended to MOA, cell lines, etc.

• Clarify licensing questions• Initiate discussion with EMBL• Investment in service to set up open standard

OpportunitiesWhere From? Value Delivered Actions / Deliverables

Standard for HTS

Bayer? •Cross Industry problem of communication with CROs

•As above

Innovation Drivers

Pistoia as an Innovation Forum

University of Manchester

• Framework for collaboration between Pharma and third parties, e.g. Academia. Need to set up IP position with gets communicated to those making a proposal.• Pistoia would own the IP in some cases.• Pistoia as the communication glue.• Academic projects get the benefit of more credibility to funding bodies.

• Format for proposals and terms of engagement to be defined. Needs to have legal input and will require effort.• “Dragon’s Den” ‐ panel for approval of proposals

Pistoia point of view on what is non‐competitive(#2?)

Group • Clear picture to the industry of areas of potential focus

• Representatives to discuss and provide examples• White Paper

• Ideas:• Gene Taxonomy – establish a service which delivers this

• e.g. BI partnership with EMBL• Shadow set of taxonomies – could be quickly achieved

• What areas count as non‐compete?• NGS• Pistoia should publish it’s ideas• What are the statistics across the industry

• BEL framework – product – already a collaboration with PFE• Language for expressing biological relationship + system for holding triples• Open source opportunities• Could become a standard or a recommendation• Pistoia shouldn’t be involved in systems implementations but only in the language definition (format)

• Academic labs (for example) would be involved in content definition• Value would be that it is an open language (non‐proprietary)

• Usecase:• Pharma needs to improve attrition rates • Need to be able to look at perturbation on other proteins for another target

• Principle: Pistoia should pick and support some standards• Principle: Should do things that are already being prioritized, e.g. a standard that is already in use by a Pharma

• Ideas:• e.g. PFE movement to large molecules – canonical model for large molecules• Opportunity for exchange of data with CROs  • Previous examples of small molecules standards which have become a hodgepotch

• Pistoia could take a role validating to the standards•Mechanism for down stream data exchange on a molecule• PRINCIPLE: Adopt standards that already exist and have a clear business case –“easy to convince my boss’ boss that it would have value this year!”• Prevent vendor lock‐in• Standards are more useful if you can combine proprietary and public data easily

• What’s the mechanism for getting any of these things done?• e.g. Publish Large Molecule standard• Pistoia organized PoC for verification tool• Be able to have strong business case (elevator speech) – appeals to individual company providing the new tool/standard, etc.• Identify people involved, get confirmation that BC is solid, PoC then stamped with Pistoia brand – need to have gates to the process