manipulación genética de microorganismos para la obtención de nuevos fármacos de tipo...
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Diapositivas de la charla que di en la 5a. reunión del grupo de Microbiología Molecular, Sociedad Española de Microbiología. Jaca, Huesca. Septiembre 2004.TRANSCRIPT
César Sánchez*, Aaroa Pérez, Alfredo F. Braña, Carmen Méndez y José A. Salas
Departamento de Biología Funcionale Instituto Universitario de Oncología del Principado de Asturias (IUOPA)
Universidad de Oviedo
Manipulación genética de microorganismos para la obtención
de nuevos fármacos de tipo indolocarbazol
Universidad de Oviedo
Un microorganismo produce un compuestocon actividad biológica reconocida
Identificación de los genes responsables de su biosíntesis
Manipulaciones genéticas
Obtención de nuevos productos derivados
Ensayos de actividad biológica
Generación de nuevos compuestos bioactivos mediante manipulación genética de microorganismos
O
NH
N NH
O O
Cl ClOH
OHOMe
OH
NH
N N
O
OH
NHCH3
MeO
O
O
OH OH
O
O
OH
O
OHCH3
NC
COOH
O
OHCH3CH3CH3
MITRAMICINA(inhibidor de replicación y transcripción de ADN)
Streptomyces argillaceus OVIEDOMICINA(inductor de apoptosis)
Streptomyces antibioticus
BORRELIDINA(inhibidor de angiogénesis)
Streptomyces parvulus
REBECAMICINA(inhibidor de ADN topoisomerasa I)
Lechevalieria aerocolonigenes
ESTAUROSPORINA(inhibidor de quinasas)
Streptomyces longisporoflavus
CROMOMICINA(inhibidor de replicación y transcripción de ADN)
Streptomyces griseus
OH OOH
H3CO
O
CH3
OHO
OH
HCH3
OOO
OOOHOH
CH3
CH3CH3CH3
OH
HO
OOO
CH3OH
O
CH3
OHOH
OH OH OH3C
O CH3
O
HOCH3 OH
OHO
OH3C
HOO
OH3C
HOO
OCH3
HOH3CCOO
H3C
OCH3
OOCCH3
O
OCH3
OCH3
HO
Compuestos antitumorales en estudio
Indolocarbazoles: nuevos agentes antitumorales
NH
N NO
CH3 H
NHCH3
H3CO
O
ESTAUROSPORINA
O OH
OH
OCH3
OH
NH
NH
N
OO
Cl Cl
REBECAMICINADerivados en ensayos clínicos:
NSC655649 (“rebeccamycin analog”),NB-506, J-107088
Derivados en ensayos clínicos:PKC412, CEP-751,
UCN-01 (7-hidroxi-estaurosporina)
Aislamiento de genes biosintéticos de rebecamicina
Genoteca del ADN cromosómico de Lechevalieria aerocolonigenes ATCC 39243(cósmido pKC505: bifuncional E. coli - Streptomyces)
Hibridación en colonia (sonda: fragmento interno del gen ngt)
Cósmidos positivos
Transformación de protoplastos de Streptomyces albus
¿ Producción de rebecamicina ?
min6.0 12.0
1400 *
Streptomyces albus / cósmido 14E8
Extracción y purificación
Caracterización estructural
O OH
OH
OCH3
OH
NH
NH
N
OO
Cl Cl
Rebecamicina
Streptomyces albus conteniendo cósmidos “reb”
Los genes biosintéticos de rebecamicina
1 kb
G O D C P M R F U H T
Formación de indolocarbazol
Glicosilación
Halogenación
Metilación del azúcar
Secreción
Regulación
NH
HOOCNH2
ClNH
HOOCNH2
NH
HN
NH
OO
Cl Cl
RebHRebORebD
RebCRebP
L-triptófano
x 2
aglicón
Biosíntesis de rebecamicina: ruta propuesta (I-III)
I. Modificación del triptófano II. DimerizaciónIII. Cierre del sistema de anillos
RebHRebORebD
RebCRebP
Biosíntesis de rebecamicina: ruta propuesta (IV-V)
NH
HN
NH
OO
Cl ClO
OH
OHOH
HO
N
HN
NH
OO
Cl Cl
OOH
OH
O
HO
N
HN
NH
OO
Cl Cl
CH3
RebG RebM
aglicón
rebecamicina
IV. Glicosilación V. Modificación del azúcar
RebG RebM
pREB6
pREB7
Expresión heteróloga de genes biosintéticos de rebecamicina
O D C P Mp
G O D C P M R F U
1 kb
G O D C P M R F U H T
pREB6
Análisis HPLC
min10.0 20.0
6001mAU
NH
NH
(Compuesto esperado: aglicón de descloro-rebecamicina)
NH
OO
Aglicón de descloro-rebecamicina
Streptomyces albus / pREB6
O D C P Mp
(Compuesto esperado: descloro-rebecamicina)
pREB7
Análisis HPLC
150
min10.0 20.0
3
2mAU
O OH
OH
O
OH
NH
NH
N
OO
R
2 (R=CH3)Descloro-rebecamicina
3 (R=H)4’-Desmetil-descloro-
rebecamicina
Streptomyces albus / pREB7
G O D C P M R F U
Biosíntesis combinatoria de indolocarbazoles (I)
O
H2NCH3
O
O
O
NHNH
Cl
O
CH3
OHH3C
O
O
CH3
OCH3
OH
CH3
HN OH
OO
CH3H3C
COOH
NH
HOHN
NHO
O
NH
S
Cl
NH2
O
NH
N
HN OO
O
OCH3
OH
OH
HO
Cl Cl
rebecamicina(Lechevalieria aerocolonigenes)
tienodolina(Streptomyces albogriseolus)
pirroindomicina β(Streptomyces rugosporus)
estaurosporina(Streptomyces longisporoflavus)
violaceína(Chromobacterium violaceum)
R1= CO, CHOH, CH2R2 , R3= H, Cl, BrR4 , R5= H, Cl, BrR6 , R7= H, Cl, Br, OH
N N
HN O
OHH3C
H3CONHCH3
NH
NH
HN
R1O
R2 R3
R5
R7
R4
R6
Biosíntesis combinatoria de indolocarbazoles (II)
L. aerocolonigenes rebecamicina
genes biosintéticosG O D C P M R F U H T
estaurosporinaS. longisporoflavus
S. albogriseolus tienodolina
C. violaceum violaceína
S. rugosporus pirroindomicina
S. albus
O D C P
estructura básica
staC
thal
vioC
banco de genesmodificadores
G
H
M
vioD
pyrH
Extracción y purificación (HPLC)
Caracterización estructural(MS, NMR)
Ensayos de actividad antitumoralstaC
thal
vioC
banco de genesmodificadores
G
H
M
vioD
pyrH
combinaciones de genes modificadores (en plásmidos)
staC pyrH
staCH G
staC vioD G M
vioC vioD G
staC
thal
Biosíntesis combinatoria de indolocarbazoles (III)
S. albus
O D C P
estructura básica
RebCRebP
III. Cierre delsistema de anillos
RebCRebP
PyrH
RebH
I. Modificaciónde Trp
RebORebD
II. Dimerización
RebG
IV. Glicosilación
RebM
V. Modificacióndel azúcar
RebCRebP
StaC
RebP
StaC
RebP
StaC
RebP
Trabajo en curso y planes inmediatos
Agotar las posibilidades de la biosíntesis combinatoria de indolocarbazoles:
Modificaciones del sistema de anillos (aglicón)
Modificaciones del azúcar
Y combinar ambos tipos de modificaciones