manuel de prelevement du cnr ist bactériennes … de prelevement.pdf · méthode de type...

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT

ProcédurequalitéauCNRISTLASyphilis

Référence:CNRSY-PREA-PR-001 Dated’application:29/01/2019

Page(s)1/17Version:v04

Rédaction Vérification ApprobationNomFonctionSignature

PhilippeGRANGEIngénieurderecherche

NadjetBENHADDOUPharmacienbiologiste

NicolasDUPINPU-PH

MANUELDEPRELEVEMENT

DUCNRISTbactériennes

LaboratoireAssocié

SYPHILIS

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

OBJET Le Manuel de Prélèvement a pour but d’améliorer les échanges entre les centrespréleveursréalisantetassurantl’acheminementdesprélèvementsetleCNRISTLASyphilis. Desinstructionsspécifiquesrelativesauprélèvementetàlamanipulationdeséchantillonsprimairessontdécritesetdocumentéesafind’obtenirdeséchantillonsbiologiquesrépondantauxconditionsnécessairesàl’obtentiond’unrésultatfiable. LeprésentManueldePrélèvementregroupelesinformationsutilesainsiquelesexigencesàrespecterpourréaliseretprendreencharge,dansdesconditionsoptimales, lesprélèvementsbactériologiques. Le CNR IST LA Syphilis a l’obligation de refuser les échantillons biologiques qui nerespecteraientpascescritèresdequalitéindispensablesàlaréalisationdesanalyses. LeManueldePrélèvementestdisponible surnotre site internet:www.cnr-ist.frdans larubrique«Documentsderéférence»etnoscorrespondantspeuventvisualiseretimprimercetteversionquiestmiseàjourrégulièrement.MOTSCLESQualité,pré-analytique,transport,échantillonDOMAINED’APPLICATIONTouslescentrespréleveurssusceptiblesdeparticiperauxprotocolesderechercheoupourl’envoid’échantillondanslecadredel’expertise.DEFINITIONS/ABREVIATIONSCNR IST LA Syphilis: Centre National de Référence des Infections Sexuellement TransmissiblesLaboratoireAssociédelaSyphilisANSP:AgenceNationaledeSantéPubliqueTPA:TreponemapallidumLCR:liquidecéphalorachidienPCR:polymerasechainreactionRFLP:restrictionfragmentlenghtpolymorphismDOCUMENTDEREFERENCELeManueldePrélèvementapporteauxcentrespréleveursl’assurancedel’existenced’unsystèmequalité au sein du CNR IST LA Syphilis tout en respectant les exigences réglementaires et lesexigencesdelanormeNFENISO15189«Laboratoired’analysesdebiologiemédicale:Exigencesparticulièresconcernantlaqualitéetlacompétence».

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

DESCRIPTIONSOMMAIRE

1-Récapitulatifdesrecommandationspré-analytiques…………………………………. 4

2-PrésentationduCNRsyphilis:sesmissions………………………………………………. 5

3-ListedesanalyseseffectuéesauCNRsyphilis…………………………………………….. 6

4-Réalisationdesprélèvements……………………………………………………………………. 7

5-Matérielsdeprélèvement…………………….…………………………………………………….. 10

6-Identificationdel’échantillon……………………………………………………………………. 12

7-Transport………………………………………………………………………………………………… 14

8-Eliminationdesdéchets……………………………………………………………………………. 16

9-Sécuritédupersonnel………………………………………………………………………………. 17

10-Phasepostanalytique……………………………………………………………………………. 17

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

1-Récapitulatifdesrecommandationspré-analytiquesSIMPLIFIEES

AnalyseNature,volumeduprélèvementet

recommandations

Transport Méthode

Délaisderenduderésultat

Stockagedes

échantillonsexaminés

T°C Délais T°C Durée

GénotypagedeTreponemapallidum

Ecouvilloncutanéo-muqueuxsurtubesec Amb <10j

Méthodedetypequalitatif

Amplificationd’acidenucléiques(nPCR)

détectiondugènetpp47

7j

-20°C Illimité

Ecouvilloncutanéo-muqueuxenmilieudetransport

4°C <2j

Sangtotal(tubeEDTA),5ml 4°C

48h

Biopsie

4°Cet-20°Csi>7j

Sérum(tubesec),5ml

LCR,0,2mlminimum

Prélèvementspérinataux(placenta,liquideamniotique,cordonombilical)

Liquideamniotique,0,2mlminimum

Sérologiesyphilis

Sérum(tubesec),5ml4°C

et-20°Csi>7j

<7j

Quantitatif(CMIAsurArchitect;IgMavecIgMEIAtestkits).Qualitatif(RPR-VDRLsurRPRtestkits;FTA-AbssurTrepoSpotIF

LCR,0,1mlminimum

Résistanceazithromycine

Ecouvilloncutanéo-muqueux Amb 10j

MéthodedetypequalitatifAmplificationd’acidenucléiques(PCR/RFLP–

PCR/séquençage):recherchemutationsA2058G–A2059G

ThermocyclerGenAmpPCRsystem9700

(AppliedBiosystems)

ContacterleCNR

Sous-typagedeTreponemapallidum

Ecouvilloncutanéo-muqueux Amb 10j


ContacterleCNR

Amplificationd’acidenucléiques(PCR,RFLP,

séquençage)

surgènesarp,trpettp0548

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

2-PrésentationduCNRIST:sesmissions

LeCentreNationaldeRéférencedesInfectionsSexuellementTransmissiblesbactériennes

a été créé en 2017, pour la période 2017-2021parArrêté du 7mars 2017 (JORFn°0058du 9

mars 2017, texte n°20). Il regroupe trois laboratoires ayant chacun des expertises

complémentaires. Les infections àChlamydia trachomatiset celles causée par les mycoplasmes

urogénitauxsontdudomainedulaboratoiredeBactériologieduCHUdeBordeaux,lesinfectionsà

gonocoque sont du domaine du laboratoire de Microbiologie de l’hôpital Saint-Louis et les

infectionàTreponemapallidumdudomainedulaboratoiredeDermatologiedel’hôpitalCochin.

LeCNRISTLASyphilisesthébergéauseindel’InstitutCochinU1016dansleLaboratoire

deDermatologie.IlestdirigéparlePr.NicolasDupin,ServicedeDermatologieàl’HôpitalCochin,

AP-HP,Paris.

LeCNRISTbactérienness’engageàassurer lesmissionsdéfiniespar ledécretno 2016-

806du16juin2016relatifauxcentresnationauxderéférencepourla luttecontre lesmaladies

transmissibles.CeCNRorienteenprioritésesactivitéssurlesinfectionsàChlamydiatrachomatis,

lesinfectionsàgonocoque,lasyphilisetlesinfectionsurogénitalesàmycoplasmes.

C’estdanscecontextequeleCNRISTLASyphilisproposeladétectionparPCRnichéedu

gène tpp47 de TPA agent de la syphilis à partir d’écouvillonnage de lésions cutanées ou

muqueusesprélevéeschezdespatientsuspectsdesyphilisprimaireetsecondaire.

Le CNR IST LA Syphilis propose également la détection du gène tpp47 de TPA dans les

prélèvements sanguins, le LCR, et les échantillons périnataux ainsi quetout autre prélèvement

pouvantêtreinfectéparTPAdèslorsquelemédecinprescripteurjugeutiledecetterecherche.

Deplus, leCNRISTLASyphilisréalise lestestsdesérologiesyphilisdans lesérumou le

plasma(CMIA/RPRetWesternblotIgG/M)etleVDRLdansleLCR

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

3-ListedesanalyseseffectuéesauCNRsyphilis

Analyse Typed’échantillon Principedelaméthodeetéquipement

GénotypagedeTreponemapallidum

Ecouvilloncutanéo-muqueuxsurtubesecoumilieudetransport2

MéthodedetypequalitatifAmplificationd’acidenucléiques(nPCR)détectiondugènetpp47

ThermocyclerProFlexPCRSystem(AppliedBiosystemsbyLifeTechnologies)

Sérum(tubesec),5ml

Sangtotal(tubeEDTA),5ml

Biopsie

LCR,0,2mlminimum

Prélèvementspérinataux(placenta,liquideamniotique,cordonombilical)

Liquideamniotique,0,2mlminimum

Sérologiesyphilis

Sérum(tubesec),5mlQuantitatif(CMIAsurArchitect;IgMavecIgMEIAtestkits).Qualitatif(RPR-VDRLsurRPRtestkits;FTA-AbssurTrepoSpotIF)

LCR,0,1mlminimum

Résistanceàl’azithromycine3

Ecouvilloncutanéou-muqueux

MéthodedetypequalitatifAmplificationd’acidenucléiques(PCR/RFLP–PCR/séquençage):recherchemutationsA2058G–A2059G

ThermocyclerGenAmpPCRsystem9700

(AppliedBiosystems)

Sous-typage4deTreponemapallidum Ecouvilloncutanéou-muqueux


Amplificationd’acidesnucléiques(PCR,RFLP,séquençage)

surgènesarp,trpettp0548

2Grangeetal.(2012)J.Clin.Microbiol.50(3):546-552.3,4ContacterleCNRsyphilis

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

4-Réalisationdesprélèvements

LesprélèvementsquisontenvoyésauCNRISTLASyphilissontdedeuxtypes.

1)Lesprélèvementsdit«d’expertise»quisontdesdemandesponctuellesdepraticienspour la

détectionmoléculaire de TPA dans divers prélèvements biologiques. Ces prélèvements sont

réalisésaudécoursdeconsultationsdepatientssuspectsdesyphilis.Lademanded’expertise

faitl’objetd’unrenduderésultatnominatif,validéparlebiologisteduCNRISTLASyphilis.

2) Les prélèvements dits «de protocole» font références à des études de recherches,mises en

placeparleCNRISTLASyphilisdanslecadredesesmissions.Cesontdesétudesprospectives,

soumises à l’approbation du Comité de Protection des Personnes (CPP) Ile de France III et

déclarées à la Commission Nationale Informatique et Libertés (CNIL). Ce sont des études

anonymesquifontl’objetd’unrenduderésultatanonymeetpériodique.

2.1-Danslecadredel’expertise

LesprélèvementspourleCNRsyphilissont:

-desécouvillonnagesde lésions cutanéesou-muqueuses (si la lésioncutanée est sèche,

réaliseruneérosiondouceàl’aided’unscalpelpermettantd’obtenirunexsudatrécupéré

parl’écouvillon)

-desprélèvementssanguins(sangtotal,sérum)

-duLCR

-desprélèvementspérinataux(placenta,liquideamniotique,cordon,sangtotaldecordon,

écouvillonbuccalet/ounasal,liquidegastrique)

-desbiopsiescutanéesouautres

-toutautretypedeprélèvement

L’ensemble des prélèvements cités ci-dessus sont réalisés selon les règles établies dans

chaquecentrepréleveur.

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

2.2-Danslecadredesprotocolesderecherche

Le CNR IST LA Syphilis, dans le cadre de ses missions d’évaluation et de recherche,

propose une «Etude Moléculaire de la syphilis ou GENOSYPH» qui est une surveillance

épidémiologique et moléculaire sentinelle pérenne et documentée qui associera les données

sociodémographique et cliniques avec les échantillons biologiques pour la constitution d’une

sérothèque/souchothèque.Cetteétudeestcoupléeàl’étude«SurveillancedelaSyphilis»réalisée

parl’ANSP.CetteétudedéclaréeàlaCNIL(n°dedéclaration1208504)areçul’agréméntduCPP

IledeFranceIII,le08novembre2012(n°S.C.3005).

En fonction des possibilités opérationnelles du centre participant (centrifugation et

stockage),leCNRISTLASyphilismetàdisposition2typesdekit:

1)unkitGENOSYPH«complet»quicontient:

-2tubessecspourleprélèvementdesangpériphériquede10mlpré-identifiés(numéro

d’anonymatduCNR)

-2tubesplastiquesstérilesbouchonrougepré-identiféspouraliquoterlesérum

- 1 écouvillon coton sec dans son étui pré-identifié (numéro d’anonymat du CNR). Si le

médecin jugeopportund’écouvillonnerd’autres lésions, ilutiliserasespropresécouvillonsmais

prendra soin d’indiquer le site de prélèvement et de coller le numéro d’anonymat du CNR

correspondantsurl’étuis.

-1jeude3étiquettesauto-collantespré-identifiées(numérod’anonymatduCNR)

-lesformulairesrelatifàl’étude

Le centre préleveur procèdera à la récolte du sérum après centrifugation à 2500 rpm

pendant10minàtempératureambiante.Lesérumseraaliquoté,enproportionégales,dans les

deuxtubesde5mlpré-identifiésfournisdanslekit.

Lesaliquotsdesérum, l’écouvillon(s)danssonétuis,ainsiquelafichederenseignement

seront placés dans la pochette du kit qui sera scellée. Le tout sera stocké à –20°C avant envoi

groupéà-20°CauCNRISTLASyphilis.

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

2) un kit GENOSYPH «allégé» qui contient :

- 1 écouvillon coton sec dans son étui pré-identifié (numéro d’anonymat du CNR). Si le

médecin jugeopportund’écouvillonnerd’autres lésions, ilutiliserasespropresécouvillonsmais

prendra soin d’indiquer le site de prélèvement et de coller le numéro d’anonymat du CNR

correspondantsurl’étuis.

-unjeude3étiquettesauto-collantespré-identifiées(numérod’anonymatduCNR)

-lesformulairesrelatifàl’étude.

-uneboitedetransportpourdumatérielbiologiqueinfectieuxprêteàl’emploi.

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

5-Matérielsdeprélèvement


LecentrepréleveurquidésireenvoyerunéchantillonauCNRsyphilisutilisesonproprematériel

deprélèvement(voirtableauci-dessousdonnéàtitred’exemple):

Matériel Typedeprélèvements

Ecouvillonsectigebois

Lésioncutanée,

muqueuseEcouvillonenmilieudetransport

TubeEDTA5ml

Sangtotal

Tubesec5ml

Sérum

Flacon

Biopsies1

Tubesechermétique

LCR

1LesbiopsiesserontenvoyéesenprésencedePBSoudesérumphysiologiqueafind’éviterleurdéshydratation

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH


LematérielmisàdispositionducentrepréleveurparleCNRISTLASyphilis:

MatérielmisàdispositionparleCNR

syphilis

Typedeprélèvement/Objet

Ecouvillonsectigebois(x1)

Lésioncutanée,muqueuse

Tubesec10ml(x2)

Sérum

Tubeplastiquestérile5ml(x2)

Aliquotedesérum

Boitedetransport

Retourécouvillonpourkit«allégé»:

Boite sécurisée pour le transport deMatériel

InfectieuxdecatégorieB

(l’écouvillonestplacédans le tubeàbouchon

noirquiest luimêmedéposédanslaboitede

transport)

Avec«kitcomplet»:écouvillon+tubessecpoursérum+tubesplastiquepouraliquotage:Chaque centre qui acceptera de participer à l’étude recevra en première dotation un lot de 3 kits

renouvelables contenant 1 écouvillon sec tige bois, 2 tubes sec + 2 tubes d’aliquote pré-identifiés et

tous les formulaires relatif à l’étude pour chaque kit.

Avec«kitallégé»:écouvillonuniquementdansboitedetransport:Chaque centre qui acceptera de participer à l’étude recevra en première dotation un lot de 3 kits

renouvelables contenant 1 écouvillon sec tige bois, une boite de transport complète prête à

l’emploi et tous les formulaires relatif à l’étude pour chaque kit.

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

6-Identificationdel’échantillon


En fonctionde l’analyse souhaitée, les fichesde renseignements sont téléchargeables sur le site

internet du CNR IST (www.cnr-ist.fr) rubrique «Envoyer une souche ou un échantillon», sous

rubrique «SYPHILIS». La fiche PCR TP correspond à une analyse par PCR. La fiche Sérologie

correspondantàunedéterminationdelasérologiesyphilissursérumouplasmadécanté.Lafiche

VDRL-LCR correspond à une demande d’analyse sérologique du LCR (test VRL charbon). Ces

fiches peuvent être envoyées également par mail (contact: Tel: 0144-412-560, e-mail:

[email protected]).

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

6.2-Danslecadred’unprotocolederecherche

Avec«kitcomplet»:écouvillon+2tubessec

poursérum:

Avec«kitallégé»:écouvillonuniquement:

FICHE DE RENSEIGNEMENTS

Date du prélèvement :_______/_______/_____

Nom du médecin ou biologiste :

_____________________________________________________________

Coordonnées précises pour vous joindre:

__________________________________________________

1- Renseignements patient

Age : __________ Sexe : M F enceinte

2- Prélèvements : utiliser les tubes pré-numérotés du sachet

Ecouvillon coton sec

(en cas de lésions muqueuses ou cutanées, faire un grattage pour obtenir une sérosité). Merci d’utiliser vos propres écouvillons si vous jugez nécessaire de réaliser plusieurs prélèvements et de les identifier avec les étiquettes CNR jointes dans le kit.

BIEN PRECISER LE SITE DE PRELEVEMENT

Génital Anal Buccal Tronc Main Pied Autres : ____________________

2 tubes secs de 10 ml chacun de sang périphérique du patient.

Les résultats seront transmis à titre indicatif et ne doivent pas modifier la prise en charge initiale

Centre : n° de code centre Numéro CNR Adresse du centre préleveur

XXXX (le code centre, le numéro CNR et l’adresse sont pré-remplis par le CNR syphilis)

Joindre cette page avec le prélèvement

FICHE DE RENSEIGNEMENTS

Date du prélèvement :_______/_______/_____

Nom du médecin ou biologiste :

_____________________________________________________________

Coordonnées précises pour vous joindre:

__________________________________________________

1- Renseignements patient

Age : __________ Sexe : M F enceinte

2- Prélèvement : utiliser le tube pré-numéroté du kit

Ecouvillon coton sec En cas de lésions muqueuses ou cutanées, faire un grattage pour obtenir une sérosité.

BIEN PRECISER LE SITE DE PRELEVEMENT

Génital Anal Buccal

Tronc

Main Pied

Autres : ____________________ Les$résultats$seront$transmis$à$titre$indicatif$et$ne$doivent$pas$modifier$la$prise$en$charge$initiale!

Centre : n° de code centre Numéro CNR Adresse du centre préleveur

XXX (le code centre, le numéro CNR et l’adresse sont pré-remplis par le CNR syphilis)

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

7-Transport

Les envois de matières infectieuses sont soumis à la réglementation du transport des

matières dangereuses. Cette réglementation impose des obligations en matière d’emballage,

d’étiquetageetde transport.Tout transportdematérielsbiologiquespotentiellement infectieux

estsousl’entièreresponsabilitédel’expéditeur.

Les modalités de transport des matières infectieuses sont fixées par l’arrêté du 5

décembre 2002 modifiant l'arrêté du 1er juin 2001 relatif au transport des marchandises

dangereusesparroute(dit«arrêtéADR»).IlestrecommandédesuivreleGuidesurlasécurité

dutransportdesmatièresinfectieusesetdeséchantillonsdediagnosticpubliéparl'OMS.


LeséchantillonspourexpertisemoléculairesontenvoyésparlecentrepréleveurauCNR

IST LA Syphilis à température ambiante, 4°C ou congelé (voir plus bas) en utilisant leur

transporteuragréépourletransportdumatérielbiologiquedecatégorieB.

L’adresse duCNR syphilis est disponible soit sur demande (Tel: 0144-412-560, e-mail:

[email protected]). Elle est également consultable à partir du site internetwww.cnr-

ist.frdanslarubrique«Envoyerunesoucheouunéchantillon».


Avec«kitcomplet»:écouvillon+2tubessecpoursérum:

L’ensemble des échantillons prélevés sont conservés à -20°C par le centre préleveur

jusqu’àépuisementdunombredekits.Le centrepréleveur contacteraalors leCNRsyphilisqui

mandaterauntransporteurpourlarécupérationdeséchantillons.L’envoidesécouvillonssefaità

-20°C.

ADRESSE: CNRdesISTbactériennes–Syphilis ServicedeDermatologie HôpitalCochin–PavillonGustaveRoussy Etage4,porte405 8,rueMéchain–75014PARIS

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

7.3-Délaid’acheminementdeséchantillons

Analyse Natureéchantillon TempératureDélai

autorisé

Sous

réserveRejet

PourPCR

EcouvillonSec Ambiante 10j >10jet<15j >15jMilieu

transport 4°C <2j >2jet<4j >5j

Sangtotal 4°C <2j >2jet<4j >5j

LCR4°C <2j >2jet<4j >5j

-20°C >7j / /

Toutautreprélevement4°C <3j >3jet<5j >5j

-20°C >7j / /

Pour

sérologie

Sérumetplasma(échantillondécantéobligatoire)

4°C <7j >7jet<8j >9j

-20°C >7j / /

LCR4°C <7j >7jet<8j >9j

-20°C >7j / /

Pouramplificationgénique

- Les écouvillons secs sont transmis à température ambiante (après expertise, le CNR

syphilis a montré que la détection de T. pallidum par nPCR est réalisable sur des

écouvilllonslaissésàtempératureambiantependant10jours).

- Lesécouvillonsenmilieude transportsontacheminésà4°Csurunepérioden’excédant

pas5j.

- Pour les autres types de prélèvements ils sont envoyés à la température de leur

conservation.Si>à7jours,ilsserontcongelés.NEPASDECONGELERUNECHANTILLON.

Poursérologie(échantillondécantéobligatoire)

- Pourlesérumetleplasmailssontenvoyésà4°C.Si>7jours,ilssontenvoyéscongelés.

- PourleLCRilestenvoyéà4°C.Si>7jours,ilestenvoyécongelé.

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

8-Eliminationdesdéchets

8.1-Réglementation

Lagestiondesdéchetsestréglementéeparlecodedel’environnement.

Loi n°75-633 du 15 juillet 1975 relative à l’élimination des déchets et la récupération des

matériaux.

Art. 1: Est déchet, tout résidu issu d’un processus de production, de transformation ou

d’utilisation. Toute substance ou matériau produit ou plus généralement tout bien meublé

abandonnéouquesondétenteurdestinàl’abandon.

Art.2:Toutproducteurdedéchetestresponsabledel’éliminationdesdéchetsqu’ilproduit.

En conséquence, tout centre préleveur est responsable de l’éliminationdes déchets non

contaminésetcontaminéspardumatérielbiologiquequ’ilproduit.

Toutpersonneldescentrespréleveurs impliquésdans la collectedeséchantillonsbiologiquesà

destinationduCNRISTLAsyphilisdoitseréférerauManueldePrélèvementetauprotocolede

Préventiondesrisquesmisenplacedanssonlaboratoire.

CNRISTLASyphilis

Gestiondelaqualité

MANUELDEPRELEVEMENT







NicolasDUPINPU-PH

9-Sécuritédupersonnel

Lepersonneldescentrespréleveurspeutêtreexposéàunegrandediversitéderisques.

Danscecadre là,unprotocoledegestiondesrisquesconduisantà leurévaluationàconduit les

responsablesdescentrespréleveursàmettreenplacedesmesuresdepréventiondupersonnel.

Tous les personnels impliqués dans la collecte des échantillons pour le CNR IST LA syphilis,

doiventsereporteraumanueldegestiondesrisquesmisenplacedansleurlaboratoire.

10-Phasepost-analytique

10.1-Conditionsdestockagedeséchantillonsanalysésetré-analyse

Les échantillons analysés sont systématiquement re-congelés immédiatement après leur

utilisationetpeuvent,decefait,êtreré-analyséssinécessaire.

10.1.1-Danslecadredel’expertise:

Leséchantillonsanalyséssontstockéspourunecourtepériodedansuncongélateur-20°C

identifié,dansuneboitenumérotéeetidentifiée«EchantillonsenvoyéspouranalysePCR»etlogo

duCNR IST.Cetteboiteest ensuite transféréedansuncongélateur -80°C identifié auCNRpour

uneconservationlongue.

10.1.2-Danslecadredesprotocolesderecherche:

Les exsudats d’écouvillons et les sérums (aliquotés en 4 fractions égales) sont stockés

pour une courte période dans un congélateur -20°C identifié au CNR IST, dans une boite

numérotéeetidentifiée«ECOUVILLON»etdansuneboitenumérotéeetidentifiée«SERUM»avec

etlelogoduCNRIST.Cesboitessontensuitetransféréesdansuncongélateur-80°Cidentifiéau

CNRpouruneconservationlongue.

10.1.3-Critèresderé-analyse

Le critère de ré-analyse est établit selon la procédure «Validation biologique des

résultats». La validation biologique est le contrôle de la vraisemblance et de la cohérence de

l’ensembledesrésultatsdesanalysesd’unmêmedossieret leurconfrontationavec lesrésultats

antérieurs.Ellepeutnécessiterlaconnaissancedel’étatcliniquedupatientetlestraitementsmis

enœuvre.ElleestassuréeparlebiologisteduCNRISTLASyphilis.